深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1241	2025-04-11	A Folding-Docking-Affinity framework for protein-ligand binding affinity prediction 2025-Apr-07, Communications chemistry IF:5.9Q1 DOI:10.1038/s42004-025-01506-1 PMID:40195508	研究论文	提出了一种名为Folding-Docking-Affinity (FDA)的框架，用于预测蛋白质-配体结合亲和力	结合深度学习和AI技术，首次在无法获得结晶蛋白质-配体结合构象的情况下，通过折叠蛋白质和确定结合构象来预测结合亲和力	未明确提及样本量或具体实验条件，可能影响结果的广泛适用性	提高蛋白质-配体结合亲和力预测的准确性，以促进药物发现	蛋白质和配体的结合亲和力	机器学习和计算生物学	NA	深度学习AI技术	FDA框架	三维蛋白质-配体结合结构	NA
1242	2025-04-11	Accelerated Spine MRI with Deep Learning Based Image Reconstruction: A Prospective Comparison with Standard MRI 2025-Apr, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2024.11.004 PMID:39580249	研究论文	本研究评估了基于深度学习的MRI重建在图像采集时间、整体图像质量和诊断可互换性方面与标准MRI的比较	首次前瞻性比较了深度学习重建MRI与标准MRI在脊柱成像中的性能，证实了深度学习在减少扫描时间和提高图像质量方面的优势	研究样本量相对有限(200名参与者)，且仅针对脊柱不适患者	评估深度学习重建MRI在脊柱成像中的临床应用价值	脊柱不适患者	医学影像分析	脊柱疾病	深度学习图像重建	DL(深度学习模型)	MRI图像	200名参与者(107名男性患者，平均年龄46.56±17.07岁)
1243	2025-04-11	Oral Microbe Community and Pyramid Scene Parsing Network-based Periodontitis Risk Prediction 2025-Apr, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2024.10.019 PMID:39613556	研究论文	本研究结合Pyramid Scene Parsing Network (PSPNet)深度学习模型与牙菌斑微生物数据，开发了一种用于预测牙周炎风险的评分系统	首次将PSPNet深度学习模型与口腔微生物数据结合，用于牙周炎风险的早期预测	样本量相对有限，且数据来源于单一数据库	开发一种可靠、高效且非侵入性的牙周炎早期筛查方法	90名健康对照者和514名牙周炎患者的牙菌斑样本	数字病理	牙周炎	微生物分析	PSPNet	微生物数据	604个牙菌斑样本（90健康对照+514牙周炎患者）
1244	2025-04-11	Radiomics Model Based on Contrast-enhanced CT Intratumoral and Peritumoral Features for Predicting Lymphovascular Invasion in Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma 2025-Apr, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2024.11.017 PMID:39643470	研究论文	基于增强CT肿瘤内和肿瘤周围特征的影像组学模型预测下咽鳞状细胞癌淋巴血管侵犯状态	结合肿瘤内和肿瘤周围的影像组学特征，构建深度学习模型和Nomogram模型，显著提高了对淋巴血管侵犯状态的预测效率	样本量相对较小（166例患者），且仅基于单一医疗中心的回顾性数据	预测下咽鳞状细胞癌（HSCC）患者的淋巴血管侵犯（LVI）状态	166例经病理确认的HSCC患者，其中47例LVI阳性	数字病理学	下咽鳞状细胞癌	增强CT（CECT）影像组学分析	深度学习模型、Nomogram模型	医学影像	166例HSCC患者（47例LVI阳性）
1245	2025-04-11	Feasibility of Sub-milliSievert Low-dose Computed Tomography with Deep Learning Image Reconstruction in Evaluating Pulmonary Subsolid Nodules: A Prospective Intra-individual Comparison Study 2025-Apr, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2024.11.042 PMID:39674695	研究论文	评估使用深度学习图像重建（DLIR）的低剂量计算机断层扫描（LDCT）在评估肺亚实性结节中的可行性	首次全面评估了DLIR在亚毫西弗LDCT中对肺亚实性结节的评估效果，展示了DLIR-H在降低剂量同时保持图像质量的优势	研究样本量相对较小（102名患者），且仅在单一机构进行	评估低剂量CT结合深度学习图像重建技术在肺亚实性结节诊断中的可行性	肺亚实性结节	数字病理	肺癌	计算机断层扫描（CT）、深度学习图像重建（DLIR）	DLIR（深度学习图像重建）	医学影像	102名患者，358个亚实性结节
1246	2025-02-20	Deep Learning with Multiphase CTA and CTP Images for Predicting Hemorrhagic Transformation in Acute Ischemic Stroke Patients 2025-Apr, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2025.02.014 PMID:39966075	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1247	2025-04-11	Cannabidiol-Rich Cannabis sativa L. Extract Alleviates LPS-Induced Neuroinflammation Behavioral Alterations, and Astrocytic Bioenergetic Impairment in Male Mice 2025-Apr, Journal of neuroscience research IF:2.9Q2 DOI:10.1002/jnr.70035 PMID:40195769	研究论文	本研究探讨了富含大麻二酚(CBD)的大麻提取物在脂多糖(LPS)诱导的神经炎症小鼠模型中的神经保护潜力	相比合成CBD，大麻提取物在缓解LPS诱导的焦虑样行为、认知缺陷和运动障碍方面表现出更优的疗效，并通过计算模型揭示了Delta-9-THC诱导的CB1受体构象变化增强了CBD结合	研究仅使用雄性小鼠，且需要进一步的临床探索	探索大麻提取物在神经炎症和相关神经退行性疾病中的治疗潜力	LPS诱导的神经炎症小鼠模型	神经科学	神经退行性疾病	定量逆转录聚合酶链反应(QRt-PCR)、细胞外通量测定、深度学习计算推断	深度学习	行为测试数据、生化指标、基因表达数据	未明确提及样本数量，仅说明使用雄性小鼠
1248	2025-04-11	Deep Learning Applications in Imaging of Acute Ischemic Stroke: A Systematic Review and Narrative Summary 2025-Apr, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.240775 PMID:40197098	系统性综述	本文系统综述了深度学习在急性缺血性卒中（AIS）影像学中的应用，并总结了当前技术的现状和发展机会	全面评估了深度学习在AIS影像学中的多种应用，包括自动检测大血管闭塞和测量Alberta卒中项目早期CT评分，并突出了公共AIS数据集的重要性	需要标准化协议和测试集、更大的公共数据集以及在真实世界环境中的性能验证	评估深度学习在成人AIS患者影像学中的应用，提供技术现状的全面概述并识别发展机会	急性缺血性卒中（AIS）的影像学数据	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	CNN, transformers	影像	380项研究（其中68项进行了详细数据提取）
1249	2025-04-11	CBD: Coffee Beans Dataset 2025-Apr, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2025.111434 PMID:40201542	research paper	介绍了一个名为CBD的高质量咖啡豆数据集，用于支持机器学习和深度学习模型在咖啡豆分类和分级中的应用	提供了包含450张高分辨率图像的咖啡豆数据集，涵盖9种不同的咖啡豆等级，旨在解决咖啡质量评估中的关键挑战	数据集的样本来源仅限于印度喀拉拉邦的Wayanad地区，可能无法代表全球咖啡豆的多样性	开发先进的咖啡豆分类技术，提高咖啡质量评估和分类准确性	咖啡豆	computer vision	NA	NA	EfficientNet-B0	image	450张高分辨率图像，涵盖9种咖啡豆等级，每类50张
1250	2025-04-10	Smectic-like bundle formation of planktonic bacteria upon nutrient starvation 2025-Apr-09, Soft matter IF:2.9Q2 DOI:10.1039/d4sm01117a PMID:40126189	研究论文	研究细菌在营养匮乏条件下形成束状聚集体的集体行为	发现营养匮乏导致细菌细胞排列成类似近晶液晶的束状结构，并通过深度学习评估其有序程度	未明确提及具体局限性	探索环境变化对细菌聚集行为的影响	浮游细菌	微生物学	NA	深度学习	NA	实验观察数据	未明确提及具体样本数量
1251	2025-04-10	Transformer-based deep learning structure-conductance relationships in gold and silver nanowires 2025-Apr-09, Physical chemistry chemical physics : PCCP IF:2.9Q1 DOI:10.1039/d4cp04605f PMID:40152302	研究论文	本研究利用基于Transformer的深度学习模型预测金和银纳米线的结构-电导关系	首次将Transformer神经网络应用于纳米线电导预测，展示了其在处理长、大及结构不同纳米线时的稳定性、准确性和可扩展性	模型训练数据主要来自模拟而非实际实验数据	建立纳米线结构与其电导特性之间的关系	金和银纳米线	机器学习	NA	分子动力学模拟(MD)与神经网络势能	Transformer	模拟数据	大量金和银纳米线结结构
1252	2025-04-10	Deep Learning with Reflection High-Energy Electron Diffraction Images to Predict Cation Ratio in Sr2xTi2(1-x)O3 Thin Films 2025-Apr-09, Nano letters IF:9.6Q1 DOI:10.1021/acs.nanolett.5c00787 PMID:40163590	研究论文	本研究利用深度学习技术预测SrTiO薄膜的化学计量比，通过反射高能电子衍射图像进行分析	使用门控卷积神经网络对小样本（31个样本）进行回归训练，实现了准确的预测，并通过可解释AI技术揭示了衍射条纹特征与阳离子化学计量之间的未知相关性	样本量较小（仅31个样本）	加速、理解和控制薄膜合成过程，揭示合成条件与材料性能之间的关系	SrTiO薄膜的化学计量比	机器学习	NA	反射高能电子衍射（RHEED）	门控卷积神经网络（Gated CNN）	图像	31个样本
1253	2025-04-10	Portal dose image prediction using Monte Carlo generated transmission energy fluence maps of dynamic radiotherapy treatment plans: a deep learning approach 2025-Apr-09, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/adc73f PMID:40164089	research paper	本研究开发并探讨了一种结合蒙特卡洛模拟和深度学习的混合模型，用于预测基于动态放射治疗计划的电子门户成像设备图像	结合蒙特卡洛模拟和深度学习方法来预测放射治疗中的电子门户成像设备图像，为剂量学质量保证提供新方法	模型在简单和复杂变体中的伽马通过率存在差异，表明模型性能有待进一步优化	开发一种用于放射治疗剂量学质量保证的混合模型	动态放射治疗计划中的电子门户成像设备图像	machine learning	various cancer types	Monte Carlo simulations, deep learning	U-Net	image	17 clinical treatment plans
1254	2025-04-10	Pulmonary Embolism Survival Prediction Using Multimodal Learning Based on Computed Tomography Angiography and Clinical Data 2025-Apr-09, Journal of thoracic imaging IF:2.0Q3 DOI:10.1097/RTI.0000000000000831 PMID:40200808	研究论文	本研究利用深度学习模型结合CT肺动脉造影（CTPA）、临床数据和PE严重指数（PESI）评分预测肺栓塞（PE）患者的生存率	首次将CTPA影像特征、临床变量和PESI评分结合，通过多模态深度学习模型预测PE生存率，并验证了其优于单独使用PESI评分的性能	研究为回顾性设计，样本来自3个机构可能存在选择偏倚，未进行外部验证	开发预测肺栓塞患者生存率的AI模型	918名肺栓塞患者（3978次CTPA扫描）	数字病理	心血管疾病	CTPA影像分析、深度学习	多模态深度学习模型、CoxPH模型	医学影像（CTPA）、临床数据	918名患者（3978次CTPA扫描）
1255	2025-04-10	Cross-institutional validation of a polar map-free 3D deep learning model for obstructive coronary artery disease prediction using myocardial perfusion imaging: insights into generalizability and bias 2025-Apr-08, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1 DOI:10.1007/s00259-025-07243-w PMID:40198356	研究论文	本研究探讨了基于心肌灌注成像（MPI）的深度学习模型在预测阻塞性冠状动脉疾病（CAD）时的跨机构泛化能力和潜在偏差	首次验证了无极性图的3D深度学习模型在不同医疗机构和人口统计学群体中的性能差异，并识别了与压力类型和患者年龄相关的偏差	模型在外部验证队列中的性能显著低于内部验证队列，且在跑步机压力MPI患者和70岁以上患者中表现较差	评估深度学习模型在预测阻塞性冠状动脉疾病时的跨机构泛化能力和潜在偏差	来自台湾两个医疗中心的接受应激/再分布铊-201 MPI检查的患者	数字病理学	心血管疾病	心肌灌注成像（MPI）	3D深度学习模型	医学影像	内部验证集933张图像，外部验证集3234张图像（来自另一个中心）
1256	2025-04-10	Enhancing Burn Diagnosis through SE-ResNet18 and Confidence Filtering 2025-Apr-08, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01495-6 PMID:40199834	research paper	提出一种基于深度学习的烧伤严重程度分类方法，通过改进的ResNet18架构和置信度过滤提高分类准确率	采用集成了注意力机制的增强型ResNet18架构，结合自适应学习率优化策略和置信度过滤后处理模块	实验仅在烧伤皮肤测试数据集上进行验证，未涉及更广泛的临床场景	提升烧伤严重程度分类的准确性和实时性，以支持临床治疗决策	烧伤皮肤图像	computer vision	烧伤	深度学习	SE-ResNet18	image	烧伤皮肤测试数据集（具体数量未说明）
1257	2025-04-10	Interpretable deep learning method to predict wound healing progress based on collagen fibers in wound tissue 2025-Apr-07, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110110 PMID:40198981	research paper	提出一种基于胶原纤维的深度学习方法来预测伤口愈合进程，并增强模型决策的可解释性	结合LayerCAM和Guided Backpropagation的可解释框架，无需像素级标注即可定位胶原纤维区域	未提及模型在更大规模或多样化数据集上的泛化能力	建立基于胶原纤维特征的伤口愈合状态分类方法	皮肤组织的组织学图像	digital pathology	wound healing	histological imaging	VGG16	image	未明确说明样本数量，涉及正常皮肤、0/3/7/10天伤口皮肤及糖尿病伤口皮肤
1258	2025-04-10	Detection of COVID-19, lung opacity, and viral pneumonia via X-ray using machine learning and deep learning 2025-Apr-07, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110131 PMID:40198984	research paper	该研究结合机器学习和深度学习技术，通过X光图像自动诊断COVID-19及其他肺部疾病	采用CNN、SVM及迁移学习技术（如ResNet18、EfficientNet-CNN和Xception-CNN），在X光图像分类中达到高准确率（最高99.20%）	数据集多样性和代表性不足，可能影响模型的泛化能力	提升COVID-19及其他肺部疾病的早期诊断效率和准确性	胸部X光图像	digital pathology	COVID-19, lung opacity, viral pneumonia	machine learning, deep learning, transfer learning	CNN, SVM, ResNet18, EfficientNet-CNN, Xception-CNN	image	21,165张胸部X光图像
1259	2025-04-10	Real-world validation of a deep learning algorithm for chest radiography in the emergency department: A tale of two specialties 2025-Apr-07, Diagnostic and interventional imaging IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.diii.2025.03.008 PMID:40199640	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1260	2025-04-10	Deep spatio-temporal dependent convolutional LSTM network for traffic flow prediction 2025-Apr-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-95711-6 PMID:40189608	研究论文	提出了一种名为STDConvLSTM的深度学习算法，用于解决交通流量预测中的空间和时间不平衡问题	设计了空间依赖的注意力机制和时间依赖的注意力机制，分别解决空间不平衡和时间不平衡问题	未提及具体局限性	准确预测交通流量以支持智能交通系统和智慧城市建设	交通流量数据	机器学习	NA	深度学习	STDConvLSTM（结合CNN和LSTM）	时间序列数据	两个真实世界的数据集