深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
701	2025-10-07	Systematic review of computational techniques, dataset utilization, and feature extraction in electrocardiographic imaging 2025-May, Medical & biological engineering & computing IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11517-024-03264-z PMID:39779645	系统综述	系统分析心电图成像中计算技术、数据集利用和特征提取的研究现状	首次采用PRISMA方法系统综述ECGI重建中的计算技术发展趋势，揭示传统方法与深度学习技术的融合趋势	仅纳入2010-2023年英文同行评审论文，排除未描述计算技术的研究	分析ECGI重建中的计算技术，重点关注数据集识别、问题解决和特征提取方法	从Scopus和Web of Science数据库筛选的99篇研究论文	医学影像分析	心血管疾病	ECGI（心电图成像）	深度学习, 混合技术	心电图数据	99篇研究论文	NA	边界元法, Tikhonov方法	NA	NA
702	2025-10-07	Evolution Trend of Brain Science Research: An Integrated Bibliometric and Mapping Approach 2025-May, Brain and behavior IF:2.6Q3 DOI:10.1002/brb3.70451 PMID:40395088	研究论文	本研究采用文献计量分析和知识图谱可视化方法，描绘脑科学研究的全球趋势、研究热点和合作网络	首次对脑科学领域进行全面的文献计量分析，整合CiteSpace和VOSviewer工具，揭示该领域的研究前沿和关键发展方向	仅基于Web of Science数据库的13,590篇文章进行分析，可能未涵盖所有相关研究	分析脑科学研究的演变趋势和发展格局	1990-2023年间发表的脑科学研究文献	文献计量学	脑科学相关疾病	文献计量分析，知识图谱可视化	NA	文献数据	13,590篇文献	CiteSpace, VOSviewer	NA	发文量，合作网络，引用模式，关键词共现，突发检测	在线文献计量平台
703	2025-10-07	Hybrid optimized temporal convolutional networks with long short-term memory for heart disease prediction with deep features 2025-May, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3 DOI:10.1080/10255842.2024.2310075 PMID:38584483	研究论文	提出一种结合时序卷积网络和长短期记忆网络的混合深度学习模型用于心脏病预测	使用新型增强型法医调查启发的元优化算法优化混合分类器参数，并采用1DCNN进行深度特征提取	NA	开发心脏病早期预测模型以帮助患者及时获得治疗	心脏病患者临床数据	机器学习	心血管疾病	深度学习	1DCNN, TCN, LSTM	临床医疗数据	NA	NA	一维卷积神经网络, 时序卷积网络, 长短期记忆网络	准确率, 精确率	NA
704	2025-10-07	ESMpHLA: Evolutionary Scale Model-Based Deep Learning Prediction of HLA Class I Binding Peptides 2025-May, HLA IF:5.9Q1 DOI:10.1111/tan.70263 PMID:40405507	研究论文	本研究开发了一种基于进化尺度模型和深度学习的ESMpHLA模型，用于预测HLA I类分子结合肽	首次将进化尺度模型(ESM)与并行CNN块和交叉注意力机制相结合构建HLA结合肽预测模型	NA	预测HLA I类分子与肽段的结合亲和力，为免疫识别研究和疫苗开发提供支持	HLA I类分子结合肽	生物信息学	免疫相关疾病	深度学习	CNN,注意力机制	肽序列数据	150,735条结合肽(41个HLA-A等位基因的91,560条，50个HLA-B等位基因的56,731条，10个HLA-C等位基因的2,444条)	NA	并行CNN块,交叉注意力机制	准确率,AUC,ROC-AUC,PR-AUC	NA
705	2025-10-07	Comparison and analysis of major research methods for non-destructive testing of wind turbine blades 2025-May-01, The Review of scientific instruments DOI:10.1063/5.0252130 PMID:40407392	综述	通过文献计量分析对风力涡轮机叶片无损检测方法进行分类比较，并探讨多方法融合与智能算法应用趋势	系统对比六种主要无损检测技术，重点分析多方法集成与深度学习等智能算法的应用前景	未涉及具体实验验证，主要基于文献分析	指导风电从业人员选择叶片健康监测技术，促进风电行业可持续发展	风力涡轮机叶片	工业检测	NA	应变数据监测, 振动数据监测, 声学测量, 超声检测, 热成像, 图像识别	深度学习	应变数据, 振动数据, 声学信号, 超声信号, 热图像, 视觉图像	NA	NA	NA	NA	NA
706	2025-05-23	Molecular insights fast-tracked: AI in biosynthetic pathway research 2025-May-22, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d4np00003j PMID:40130306	综述	本文探讨了人工智能在生物合成途径研究中的潜力，以加速分子洞察并应对相关挑战	综述了AI技术在生物合成途径研究中的应用，包括机器学习、深度学习、自然语言处理等多种技术，并讨论了AI在途径发现、设计和优化中的具体应用	指出了当前AI在生物合成途径研究中的局限性，并强调了AI与实验方法协同的重要性	探讨AI如何加速生物合成途径研究，以开发具有药理学、农业和生物技术应用的生物活性天然产物	生物合成途径研究	机器学习	NA	机器学习(ML)、深度学习(DL)、自然语言处理、网络分析、数据挖掘	NA	组学数据	NA	NA	NA	NA	NA
707	2025-05-23	On factors that influence deep learning-based dose prediction of head and neck tumors 2025-May-22, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adcfeb PMID:40267938	研究论文	本研究探讨了影响基于深度学习的头颈部肿瘤剂量预测模型的关键因素	系统分析了输入和剂量网格分辨率、输入类型、损失函数、模型架构和噪声对模型性能的影响，并提出了优化建议	仅使用了两个数据集（一个公共数据集和一个内部临床数据集），可能限制了结果的普适性	评估深度学习模型在头颈部癌症放射治疗剂量预测中的准确性、鲁棒性和计算效率	头颈部肿瘤的放射治疗剂量预测	数字病理	头颈部癌症	深度学习	SwinUNETR	CT图像和剂量网格数据	两个数据集（OpenKBP公共数据集和内部临床数据集）	NA	NA	NA	NA
708	2025-05-23	Quantum-Chemical Simulation of Multiresonance Thermally Activated Delayed Fluorescence Materials Based on B,N-Heteroarenes Using Graph Neural Networks 2025-May-22, The journal of physical chemistry. A DOI:10.1021/acs.jpca.5c01243 PMID:40338523	研究论文	本研究开发了一种基于B,N-杂芳烃的多共振热激活延迟荧光（MR-TADF）材料的简单分子设计方法，并利用图神经网络加速了MR-TADF发射体的搜索	提出了一种基于π扩展DABNA核心的简单分子设计方法，并开发了基于深度学习的加速搜索工具，用于预测MR-TADF发射体的能量值	NA	开发高效、窄带发射的MR-TADF材料，用于下一代电致发光器件	基于B,N-杂芳烃的MR-TADF材料	机器学习	NA	密度泛函理论，深度学习	图神经网络	化学分子数据	18种不同的环状系统修饰的化合物	NA	NA	NA	NA
709	2025-05-23	Whole-body CT-to-PET synthesis using a customized transformer-enhanced GAN 2025-May-22, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/add8dd PMID:40367973	research paper	提出了一种基于深度学习的全身CT到PET图像合成方法，使用定制的transformer增强GAN模型	提出了一个结合残差块和全连接transformer残差块的CPGAN模型，能够同时捕捉局部特征和全局上下文信息，并设计了包含结构一致性的定制损失函数以提高合成PET图像的质量	CT图像本身无法直接反映代谢组织的生物信息	开发一种能够从CT图像合成高质量PET图像的深度学习方法，以减少对实际PET-CT扫描的依赖	全身CT和PET图像	digital pathology	tumors	深度学习	transformer-enhanced GAN (CPGAN)	3D和2D医学图像	102对3D CT和PET扫描，切片为27,240对2D图像（训练21,855对，验证2,810对，测试2,575对）	NA	NA	NA	NA
710	2025-05-23	Recognizing artery segments on carotid ultrasonography using embedding concatenation of deep image and vision-language models 2025-May-22, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/add8db PMID:40367970	研究论文	本研究提出了一种自动分类模型，用于识别颈动脉超声图像中的不同动脉段，以提高颈动脉检查的量化准确性	结合了预训练的DenseNet201、视觉变换器和回声对比语言-图像预训练模型的嵌入特征，使用支持向量机分类器进行解剖结构识别	样本量相对较小（288名患者），且仅使用了B型超声图像	提高颈动脉超声检查的准确性和一致性	颈总动脉（CCA）、颈动脉球部、颈内动脉（ICA）和颈外动脉（ECA）	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	DenseNet201, 视觉变换器, 支持向量机	图像	288名患者的2943张B型超声图像（CCA: 1563; 球部: 611; ICA: 476; ECA: 293）	NA	NA	NA	NA
711	2025-05-23	A Review of ChatGPT as a Reliable Source of Scientific Information Regarding Endodontic Local Anesthesia 2025-May, Journal of endodontics IF:3.5Q1 DOI:10.1016/j.joen.2025.02.002 PMID:39952316	review	评估ChatGPT作为牙髓病局部麻醉科学信息可靠来源的能力	首次评估ChatGPT在牙髓病局部麻醉领域的回答准确性和引用可靠性	仅评估了16个问题，样本量有限，且仅针对牙髓病局部麻醉这一细分领域	评估ChatGPT作为牙髓病局部麻醉科学信息可靠来源的能力	ChatGPT生成的关于牙髓病局部麻醉的回答和引用	natural language processing	NA	自然语言处理	Deep Learning	text	16个关于牙髓病局部麻醉的问题	NA	NA	NA	NA
712	2025-10-07	Machine learning-based label-free macrophage phenotyping in immune-material interactions 2025-May-21, Journal of materials chemistry. B DOI:10.1039/d5tb00365b PMID:40289902	研究论文	本研究开发了一种基于人工智能的无标记巨噬细胞表型分析方法，结合定量相位成像和深度学习模型	首次将AI驱动的图像分类与定量相位成像结合用于无标记巨噬细胞表型分析，避免了传统方法的固定和终点分析限制	单独使用定量相位成像无法完全区分表型，需要深度学习模型辅助	优化植入式生物医学材料的免疫相容性评估	THP-1来源的巨噬细胞（M0、M1、M2a、M2c表型）及其对不同胶原涂层的反应	计算机视觉	NA	定量相位成像（QPI）	CNN	图像	THP-1来源的巨噬细胞四种表型	NA	GoogLeNet, ShuffleNet, VGG-16, ResNet-18	准确率	NA
713	2025-10-07	A Chemistry-Informed Generative Deep Learning Approach for Enhancing Voltammetric Neurochemical Sensing in Living Mouse Brain 2025-May-21, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.5c05393 PMID:40358003	研究论文	提出一种化学信息引导的生成神经网络模型，用于增强活体小鼠脑部伏安法神经化学传感的定量准确性	开发了结合化学原理的生成深度学习模型，能够分离伏安电流中的法拉第和非法拉第成分，减少信号串扰	NA	开发同时监测多种神经化学物质动态的高精度传感平台	活体小鼠脑部的多巴胺、抗坏血酸和离子强度动态	机器学习	神经炎症	伏安法神经化学传感	生成神经网络	伏安电流信号	神经炎症模型小鼠和对照小鼠	NA	化学信息引导的生成神经网络(CIGNN)	定量准确性	NA
714	2025-10-07	An Ultrasound Image-Based Deep Learning Radiomics Nomogram for Differentiating Between Benign and Malignant Indeterminate Cytology (Bethesda III) Thyroid Nodules: A Retrospective Study 2025-May-21, Journal of clinical ultrasound : JCU IF:1.2Q3 DOI:10.1002/jcu.24058 PMID:40396203	研究论文	开发并验证基于超声图像和临床特征的深度学习放射组学列线图，用于预测不确定细胞学（Bethesda III）甲状腺结节的恶性风险	首次结合深度学习迁移特征、超声放射组学特征和临床特征构建综合诊断模型，用于Bethesda III类甲状腺结节的良恶性鉴别	回顾性研究设计，样本量相对有限（训练集155例，内部验证集39例）	开发甲状腺结节良恶性鉴别诊断工具	不确定细胞学（Bethesda III）甲状腺结节患者	医学影像分析	甲状腺结节	超声成像	深度学习	超声图像，临床数据	训练集155例，内部验证集39例，外部验证集160例（来自两个医疗中心各80例）	NA	ResNet34	AUC, 准确率, 灵敏度, 特异度, 精确率, 召回率	NA
715	2025-10-07	Validation of a deep learning model for the automated detection and quantification of cystoid macular oedema on optical coherence tomography in patients with retinitis pigmentosa 2025-May-21, Acta ophthalmologica IF:3.0Q1 DOI:10.1111/aos.17518 PMID:40396533	研究论文	验证基于深度学习的模型在视网膜色素变性患者光学相干断层扫描中自动检测和量化囊样黄斑水肿的能力	首次在视网膜色素变性患者中验证nnU-Net架构用于囊样黄斑水肿的自动分割，性能达到与人类专家相当的水平	样本量相对有限（37个外部测试扫描），仅在特定患者群体（视网膜色素变性）中验证	开发并验证用于自动检测和量化囊样黄斑水肿的深度学习模型	视网膜色素变性患者的囊样黄斑水肿	医学影像分析	视网膜色素变性	光谱域光学相干断层扫描	深度学习	医学影像	112个OCT体积（70训练，42验证），37个外部测试扫描	nnU-Net	nnU-Net	Dice相似系数，组内相关系数	NA
716	2025-10-07	Decoding cancer prognosis with deep learning: the ASD-cancer framework for tumor microenvironment analysis 2025-May-20, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.01455-24 PMID:40237527	评论	本文探讨了ASD-cancer深度学习框架在肿瘤微环境分析中的方法创新和可扩展性	提出基于自编码器的半监督学习框架，通过迁移学习处理新数据集而无需重新训练	未整合额外数据层，缺乏自适应AI模型的持续学习能力	改进多组学数据分析，提升癌症预后预测能力	肿瘤微环境分析	机器学习	癌症	多组学数据分析	自编码器	多组学数据	NA	NA	自编码器	NA	NA
717	2025-10-07	XVir: A Transformer-Based Architecture for Identifying Viral Reads from Cancer Samples 2025-May-20, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology IF:1.4Q2 DOI:10.1089/cmb.2025.0075 PMID:40392695	研究论文	提出一种基于Transformer的深度学习架构XVir，用于从癌症样本中可靠识别病毒DNA	采用Transformer架构处理病毒DNA检测问题，能够在多样病毒种群中保持高准确率且训练速度显著快于其他大型深度学习分类器	基于半实验数据验证，未提及在真实临床环境中的性能表现	开发计算工具识别与癌症相关的病毒DNA	人类肿瘤中的病毒DNA	生物信息学	癌症	DNA测序	Transformer	DNA测序 reads	来自病毒和人类基因组的混合测序reads	NA	Transformer	分类准确率	NA
718	2025-10-07	Streaks on martian slopes are dry 2025-May-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59395-w PMID:40389425	研究论文	通过深度学习分析火星斜坡条纹特征，挑战传统液态水形成理论，支持干性尘埃驱动机制	首次建立包含50万个斜坡条纹的全球一致性目录，通过地理统计分析推翻湿润形成模型	主要依赖遥感观测数据，缺乏实地验证	探究火星斜坡条纹的形成机制及其在火星尘埃循环中的作用	火星表面的斜坡条纹和季节性重复坡线	行星科学, 计算机视觉	NA	深度学习, 地理统计分析	深度学习模型	火星遥感图像	50万个斜坡条纹样本	NA	NA	NA	NA
719	2025-10-07	Enhancing hand-drawn diagram recognition through the integration of machine learning and deep learning techniques 2025-May-19, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-01823-4 PMID:40389485	研究论文	提出一种集成机器学习和深度学习技术的方法来增强手绘图表识别性能	整合多种机器学习方法的优势并引入深度学习技术，提出了包括Fossum Soergel k-means聚类、形态学Canny Bessel径向基轮廓形状因子、Fisher核k近邻、单S曲线模糊规则生成和宽上下文快速区域卷积神经网络等改进方法	主要关注离线手绘图表识别，未涉及实时识别场景	开发有效的手绘图表识别和理解方法	手绘流程图、有限自动机和业务过程模型	计算机视觉	NA	NA	CNN, k-means, k-NN	图像	基准数据集中的手绘图表样本	NA	区域卷积神经网络	NA	NA
720	2025-10-07	Harnessing optimization with deep learning approach on intelligent transportation system for anomaly detection in pedestrian walkways 2025-May-19, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99940-7 PMID:40389534	研究论文	提出一种结合优化算法与深度学习的智能交通系统方法，用于行人通道异常检测	提出HODLAITS-ADPW方法，整合改进的YOLOv7目标检测器、变色龙群算法优化超参数和注意力金字塔卷积神经网络	NA	提升城市环境中行人通道的安全性和效率	行人通道中的异常行为和活动	计算机视觉	NA	计算机视觉，深度学习	CNN, YOLO	图像	行人数据集	NA	YOLOv7, Attention Pyramid Convolutional Neural Network	NA	NA