深度学习在生物医药领域的应用

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 算法框架 模型架构 性能指标 计算资源
81 2025-10-05
EDNTOM: An Ensemble Learning and Weight Mechanism-Based Nanopore Methylation Detection Tool
2025-Aug-05, ACS omega IF:3.7Q2
研究论文 开发了一种基于集成学习和注意力权重机制的纳米孔甲基化检测工具EDNTOM 采用集成学习技术整合多个预训练单模型预测,并引入注意力权重机制,在提高检测准确性的同时减少计算资源消耗 NA 开发更强大可靠的DNA甲基化检测工具,平衡计算资源和信息处理性能 DNA甲基化检测 机器学习 NA 纳米孔测序 深度学习,集成学习 DNA测序数据 NA NA NA NA NA
82 2025-10-05
GGCRB: A Graph Neural Network Approach for Predicting CircRNA-RBP Interactions Using Structural and Sequence Features
2025-Aug-05, ACS omega IF:3.7Q2
研究论文 提出一种结合序列和结构特征的图神经网络方法GGCRB,用于预测环状RNA与RNA结合蛋白的相互作用位点 首次将图卷积网络和图注意力网络应用于circRNA结构特征建模,并通过多模态特征融合提升预测精度 未明确说明模型在独立测试集上的泛化性能及计算复杂度分析 开发计算模型准确预测circRNA-RBP结合位点 环状RNA与RNA结合蛋白的相互作用 生物信息学 NA RNA结构预测 GCN, GAT, CNN, BiLSTM 序列数据, 结构数据 16个基准数据集 TensorFlow, PyTorch 图卷积网络, 图注意力网络, 卷积神经网络, 双向LSTM 准确率, 精确率, 召回率, F1分数, AUC NA
83 2025-10-05
A review on learning-based algorithms for tractography and human brain white matter tracts recognition
2025-Aug, Neuroradiology IF:2.4Q2
综述 本文综述了基于学习算法的脑白质纤维束追踪与识别方法 扩展了先前相关综述,涵盖最新方法和网络架构细节,并通过全面比较评估基于学习方法的效率 NA 回顾基于学习的纤维束追踪算法及其在白质束识别中的应用 人脑白质纤维束 医学影像分析 神经系统疾病 扩散磁共振成像 传统机器学习,深度学习,强化学习,字典学习 扩散MRI数据 NA NA NA NA NA
84 2025-10-05
Detecting Fifth Metatarsal Fractures on Radiographs Through the Lens of Smartphones: The FIXUS AI Algorithm
2025-Aug, Cureus
研究论文 开发用于从智能手机拍摄的X光片中检测第五跖骨骨折的深度学习算法 首次针对智能手机拍摄的X光图像开发专用深度学习模型,解决了传统模型在移动设备图像上的性能下降问题 回顾性研究,样本量有限(共2464例),仅针对第五跖骨骨折 提高第五跖骨骨折诊断的可及性,特别是在资源有限环境中 第五跖骨骨折患者和对照组 计算机视觉 骨科创伤 X射线摄影 CNN 图像 骨折组1240例,对照组1224例,总计2464例 NA ResNet-152V2 AUROC NA
85 2025-10-05
AdaSemb: an adaptive knowledge-driven deep learning framework integrating cancer protein assemblies for predicting PI3Kα inhibitor response and resistance
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种自适应知识驱动的深度学习框架AdaSemb,通过整合癌症蛋白组装体预测PI3Kα抑制剂反应和耐药性 首次将多蛋白组装图谱与深度学习结合,采用生物结构神经网络和条件域对抗网络增强基因-药物分布泛化能力 研究主要聚焦乳腺癌,未验证其他癌症类型的适用性;样本量相对有限 开发能够预测PI3Kα抑制剂反应和耐药性的精准医疗方法 乳腺癌患者、癌细胞系和患者来源异种移植模型 机器学习 乳腺癌 基因组测序 生物结构神经网络,条件域对抗网络 基因组数据,药物分子结构数据 1244个癌细胞系和PDX模型,116名TCGA乳腺癌患者 NA AdaSemb-PA,AdaSemb-DRP 生存分析预测精度 NA
86 2025-10-05
Advancing ADMET prediction through multiscale fragment-aware pretraining with MSformer-ADMET
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文开发了MSformer-ADMET模型,通过多尺度片段感知预训练方法提升ADMET性质预测性能 将MSformer框架专门适配于ADMET性质预测,采用基于片段的分子表示学习方法,并提供事后可解释性分析 NA 开发更准确、可解释的ADMET性质预测方法以加速药物发现过程 药物候选分子的吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)性质 机器学习 NA 深度学习 Transformer 分子结构数据 来自治疗数据共享库(TDC)的22个任务数据集 PyTorch MSformer 准确率,精确率,召回率,F1分数,AUC NA
87 2025-10-05
Identifying survival subtypes with autoencoder using multiple types of high-dimensional genomic data from studies of glioblastoma multiforme
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过自编码器整合多组学数据识别胶质母细胞瘤患者的生存亚型 首次将自编码器深度学习方法应用于整合RNA-seq、甲基化和DNA拷贝数变异数据来识别胶质母细胞瘤生存亚型 研究仅基于TCGA公共数据库数据,需要外部验证 识别胶质母细胞瘤患者的生存亚型并理解其分子特征 胶质母细胞瘤患者的多组学数据 机器学习 胶质母细胞瘤 RNA-seq, 甲基化测序, DNA拷贝数变异分析 自编码器, Cox-PH模型 基因组数据 TCGA数据库中的胶质母细胞瘤患者样本 NA 自编码器 交叉验证 NA
88 2025-10-05
The Path Towards Effective Long-Lasting Tissue-Targeted Prime/Pull/Keep Herpes Simplex Therapeutic Vaccines
2025-Aug-27, Vaccines IF:5.2Q1
综述 本文探讨了针对单纯疱疹病毒的有效长效组织靶向Prime/Pull/Keep治疗性疫苗的开发路径 提出结合组学、人工智能和深度学习的理性疫苗设计方法,开发能同时在感觉神经节和皮肤黏膜组织诱导持久T细胞免疫的PPK疫苗策略 目前PPK疫苗仅在临床前动物模型中显示成功,尚未进入临床应用阶段 开发针对HSV-1和HSV-2的有效长效治疗性疫苗 单纯疱疹病毒1型和2型(HSV-1和HSV-2) 医学免疫学 疱疹病毒感染 组学技术,人工智能,深度学习 NA NA 临床前动物模型 NA NA NA NA
89 2025-10-05
Revolution or routine? Comparing AI and traditional imaging in thoracic surgery outcomes: a systematic review
2025-Aug, Journal of medicine and life
系统综述 比较人工智能与传统影像方法在胸外科术后成像中的应用及效果 系统比较AI/ML与传统影像方法在胸外科的应用,探讨深度学习等新兴技术的未来发展潜力 NA 评估AI和机器学习在胸外科术后影像中的当前应用和未来发展方向 胸外科术后患者的影像数据 医学影像分析 胸外科疾病 医学影像分析 深度学习,神经网络 医学影像 NA NA NA NA NA
90 2025-10-05
From Gene Networks to Therapeutics: A Causal Inference and Deep Learning Approach for Drug Discovery
2025-Aug-30, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
研究论文 提出一种整合网络分析、统计中介和深度学习的计算框架,用于识别因果靶基因和可重定位小分子候选药物 首次将加权基因共表达网络分析、双向中介分析与深度学习相结合,构建表型驱动的药物发现框架 研究样本量相对有限(103例IPF患者),需要进一步实验验证 开发计算框架加速药物发现过程,特别针对复杂疾病 特发性肺纤维化(IPF)患者和对照组的转录组数据 机器学习 特发性肺纤维化 RNA-seq, WGCNA, 双向中介分析 深度学习 转录组数据 103例IPF患者和103例对照组 NA DeepCE 相关性分析 NA
91 2025-10-05
AI in Dentistry: Innovations, Ethical Considerations, and Integration Barriers
2025-Aug-29, Bioengineering (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了人工智能在牙科领域的应用现状、技术创新及整合障碍 系统分析了联邦学习和可解释AI在牙科领域的最新应用进展 未进行定量荟萃分析,主要基于叙述性综述方法 评估AI在牙科医学中的技术发展和整合挑战 牙科医学中的AI应用 机器学习 口腔疾病 锥形束计算机断层扫描(CBCT),口内摄影,射线照相 深度学习 医学影像 NA TensorFlow U-Net 灵敏度,特异性,准确率 NA
92 2025-10-05
The Expanding Frontier: The Role of Artificial Intelligence in Pediatric Neuroradiology
2025-Aug-27, Children (Basel, Switzerland)
综述 本文探讨人工智能在儿科神经放射学领域的应用现状、挑战与未来机遇 系统阐述AI在儿科神经放射学这一新兴前沿领域的独特价值,特别关注儿童大脑发育特性与AI技术的结合点 面临儿科数据稀缺、伦理法律限制、模型可解释性不足以及医学法律责任界定等挑战 分析AI在儿科神经放射学的应用现状、挑战及未来发展前景 儿科神经放射学领域,特别是新生儿和儿童大脑发育相关疾病 医学影像分析 神经系统疾病(如药物抵抗性癫痫) 深度学习,联邦学习 深度学习算法,图算法 医学影像(MRI,CT) NA NA MELD图算法 NA NA
93 2025-10-05
HQRNN-FD: A Hybrid Quantum Recurrent Neural Network for Fraud Detection
2025-Aug-27, Entropy (Basel, Switzerland)
研究论文 提出一种用于金融欺诈检测的混合量子循环神经网络模型 首次将变分量子电路与循环神经网络结合用于欺诈检测,采用角度编码、数据重上传和分层纠缠等量子技术增强特征提取 未提及模型在真实金融环境中的部署挑战和计算资源需求 开发量子增强的深度学习模型以提升金融欺诈检测性能 金融交易数据 机器学习 NA 量子计算, 深度学习 RNN, 混合量子神经网络 序列数据 公开欺诈检测数据集(未指定具体数量) NA Hybrid Quantum RNN, 自注意力机制 准确率 量子计算资源(未指定具体类型)
94 2025-10-05
Deep Learning Method Based on Multivariate Variational Mode Decomposition for Classification of Epileptic Signals
2025-Aug-27, Brain sciences IF:2.7Q3
研究论文 提出一种基于多元变分模态分解的深度学习框架,用于癫痫信号的分类 整合时空信息提取,采用多元变分模态分解保持通道间模态对齐,有效缓解模态混叠和模态失配问题 NA 准确分类癫痫发作类型和精确定位局灶性癫痫信号,为临床诊断提供依据 多通道癫痫信号 机器学习 癫痫 多元变分模态分解 深度学习 脑电信号 Bern-Barcelona数据库和TUSZ数据库 NA NA 准确率, 灵敏度, 特异性, 加权F1分数 NA
95 2025-10-05
Deep Learning-Powered Down Syndrome Detection Using Facial Images
2025-Aug-27, Life (Basel, Switzerland)
研究论文 开发并验证了一种基于面部图像的唐氏综合征早期检测深度学习模型 提出结合RegNet X-MobileNet V3和视觉Transformer-Linformer的混合特征提取架构,采用自适应注意力特征融合机制增强诊断相关面部区域的关注 未明确说明样本来源和具体数据收集条件 开发非侵入性、公平的唐氏综合征筛查工具 婴儿面部图像 计算机视觉 唐氏综合征 面部图像分析 深度学习 图像 NA NA RegNet, MobileNet V3, Vision Transformer (ViT)-Linformer, ExtraTrees 准确率, 精确率, 召回率, F1分数, 特异性 NA
96 2025-10-05
Deep Learning Algorithm to Determine the Presence of Rectal Cancer from Transrectal Ultrasound Images
2025-Aug-27, Life (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究开发了一种基于深度学习的卷积神经网络模型,用于通过经直肠超声图像识别直肠癌 首次将EfficientNetV2-S架构应用于经直肠超声图像的直肠癌检测,为临床医生提供有价值的决策支持工具 研究为回顾性设计,样本量相对有限,模型泛化能力有待进一步验证 开发并评估用于直肠癌检测的深度学习算法 经直肠超声图像 计算机视觉 直肠癌 经直肠超声 CNN 图像 681张经直肠超声图像(533张直肠癌,148张正常直肠) NA EfficientNetV2-S 准确率, AUC, 精确率, 召回率, F1分数 NA
97 2025-10-05
Diagnosis of Periodontitis via Neutrophil Degranulation Signatures Identified by Integrated scRNA-Seq and Deep Learning
2025-Aug-26, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和深度学习算法,识别了与牙周炎中性粒细胞脱颗粒相关的关键生物标志物,并建立了诊断模型 首次结合单细胞RNA测序、分层加权基因共表达网络分析和深度学习模型,系统揭示了牙周炎中致病性中性粒细胞亚群通过脱颗粒驱动疾病发展的机制 研究样本来源和规模有限,需要在更大多中心队列中验证模型的泛化能力 建立牙周炎的早期诊断和精准干预模型 人类牙龈组织和中性粒细胞亚群 数字病理学 牙周炎 scRNA-seq, 单细胞转录组测序, 批量转录组测序 CNN, 机器学习 基因表达数据, 免疫细胞谱数据 多个队列的人类牙龈组织样本 NA 卷积神经网络 AUC NA
98 2025-10-05
Artificial Intelligence in Small-Molecule Drug Discovery: A Critical Review of Methods, Applications, and Real-World Outcomes
2025-Aug-26, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
综述 本文批判性地回顾了人工智能在小分子药物发现中的方法、应用和实际成果 系统评估了AI从早期规则系统到生成模型、扩散模型和自主智能体的演进,并提供了成功与失败案例的平衡视角 面临数据质量、模型可解释性、监管障碍和伦理问题等持续挑战 评估人工智能在小分子药物发现中的实际应用效果和未来发展机遇 小分子药物发现流程中的靶点识别、先导化合物发现、先导优化和安全性预测 机器学习 多种疾病(COVID-19、类风湿关节炎、抗生素耐药等) 深度学习、生成模型、扩散模型、自主智能体系统 生成模型,扩散模型,自主AI系统 药物发现相关数据 NA NA NA 临床开发成功率 NA
99 2025-10-05
Comprehensive Survey of OCT-Based Disorders Diagnosis: From Feature Extraction Methods to Robust Security Frameworks
2025-Aug-25, Bioengineering (Basel, Switzerland)
综述 本文系统综述了基于光学相干断层扫描(OCT)的眼科疾病诊断技术,涵盖传统特征提取方法和深度学习技术,并探讨了对抗攻击与防御策略 首次对OCT诊断方法进行20年研究的系统比较分析,探索针对OCT诊断系统的对抗攻击漏洞,并提出优于现有方案的实用防御策略 作为综述性文章,未提出新的原始算法模型,主要基于已有研究进行分析和总结 评估和比较OCT在眼科疾病诊断中的各种技术方法,提升诊断系统的安全性和可靠性 青光眼、糖尿病视网膜病变、白内障、弱视和黄斑变性等视网膜疾病 计算机视觉 眼科疾病 光学相干断层扫描(OCT) NA 医学影像 公共OCT数据集 NA NA 准确率, 灵敏度, 特异性, 计算成本 NA
100 2025-10-05
Evolving Public Attitudes Towards the HPV Vaccine in China: A Fine-Grained Emotion Analysis of Sina Weibo (2016 vs. 2024)
2025-Aug-22, Entropy (Basel, Switzerland)
研究论文 通过深度学习模型分析中国新浪微博平台2016-2024年HPV疫苗相关推文的情感演变 首次采用细粒度情感分析方法追踪中国社交媒体对HPV疫苗态度的长期演变,结合结构熵分析揭示情感传播网络特征 仅基于新浪微博平台数据,可能无法完全代表中国全体网民观点 探究中国公众对HPV疫苗态度的演变规律及情感传播机制 新浪微博平台38,615条HPV疫苗相关推文 自然语言处理 HPV相关疾病 深度学习情感分析 深度学习模型 社交媒体文本 38,615条微博推文 NA NA 结构熵分析 NA
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