深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
20961	2024-08-05	Intelligent real-life key-pixel image detection system for early Arabic sign language learners 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2063 PMID:38983191	研究论文	本研究提出了一种改进的手语检测方法，旨在提高早期阿拉伯手语学习者的学习效果	提出的iSDS方法基于YOLOv8算法，能够有效降低误报率并提高手语检测的准确性和速度	本文未提及具体的样本量和训练数据的多样性	改善手语学习框架，以帮助听力障碍人群更好地学习手语	早期阿拉伯手语学习者	计算机视觉	NA	YOLOv8	深度学习	图像	NA
20962	2024-08-05	Deep learning-driven dyslexia detection model using multi-modality data 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2077 PMID:38983227	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的多模态阅读障碍检测模型	通过集成多模态数据并应用多种深度学习模型进行特征提取，提出了一种有效的阅读障碍检测模型	该模型在计算资源有限的情况下表现良好，但对模型的可解释性仍需要进一步提高	研究阅读障碍的检测方法以帮助早期干预	使用磁共振成像（MRI）、功能性MRI和脑电图（EEG）数据进行检测模型的开发	机器学习	阅读障碍	深度学习	MobileNet V3，EfficientNet B7，Bi-LSTM	图像	三个包含FMRI、MRI和EEG数据的数据集
20963	2024-08-05	MCV-UNet: a modified convolution & transformer hybrid encoder-decoder network with multi-scale information fusion for ultrasound image semantic segmentation 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2146 PMID:38983210	研究论文	本文介绍了一种新的混合网络，用于超声图像的语义分割	提出了一种结合卷积神经网络和视觉变换器的网络，并在编码器和解码器阶段引入了多尺度CNN	NA	提高超声图像语义分割的准确性	公共基准超声神经分割数据集	计算机视觉	NA	深度学习	混合CNN和ViT	图像	NA
20964	2024-08-05	Domain Generalization with Correlated Style Uncertainty 2024-Jan, IEEE Winter Conference on Applications of Computer Vision. IEEE Winter Conference on Applications of Computer Vision DOI:10.1109/wacv57701.2024.00200 PMID:38978834	研究论文	本文介绍了一种新的数据增强方法，称为相关风格不确定性（CSU），旨在提高领域泛化能力	提出了一种新的数据增强方法，克服了线性插值的局限性，同时保留了重要的相关性信息	先前的工作可能忽视了不同特征通道之间的相互依赖关系	提高深度学习模型在不同领域的鲁棒性	跨领域计算机视觉和医学成像分类任务的数据集	计算机视觉	NA	数据增强	NA	图像	多个数据集，包括PACS, Office-Home, Camelyon17，以及Duke-Market1501实例检索任务
20965	2024-08-05	Deep learning-based dimensional emotion recognition for conversational agent-based cognitive behavioral therapy 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2104 PMID:38983201	研究论文	本研究开发了一种基于转换器的模型，用于进行维度情感识别，以增强基于对话代理的认知行为治疗的效果	通过开发使用新颖的维度情感数据集的转换器模型，超越了现有的情感建模方法	没有详细讨论模型在不同文化背景或其他语言中的表现	改进互联网基础的认知行为治疗中的情感识别技术	使用变换器模型检测情感的维度，对75,503个样本的情感进行分析	自然语言处理	NA	转换器模型	转换器	文本	75,503个样本用于训练，20名参与者用于可行性研究
20966	2024-08-05	Multi-FusNet: fusion mapping of features for fine-grained image retrieval networks 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2025 PMID:38983204	研究论文	本文提出了一种新的细粒度图像检索方法，结合了特征融合和哈希映射技术	首次在细粒度图像检索中应用了代理自注意架构，并强调中间层特征的融合	尚未明确指出该方法在特定条件下的局限性	提高细粒度图像检索的效率和准确性	细粒度图像数据集与特征	计算机视觉	NA	哈希映射	自注意力架构	图像	涉及五个公开可用的细粒度数据集
20967	2024-08-05	Efficient geospatial mapping of buildings, woodlands, water and roads from aerial imagery using deep learning 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2039 PMID:38983232	研究论文	本研究提出了一种使用深度学习方法对航空影像进行精确地面覆盖分类的策略	采用了三种流行的深度学习模型，提出了一种新的方法以提高预测准确性	没有提及该方法在不同地理区域或不同类型地形上的适用性	提升航空影像分析中地面覆盖分类的效率和准确性	航空影像中建筑物、林地、水域和道路的分类	计算机视觉	NA	深度学习	Vanilla-UNet, ResNet50 UNet, DeepLabV3 ResNet50	图像	NA
20968	2024-08-05	The utilization of artificial intelligence in glaucoma: diagnosis versus screening 2024, Frontiers in ophthalmology DOI:10.3389/fopht.2024.1368081 PMID:38984126	研究论文	文章探讨了人工智能在青光眼诊断和筛查中的不同作用	强调了诊断模型与筛查模型在敏感性与特异性之间的关键平衡	NA	研究人工智能在青光眼诊断和筛查中的应用	青光眼患者及其相关的眼科影像数据	计算机视觉	青光眼	机器学习和深度学习	NA	彩色视网膜照片和其他视网膜成像模式	NA
20969	2024-08-05	COVID-19 and Pneumonia detection and web deployment from CT scan and X-ray images using deep learning 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0302413 PMID:38976703	研究论文	该文章设计了一个基于深度学习的框架，用于检测COVID-19及肺炎，并进行网络部署	提出了多种深度学习算法组合的检测框架，并通过四个深度学习模型在不同数据集上进行了比较与分析	未提及具体的外部验证数据或不同人群的适应性	旨在提升COVID-19及肺炎的检测准确性及管理效率	基于CT扫描和X光图像的数据集进行模型训练和检测	数字病理学	COVID-19	深度学习	VGG-19, ResNet-50, Inception V3, Xception	图像	使用了CT图像和X光图像的数据集进行模型评估，具体样本数量未详细说明
20970	2024-08-05	A Review of Machine Learning and Algorithmic Methods for Protein Phosphorylation Site Prediction 2023-12, Genomics, proteomics & bioinformatics DOI:10.1016/j.gpb.2023.03.007 PMID:37863385	综述	该综述组织了与磷酸化位点预测相关的知识，以促进该领域的未来研究	综述了磷酸化位点（p-site）预测的算法和机器学习方法，并提出重要的特征提取技术	在线p-site预测工具在未见过的蛋白质上的实际性能显著低于相关研究论文中报告的结果	整理和总结与磷酸化位点预测相关的知识	涉及磷酸化修饰及其在生物过程中的角色的蛋白质	机器学习	神经疾病和癌症	NA	传统和端到端深度学习方法	蛋白质数据	创建自2022年dbPTM数据库的新蛋白质的三个测试集
20971	2024-08-05	Protein Structure Prediction: Challenges, Advances, and the Shift of Research Paradigms 2023-10, Genomics, proteomics & bioinformatics DOI:10.1016/j.gpb.2022.11.014 PMID:37001856	综述	该文章综述了蛋白质结构预测领域的研究进展与研究范式的转变	强调了深度学习在蛋白质结构预测中的成功以及研究范式的转变	理论解释神经网络的机制和对蛋白质折叠的知识仍然高度缺乏	探讨蛋白质结构预测的不同研究范式及其演变	涉及多领域研究者对蛋白质结构预测的努力	计算机科学	NA	深度学习	深度神经网络	NA	NA
20972	2024-08-05	Preclinical-to-clinical Anti-cancer Drug Response Prediction and Biomarker Identification Using TINDL 2023-06, Genomics, proteomics & bioinformatics DOI:10.1016/j.gpb.2023.01.006 PMID:36775056	研究论文	本研究开发了一种名为TINDL的深度学习框架，用于预测癌症患者对不同治疗的反应和识别药物反应的生物标志物	使用基于组织的归一化方法处理数据，使得该模型能够识别预测药物反应的小基因集合，并使深度学习黑箱可解释	本研究的实验主要基于癌症细胞系，是否能充分适用于临床患者仍需进一步验证	个性化医学中预测癌症患者对不同治疗反应和识别药物反应生物标志物的目标	预临床癌症细胞系和癌症肿瘤数据，这些数据用于训练和验证模型	机器学习	癌症	深度学习	NA	数据集	使用了来自两个大型数据库的癌症细胞系和肿瘤数据
20973	2024-08-05	Deep Learning-Based Dose Prediction for Automated, Individualized Quality Assurance of Head and Neck Radiation Therapy Plans 2023 May-Jun, Practical radiation oncology IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.prro.2022.12.003 PMID:36697347	研究论文	本研究旨在利用基于深度学习的剂量预测来评估头颈部治疗计划的质量并识别不理想的计划	本研究采用3D Dense Dilated U-Net架构进行剂量预测，显示其在自动化、个性化评估头颈部放疗计划质量中的应用潜力	临床计划的OAR标记存在高的医师间变异性，且仅有83%的医师标记的OAR由其中一位医师提出	研究深度学习在头颈部放疗计划质量评估中的应用	245个体积调制弧治疗（VMAT）头颈部计划以及112个高质量计划	医学影像处理	头颈癌	深度学习	3D Dense Dilated U-Net	计算机断层扫描图像	245个计划
20974	2024-08-07	Automated Determination of Left Ventricular Function Using Electrocardiogram Data in Patients on Maintenance Hemodialysis 2022-07, Clinical journal of the American Society of Nephrology : CJASN IF:8.5Q1 DOI:10.2215/CJN.16481221 PMID:35667835	研究论文	本研究利用深度学习模型，通过心电图数据自动评估接受维持性血液透析患者的左心室射血分数	使用迁移学习方法在小样本量的维持性血液透析患者中估计左心室射血分数	NA	开发和评估用于估计维持性血液透析患者左心室射血分数的深度学习模型	接受维持性血液透析的患者	机器学习	心血管疾病	深度学习	CNN	心电图数据	18,626对心电图与超声心动图数据用于模型1和2，705,075对用于模型3和4
20975	2024-08-07	Evaluating the utility of deep learning for predicting therapeutic response in diabetic eye disease 2022, Frontiers in ophthalmology DOI:10.3389/fopht.2022.852107 PMID:36744216	研究论文	本研究评估了深度学习在糖尿病眼病治疗反应预测中的应用	探索了在样本量有限的情况下，使用深度学习技术预测治疗反应的可能性	在数据集较小的情况下，深度学习模型在预测治疗反应方面的表现受限	理解深度学习在眼科临床问题中的实用性，特别是在预测治疗反应方面	使用深度学习模型预测糖尿病眼病的治疗反应	机器学习	糖尿病眼病	深度学习	CNN	图像	29个临床试验数据集，217张超广角血管造影图像
20976	2024-08-07	Deep learning and optical coherence tomography in glaucoma: Bridging the diagnostic gap on structural imaging 2022, Frontiers in ophthalmology DOI:10.3389/fopht.2022.937205 PMID:38983522	综述	本文综述了利用深度学习算法和光学相干断层扫描（OCT）在青光眼诊断中的应用，特别是在结构影像方面的进展	介绍了深度学习算法在自动化检测青光眼损伤和进展方面的创新进展，以及如何利用OCT数据改进眼底摄影中青光眼损伤的检测	NA	探讨深度学习模型在青光眼检测中的应用，并展望这些发现在未来老化和基础科学领域的应用	青光眼的诊断和进展检测	计算机视觉	青光眼	光学相干断层扫描（OCT）	深度学习（DL）	影像	NA
20977	2024-08-07	Individual dairy cow identification based on lightweight convolutional neural network 2021, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0260510 PMID:34843562	研究论文	本研究利用深度学习技术，通过改进的轻量级卷积神经网络Alexnet，实现了在复杂背景下的个体奶牛识别	提出了一种改进的轻量级卷积神经网络模型，通过短路连接的BasicBlock和改进的inception模块及注意力机制，提高了特征点的检测能力，同时减少了模型参数	NA	提高农场中个体奶牛识别技术的实用性和效率	个体奶牛的图像识别	计算机视觉	NA	卷积神经网络	CNN	图像	13头奶牛的侧视图像
20978	2024-08-05	A review of ADHD detection studies with machine learning methods using rsfMRI data 2024-Aug, NMR in biomedicine IF:2.7Q1 DOI:10.1002/nbm.5138 PMID:38472163	综述	本文综述了基于静息状态功能磁共振成像(rsfMRI)数据和机器学习方法的ADHD检测研究	该研究首次专门调查了ADHD的检测，并详细比较了现有研究的性能优缺点	文章未提及具体数据的样本大小和类型	研究旨在评估rsfMRI数据与机器学习方法在ADHD检测中的应用	研究对象为ADHD相关的fMRI数据和机器学习检测方法	机器学习	注意力缺陷多动障碍	rsfMRI	机器学习	fMRI数据	NA
20979	2024-08-05	A review of self-supervised, generative, and few-shot deep learning methods for data-limited magnetic resonance imaging segmentation 2024-Aug, NMR in biomedicine IF:2.7Q1 DOI:10.1002/nbm.5143 PMID:38523402	review	该文章回顾了用于数据有限的磁共振成像分割的自监督、生成和少样本深度学习方法	创新点在于总结了利用少量标注样本的最新算法，并探讨了自监督学习、生成模型、少样本学习和半监督学习的基本原理	本综述没有深入探讨所有最新算法的细节，只是提供了一个概述	本研究的目的是回顾在数据有限情况下进行的磁共振成像分割的先进算法	研究对象包括心脏、腹部和脑部的磁共振成像分割应用	数字病理	NA	NA	自监督学习、生成模型、少样本学习和半监督学习	MRI图像	NA
20980	2024-08-05	Engineering a Robust UDP-Glucose Pyrophosphorylase for Enhanced Biocatalytic Synthesis via ProteinMPNN and Ancestral Sequence Reconstruction 2024-Jul-10, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c03126 PMID:38918953	研究论文	本研究关注于通过多酶催化合成UDP-葡萄糖，采用深度学习和祖先序列重建工程化热稳定UGP变体	创新点在于利用深度学习和祖先序列重建设计了一个热稳定性显著提高的UDP-葡萄糖焦磷酸酶变体	NA	研究UDP-葡萄糖的合成方法以降低成本	UDP-葡萄糖焦磷酸酶及其工程化变体	生物催化	NA	深度学习	NA	化学反应数据	实验验证了工程化UGP变体的合成能力，合成量为52.6 mM