深度学习在生物医药领域的应用

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 算法框架 模型架构 性能指标 计算资源
981 2025-10-06
Robust whole-body PET image denoising using 3D diffusion models: evaluation across various scanners, tracers, and dose levels
2025-Jun, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1
研究论文 提出并验证了一种基于3D扩散模型的全身PET图像去噪方法,能够适应不同扫描仪、示踪剂和剂量水平 首次将3D Denoising Diffusion Probabilistic Model应用于全身PET图像去噪,实现了跨多种临床场景的鲁棒性能 模型训练主要基于Biograph Vision Quadra PET/CT扫描仪的高质量数据 开发一种能够适应多种PET协议的鲁棒性全身PET图像去噪方法 全身PET图像 医学影像处理 癌症 PET成像 DDPM 3D医学图像 来自4台扫描仪、4种示踪剂类型和6个剂量水平的数据集 NA 3D卷积网络 去噪性能,不确定性图方差 NA
982 2025-10-06
Integrating generative AI with neurophysiological methods in psychiatric practice
2025-Jun, Asian journal of psychiatry IF:3.8Q1
综述 探讨生成式AI与神经生理学方法在精神病学实践中的整合潜力与应用前景 首次系统提出生成式AI与神经科学、生理学方法在精神病学领域的协同整合框架 面临数据可靠性、隐私保护和资源限制等挑战 探索生成式AI如何增强精神病学临床实践和神经生理学研究 精神病学临床实践、神经生理学数据、心理症状模型 自然语言处理, 机器学习 精神疾病 深度学习, 神经生理学方法 大语言模型 多模态数据, 文本, 神经生理信号 NA NA NA NA NA
983 2025-10-06
Sustainable water allocation under climate change: Deep learning approaches to predict drinking water shortages
2025-Jun, Journal of environmental management IF:8.0Q1
研究论文 本研究采用深度学习方法预测德黑兰饮用水短缺问题,为可持续水资源分配提供前瞻性解决方案 结合循环神经网络与三种优化算法(FHO、WOA、HOA)的混合模拟模型,首次在德黑兰水资源管理中实现多模型比较和优化 研究依赖于气候模型的预测准确性,且未考虑突发性极端气候事件的影响 通过先进机器学习方法理解和缓解城市化、土地利用管理不善及气候变异对水资源的影响 德黑兰五个关键水坝水库和德黑兰含水层系统 机器学习 NA 混合模拟模型,气候模型(MRI-ESM2、CNRM-CM6-1、BCC-CSM2) RNN, LSTM 气候数据、水文数据、水资源分配数据 2021-2050年期间三种排放路径(SSP1.26、SSP2.45、SSP5.85)的预测数据 NA RNN-FHO, RNN-WOA, RNN-HOA混合架构 水坝流入量预测性能、地下水位波动预测精度 NA
984 2025-06-01
Learnable fractional Fourier transform for high-quality computer-generated holography
2025-Jun-01, Optics letters IF:3.1Q2
research paper 提出了一种基于深度学习的计算机生成全息术方法,通过分数傅里叶变换提升全息成像质量 提出了复数分数傅里叶网络(CFrFNet),整合分数傅里叶变换(FrFT)于空间-频率统一框架中,生成高保真相位全息图(POHs) NA 提升计算机生成全息术的成像质量 相位全息图(POHs) computer vision NA 分数傅里叶变换(FrFT) CFrFNet, FrFNM, MFEB image NA NA NA NA NA
985 2025-10-07
Predicting host-pathogen interactions with machine learning algorithms: A scoping review
2025-06, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
综述 本文通过范围综述方法系统评估机器学习算法在宿主-病原体相互作用预测中的应用现状 首次系统比较不同机器学习方法在HPI预测中的效果,提供未来研究路线图 数据集标准化不足和模型可解释性存在显著差距 评估机器学习在宿主-病原体相互作用预测中的有效性 宿主-病原体相互作用(特别是蛋白质-蛋白质相互作用) 机器学习 传染病 机器学习算法 Random Forest, Gradient Boosting, CNN, RNN 分子相互作用数据 46篇相关文献中筛选30篇进行综述 NA 卷积神经网络, 循环神经网络 准确率 NA
986 2025-10-07
Combining Deep Data-Driven and Physics-Inspired Learning for Shear Wave Speed Estimation in Ultrasound Elastography
2025-Jun, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
研究论文 提出一种结合数据驱动和物理启发学习的混合方法,用于超声弹性成像中的剪切波速度估计 采用自适应无监督损失函数,能够在没有已知SWS值的真实数据上训练网络,减少伪影并提高鲁棒性 仅在实验体模数据和两名人类受试者的肝脏数据上进行了验证,样本量有限 提高超声弹性成像中剪切波速度估计的准确性和鲁棒性 剪切波在生物组织中的传播特性 医学影像分析 肝脏疾病 超声弹性成像,剪切波弹性成像 深度学习 超声RF/IQ数据,位移数据 实验体模数据和两名人类受试者的肝脏数据 NA NA 准确性,可靠性 NA
987 2025-10-07
Virtual monochromatic image-based automatic segmentation strategy using deep learning method
2025-Jun, Physica medica : PM : an international journal devoted to the applications of physics to medicine and biology : official journal of the Italian Association of Biomedical Physics (AIFB)
研究论文 本研究提出了一种基于双能CT虚拟单能图像的新型深度学习模型MIAU-Net,用于头颈部危及器官的自动分割 首次系统研究双能CT虚拟单能图像在自动分割中的应用,提出新型MIAU-Net模型并确定不同组织分割的最佳能量水平 研究样本量有限(46例患者),需要更多数据验证模型泛化能力 评估双能CT虚拟单能图像在自动分割中的性能并确定最佳能量水平 头颈部危及器官(脑干、视交叉、晶状体、下颌骨、眼睛、视神经) 医学影像分析 头颈部肿瘤 双能CT(DECT)、虚拟单能图像(VMI) 深度学习 CT医学图像 46例患者的双能CT数据 NA MIAU-Net, U-Net, Attention-UNet, nnU-Net, TransFuse Dice相似系数(DSC) NA
988 2025-10-07
AutoFE-Pointer: Auto-weighted feature extractor based on pointer network for DNA methylation prediction
2025-Jun, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 提出一种基于指针网络的自动加权特征提取框架AutoFE-Pointer,用于DNA甲基化预测 使用改进的软化指针网络动态提取和加权DNA序列特征,能够同时处理多物种数据集 未明确说明模型在特定疾病类型上的具体表现 开发轻量级DNA甲基化预测工具,解决现有模型物种特异性限制和计算资源需求高的问题 DNA甲基化模式 计算生物学 癌症 DNA甲基化测序 指针网络 DNA序列数据 17个不同基准数据集(跨多个物种) NA 改进的软化指针网络 预测准确性,跨物种泛化能力 本地离线环境部署
989 2025-10-07
Comparative analysis of deep learning methods for breast ultrasound lesion detection and classification
2025-Jun, Physica medica : PM : an international journal devoted to the applications of physics to medicine and biology : official journal of the Italian Association of Biomedical Physics (AIFB)
研究论文 比较分析深度学习方法在乳腺超声病灶检测和分类中的性能 首次系统比较目标检测、语义分割和实例分割方法在乳腺超声病灶分析中的效果,并公开新的BUS-UCLM数据集 研究结果可能受限于所用数据集的特性和规模 评估不同深度学习方法在乳腺超声计算机辅助诊断系统中的性能 乳腺超声图像中的病灶 计算机视觉 乳腺癌 超声成像 CNN 医学图像 5个数据集(包括新收集的BUS-UCLM和4个公开数据集) NA Mask R-CNN, Poolformer COCO AP50, Dice系数 NA
990 2025-10-07
S2L-CM: Scribble-supervised nuclei segmentation in histopathology images using contrastive regularization and pixel-level multiple instance learning
2025-Jun, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 提出一种基于涂鸦监督的病理图像细胞核分割框架S2L-CM,通过对比正则化和像素级多示例学习提升分割性能 结合自生成伪标签、多尺度对比正则化和像素级多示例学习,在稀疏标注条件下实现接近全监督性能的细胞核分割 性能仍略低于全监督学习方法,依赖初始涂鸦标注质量 开发弱监督的病理图像细胞核分割方法以减少人工标注成本 病理图像中的细胞核 数字病理 NA 深度学习 CNN 病理图像 四个细胞核数据集 PyTorch NA 分割性能指标 NA
991 2025-10-07
Performance of the automated digital cell image analyzer UIMD PBIA in white blood cell classification: a comparative study with sysmex DI-60
2025-Jun-26, Clinical chemistry and laboratory medicine IF:3.8Q1
研究论文 评估基于深度学习的自动化数字形态分析仪PBIA在白细胞分类中的性能,并与DI-60进行对比研究 首次对新型深度学习驱动的PBIA分析仪与广泛使用的DI-60在白细胞分类性能上进行系统性比较 需要更多多中心研究进行完整验证,对非典型淋巴细胞检测存在较高假阴性率 评估自动化数字细胞图像分析仪在白细胞分类中的性能 外周血涂片中的白细胞 数字病理 NA 数字细胞图像分析 深度学习 细胞图像 461张玻片 NA NA 准确率, Cohen's kappa, Pearson相关系数, 假阳性率, 假阴性率 NA
992 2025-03-06
Research on the development of image-based Deep Learning (DL) model for serum quality recognition
2025-Jun-26, Clinical chemistry and laboratory medicine IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
993 2025-10-07
Optimizing MR-based attenuation correction in hybrid PET/MR using deep learning: validation with a flatbed insert and consistent patient positioning
2025-Jun, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1
研究论文 本研究利用平板插入器和统一患者体位,通过深度学习优化PET/MR中的MR-based衰减校正,并与CT-based衰减校正进行精确对比验证 采用平板插入器和手臂下放体位确保PET/CT与PET/MR扫描位置一致性,开发基于深度学习的合成CT生成框架用于多种MRAC方法比较 在骨骼丰富区域(如脊柱和肝脏)的SUV定量存在较大变异性且可重复性较低 优化PET/MR系统中的MR-based衰减校正方法,提高定量准确性 21名接受全身[18F]FDG PET/CT和PET/MR扫描的患者 医学影像分析 NA PET/CT, PET/MR, 深度学习 深度学习 医学影像(MR图像, CT图像) 21名患者用于验证,300名患者用于训练 NA NA 标准化摄取值(SUV), 相关系数(r), p值, 联合直方图分析 NA
994 2025-10-07
Evaluation of deep learning-based scatter correction on a long-axial field-of-view PET scanner
2025-Jun, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1
研究论文 评估基于深度学习的散射校正方法在长轴视野PET扫描仪上的性能 首次将深度学习散射估计方法应用于长轴视野PET系统,相比传统单散射模拟方法具有更高精度和鲁棒性 未使用[18F]-PSMA数据进行训练,但仍在临床数据中表现一致 评估深度学习散射估计方法在长轴视野PET系统中的性能 长轴视野PET系统的散射校正 医学影像处理 NA PET成像,蒙特卡洛模拟 CNN 正弦图,医学影像 XCAT体模模拟数据及7个临床数据集([18F]-FDG和[18F]-PSMA) NA U-Net 精度,鲁棒性,病灶对比度恢复 NA
995 2025-10-07
Eliminating the second CT scan of dual-tracer total-body PET/CT via deep learning-based image synthesis and registration
2025-Jun, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1
研究论文 开发并验证一种深度学习框架,用于消除双示踪剂全身PET/CT成像中的第二次CT扫描 将注册生成对抗网络与非刚性配准技术相结合,首次实现通过深度学习合成伪衰减校正CT图像 研究为回顾性设计,样本量相对有限(247例患者) 减少双示踪剂全身PET/CT成像中的CT辐射剂量 接受双示踪剂全身PET/CT成像的患者 医学影像分析 肿瘤疾病 PET/CT成像,深度学习图像合成 GAN, 深度学习 医学影像(CT和PET图像) 247例患者,分为三个队列:167例[68Ga]Ga-DOTATATE/[18F]FDG,50例[68Ga]Ga-PSMA-11/[18F]FDG,30例[68Ga]Ga-FAPI-04/[18F]FDG NA RegGAN(注册生成对抗网络) MAE, PSNR, SSIM, SUV偏差 NA
996 2025-05-29
Skin Cancer Detection Using Deep Learning Approaches
2025-Jun, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
review 该综述探讨了多种深度学习方法在皮肤病变识别和分类中的应用 评估了不同深度学习方法在皮肤癌检测中的表现,特别是CNN在视觉病变识别中的高准确性和GAN在训练增强中的潜力 现有数据集存在肤色多样性不足、计算需求高、病变表示不均等问题,可能影响模型的效率、包容性和泛化能力 通过深度学习方法提高皮肤癌的早期检测效率和准确性 皮肤病变图像 computer vision skin cancer deep learning CNN, GAN, ANN, KNN image NA NA NA NA NA
997 2025-05-29
Deep learning-based intraoperative visual guidance model for ureter identification in laparoscopic sigmoidectomy
2025-Jun, Surgical endoscopy
研究论文 本研究评估了一种基于深度学习的计算机视觉模型在腹腔镜乙状结肠切除术中实时识别左侧输尿管的性能 开发了基于语义分割算法的深度学习模型,用于腹腔镜手术中输尿管的实时识别,并实现了高精度的实时操作 样本量有限,手术方法缺乏多样性,手术过程不完整,且缺乏外部验证 评估深度学习模型在腹腔镜乙状结肠切除术中实时识别左侧输尿管的可行性 腹腔镜乙状结肠切除术中的左侧输尿管 计算机视觉 NA 语义分割算法 YOLO 8 和 YOLO 11 视频 86 例腹腔镜乙状结肠切除术录像,1237 张手动标注的图像 NA NA NA NA
998 2025-10-07
Discovery of Active Ingredient of Yinchenhao Decoction Targeting TLR4 for Hepatic Inflammatory Diseases Based on Deep Learning Approach
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 基于深度学习框架AIGO-DTI预测茵陈蒿汤活性成分靶向TLR4的作用机制 提出AIGO-DTI深度学习框架用于预测中药成分与TLR4靶点的相互作用,并通过实验验证了异东莨菪素通过TLR4影响树突状细胞成熟的机制 NA 探索茵陈蒿汤中靶向TLR4的有效成分及其治疗肝病的机制 茵陈蒿汤主要成分、TLR4靶点、树突状细胞 机器学习 肝炎 深度学习、湿实验验证 AIGO-DTI, RF, SVM, KNN, XGBoost, GCN, GAT 化合物靶点相互作用数据 NA NA AIGO-DTI Recall, AUC NA
999 2025-10-07
A Multi-View Feature-Based Interpretable Deep Learning Framework for Drug-Drug Interaction Prediction
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出基于多视图特征的可解释深度学习框架MI-DDI用于药物相互作用预测 首次结合原子视图和子结构视图特征进行药物相互作用预测,并设计可解释的交互模块 未明确说明模型在其他药物数据集上的泛化能力 开发准确且可解释的药物相互作用预测方法 药物分子及其相互作用 机器学习 NA 分子图分析,SMILES序列处理 MPNN, Transformer 分子图,SMILES序列 BIOSNAP数据集和DrugBank数据集 PyTorch, RDkit Message Passing Neural Network, Transformer编码器 准确率 NA
1000 2025-10-07
Marker Data Enhancement for Markerless Motion Capture
2025-06, IEEE transactions on bio-medical engineering
研究论文 本文开发了一种更准确和泛化能力更强的标记增强器,用于将稀疏视频关键点转换为密集解剖标记 创建了更大更多样化的训练数据集,开发了比OpenCap原始增强器更准确且泛化能力更强的标记增强模型 未明确提及具体限制,但暗示模型在未见过的多样化运动上仍有改进空间 提高无标记运动捕捉中人体姿态估计的准确性和泛化能力 人体运动捕捉数据 计算机视觉 NA 运动捕捉技术 深度学习模型 视频关键点数据、解剖标记数据 1176名受试者的标记运动捕捉数据,合成1433小时视频关键点和解剖标记 NA 标记增强器 平均误差、最大误差 NA
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