深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
741	2025-11-14	Analysis of moldy peanuts by Raman hyperspectral imaging 2026-Feb-15, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy DOI:10.1016/j.saa.2025.126971 PMID:41038081	研究论文	利用拉曼高光谱成像技术分析混合品种霉变花生	结合一维光谱数据和二维空间信息，采用s-GoogLeNet深度学习模型实现混合品种霉变花生的高精度检测	仅针对五种特定花生品种进行研究，未涉及其他品种或更广泛的应用场景	开发霉变花生的快速检测方法以提高粮食安全	混合品种霉变花生（包括白沙、伯克、红沙、花红和花衣红火五个品种）	计算机视觉	NA	拉曼高光谱成像	深度学习,传统机器学习	高光谱图像	五种花生品种的混合样本	NA	s-GoogLeNet	准确率,F1分数	NA
742	2025-11-14	Deep neural network-based detection of lead contamination via Förster resonance energy transfer in live cells 2026-Feb-15, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy DOI:10.1016/j.saa.2025.127015 PMID:41075414	研究论文	本研究开发了一种基于FRET生物传感器和深度学习模型的便携式铅污染检测方法	首次将FRET生物传感器与EfficientNet深度学习模型结合，实现现场可部署的铅污染水平分类	30分钟和60分钟反应时间的AUC分别为69.8%和72.0%，识别准确率有待进一步提升	开发一种能够现场检测铅污染水平的便携式检测平台	HEK293T活细胞中的铅离子浓度	计算机视觉	重金属中毒	FRET（Förster共振能量转移）、荧光显微镜、活细胞成像	CNN	图像	1131对图像（30分钟和60分钟反应时间）	NA	EfficientNet	AUC, Youden's J统计量, 损失函数	NA
743	2025-11-14	Deep learning with multimodal Raman spectral fusion framework: An analytical approach for microalgal lipid quantification 2026-Feb-15, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy DOI:10.1016/j.saa.2025.127009 PMID:41076933	研究论文	本研究提出了一种融合多模态拉曼光谱与深度学习的微藻脂质定量分析方法	创新性地将深度学习与多模态拉曼成像相结合，构建了基于双分支注意力机制的卷积神经网络，实现了微藻单细胞脂质积累的精确动态调控	NA	开发精确、绿色、动态的微藻脂质定量检测方法，阐明超声波诱导脂质合成机制	微藻细胞	机器学习	NA	多频超声波、拉曼光谱、RGB成像	CNN	拉曼光谱数据、RGB图像	NA	NA	双分支注意力卷积神经网络(DBACNN)	决定系数(R)、均方根误差(RMSE)	NA
744	2025-11-14	A Shape and Size-Scaled Deep Learning Brain Injury Model for Near Real-Time Dynamic Impact Simulation 2026-Feb-01, Journal of biomechanical engineering DOI:10.1115/1.4070192 PMID:41134603	研究论文	本研究开发了一种形状和尺寸可缩放的深度学习脑损伤模型，用于近实时动态冲击模拟	将通用的50百分位成年男性脑模型扩展到适用于男性、女性和青少年的个性化替代模型，并引入三个缩放因子作为额外输入	模型基于模拟数据训练，需要进一步验证真实世界应用的准确性	开发快速估计脑变形的高效深度学习脑损伤模型	创伤性脑损伤(TBI)中的脑变形和轴索损伤	数字病理	创伤性脑损伤	深度学习，有限元模拟	CNN	体素化脑-颅骨相对位移数据	1363个基于随机缩放Worcester头部损伤模型V1.0的模拟头部冲击样本	NA	多任务卷积神经网络	R2, RMSE, 线性回归斜率, Pearson相关系数, 成功率	笔记本电脑(<1秒) vs 高端集群(>30分钟)
745	2025-11-14	MultiExCam: A multi approach and explainable artificial intelligence architecture for skin lesion classification 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109081 PMID:41021995	研究论文	提出一种用于皮肤病变分类的多方法可解释人工智能架构MultiExCam	首次实现深度学习与机器学习的真正混合集成，采用自适应集成架构学习个性化决策策略，结合GradCAM和SHAP提供全面可解释性	未明确说明计算资源需求和模型训练时间	开发能够同时提供高诊断性能和临床可解释性的皮肤癌检测AI系统	皮肤病变图像分类	计算机视觉	皮肤癌	数字成像处理	CNN, 集成学习, 前馈神经网络	皮肤镜图像, 深度学习特征, 手工统计特征	三个数据集（HAM10000, ISIC, MED-NODE）	NA	卷积神经网络, 前馈神经网络（带门控和注意力机制）	AUC, F1-score	NA
746	2025-11-14	A deep learning model leveraging semantic features fusion for DNase I hypersensitive sites identification in the human genome 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109127 PMID:41151193	研究论文	提出多种深度学习模型用于识别人类基因组中的DNase I超敏感位点	首次将语义特征融合表示集成到模型中，有效捕捉复杂DHS序列中的局部和全局模式及时空依赖关系	未提及模型在独立验证集上的泛化能力及计算效率分析	开发高性能、低成本的DHS识别计算方法	人类基因组中的DNase I超敏感位点	生物信息学	乳腺癌, 冠状动脉疾病, 阿尔茨海默病, 自身免疫疾病, 神经系统疾病	深度学习	CNN, GRU	基因组序列数据	NA	NA	1维CNN, CNN-GRU融合模型, CNN-kmer融合模型, CNN-GRU-kmer融合模型	准确率, 灵敏度, 特异性, MCC, AUC ROC, AUC PR	NA
747	2025-11-14	MEMOL: Mixture of experts for multimodal learning through multi-head attention to predict drug toxicity 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109088 PMID:41046705	研究论文	提出一种基于多头注意力的多模态混合专家模型MEMOL，用于预测药物毒性	将稀疏混合专家机制直接集成到注意力机制中，通过自注意力和交叉注意力增强多模态特征提取与融合	NA	开发精确的药物毒性预测方法	分子图像、分子图和分子指纹三种分子模态	机器学习	NA	多模态学习	混合专家模型,多头注意力	分子图像,分子图,分子指纹	NA	NA	MEMOL	AUROC,AUPRC	NA
748	2025-11-14	Non-invasive urine flow dynamics characterization of pediatric hydronephrosis based on deep learning and computational fluid dynamics 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109077 PMID:41046707	研究论文	基于深度学习和计算流体动力学开发非侵入性尿液流动动力学表征方法用于小儿肾积水的诊断和预后评估	首次结合深度学习和CFD技术从MRU数据重建患者特异性三维肾脏模型并模拟尿液流动动力学	方法依赖于MRU图像质量，CFD模拟需要专业设置和验证	开发非侵入性尿液流动动力学计算方法以改善小儿肾积水诊断和预后评估	小儿肾积水患者的MRU图像数据和尿液流动特性	医学影像分析, 计算流体动力学	小儿肾积水	磁共振尿路造影, 计算流体动力学	深度学习模型	医学影像	NA	NA	NA	尿液流速比, 压力分布比较	NA
749	2025-11-14	Multimodal Nomogram Combining Multiparametric MRI, Functional Subsets of Peripheral Lymphocytes and PI-RADS Can Predict Risk Stratification of Prostate Cancer 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109086 PMID:41046708	研究论文	开发结合多参数MRI、外周淋巴细胞功能亚群和PI-RADS的多模态列线图用于前列腺癌风险分层预测	首次探索非侵入性三分法风险分层，整合多模态数据构建预测模型替代传统PSA方法	回顾性研究，样本量有限（110例患者），仅来自单一医疗中心	开发自动化可靠的前列腺癌风险分层工具以指导临床决策	前列腺癌患者	数字病理	前列腺癌	多参数MRI，外周淋巴细胞检测，PI-RADS评分	深度学习，放射组学	医学影像，临床数据	110例患者	NA	列线图模型	AUC，F1分数，灵敏度，特异性	NA
750	2025-11-14	Detection of nocturnal epileptic seizures using a wearable armband: A deep learning approach combining accelerometry and photoplethysmography signals 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109087 PMID:41072127	研究论文	提出一种基于深度学习的穿戴式臂环系统，结合加速度和光电容积脉搏波信号检测夜间癫痫发作	首次将CNN-LSTM与注意力机制结合用于穿戴式设备的多模态信号癫痫检测，采用两步式方法显著降低数据量	样本量相对有限（68名患者），假阳性率较高（0.165/小时），阳性预测值较低（0.334）	开发家庭环境下夜间癫痫发作的自动检测系统，降低癫痫猝死风险	68名患有严重癫痫发作的患者	医疗健康监测	癫痫	三轴加速度计，光电容积脉搏波	CNN-LSTM	时间序列信号数据	68名患者，788次夜间记录（6304小时），1846次严重发作	NA	CNN-LSTM with attention mechanism	灵敏度，假警报率，ROC曲线下面积，准确率，阳性预测值	NA
751	2025-11-14	Lightweight element-wise product enhanced neural network for efficient arrhythmia detection on embedded devices 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109101 PMID:41075315	研究论文	提出一种轻量级元素乘积增强神经网络，用于嵌入式设备上高效的心律失常检测	引入元素乘积融合机制结合双路径特征，采用纺锤形架构与深度可分离卷积，显著降低模型参数和计算成本	NA	开发适用于资源受限嵌入式设备的实时心律失常检测模型	心电图信号数据	机器学习	心血管疾病	ECG信号分析	CNN	信号数据	MIT-BIH、SVDB、INCART和PTB数据库	NA	深度可分离卷积，纺锤形架构	准确率，精确率，召回率，F1分数，计算复杂度，推理时间，功耗	树莓派5，Android 10 x86虚拟机
752	2025-11-14	Self-supervised learning and hybrid deep models for predicting the progression of Fuchs' endothelial corneal dystrophy after cataract surgery 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109100 PMID:41106173	研究论文	提出一种基于自监督学习和混合深度学习模型的框架，用于预测白内障手术后Fuchs角膜内皮营养不良的进展	整合临床领域知识、集成学习和自监督学习，提出结合RANSAC算法和双分支设计的混合CNN架构，采用Polar Pooling模拟临床推理	对标注数据的依赖仍然存在，尽管通过自监督学习有所减少	改善Fuchs角膜内皮营养不良的预后预测，支持白内障手术规划	Fuchs角膜内皮营养不良患者	医学影像分析	角膜疾病	Scheimpflug断层成像	CNN, 自监督学习	医学影像	多中心数据集	NA	混合卷积神经网络, 双分支设计	AUC	NA
753	2025-11-14	NN-PCP: Screening phenotype-related core pathways to construct a prostate cancer metastasis prediction model based on multiple types of mutation data 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109118 PMID:41109149	研究论文	提出基于表型相关核心通路的神经网络模型NN-PCP，利用多种突变数据预测前列腺癌转移	开发了结合改进的过表征分析和基因集富集分析的表型相关核心通路筛选方法，构建具有双差分层级的神经网络架构	NA	提高基于突变数据的前列腺癌转移预测准确性	前列腺癌患者突变数据	机器学习	前列腺癌	突变数据分析	神经网络	基因突变数据	NA	NA	NN-PCP（包含IORA驱动模块、IGSEA驱动模块和双差分层级）	准确率,精确率,召回率,F1分数,AUC,AUPR	NA
754	2025-11-14	Memory-driven modeling of herpes simplex virus type-1 and type-2 dynamics with neural network optimization 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109121 PMID:41124993	研究论文	开发了一个结合分数阶导数和深度神经网络的HSV-1和HSV-2病毒动力学建模框架	首次将分数阶导数引入HSV动力学建模以捕捉记忆效应，并集成深度学习进行行为近似	未明确说明模型验证使用的具体数据集和样本规模	更好地理解HSV病毒动力学并评估干预策略	HSV-1和HSV-2病毒的传播动态	计算生物学	病毒感染	分数阶微分方程建模，神经网络优化	深度神经网络	模拟数据	NA	NA	NA	预测准确度(R≈1)	NA
755	2025-11-14	Dual adversarial attacks on Explainable Deep Learning in medical image classification 2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109125 PMID:41138644	研究论文	提出针对医学图像分类中可解释深度学习的双重对抗攻击方法，同时攻击模型预测和解释结果	首次提出同时针对预测和解释的双重对抗攻击框架，并引入联合评估指标ASR	仅在三种医学影像数据集和三种深度学习模型上验证，未涉及更多模型架构和数据类型	探究可解释深度学习模型在医学图像分类中的安全性漏洞	医学图像分类模型及其解释方法	计算机视觉	多种疾病（胸部X光、眼底影像、皮肤镜影像）	深度学习	CNN	医学图像	三个基准医学影像数据集	PyTorch, TensorFlow	ResNet50, DenseNet121, EfficientNet-V2	攻击成功率(ASR)	GPU（具体型号未提及）
756	2025-11-12	A novel VOC mixtures classification methods based on GBLinear and TabNet and informative feature selection from gas sensors (E-Nose) data 2026-Jan-01, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2025.128554 PMID:40652634	研究论文	提出一种基于GBLinear和TabNet算法结合特征选择技术的电子鼻系统精油分类新方法	首次将GBLinear和TabNet算法与特征选择技术结合用于电子鼻数据分析，提高精油分类的准确性和可解释性	NA	提高精油挥发性有机化合物混合物的分类准确性和模型可解释性	精油中的挥发性有机化合物(VOCs)混合物	机器学习	NA	电子鼻(E-Nose)气体传感器技术	GBLinear, TabNet	气体传感器数据	NA	NA	GBLinear, TabNet	准确率	NA
757	2025-11-08	CNN-Autoformer: Automated EEG-Based Seizure Detection and Localization Using Hybrid Deep Learning 2026-Feb, Biomedical signal processing and control IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.bspc.2025.108896 PMID:41189712	研究论文	提出一种结合CNN和Autoformer的混合深度学习框架，用于自动检测和定位癫痫发作	首次将CNN的空间特征提取能力与Autoformer的时间建模能力相结合，通过自相关机制提取周期性依赖并将信号分解为趋势和季节成分	未提及模型在更广泛数据集上的泛化能力及计算效率分析	开发自动癫痫检测和定位方法以辅助临床诊断	多通道脑电图信号	数字病理	癫痫	脑电图	CNN, Autoformer	时序信号	CHB-MIT公共数据集和SH-SDU专有数据集	NA	CNN-Autoformer混合架构	准确率, 灵敏度, 特异性, 精确率, F1分数, 假阳性检测率	NA
758	2025-11-08	AI-powered programmable wetting-delamination μPAD for point-of-care food safety detection 2026-Jan-15, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2025.118083 PMID:41092667	研究论文	开发了一种基于可编程润湿脱层定时器的微流控纸基分析装置，用于快速检测食品中的农药残留和转基因蛋白	采用可编程润湿脱层定时器实现流体延迟控制，通过预切割辅助浸染策略提高定时器稳定性50%以上，将传统颜色衰减信号转换为颜色增强信号提高灵敏度	NA	开发低成本、便携式的食品安全检测技术	农药残留（毒死蜱）和转基因蛋白（Cry1Ab/Ac）	微流控技术	食品安全	微流控纸基分析装置、侧向流动分析、深度学习图像分析	深度学习	图像	40个真实样品	NA	NA	灵敏度、特异性、准确度	NA
759	2025-11-08	Feature extraction and intelligent diagnosis of ECG signals based on KANs and xLSTM 2026-Jan-15, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2025.118105 PMID:41110222	研究论文	提出基于KAN和xLSTM的深度学习架构用于心电信号特征提取和心律失常智能诊断	首次将KAN网络和xLSTM网络应用于心电信号分析，KAN使用可学习的激活函数和样条函数替代传统权重参数，xLSTM引入指数门控机制并改进记忆结构	NA	开发更准确的心律失常检测方法以实现心血管疾病的早期预防和治疗	心电信号中的心律失常分类	机器学习	心血管疾病	心电信号分析	KAN, xLSTM	心电信号	MIT-BIH数据库109,262个心跳样本，St. Petersburg INCART数据库166,909个心跳样本	NA	Kolmogorov-Arnold networks, xLSTM	准确率, F1分数	NA
760	2025-11-05	Auto-Masked Audio Spectrogram Transformer for depression detection from speech 2026-Jan-15, Journal of affective disorders IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.jad.2025.120295 PMID:40967413	研究论文	提出一种用于从语音中检测抑郁症的自掩码音频频谱图Transformer模型	引入自掩码训练增强上下文学习，结合时频注意力机制同时捕捉时间和频率信息	NA	开发非侵入性抑郁症筛查工具	语音信号	自然语言处理	抑郁症	语音频谱分析	Transformer	音频频谱图	两个公开数据集：Distress Analysis Interview Corpus-Wizard of Oz和Multi-modal Open Dataset for Mental disorder Analysis	NA	Auto-Masked Audio Spectrogram Transformer (AMAST)	F1分数	NA