深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
181	2025-10-04	A deep learning approach for brain tumour classification and detection in MRI images using YOLOv7 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1508326 PMID:41040522	研究论文	本研究使用YOLOv7深度学习模型对脑部MRI图像中的肿瘤进行分类和检测	采用最新的YOLOv7模型进行脑肿瘤检测，并在预处理阶段应用纵横比归一化和调整大小算法以提高肿瘤定位精度	仅使用2870张标注图像的数据集，可能数据规模有限	提高脑肿瘤在MRI图像中的分类和检测准确性	脑部MRI图像中的四种肿瘤类型：垂体瘤、胶质瘤、脑膜瘤和无肿瘤	计算机视觉	脑肿瘤	深度学习	YOLOv7	图像	2870张标注的脑部MRI图像，分为四种肿瘤类型
182	2025-10-04	BioSemAF-BiLSTM: a protein sequence feature extraction framework based on semantic and evolutionary information 2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2025.1616880 PMID:41040660	研究论文	提出了一种基于深度学习的蛋白质序列特征提取框架BioSemAF-BiLSTM，用于预测S-亚磺酰化位点	整合进化信息和语义特征，使用序列压缩方法定量评估特征充分性，并采用自适应特征融合模块增强特征交互	特征提取存在11%的信息损失率	提高蛋白质S-亚磺酰化位点的预测准确性	蛋白质序列中的S-亚磺酰化位点	生物信息学	NA	fastText词嵌入、位置特异性评分矩阵(PSSM)	BiLSTM（双向长短期记忆网络）	蛋白质序列数据	基准数据集和独立测试集（具体数量未提及）
183	2025-10-04	A bibliometric review of deep learning in crop monitoring: trends, challenges, and future perspectives 2025, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2025.1636898 PMID:41041084	综述	对深度学习在作物监测领域的650多篇文献进行文献计量学分析，总结趋势、挑战和未来展望	首次通过文献计量和知识图谱方法系统分析深度学习在农业监测中的应用现状和发展趋势	基于文献分析而非原始实验研究，可能受限于文献覆盖范围和检索策略	系统梳理人工智能特别是深度学习在农业监测中的应用现状和发展趋势	2000-2024年间发表的650多篇关于深度学习和农业监测的学术文献	机器学习	NA	文献计量分析、知识图谱分析	CNN	遥感数据（无人机、卫星图像）	650多篇学术文献
184	2025-10-04	Fusion-driven multimodal learning for biomedical time series in surgical care 2025, Frontiers in physiology IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fphys.2025.1605406 PMID:41041272	研究论文	提出一种用于生物医学时间序列预测的新型多模态深度学习框架	引入自适应多模态融合网络和动态跨模态学习策略，通过注意力对齐、图表示学习和模态自适应融合机制增强信息整合	NA	提高生物医学时间序列预测的准确性和鲁棒性，支持临床决策	生物医学时间序列数据，包括生理信号、影像和电子健康记录	机器学习	NA	深度学习	自适应多模态融合网络（AMFN）	多模态时间序列数据（生理信号、影像、电子健康记录）	NA
185	2025-10-04	Correlation does not equal causation: the imperative of causal inference in machine learning models for immunotherapy 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1630781 PMID:41041318	综述	本文系统分析了机器学习在免疫治疗研究中忽视因果推断的现状，并探讨了因果机器学习的最新进展与挑战	首次系统性地揭示了免疫治疗研究中因果推断的缺失问题，并提出了因果机器学习作为解决方案	实践应用仍面临数据质量差、算法不透明、方法复杂和跨学科沟通障碍等挑战	推动因果推断在免疫治疗机器学习模型中的应用，实现从相关性分析向因果推理的范式转变	免疫检查点抑制剂和黑色素瘤的相关研究	机器学习	免疫治疗相关疾病	系统综述方法，因果机器学习技术	Targeted-BEHRT, CIMLA, CURE等因果机器学习模型	多模态数据（包括影像学、基因组学和临床记录）	90项免疫检查点抑制剂研究和36项黑色素瘤回顾性研究
186	2025-10-04	MLVI-CNN: a hyperspectral stress detection framework using machine learning-optimized indices and deep learning for precision agriculture 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1631928 PMID:41041588	研究论文	提出一种结合机器学习优化植被指数和深度学习的高光谱胁迫检测框架，用于精准农业中的作物胁迫早期检测	开发了两种新型高光谱指数MLVI和H_VSI，采用递归特征消除优化光谱波段，并结合CNN模型实现作物胁迫严重程度的六级分类	NA	实现作物水分和结构胁迫的早期准确检测	作物胁迫	计算机视觉	NA	递归特征消除(RFE)、高光谱成像	CNN	高光谱图像	NA
187	2025-10-04	A medical image classification method based on self-regularized adversarial learning 2024-Nov, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17320 PMID:39078069	研究论文	提出一种基于自正则化对抗学习的医学图像分类框架GAN-DL，通过对抗网络提供补充正则化来提升分类性能	创新性地将GAN模型作为补充正则化项来支持分类任务，无需额外数据标注即可自动从重建过程中推导损失函数	方法性能依赖于对抗网络的质量，且需要足够训练数据来训练GAN模型达到最佳性能	开发一种能够应对医学图像数据挑战（小标注数据集、类别不平衡、成像质量差异）的分类方法	COVID-19胸部X光图像和口咽鳞状细胞癌PET图像	计算机视觉	COVID-19, 口咽鳞状细胞癌	生成对抗网络(GAN), 深度学习	GAN-DL框架（包含F-Net特征提取网络、分类器、R-Net重建网络和D-Net判别网络）	医学图像（X光图像、PET图像）	COVID-19数据集包含13,958张胸部X光图像，OPSCC数据集包含3,255张PET图像
188	2025-10-04	Artificial Intelligence in Clinical Diagnosis and Treatment of Dry Eye: Workflows, Effectiveness, and Evaluation 2024 Oct-Dec, Journal of current ophthalmology IF:1.2Q3 DOI:10.4103/joco.joco_172_24 PMID:41041032	综述	本文综述人工智能在干眼症临床诊疗中的应用流程、效果与评估	系统总结AI在干眼症诊疗中的工作流程，并探讨云端治疗管理等新兴应用方向	AI在干眼症应用中仍面临某些需要解决的挑战	探讨人工智能在干眼症临床诊疗中的应用及其发展前景	干眼症相关临床研究	医学人工智能	干眼症	机器学习、深度学习、计算机辅助技术	NA	临床数据、图像数据	基于48篇相关原始研究
189	2025-10-04	Prediction of MRI-Induced Power Absorption in Patients with DBS Leads 2024-Jun, Proceedings. IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems DOI:10.1109/cbms61543.2024.00087 PMID:41030917	研究论文	本研究使用机器学习方法预测深部脑刺激患者在接受MRI检查时电极尖端局部比吸收率值	首次将XgBoost和深度残差网络应用于DBS患者MRI诱导功率吸收预测，显著超越现有最佳方法	数据量较小，仅包含260个实例，且部分为人工生成数据	开发计算效率更高的方法来预测DBS患者MRI检查时的组织加热风险	深部脑刺激系统患者在接受磁共振成像检查时的功率吸收情况	机器学习	神经系统疾病	电磁仿真，机器学习	XgBoost，深度残差网络	电磁仿真数据	260个实例（包含患者数据和人工数据）
190	2025-10-04	Reliable Active Learning via Influence Functions 2023-Nov, Transactions on machine learning research PMID:41036166	研究论文	提出一种基于影响函数的可靠主动学习框架，解决深度学习中主动学习算法性能不可靠的问题	通过影响函数、伪标签和多样性选择来高效估计样本对模型在整个数据集上性能的提升，确保主动学习的选择价值	NA	提高主动学习在深度学习架构中的可靠性和性能稳定性	深度学习模型中的样本选择策略	机器学习	NA	影响函数、伪标签、多样性选择	深度学习架构	标注数据和未标注数据	NA
191	2025-10-03	Applications of artificial intelligence and nanotechnology in vaccine development 2025-Nov-10, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.ijpharm.2025.126096 PMID:40886810	综述	探讨人工智能和纳米技术在疫苗开发中的协同应用与创新潜力	首次系统阐述AI与纳米技术的协同效应对疫苗开发的变革性影响，提出个性化免疫策略新范式	未涉及具体临床验证数据和实际应用案例的详细分析	研究AI和纳米技术如何共同推动疫苗开发的技术革新	疫苗设计、递送系统和免疫优化策略	生物医学工程	传染病	机器学习(ML)、深度学习(DL)、纳米颗粒技术	深度学习算法	基因组学、蛋白质组学、免疫学数据集	NA
192	2025-10-03	Label-free classification of nanoscale drug delivery systems using hyperspectral imaging and convolutional neural networks 2025-Nov-10, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.ijpharm.2025.126065 PMID:40885220	研究论文	本研究开发了一种结合高光谱成像和深度学习技术的无标记纳米药物递送系统分类方法	首次将3D卷积神经网络与高光谱成像结合用于无标记脂质体分类，并采用SMOTE技术解决药物数据集类别不平衡问题	NA	开发无标记、高通量的纳米药物递送系统表征方法	治疗性脂质体（对照组和阿霉素负载脂质体）	计算机视觉	NA	高光谱成像（HSI）、暗场高光谱成像（VNIR 400-1000 nm）	3D CNN	高光谱图像	NA
193	2025-10-03	Harnessing artificial intelligence to advance insights in systemic sclerosis skin and lung disease 2025-Nov-01, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1 DOI:10.1097/BOR.0000000000001114 PMID:40767529	综述	本文总结了截至2024年人工智能在系统性硬化症皮肤和肺部疾病研究中的应用进展	系统梳理了AI在系统性硬化症研究中的多种应用方法，包括监督和无监督机器学习、深度学习图像分析等创新方法	NA	推进系统性硬化症皮肤和肺部疾病的研究	系统性硬化症患者	机器学习	系统性硬化症	监督机器学习、无监督机器学习、深度学习	监督机器学习模型、无监督机器学习模型、深度学习模型	医疗数据、医学影像、皮肤活检数据	相对较小的系统性硬化症队列
194	2025-10-03	Does Sequence Clustering Confound AlphaFold2? 2025-Nov-01, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2025.169376 PMID:40780395	研究论文	本文通过进一步分析证明AF-Cluster方法中局部进化耦合的重要作用，并反驳了相关文献中的错误主张	澄清了AF-Cluster方法中局部进化耦合的作用机制，纠正了领域内对AlphaFold2构象采样方法的误解	NA	解释深度学习模型预测结果的原因，澄清AlphaFold2构象采样方法中的误解	蛋白质多构象状态预测方法，特别是AF-Cluster方法	结构生物学	NA	AlphaFold2，AF-Cluster，深度学习	深度学习模型	蛋白质序列数据	NA
195	2025-10-03	FoldExplorer: Fast and Accurate Protein Structure Search with Sequence-Enhanced Graph Embedding 2025-Nov-01, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2025.169412 PMID:40889693	研究论文	提出一种基于深度学习的蛋白质结构快速搜索方法FoldExplorer	结合图注意力神经网络和蛋白质语言模型，联合编码结构和序列信息生成蛋白质结构搜索专用嵌入表示	NA	开发快速准确的蛋白质结构搜索方法以适应结构数据库的指数级扩张	蛋白质结构	生物信息学	NA	图注意力神经网络、蛋白质语言模型	图注意力神经网络	蛋白质结构数据、序列数据	NA
196	2025-10-03	Use of Artificial Intelligence to Detect Cardiac Rhythm Disturbances in Athletes: A Scoping Review 2025 Nov-Dec, Journal of veterinary internal medicine IF:2.1Q1 DOI:10.1111/jvim.70257 PMID:41017277	综述	本文通过范围综述评估人工智能在运动员（特别是马匹）心电图心律失常检测中的应用现状和潜力	首次系统评估AI技术在运动物种心律失常检测中的应用，特别关注马匹这一研究较少的领域	样本量较小且物种特异性心电图形态学差异限制了在兽医医学中的广泛应用	评估人工智能在心电图心律失常检测中的应用，特别关注在运动物种中的当前和潜在用途	人类、马匹和犬类运动员的心电图数据	医疗人工智能	心血管疾病	深度学习、卷积神经网络、恢复分析和迁移学习	CNN	心电图信号	包含17项研究：13项涉及人类，3项涉及马匹，1项涉及犬类
197	2025-10-03	Comparative Study of a Variant Neural Relational Inference Deep Learning Model and Dynamical Network Analysis for p53-DNA Allosteric Interactions 2025-Nov-01, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2025.169374 PMID:40769488	研究论文	本研究比较了改进的神经关系推理模型与动态网络分析在p53-DNA变构相互作用中的表现	通过集成transformer的多头自注意力模块改进NRI模型，首次系统比较不同方法在蛋白质变构研究中的表现	未明确说明样本规模和具体数据集的详细信息	比较不同计算方法在蛋白质变构相互作用研究中的效果	p53蛋白与DNA的变构相互作用，包括野生型和突变型p53	计算生物学	癌症（与p53突变相关）	神经关系推理(NRI)、动态网络分析、transformer多头自注意力机制	改进的NRI模型（集成transformer模块）	蛋白质结构数据、分子动力学数据	NA
198	2025-10-03	Transforming sleep medicine: the evolving role of artificial intelligence 2025-Nov-01, Current opinion in pulmonary medicine IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCP.0000000000001210 PMID:40855966	综述	探讨人工智能在睡眠医学中不断演变的作用及其临床应用前景	系统阐述AI技术如何通过先进数据分析改善睡眠障碍检测并实现精准治疗	临床应用前需解决患者隐私、数据偏见和透明度等伦理挑战	阐明AI在睡眠医学中的发展角色并为临床医生提供关键应用信息	睡眠障碍患者及睡眠医学临床实践	医疗人工智能	睡眠障碍（阻塞性睡眠呼吸暂停、失眠、发作性睡病）	机器学习、深度学习	NA	多导睡眠图、消费者睡眠设备数据	NA
199	2025-10-03	Ptgs2+ CPTC Function as a "Force-Immune Axis" by Responding to Acupuncture and Mediating M2 Macrophage Activation for Anti-Inflammatory Effects 2025-Oct-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202501175RR PMID:41017691	研究论文	本研究通过单细胞测序发现Ptgs2+ CPTC作为力-免疫轴响应针刺刺激并通过Il6-Il6st-Stat3通路激活M2巨噬细胞产生抗炎效应	首次确立Ptgs2+ CPTC作为连接机械刺激与免疫调节的关键力-免疫轴	NA	探索筋膜组织中特络细胞的细胞景观及其在针刺抗炎中的作用机制	腹部中线筋膜中的Cd34+/Pdgfra+特络细胞及其亚群	细胞生物学	炎症性疾病	单细胞测序、深度学习、细胞形态学分析	深度学习模型	单细胞测序数据、细胞形态数据	痢疾大鼠模型
200	2025-10-03	Role of artificial intelligence in gastric diseases 2025-Oct-07, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1 DOI:10.3748/wjg.v31.i37.111327 PMID:41025012	综述	本文综述人工智能在胃部疾病诊疗中的应用进展与发展趋势	发现AI效能与用户专业水平呈反比关系，中等专业水平从业者获益最大；开发了内外部验证表现优异的临床决策支持系统	训练数据存在地域偏见、监管障碍、患者隐私与AI责任伦理问题、AI开发集中于科技巨头	探讨人工智能在胃部疾病诊断和管理中的应用价值与发展前景	胃部疾病诊疗相关的AI技术应用	医学人工智能	胃部疾病	多模态集成框架、大语言模型、智能眼镜	深度学习、大语言模型、多智能体架构	内窥镜图像、临床病史、实验室结果、基因组数据	NA