深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
22181	2024-08-05	A knowledge-aware deep learning model for landslide susceptibility assessment in Hong Kong 2024-Sep-01, The Science of the total environment DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.173557 PMID:38806128	研究论文	本文提出了一种知识感知的深度学习模型，用于评估香港的滑坡易发性。	将滑坡先验知识与深度学习模型相结合，提高了模型的可转移性和稳定性。	在滑坡发生之前，只有少数滑坡显示检测到的运动，大多数滑坡是自发发生的，缺乏前兆运动。	研究旨在提高滑坡预测模型的准确性和稳定性。	研究对象为香港地区的滑坡发生情况及其影响因素。	数字病理学	NA	深度学习	变分自编码器	地形、地质、气候等相关数据	NA
22182	2024-08-05	Convolutional neural networks combined with classification algorithms for the diagnosis of periodontitis 2024-Jul, Oral radiology IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s11282-024-00739-5 PMID:38393548	研究论文	本文旨在开发一种结合卷积神经网络和分类算法的深度学习模型，以帮助牙医快速准确地诊断牙周炎的阶段	本文创新性地将多种CNN模型与分类算法结合，提高了牙周炎诊断的准确性和效率	未提及本文可能的局限性	提高牙周炎的诊断效率和准确率	牙周炎的阶段诊断	计算机视觉	口腔疾病	卷积神经网络（CNN）	Alexnet, VGG16, ResNet18	影像（根尖放射线照相）和临床数据	未提供具体样本数量
22183	2024-08-05	Artificial intelligence for caries detection: a novel diagnostic tool using deep learning algorithms 2024-Jul, Oral radiology IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s11282-024-00741-x PMID:38498223	研究论文	本文旨在利用深度学习算法开发一种自动检测牙齿龋齿的评估工具	提出了一种名为ResNet+SAM的新型诊断模型，能够自动检测牙齿龋齿，并在性能上优于传统的CNN模型	文章未提及具体的算法训练细节或潜在的进一步验证	开发一种用于自动检测牙齿龋齿的工具	使用4278幅经医学专家注释的根尖X光照片来训练和验证模型	计算机视觉	NA	卷积神经网络	ResNet+SAM	图像	4278幅根尖X光照片
22184	2024-08-05	Solution-state methyl NMR spectroscopy of large non-deuterated proteins enabled by deep neural networks 2024-Jun-13, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49378-8 PMID:38871714	研究论文	本文展示了使用深度神经网络处理质子化样本的NMR光谱，以解决大分子样品准备的挑战。	本研究创新性地展示了在不进行氘代的情况下，通过深度神经网络获得高质量的NMR光谱。	研究中可能仍存在对数据处理及解读的限制，且未涉及所有类型的大分子蛋白质。	探讨使用深度学习分析复杂磁共振数据的方法，以促进对大生物分子的研究。	研究涉及分子量在42-360 kDa范围内的三种蛋白质及大肠杆菌苹果酸合成酶G（81 kDa）。	数字病理学	NA	NMR光谱	深度神经网络	光谱数据	三种蛋白质
22185	2024-08-05	Active gas camera mass flow quantification (qOGI): Application in a biogas plant and comparison to state-of-the-art gas cams 2024-Jun-01, The Review of scientific instruments DOI:10.1063/5.0206155 PMID:38884562	研究论文	本文介绍了一种用于气体流量量化的新型主动气体相机，并在生物气体工厂进行应用。	本文创新地增强了气体相机的灵敏度适应性和相机-气体距离检测功能，首次实现了主动与被动气体相机间的比较。	本文未详细讨论在不同环境条件下该技术的普遍适用性。	研究气体流量的量化技术，评估主动气体相机在实际应用中的性能。	本研究对象为德国一座生物气体工厂中的气体泄漏情况。	数字道歉病理学	NA	激光光谱法和深度学习	NA	气体浓度	在生物气体工厂测量了一次气体泄漏情况
22186	2024-08-05	Automated blood volume estimation in surgical drains for clinical decision support 2024-Jun, European review for medical and pharmacological sciences DOI:10.26355/eurrev_202406_36375 PMID:38884505	研究论文	本文提出了一种利用深度学习技术自动估算手术引流管中血液体积的方法	创新点在于使用非接触方法和深度学习技术自动检测引流管，并计算血液体积	尚未提及系统在不同临床环境下的长期稳定性测试	研究旨在创建一个自动化的血液体积监测系统，以支持临床决策	主要研究对象是手术引流管中的血液体积监测	计算机视觉	NA	深度学习	语义分割	图像	使用了1004张在各种背景和光照条件下拍摄的图像
22187	2024-08-05	A systematic review of brain metastases from lung cancer using magnetic resonance neuroimaging: Clinical and technical aspects 2024-Jun, Journal of medical radiation sciences IF:1.8Q3 DOI:10.1002/jmrs.756 PMID:38234262	综述	本综述总结了与肺癌相关的脑转移瘤在磁共振成像技术方面的最新进展	文章创新性地展示了先进的磁共振成像技术在脑转移瘤管理中的应用，如灌注加权成像(PWI)和扩散加权成像(DWI)	文章可能未能包括所有相关研究，可能存在偏倚的文献选择	探讨磁共振成像技术在肺癌脑转移瘤中的临床和技术应用	涉及2013年1月至2023年3月间进行的脑转移瘤相关的65项研究	数字病理学	肺癌	磁共振成像(MRI)	深度学习(DL)	文本	65项研究
22188	2024-08-05	TomoNet: A streamlined cryoET software pipeline with automatic particle picking on flexible lattices 2024-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.02.17.580557 PMID:38464049	研究论文	TomoNet是一种流线型的cryoET软件管道，具有自动粒子拾取功能，能够在灵活的晶格上进行操作	开发了具有现代图形用户界面的软件包，集成了自动粒子拾取和3D分类功能以提高分辨率	NA	通过提高分辨率来准确定位和平均生物复杂体的结构	病毒样颗粒、细胞层内的细菌表面层和装饰核排出蛋白复合物的膜	数字病理学	NA	cryoET	深度学习	3D图像	多个数据集，具体数目未提及
22189	2024-08-05	Self-supervised multimodal learning for group inferences from MRI data: Discovering disorder-relevant brain regions and multimodal links 2024-Jan, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2023.120485 PMID:38110045	研究论文	本文提出了一种自监督框架，用于从多模态神经影像数据中提取代表性，以增强群体推断。	该研究将Deep InfoMax扩展到多模态数据，首次探索其在识别相关脑区和多模态链接中的应用。	该方法依赖于自监督学习，可能在没有准确标签的情况下对某些特定案例的适用性有限。	研究旨在通过增强群体推断，探讨复杂脑部疾病的多模态联系。	研究对象包括使用MRI数据预测阿尔茨海默病及其相关疾病的脑区。	计算机视觉	阿尔茨海默病	自监督学习，Deep InfoMax	NA	神经影像数据	NA
22190	2024-08-05	Machine learning and deep learning for brain tumor MRI image segmentation 2023-11, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.) DOI:10.1177/15353702231214259 PMID:38102956	综述	文章综述了用于脑肿瘤MRI图像分割的常用机器学习和深度学习技术	结合两种或更多技术的趋势是当前的创新点	讨论了所述机器学习和深度学习方法的局限性和优点	研究脑肿瘤MRI图像分割的技术	脑肿瘤的MRI图像	计算机视觉	脑肿瘤	MRI	机器学习和深度学习技术	图像	NA
22191	2024-08-07	Protein structural alignment using deep learning 2023-10, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-023-01543-3 PMID:37816889	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
22192	2024-08-05	Study on breast cancerization and isolated diagnosis in situ by HOF-ATR-MIR spectroscopy with deep learning 2024-Oct-15, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy DOI:10.1016/j.saa.2024.124546 PMID:38824755	研究论文	本研究探讨了通过HOF-ATR-MIR光谱与深度学习对乳腺癌的分类与诊断	首次建立了基于1D-CNN的三类分类模型，能够有效区分正常、癌旁及癌变乳腺组织	并未明确提到具体的样本数量及研究局限性	旨在利用深度学习技术提高乳腺组织的分类与诊断准确性	研究对象为不同类型的乳腺组织，包括正常组织、癌旁组织和癌变组织	数字病理学	乳腺癌	HOF-ATR-MIR光谱	1D-CNN	光谱数据	NA
22193	2024-08-05	Learning active subspaces and discovering important features with Gaussian radial basis functions neural networks 2024-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2024.106335 PMID:38733793	研究论文	提出了一种改进的径向基函数神经网络模型，旨在提高预测性能并增强可解释性	通过可学习的精度矩阵修改了传统的径向基函数神经网络模型，使其能够提取关键特征和主动子空间	未提及具体的局限性	旨在通过提高模型的可预测性和可解释性来解决机器学习中的主要挑战	对回归、分类和特征选择任务进行数值实验	机器学习	NA	高斯径向基函数神经网络	NA	表格数据	NA
22194	2024-08-05	Towards complex dynamic physics system simulation with graph neural ordinary equations 2024-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2024.106341 PMID:38692189	研究论文	本文提出了一种新模型GNSTODE，用于模拟复杂的粒子系统	引入了图网络与时空神经常微分方程的结合，以处理粒子系统中的时空依赖性	未提及具体的局限性	旨在理解和模拟复杂物理系统中的粒子交互行为	复杂粒子系统的模拟	机器学习	NA	神经常微分方程	图网络	观测数据	在两个真实世界的粒子系统中进行评估，未具体说明样本数量
22195	2024-08-05	Which images to label for few-shot medical image analysis? 2024-Aug, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103200 PMID:38801797	研究论文	该文章提出了一种新颖的模板选择策略，以在少量标记医疗图像分析中选择值得标记的图像	提出了一种新颖的模板选择策略（TECP），优先选择适合标注的图像以改善模型性能	该研究未提及TECP在不同类型数据集上的适用性分析	旨在通过改进标注策略来提升少样本医疗图像分析的效果	涉及多种少样本医疗任务，包括标志检测、解剖检测和解剖分割	计算机视觉	NA	深度学习	NA	医学图像	多个公共数据集
22196	2024-08-05	Multi-scale self-attention approach for analysing motor imagery signals in brain-computer interfaces 2024-Aug, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2024.110182 PMID:38795979	研究论文	本文提出了一种利用多尺度自注意力机制分析运动想象信号的模型	创新点在于使用多尺度时空自注意力网络进行脑电图运动想象信号的分类	仍面临脑电图数据准确分类的挑战	研究旨在通过自注意力机制提高运动想象脑电图信号的分类精确度	研究对象为运动想象的脑电图信号，包括左手、右手、脚和舌头/休息四类	自然语言处理	NA	脑电图（EEG）	多尺度自注意力网络	信号	在BCI竞赛的IV-2b数据集上进行测试
22197	2024-08-05	CMAN: Cascaded Multi-scale Spatial Channel Attention-guided Network for large 3D deformable registration of liver CT images 2024-Aug, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103212 PMID:38830326	研究论文	提出了一种新的CNN基础的无监督学习配准方法CMAN，用于处理肝脏CT图像的大变形。	创新点在于采用双重粗到细的配准方法，结合空间通道注意力模块，有效提高大变形域的配准精度。	缺乏对更多复杂形状器官或其他医学图像的适应性验证。	研究旨在开发一种能够高效处理大变形图像配准的深度学习网络。	研究对象为肝脏CT图像。	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	使用了两个公开数据集进行训练，并在另一个公共数据集和一个私人数据集上进行了评估
22198	2024-08-05	Local spatial and temporal relation discovery model based on attention mechanism for traffic forecasting 2024-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2024.106365 PMID:38739964	研究论文	提出了一种基于注意机制的局部空间和时间关系发现模型，旨在提高交通预测的准确性	引入了局部注意机制来建模历史输入数据的异步依赖性，并使用皮尔逊相关系数提取邻近道路历史交通条件对目标道路未来状态的影响	深度学习方法的属性使得其解释显式时空关系存在挑战	提高智能交通系统中交通预测的准确性	交通数据，通过深度学习方法建模交通状态演变模式	机器学习	NA	深度学习	注意机制模型	交通数据	多个数据集的实验结果
22199	2024-08-05	Improved weight initialization for deep and narrow feedforward neural network 2024-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2024.106362 PMID:38733795	研究论文	提出了一种新的权重初始化方法，以解决RELU激活函数在深度神经网络中的‘死亡RELU’问题	提出了新的权重初始化方法，能有效解决深度和窄的前馈神经网络中的信号传播问题	尚未提及方法在极端情况下的表现和适用性	解决RELU激活函数导致的深度神经网络训练困难问题	深度和窄的前馈神经网络	机器学习	NA	NA	前馈神经网络	NA	通过一系列实验进行比较，样本大小未具体说明
22200	2024-08-05	Unsupervised mutual transformer learning for multi-gigapixel Whole Slide Image classification 2024-Aug, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103203 PMID:38810517	研究论文	提出了一种基于互变换学习的全无人监督的WSI分类算法	创新性地提出了一种完全无人监督的WSI分类算法，并通过互变换学习生成伪标签	未提及具体的局限性	研究WSI分类中的无人监督学习方法	多千兆像素的全幻灯片图像	计算病理学	癌症	变换学习	变换器	图像	在四个公开可用的数据集上进行了大量实验