深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
181	2026-06-15	Rapid-EEG Software Architecture's Clinical Impact: Advantages and Limitations 2026-Mar-01, Journal of clinical neurophysiology : official publication of the American Electroencephalographic Society IF:2.3Q3 DOI:10.1097/WNP.0000000000001188 PMID:41773895	综述	本文综述了快速脑电图（EEG）设备软件架构的临床应用优势与局限性	系统阐述了快速EEG设备从第一代麻醉管理到第二代癫痫检测的发展历程，并重点分析了深度学习算法在回顾性研究中与人类专家相媲美或更优的表现，同时指出算法“黑箱”特性对临床应用的制约	讨论限于回顾性研究，缺乏前瞻性临床试验验证，且对专有算法透明性问题提出建议但未给出具体解决方案	评估快速EEG设备自动分析方法的原理及人工智能/机器学习技术在癫痫检测中的应用影响，并倡导算法透明度以促进临床协作	快速EEG设备的软件架构及其临床应用中的算法性能	机器学习	癫痫	EEG	深度学习	EEG信号	NA	NA	NA	NA	NA
182	2026-06-15	Glycemic Variability as a Predictor of Mortality in Sepsis Patients With Concurrent Persistent Inflammation, Immunosuppression, and Catabolism Syndrome 2026-Mar, Immunity, inflammation and disease DOI:10.1002/iid3.70400 PMID:41791121	research paper	本研究探讨血糖变异系数（GVC）对并发持续性炎症、免疫抑制和分解代谢综合征（PICS）的脓毒症患者死亡率的影响	首次在并发PICS的脓毒症亚组中验证GVC与不良临床结局的关联，并利用TabPFN深度学习模型构建预测模型，AUC达0.960	单中心数据库回顾性研究，GVC分组基于指南但未动态调整，外部验证样本量较小	评估GVC对并发PICS的脓毒症患者28天、院内及180天死亡率的预测价值	1353例来自MIMIC-IV数据库的院内感染脓毒症患者，以及116例天津医科大学总医院急诊科验证队列	machine learning	sepsis	NA	TabPFN（表格数据先验适配网络）	tabular data	1353例（训练队列）及116例（外部验证队列）	Scikit-learn (Boruta), PyTorch (TabPFN)	TabPFN	AUC	NA
183	2026-06-15	Bone Cancer Cell Prediction Using an Enhanced Deep Learning Algorithm with an Optimization Technique 2026-Mar-01, Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP DOI:10.31557/APJCP.2026.27.3.839 PMID:41793662	研究论文	提出一种结合布谷鸟搜索优化和ResNet的深度学习算法用于骨癌细胞检测	将布谷鸟搜索优化算法与ResNet结合，形成CS-MHC ResNet模型，优化特征选择和超参数调优，提升骨癌分类性能	仅在有限数据集上验证，未来需要在更大规模多中心数据集和简化设计上提高鲁棒性和适用性	开发一种自动化的骨癌细胞检测与分类系统，用于早期骨癌诊断	骨癌组织图像（恶性和健康骨组织）	计算机视觉	骨癌	图像分类	卷积神经网络（CNN）	图像	未明确说明样本数量	NA	ResNet, VGG-16, Xception, Inception	准确率，敏感性，精确率，F-measure	NA
184	2026-06-15	DECODE: deep learning-based common deconvolution framework for various omics data 2026-Mar, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-026-03007-y PMID:41772096	研究论文	提出DECODE，一个通用反卷积框架，适用于多种组学数据，包括转录组、蛋白质组和代谢组	首次实现代谢组学反卷积，并能在不同组学数据、供体、疾病状态和测量平台上优于现有方法	信息不足，无法从标题和摘要中提取	开发一个通用反卷积框架，用于从组织水平数据估算细胞类型丰度，并整合多组学数据	细胞类型和细胞状态	机器学习	NA	反卷积算法	深度学习模型	转录组、蛋白质组、代谢组数据	NA	NA	NA	性能指标未在摘要中明确列出，但提到优于现有方法	NA
185	2026-06-15	Clinically validated deep learning auto-contouring for glioblastoma volumetric modulated arc therapy planning: a dosimetric equivalence study 2026-Mar, Radiation oncology journal IF:1.8Q3 DOI:10.3857/roj.2025.00808 PMID:41943643	研究论文	开发一种全自动双模态深度学习框架，用于胶质母细胞瘤放疗的靶区和危及器官自动勾画，并通过剂量学等效性验证其临床实用性	提出了一种无需预对齐的双编码器注意力U-Net结构，同时处理CT和MRI双模态图像，且在独立测试集上实现了与专家手动勾画在剂量学上的等效性	未在文中提及	通过剂量学等效性验证自动勾画框架在胶质母细胞瘤放疗计划中的临床可靠性	胶质母细胞瘤患者的CT和MRI图像	数字病理学	胶质母细胞瘤	深度学习	注意力U-Net	CT和MRI图像	100名患者的回顾性数据集	NA	双编码器注意力U-Net（CT），单编码器注意力U-Net（MRI）	Dice相似系数（DSC）	NA
186	2026-06-15	Deep learning-based semantic matching of cis-regulatory DNA sequences facilitates the prediction of gene function 2026-Mar, Nature plants IF:15.8Q1 DOI:10.1038/s41477-026-02231-w PMID:41708941	研究论文	使用深度学习模型PhytoBabel捕捉顺式调控DNA序列的语义相似性，从而预测基因功能	证明了远缘物种间（约1.6亿年进化分歧）的直系同源顺式调控序列虽缺乏序列相似性，但保留可通过深度学习捕获的语义相似性，并能在无直接训练的情况下隐式学习时空表达模式、保守非编码序列和系统发育关系	未明确说明模型在不同物种间的泛化能力、对非直系同源序列的适用性或计算资源需求等潜在局限性	利用顺式调控DNA序列的语义相似性来预测未知基因功能，特别是反向遗传学中的应用	15种被子植物的直系同源顺式调控序列对，以及玉米和拟南芥中与体细胞胚胎发生相关的形态发生调控因子	机器学习	NA	NA	深度学习模型（PhytoBabel）	DNA序列	15种被子植物的直系同源顺式调控序列对	NA	NA	语义相似性（深度学习捕获）	NA
187	2026-06-13	Room-Temperature Trace NO2 Monitoring System Based on Two-Dimensional Heterostructures and Integrated with Deep Learning 2026-Mar-27, ACS sensors IF:8.2Q1 DOI:10.1021/acssensors.5c04107 PMID:41785406	研究论文	提出了一种基于二维异质结构和深度学习集成的室温痕量NO2监测系统	首次将BiS/WO异质结构传感器与1D-CNN/LSTM深度学习模型及无线通信模块集成，实现低浓度NO的室温高精度实时监测	数据稀缺性通过数据增强缓解，但模型泛化能力和长期稳定性需进一步验证	实现室温下痕量NO的高精度检测，用于空气质量控制和呼吸疾病早期诊断	BiS/WO异质结构气体传感器及低浓度NO气体	机器学习	呼吸疾病	气体传感	1D-CNN/LSTM	时间序列气体传感数据	未明确说明样本数量，涉及5 ppm NO测试及ppb级回归验证	NA	1D-CNN, LSTM	响应值（17.9）、灵敏度（3.84/ppm）、响应/恢复时间（27/110 s）、R方（0.9826）	未明确说明计算资源
188	2026-06-13	Three-Dimensional Burrowing Behavior of Earthworms for Ecotoxicological Studies 2026-Mar-17, Environmental science & technology IF:10.8Q1 DOI:10.1021/acs.est.5c15144 PMID:41782362	研究论文	开发了一种结合透明介质和深度学习轨迹重建算法的方法，用于量化研究蚯蚓的三维掘穴行为	首次将透明介质与深度学习算法结合，实现对蚯蚓三维掘穴行为的连续追踪和定量分析	未明确提及算法在大规模或长期应用中的稳定性评估	研究蚯蚓在污染物环境下的三维掘穴行为，以评估土壤生态风险	五种不同蚯蚓物种	机器视觉	NA	深度学习轨迹重建算法	深度学习模型	图像数据	五种蚯蚓物种，28天试验中超过80%存活率	NA	轨迹重建深度学习模型	坐标提取率	NA
189	2026-06-13	Machine and deep learning-based forecast of Tehran's accelerating nighttime surface heat island crisis 2026-Mar-12, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-42066-1 PMID:41820422	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
190	2026-06-13	Prescription‑dose stratification improves deep learning‑based VMAT dose prediction in locally advanced NSCLC 2026-Mar-09, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-43192-6 PMID:41796211	研究论文	本文评估了处方剂量分层对基于深度学习的VMAT剂量预测性能的影响	首次系统地比较了单一处方模型与混合处方模型在局部晚期非小细胞肺癌VMAT剂量预测中的表现，证实了处方剂量分层能改善预测精度	样本量较小（72例），且仅针对单一病种和单一治疗技术，未考虑其他处方剂量组合或不同放疗技术的泛化性	评估处方剂量分层是否能够提高深度学习VMAT剂量预测的性能	72例局部晚期非小细胞肺癌VMAT病例	机器学习	肺癌	VMAT计划数据重算	3D U-Net	剂量分布数据	72例（42例训练，10例验证，20例测试）	NA	3D U-Net	平均绝对误差	NA
191	2026-06-13	Survival prediction for bladder cancer using multimodal data with quantum neural networks and transformer architectures 2026-Mar-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-42047-4 PMID:41794871	研究论文	本研究提出了一种结合量子神经网络和Transformer架构的混合模型QTMPN，用于膀胱癌生存预测，实现了多模态数据的高效融合	提出了QTMPN框架，创新性地融合量子神经网络、Transformer和图神经网络，通过量子特征提取器（QFE）捕获长距离依赖，并采用注意力引导动态图的多模态融合模块	尚未提及局限性信息	提高膀胱癌生存预测准确性，支持精准医学	膀胱癌患者的多模态数据，包括全切片病理图像和临床特征	机器学习和数字病理学	膀胱癌	NA	量子神经网络（QNN）、Transformer、图神经网络（GNN）	图像（病理全切片图像）、结构化数据（临床特征）	TCGA-BLCA数据集	NA	QTMPN（包含QFE、TCF模块）	准确率（Accuracy）	NA
192	2026-06-13	Development trajectory and trends of ultrasound biomicroscopy in glaucoma research: a comprehensive 20-year bibliometric analysis 2026-Mar-06, International ophthalmology IF:1.4Q3 DOI:10.1007/s10792-026-04010-0 PMID:41790279	综述	对过去20年间超声生物显微镜在青光眼研究中应用的综合文献计量分析	首次通过文献计量学方法系统梳理了超声生物显微镜在青光眼研究中的应用发展轨迹和趋势，并识别出新兴前沿研究方向，包括深度学习、三维重建和微创青光眼手术	仅涵盖2005年至2024年间发表的文章，可能遗漏早期或近期的重要文献；分析基于单一数据库，可能存在数据完整性不足	评估超声生物显微镜在青光眼研究中的应用进展、趋势和未来方向	557篇关于超声生物显微镜在青光眼研究中应用的相关文献	自然语言处理	青光眼	文献计量分析	NA	文献数据	557篇文献	VOSviewer, CiteSpace	NA	NA	NA
193	2026-06-13	Leveraging Naturalistic Driving Digital Biomarkers for Early Mild Cognitive Impairment Detection: Deep Learning Strategies 2026-Mar-06, JMIR medical informatics IF:3.1Q2 DOI:10.2196/83622 PMID:41791118	研究论文	利用自然驾驶数字生物标志物通过深度学习策略早期检测轻度认知障碍	首次将自然驾驶数据结合深度学习模型用于早期轻度认知障碍检测，并比较了多种数据融合策略（单视图、特征级融合、模型级晚期融合）的性能	样本量较小（仅22名参与者），且数据来自单一驾驶场景，可能限制了模型的泛化能力	开发基于自然驾驶数据的深度学习模型，以实现轻度认知障碍的早期非侵入性检测	轻度认知障碍患者和认知正常的驾驶员	机器学习	轻度认知障碍	GPS、加速度计、陀螺仪传感器	深度学习模型（未指定具体类型）	驾驶行为数据（GPS、加速度计、陀螺仪信号）	22名参与者，包括8名轻度认知障碍患者和14名认知正常者，其中3名在实验完成前退出	NA	NA	准确率、受试者工作特征曲线下面积	NA
194	2026-06-13	Enhancing trustworthiness of Arabic online health information quality evaluation using an enhanced BERT architecture with PCA and ICA feature weighting 2026-Mar-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-43158-8 PMID:41792455	研究论文	使用增强版阿拉伯语BERT架构结合PCA和ICA特征加权来提高在线阿拉伯语健康信息质量评估的可信度	提出了增强版阿拉伯语BERT模型用于医疗数据，结合PCA和ICA特征提取技术，并采用基于信息熵的改进损失函数提高模型确定性和校准能力	NA	利用人工智能技术评估在线健康信息质量，模拟人类级别的评估能力	在线阿拉伯语健康信息	自然语言处理	NA	特征提取（PCA和ICA）	增强版阿拉伯语BERT	文本	NA	NA	增强版阿拉伯语BERT	准确率	NA
195	2026-06-13	DiNovo enables high-coverage and high-confidence de novo peptide sequencing via mirror proteases and deep learning 2026-Mar-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-026-70224-6 PMID:41786727	研究论文	提出一种名为DiNovo的软件系统，利用镜像蛋白酶互补性和深度学习实现高覆盖、高可信度的从头肽测序	利用镜像蛋白酶互补性提高肽段覆盖度和可信度；提出独立于预测序的镜像谱识别算法、基于深度学习和图论的测序算法，以及无需先验肽段识别的结果评估方法	未明确说明，但可能受限于蛋白酶组合和深度模型泛化能力	开发高覆盖、高可信度的从头肽测序方法，克服单一蛋白酶实验的碎片不完全和酶解不充分问题	肽段和蛋白质序列	机器学习	NA	质谱（蛋白质组学、蛋白酶消化）	NA	质谱数据（肽段片段谱）	NA	NA	NA	测序可信度（高置信度氨基酸数）、序列覆盖率	NA
196	2026-06-13	An explainable deep learning framework for few shot crop disease detection in rice and sugarcane using CNN based feature extraction 2026-Mar-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-37501-2 PMID:41786811	研究论文	提出一种基于CNN特征提取的可解释深度学习框架，用于水稻和甘蔗作物的少样本病害检测	将少样本学习方法（原型网络和MAML）与可解释人工智能（Grad-CAM）结合，用于作物病害检测	未提及模型在不同环境或数据集上的泛化能力及计算资源消耗	实现水稻和甘蔗叶部病害的快速、自动化、精确检测与预测	水稻和甘蔗叶部病害	机器学习	作物病害	图像处理	CNN, 原型网络, 模型无关元学习（MAML）	图像	NA	NA	CNN, 原型网络, 模型无关元学习（MAML）, Grad-CAM	准确率, 特异性	NA
197	2026-06-13	Cross-species gene redesign leveraging ortholog information and generative modeling 2026-Mar-03, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-026-69966-0 PMID:41775687	研究论文	提出OrthologTransformer模型，利用直系同源基因数据和生成式建模跨物种重新设计基因，以超越传统密码子优化的局限	首次利用Transformer深度学习模型从大规模直系同源基因数据中学习，实现跨物种基因重新设计，能够捕捉非同义突变和插入/缺失等进化适应性变化	未明确提及局限性，但可能依赖直系同源基因数据集的规模和质量，以及模型在不同物种间泛化能力的验证	开发一种基于AI的基因设计方法，通过直系同源信息生成功能性更强、表达量更高的跨物种基因序列	细菌直系同源基因序列，特别是PETase酶在枯草芽孢杆菌中的表达	机器学习和数字病理学不适用，可归为计算生物学或生成式建模	不适用	Transformer深度学习模型，直系同源基因数据训练	Transformer	基因序列数据（编码序列）	大规模直系同源基因数据集（具体数量未说明），以及多种细菌物种对	PyTorch	Transformer	序列相似性、蛋白功能保持、表达产量（如反应产物量10倍提升）	未指定，可能包括GPU加速
198	2026-06-13	An IoT-enabled CRNN framework for secure wearable sensor-based activity recognition in physical education 2026-Mar-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-42082-1 PMID:41776307	研究论文	提出一个基于IoT的CRNN框架用于体育教育中基于可穿戴传感器的活动识别	提出了一种新型CRNN架构，能同时建模多模态可穿戴传感器数据流的空间和时间特征，并集成到IoT框架中	未明确提及局限性	解决可穿戴传感器信号中时空依赖建模不足的问题，实现高精度的活动识别	多模态可穿戴传感器数据（心率变异性、三轴加速度计、陀螺仪角速度、磁力计方向、皮肤温度等）	机器深度学习	NA	可穿戴传感器技术	CRNN	时间序列数据	未提及具体样本数量	NA	CRNN（CNN + RNN）	准确率98.2%, 灵敏度97.2%, 特异度99.2%, 召回率97.4%, 精确率97.6%	NA
199	2026-06-13	CAGAD: dynamic community attention for prediction gene regulatory network 2026-Mar-03, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften DOI:10.1007/s12064-026-00460-3 PMID:41774282	研究论文	提出CAGAD框架，通过动态社区注意力机制预测基因调控网络，整合基因表达数据和已知基因关系以提升预测准确性	首次将社区注意力机制与GraphSAGE结合，利用结构特征和社区级特征提高基因互作预测的准确性和可解释性	未明确讨论方法的局限性	构建能够处理测量误差、整合生物学先验知识并具有高可解释性的稳健基因调控网络预测模型	大肠杆菌和酿酒酵母的基因调控网络	机器学习	NA	基因表达数据分析，基因调控网络构建	图神经网络（GNN），GraphSAGE	基因表达数据，已知基因关系数据	NA	GraphSAGE	社区注意力机制结合GraphSAGE	预测准确性（相较于最先进方法的性能提升）	NA
200	2026-06-13	Deep learning-based identification and maturation assessment of the zygomaticomaxillary suture in cone-beam computed tomography images 2026-Mar-02, Progress in orthodontics IF:3.5Q1 DOI:10.1186/s40510-026-00614-5 PMID:41770475	研究论文	基于深度学习的锥形束CT图像中颧上颌缝识别与成熟度评估系统	首次提出双网络深度学习架构（3D U-Net结合3D ResNet50）实现CBCT中颧上颌缝的自动化定位与成熟度分期评估，克服了传统主观评分的局限性	数据集规模有限（505例），且不同分期任务（五阶段分类）准确率较低（0.611），模型泛化能力有待验证	开发可定量、可复现的颧上颌缝成熟度评估系统，优化上颌前牵引治疗的时机决策	锥形束CT图像中的颧上颌缝结构及其成熟度分期	计算机视觉	上颌发育不足	CBCT	CNN、3D U-Net、3D ResNet50	图像（三维锥形束CT扫描）	505例锥形束CT扫描数据	PyTorch	3D U-Net、3D ResNet50	准确率、精确率、召回率、F1分数、AUC	NA