深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
801	2025-04-26	A novel data-driven screening method of antidepressants stability in wastewater and the guidance of environmental regulations 2025-Apr, Environment international IF:10.3Q1 DOI:10.1016/j.envint.2025.109427 PMID:40188602	研究论文	本研究提出了一种基于数据驱动的抗抑郁药物在废水中稳定性的筛选方法，并构建了MSSL-RealFormer分类模型以预测其稳定性	首次构建了基于理化性质的抗抑郁药物废水稳定性评估框架和MSSL-RealFormer分类模型，预测精度显著高于传统方法	研究仅针对66种抗抑郁药物，样本量相对有限	开发一种快速筛选抗抑郁药物在废水中稳定性的方法，并为环境法规提供指导	66种抗抑郁药物及其在废水中的稳定性	环境科学	NA	密度泛函理论、SHapley Additive exPlanation方法、Ecological Structure Activity Relationships模型	MSSL-RealFormer分类模型	理化性质数据、分子结构数据	66种抗抑郁药物
802	2025-04-26	Greenspace and depression incidence in the US-based nationwide Nurses' Health Study II: A deep learning analysis of street-view imagery 2025-Apr, Environment international IF:10.3Q1 DOI:10.1016/j.envint.2025.109429 PMID:40209395	research paper	该研究利用深度学习分析街景图像，探讨了美国女性中绿地暴露与抑郁症发病率之间的关系	首次使用街景图像而非卫星植被指数来测量绿地暴露，提高了暴露分类的准确性并增强了政策相关性	研究仅针对美国女性护士群体，可能无法推广到其他人群	研究绿地暴露与抑郁症发病率之间的关联	美国女性护士健康研究II的参与者（N=33,490）	computer vision	depression	deep learning segmentation models	CNN	image	350 million US street-view images, 33,490 participants
803	2025-04-26	Toward a unified benchmark and framework for deep learning-based prediction of nuclear magnetic resonance chemical shifts 2025-Apr, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-025-00783-z PMID:40155533	研究论文	本文介绍了NMRNet，一个基于SE(3) Transformer的深度学习框架，用于预测核磁共振化学位移	提出了NMRNet框架，采用SE(3) Transformer进行原子环境建模，并通过预训练和微调范式提升性能	未明确提及具体局限性	推动深度学习在分析和结构化学中的应用	核磁共振化学位移预测模型	机器学习	NA	核磁共振(NMR)	SE(3) Transformer	分子结构数据	基于先前研究和数据库的多样化化学系统数据集
804	2025-04-26	Deep Learning Model for Diagnosing and Classifying Subtypes of Chronic Pulmonary Aspergillosis in Chest CT 2025-Apr, Mycoses IF:4.1Q2 DOI:10.1111/myc.70061 PMID:40277031	研究论文	本研究开发了一种深度学习模型，用于在胸部CT图像中诊断和分类慢性肺曲霉病（CPA）及其亚型	利用人工智能生成技术和半监督学习增强模型性能，特别是在小样本、分布偏斜和多类特征的数据集上	数据集虽然来自多中心，但样本量仍相对较小，且外部测试集的样本数量有限	探索人工智能技术在慢性肺曲霉病诊断和亚型分类中的应用	慢性肺曲霉病（CPA）患者及其CT图像	数字病理学	肺曲霉病	深度学习	多分类模型	CT图像	660名患者的39,387张胸部CT图像用于训练、验证和内部测试，外加11名患者的3,337张CT图像作为外部测试集1，以及其他研究的120张图像作为外部测试集2
805	2025-04-25	Toward Switching and Fusing Neuromorphic Computing: Vertical Bulk Heterojunction Transistors with Multi-Neuromorphic Functions for Efficient Deep Learning 2025-Apr-24, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202419245 PMID:40270224	研究论文	介绍了一种新型垂直体异质结神经形态晶体管（VHNT），能够模拟ANN和SNN的计算功能，用于高效深度学习	提出了一种新型VHNT设备，能够通过简单编程切换为脉冲神经元和自激活神经元，无需辅助电路，显著提高了训练速度和效率	NA	开发高性能、低功耗且环境适应性强的通用人工智能（AGI）设备	垂直体异质结神经形态晶体管（VHNT）	神经形态计算	NA	TaO基电化学反应和PDVT-10/N2200基体异质结	ANN和SNN融合架构	NA	CIFAR-10数据集
806	2025-04-25	Deep Learning Empowered Parallelized Metasurface Computed Tomography Snapshot Spectral Imaging 2025-Apr-24, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202419383 PMID:40270309	研究论文	提出了一种基于生成式深度学习的并行化超表面计算断层扫描技术，用于实现超紧凑的快照光谱成像	将快照光谱成像的光学体积从厘米级减小到亚毫米级，同时保持高分辨率和成像速度	NA	解决快照光谱成像在空间受限场景（如内窥镜辅助脑显微手术和实时细胞组织成像）中的应用问题	快照光谱成像系统	计算机视觉	NA	生成式深度学习	GAN	图像	NA
807	2025-04-25	Unveiling Multi-Scale Architectural Features in Single-Cell Hi-C Data Using scCAFE 2025-Apr-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416432 PMID:40270467	research paper	介绍了一种名为scCAFE的深度学习模型，用于在单细胞水平上检测多尺度染色质结构特征	scCAFE提供了一个统一框架，用于注释单个细胞中的染色质环、TAD样结构域（TLDs）和区室，优于之前的scHi-C环检测方法	NA	分析单细胞基因组结构并实现基于3D基因组特征的精确细胞类型注释	单细胞Hi-C数据中的染色质结构特征	computational biology	NA	single-cell Hi-C (scHi-C)	deep learning model (scCAFE)	genomic data	NA
808	2025-04-25	Mixed Outcomes in Recombination Rates After Domestication: Revisiting Theory and Data 2025-Apr-24, Molecular ecology IF:4.5Q1 DOI:10.1111/mec.17773 PMID:40271548	研究论文	本文探讨了驯化过程中基因组重组率的变化，结合理论、实验室实验和数据分析，比较了家养动物与其野生祖先的重组率	利用群体测序数据和深度学习方法推断基因组范围内的重组率，提供了鸡/红原鸡、绵羊/摩弗伦羊和山羊/野山羊的新比较结果	研究结果在不同物种间不一致，未能提供驯化导致基因组重组率普遍增加的统一证据	验证驯化过程是否间接导致基因组重组率增加的假说	家养动物（鸡、绵羊、山羊）及其野生祖先（红原鸡、摩弗伦羊、野山羊）	基因组学	NA	群体测序、深度学习	深度学习	基因组测序数据	多个物种的比较（鸡/红原鸡、绵羊/摩弗伦羊、山羊/野山羊）
809	2025-04-25	Artificial Intelligence in Panoramic Radiography Interpretation: A Glimpse into the State-of-the-Art Radiologic Examination Method 2025-Apr-24, International journal of computerized dentistry IF:1.8Q2 DOI:10.3290/j.ijcd.b6173229 PMID:40272192	研究论文	本研究开发了一种基于YOLO-v8深度学习模型的人工智能系统，用于全景X光片中多种牙齿问题和解剖结构的准确评估和分割	开发了一个多类别诊断模型，能够同时检测和分割全景X光片中的33种不同牙齿状况和解剖结构，而现有研究通常单独处理这些条件	研究未提及模型在不同设备获取的X光片上的泛化能力测试	开发能够准确评估和分割全景X光片中各种牙齿问题和解剖结构的深度学习模型	全景X光片中的牙齿问题、牙齿修复体、牙科植入物、解剖标志、牙周状况、颌骨病理和根尖周病变	数字病理	牙科疾病	深度学习	YOLO-v8	图像	未明确说明样本数量，但涉及33种不同条件的标注
810	2025-04-25	Role of artificial intelligence in advancing immunology 2025-Apr-24, Immunologic research IF:3.3Q3 DOI:10.1007/s12026-025-09632-7 PMID:40272607	综述	本文探讨了人工智能（AI）在免疫学领域的革命性作用，特别是在疫苗开发、免疫治疗和过敏治疗方面的应用	AI通过分析大量基因组序列和蛋白质结构，帮助识别潜在疫苗候选物并预测机体对不同抗原的反应，同时为癌症患者提供个性化免疫治疗方案	NA	探讨AI在免疫学领域的应用及其对医学研究和医疗保健的推动作用	免疫学领域，包括疫苗开发、免疫治疗、过敏治疗及免疫疾病诊断	人工智能在生物医学中的应用	自身免疫疾病、免疫缺陷、过敏及癌症	机器学习和深度学习	NA	基因组序列、蛋白质结构、患者历史和实验室结果	NA
811	2025-04-25	Unsupervised non-small cell lung cancer tumor segmentation using cycled generative adversarial network with similarity-based discriminator 2025-Apr-23, Journal of applied clinical medical physics IF:2.0Q3 DOI:10.1002/acm2.70107 PMID:40266997	research paper	该研究提出了一种无监督的非小细胞肺癌肿瘤分割方法smic-GAN，通过使用基于相似性的生成对抗网络和循环策略进行训练，无需依赖手动标注数据	提出了一种无监督的肿瘤分割网络smic-GAN，不依赖任何手动标注，减少了训练数据准备的工作量	虽然性能与有监督方法相当，但并未明确指出其在复杂病例或不同数据分布下的泛化能力	开发一种无需手动标注的无监督肿瘤分割方法，以减轻数据准备负担	非小细胞肺癌患者的CT扫描图像	digital pathology	lung cancer	CT扫描	GAN	image	609例肺癌患者的CT扫描（504训练，35验证，70测试）
812	2025-04-25	FedOpenHAR: Federated Multitask Transfer Learning for Sensor-Based Human Activity Recognition 2025-Apr-23, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology IF:1.4Q2 DOI:10.1089/cmb.2024.0631 PMID:40267073	研究论文	介绍FedOpenHAR框架，探索在联邦学习环境中进行多任务迁移学习，用于传感器基础的人类活动识别和设备位置识别任务	提出FedOpenHAR框架，结合联邦学习和迁移学习，支持多任务处理，并允许新客户端利用现有共同层进行训练	需要处理不同数据集中可能仅包含部分标签类型的情况，模型鲁棒性面临挑战	开发适用于传感器基础的人类活动识别和设备位置识别的分布式机器学习方法	穿戴和移动设备收集的运动传感器数据	机器学习	NA	联邦学习，迁移学习	DeepConvLSTM	传感器数据	OpenHAR框架中的十个较小数据集
813	2025-04-25	Deep Learning Model for Histologic Diagnosis of Dysplastic Barrett's Esophagus: Multisite Cohort External Validation 2025-Apr-23, The American journal of gastroenterology DOI:10.14309/ajg.0000000000003495 PMID:40267276	研究论文	本文通过外部验证一种深度学习模型（BEDDLM），用于在巴雷特食管（BE）组织学切片上诊断不典型增生程度	首次在多个外部学术中心验证了深度学习模型（BEDDLM）在巴雷特食管不典型增生诊断中的准确性，并采用了cGANs进行染色标准化和YOLO与ResNet101结合的集成方法	样本量相对有限（489张全切片图像），且主要来自男性患者（84.7%）	提高巴雷特食管不典型增生的诊断准确性，减少人工病理读片中的观察者间变异和过度诊断	巴雷特食管患者的组织学切片（非不典型增生、低级别不典型增生和高级别不典型增生）	数字病理学	食管腺癌	全切片图像分析、cGANs染色标准化	YOLO与ResNet101的集成模型	图像	489张全切片图像（232例非不典型增生，117例低级别不典型增生，140例高级别不典型增生）
814	2025-04-25	Semantic Consistency Network with Edge Learner and Connectivity Enhancer for Cervical Tumor Segmentation from Histopathology Images 2025-Apr-23, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00691-w PMID:40268829	研究论文	提出了一种名为ERNet的端到端语义一致性网络，用于从组织病理学图像中分割宫颈肿瘤	ERNet结合了边缘学习器和连接增强器，有效提升了模型对多形态肿瘤边缘的学习和表示能力，以及分割掩模的像素连接性	虽然模型在宫颈肿瘤图像上表现良好，但在其他类型肿瘤上的泛化能力仅通过喉部肿瘤图像进行了初步验证	提高宫颈肿瘤在组织病理学图像中的分割准确性，以辅助诊断和预后	宫颈肿瘤的组织病理学图像	数字病理学	宫颈癌	深度学习	CNN	图像	NA
815	2025-04-25	An effective model of hybrid adaptive deep learning with attention mechanism for healthcare data analysis in blockchain-based secure transmission over IoT 2025-Apr-23, Network (Bristol, England) DOI:10.1080/0954898X.2025.2492375 PMID:40269520	研究论文	本文提出了一种结合混合自适应深度学习和注意力机制的有效模型，用于区块链安全传输物联网中的医疗数据分析	结合区块链技术和混合自适应深度学习模型，引入FUPOA进行参数优化和密钥生成，提高了数据传输的安全性和隐私性	未提及具体实验数据集规模和实际部署中的性能表现	解决医疗数据在物联网传输中的安全性和隐私性问题	医疗数据的安全传输和存储	机器学习	NA	混合自适应深度学习方法(HADL-AM), FUPOA优化算法	深度学习模型(未明确具体类型)	医疗数据	未明确说明具体样本数量
816	2025-04-25	deep-Sep: a deep learning-based method for fast and accurate prediction of selenoprotein genes in bacteria 2025-Apr-22, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.01258-24 PMID:40062874	research paper	开发了一种基于深度学习的算法deep-Sep，用于快速准确地预测细菌基因组中的硒蛋白基因	使用Transformer-based神经网络架构构建最优模型，结合同源搜索策略减少假阳性，显著优于现有方法	未明确提及算法在极端复杂或高度变异细菌基因组中的表现	开发高效工具以准确识别细菌基因组中的硒蛋白基因	细菌基因组序列	machine learning	NA	深度学习	Transformer-based neural network	基因组序列数据	20个细菌基因组作为独立测试数据集
817	2025-04-25	Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning 2025-Apr-22, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.00183-25 PMID:40105319	研究论文	本研究结合扩散模型和transformer模型，用于增强合成启动子的设计与强度预测	首次将扩散模型应用于合成启动子设计，并结合transformer模型进行强度预测，相比传统方法表现出更高的性能	研究仅针对模型细菌和蓝藻细菌中的启动子，未验证在其他生物系统中的适用性	开发高效的合成启动子设计与预测方法，以优化外源基因表达和代谢途径效率	合成启动子序列及其转录活性	合成生物学	NA	深度学习	扩散模型, transformer	生物序列数据	未明确说明样本数量
818	2025-04-25	An end-to-end neural network for 4D cardiac CT reconstruction using single-beat scans 2025-Apr-22, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adcafb PMID:40203865	研究论文	提出了一种基于深度学习的端到端重建框架，用于单次心跳快速CT扫描的动态心脏成像	使用单次心跳扫描数据，无需多次扫描，减少辐射暴露，尤其适用于心律不齐患者	模型训练依赖于模拟投影数据，可能在实际临床应用中存在差异	减少心脏CT成像中的运动伪影，提高心脏疾病的检测和诊断准确性	心脏CT成像	数字病理	心血管疾病	CT扫描	端到端神经网络	图像	30名真实患者的模拟投影数据
819	2025-04-25	A novel deep learning approach to classify 3D foot types of diabetic patients 2025-Apr-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-98471-5 PMID:40258927	研究论文	提出了一种基于DiffusionNet的新型深度学习方法，用于通过3D足部图像对糖尿病患者的足型进行分类	结合自注意力机制和外部特征，直接使用简单的3D足部图像对糖尿病患者的足型进行六类分类，准确率达到82.9%，超越了现有的机器和深度学习方法	NA	精确分类糖尿病足，以识别足部异常并促进通过足部矫形器工程设计的个性化治疗和预防措施	糖尿病患者的足型	计算机视觉	糖尿病	DiffusionNet	深度学习	3D图像	NA
820	2025-04-25	Securing the CAN bus using deep learning for intrusion detection in vehicles 2025-Apr-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-98433-x PMID:40258975	研究论文	本文评估了深度学习在检测CAN总线网络入侵中的应用	利用LSTM、GRU和VGG-16等深度学习模型分析CAN消息的时间和空间特征，提高了入侵检测的准确率	未提及模型在实时检测中的性能表现以及计算资源消耗	提高智能交通系统（ITS）中CAN总线网络的安全性和韧性	车辆中的CAN总线网络	机器学习	NA	深度学习	RNN, LSTM, GRU, VGG-16	CAN消息序列	Car Hacking, Survival Analysis, 和 OTIDS 数据集