深度学习在生物医药领域的应用
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当前共找到 36822 篇文献，本页显示第 21561 - 21580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21561 | 2025-10-07 |
Optimal Transport Based Graph Kernels for Drug Property Prediction
2025, IEEE open journal of engineering in medicine and biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1109/OJEMB.2024.3480708
PMID:39906265
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研究论文 | 提出基于最优传输理论的图核方法用于药物ADMET性质预测 | 首次将最优传输理论应用于构建图核函数，相比图神经网络具有更好的可解释性、适应性和泛化能力 | 未明确说明方法在特定类型药物或性质预测上的局限性 | 开发计算工具以早期准确预测药物的ADMET性质 | 药物分子的图结构数据 | 机器学习 | NA | 图匹配，最优传输理论 | 图核方法 | 图数据 | 19个不同的ADMET数据集 | NA | 基于最优传输的图核 | NA | NA |
| 21562 | 2025-10-07 |
ChromosomeNet: Deep Learning-Based Automated Chromosome Detection in Metaphase Cell Images
2025, IEEE open journal of engineering in medicine and biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1109/OJEMB.2024.3512932
PMID:39906268
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研究论文 | 提出基于深度学习的染色体自动检测系统ChromosomeNet，用于中期细胞图像中的染色体识别 | 结合单阶段和双阶段模型优势，无需预处理即可处理原始图像，在包含困难图像的大规模数据集上实现高精度检测 | 需要其他医院数据进行跨院验证以确认临床适用性 | 开发自动染色体检测和识别系统以辅助产前诊断 | 中期细胞图像中的染色体 | 计算机视觉 | 染色体疾病 | 深度学习 | 目标检测模型 | 图像 | 5000张中期细胞图像，包含229,852条染色体（其中3827张简单图像，1173张困难图像） | NA | ChromosomeNet（结合单阶段和双阶段模型） | mAP50, 准确率, 召回率, F1分数 | NA |
| 21563 | 2025-10-07 |
Evaluating the advancements in protein language models for encoding strategies in protein function prediction: a comprehensive review
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1506508
PMID:39906415
|
综述 | 全面评估蛋白质语言模型在蛋白质功能预测中编码策略的最新进展 | 系统整合最新蛋白质语言模型在功能预测中的应用现状，并与传统方法进行详尽性能对比 | NA | 评估蛋白质语言模型在蛋白质功能预测编码策略中的进展 | 蛋白质序列数据及其功能预测 | 生物信息学 | NA | 深度学习，蛋白质语言模型 | 蛋白质语言模型 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | 准确率 | NA |
| 21564 | 2025-10-07 |
ECG-LM: Understanding Electrocardiogram with a Large Language Model
2025, Health data science
DOI:10.34133/hds.0221
PMID:39906894
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研究论文 | 开发了首个能够处理自然语言并理解心电图信号的多模态大语言模型ECG-LM | 首创将多模态大语言模型应用于心电图处理，通过专门的ECG编码器将原始ECG信号转换到高维特征空间并与文本特征空间对齐 | 文本-ECG数据稀缺问题通过医疗指南生成数据来解决，但仍需更多真实临床数据验证 | 开发能够整合患者数据和ECG读数并提供临床建议的多模态大语言模型 | 心电图信号和患者临床数据 | 自然语言处理, 医疗人工智能 | 心血管疾病 | 多模态大语言模型, ECG信号处理 | 大语言模型, 多模态模型 | 心电图信号, 文本数据 | 基于医疗指南生成的文本-ECG对和医院真实临床数据 | NA | 大语言模型, 专门的ECG编码器 | 心血管疾病检测准确率, 问答性能 | NA |
| 21565 | 2025-10-07 |
Application of human-in-the-loop hybrid augmented intelligence approach in security inspection system
2025, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2025.1518850
PMID:39911181
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研究论文 | 提出一种人在回路混合增强智能方法，通过混合决策策略提升安检系统的安全性和效率 | 首次将“拒绝优先”和“放行优先”两种策略结合的混合决策方法应用于安检系统 | 实验数据仅来自特定安检场景，未验证在其他场景的泛化能力 | 提升安检系统的安全性和可靠性，同时降低人力成本 | 安检系统中的违禁品检测 | 机器智能 | NA | 人在回路混合增强智能 | 深度学习 | 安检数据 | 来自特定安检站点的数据集 | NA | NA | 安全性、效率、人力成本 | NA |
| 21566 | 2025-10-07 |
AlphaFold 2, but not AlphaFold 3, predicts confident but unrealistic β-solenoid structures for repeat proteins
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.016
PMID:39911842
|
研究论文 | 评估AlphaFold 2在完美重复序列蛋白质结构预测中的表现，发现其倾向于生成高置信度但不现实的β-螺线管结构 | 首次系统揭示AlphaFold 2对完美重复序列存在特异性预测偏差，生成具有不合理特征的β-螺线管结构 | 研究主要针对人工设计的完美重复序列，对天然蛋白质的适用性需要进一步验证 | 评估AlphaFold 2在特定蛋白质序列类型（完美重复序列）上的预测准确性 | 由不同长度随机序列组成的完美重复蛋白质序列 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测，分子动力学模拟 | 深度学习 | 蛋白质序列数据 | 多种不同长度的完美重复序列 | AlphaFold 2, 其他先进结构预测方法 | AlphaFold 2架构 | 预测置信度，结构合理性评估 | NA |
| 21567 | 2025-10-07 |
Intelligent cholinergic white matter pathways algorithm based on U-net reflects cognitive impairment in patients with silent cerebrovascular disease
2024-Dec-30, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2023-002976
PMID:38569895
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研究论文 | 开发基于U-net的智能算法评估静默性脑血管病患者胆碱能白质通路损伤与认知功能障碍的关系 | 首个用于评估胆碱能白质通路的智能算法，相比金标准具有良好准确性 | NA | 建立智能算法评估血管源性白质高信号患者的胆碱能白质通路损伤 | 静默性脑血管病伴血管源性白质高信号患者 | 数字病理 | 脑血管疾病 | 深度学习 | CNN | 医学影像 | 内部训练测试集464例患者，外部验证集100例患者 | NA | U-net | 灵敏度, 特异性, AUC | NA |
| 21568 | 2025-10-07 |
Application of deep learning models on single-cell RNA sequencing analysis uncovers novel markers of double negative T cells
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82406-7
PMID:39732739
|
研究论文 | 本研究应用深度学习模型分析单细胞RNA测序数据，揭示了双阴性T细胞的新型标志物 | 首次使用scVI深度学习模型识别DNT细胞亚群的新型标志物，修正了先前关于CD137表达的错误认知，并发现了CD30和CD153等新标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类DNT细胞的验证相对有限 | 通过深度学习技术识别和验证双阴性T细胞的新型分子标志物 | C57BL/6小鼠和MRL/lpr小鼠的脾脏双阴性T细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 深度学习 | 基因表达数据 | C57BL/6小鼠和MRL/lpr小鼠的脾脏DNT细胞 | scVI | Single Cell Variational Inference | 流式细胞术验证 | NA |
| 21569 | 2025-10-07 |
Predicting RNA Structure and Dynamics with Deep Learning and Solution Scattering
2024-Dec-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.08.598075
PMID:39764023
|
研究论文 | 开发了结合深度学习与溶液散射的SCOPER流程，用于预测RNA在溶液中的结构和动力学 | 整合了基于运动学的构象采样与创新的深度学习模型IonNet，专门预测Mg离子结合位点，解决了RNA构象可塑性和离子效应的问题 | 需要初始足够准确的结构作为输入，可能对实验SAXS数据存在过拟合风险 | 提高RNA在溶液中结构和动力学的预测准确性 | RNA分子及其溶液构象 | 计算生物学 | NA | 小角X射线散射(SAXS), 深度学习 | 深度学习模型 | SAXS剖面数据, 结构数据 | 14个实验数据集 | NA | IonNet | SAXS剖面拟合质量 | NA |
| 21570 | 2025-10-07 |
Automatic detection and counting of wheat spike based on DMseg-Count
2024-11-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80244-1
PMID:39613805
|
研究论文 | 提出基于DMseg-Count的小麦穗自动检测与计数方法，用于产量预测和品种评估 | 在DM-Count模型基础上引入小麦穗局部分割分支，通过逐元素点乘机制融合全局与局部上下文监督信息 | 未明确说明模型在极端遮挡和重叠情况下的性能限制 | 提高复杂田间环境下小麦穗自动检测与计数的准确性 | 小麦穗图像 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | CNN | 图像 | NA | NA | DMseg-Count, DM-Count | 平均绝对误差(MAE), 均方根误差(RMSE) | NA |
| 21571 | 2025-10-07 |
Synthetic augmentation of cancer cell line multi-omic datasets using unsupervised deep learning
2024-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54771-4
PMID:39614072
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研究论文 | 本研究开发了一种无监督深度学习模型MOSA，用于整合和增强癌症细胞系的多组学数据集 | 提出首个专门用于整合和增强癌症依赖图谱的无监督深度学习模型，能够生成分子和表型特征，将多组学特征数量增加32.7% | NA | 解决生物数据异质性、复杂性和稀疏性问题，实现对癌症生物学的整体理解 | 1523个癌症细胞系的多组学数据 | 机器学习 | 癌症 | 多组学分析 | 无监督深度学习 | 多组学数据 | 1523个癌症细胞系 | NA | MOSA | SHAP分析 | NA |
| 21572 | 2025-10-07 |
nPOD-Kidney: A Heterogenous Donor Cohort for the Investigation of Diabetic Kidney Disease Pathogenesis and Progression
2024-Nov-05, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000000620
PMID:39499578
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研究论文 | 介绍nPOD-K肾脏项目通过传统和数字病理学方法研究糖尿病肾病发病机制和进展 | 建立首个基于器官捐赠者肾脏的异质性队列，结合数字病理和深度学习工具分析糖尿病肾病进展 | 研究依赖于器官捐赠者样本，样本获取可能受限 | 利用器官捐赠者肾脏增强对糖尿病肾病发病机制和进展的理解 | 器官捐赠者的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 传统病理学染色, 数字病理学, 全玻片成像 | 深度学习, 机器学习 | 病理图像 | nPOD-K队列肾脏样本 | Visiopharm | NA | 组织学定量分析 | NA |
| 21573 | 2025-10-07 |
Machine learning-optimized targeted detection of alternative splicing
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.20.614162
PMID:39386495
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研究论文 | 提出一种名为LSV-seq的靶向RNA测序方法，通过机器学习优化引物设计，提高选择性剪接检测的效率和灵敏度 | 开发了Optimal Prime机器学习算法优化引物设计，并首次将深度学习剪接编码预测与靶向测序相结合 | 方法主要针对已知剪接事件的检测，可能不适用于全新剪接事件的发现 | 开发高效检测和量化选择性剪接的靶向RNA测序方法 | 人类组织样本中的选择性剪接事件 | 机器学习 | NA | RNA-seq, LSV-seq, 靶向测序 | 机器学习, 深度学习 | RNA测序数据 | GTEx数据库中的数千个引物序列 | NA | NA | 捕获率, 测序深度, 灵敏度 | NA |
| 21574 | 2025-10-07 |
Empowering Portable Age-Related Macular Degeneration Screening: Evaluation of a Deep Learning Algorithm for a Smartphone Fundus Camera
2024-09-05, BMJ open
IF:2.4Q1
DOI:10.1136/bmjopen-2023-081398
PMID:39237272
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研究论文 | 评估用于智能手机眼底相机的深度学习算法在年龄相关性黄斑变性筛查中的性能 | 首次评估基于智能手机眼底相机的AI系统进行AMD筛查，通过两阶段训练策略（初始训练+设备特定微调） | 使用回顾性数据，需要前瞻性研究验证临床适用性 | 开发便携式年龄相关性黄斑变性筛查系统 | 视网膜图像和年龄相关性黄斑变性患者 | 计算机视觉 | 年龄相关性黄斑变性 | 眼底成像 | 深度学习 | 图像 | 初始训练108,251张图像，微调1,108张图像，测试集分别包含909张和238张图像 | NA | NA | AUC, 敏感度, 特异度 | NA |
| 21575 | 2025-10-07 |
Free access via computational cloud to deep learning-based EEG assessment in neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy: revolutionary opportunities to overcome health disparities
2024-Sep, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-024-03427-6
PMID:39107521
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研究论文 | 评估基于深度学习的脑电监测系统BSN作为新生儿缺氧缺血性脑病严重程度床边标志物的有效性 | 首次通过计算云平台免费提供基于深度学习的脑电评估，为克服健康差异提供创新解决方案 | 样本量较小（仅46例HIE新生儿），需要更大规模研究验证 | 开发可访问的深度学习脑电评估工具用于新生儿脑病严重程度监测 | 缺氧缺血性脑病新生儿与健康婴儿 | 医疗人工智能 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 脑电图 | 深度学习 | 脑电信号 | 46例HIE新生儿及健康婴儿对照 | NA | Brain State of the Newborn (BSN) | 与Total Sarnat Score相关性分析 | 计算云平台 |
| 21576 | 2025-10-07 |
AI and Big Data approaches to addressing the opioid crisis: a scoping review protocol
2024-08-31, BMJ open
IF:2.4Q1
DOI:10.1136/bmjopen-2024-084728
PMID:39645274
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综述 | 本文提出了一项范围综述方案，旨在评估人工智能和大数据技术在应对阿片类药物危机中的最新进展 | 首次系统性地对AI和大数据技术在阿片类药物危机中的应用进行范围综述，填补该领域综合评估的空白 | 作为综述方案，尚未开展实际数据收集和分析，结果有待后续研究验证 | 评估AI和大数据技术在检测、治疗、预防和应对阿片类药物危机方面的有效性 | 2013-2023年间发表的关于AI和大数据技术应用于阿片类药物危机的研究文献 | 自然语言处理, 机器学习 | 阿片类药物危机 | 机器学习, 深度学习, 自然语言处理 | NA | 文献数据, 灰色文献 | 四个科学数据库的文献（PubMed, Web of Science, Engineering Village, PsycInfo） | NA | NA | 评估指标将作为提取信息的一部分进行分析 | Covidence文献筛选工具 |
| 21577 | 2025-10-07 |
CREMP: Conformer-rotamer ensembles of macrocyclic peptides for machine learning
2024-Aug-09, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03698-y
PMID:39122750
|
研究论文 | 本文介绍了CREMP数据集，这是一个用于机器学习模型开发和评估的环肽构象集合资源 | 首次创建了包含36,198个独特环肽及其高质量结构集合的大规模数据集，填补了环肽构象建模领域的空白 | 数据集主要基于计算模拟生成，需要进一步实验验证 | 开发用于环肽构象建模和优化的机器学习方法 | 环肽的构象集合和结构特性 | 机器学习 | NA | 构象-旋转异构体集合采样工具(CREST)，半经验扩展紧束缚(xTB)DFT计算 | NA | 结构数据，构象集合，能量注释 | 36,198个独特环肽，包含近3,130万个独特环肽几何结构，其中3,258个环肽具有被动渗透性数据 | NA | NA | NA | NA |
| 21578 | 2025-10-07 |
Artificial intelligence for gastric cancer in endoscopy: From diagnostic reasoning to market
2024-Jul, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.dld.2024.04.019
PMID:38763796
|
综述 | 本文全面评估人工智能在内窥镜成像中评估胃癌前病变和癌变病变的应用现状及临床推广障碍 | 系统梳理人工智能在胃镜领域从诊断推理到市场应用的全链条发展，重点关注临床转化面临的挑战 | 缺乏大规模稳健验证研究，存在监管障碍，临床常规应用尚未普及 | 评估人工智能在内窥镜胃部病变检测中的当前应用状况和实施障碍 | 胃部癌前病变和癌变病变的内窥镜图像 | 计算机视觉 | 胃癌 | 内窥镜成像 | 深度学习 | 医学图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21579 | 2025-10-07 |
Sentiment analysis of the Hamas-Israel war on YouTube comments using deep learning
2024-06-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63367-3
PMID:38871739
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研究论文 | 本研究使用深度学习方法对YouTube上关于哈马斯-以色列战争的评论进行情感分析 | 首次将多种深度学习模型应用于哈马斯-以色列战争相关的社交媒体评论情感分析，并比较了不同词嵌入技术的效果 | 研究仅针对YouTube平台，样本来源有限；人工标注可能存在主观性；未考虑评论的时间动态变化 | 通过分析社交媒体评论了解公众对哈马斯-以色列战争的情感和意见倾向 | YouTube上关于哈马斯-以色列战争的用户评论 | 自然语言处理 | NA | 自然语言处理，情感分析 | LSTM, Bi-LSTM, GRU, CNN | 文本评论 | 24,360条来自BBC、WION、Aljazeera等YouTube新闻频道的评论 | NA | CNN和Bi-LSTM混合模型 | 准确率 | NA |
| 21580 | 2025-10-07 |
The Neurobeachin-like 2 protein (NBEAL2) controls the homeostatic level of the ribosomal protein RPS6 in mast cells
2024-05, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13756
PMID:38272677
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研究论文 | 本研究揭示了NBEAL2蛋白通过调控核糖体蛋白RPS6的稳态水平影响肥大细胞功能的分子机制 | 首次发现NBEAL2与RPS6形成复合物调控其蛋白稳态，并阐明NBEAL2缺失导致RPS6异常磷酸化进而引发肥大细胞表型异常的机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类样本验证不足；具体分子相互作用机制仍需进一步探索 | 探究NBEAL2在肥大细胞中的详细功能及其分子机制 | 小鼠肥大细胞、MC/9肥大细胞系 | 分子生物学 | 免疫系统疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑, 免疫共沉淀, 蛋白质印迹, ELISA, 流式细胞术 | 深度学习 | 蛋白质结构, 分子相互作用数据 | 野生型和Nbeal2基因敲除小鼠的肥大细胞, MC/9细胞系 | RoseTTAFold, Pymol | 深度学习蛋白质结构预测模型 | NA | NA |