深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
101	2025-10-05	Analysis of Microscopic Remaining Oil Based on the Fluorescence Image and Deep Learning 2025-Aug, Journal of fluorescence IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s10895-024-04032-w PMID:39557795	研究论文	基于荧光图像和深度学习分析微观剩余油分布	创新应用四种深度学习网络实现荧光图像自动分割，显著提升分析效率与准确性	未明确说明训练数据规模及模型泛化能力验证	提高高含水油藏采收率	微观剩余油的赋存形态与分布规律	计算机视觉	NA	荧光薄片分析	深度学习	荧光图像	NA	NA	U-Net, ResU-Net, ScSEU-Net, Unet++	分割准确度	NA
102	2025-10-05	TCM-navigator, a deep learning-based workflow for generation and evaluation of traditional Chinese medicine-like compounds for drug development 2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbaf498 PMID:41004131	研究论文	开发基于深度学习的TCM-navigator工作流，用于生成和评估类中药化合物以促进药物开发	首个专门针对中药特性设计的定量评估模型TCM-Identifier，以及能够生成370万类中药分子的TCM-Generator	未明确说明模型在真实药物开发场景中的验证效果和临床应用限制	解决中药研究中数据稀缺、网络复杂和数据表示不一致等问题，促进中药现代化药物开发	中药样分子化合物	机器学习	NA	深度学习，化学语言模型	LSTM, 消息传递神经网络	化学分子数据	生成370万个类中药分子	AttentiveFP	LSTM, AttentiveFP	NA	NA
103	2025-10-05	Multi-Omics Feature Selection to Identify Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma 2025-Aug-28, Metabolites IF:3.4Q2 DOI:10.3390/metabo15090575 PMID:41002959	研究论文	本研究通过多组学特征选择方法识别肝细胞癌的生物标志物	提出了一种结合递归特征选择和基于Transformer深度学习模型的新方法，用于多组学数据整合分析	样本量有限，需要在更大独立队列中验证发现的生物标志物	识别肝细胞癌的新型生物标志物以改善早期检测	肝细胞癌患者和肝硬化患者的血清样本	机器学习	肝细胞癌	非靶向和靶向质谱分析	Transformer	多组学数据	肝细胞癌病例和肝硬化对照的血清样本	NA	Transformer	NA	NA
104	2025-10-05	ERLD-HC: Entropy-Regularized Latent Diffusion for Harmony-Constrained Symbolic Music Generation 2025-Aug-25, Entropy (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/e27090901 PMID:41008027	研究论文	提出一种结合变分自编码器、潜在扩散模型和熵正则化条件随机场的符号音乐生成框架ERLD-HC	在扩散过程的UNet交叉注意力层引入熵正则化CRF模块，实现谐波条件控制，平衡算法驱动方法的理论正确性与基于规则方法的灵活性	尚未提供直接的外部弦条件控制	解决符号音乐生成中违反音乐规则的问题，特别是谐波结构控制	符号音乐	机器学习	NA	深度学习	VAE, Diffusion, CRF	MIDI符号音乐数据	Lakh MIDI数据集	NA	UNet	谐波规则违反率, 旋律自然度	NA
105	2025-10-05	Convolutional slime mold deep learning model for diagnosis of PD 2025-Aug-20, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3 DOI:10.1080/10255842.2025.2542942 PMID:40835536	研究论文	开发了一种基于增强卷积黏菌注意力模型的帕金森病诊断系统，通过语音分析实现疾病检测	提出增强卷积黏菌注意力(ECSMA)模型，结合卡方特征统计进行特征选择，优化帕金森病诊断效果	NA	开发高效的帕金森病检测方案，降低医疗成本并识别疾病发展阶段	人类语音录音	机器学习	帕金森病	语音分析	深度学习	语音录音	NA	NA	增强卷积黏菌注意力模型(ECSMA)	NA	NA
106	2025-10-05	Molecular origin of the differential stabilities of the protofilaments in different polymorphs: molecular dynamics simulation and deep learning 2025-Aug, Journal of biomolecular structure & dynamics IF:2.7Q2 DOI:10.1080/07391102.2024.2427364 PMID:39552194	研究论文	通过分子动力学模拟和深度学习研究α-突触核蛋白不同多晶型中原丝差异稳定性的分子机制	结合分子动力学模拟和深度神经网络分析，首次揭示了不同多晶型中四级结构排列如何通过反馈回路影响残基关键作用的分子机制	研究聚焦于特定片段和突变，可能无法完全代表所有α-突触核蛋白多晶型的复杂性	探究α-突触核蛋白不同多晶型结构稳定性的分子基础及其与帕金森病的关联	α-突触核蛋白片段及其E46K突变体在不同多晶型（棒状和螺旋状）中的构象行为	机器学习	帕金森病	分子动力学模拟	DNN	分子构象数据	NA	NA	深度神经网络	NA	NA
107	2025-10-05	A novel deep learning model for diabetic retinopathy detection in retinal fundus images using pre-trained CNN and HWBLSTM 2025-Aug, Journal of biomolecular structure & dynamics IF:2.7Q2 DOI:10.1080/07391102.2024.2314269 PMID:38373067	研究论文	提出一种结合预训练CNN和HWBLSTM的深度学习模型，用于从视网膜眼底图像中检测糖尿病视网膜病变	提出HWBLSTM（He加权双向长短期记忆网络）结合迁移学习的新方法，并采用HGFPDFGC预处理技术和EGORGA分割算法	仅使用APTOS和MESSIDOR两个数据集进行验证，未提及在其他数据集上的泛化能力	开发糖尿病视网膜病变的自动检测和分级系统	糖尿病视网膜病变患者	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	视网膜眼底成像	CNN, LSTM	图像	APTOS和MESSIDOR数据集（具体数量未提及）	NA	Squeeze Net, HWBLSTM	准确率，计算开销	NA
108	2025-10-05	Integrating Artificial Intelligence in Dermatological Cancer Screening and Diagnosis: Efficacy, Challenges, and Future Directions 2025-08, Annual review of biomedical data science IF:7.0Q1 DOI:10.1146/annurev-biodatasci-103123-094521 PMID:40312261	综述	探讨人工智能在皮肤癌筛查和诊断中的整合应用，分析其效能、挑战及未来发展方向	系统性地整合了AI在皮肤癌诊断中的临床应用前景，并首次深入探讨了视觉语言模型在该领域的潜在价值	缺乏具体临床验证数据，主要基于文献综述而非原始研究	评估人工智能技术在皮肤癌筛查和诊断中的应用效果与挑战	皮肤癌筛查和诊断过程	计算机视觉	皮肤癌	深度学习	视觉语言模型	皮肤病图像	NA	NA	NA	NA	NA
109	2025-10-05	Embedding Methods for Electronic Health Record Research 2025-08, Annual review of biomedical data science IF:7.0Q1 DOI:10.1146/annurev-biodatasci-103123-094729 PMID:40312284	综述	本文系统阐述嵌入方法在电子健康记录数据分析与研究中的应用价值及实施策略	全面梳理多种嵌入技术（词嵌入、图嵌入等）在医疗数据整合与分析中的创新应用，并建立嵌入质量评估框架	未涉及具体临床实施案例的定量分析，缺乏对不同医疗系统适配性的深入探讨	探索嵌入技术如何提升电子健康记录数据在机器学习模型中的效用	电子健康记录中的多维度、非结构化医疗数据	自然语言处理, 机器学习	NA	词嵌入, 图嵌入, 深度学习	深度学习模型	电子健康记录文本数据	NA	NA	NA	与传统模型对比的性能评估	NA
110	2025-10-05	AI-Enhanced Electrochemical Sensing Systems: A Paradigm Shift for Intelligent Food Safety Monitoring 2025-Aug-28, Biosensors DOI:10.3390/bios15090565 PMID:41002305	综述	探讨人工智能在电化学生物传感系统中的应用及其对食品安全监测的变革性影响	系统综述AI与电化学传感的跨学科融合，重点关注机器学习与深度学习在传感器设计、材料优化和信号处理中的创新应用	数据质量不足、模型泛化能力有限、算法可解释性待提升	构建支持可扩展食品安全监测的智能生物传感系统	食源性病原体（如大肠杆菌、沙门氏菌、李斯特菌）	机器学习	食源性疾病	电化学传感技术	机器学习, 深度学习	电化学信号数据	NA	NA	NA	灵敏度, 多重检测能力	NA
111	2025-10-05	Test-Time Augmentation for Cross-Domain Leukocyte Classification via OOD Filtering and Self-Ensembling 2025-Aug-28, Journal of imaging IF:2.7Q3 DOI:10.3390/jimaging11090295 PMID:41003346	研究论文	提出一种通过OOD过滤和自集成的方法改进测试时增强在跨域白细胞分类中的性能	引入OOD样本过滤机制和基于距离的加权策略，结合轻量级自集成方法提升跨域鲁棒性	未明确说明方法在极端域偏移情况下的性能边界	解决医学图像分析中的域偏移问题，提升白细胞分类的跨域泛化能力	白细胞图像数据	计算机视觉	血液疾病	深度学习	深度学习模型	图像	NA	NA	NA	分类准确率	NA
112	2025-10-05	Colorectal Polyp Segmentation Based on Deep Learning Methods: A Systematic Review 2025-Aug-27, Journal of imaging IF:2.7Q3 DOI:10.3390/jimaging11090293 PMID:41003344	系统综述	本文系统综述了基于深度学习的结直肠息肉分割方法	首次系统分析了2018-2024年间146篇息肉分割论文，全面评估了44个模型的性能，并涵盖了Mamba方法和视频息肉分割技术	仅涵盖2018-2024年间的文献，可能遗漏早期重要研究	系统整理和评估结直肠息肉分割领域的研究进展和方法	结直肠息肉分割的深度学习方法和相关数据集	计算机视觉	结直肠癌	深度学习	NA	图像, 视频	基于146篇论文的分析	NA	NA	分割性能指标, 实时分析能力	NA
113	2025-10-05	A Flexible Multi-Channel Deep Network Leveraging Texture and Spatial Features for Diagnosing New COVID-19 Variants in Lung CT Scans 2025-Aug-27, Tomography (Ann Arbor, Mich.) DOI:10.3390/tomography11090099 PMID:41003482	研究论文	提出一种基于双通道CNN的深度学习方法，利用纹理和空间特征从肺部CT扫描中诊断新型COVID-19变异株	采用动态学习纹理模式的双通道CNN架构，无需依赖预定义特征，通过改进的LBP技术提取矩阵形式纹理数据	NA	开发自动诊断COVID-19变异株的深度学习方法	COVID-19变异株的肺部CT扫描图像	计算机视觉	COVID-19	肺部计算机断层扫描(CT)	CNN	医学图像	两个基准数据集：COVID-349和Italian COVID-Set	NA	双通道卷积神经网络	准确率, 精确率, 召回率	NA
114	2025-10-05	Directional Lighting-Based Deep Learning Models for Crack and Spalling Classification 2025-Aug-25, Journal of imaging IF:2.7Q3 DOI:10.3390/jimaging11090288 PMID:41003339	研究论文	提出两种基于定向照明的深度学习算法用于混凝土裂缝和剥落分类	首次使用定向照明而非均匀漫射照明来分类混凝土缺陷，提出融合神经网络和多通道神经网络两种新方法	未明确说明样本数量和具体计算资源需求	改进低光环境下混凝土结构的自动检测能力	混凝土结构的裂缝和剥落缺陷	计算机视觉	NA	定向照明技术	深度学习模型	图像	NA	NA	融合神经网络, 多通道神经网络	准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
115	2025-10-05	Solar Panel Surface Defect and Dust Detection: Deep Learning Approach 2025-Aug-25, Journal of imaging IF:2.7Q3 DOI:10.3390/jimaging11090287 PMID:41003338	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的自动化太阳能电池板表面缺陷检测系统	采用YOLOv11模型结合计算机视觉技术，构建了包含五种异常类别的检测系统，并集成到实时监控仪表板中	NA	提高太阳能电池板维护效率，实现自动化缺陷检测	太阳能电池板表面缺陷和灰尘	计算机视觉	NA	深度学习，计算机视觉	YOLO	图像	8973张图像	NA	YOLOv11	mAP@0.5, 准确率, 召回率, F1分数	边缘设备
116	2025-10-05	Performance of a Deep Learning Reconstruction Method on Clinical Chest-Abdomen-Pelvis Scans from a Dual-Layer Detector CT System 2025-Aug-25, Tomography (Ann Arbor, Mich.) DOI:10.3390/tomography11090094 PMID:41003477	研究论文	比较深度学习重建方法与现有方法在软组织CT图像重建中的性能和鲁棒性	首次在双层探测器CT系统上评估深度学习重建方法，并与传统滤波反投影和迭代模型重建进行系统比较	样本量相对较小（99例扫描），其中1例因恶病质被排除，可能影响统计功效	评估深度学习重建方法在临床胸腹盆CT扫描中的性能	临床胸腹盆CT扫描图像	医学影像	NA	CT扫描	深度学习重建	CT图像	99例胸腹盆CT扫描（最终分析98例）	NA	NA	衰减稳定性，图像噪声水平，Likert量表评分	NA
117	2025-10-05	An Enhanced MIBKA-CNN-BiLSTM Model for Fake Information Detection 2025-Aug-23, Biomimetics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/biomimetics10090562 PMID:41002796	研究论文	提出一种名为MIBKA-CNN-BiLSTM的混合检测模型，用于虚假信息检测	通过三策略增强的黑鸢优化算法(MIBKA)和优化的双通道深度学习架构，显著提升检测精度和效率	NA	提高虚假信息检测的准确性和效率	社交媒体平台上的虚假信息	自然语言处理	NA	NA	CNN, BiLSTM	文本	自建数据集和Weibo21数据集	NA	CNN-BiLSTM双通道特征提取网络	准确率, F1-score	NA
118	2025-10-05	Mobile Mental Health Screening in EmotiZen via the Novel Brain-Inspired MCoG-LDPSNet 2025-Aug-23, Biomimetics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/biomimetics10090563 PMID:41002797	研究论文	本研究提出了一种名为MCoG-LDPSNet的脑启发模型，用于移动心理健康筛查，通过新型激活函数解决类别不平衡问题	提出结合双正交编码通路与新型损失驱动参数化Swish激活函数的脑启发模型，通过可学习β参数实现神经生物学启发的自适应增益机制	NA	开发能够处理严重类别不平衡的移动心理健康筛查解决方案	焦虑和抑郁患者	自然语言处理	心理健康疾病	深度学习	MCoG-LDPSNet	文本数据	NA	NA	MCoG-LDPSNet	AUROC, G-mean	NA
119	2025-10-05	An integrative assay for measuring social aversion and motivation in freely behaving mice 2025-Aug-18, Cell reports methods IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101108 PMID:40680732	研究论文	开发了一种名为SAUSI的行为测试方法，用于综合评估自由行为小鼠的社会厌恶和动机	整合了社会动机、犹豫和自由互动元素，能够对社会厌恶进行多重评估	NA	开发评估社会厌恶的行为工具并研究其神经机制	小鼠	行为神经科学	精神健康障碍	行为测试，深度学习	深度学习模型	行为数据	NA	NA	NA	NA	NA
120	2025-10-05	Performance Degradation between Development and Deployment of a Predictive Model for Central Line-Associated Bloodstream Infections in Hospitalized Children 2025-Aug, Applied clinical informatics IF:2.1Q4 DOI:10.1055/a-2605-1847 PMID:40355126	研究论文	本研究探讨儿科中心静脉导管相关血流感染预测模型从开发到临床部署过程中的性能退化问题	创建了新型数据基础设施来处理实时和历史数据，并系统分析了预测模型从开发到部署性能下降的根本原因	模型在部署后性能显著下降（AUROC从0.97降至<0.60），存在训练/服务偏差、特征泄漏和过拟合等问题	前瞻性实施儿科CLABSI预测模型并在临床实践中实现足够的性能	住院儿童中心静脉导管相关血流感染	机器学习	血流感染	深度学习	深度学习模型	临床特征数据	NA	NA	NA	AUROC	NA