深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
221	2025-09-28	EEG-Based Deep Learning Model for Hyper-Acute Large Vessel Occlusion Stroke Detection in Mice 2025-Sep, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.70592 PMID:41014019	研究论文	开发基于EEG信号的深度学习模型用于小鼠超急性大血管闭塞性卒中的早期检测	首次将EEGNet深度学习架构应用于超急性期LVO卒中的EEG信号检测，并在1.5小时内实现高精度诊断	研究基于小鼠pMCAO模型，尚未在人类临床环境中验证	开发早期准确检测超急性大血管闭塞性卒中的深度学习模型	pMCAO模型小鼠	机器学习	脑血管疾病	高分辨率EEG信号采集、七折交叉验证、t-SNE分析	EEGNet	EEG信号	使用pMCAO模型小鼠的EEG数据（具体数量未明确说明）
222	2025-09-28	scBCN: deep learning-based batch correction network for integration of heterogeneous single-cell data 2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbaf503 PMID:40991329	研究论文	提出基于深度学习的单细胞数据批次校正网络scBCN，用于整合异质性单细胞数据	结合跨批次相似聚类识别与深度残差神经网络，在消除批次效应的同时保留生物变异	NA	开发单细胞数据批次校正方法以准确识别细胞类型	异质性单细胞数据集	生物信息学	NA	单细胞测序	深度残差神经网络	单细胞基因表达数据	多个模拟和真实数据集（未指定具体样本量）
223	2025-09-28	From Gene Networks to Therapeutics: A Causal Inference and Deep Learning Approach for Drug Discovery 2025-Aug-30, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/ph18091304 PMID:41011176	研究论文	提出一种整合网络分析、统计中介和深度学习的计算框架，用于识别因果靶基因和可重定位小分子候选药物	首次将加权基因共表达网络分析、双向中介分析与深度学习相结合，建立表型驱动的药物发现新方法	仅基于103例特发性肺纤维化患者数据，样本规模有限	开发用于药物发现的计算框架，识别疾病相关因果基因和候选治疗化合物	特发性肺纤维化患者的转录组数据和化合物筛选	生物信息学	特发性肺纤维化	RNA-seq、加权基因共表达网络分析、双向中介分析、深度学习	DeepCE	转录组数据	103名IPF患者和103名对照的RNA-seq数据
224	2025-09-28	3D localization of retrovirus assembly in the presence of structured background with deep learning 2025-Aug-29, Biophysical journal IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.bpj.2025.08.028 PMID:40883991	研究论文	提出结合双螺旋点扩散函数和深度学习的方法，实现活细胞顶部质膜HIV-1病毒颗粒组装的3D定位成像	首次将双螺旋点扩散函数3D成像与深度学习管道结合，解决顶部质膜病毒组装成像中结构化背景干扰的挑战	未明确说明方法在其他病毒体系或细胞类型的普适性	开发活细胞顶部质膜病毒组装过程的3D定位成像分析方法	人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）Gag蛋白在贴壁细胞顶部质膜的组装过程	计算显微镜	艾滋病	双螺旋点扩散函数3D成像、深度学习图像分析、荧光显微镜	深度学习管道	3D荧光显微镜图像	NA
225	2025-09-28	AI in Dentistry: Innovations, Ethical Considerations, and Integration Barriers 2025-Aug-29, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12090928 PMID:41007172	综述	本文综述了人工智能在牙科领域的应用现状、技术创新及整合障碍	系统评估了联邦学习架构在牙科诊所协同训练中的跨站点一致性（准确率超90%），并探讨了可解释AI对透明度提升的作用	未涉及具体临床验证数据，主要基于文献综述的分析	分析AI在牙科医学中的技术应用、伦理考量与整合挑战	牙科诊疗流程中的影像诊断、预测分析和自动化管理	机器学习	口腔疾病	深度学习、联邦学习、可解释AI	U-Net、TensorFlow	医学影像（CBCT扫描、口内照片、X光片）	NA
226	2025-09-28	PRIME 2.0: Proposed Requirements for Cardiovascular Imaging-Related Multimodal-AI Evaluation: An Updated Checklist 2025-Aug-27, JACC. Cardiovascular imaging DOI:10.1016/j.jcmg.2025.08.004 PMID:40892627	指南更新	介绍心血管影像AI评估标准PRIME 2.0检查清单的更新内容	针对深度学习、大语言模型和多模态生成AI等新技术发展，在原7领域框架基础上增加了心血管影像特异性考量	NA	为心血管影像AI应用的开发、评估和报告提供标准化框架	心血管影像AI研究	医学影像分析	心血管疾病	改良德尔菲法	多模态AI/大语言模型/生成式AI	医学影像数据	国际临床和技术专家小组
227	2025-09-28	Development of Privacy-preserving Deep Learning Model with Homomorphic Encryption: A Technical Feasibility Study in Kidney CT Imaging 2025-08-27, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240798 PMID:40862694	研究论文	本研究开发了一种基于同态加密的隐私保护深度学习模型，用于肾脏CT图像的分类分析	首次将全同态加密技术应用于肾脏CT图像的深度学习分析，实现了端到端的隐私保护	加密显著增加了存储和计算需求，CPU推理时间长达50分钟	评估同态加密在深度学习模型中实现隐私保护CT图像分析的技术可行性	肾脏CT图像（包括肾囊肿、正常肾脏和肾脏肿瘤）	医学影像分析	肾脏疾病	同态加密技术（CKKS加密方案）	CNN（基于ResNet架构）	CT图像	12,446张CT图像（3,709张肾囊肿、5,077张正常肾脏、2,283张肾脏肿瘤）
228	2025-09-28	The Expanding Frontier: The Role of Artificial Intelligence in Pediatric Neuroradiology 2025-Aug-27, Children (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/children12091127 PMID:41006992	综述	本文探讨人工智能在儿科神经放射学领域的应用现状、挑战及未来发展前景	系统阐述AI在儿科神经放射学这一新兴前沿领域的独特价值，特别关注儿童大脑发育特性与AI技术的结合点	面临儿科数据稀缺、伦理法律限制以及AI模型可解释性等挑战	分析AI在儿科神经放射学的应用潜力、当前挑战和未来发展方向	儿科患者（特别是新生儿和幼儿）的神经影像数据	医学影像分析	儿科神经系统疾病（如药物抵抗性癫痫）	深度学习算法、压缩感知、欠采样技术、联邦学习	深度学习算法（如图形算法MELD）	医学影像数据（MRI、CT扫描）	NA
229	2025-09-28	HQRNN-FD: A Hybrid Quantum Recurrent Neural Network for Fraud Detection 2025-Aug-27, Entropy (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/e27090906 PMID:41008033	研究论文	提出一种用于欺诈检测的混合量子循环神经网络模型	首次将变分量子电路与循环神经网络结合，采用角度编码、数据重上传和分层纠缠技术实现量子增强的特征提取	NA	提升金融欺诈检测的预测精度和处理高维非线性特征的能力	金融交易数据	机器学习	NA	变分量子电路(VQC)、SMOTE过采样技术	混合量子循环神经网络(HQRNN-FD)、RNN、自注意力机制	序列交易数据	公开可用的欺诈检测数据集
230	2025-09-28	Deep Learning Method Based on Multivariate Variational Mode Decomposition for Classification of Epileptic Signals 2025-Aug-27, Brain sciences IF:2.7Q3 DOI:10.3390/brainsci15090933 PMID:41008293	研究论文	提出一种结合多元变分模态分解的深度学习框架，用于癫痫信号的分类和癫痫灶定位	首次将多元变分模态分解与深度学习结合，通过保持通道间模态对齐有效解决模态混叠和失配问题	NA	提高癫痫信号分类精度，为临床诊断提供更准确的癫痫灶定位信息	多通道癫痫脑电信号	机器学习	癫痫	多元变分模态分解	深度学习框架	脑电信号	Bern-Barcelona数据库和TUSZ数据库（具体样本数未明确说明）
231	2025-09-28	Deep Learning-Powered Down Syndrome Detection Using Facial Images 2025-Aug-27, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15091361 PMID:41010303	研究论文	开发并验证了一种基于面部图像的唐氏综合征早期检测深度学习模型	提出结合RegNet X-MobileNet V3和ViT-Linformer的混合特征提取架构，采用自适应注意力特征融合机制	NA	开发非侵入性、公平的唐氏综合征筛查工具	婴儿面部图像	计算机视觉	唐氏综合征	深度学习	RegNet X-MobileNet V3, ViT-Linformer, ExtraTrees	图像	NA
232	2025-09-28	Deep Learning Algorithm to Determine the Presence of Rectal Cancer from Transrectal Ultrasound Images 2025-Aug-27, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15091358 PMID:41010300	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习算法的CNN模型，用于通过经直肠超声图像自动识别直肠癌	首次将EfficientNetV2-S架构应用于经直肠超声图像的直肠癌自动检测，为临床提供决策支持工具	研究为回顾性设计，样本量有限，模型泛化能力需进一步验证，且未实现癌症分期分类	开发并评估用于直肠癌检测的深度学习模型	经直肠超声图像（直肠癌病例和正常直肠组织）	计算机视觉	直肠癌	深度学习	CNN（EfficientNetV2-S架构）	医学图像	681张经直肠超声图像（533张直肠癌，148张正常直肠）
233	2025-09-28	The Path Towards Effective Long-Lasting Tissue-Targeted Prime/Pull/Keep Herpes Simplex Therapeutic Vaccines 2025-Aug-27, Vaccines IF:5.2Q1 DOI:10.3390/vaccines13090908 PMID:41012114	综述	本文探讨了针对单纯疱疹病毒（HSV）的有效长效组织靶向Prime/Pull/Keep治疗性疫苗的开发路径	提出结合组学、人工智能和深度学习技术设计组织靶向疫苗新策略，通过Prime/Pull/Keep三步骤在感染中枢和外周组织诱导持久T细胞免疫	目前研究仍处于临床前动物模型试验阶段，尚未进行人体临床试验	开发针对HSV-1和HSV-2的有效长效治疗性疫苗	单纯疱疹病毒类型1和2（HSV-1/HSV-2）	疫苗研发	疱疹病毒感染	组学技术、人工智能、深度学习	NA	NA	临床前动物模型试验
234	2025-09-28	Real-Time Global Longitudinal Strain During Echocardiography: A Deep Learning Platform for Improved Workflow 2025-Aug-26, Journal of the American Society of Echocardiography : official publication of the American Society of Echocardiography IF:5.4Q1 DOI:10.1016/j.echo.2025.08.015 PMID:40876495	研究论文	开发用于超声心动图实时全自动全局纵向应变分析的深度学习平台	首次实现实时GLS分析的完全自动化深度学习平台，集成标准化工具并显著提升工作流程效率	样本量较小（50例患者），需更大规模研究验证	评估深度学习辅助实时GLS测量的可行性、精确性和时间效率	50名接受超声心动图检查的患者（平均年龄56岁，64%男性）	医学影像分析	心血管疾病	超声心动图，深度学习	深度学习平台	医学影像	50例患者
235	2025-09-28	Diagnosis of Periodontitis via Neutrophil Degranulation Signatures Identified by Integrated scRNA-Seq and Deep Learning 2025-Aug-26, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes16091005 PMID:41009952	研究论文	本研究结合单细胞转录组学与深度学习技术，通过识别中性粒细胞脱颗粒特征建立牙周炎诊断模型	首次整合scRNA-seq、hdWGCNA和CNN模型系统解析中性粒细胞脱颗粒在牙周炎中的作用机制	NA	开发基于中性粒细胞脱颗粒特征的牙周炎早期诊断和精准干预模型	人牙龈组织样本及其单细胞转录组数据	数字病理	牙周炎	scRNA-seq, hdWGCNA, 伪时间轨迹分析, 细胞通讯分析	CNN, 机器学习	基因表达数据, 免疫细胞谱数据	多队列人牙龈组织scRNA-seq和批量转录组数据集
236	2025-09-28	Artificial Intelligence in Small-Molecule Drug Discovery: A Critical Review of Methods, Applications, and Real-World Outcomes 2025-Aug-26, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/ph18091271 PMID:41011141	综述	本文批判性回顾了人工智能在小分子药物发现中的方法、应用及实际成果	系统评估AI从早期规则系统到生成模型、扩散模型及自主智能体系统的演进，并首次平衡展示成功与失败案例	存在数据质量、模型可解释性、监管障碍和伦理问题等持续挑战	评估AI作为辅助工具在小分子药物发现中的实际价值与局限性	AI驱动的药物研发案例（如巴瑞替尼、halicin等）及相关技术方法	机器学习	NA	深度学习、生成模型、扩散模型、自主智能体AI系统	生成模型、扩散模型	多模态药物研发数据	涉及多个临床阶段药物案例（包括I期至IIa期）
237	2025-09-28	Comprehensive Survey of OCT-Based Disorders Diagnosis: From Feature Extraction Methods to Robust Security Frameworks 2025-Aug-25, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12090914 PMID:41007159	综述	本文系统综述了基于光学相干断层扫描的眼部疾病诊断技术，涵盖传统特征提取和深度学习方法，并首次探讨了诊断系统的对抗攻击及防御策略	首次对OCT诊断方法进行20年研究的系统比较分析，并创新性地研究针对OCT诊断系统的对抗攻击漏洞及提出实用防御方案	NA	评估OCT眼部疾病诊断技术的性能差异并提出安全防御框架	青光眼、糖尿病视网膜病变、白内障、弱视和黄斑变性等视网膜疾病	数字病理	眼科疾病	光学相干断层扫描	传统特征提取方法和深度学习模型	医学影像	基于公共OCT数据集（未指定具体数量）
238	2025-09-28	ERLD-HC: Entropy-Regularized Latent Diffusion for Harmony-Constrained Symbolic Music Generation 2025-Aug-25, Entropy (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/e27090901 PMID:41008027	研究论文	提出一种结合变分自编码器和隐空间扩散模型的符号音乐生成框架，通过熵正则化条件随机场实现和声约束	首次在隐空间扩散模型中引入熵正则化CRF模块，通过可学习的特征函数学习经典和声规则，实现算法驱动与规则约束的平衡	尚未提供直接的外部弦条件控制功能	解决符号音乐生成中违反音乐规则的问题，特别是提升和声结构的控制能力	符号音乐数据（MIDI格式）	自然语言处理	NA	变分自编码器(VAE)、隐空间扩散模型、条件随机场(CRF)、UNet架构	VAE+Diffusion+CRF混合模型	符号音乐数据（MIDI）	Lakh MIDI数据集
239	2025-09-28	Evolving Public Attitudes Towards the HPV Vaccine in China: A Fine-Grained Emotion Analysis of Sina Weibo (2016 vs. 2024) 2025-Aug-22, Entropy (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/e27090887 PMID:41008013	研究论文	通过深度学习模型分析中国微博平台2016-2024年HPV疫苗相关推文的情感演变	首次采用细粒度情感分析结合结构熵方法揭示HPV疫苗话题的情感传播网络动态	仅基于单一社交媒体平台数据，可能无法完全代表整体公众态度	探究中国公众对HPV疫苗态度的演变规律及情感传播机制	新浪微博平台2016-2024年发布的38,615条HPV疫苗相关推文	自然语言处理	宫颈癌	深度学习情感分析、结构熵分析	深度学习模型	社交媒体文本	38,615条微博推文
240	2025-09-28	Characterizing the Impact of Training Data on Generalizability: Application in Deep Learning to Estimate Lung Nodule Malignancy Risk 2025-08-20, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240636 PMID:40833260	研究论文	本研究探讨训练数据量对深度学习算法评估肺结节恶性风险性能的影响	首次系统性地量化训练数据规模与AI算法泛化能力的关系，并确定达到临床医生水平性能所需的最小数据量	回顾性研究，数据来源于特定临床试验人群，可能影响泛化性	研究训练数据量对肺结节恶性风险预测AI算法性能的影响	低剂量CT扫描检测到的肺结节	数字病理	肺癌	深度学习	深度学习AI算法	CT图像	NLST数据集16077个标注结节（1249恶性，14828良性），DLCST测试集883个结节（65恶性，818良性）