深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-05-28	Innovative Artificial Intelligence System in the Children's Hospital in Japan 2025-Apr-28, JMA journal IF:1.5Q2 DOI:10.31662/jmaj.2024-0312 PMID:40415999	研究论文	本文介绍了日本儿童医院中创新人工智能系统的应用及其在医疗领域的广泛潜力	利用深度学习技术和大量医疗数据集，推动突破性医疗治疗的进步，包括病理诊断加速、细菌种类区分、眼疾早期检测和遗传疾病预测	未提及具体的技术实施细节和系统性能的定量评估	推动人工智能在儿科医院中的应用，提升医疗诊断和治疗的效率和准确性	儿科患者，包括病理诊断、细菌种类、眼疾、遗传疾病、儿科癌症、自闭症等	医疗人工智能	儿科疾病	深度学习	NA	医疗图像数据、基因组数据、行为与沟通数据	未提及具体样本数量
202	2025-05-28	A comprehensive validation study on the influencing factors of cough-based COVID-19 detection through multi-center data with abundant metadata 2025-Apr, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbi.2025.104798 PMID:39993588	研究论文	本研究通过多中心数据和丰富的元数据，全面验证了基于咳嗽的COVID-19检测模型的影响因素	首次利用自监督学习进行预训练，并通过不同来源的数据微调模型，同时验证了咳嗽类型、症状和感染阶段等因素对检测性能的影响，并观察了预测概率与临床指标的相关性	在康复个体和开源数据集上检测性能较差，且临床数据样本量较小	评估基于咳嗽的COVID-19检测模型在实际应用中的可行性	临床和众包的咳嗽音频数据	机器学习	COVID-19	自监督学习	深度学习模型	音频	多中心临床和众包数据
203	2025-05-27	SCOPE-MRI: Bankart Lesion Detection as a Case Study in Data Curation and Deep Learning for Challenging Diagnoses 2025-Apr-29, ArXiv PMID:40395941	research paper	该研究介绍了ScopeMRI，首个公开的专家标注肩部病理数据集，并提出了一个深度学习框架用于在标准MRI和MRA上检测Bankart病变	首次公开专家标注的肩部病理数据集ScopeMRI，开发了结合CNN和transformer的深度学习模型，在标准MRI上达到与放射科医生相当的诊断性能	虽然在外院数据上进行了初步验证，但模型在不同成像协议下的泛化能力仍需进一步研究	开发深度学习模型以提高Bankart病变在标准MRI上的诊断准确性，减少对侵入性MRA的依赖	肩部MRI图像中的Bankart病变检测	digital pathology	musculoskeletal disease	MRI	CNN, transformer	3D medical imaging	586 shoulder MRIs (335 standard, 251 MRAs) from 558 patients
204	2025-05-27	Hybrid AI models for predicting heat distribution in complex tissue structures with bioheat transfer simulation 2025-Apr, Journal of thermal biology IF:2.9Q1 DOI:10.1016/j.jtherbio.2025.104122 PMID:40311397	研究论文	本文提出了一种结合深度学习与分数阶Legendre小波方法的生物热传递模型，用于精确预测工程组织构建中的热效应	该模型整合了分数阶Legendre小波方法，实现了比传统方法快15%的热预测速度，并在多种组织类型中保持预测误差低于0.4°C	实验验证仅针对5厘米组织构建体进行，未涉及更复杂或更大规模的组织结构	提高生物组织热行为的预测精度，以支持热疗、热消融和组织工程等医疗应用	工程组织构建体（包括皮肤、肌肉、脂肪和骨骼等多种组织类型）	生物医学工程	NA	深度学习增强的生物热传递模拟	深度学习与分数阶Legendre小波混合模型	热分布数据	5厘米组织构建体，暴露于15W热源120分钟
205	2025-05-26	Development and validation of a multivariable risk model based on clinicopathological characteristics, mammography, and MRI imaging features for predicting axillary lymph node metastasis in patients with upgraded ductal carcinoma in situ 2025-Apr-30, Gland surgery IF:1.5Q3 DOI:10.21037/gs-2025-89 PMID:40405957	研究论文	开发并验证了一个基于临床病理特征、乳腺X线摄影和MRI影像特征的多变量风险模型，用于预测升级导管原位癌患者的腋窝淋巴结转移	结合临床病理特征、MRI影像组学和乳腺X线摄影深度学习模型，构建了一个融合模型，显著提高了预测腋窝淋巴结转移的准确性和稳健性	研究为回顾性分析，样本量相对有限（326例患者）	预测升级导管原位癌患者的腋窝淋巴结转移，以减少不必要的腋窝手术干预	升级导管原位癌患者	数字病理	乳腺癌	MRI影像组学、深度学习	融合模型（结合临床病理模型、MRI影像组学模型和深度学习模型）	临床病理数据、MRI影像、乳腺X线摄影图像	326例升级导管原位癌患者
206	2025-05-26	Malignant risk prediction of cystic-solid thyroid nodules using a comprehensive model integrating clinical and ultrasound features, ultrasound radiomics, and deep transfer learning 2025-Apr-30, Gland surgery IF:1.5Q3 DOI:10.21037/gs-2024-551 PMID:40405959	research paper	本研究开发了一个综合模型，结合临床和超声特征、超声放射组学及深度迁移学习，用于预测囊实性甲状腺结节（CSTN）的恶性风险	首次将深度迁移学习（DTL）、超声放射组学与临床和超声特征结合，构建综合模型预测CSTN的恶性风险	研究为回顾性分析，样本量相对较小（278例），且来自单一医疗机构，可能影响结果的普遍性	探索综合模型在预测囊实性甲状腺结节恶性风险中的价值	278例经病理证实的囊实性甲状腺结节患者	digital pathology	thyroid cancer	ultrasound imaging, deep transfer learning, radiomics	logistic regression, LASSO, DTL	ultrasound images	278 patients with cystic-solid thyroid nodules
207	2025-05-25	CPDMS: a database system for crop physiological disorder management 2025-Apr-22, Database : the journal of biological databases and curation DOI:10.1093/database/baaf031 PMID:40261733	research paper	本研究开发了一个用于实时收集和分析番茄生理障碍图像的系统，构建了一个包含多种胁迫条件下番茄图像的数据库	开发了一个系统化的番茄生理障碍图像收集与分析系统，并构建了一个大规模的图像数据库	AI模型的平均精度(mAP)和召回率仍有提升空间	开发一个用于精准农业的实时作物图像收集与分析系统	番茄生理障碍	digital pathology	NA	deep learning	CNN	image	58,479张番茄图像（其中43,894张适合标注，24,000张用于模型训练，13,037张用于模型测试）
208	2025-05-24	Pleural invasion of peripheral cT1 lung cancer by deep learning analysis of thoracoscopic images: a retrospective pilot study 2025-Apr-30, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3 DOI:10.21037/jtd-24-1510 PMID:40400958	研究论文	本研究开发了一种深度学习算法，通过胸腔镜图像预测外周cT1肺癌的胸膜侵犯	首次使用深度学习分析胸腔镜图像来预测胸膜侵犯，为术中评估提供新方法	样本量较小（80例患者），且为回顾性研究	开发预测胸膜侵犯的深度学习算法，以指导手术决策	外周cT1N0M0非小细胞肺癌患者	数字病理	肺癌	深度学习图像分析	ResNet50	图像	80例患者（422,873张图像）
209	2025-05-24	Multimodal radiopathological integration for prognosis and prediction of adjuvant chemotherapy benefit in resectable lung adenocarcinoma: A multicentre study 2025-Apr-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217557 PMID:39954935	研究论文	开发并验证了一个多模态分析框架，整合CT图像和H&E染色的全切片图像（WSIs），以增强肺腺癌（LUAD）患者的风险分层和辅助化疗获益预测	首次整合放射组学和病理组学特征，构建了一个多模态签名，用于预测LUAD患者的预后和辅助化疗获益，其性能优于现有的深度学习方法	研究为回顾性设计，需要前瞻性研究进一步验证	提高肺腺癌患者的风险分层和辅助化疗获益预测的准确性	1039例可切除的肺腺癌患者（I-III期）	数字病理	肺癌	CT成像和H&E染色全切片图像分析	生存支持向量机（SVM）	图像	1039例患者（训练数据集303例，测试数据集197例和228例，特征测试数据集311例）
210	2025-05-24	CPDMS: a database system for crop physiological disorder management 2025-Apr-22, Database : the journal of biological databases and curation DOI:10.1093/database/baaf031 PMID:40402767	研究论文	开发了一个用于实时收集和分析作物生理障碍图像的系统，特别针对番茄的生理障碍	开发了一个可扩展且高效的实时作物图像收集系统，并利用深度学习模型进行图像分析	模型的平均精度(mAP)和召回率仍有提升空间	为精准农业提供实时数据收集和分析工具	番茄的生理障碍	数字农业	番茄细菌性枯萎病(BW)、番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)、番茄斑萎病毒(TSWV)、干旱和盐胁迫	深度学习	深度学习模型	图像	58,479张图像(其中43,894张适合标注，24,000张用于模型训练，13,037张用于模型测试)
211	2025-05-24	Autonomous object tracking with vision based control using a 2DOF robotic arm 2025-Apr-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-97930-3 PMID:40251241	研究论文	本文设计了一种基于视觉控制的2自由度机械臂自主物体追踪系统	提出了一种结合深度学习物体检测框架和基于图像的视觉伺服(IBVS)的新方法，用于2自由度机械臂的追踪控制	仅验证了2自由度机械臂的性能，未测试更高自由度的系统	设计精确且响应迅速的物体追踪系统，解决传统系统复杂、刚性、需要多传感器等问题	2自由度机械臂	机器视觉	NA	基于图像的视觉伺服(IBVS)，深度学习物体检测	深度学习框架	图像	使用CoppeliaSim机器人模拟器和2-DOF机械臂进行仿真和实验验证
212	2025-05-24	Large language models deconstruct the clinical intuition behind diagnosing autism 2025-Apr-17, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2025.02.025 PMID:40147442	research paper	利用深度学习解构专家临床直觉，以改进自闭症诊断标准	通过大型语言模型（LLMs）分析临床报告，揭示自闭症诊断中的关键因素，挑战现有诊断标准	研究依赖于有限的临床报告样本（>4,000份），可能无法涵盖所有自闭症病例的多样性	解构临床专家直觉，改进自闭症诊断标准	自闭症患者的临床报告	natural language processing	autism	large language models (LLMs)	LLMs	text	>4,000份自由格式健康记录
213	2025-05-24	Difficulty aware programming knowledge tracing via large language models 2025-Apr-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-96540-3 PMID:40181055	research paper	该论文提出了一种基于大型语言模型的难度感知编程知识追踪方法（DPKT），用于评估编程问题的文本理解难度和知识概念难度，并动态更新学生的知识状态	结合注意力机制分析知识概念难度与文本理解难度的关系，并采用更新门机制和图注意力网络，显著提高了编程问题难度的评估准确性和知识状态的时空反映能力	未提及具体的数据集规模限制或模型在其他领域的泛化能力	提高编程知识追踪的准确性，促进个性化学习	学生在智能辅导系统中的交互数据	natural language processing	NA	large language models, attention mechanism, graph attention network	DPKT (Difficulty aware Programming Knowledge Tracing)	text	未提及具体样本数量
214	2025-05-24	Personalized Blood Glucose Forecasting From Limited CGM Data Using Incrementally Retrained LSTM 2025-04, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2024.3494732 PMID:39514345	research paper	该研究提出了一种名为增量重训练堆叠LSTM（IS-LSTM）的新型深度学习框架，用于从有限的连续血糖监测（CGM）数据中进行个性化血糖预测	提出增量重训练堆叠LSTM框架，能够逐步适应个体数据并采用参数迁移提高效率，解决了传统方法需要大量训练数据的问题	研究仅针对1型糖尿病患者，未涉及其他类型糖尿病	开发一种能够从有限CGM数据中进行准确血糖预测的个性化方法	1型糖尿病患者的血糖数据	machine learning	糖尿病	连续血糖监测（CGM）	LSTM	时间序列数据	两个CGM数据集：OpenAPS和Replace-BG
215	2025-05-24	Leveraging Natural Language Processing and Machine Learning Methods for Adverse Drug Event Detection in Electronic Health/Medical Records: A Scoping Review 2025-Apr, Drug safety IF:4.0Q1 DOI:10.1007/s40264-024-01505-6 PMID:39786481	综述	本文通过范围综述总结了利用自然语言处理（NLP）和机器学习（ML）技术从非结构化电子健康记录（EHR）数据中检测药物不良事件（ADEs）的有效性	综述了NLP/ML技术在药物警戒中的应用，展示了这些技术在检测未报告的不良事件和发现新的安全信号方面的潜力	研究中存在技术和方法学的异质性，缺乏标准化的方法和验证标准，阻碍了NLP/ML在药物警戒中的广泛应用	评估NLP/ML技术在药物警戒中的应用效果，以提高从非结构化EHR数据中检测ADEs的能力	非结构化电子健康记录（EHR）数据	自然语言处理	NA	自然语言处理（NLP）、机器学习（ML）	基于规则的NLP、统计模型、深度学习	非结构化文本数据	七项研究符合纳入标准
216	2025-05-24	Deep Learning-Based Event Counting for Apnea-Hypopnea Index Estimation Using Recursive Spiking Neural Networks 2025-04, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2024.3498097 PMID:40030371	research paper	提出了一种基于深度学习的递归脉冲神经网络方法RSN-Count，用于家庭环境中睡眠呼吸暂停的筛查，重点在于无需精确定位事件即可可靠估计呼吸暂停低通气指数（AHI）	利用脉冲神经网络直接计数呼吸暂停事件，减少对事件时间精确定位的依赖，提高了AHI估计的准确性	研究样本量较小（N = 33），可能影响结果的普遍性	改进家庭环境中的睡眠呼吸暂停筛查方法	睡眠呼吸暂停患者	machine learning	sleep apnea	Spiking Neural Networks	RSN-Count	audio and SpO recordings	33名患者的整夜音频和血氧记录
217	2025-05-24	Brain-wide 3D neuron detection and mapping with deep learning 2025-Apr, Neurophotonics IF:4.8Q1 DOI:10.1117/1.NPh.12.2.025012 PMID:40401216	research paper	该论文介绍了一种名为NeuronMapper的全脑3D神经元检测与映射方法，利用深度学习技术实现自动化且可靠的神经元检测与定位	提出了一种四阶段框架（预处理、分类、检测和映射），结合轻量级分类网络和基于Video Swin Transformer的分割网络，实现了百万级别小鼠全脑神经元的高精度检测与定位	目前仅在小鼠脑数据上验证，尚未在其他物种或更复杂脑区测试	开发自动化神经元检测与映射技术以理解神经回路功能	小鼠全脑成像数据中的神经元胞体	digital pathology	NA	3D成像、深度学习	Video Swin Transformer	3D图像	百万级别小鼠神经元
218	2025-05-23	Estimating hair density with XGBoost 2025-Apr, International journal of cosmetic science IF:2.7Q2 DOI:10.1111/ics.13030 PMID:39551627	研究论文	本研究探索使用XGBoost算法进行头发密度估计，旨在开发一种更准确和通用的方法	采用XGBoost算法进行头发密度估计，相比之前的方法在测试集上达到了95.3%的准确率，显著优于其他研究	研究仅使用了895张头皮图像，样本量可能不足以覆盖所有临床情况	开发一种更准确和通用的头发密度估计方法	头皮图像	计算机视觉	NA	图像处理	XGBoost	图像	895张头皮图像（745张用于训练，150张用于测试）
219	2025-05-23	Generalizable Magnetic Resonance Imaging-based Nasopharyngeal Carcinoma Delineation: Bridging Gaps Across Multiple Centers and Raters With Active Learning 2025-Apr-01, International journal of radiation oncology, biology, physics DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.11.064 PMID:39557309	研究论文	开发了一种利用主动学习和无源域适应的深度学习方法，用于鼻咽癌（NPC）大体肿瘤体积的勾画，以解决在多中心和多位评估者环境中部署分割模型时的变异性和不准确性问题	结合主动学习和无源域适应技术，显著减少了对目标域标记样本的需求，同时在多中心和多位评估者环境中实现了与全监督模型相当的性能	虽然减少了标记样本的需求，但仍需要一定量的目标域标记数据（20%）进行适应	开发一种能够准确且可推广的鼻咽癌大体肿瘤体积分割方法，以克服多中心和多位评估者环境中的变异性和不准确性	鼻咽癌患者的磁共振成像（MRI）扫描	数字病理	鼻咽癌	主动学习，无源域适应	U-Net	MRI图像	1057例来自5家医院的鼻咽癌患者MRI扫描，以及另外170例由4位独立专家标注的患者数据
220	2025-05-23	Primary angle-closed diseases recognition through artificial intelligence-based anterior segment-optical coherence tomography imaging 2025-Apr, Graefe's archive for clinical and experimental ophthalmology = Albrecht von Graefes Archiv fur klinische und experimentelle Ophthalmologie DOI:10.1007/s00417-024-06709-1 PMID:39680113	研究论文	本研究利用人工智能技术对前段光学相干断层扫描（AS-OCT）图像进行深度学习分类，自动分析AS-OCT图像的角结构并分类前房角，以提高AS-OCT图像分析的效率	开发了一种基于深度学习的AS-OCT图像自动前房角分析软件，并应用迁移学习于ResNet-50架构，实现了高效的前房角闭合检测	样本主要来自上海社区的老年人青光眼筛查项目，可能限制了结果的普适性	提高AS-OCT图像分析的效率，自动化前房角的临床评估	AS-OCT图像	计算机视觉	青光眼	光学相干断层扫描（OCT）	ResNet-50	图像	687名参与者的94895张AS-OCT图像