深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
2481	2025-11-28	Magnetic resonance image processing transformer for general accelerated image restoration 2025-Nov-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-23851-w PMID:41249204	研究论文	提出基于Vision Transformer的磁共振图像处理框架MR-IPT，用于加速MRI图像恢复	首次将Vision Transformer架构应用于加速MRI图像恢复，通过在大规模多加速因子数据集上预训练实现统一框架，无需为不同加速因子单独训练模型	未明确说明模型在极端加速条件下的性能表现，也未讨论计算复杂度与推理时间	开发通用的加速磁共振图像恢复框架，提高模型的泛化能力和鲁棒性	加速采样的磁共振图像	计算机视觉	NA	磁共振成像	Transformer	图像	大规模数据集（具体数量未说明）	NA	Vision Transformer	图像质量指标（具体指标未明确说明）	NA
2482	2025-11-28	Translating Features to Findings: Deep Learning for Melanoma Subtype Prediction 2025-Nov-12, Dermatopathology (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/dermatopathology12040042 PMID:41283484	综述	本文探讨深度学习在黑色素瘤亚型预测中的应用现状与前景	系统梳理深度学习在皮肤病理学中的核心方法学，并提出多模态整合、合成数据生成等新兴方向作为解决方案	存在数据集不平衡、模型可解释性不足和领域泛化能力有限等问题	提升黑色素瘤亚型诊断的精确度和可重复性	组织病理学切片中的黑色素瘤亚型	数字病理学	黑色素瘤	组织病理学分析	CNN	图像	NA	NA	NA	NA	NA
2483	2025-11-28	Deep learning framework for bronchoscopic diagnosis of burn inhalation injury 2025-Nov-08, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.burns.2025.107770 PMID:41297238	研究论文	本研究开发了一种基于视觉Transformer的深度学习框架，用于支气管镜诊断烧伤吸入性损伤的自动分级	首次将预训练的视觉Transformer模型应用于烧伤吸入性损伤的支气管镜图像自动分级，相比传统人工评分系统和其他深度学习模型表现出更优性能	样本量较小（仅36名患者），单中心研究，需要更大规模的多中心验证	开发自动化的支气管镜分级系统以提高烧伤吸入性损伤诊断的准确性和可靠性	烧伤吸入性损伤患者的支气管镜图像	计算机视觉	烧伤吸入性损伤	支气管镜检查	Vision Transformer (ViT)	图像	36名患者的1089张质量控制的支气管镜图像帧	NA	Vision Transformer (ViT)	准确率, 精确率, F1分数, 召回率	NA
2484	2025-11-28	Comparative Analysis of Transformer Architectures and Ensemble Methods for Automated Glaucoma Screening in Fundus Images from Portable Ophthalmoscopes 2025-Nov-03, Vision (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/vision9040093 PMID:41283577	研究论文	本研究比较多种Transformer架构和集成方法在便携式眼底镜图像中自动筛查青光眼的性能	首次系统评估Transformer集成方法在低质量便携设备图像上的青光眼检测性能，通过患者级聚合显著提升准确度	研究主要基于特定数据集，在更广泛设备类型和人群中的泛化能力仍需验证	开发适用于便携设备的鲁棒青光眼自动筛查方法	眼底图像	计算机视觉	青光眼	深度学习	Transformer	图像	Brazil Glaucoma数据集和私有D-Eye数据集	NA	Swin-Tiny, ViT-Base, MobileViT-Small, DeiT-Base	准确率, F1分数, 敏感度	NA
2485	2025-11-28	Comparing Handcrafted Radiomics Versus Latent Deep Learning Features of Admission Head CT for Hemorrhagic Stroke Outcome Prediction 2025-Nov-02, Biotech (Basel (Switzerland)) DOI:10.3390/biotech14040087 PMID:41283322	研究论文	比较手工放射组学与潜在深度学习特征在入院头部CT中对出血性卒中结局预测的性能	首次系统比较手工放射组学与从分割编码器和生成自编码器提取的潜在深度学习特征在出血性卒中预后预测中的表现	预测性能提升仅在>3 mL血肿扩张阈值达到统计显著性，改进幅度有限	预测急性脑出血患者的3个月临床结局和血肿扩张	急性脑出血患者的入院非增强头部CT图像	医学影像分析	脑出血	CT影像分析	U-Net, 自编码器	医学影像	训练集866例（多中心试验队列），外部验证集645例（单中心数据集）	NA	多尺度U型分割网络, 生成自编码器	准确率, 统计显著性	NA
2486	2025-11-28	Artificial intelligence-based metal artefact correction algorithm for radiotherapy patients with dental hardware in head and neck CT: towards precise imaging 2025-Nov-01, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twaf038 PMID:40366748	研究论文	本研究评估基于人工智能的金属伪影校正算法在头颈部CT中对牙科金属植入物患者图像质量的改善效果	首次在体内研究中证明基于深度学习的AI-MAC算法在金属伪影校正方面优于传统插值法MAC	回顾性研究设计，样本量较小（41例患者），仅针对头颈部放疗患者	评估AI-MAC算法在头颈部CT中减少牙科金属伪影的临床效能	41例带有不可移除牙科金属植入物并接受头颈部CT扫描的放疗患者	医学影像处理	头颈部肿瘤	CT扫描，深度学习	深度学习模型	CT图像	41例患者	NA	NA	信噪比，伪影指数，Dice相似系数，Hausdorff距离	NA
2487	2025-11-28	Development of an Open-Source Algorithm for Automated Segmentation in Clinician-Led Paranasal Sinus Radiologic Research 2025-Nov, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.32292 PMID:40421828	研究论文	开发并验证用于鼻窦CT自动分割的开源算法	提供首个专门针对鼻窦腔的公开可用的深度学习分割算法	样本量相对较小（100个扫描），需要进一步验证	为耳鼻喉科研究社区开发开源分割算法	鼻窦CT扫描	数字病理	鼻窦疾病	CT扫描	深度学习	医学影像	100个鼻窦扫描，7300个切片	NA	UNet++	Dice相似系数, IoU, Hausdorff距离, 敏感度, 特异度, 视觉相似度评分	NA
2488	2025-11-28	Automated Detection and Grading of Renal Cell Carcinoma in Histopathological Images via Efficient Attention Transformer Network 2025-Nov-01, Medical sciences (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/medsci13040257 PMID:41283258	研究论文	提出EAT-Net双流深度学习模型，用于自动检测和分级肾细胞癌组织病理学图像	结合EfficientNet局部特征提取和Vision Transformer全局上下文依赖捕获，集成SE模块重新校准特征图	NA	自动化肾细胞癌组织病理学分级	肾细胞癌组织病理学图像	数字病理学	肾细胞癌	组织病理学成像	CNN, Transformer	图像	两个公开数据集KMC-RENAL和RCCG-Net	NA	EfficientNetB0, Vision Transformer, Squeeze-and-Excitation	准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
2489	2025-11-28	Development of a PANoptosis-Related Pathomics Prognostic Model in Ovarian Cancer: A Multi-Omics Study 2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70958 PMID:41284376	研究论文	本研究开发了一种基于PANoptosis相关病理组学的卵巢癌预后深度学习模型	首次探索PANoptosis在卵巢癌预后中的作用，并开发了结合多组学数据的病理组学预后模型	研究基于公开数据库数据，需要进一步实验验证	阐明PANoptosis在卵巢癌预后中的作用并开发预后模型	卵巢癌患者	数字病理	卵巢癌	scRNA-seq, 空间转录组, 病理图像分析	深度学习	基因表达数据, 空间数据, 病理图像	TCGA、GTEx和GEO数据库的卵巢癌数据	NA	ResNet-50	预后预测准确性	NA
2490	2025-11-28	Few-shot learning for the classification of colorectal neuroendocrine tumors and polyps on endoscopic images 2025-Nov, The Journal of international medical research IF:1.4Q4 DOI:10.1177/03000605251395564 PMID:41285115	研究论文	提出一种基于小样本学习的结直肠神经内分泌肿瘤和息肉内镜图像分类方法	首次将小样本学习应用于结直肠神经内分泌肿瘤与息肉的分类，解决了罕见病数据稀缺问题	样本量相对有限（总计195张图像），且为回顾性研究	开发能够准确分类结直肠神经内分泌肿瘤和息肉的计算机辅助诊断系统	结直肠神经内分泌肿瘤、锯齿状病变和息肉、传统腺瘤的内镜图像	计算机视觉	结直肠癌	内镜成像	小样本学习	图像	195张内镜图像（56张锯齿状病变和息肉，86张腺瘤，53张神经内分泌肿瘤）	TensorFlow, Keras	ResNet50 V2	AUC, F1-score, Matthews相关系数, Cohen's kappa, 准确率, 灵敏度, 精确率	NA
2491	2025-11-28	The value of low-energy images combined with deep learning image reconstruction to improve image quality, reduce radiation and contrast doses in dual-energy computed tomography (CT) portal venography in cirrhotic patients 2025-Oct-29, Clinical radiology IF:2.1Q2 DOI:10.1016/j.crad.2025.107139 PMID:41297158	研究论文	探讨低能量图像结合深度学习图像重建在肝硬化患者CT门静脉成像中改善图像质量、降低辐射和对比剂剂量的可行性	首次将双能CT低能量图像与深度学习图像重建技术结合应用于肝硬化患者门静脉成像，实现辐射剂量降低48%和对比剂剂量降低32%的同时提升图像质量	样本量较小(60例)，仅针对肝硬化患者，缺乏与其他重建方法的直接比较	改善肝硬化患者CT门静脉成像的图像质量并降低辐射和对比剂剂量	60例肝硬化患者	医学影像	肝硬化	双能CT，深度学习图像重建，CT门静脉成像	深度学习	CT图像	60例肝硬化患者随机分为两组	NA	DLIR-H(深度学习图像重建-高)	对比噪声比，信噪比，主观图像质量评分	NA
2492	2025-11-28	Recent Advances and Application of Machine Learning for Protein-Protein Interaction Prediction in Rice: Challenges and Future Perspectives 2025-Oct-27, Proteomes IF:4.0Q2 DOI:10.3390/proteomes13040054 PMID:41283644	综述	本文综述了机器学习在水稻蛋白质-蛋白质相互作用预测中的最新进展、应用及未来展望	重点关注蛋白质异构体对PPI动态和特异性的影响，并系统总结机器学习方法在水稻PPI预测中的算法创新、特征提取和计算资源发展	面临数据限制和模型泛化性等关键挑战	为研究人员提供使用机器学习生成水稻PPI网络预测性和机制性见解的路线图	水稻蛋白质-蛋白质相互作用	机器学习	植物胁迫响应	机器学习，多组学整合	深度学习，人工智能	蛋白质序列数据，相互作用数据	NA	NA	NA	NA	NA
2493	2025-11-28	Deep Learning-Based Motion-Compensated Reconstruction for Accelerating 4-Dimensional Magnetic Resonance Fingerprinting 2025-Oct-23, International journal of radiation oncology, biology, physics DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.10.001 PMID:41138788	研究论文	开发并验证基于深度学习的运动补偿4D磁共振指纹成像重建方法DeepMocor，用于加速传统4D-MRF重建	提出DeepMocor方法，通过运动场初始化和细化实现运动补偿的4D-MRF重建，相比传统方法实现24倍加速	研究样本量较小（19例肝细胞癌患者），需要进一步验证	加速4D磁共振指纹成像重建，提高临床治疗规划效率	肝细胞癌患者	医学影像分析	肝细胞癌	4D磁共振指纹成像，自由呼吸采集	深度学习	k空间数据，磁共振图像	19例肝细胞癌患者（平均年龄62岁，14名男性）	NA	DeepMocor（包含运动场初始化、运动场细化和最终重建三个阶段）	PSNR, SSIM, MAPE, CNR, AMD, PCC	3T磁共振成像扫描仪
2494	2025-11-28	Integrating deep learning and radiomics for preoperative glioma grading using multi-center MRI data 2025-Oct-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-20711-5 PMID:41120521	研究论文	提出融合深度学习和影像组学的双流框架，用于术前胶质瘤分级	首次将3D卷积神经网络与影像组学特征通过集成模型结合，并在多中心数据中验证其优越性能	回顾性研究设计，需要前瞻性验证	提高术前胶质瘤分级的准确性	经组织病理学确诊的胶质瘤患者	医学影像分析	胶质瘤	多参数MRI	CNN, 集成学习	医学影像	847例训练患者（来自5个神经外科中心）+213例外部队列验证	NA	3D CNN	AUC, 敏感性, 特异性	NA
2495	2025-11-28	Bio-inspired neutrosophic-enzyme intelligence framework for pediatric dental disease detection using multi-modal clinical data 2025-Oct-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21923-5 PMID:41107487	研究论文	开发了一种基于生物启发的神经模糊-酶智能框架，用于儿科牙科疾病的多模态临床数据检测	整合生物原理与不确定性量化的神经模糊深度学习框架，模仿唾液酶动力学的特征提取和蝾螈再生愈合预测机制	NA	提高儿科牙科疾病诊断的精确度和效率	儿科牙科疾病患者	数字病理	儿科牙科疾病	多模态临床数据整合	深度学习	临床检查、放射影像、遗传生物标志物、行为评估	18,432名3-17岁儿科患者，来自六个国际中心	NA	神经模糊深度学习	准确率、敏感性、特异性	NA
2496	2025-11-28	PARSEbp: Pairwise Agreement-based RNA Scoring with Emphasis on Base Pairings 2025-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.10.13.682106 PMID:41279467	研究论文	提出一种基于配对一致性的RNA评分方法PARSEbp，整合构象集合中的结构一致性和碱基配对一致性	结合3D层面的全局结构一致性和2D层面的碱基配对一致性，构建共识相似度矩阵计算结构精度得分	NA	开发高效的RNA三维结构评分方法	RNA三维结构	计算生物学	NA	RNA结构预测	多模型评分方法	RNA三维结构数据	CASP16 RNA靶标数据集	NA	共识相似度矩阵	多种互补评估指标	NA
2497	2025-11-28	The Evolution of Machine Learning and Its Applications in Orthopaedics: A Bibliometric Analysis 2025-Oct, Cureus DOI:10.7759/cureus.95296 PMID:41287693	文献计量分析	通过文献计量分析探讨机器学习在骨科领域的应用现状和发展趋势	首次对骨科领域机器学习应用的100篇高被引文献进行系统性文献计量分析	仅纳入英文文献且样本量有限，缺乏高质量证据支持的研究	分析机器学习在骨科领域的应用现状、方法学质量和研究趋势	Web of Science数据库中骨科机器学习应用的100篇高被引文献	机器学习	骨科疾病	文献计量分析	CNN,深度学习	文献数据	100篇高被引文献，总计10886次引用	NA	卷积神经网络	引用次数，证据等级	NA
2498	2025-11-28	Accuracy and Reliability of Artificial Intelligence in Surgical Decision-Making: A Literature Review 2025-Oct, Cureus DOI:10.7759/cureus.95337 PMID:41287740	文献综述	本文通过文献综述评估人工智能在手术决策中的准确性和可靠性	系统评估AI在不同外科专科中的性能表现，并首次综合比较实时引导技术的基准	仅采用叙述性综合方法，未进行数据验证或纳入研究质量评估，缺乏系统评价验证	评估AI在手术决策中的准确性和可靠性，识别数据与伦理问题，比较不同专科模型性能	28项来自不同地理和学科背景的外科AI应用研究	医疗人工智能	外科手术	机器学习，深度学习	CNN, GAN	手术相关数据	28项研究	NA	卷积神经网络，生成对抗网络	AUC, 准确率	NA
2499	2025-11-28	Deep Learning-Based Automatic Segmentation and Analysis of Mitochondrial Damage by Zika Virus and SARS-CoV-2 2025-Sep-19, Viruses DOI:10.3390/v17091272 PMID:41012699	研究论文	开发基于深度学习的自动分割和分析方法，用于识别寨卡病毒和SARS-CoV-2引起的线粒体损伤	首次将U-Net架构的卷积神经网络应用于病毒感染的线粒体超微结构自动分割和分析，实现免疫反应预测	未提及模型在其他病毒或细胞类型中的泛化能力验证	开发自动化工具分析病毒感染引起的线粒体形态变化	感染两种SARS-CoV-2变体和寨卡病毒的细胞线粒体	数字病理学	病毒感染	透射电子显微镜	CNN	图像	NA	NA	U-Net	准确率	NA
2500	2025-11-28	Nivolumab plus ipilimumab for potentially resectable hepatocellular carcinoma: Long-term efficacy and biomarker exploration 2025-Sep-17, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.035 PMID:40972843	研究论文	评估纳武利尤单抗联合伊匹木单抗在潜在可切除肝细胞癌患者中的疗效、安全性及生物标志物探索	首次在潜在可切除肝细胞癌中探索纳武利尤单抗联合伊匹木单抗新辅助治疗的长期疗效，并发现三级淋巴结构形成与抗肿瘤免疫增强相关	单臂临床试验设计，样本量有限（43例患者）	评估免疫检查点抑制剂联合疗法在潜在可切除肝细胞癌中的疗效和安全性，探索治疗反应的预测生物标志物	潜在可切除肝细胞癌患者	临床肿瘤学	肝细胞癌	基因组分析，转录组分析，免疫细胞分析，光谱流式细胞术，深度学习算法	深度学习	肿瘤组织样本，外周血样本，临床数据	43例肝细胞癌患者（男性/女性：37/6；病毒性/非病毒性：41/2）	NA	NA	客观缓解率，无进展生存率，总生存率，主要病理学缓解率	NA