深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
441	2025-09-11	Editorial for "A Deep Learning-Based Fully Automated Cardiac MRI Segmentation Approach for Tetralogy of Fallot Patients" 2026-Jan, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.70114 PMID:40928233	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
442	2025-12-17	Innovative Learning in Anatomy Education: Assessing the Impact of Low-Cost 3D Deep Learning Anatomical Models in Museum-Based Instruction 2026-Jan, Journal of surgical education IF:2.6Q1 DOI:10.1016/j.jsurg.2025.103748 PMID:41187606	研究论文	本研究评估了基于低成本3D深度学习解剖模型的虚拟解剖博物馆教学方法对医学生临床推理和解剖学理解的影响	将低成本的交互式3D模型与深度学习技术（PointNeXt和AnatoVision Block）结合，创建了一个虚拟解剖博物馆平台，用于增强医学生的临床相关性和空间定向能力	研究样本量较小（40名学生），且为概念验证性研究；技术困难报告率为25%；对照组采用传统授课加3D打印模型，与实验组的数字交互方法存在质性差异，并非直接比较	评估虚拟解剖博物馆教学方法在提升医学生临床推理和解剖学熟练度方面的有效性	沙特阿拉伯国王哈立德大学应用医学科学学士课程的40名本科医学生	数字病理	NA	虚拟解剖博物馆、交互式3D可视化	深度学习	3D模型、问卷数据	40名本科医学生（实验组20人，对照组20人）	NA	PointNeXt, AnatoVision Block	平均分、标准差、p值、百分比	NA
443	2025-12-17	Predicting Radiation Pneumonitis Integrating Clinical Information, Medical Text, and 2.5D Deep Learning Features in Lung Cancer 2026-Jan-01, International journal of radiation oncology, biology, physics DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.07.1437 PMID:40844448	研究论文	本文构建了一个基于临床信息、医学文本和2.5D深度学习特征的肺癌患者放射性肺炎预测模型	提出了一种结合临床信息、医学文本和2.5D多实例学习特征的放射性肺炎预测模型，为预测放疗副作用提供了新思路	模型在不同测试队列中的最优模型类型存在差异，可能影响泛化能力	构建放射性肺炎的预测模型以评估放疗副作用	肺癌患者	数字病理学	肺癌	CT成像, 放射治疗剂量切片	深度学习模型	图像, 文本	594名患者（356名来自一个中心，238名来自三个其他中心）	NA	DenseNet121, DenseNet201, Twins-SVT	AUC	NA
444	2025-12-15	Molecular, metabolic, and histological subtypes of pancreatic ductal adenocarcinoma and its tumor microenvironment: Insights into tumor heterogeneity and clinical implications 2026-Jan, Pharmacology & therapeutics IF:12.0Q1 DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108946 PMID:41183744	综述	本文综述了胰腺导管腺癌（PDAC）在分子、代谢和组织学层面的亚型分类方法，旨在促进实用、经济高效的诊断和个性化医疗	整合了单细胞和空间转录组学、代谢组学以及深度学习在组织病理学中的应用，揭示了PDAC的肿瘤异质性、肿瘤微环境相互作用及亚型可塑性，为亚型指导的治疗策略提供了新视角	作为一篇综述，未提出新的实验数据或模型，主要基于现有研究进行总结和讨论	旨在全面概述PDAC的亚型异质性，以指导未来的亚型知情治疗策略	胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境	数字病理学	胰腺癌	单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 深度学习	深度学习模型	组织病理学图像（H&E染色切片）, 转录组数据, 代谢组数据	NA	NA	NA	NA	NA
445	2025-12-15	A transformer-based pathomics model using endoscopic biopsy WSIs for predicting pathological complete response to preoperative immunotherapy in colorectal cancer 2026-Jan, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology DOI:10.1016/j.ejso.2025.111182 PMID:41240799	研究论文	本研究基于内镜活检全切片图像，利用深度学习模型预测结直肠癌患者术前免疫治疗的病理完全缓解	结合Swin Transformer架构与卷积神经网络增强的自注意力机制，并采用CLAM框架优化病理图像分析，首次利用内镜活检WSIs预测结直肠癌术前免疫治疗的pCR	样本量较小（训练集72例，验证集23例），且为单中心回顾性研究，可能限制模型的泛化能力	构建预测模型以识别结直肠癌患者术前免疫治疗的病理完全缓解	结直肠癌患者	数字病理学	结直肠癌	H&E染色全切片图像分析	Transformer, CNN	图像	训练集72例，验证集23例	CLAM	Swin Transformer	AUC	NA
446	2025-12-15	Optimal artificial intelligence model based on gastrointestinal filling contrast-enhanced ultrasound: Risk stratification of gastric gastrointestinal stromal tumors 2026-Jan, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology DOI:10.1016/j.ejso.2025.111190 PMID:41265372	研究论文	本研究基于胃肠道充盈对比增强超声图像，开发了一种深度学习模型，用于胃胃肠道间质瘤的早期筛查、辅助诊断和风险分层评估	首次将深度学习模型应用于胃肠道充盈对比增强超声图像，以实现胃胃肠道间质瘤的客观风险分层预测，减少操作者经验和主观判断的影响	样本量相对较小（121例患者），且为单中心研究，可能影响模型的泛化能力	开发基于胃肠道充盈对比增强超声图像的深度学习模型，用于胃胃肠道间质瘤的早期筛查、辅助诊断和风险分类评估	原发性胃胃肠道间质瘤患者	计算机视觉	胃肠道间质瘤	胃肠道充盈对比增强超声	CNN	图像	121例原发性胃胃肠道间质瘤患者	NA	ResNet, CNN, ViT, EfficientNet	AUC	NA
447	2025-12-15	Uncertainty- and hardness-weighted loss functions for medical image segmentation 2026-Jan-01, Engineering applications of artificial intelligence IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.engappai.2025.113118 PMID:41383559	研究论文	本文提出了一种用于医学图像分割的新型不确定性/困难度加权损失函数，通过概率引导不确定性权重和区域增强困难度权重来提升分割精度	首次提出结合像素级预测不确定性和困难度的双重加权损失函数，通过PGU和REH权重机制动态调整训练关注点	实验仅基于四种特定医学图像数据集，未验证在更广泛模态或临床场景中的泛化能力	改进医学图像分割的精度，特别是减少边界区域的分割误差	视网膜青光眼图像、视网膜血管树图像、光学相干断层扫描图像和心房分割挑战数据集	计算机视觉	青光眼,心血管疾病	深度学习	Transformer, CNN	二维图像,三维图像	四个公开数据集（REFUGE, RETA, OCT, ASC）	PyTorch	Swin-Unet, V-Net	Dice系数,分割误差	未明确说明
448	2025-12-15	Feasibility of recent peptide therapy for ischemic stroke: a comprehensive exploration 2026-Jan, Journal of pharmacological sciences IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.jphs.2025.10.007 PMID:41390189	综述	本文综述了肽疗法在缺血性卒中治疗中的最新进展及其潜力	探讨了人工智能与深度学习在肽生成中的应用，以加速药物发现过程	NA	探索肽疗法作为缺血性卒中新型治疗策略的可行性	缺血性卒中及其相关分子通路	自然语言处理	心血管疾病	NA	深度学习	NA	NA	NA	NA	NA	NA
449	2025-12-14	NMR-based deep learning classification of raw cow's milk samples in different stages of mastitis 2026-Jan-30, Journal of the science of food and agriculture IF:3.3Q2 DOI:10.1002/jsfa.70200 PMID:40959907	研究论文	本研究利用核磁共振（NMR）数据和深度强化学习（DRL）协议，开发了一个用于对生牛奶样本在不同乳腺炎阶段进行分类的可靠预测模型	首次将未经预处理的生牛奶NMR数据作为指纹图谱，结合先进的张量分解方法和深度强化学习（DRL）协议，用于乳腺炎阶段的分类	未明确说明样本的具体数量，且模型在仅使用一半训练集时达到82%的准确率，可能表明数据量有限或模型泛化能力有待进一步验证	评估核磁共振（NMR）数据作为指纹图谱，结合深度强化学习（DRL）开发可靠的预测模型，以对生牛奶样本在不同乳腺炎阶段进行分类	健康奶牛（两组）以及患有亚临床（四组）和临床（一组）乳腺炎的奶牛的生牛奶样本	机器学习	乳腺炎	核磁共振（NMR），包括1H-NMR和扩散排序光谱（DOSY）NMR	深度神经网络（DNN），深度强化学习（DRL）	光谱数据（2D DOSY NMR谱）	NA	NA	NA	准确率	NA
450	2025-12-14	Artificial intelligence-based pollen classification machine in apiculture: design, implementation and evaluation 2026-Jan-30, Journal of the science of food and agriculture IF:3.3Q2 DOI:10.1002/jsfa.70238 PMID:41051118	研究论文	本文开发了一种基于人工智能的花粉分类系统，用于养蜂业中花粉的自动化分类和质量控制	利用深度学习模型（特别是DenseNet201和YOLOv8）基于颜色特性对花粉样本进行分类，实现了高精度（98.5%）和实时处理能力	实验室规模验证，可能未涵盖所有实际环境中的花粉类型和变异	开发一种标准化、可追溯的花粉产品分类系统，以支持养蜂业的可持续和卫生花粉采集	花粉样本，特别是单花种花粉类型	计算机视觉	NA	深度学习驱动的图像分类	CNN	图像	未明确指定样本数量，但涉及实验室规模验证	未明确指定，但可能基于TensorFlow或PyTorch	MobileNet, InceptionV3, Xception, NasNet Large, DenseNet201, YOLOv8	准确率	未明确指定
451	2025-12-13	Circulating microRNAs in viral myocarditis: Advancements in biological understanding and potential clinical applications 2026-Jan-10, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149866 PMID:41177414	综述	本文系统综述了循环microRNAs在病毒性心肌炎中的生物学作用、临床诊断与治疗应用潜力及局限性	整合了高通量测序、深度学习和人工智能技术，以深入理解循环microRNAs在病毒性心肌炎发病机制中的调控网络作用	作为综述文章，未进行原始实验研究，依赖于现有文献证据，可能存在发表偏倚	为改善病毒性心肌炎的精准诊断和治疗建立理论基础和策略框架	循环microRNAs及其在病毒性心肌炎中的调控网络	自然语言处理	心血管疾病	高通量测序技术	深度学习	文本	NA	NA	NA	NA	NA
452	2025-12-13	Open Lumbar Spine Image Analysis: A 3D Slicer Extension for Segmentation, Grading, and Intervertebral Disc Height Index With Multi-Data Set Validation 2026-Jan-01, Spine IF:2.6Q1 DOI:10.1097/BRS.0000000000005462 PMID:40747922	研究论文	本研究开发了一个名为OLSIA的开放软件，用于腰椎图像分析，实现无代码的腰椎分割、分级和椎间盘高度指数计算，并在多个外部数据集上进行了验证	开发了首个集成深度学习模型的无代码腰椎图像分析软件，支持自动化分割、分级和DHI计算，并在6个不同地理区域的外部数据集上进行了鲁棒性评估	研究主要基于T2加权矢状位切片，可能未涵盖所有腰椎成像模态；尽管在多个数据集中验证，但样本量仍有限	开发一个开放、用户友好的软件工具，以加速腰椎图像的放射组学和分析工作流程	腰椎图像，特别是T2加权矢状位切片中的L1至S1椎体和L1/2至L5/S1椎间盘	数字病理	脊柱疾病	深度学习，图像增强（直方图裁剪、中值滤波、几何缩放）	深度学习模型	医学图像（T2加权MRI切片）	训练使用NFBC1966数据集，外部评估从6个数据集中各采样30名参与者，总计180名外部样本	NA	NA	Dice相似系数，Bland-Altman分析，配对t检验	NA
453	2025-12-13	Prediction of neoadjuvant therapy response to HER2-positive and triple-negative breast cancer: a multicenter proof-of-concept study 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109130 PMID:41135295	研究论文	本研究开发了一个基于乳腺X线摄影、多参数MRI和临床特征的深度学习框架，用于预测HER2阳性和三阴性乳腺癌患者新辅助治疗后的病理完全缓解	提出了一种结合多模态影像（ADC、DCE-MRI、SPAIR T2WI、DWI、CC、MLO）和临床特征的融合模型，用于预测乳腺癌新辅助治疗反应	回顾性研究，样本量相对有限（359例），且仅来自两个机构，可能存在选择偏倚	预测HER2阳性和三阴性乳腺癌患者新辅助治疗后的病理完全缓解	HER2阳性和三阴性乳腺癌患者	数字病理	乳腺癌	乳腺X线摄影，多参数MRI（包括ADC、DCE-MRI、SPAIR T2WI、DWI）	深度学习	影像（乳腺X线摄影、MRI），临床特征	359名乳腺癌患者（来自两个机构）	NA	DenseNet169-CBAM, Multi-Layer Perceptron	AUC, 准确率, 敏感性, 特异性	NA
454	2025-12-12	Using Deep Learning With Few-Shot Learning to Improve Data Capture in Total Hip Arthroplasty Operative Notes 2026-Jan, The Journal of arthroplasty IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.arth.2025.06.008 PMID:40484056	研究论文	本研究评估了使用GPT-4结合少样本学习技术，从全髋关节置换术手术记录中提取植入物固定方式、技术使用和手术入路信息的可行性	首次将GPT-4与自定义少样本学习提示结合，应用于骨科手术记录的自动化数据提取，并生成临床分类的详细理由	研究为单中心试点，样本量有限（240份记录），且仅针对全髋关节置换术，未验证在其他手术或医疗场景的泛化能力	提高全髋关节置换术手术记录中关键信息的自动化提取准确性和效率，以支持大规模骨科数据登记和分析	全髋关节置换术的手术记录文本	自然语言处理	骨科疾病	少样本学习	GPT-4	文本	240份独特手术记录（来自38名外科医生，2011年11月至2024年3月）	NA	GPT-4	准确率, Flesch-Kincaid等级分数, 自BLEU分数, 字符级序列匹配率	NA
455	2025-12-12	Systematic review and meta-analysis of artificial intelligence models for diagnosing and subphenotyping ARDS in adults 2026 Jan-Feb, Heart & lung : the journal of critical care IF:2.4Q2 DOI:10.1016/j.hrtlng.2025.09.017 PMID:41037977	系统综述与荟萃分析	本文通过系统综述和荟萃分析评估了人工智能模型在成人ARDS诊断和亚表型识别中的诊断性能与方法学质量	首次对人工智能模型在ARDS诊断和亚表型识别方面的研究进行了全面的系统综述和荟萃分析，并评估了其方法学质量及AI特定指标	研究存在高异质性，校准报告缺失较多，外部验证不足，亚表型研究仍处于探索阶段	评估人工智能模型在成人ARDS及其亚表型识别中的诊断性能和方法学质量	成人ARDS患者	机器学习	急性呼吸窘迫综合征	NA	深度学习, 机器学习	图像, 非图像数据	63项研究，共135,762名参与者	NA	NA	灵敏度, 特异性, AUROC	NA
456	2025-12-12	Classifying retinal degeneration using OCT and histological images in a rodent model for retinal degeneration by deep learning 2026-Jan, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110748 PMID:41241339	研究论文	本研究首次使用深度学习模型，结合OCT和组织学图像，对啮齿类动物视网膜变性模型进行分期分类，并从OCT图像预测视力	首次在临床前视网膜变性模型中，同时使用OCT和组织学图像进行分期分类，并实现从OCT图像预测视力功能	研究仅在RCS大鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证	利用深度学习对视网膜变性进行客观、准确的分期分类和功能预测	皇家外科医生学院（RCS）大鼠，一种广泛使用的视网膜变性模型	计算机视觉	视网膜变性	光学相干断层扫描（OCT），组织学成像	CNN	图像	35只大鼠，OCT图像62,070张，组织学图像16,306张	NA	ResNet18	准确率，F1分数，均方误差，平均绝对误差	NA
457	2025-12-12	Deep Learning Approaches for Thrombosis Detection and Risk Assessment Via Ultrasound Imaging: A Scoping Review 2026-Jan, Ultrasound in medicine & biology DOI:10.1016/j.ultrasmedbio.2025.09.019 PMID:41136271	综述	本文是一篇范围综述，探讨了深度学习技术在超声成像中用于血栓检测和风险评估的应用现状	系统性地综述了深度学习在静脉、动脉和心脏血栓超声检测与风险评估中的应用，并识别了当前的研究趋势和未来方向	纳入研究的数据集和验证方法存在显著异质性，且缺乏标准化、可公开访问的数据集	调查深度学习技术如何应用于超声成像，以增强血栓的检测和风险评估	超声成像中的血栓，涉及静脉、动脉和心脏等不同血管环境	计算机视觉	心血管疾病	超声成像，包括B型超声、多普勒超声、血管内超声和经食道超声心动图	CNN, U-Net, ResNet, ANN	图像	NA	NA	卷积神经网络, U-Net, 残差神经网络, 人工神经网络	灵敏度, 特异度, 准确率, AUC	NA
458	2025-12-12	Biomarker-Specific Test-Retest Repeatabilities of Microperimetry in Neovascular Age-Related Macular Degeneration 2026-Jan, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2025.100978 PMID:41362358	研究论文	本研究评估了微视野检查在新生血管性年龄相关性黄斑变性患者中针对特定生物标志物的设备内和设备间重复性	首次结合深度学习量化OCT生物标志物，系统评估了不同光照条件下微视野检查的重复性及其与特定生物标志物的关联	样本量较小（20只眼），仅纳入nAMD患者，未包含健康对照组或其他视网膜疾病	评估微视野检查在nAMD患者中的重复性，并探究OCT生物标志物对重复性的影响	20名新生血管性年龄相关性黄斑变性患者的20只眼	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	微视野检查，OCT成像，深度学习图像分析	深度学习模型	图像，功能测试数据	20只眼（来自20名nAMD患者）	NA	NA	Bland-Altman图，重复性系数，组内相关系数，混合效应模型P值	NA
459	2025-12-12	Predicting Attainment of Clinically Important Difference in the Japanese Orthopaedic Association Back Pain Evaluation Questionnaire: A Comparison of Deep Learning and Machine Learning 2026-Jan-01, Spine IF:2.6Q1 DOI:10.1097/BRS.0000000000005534 PMID:41066627	研究论文	本研究比较了三种人工智能模型（TabNet、深度神经网络和弹性网络惩罚逻辑回归）在预测日本骨科协会背痛评估问卷临床重要差异达成方面的能力	首次将TabNet等深度学习模型应用于预测背痛手术后功能改善的临床重要差异，并通过多中心数据进行训练和外部验证	研究为回顾性设计，可能存在选择偏倚；样本量相对有限，且仅基于日本患者数据，可能影响模型的泛化能力	评估人工智能模型在预测腰椎手术后患者报告结局改善方面的准确性和可靠性	来自三个脊柱中心的1149名接受腰椎手术的患者	机器学习	背痛	患者报告结局测量（JOABPEQ和VAS评分）	TabNet, DNN, ENLR	结构化临床数据（包括年龄、性别、术前评分等）	1149名患者（训练集981名，外部验证集168名）	NA	TabNet, 深度神经网络, 弹性网络惩罚逻辑回归	AUC, 准确率	NA
460	2025-12-12	Transformer-based deep learning architecture for multivariable radioactive source term inversion 2026-Jan, Journal of environmental radioactivity IF:1.9Q3 DOI:10.1016/j.jenvrad.2025.107835 PMID:41082808	研究论文	本文开发了一种基于Transformer的深度学习架构，用于多变量放射性源项反演，以支持核应急响应和后果评估	首次将Transformer架构结合贝叶斯优化应用于放射性源项的多变量反演，并通过特征消融分析揭示了高浓度监测点对反演的重要性	在耦合所有三个变量的场景中，释放高度的决定系数较低（0.72），表明模型在该变量上的反演性能有待提升	开发一种深度学习模型，用于准确估计放射性源项的多个变量（释放速率、高度和位置）	放射性源项的反演，包括释放速率、释放高度和释放位置	机器学习	NA	CALMET-LAPMOD耦合模型，Kincaid示踪实验验证	Transformer	模拟数据集	针对五种代表性场景系统构建的数据集，具体样本数量未明确说明	NA	Transformer	决定系数（R），平均距离误差，95%置信水平	NA