深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1401	2025-03-09	Latent Weight Quantization for Integerized Training of Deep Neural Networks 2025-Apr, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2025.3527498 PMID:40030978	研究论文	本文提出了一种用于深度神经网络整数化训练的潜在权重量化方案，旨在减少量化对训练过程的扰动	首次提出了一种通用的整数化训练潜在权重量化方案，通过残差量化和优化的双量化器最小化量化扰动	未明确提及具体限制，但可能涉及硬件实现的复杂性和对不同架构的适应性	提高深度神经网络整数化训练的效率和性能	深度神经网络，包括ResNets、MobileNetV2和Transformers	机器学习	NA	残差量化和双量化器	ResNets, MobileNetV2, Transformers	图像和文本	未明确提及具体样本数量，但涉及多种架构和任务
1402	2025-03-09	Torsion Graph Neural Networks 2025-Apr, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2025.3528449 PMID:40030998	研究论文	本文提出了一种新的图神经网络模型TorGNN，通过引入解析扭转来增强图神经网络对非欧几里得数据的分析能力	TorGNN模型创新性地使用解析扭转作为边权重，以捕捉图局部结构的拓扑信息，从而提升图神经网络的性能	NA	提升图神经网络在非欧几里得数据分析中的性能	图神经网络模型及其在链接预测和节点分类任务中的应用	机器学习	NA	解析扭转	图神经网络（GNN）	图数据	16种不同类型的网络用于链接预测任务，4种类型的网络用于节点分类任务
1403	2025-03-09	Characterizing diverse maize varieties under organic cultivation: phenotypic, yield, and canopy data from VIT Vellore 2025-Apr, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.110367 PMID:40051419	研究论文	本文介绍了在有机栽培条件下不同玉米品种的表型、产量和冠层数据，旨在评估品种性能并促进作物改良	提供了有机栽培条件下八个玉米品种的详细数据集，包括表型、产量、冠层温度和叶绿素读数，为未来育种和深度学习模型构建提供了基础数据	研究仅基于单一地点的有机栽培数据，可能无法完全反映其他环境条件下的品种表现	评估不同玉米品种在有机栽培条件下的表现，为作物改良和育种提供数据支持	八个玉米品种，包括四个来自IIMR的新品种和四个本地栽培品种	农业科学	NA	ANOVA (FRBD)	NA	表型数据、产量数据、冠层温度数据、叶绿素数据	160株玉米植株（每个品种20株，每个重复5株）
1404	2025-03-08	Optimizing Catheter Verification: An Understandable AI Model for Efficient Assessment of Central Venous Catheter Placement in Chest Radiography 2025-Apr-01, Investigative radiology IF:7.0Q1 DOI:10.1097/RLI.0000000000001126 PMID:39724590	研究论文	本研究旨在通过分割支持材料和解剖结构来提高中心静脉导管（CVC）错位检测的精确性和可理解性	结合分类网络和分割网络的深度学习模型，提高了CVC错位检测的准确性和临床可解释性	研究中使用的数据集可能存在标签不准确的问题，且模型的泛化能力需要进一步验证	提高中心静脉导管（CVC）错位检测的准确性和临床可解释性	中心静脉导管（CVC）在胸部X光片中的位置	医学影像分析	NA	深度学习	分类网络、分割网络及其组合	胸部X光片	1006张带注释的仰卧胸部X光片
1405	2025-03-08	Assessment of Emphysema on X-ray Equivalent Dose Photon-Counting Detector CT: Evaluation of Visual Scoring and Automated Quantification Algorithms 2025-Apr-01, Investigative radiology IF:7.0Q1 DOI:10.1097/RLI.0000000000001128 PMID:39729642	研究论文	本研究评估了在X射线等效剂量光子计数探测器CT上使用视觉评分、低衰减体积（LAV）和深度学习方法估计肺气肿范围的可行性和效果，旨在探索未来剂量减少的潜力	首次在X射线等效剂量光子计数探测器CT上评估了视觉评分和自动化量化算法在肺气肿估计中的应用，并探索了剂量减少的潜力	深度学习和LAV算法在X射线剂量扫描中高估了肺气肿范围	评估在X射线等效剂量光子计数探测器CT上估计肺气肿范围的可行性和效果	101名前瞻性入组的患者	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	CT扫描、深度学习方法	深度学习模型	图像	101名患者
1406	2025-03-08	FusionNet: Dual input feature fusion network with ensemble based filter feature selection for enhanced brain tumor classification 2025-Apr-01, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2025.149507 PMID:39970997	研究论文	本文提出了一种名为FusionNet的新方法，利用正常和分割的MRI图像来提高脑肿瘤分类的准确性	FusionNet结合了正常和分割的MRI图像，使用基于注意力机制和集成特征选择的方法来优先考虑相关特征，从而提高分类性能	NA	提高脑肿瘤分类的准确性	脑肿瘤	计算机视觉	脑肿瘤	深度学习	FusionNet	MRI图像	多个数据集（Figshare, Kaggle, Sartaj, 组合数据集）
1407	2025-03-08	Lightweight sparse optoacoustic image reconstruction via an attention-driven multi-scale wavelet network 2025-Apr, Photoacoustics IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.pacs.2025.100695 PMID:40046019	研究论文	本文提出了一种轻量级的稀疏光声图像重建网络AD-WaveNet，通过结合离散二维小波变换和自适应注意力机制，提高了稀疏采样下的图像重建质量并降低了计算复杂度	AD-WaveNet网络创新性地将离散二维小波变换与自适应注意力机制相结合，利用小波变换的多尺度分解特性，强调不同尺度下的关键特征，从而在降低计算复杂度和参数量的同时保持最佳重建质量	NA	提高稀疏采样下光声断层扫描（PAT）图像的重建质量，并降低计算复杂度	光声断层扫描（PAT）图像	计算机视觉	NA	离散二维小波变换（DWT）	AD-WaveNet	图像	NA
1408	2025-03-06	Deep Learning-Powered CT-Less Multitracer Organ Segmentation From PET Images: A Solution for Unreliable CT Segmentation in PET/CT Imaging 2025-Apr-01, Clinical nuclear medicine IF:9.6Q1 DOI:10.1097/RLU.0000000000005685 PMID:39883026	研究论文	本研究开发了一种不依赖CT图像的PET器官分割框架，利用深度学习模型对两种常用PET示踪剂进行多器官分割	提出了一种不依赖CT图像的PET器官分割方法，解决了PET/CT成像中CT分割不可靠的问题	研究中排除了PET和CT图像不匹配的病例，可能影响模型的泛化能力	开发一种不依赖CT图像的PET器官分割框架，以解决PET/CT成像中CT分割不可靠的问题	2062例PET/CT图像，包括18 F-FDG和68 Ga-PSMA两种示踪剂	数字病理学	NA	深度学习	nnU-Net	PET/CT图像	2062例PET/CT图像
1409	2025-03-05	Toward automated detection of microbleeds with anatomical scale localization using deep learning 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103415 PMID:39642804	研究论文	本文提出了一种新颖的3D深度学习框架，用于自动检测脑微出血（CMBs）并识别其在大脑中的解剖位置	提出了一种结合3D U-Net和区域提议网络（RPN）的单端到端模型，并引入了特征融合模块（FFM）和硬样本原型学习（HSPL）来减少假阳性	未提及具体的数据集大小或多样性限制	自动检测脑微出血并识别其解剖位置，以提高检测准确性和减少假阳性	脑微出血（CMBs）	计算机视觉	脑血管疾病	深度学习	3D U-Net, RPN	3D图像（SWI和相位图像）	未提及具体样本数量
1410	2025-03-05	Comparative benchmarking of failure detection methods in medical image segmentation: Unveiling the role of confidence aggregation 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103392 PMID:39657400	研究论文	本文介绍了一个全面的基准测试框架，用于评估医学图像分割中的失败检测方法	提出了一个综合的基准测试框架，并强调了像素置信度聚合的重要性，发现成对Dice分数在集成预测之间的优越性能	研究中使用的数据集仅限于五个公共3D医学图像集合，可能无法涵盖所有临床场景	评估医学图像分割中的失败检测方法，以提高其在真实临床应用中的可靠性	医学图像分割中的失败检测方法	数字病理	NA	深度学习算法	NA	3D医学图像	五个公共3D医学图像集合
1411	2025-03-05	AutoFOX: An automated cross-modal 3D fusion framework of coronary X-ray angiography and OCT 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103432 PMID:39700845	研究论文	本文提出了一种自动化的跨模态3D融合框架AutoFOX，用于冠状动脉X射线血管造影（XA）和光学相干断层扫描（OCT）的融合，以改善冠状动脉疾病的诊断和预后	AutoFOX框架首次采用了先进的侧支管腔重建算法，增强了分叉病变的评估，并通过深度学习模型TransCAN实现了3D血管对齐，显著提高了对齐精度	尽管AutoFOX在3D对齐和分叉病变评估方面表现出色，但其在临床应用中的广泛推广仍需进一步的多中心验证和优化	开发一种自动化的3D融合框架，以提高冠状动脉疾病的诊断和预后评估	冠状动脉X射线血管造影（XA）和光学相干断层扫描（OCT）数据	数字病理学	心血管疾病	深度学习	TransCAN	3D图像	多中心数据集
1412	2025-03-05	DDoCT: Morphology preserved dual-domain joint optimization for fast sparse-view low-dose CT imaging 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103420 PMID:39705821	研究论文	本文提出了一种名为DDoCT的双域联合优化低剂量CT成像框架，旨在通过减少管电流和投影数量来降低辐射剂量，同时解决由此引入的噪声和伪影问题	DDoCT框架在投影和图像域中进行联合优化，不仅解决了减少管电流引入的噪声，还特别关注了减少投影数量引起的条纹伪影问题，提升了在快速低剂量CT成像环境中的适用性	NA	开发一种能够在减少辐射剂量的同时，有效降低噪声和伪影的低剂量CT成像方法	低剂量CT成像	计算机视觉	NA	CT成像	深度学习	图像	NA
1413	2025-03-05	Personalized dental crown design: A point-to-mesh completion network 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103439 PMID:39705822	研究论文	本文介绍了一种端到端的深度学习模型，用于自动生成个性化的牙冠网格	提出了一种结合特征提取器和基于transformer的模型，以及点对网格模块的深度学习模型，用于牙冠设计，显著减少了Chamfer距离和MSE	未提及具体的数据集大小或模型在不同临床环境中的泛化能力	开发一种自动生成个性化牙冠的深度学习模型，以提高牙冠设计的效率和准确性	牙冠设计	计算机视觉	NA	深度学习	transformer, 点对网格模块	点云数据	未提及具体样本数量
1414	2025-03-05	SurgiTrack: Fine-grained multi-class multi-tool tracking in surgical videos 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103438 PMID:39708509	研究论文	本文提出了一种名为SurgiTrack的新型深度学习方法，用于在手术视频中进行精细的多类别多工具跟踪	SurgiTrack利用YOLOv7进行精确的工具检测，并采用注意力机制建模工具的起始方向，作为操作者的代理，以实现工具重新识别	手术视频中未明确捕捉到操作者的信息，工具在遮挡或重新插入体内后的重新识别仍然具有挑战性	提高手术视频中工具跟踪的准确性和灵活性，以支持计算机辅助干预的成功	手术视频中的多类别多工具	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv7, 注意力机制	视频	CholecTrack20数据集
1415	2025-03-05	TractGraphFormer: Anatomically informed hybrid graph CNN-transformer network for interpretable sex and age prediction from diffusion MRI tractography 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2025.103476 PMID:39870000	研究论文	本文介绍了一种名为TractGraphFormer的混合图CNN-Transformer深度学习框架，用于从扩散MRI纤维束成像中预测性别和年龄	TractGraphFormer结合了局部解剖特征和全局特征依赖，通过图CNN模块捕捉白质几何和灰质连接性，并通过Transformer模块增强全局信息学习，同时包含一个注意力模块用于解释预测性白质连接	NA	研究目的是通过扩散MRI纤维束成像预测个体的性别和年龄	研究对象包括儿童（n = 9345）和年轻成年人（n = 1065）	数字病理学	NA	扩散MRI纤维束成像	Graph CNN-Transformer	图像	儿童（n = 9345）和年轻成年人（n = 1065）
1416	2025-03-05	Application-driven validation of posteriors in inverse problems 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2025.103474 PMID:39892221	研究论文	本文提出了一个系统框架，用于在逆问题中基于应用需求验证后验方法	首次将目标检测验证中的关键原则应用于后验方法的验证，提出了模式中心验证方法	未提及具体局限性	解决逆问题中多解情况下的后验方法验证问题	后验方法（如条件扩散模型和可逆神经网络）	计算机视觉	NA	NA	条件扩散模型、可逆神经网络	图像	NA
1417	2025-03-05	DSAM: A deep learning framework for analyzing temporal and spatial dynamics in brain networks 2025-Apr, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2025.103462 PMID:39892220	研究论文	本文提出了一种名为DSAM的深度学习框架，用于分析脑网络中的时空动态	DSAM框架通过时间因果卷积网络捕捉时间动态，使用时间注意单元识别重要时间点，自注意单元构建目标特定的连接矩阵，并采用图神经网络的变体捕捉空间动态，用于下游分类	NA	研究目标是开发一种深度学习框架，以更好地理解脑网络中的时空动态	研究对象为人类脑网络，具体使用了Human Connectome Project数据集和Adolescent Brain Cognitive Development数据集	机器学习	NA	rs-fMRI	图神经网络	时间序列数据	Human Connectome Project数据集包含1075个样本，Adolescent Brain Cognitive Development数据集包含8520个样本
1418	2025-03-05	ResGEM: Multi-Scale Graph Embedding Network for Residual Mesh Denoising 2025-Apr, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2024.3378309 PMID:38498760	研究论文	本文提出了一种新的多尺度图嵌入网络ResGEM，用于残差网格去噪，通过并行处理法线和顶点分支来平衡平滑度和几何细节	引入了ResGEM，一种新的图卷积网络，具有多尺度嵌入模块和残差解码结构，用于网格去噪，并提出新的正则化项以增强网络的平滑和泛化能力	NA	提高3D网格去噪的精度和效率，特别是在处理具有不规则拓扑结构的网格时	噪声污染的3D网格	计算机视觉	NA	图卷积网络(GCNs)	ResGEM	3D网格数据	合成和真实扫描的数据集
1419	2025-03-04	A comparative analysis of deep learning and chemometric approaches for spectral data modeling 2025-Apr-15, Analytica chimica acta IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.aca.2025.343766 PMID:40024653	研究论文	本研究对五种不同的光谱数据分析建模方法进行了全面比较，包括PLS结合经典化学计量学预处理、iPLS结合经典预处理或小波变换、LASSO结合小波变换以及CNN结合光谱预处理	提供了预处理方法和模型组合的详尽比较，发现在低数据量环境下无法预先确定最优的预处理和模型组合	研究仅限于低维案例研究，可能无法推广到高维数据	比较不同建模方法在光谱数据分析中的性能	啤酒数据集和废润滑油数据集	机器学习	NA	PLS, iPLS, LASSO, CNN, 小波变换	PLS, iPLS, LASSO, CNN	光谱数据	啤酒数据集40个训练样本，废润滑油数据集273个训练样本
1420	2025-03-04	Contrastive learning in brain imaging 2025-Apr, Computerized medical imaging and graphics : the official journal of the Computerized Medical Imaging Society IF:5.4Q1 DOI:10.1016/j.compmedimag.2025.102500 PMID:39889467	研究论文	本文探讨了对比学习在脑成像中的应用及其作为一种无需数据标注的深度学习技术的潜力	对比学习通过将数据映射到潜在空间，并假设同类样本在潜在空间中应彼此接近，不同类样本应彼此远离，从而在无需标注的情况下学习数据的代表性特征	未明确提及具体的研究限制	研究对比学习在医学图像处理和分析中的应用	脑成像数据	医学影像	NA	对比学习	深度学习	图像	NA