深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
221	2025-09-20	Application of artificial intelligence in microbial drug discovery: Unlocking new frontiers in biotechnology 2025-Oct, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4 DOI:10.1016/j.mimet.2025.107232 PMID:40846079	综述	本文综述了人工智能在微生物药物发现中的应用及其对生物技术领域的推动作用	整合生成对抗网络、强化学习和自然语言处理等AI技术，实现从分子设计到临床加速的全流程创新	数据质量不一致、模型可解释性有限以及伦理法律问题尚未解决	利用人工智能技术加速抗微生物药物的发现与开发	细菌、真菌和病毒病原体相关的药物发现	计算生物学	传染病	深度学习、机器学习、大数据分析、NLP	GAN、强化学习模型	生物医学大数据、文献文本	NA
222	2025-09-20	Deep learning-based feature discovery for decoding phenotypic plasticity in pediatric high-grade gliomas single-cell transcriptomics 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110971 PMID:40848317	研究论文	利用基于深度学习和图机器学习的方法，从儿童高级别胶质瘤单细胞转录组数据中识别表型可塑性的关键调控特征	通过复杂网络动态和基于图的机器学习，揭示了IDHWT胶质母细胞瘤和K27M突变型中线胶质瘤中亚型特异性可塑性的关键决定因素，并发现跨子系统的过渡基因和中枢基因	NA	解码儿童高级别胶质瘤（pHGGs）中的表型可塑性机制	儿童高级别胶质瘤（pHGGs）的单细胞转录组数据，包括IDHWT胶质母细胞瘤和K27M突变型中线胶质瘤亚型	生物信息学	儿童高级别胶质瘤	单细胞转录组测序，基于图的机器学习	深度学习，图机器学习	单细胞转录组数据	NA
223	2025-09-20	Deep learning ensemble for abdominal aortic calcification scoring from lumbar spine X-ray and DXA images 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110961 PMID:40848321	研究论文	提出一种基于深度学习集成模型的方法，用于从腰椎X射线和DXA图像中自动量化腹主动脉钙化评分	将AAC评分视为正态分布随机变量以考虑人工评分变异性，并采用集成CNN模型预测可能的AAC评分分布	NA	开发自动化AAC评分方法以识别心血管疾病高风险个体	腹主动脉钙化（AAC）	计算机视觉	心血管疾病	深度学习，卷积神经网络	CNN集成模型	X射线图像，DXA图像	NA
224	2025-09-20	OpenSpindleNet: An open-source deep learning network for reliable sleep spindle detection in scalp and intracranial EEG 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110854 PMID:40857816	研究论文	介绍一种名为OpenSpindleNet的开源深度学习网络，用于在头皮和颅内脑电图中可靠检测睡眠纺锤波	采用双头架构的新型自动检测方法，在性能和鲁棒性上优于现有方法如SUMO、A7和YASA	NA	开发精确自动的睡眠纺锤波检测方法，以促进对睡眠状态生理学和脑健康的研究	头皮脑电图(EEG)和颅内脑电图(iEEG)数据	机器学习	神经系统疾病	深度学习	双头架构神经网络	脑电图信号	在iEEG数据集和公开的DREAMS头皮EEG数据集上进行测试
225	2025-09-20	Squat errors classification based on National Academy of Sports Medicine guidelines using IMU and deep learning algorithms 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110962 PMID:40857817	研究论文	基于NASM指南，利用IMU和深度学习算法对深蹲错误进行分类	结合多种混合深度学习架构（如CNN-GRU）并探索单IMU传感器的最优放置策略，实现高精度自动化分类	样本量较小（20名运动员），未提及模型泛化能力到更广泛人群的验证	开发自动化深蹲错误分类方法以替代主观视觉评估	运动员的深蹲动作（包括正确和四种错误形式）	运动科学	NA	惯性测量单元（IMU）数据采集	CNN, GRU, TabNet及混合架构（如CNN-GRU, CNN-TabNet）	运动学传感器数据	20名运动员（10男10女），每人完成5种深蹲变式
226	2025-09-20	Polyp segmentation in colonoscopy images using DeepLabV3+ 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110986 PMID:40876416	研究论文	本研究提出了一种基于DeepLabV3+改进的DeepLabV3++模型，用于提高结肠镜图像中息肉分割的精度和鲁棒性	在编码器中采用EfficientNetV2S减少可训练参数，并集成了多尺度金字塔池化(MSPP)和并行注意力聚合模块(PAAB)，重新设计了解码器结构	仅在三个公开数据集上进行验证，未提及临床实际应用环境的测试结果	提升结肠镜图像中息肉分割的准确性和鲁棒性，辅助结直肠癌的早期识别与诊断	结肠镜图像中的息肉区域	计算机视觉	结直肠癌	深度学习图像分割	DeepLabV3++, EfficientNetV2S	图像	三个公开数据集(CVC-ColonDB, CVC-ClinicDB, Kvasir-SEG)
227	2025-09-20	LUNAR: Periodicity-aware time-series analysis framework for LUNg Auscultation Respiratory detection 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110947 PMID:40876419	研究论文	提出一种周期性感知的深度学习框架LUNAR，用于自动检测肺听诊信号中的呼吸周期	集成新型呼吸周期性感知模块(RPAM)与CNN，显式建模呼吸周期的重复特性，无需依赖专家手动标注	NA	开发自动化呼吸周期检测方法以辅助呼吸系统疾病诊断	肺听诊信号	数字病理	呼吸系统疾病（哮喘、COPD、肺炎）	深度学习	CNN	时间序列信号	训练集279例，验证集ICBHI 126例和SNUCH_Lung 203例
228	2025-09-20	Advancements in biomedical rendering: A survey on AI-based denoising techniques 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110979 PMID:40882480	综述	本文调查了基于AI的去噪技术在生物医学渲染中的应用，并通过专业医护人员问卷分析其主观评价与定量指标的不一致性	通过专业医护人员的主观评价调查，揭示AI去噪技术在CT图像渲染中定量指标与主观感知之间的差异	样本量相对较小（74人），且依赖作者专业网络进行抽样，可能存在选择偏差	探究深度学习去噪技术在CT体积可视化中的主观评价与定量结果不一致的原因	放射科医师、住院医师、骨科外科医生和兽医等医疗专业人员	计算机视觉	NA	蒙特卡洛路径追踪，AI去噪	深度学习	CT图像，视频	74名医疗专业人员（经验<1年11人，1-3年27人，3-5年12人，>5年24人）
229	2025-09-20	Designing Buchwald-Hartwig Reaction Graph for Yield Prediction 2025-Sep-19, The Journal of organic chemistry IF:3.3Q1 DOI:10.1021/acs.joc.5c01400 PMID:40929732	研究论文	设计了一种用于Buchwald-Hartwig反应产率预测的新型反应图表示方法	提出Buchwald-Hartwig反应图，通过将每个反应物表示为图中的独立节点来模拟多组分相互作用，同时捕获单分子和分子间关系特征	NA	开发基于图神经网络的化学反应产率预测模型	Buchwald-Hartwig反应体系	机器学习	NA	图神经网络(GNN)	BH-RGNN (B-H Reaction Graph Neural Network)	化学反应数据	高通量B-H反应数据集
230	2025-09-20	PWLS-SOM: alternative PWLS reconstruction for limited-view CT by strategic optimization of a deep learning model 2025-Sep-19, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adffe0 PMID:40865562	研究论文	提出一种结合深度学习先验与数据一致性的新型有限视角CT重建方法PWLS-SOM	引入显著性评分机制量化模型参数贡献，并采用三阶段策略优化实现DL先验与PWLS自适应的融合	NA	改善有限视角CT中的条纹伪影抑制与鲁棒重建	CT投影数据	医学影像重建	NA	惩罚加权最小二乘(PWLS)重建、深度学习	深度学习网络	CT投影数据	大规模配对数据集（具体数量未说明）及死亡大鼠真实实验
231	2025-09-20	Full-Spectrum phototherapy in hair loss management: a systematic review of wavelength-dependent mechanisms, clinical efficacy, and future directions 2025-Sep-19, Lasers in medical science IF:2.1Q2 DOI:10.1007/s10103-025-04616-3 PMID:40968340	综述	本文系统综述了全光谱光疗在脱发管理中的波长依赖性机制、临床疗效及未来发展方向	提出新型'波长-穿透深度-靶向机制'模型，阐明全光谱光疗对毛囊再生的多层次调控作用	存在治疗窗口窄、患者反应差异大和组织穿透有限等未解决挑战	探讨光疗作为精准无创治疗方式在脱发管理中的应用潜力	脱发患者（包括斑秃和雄激素性脱发）的毛囊再生机制	医学光疗	脱发疾病	全光谱光疗（紫外到中红外波长）	NA	临床研究数据	NA
232	2025-09-20	Research progress and future prospects in intelligent lung sound diagnosis: models, lightweight design, and hardware platform implementation 2025-Sep-19, Biomedizinische Technik. Biomedical engineering DOI:10.1515/bmt-2025-0197 PMID:40968576	综述	本文系统回顾了基于深度学习的肺音智能识别技术，重点关注模型构建、轻量化设计及硬件平台部署的最新进展	深入探讨了肺音识别模型在嵌入式系统和FPGA等硬件平台的部署路径，特别是软硬件协同设计在边缘计算中的应用前景	NA	推动肺音智能识别技术在医疗辅助诊断领域的发展，实现低延迟本地推理	肺音信号	数字病理	呼吸系统疾病	深度学习	深度学习模型	音频信号	NA
233	2025-09-20	Cross-Modal Interaction-Aware Progressive Fusion Network for Drug-Target Interaction Prediction 2025-Sep-19, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01429 PMID:40970765	研究论文	提出一种用于药物-靶点相互作用预测的跨模态交互感知渐进融合网络（CIPFN）	引入双向交互感知模块精确对齐药物与蛋白质间的细粒度交互，并开发包含门控和卷积融合块的渐进融合网络	NA	改进药物-靶点相互作用（DTI）预测的准确性和效率	药物和蛋白质之间的相互作用	机器学习	NA	深度学习	CIPFN（包含门控和卷积融合块的融合网络）	跨模态数据（药物和蛋白质的交互信息）	五个基准数据集
234	2025-09-20	PPAP: A Protein-protein Affinity Predictor Incorporating Interfacial Contact-Aware Attention 2025-Sep-19, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01390 PMID:40970903	研究论文	提出一种结合界面接触感知注意力的蛋白质-蛋白质亲和力预测模型PPAP	整合结构特征与序列表示，通过界面接触感知注意力机制充分利用相互作用界面的结构信息	NA	准确预测蛋白质-蛋白质相互作用结合亲和力，以理解相互作用机制并指导蛋白质工程	蛋白质-蛋白质复合物	生物信息学	NA	深度学习	注意力机制神经网络	蛋白质序列和结构数据	未明确说明具体样本数量，但包含内部和外部测试集
235	2025-09-20	Deep learning-based acceleration and denoising of 0.55T MRI for enhanced conspicuity of vestibular Schwannoma post contrast administration 2025-Sep-19, Neuroradiology IF:2.4Q2 DOI:10.1007/s00234-025-03758-z PMID:40970959	研究论文	本研究评估基于深度学习的去噪算法在0.55T MRI中提升前庭神经鞘瘤对比度并缩短扫描时间的效果	首次在0.55T MRI中应用DL去噪技术，实现在保持图像质量的同时将扫描时间缩短超过一半	回顾性研究，样本量较小（30例患者），且仅针对前庭神经鞘瘤一种疾病	评估深度学习去噪技术对低场强MRI图像质量和扫描时间的改善效果	前庭神经鞘瘤患者	医学影像分析	前庭神经鞘瘤	MRI成像，深度学习去噪算法	深度学习（具体架构未说明）	医学影像	30例前庭神经鞘瘤患者（9名女性）
236	2025-09-20	Intelligent sports rehabilitation: integrating deep learning and real-time monitoring to achieve personalized rehabilitation 2025-Sep-19, Disability and rehabilitation. Assistive technology DOI:10.1080/17483107.2025.2559187 PMID:40970943	研究论文	本研究探讨将太极拳融入强制性药物康复计划对运动员的心理益处	结合太极拳这一传统文化运动与现代康复理念，验证其在心理康复中的有效性	样本量有限（172人），且仅针对特定运动员群体，结果普适性有待进一步验证	评估太极拳对运动员药物康复期间心理健康的改善效果	参与强制性药物康复计划的运动员	运动康复	药物成瘾	随机对照试验	NA	心理评估数据	172名参与者，平均分为太极拳干预组和对照组
237	2025-09-20	Deep Learning Models for Predicting Human Cytochrome P450 Inhibition and Induction 2025-Sep-18, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01192 PMID:40966069	研究论文	本研究开发了基于深度学习的模型，用于预测人类细胞色素P450酶的抑制和诱导作用	整合深度神经网络与PCA和SMOTE技术，开发了新型分类模型并能识别结构警报，还首次提出了专门预测hPXR激活的深度学习方法	NA	提高药物开发和安全评估中CYP酶抑制和诱导作用的预测效率	人类细胞色素P450酶（CYP3A4、CYP2D6、CYP1A2、CYP2C9、CYP2C19）及相关化合物	机器学习	NA	深度神经网络、主成分分析(PCA)、合成少数类过采样技术(SMOTE)	深度学习模型	化合物结构数据	NA
238	2025-09-20	Revisiting Protein-Protein Docking: A Systematic Evaluation Framework 2025-Sep-18, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01399 PMID:40966105	研究论文	提出一个用于系统评估蛋白质-蛋白质对接方法的综合基准框架	建立了统一的基准测试框架，包含经典数据集、新构建的抗体-抗原复合物数据集以及用于评估分布外泛化能力的数据集	深度学习模型在分布外泛化测试中表现显著下降	评估蛋白质-蛋白质对接方法的性能并比较传统与深度学习方法的优劣	11种蛋白质-蛋白质对接方法	计算生物学	NA	蛋白质-蛋白质对接	传统方法(HDOCK, PatchDock等)和深度学习方法(EquiDock, AlphaFold系列等)	蛋白质结构数据	使用DockingBenchmark 5.5数据集、AACBench抗体-抗原数据集和PPCBench数据集
239	2025-09-20	FourierMask: Explain EEG-based End-to-end Deep Learning Models in the Frequency Domain 2025-Sep-18, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3610742 PMID:40966133	研究论文	提出FourierMask框架，用于从频域角度解释基于EEG的端到端深度学习模型	首个专门为EEG模型频域解释设计的掩码扰动框架，包含傅里叶域变换、可学习掩码机制和集群感知正则化三项创新	NA	增强基于EEG的端到端深度学习模型的可解释性	脑电图（EEG）信号	机器学习	NA	傅里叶变换，深度学习	EEGNet, TSCeption, DeepConvNet	时间序列EEG信号	EEG基准数据集（具体数量未说明）
240	2025-09-20	Multi-source Discriminant Dynamic Domain Adaptation for Cross-subject Motor Imagery EEG Recognition 2025-Sep-18, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3610446 PMID:40966137	研究论文	提出一种多源判别动态域自适应模型（MSD-DDA），用于提升跨被试运动想象脑电信号的分类精度	动态最小化全局域与局部子域差异，引入批量核范数最大化保证目标域判别性，设计加权联合预测机制自适应调整多源域贡献	NA	通过域自适应技术解决跨被试脑电信号分类的泛化问题	运动想象（MI）脑电信号（EEG）	脑机接口	NA	域自适应（Domain Adaptation）	MSD-DDA（多源判别动态域自适应模型）	脑电信号（EEG）	基于BCI Competition IV数据集1和2a及openBMI数据集进行实验