深度学习在生物医药领域的应用
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当前共找到 948 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-06 |
GPT2-ICC: A data-driven approach for accurate ion channel identification using pre-trained large language models
2025-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2025.101302
PMID:40919588
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研究论文 | 开发了一种基于预训练大语言模型的深度学习算法GPT2-ICC，用于从蛋白质序列中准确识别离子通道 | 首次将表示学习与大语言模型分类器相结合，解决了蛋白质序列数据不平衡的挑战 | NA | 开发准确高效的离子通道分类方法 | 离子通道蛋白质序列 | 自然语言处理 | NA | 蛋白质序列分析 | LLM, 深度学习 | 蛋白质序列数据 | 测试集包含比非离子通道蛋白质多约239倍的数据 | NA | GPT2 | 准确率 | NA |
| 362 | 2025-10-06 |
Unravelling phosphorylation-induced impacts on inhibitor-CDK2 through multiple independent molecular dynamics simulations and deep learning
2025-Aug, SAR and QSAR in environmental research
IF:2.3Q3
DOI:10.1080/1062936X.2025.2552131
PMID:40926679
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研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟、深度学习和自由能景观分析系统探索磷酸化对CDK2与抑制剂结合的分子机制 | 创新性地整合分子动力学模拟、深度学习技术和自由能景观分析，首次系统揭示磷酸化对CDK2与抑制剂结合的分子机制 | 研究主要基于计算模拟，需要实验验证来进一步确认发现 | 探索磷酸化对CDK2与抑制剂结合的分子机制 | 磷酸化状态下的CDK2蛋白及其与抑制剂SCH、CYC的结合 | 计算生物学 | 癌症 | 分子动力学模拟, 深度学习, 自由能景观分析, QM/MM-GBSA计算 | 深度学习模型 | 分子动力学轨迹数据 | 两个抑制剂(SCH和CYC)与磷酸化CDK2的结合系统 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2025-10-06 |
Using deep learning to predict internalizing problems from brain structure in youth
2025-Aug-29, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03565-3
PMID:40883286
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研究论文 | 使用深度学习模型通过大脑结构特征预测青少年内化问题及其恶化轨迹 | 首次结合四个大规模数据集，利用深度学习从大脑结构特征中预测内化问题的横断面和纵向恶化轨迹 | 纵向模型在普通人群样本中预测性能欠佳，主要适用于神经发育条件人群 | 探索大脑结构特征与内化问题之间的生物标志物关系 | 青少年内化问题（如焦虑和抑郁） | 机器学习 | 精神健康疾病 | 脑结构测量（厚度、表面积和体积） | 深度学习 | 脑结构测量数据 | 横断面分析14,523人，纵向分析10,540人 | NA | NA | AUC | NA |
| 364 | 2025-10-06 |
An MRI Atlas of the Human Fetal Brain: Reference and Segmentation Tools for Fetal Brain MRI Analysis
2025-Aug-28, ArXiv
PMID:40900685
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研究论文 | 本文介绍了CRL-2025胎儿大脑图谱，这是一个包含详细组织分割和白质区划的时空胎儿大脑MRI图谱 | 相比CRL-2017图谱显著增强了解剖细节，首次包含瞬态白质分区和126个解剖区域划分，并提供了基于深度学习的多类分割模型 | 仅包含160例正常发育胎儿样本， gestational weeks范围限定在21-37周 | 建立高精度胎儿大脑MRI参考图谱和分割工具 | 人类胎儿大脑 | 医学影像分析 | 神经发育疾病 | MRI，扩散MRI | 深度学习分割模型 | MRI图像 | 160例正常发育胎儿 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2025-10-06 |
EEG-ERnet: Emotion Recognition based on Rhythmic EEG Convolutional Neural Network Model
2025-Aug-28, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/JIN41547
PMID:40919632
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研究论文 | 提出基于节律EEG的卷积神经网络模型EEG-ERnet用于情绪识别 | 提出深度并行CNN网络结构，将不同节律的功率谱密度投影为2D图像，综合编码通道、节律和时间特性 | 未明确说明模型对个体差异的泛化能力限制及计算复杂度分析 | 开发不依赖特定被试的情绪识别模型，提升脑机接口中的情绪识别性能 | 脑电图信号和情绪状态 | 脑机接口 | NA | 脑电图 | CNN | 脑电图信号 | 使用DEAP数据集，10折交叉验证 | NA | EEG-ERnet, 深度并行CNN | 准确率 | NA |
| 366 | 2025-10-06 |
Artificial Intelligence in the Diagnosis and Imaging-Based Assessment of Pelvic Organ Prolapse: A Scoping Review
2025-Aug-21, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina61081497
PMID:40870541
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综述 | 本范围综述系统总结了人工智能在盆腔器官脱垂影像诊断和解剖评估中的当前应用证据 | 首次系统综述AI在POP影像评估中的应用，重点关注深度学习技术在超声和MRI图像分析中的创新应用 | 所有研究均依赖内部数据集，模型可解释性有限且缺乏外部验证，临床部署和结果评估研究不足 | 评估人工智能在盆腔器官脱垂影像诊断和解剖评估中的应用现状和效果 | 盆腔器官脱垂患者的医学影像数据 | 医学影像分析 | 盆腔器官脱垂 | 超声成像, 磁共振成像 | CNN, ViT, 混合模型 | 2D/3D超声图像, 静态或应力MRI图像 | 8项符合纳入标准的研究 | NA | 卷积神经网络, 视觉变换器, 混合模型 | 诊断准确率 | NA |
| 367 | 2025-10-06 |
Passive Sensing for Mental Health Monitoring Using Machine Learning With Wearables and Smartphones: Scoping Review
2025-Aug-14, Journal of medical Internet research
IF:5.8Q1
DOI:10.2196/77066
PMID:40811794
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综述 | 本文系统综述了基于可穿戴设备和智能手机被动感知与机器学习技术用于心理健康监测的研究现状 | 首次系统总结了被动感知技术在心理健康监测中的技术方法和临床关联模式，识别了行为特征与精神障碍的关联模式 | 样本量小（76%研究样本量<100），监测周期短（45%研究<7天），外部验证稀缺（仅2%），数据匿名化报告有限（14%） | 评估被动感知和机器学习技术在心理健康监测中的应用现状和发展方向 | 临床诊断的精神障碍患者，特别是抑郁症和焦虑症患者 | 机器学习 | 精神疾病 | 被动感知技术 | CNN, LSTM, 随机森林 | 传感器数据（心率、运动指数、步数等） | 42项研究，中位样本量60.5（IQR 54-99） | NA | 卷积神经网络-长短期记忆网络 | 准确率 | NA |
| 368 | 2025-10-06 |
Multimodal artificial intelligence for subepithelial lesion classification and characterization: a multicenter comparative study (with video)
2025-Aug-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03147-9
PMID:40814087
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研究论文 | 开发了一种融合白光内镜和微探头超声内镜的多模态人工智能模型ECMAI-WME，用于消化道黏膜下病变的分类和特征分析 | 首次提出并行融合深度学习模型，整合白光内镜和微探头超声内镜两种模态数据，实现黏膜下病变的多分类和特征识别 | 研究样本来自四家医院，虽为多中心研究但样本量相对有限，需要进一步扩大验证范围 | 提高消化道黏膜下病变的诊断准确性，区分恶性与良性病变 | 消化道黏膜下病变，包括胃肠道间质瘤、神经内分泌肿瘤和平滑肌瘤 | 计算机视觉 | 胃肠道疾病 | 白光内镜，微探头超声内镜 | 深度学习 | 内镜图像 | 523例病变用于模型开发，外部验证队列88例，多中心测试队列274例 | NA | 并行融合深度学习模型 | 准确率，敏感性，特异性 | NA |
| 369 | 2025-10-06 |
Lateral flow and colorimetric assay for ketamine detection reinforced with deep learning model interfaced with mobile app for smart alert
2025-Aug-09, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-025-07429-x
PMID:40781183
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研究论文 | 开发了一种结合侧向层析和比色法的氯胺酮检测方法，并集成深度学习模型与移动应用实现智能预警 | 提出双阶段深度学习框架（YOLOv5和ResNet50）用于LFA试纸条数据分类，结合移动应用实现智能预警 | 仅在合成尿液样本中进行测试，未涉及真实临床样本验证 | 开发便携、低成本的即时诊断设备用于氯胺酮检测 | 氯胺酮药物 | 计算机视觉 | NA | 侧向层析检测、比色法、适配体技术、金纳米颗粒、UV-Vis分光光度法 | 深度学习 | 图像 | NA | PyTorch | YOLOv5, ResNet50 | 准确率, 速度, 可靠性 | NA |
| 370 | 2025-10-06 |
MoB QDs/N, F-CDs for ratiometric fluorescence sensing of perfluorooctanoic acid based on fluorine‑fluorine interaction
2025-Aug-06, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-025-07431-3
PMID:40770453
|
研究论文 | 开发了一种基于MoB量子点和氮氟共掺杂碳点的双发射比率荧光探针，用于检测全氟辛酸 | 利用氟-氟相互作用构建比率荧光探针，结合智能手机和深度学习算法实现现场可视化检测 | NA | 建立全氟辛酸的快速现场检测方法 | 环境水样和纺织品中的全氟辛酸 | 分析化学 | NA | 比率荧光传感 | YOLOv5 | 荧光图像 | NA | NA | YOLOv5 | 检测限, 线性范围 | 智能手机 |
| 371 | 2025-10-06 |
Applications of generative adversarial networks in the diagnosis, prognosis, and treatment of ophthalmic diseases
2025-Aug, Graefe's archive for clinical and experimental ophthalmology = Albrecht von Graefes Archiv fur klinische und experimentelle Ophthalmologie
DOI:10.1007/s00417-025-06830-9
PMID:40263170
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综述 | 本文综述了生成对抗网络在眼科疾病诊断、预后和治疗中的应用现状与挑战 | 系统性地总结了GAN在八种眼科疾病中的多任务应用，突出了该技术在眼科领域的独特价值和发展趋势 | GAN技术在临床中的主流应用仍依赖于更大规模的公共数据集进行广泛验证和必要的监管监督 | 为医疗专业人士和相关科学家提供GAN在眼科领域应用现状的批判性评估 | 八种眼科疾病的诊断、治疗和预后 | 计算机视觉 | 眼科疾病 | 生成对抗网络 | GAN | 图像 | NA | NA | 条件GAN | NA | NA |
| 372 | 2025-10-06 |
A Genus Comparison in the Topological Analysis of RNA Structures
2025-Aug-01, Acta biotheoretica
IF:1.4Q4
DOI:10.1007/s10441-025-09500-9
PMID:40748481
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综述 | 本文从拓扑数学角度探讨RNA结构分析，比较了矩阵场理论方法与实验确定的RNA结构拓扑信息 | 将矩阵场理论应用于RNA结构的拓扑分类，并开发了McGenus计算软件进行拓扑和折叠预测 | 未提供具体的性能比较数据，主要侧重于理论框架介绍 | 促进数学物理与生物学交叉领域研究，推动RNA折叠和结构研究发展 | RNA二级结构和三维结构 | 计算生物学 | NA | 矩阵场理论，拓扑分析 | NA | RNA结构数据 | NA | McGenus | NA | NA | NA |
| 373 | 2025-10-06 |
MuSARCyto: Multi-Head Self-Attention-Based Representation Learning for Unsupervised Clustering of Cytometry Data
2025-Aug, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24956
PMID:40785593
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研究论文 | 提出一种基于多头自注意力的无监督深度学习架构MuSARCyto，用于细胞计数数据的自动聚类分析 | 首次将多头自注意力机制应用于细胞计数数据的表示学习，提出集成聚类评估指标仲裁评分 | NA | 改进细胞计数数据的自动聚类性能，减少对人工门控的依赖 | 细胞计数数据 | 机器学习 | 免疫学相关疾病 | 细胞计数技术 | 自注意力机制,深度学习 | 细胞计数数据 | 六个公开可用的质谱和流式细胞术数据集 | NA | 多头自注意力网络,全连接表示网络 | 聚类评估指标仲裁评分 | NA |
| 374 | 2025-10-06 |
SamRobNODDI:q-space sampling-augmented continuous representation learning for robust and generalized NODDI
2025-Aug-29, Physics in medicine and biology
IF:3.3Q1
DOI:10.1088/1361-6560/adf9b8
PMID:40780245
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研究论文 | 提出一种基于q空间采样增强的连续表示学习框架SamRobNODDI，用于实现鲁棒且泛化的NODDI参数估计 | 引入q空间采样增强的连续表示学习方法，探索不同梯度方向间的信息，并设计采样一致性损失约束不同采样方案的输出 | NA | 开发在变化扩散梯度方向下能稳健执行的NODDI参数估计方法 | 扩散磁共振成像(dMRI)数据 | 医学影像分析 | 神经系统疾病 | 扩散磁共振成像(dMRI), NODDI | 深度学习 | 医学影像 | NA | NA | NA | 性能、鲁棒性、泛化性、灵活性 | NA |
| 375 | 2025-10-06 |
Single-cell multiomics reveals the oscillatory dynamics of mRNA metabolism and chromatin accessibility during the cell cycle
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116089
PMID:40751912
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示细胞周期中mRNA代谢和染色质可及性的振荡动态 | 首次结合单细胞多组学测序、生物物理建模和深度学习量化mRNA转录、剪接、核输出和降解速率 | NA | 研究细胞周期中基因表达的时空调控机制 | 增殖细胞中的mRNA代谢过程和染色质可及性 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度学习 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2025-10-06 |
Heat stress responses mediated by N6-methyladenine DNA methylation in maize
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116058
PMID:40728929
|
研究论文 | 本研究揭示了玉米中N6-甲基腺嘌呤(6mA)在热胁迫响应中的调控机制 | 首次在作物中发现6mA动态变化与热胁迫耐受性相关，鉴定ZmALKBH1为6mA去甲基化酶，并开发了基于深度学习的6mA分布预测模型 | 研究仅针对四个玉米自交系，需要在更广泛的种质资源中验证 | 探究6mA在玉米热胁迫响应中的功能和作用机制 | 玉米自交系B73、Mo17、W22和B104 | 生物信息学 | NA | 全基因组6mA谱分析，基因表达分析，突变体研究 | 深度学习 | 表观基因组数据，基因表达数据 | 四个玉米自交系（B73、Mo17、W22、B104） | NA | NA | 预测准确性，实验验证 | NA |
| 377 | 2025-10-06 |
Accurate VLE Predictions via COSMO-RS-Guided Deep Learning Models: Solubility and Selectivity in Physical Solvent Systems for Carbon Capture
2025-Aug-25, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01148
PMID:40757514
|
研究论文 | 开发了一种结合COSMO-RS和深度学习的机器学习流程，用于准确预测物理溶剂系统中的溶解度和选择性，以支持碳捕获应用的溶剂筛选 | 将量子化学热力学模型COSMO-RS与定向消息传递神经网络(D-MPNN)相结合，通过迁移学习校正预测偏差，显著提高了VLE预测精度 | 依赖COSMO-RS模拟数据的质量，实验数据量有限可能影响模型泛化能力 | 开发准确的汽液平衡(VLE)预测模型，用于碳捕获物理溶剂的筛选和优化 | 物理溶剂系统中的溶解度和选择性预测，针对CO和常见气体杂质(HS、CH、N、H) | 机器学习 | NA | 量子化学计算、COSMO-RS模拟 | D-MPNN | 分子结构数据、热力学模拟数据、实验数据 | 30,000个COSMO-RS模拟数据点，以及实验VLE数据集 | NA | 定向消息传递神经网络(D-MPNN) | 预测精度、物理一致性、压力预测偏差校正 | NA |
| 378 | 2025-10-06 |
A Molecular Representation Learning Model Based on Multidimensional Joint and Cross-Learning for Drug-Drug Interaction Prediction
2025-Aug-25, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01171
PMID:40758117
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研究论文 | 提出一种基于多维联合交叉学习的分子表示学习模型，用于预测药物相互作用 | 通过交叉注意力融合模块整合药物的一维、二维和三维分子特征，并设计分子对反应模块识别潜在相互作用位点 | 未明确说明模型在真实临床环境中的泛化能力及对罕见药物组合的预测效果 | 开发更精准的药物相互作用预测计算方法 | 药物分子及其相互作用 | 机器学习 | NA | 分子表示学习 | 深度学习 | 分子结构数据（1D/2D/3D特征） | 基准数据集（未指定具体数量） | NA | 交叉注意力融合模块，分子对反应模块 | 评估指标（未具体说明） | NA |
| 379 | 2025-10-06 |
FakeRotLib: Expedient Noncanonical Amino Acid Parametrization in Rosetta
2025-Aug-25, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01030
PMID:40789114
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研究论文 | 提出FakeRotLib方法用于在Rosetta中快速参数化非经典氨基酸 | 使用小分子构象异构体统计拟合创建旋转异构体分布，显著缩短参数化时间并能处理Rosetta之前未建模的NCAA类型 | NA | 改进Rosetta中非经典氨基酸的参数化方法 | 非经典氨基酸 | 计算生物学 | NA | 统计拟合，小分子构象异构体分析 | NA | 分子构象数据 | NA | Rosetta | NA | 参数化时间，建模能力 | NA |
| 380 | 2025-10-06 |
PepPCBench is a Comprehensive Benchmarking Framework for Protein-Peptide Complex Structure Prediction
2025-Aug-25, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01084
PMID:40792461
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研究论文 | 本文介绍了PepPCBench，一个用于蛋白质-肽复合物结构预测的综合基准测试框架 | 开发了首个专门针对蛋白质-肽复合物结构预测的基准测试框架，并构建了包含261个实验解析复合物的数据集 | 置信度指标与实验结合亲和力相关性较差，评分策略和泛化能力需要改进 | 系统评估深度学习方法在蛋白质-肽复合物结构预测中的性能 | 蛋白质-肽复合物结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 蛋白质折叠神经网络 | 蛋白质结构数据 | 261个实验解析的蛋白质-肽复合物，肽段长度5-30个残基 | NA | AlphaFold3, AlphaFold-Multimer, Chai-1, HelixFold3, RoseTTAFold-All-Atom | 综合评估指标 | NA |