深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
1621	2025-10-06	CSCE: Cross Supervising and Confidence Enhancement pseudo-labels for semi-supervised subcortical brain structure segmentation 2025-Nov, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2025.110522 PMID:40653056	研究论文	提出一种基于交叉监督和置信度增强伪标签的半监督皮层下脑结构分割框架	设计双师生模型(U-Net和TransUNet)相互生成伪标签进行交叉监督，并引入信息熵和辅助检测任务增强伪标签置信度	仅使用两个公开脑MRI数据集进行验证，未在更多临床场景测试	开发半监督学习方法以解决脑部结构分割中标注数据稀缺的问题	脑部MR图像中的皮层下结构	医学图像分割	脑部疾病	脑部MRI	U-Net, TransUNet	脑部MR图像	两个公开脑MRI基准数据集	NA	U-Net, TransUNet	Dice系数, MHD(平均豪斯多夫距离)	NA
1622	2025-10-06	Multi-class mental Task Classification based Brain-Computer Interface using Improved Remora depthwise convolutional adaptive neuro-fuzzy inference network model 2025-Nov, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2025.110536 PMID:40681115	研究论文	提出一种基于改进Remora深度卷积自适应神经模糊推理网络模型的多类心理任务分类脑机接口系统	提出IRDCANFIN分类器模型，结合改进的Remora优化算法进行参数调优，并采用混合动态中心二值模式和多阈值三值模式进行特征提取	未明确说明计算资源需求和实时性能的具体表现	开发准确可靠的多类心理任务分类脑机接口系统	脑电信号和心理任务分类	脑机接口	运动障碍疾病	脑电信号采集	深度学习,神经模糊推理网络	EEG信号	BCI实验室数据集和EEG精神障碍数据集	NA	IRDCANFIN,1D-CNN-LSTM	准确率	NA
1623	2025-10-06	Hybrid two-stage CNN for detection and staging of periodontitis on panoramic radiographs 2025 Nov-Dec, Journal of oral biology and craniofacial research DOI:10.1016/j.jobcr.2025.08.019 PMID:40927498	研究论文	开发了一种混合两阶段CNN模型，用于在全景X光片上检测和分期牙周炎	首次将Mask R-CNN与DenseNet169集成用于牙周炎检测和分期，采用两阶段混合架构	需要进一步开发以提高临床适用性和准确性	评估混合两阶段CNN在全景X光片上检测和分期牙周炎的性能	牙周炎患者	计算机视觉	牙周炎	全景X光成像	CNN, DenseNet	医学影像	600张全景X光片（训练集）+ 100张外部测试X光片	NA	Mask R-CNN, DenseNet169	特异性, 准确率	NA
1624	2025-10-06	SST-DUNet: Smart Swin Transformer and Dense UNet for automated preclinical fMRI skull stripping 2025-Nov, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2025.110545 PMID:40789440	研究论文	提出一种结合智能Swin Transformer和密集UNet的自动化方法，用于预处理前fMRI颅骨剥离	将智能移位窗口多头自注意力模块集成到Swin Transformer中，替代原有的基于掩码的模块，能够学习不同通道特征并关注脑结构内的相关依赖性	方法仅在鼠类fMRI数据上验证，未在其他物种或MRI模态上测试	开发自动化颅骨剥离方法以替代手动预处理	大鼠功能磁共振成像数据	计算机视觉	NA	功能磁共振成像	Transformer, CNN	图像	三个内部数据集的大鼠fMRI图像	NA	SST-DUNet, Dense UNet, Smart Swin Transformer	Dice相似系数	NA
1625	2025-10-06	EEG-based cerebral pattern analysis for neurological disorder detection via hybrid machine and deep learning approaches 2025-Nov, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2025.110551 PMID:40816535	研究论文	本研究开发了一种结合随机森林和卷积神经网络的混合模型，用于基于EEG信号的神经系统疾病检测	首次将基于特征的随机森林机器学习与基于图像的卷积神经网络深度学习方法相结合，形成混合RF-CNN模型	NA	通过脑电信号分析检测神经系统疾病	轻度认知障碍、阿尔茨海默病和癫痫患者	机器学习	神经系统疾病	脑电图	RF, CNN	EEG信号	NA	NA	RF-CNN混合架构	准确率, F1分数	NA
1626	2025-10-06	Evaluation of the deep learning-based detection of dopaminergic neurons in primary culture: A practical alternative to manual counting 2025-Nov, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2025.110557 PMID:40819676	研究论文	评估基于深度学习的多巴胺能神经元自动检测方法，作为手动计数的实用替代方案	首次系统比较传统级联分类器与基于YOLOv3的深度学习模型在检测多巴胺能神经元中的性能表现	研究仅限于体外培养的多巴胺能神经元，未验证在其他细胞类型或组织中的适用性	开发自动化的神经元计数方法以替代传统手动计数	酪氨酸羟化酶阳性的多巴胺能神经元	计算机视觉	神经系统疾病	免疫染色	CNN	图像	NA	NA	YOLOv3	精确度, 处理时间	NA
1627	2025-10-06	Development and Validation of a Semiautomated Tool for Measuring Periorbital Distances 2025 Nov-Dec, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2025.100887 PMID:40917265	研究论文	开发并验证了一种用于测量眼周距离的半自动化工具OrbitJ，并与人工测量及两种AI工具进行比较	开发了基于FIJI(ImageJ)的半自动化眼周测量工具，结合线性插值和四次多项式拟合，提高了测量效率和可重复性	样本量较小(45例)，仅针对唇腭裂综合征患者，PeriOrbitAI工具在6张图像上分析失败	验证眼周测量工具的准确性和效率	45例唇腭裂综合征患者的正面照片	医学图像分析	唇腭裂综合征	图像分析，线性插值，多项式拟合	深度学习算法	图像	45张患者照片	FIJI(ImageJ)	NA	平均绝对误差，可靠性，偏差，Pearson相关系数，组内相关系数(ICC)	NA
1628	2025-10-06	MRI-based diffusion weighted imaging and diffusion kurtosis imaging grading of clear cell renal cell carcinoma using a deep learning classifier 2025-Nov, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2025.15246 PMID:40917726	研究论文	本研究开发了一种基于MRI扩散加权成像和扩散峰度成像的深度学习模型，用于术前预测透明细胞肾细胞癌的病理分级	首次结合DWI和DKI序列图像构建深度学习模型用于ccRCC病理分级预测，采用VGG-16作为主干网络架构	样本量相对较小（仅79例患者），需要更大规模的研究验证模型泛化能力	验证基于MRI的深度学习模型在术前预测透明细胞肾细胞癌病理分级的有效性	79例透明细胞肾细胞癌患者（40例低级别，39例高级别）	医学影像分析	肾细胞癌	MRI, 扩散加权成像(DWI), 扩散峰度成像(DKI)	深度学习	医学影像	79例ccRCC患者（40例低级别，39例高级别）	NA	VGG-16	准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
1629	2025-10-06	Artificial Intelligence in Liver Pathology: Precision Histology for Accurate Diagnoses 2025 Nov-Dec, Journal of clinical and experimental hepatology IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.jceh.2025.103145 PMID:40927758	综述	本文综述了人工智能在肝脏病理学中的应用，重点探讨AI如何推动精准组织学诊断的发展	系统阐述AI在肝脏组织学中减少重复任务负担、预测多种结果、降低观察者间变异性的创新应用	未提供具体实验数据验证AI模型在肝脏病理中的实际性能表现	探讨人工智能技术在肝脏病理学和精准组织学诊断中的应用价值与挑战	肝脏组织病理学数据和诊断流程	数字病理学	肝脏疾病	全玻片成像, 数字病理学	机器学习, 深度学习	病理图像	NA	NA	NA	NA	NA
1630	2025-10-06	Identification of syrup adulteration in wolfberry honey using CNN-CBAM-SVM combined with 1H NMR 2025-Nov-30, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.145728 PMID:40752444	研究论文	开发基于CNN-CBAM-SVM架构结合氢核磁共振谱的深度学习模型用于检测枸杞蜂蜜中的糖浆掺假	在传统CNN模型中引入CBAM注意力模块并用SVM分类器替代全连接层，使其更适合小样本数据	样本量较小（仅40个样本），验证集样本数量有限（8个样本）	检测蜂蜜中的糖浆掺假问题	枸杞蜂蜜样品	计算机视觉	NA	氢核磁共振（1H NMR）	CNN, SVM	光谱数据	40个样本（20个真品和20个掺假样品，含两种不同糖浆）	NA	CNN-CBAM-SVM	准确率	NA
1631	2025-10-06	Deep learning-based multimodal fusion for quality prediction of chili paste using hyperspectral imaging and near-infrared spectroscopy 2025-Nov-30, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.145712 PMID:40743732	研究论文	开发基于深度学习的多模态融合系统，通过融合高光谱成像和近红外光谱技术无损预测辣椒酱品质	首次建立辣椒酱发酵的无损快速检测框架，采用CNN-LSTM混合模型实现多模态特征融合	样本量较小（原始仅160个样本），需通过数据增强扩充	开发智能多模态系统用于辣椒酱品质的无损评估	辣椒酱的品质参数（颜色值、辣椒素、二氢辣椒素和挥发性物质）	计算机视觉	NA	高光谱成像（HSI）、近红外光谱	CNN, LSTM	高光谱图像、光谱数据、理化指标	160个原始样本，通过Mixup增强扩展到800个样本	NA	CNN-LSTM混合模型	决定系数R	NA
1632	2025-10-06	Verification of resolution and imaging time for high-resolution deep learning reconstruction techniques 2025-Nov, Magnetic resonance imaging IF:2.1Q2 DOI:10.1016/j.mri.2025.110463 PMID:40706823	研究论文	评估供应商提供的超分辨率深度学习重建方法在磁共振成像中的性能表现	首次系统评估了商用超分辨率DLR方法(PIQE)在不同参数配置下的性能边界，明确了最佳使用条件	研究样本量较小(仅8例患者)，且仅针对特定厂商的MRI扫描仪和算法	验证超分辨率深度学习重建技术在MRI中的分辨率和成像时间优化效果	边缘模体和8例患者的临床脑部图像	医学影像分析	神经系统疾病	磁共振成像, 深度学习重建	深度学习	医学图像	8例患者脑部图像	供应商专有算法(Precise IQ Engine)	超分辨率重建网络	SSIM, PSNR, RMSE, FWHM, 五分制Likert量表	佳能3T MRI扫描仪
1633	2025-10-06	Applications of artificial intelligence in liver cancer: A scoping review 2025-Nov, Artificial intelligence in medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.artmed.2025.103244 PMID:40818357	综述	本文系统回顾了人工智能在原发性肝癌管理中的应用进展	全面梳理了AI在肝癌筛查、诊断、治疗规划和预后预测等全流程中的应用现状	多数模型缺乏充分的临床适用性评估和外部验证，开发与临床应用存在差距	探索人工智能在肝癌管理中的应用潜力	原发性肝癌（肝细胞癌和肝内胆管癌）	机器学习	肝癌	机器学习，深度学习	深度学习模型	医学影像数据（CT，MRI）	从13,122篇文献中筛选出62篇进行详细分析	NA	NA	敏感性，特异性	NA
1634	2025-10-06	Deep learning-augmented inductively coupled plasma atomic emission spectrometry for multivariate authentication of green tea origin and grades 2025-Nov, Food research international (Ottawa, Ont.) DOI:10.1016/j.foodres.2025.117015 PMID:40922162	研究论文	开发了一种结合多种金属元素分析和反向传播神经网络的方法，用于同时鉴定绿茶的产地和等级	首次将ICP-AES与BPNN结合用于同时鉴定茶叶产地和等级，并采用SHAP进行模型解释和优化	仅针对龙井茶等特定绿茶品种进行研究，样本多样性可能有限	建立简单可靠的绿茶产地和等级同时鉴定方法	绿茶样本（如龙井茶）	机器学习	NA	电感耦合等离子体原子发射光谱法（ICP-AES）	BPNN（反向传播神经网络）	光谱数据，元素含量数据	NA	NA	BPNN	准确率	NA
1635	2025-10-06	From droplets to diagnosis: AI-driven imaging and system integration in digital nucleic acid amplification testing 2025-Nov-15, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2025.117741 PMID:40664140	综述	系统综述人工智能驱动的荧光图像分析在数字核酸扩增检测中的应用与发展	首次系统整合AI在dNAAT荧光图像分析中的应用，提出将dNAAT重新定义为五个阶段的结构化框架，并探索AI原生平台的转化机遇	数据稀缺性和模型泛化能力等关键限制	推动数字核酸扩增检测在即时检测中的广泛应用	数字核酸扩增检测技术及其在精准诊断中的应用	数字病理	NA	数字PCR、等温扩增技术、荧光成像	深度学习、基础模型	荧光图像	NA	NA	SAM, ViT, GPT-4o	NA	NA
1636	2025-10-06	Deep learning estimations of the production cross sections of 77Br medical radionuclide 2025-Nov, Applied radiation and isotopes : including data, instrumentation and methods for use in agriculture, industry and medicine IF:1.6Q3 DOI:10.1016/j.apradiso.2025.112003 PMID:40517722	研究论文	本研究利用深度学习算法改进溴-77医用放射性核素生产截面的预测	首次将深度学习算法应用于溴-77放射性核素生产截面的预测，相比传统TALYS代码计算能更准确地符合实验值	仅针对特定核反应类型进行研究，未验证其他可能的核反应途径	提高医用放射性核素溴-77生产截面的预测精度	溴-77放射性核素	机器学习	NA	核反应截面测量	人工神经网络	核反应实验数据	来自EXFOR核反应数据库的实验截面数据	Python	NA	与实验值符合度	NA
1637	2025-10-06	Combining deep learning algorithm and a-star algorithm to increase the accuracy of tracking lost gamma source 2025-Nov, Applied radiation and isotopes : including data, instrumentation and methods for use in agriculture, industry and medicine IF:1.6Q3 DOI:10.1016/j.apradiso.2025.112001 PMID:40532512	研究论文	提出一种结合深度学习算法和A-star算法的自动搜索算法ACR，用于提高丢失伽马源的追踪精度	首次将CNN和RNN两种深度学习算法与A-star路径规划算法相结合，用于伽马源追踪任务	研究基于MCNP模拟数据，未提及在真实环境中的验证结果	开发高精度的自动搜索算法来定位丢失的伽马源	丢失的伽马辐射源	机器学习	NA	蒙特卡洛N粒子(MCNP)模拟	CNN, RNN	辐射剂量率数据	81个网格的模拟辐射数据	NA	CNN-RNN混合架构	平均步数, 失败率	NA
1638	2025-10-06	DeepNSI: Element identification in experimental photoneutron spectra for illicit material detection 2025-Nov, Applied radiation and isotopes : including data, instrumentation and methods for use in agriculture, industry and medicine IF:1.6Q3 DOI:10.1016/j.apradiso.2025.112014 PMID:40580656	研究论文	提出DeepNSI深度学习框架，用于在光子诱导中子谱中识别元素组成以检测非法材料	开发了基于元素特定卷积神经网络集成的新型框架，结合蒙特卡洛Dropout提供预测不确定性，并采用非负最小二乘后处理重构实验谱	NNLS系数受核截面影响，不能直接解释为浓度值	开发用于非法材料检测的元素组成识别方法	光子诱导中子谱中的元素组成，特别是氮和氧等轻元素	机器学习	NA	光中子谱法	CNN	中子谱数据	模拟和实验光中子谱混合数据集	NA	卷积神经网络集成	预测不确定性估计	NA
1639	2025-10-06	DHR-Net: Dynamic Harmonized registration network for multimodal medical images 2025-Nov, Applied radiation and isotopes : including data, instrumentation and methods for use in agriculture, industry and medicine IF:1.6Q3 DOI:10.1016/j.apradiso.2025.112031 PMID:40633305	研究论文	提出一种基于动态协调注册框架的端到端多模态医学图像配准方法DHR-Net	提出动态协调注册框架和基于噪声对比估计的损失函数，采用动态温度调整机制优化特征对比约束	NA	解决多模态医学图像配准中解剖结构一致性不足和形变场优化不稳定的问题	心脏医学图像	医学图像处理	心血管疾病	深度学习	CNN	医学图像	M&M心脏数据集	NA	级联两阶段架构（包含翻译网络和配准网络）	配准精度, 形变场平滑度, 跨模态鲁棒性	NA
1640	2025-10-06	Exploring Biginelli hybrids in the AI-driven development of ruthenium complexes: Anticancer activity, DNA/HSA binding study, impacts on apoptosis and BCL-2/BCL-XL suppression 2025-Nov, Journal of inorganic biochemistry IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.jinorgbio.2025.112988 PMID:40644785	研究论文	本研究利用深度学习模型设计具有抗癌潜力的四氢嘧啶及其钌对伞花烃配合物，并通过实验验证其抗癌活性和作用机制	首次将深度学习模型应用于钌配合物的结合亲和力预测，并系统研究其对癌细胞凋亡和BCL-2/BCL-XL抑制的影响	仅针对特定类型的钌配合物进行研究，样本量有限，需要进一步扩大化合物库验证	开发新型钌基抗癌药物并研究其作用机制	四氢嘧啶类化合物及其钌对伞花烃配合物	药物发现	癌症	深度学习，分子对接，结合亲和力预测	深度学习模型	化学结构数据，结合能数据	10个结合能低于-31.3 kJ/mol的化合物	NA	NA	结合能，结合常数，细胞毒性活性	NA