深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
2601	2026-03-03	Exploring the role of micro-valence in the phenomenal space: insights from similarity judgments and deep learning models 2026, Neuroscience of consciousness IF:3.1Q1 DOI:10.1093/nc/niag005 PMID:41767289	研究论文	本研究通过行为实验和深度神经网络分析，探讨微观效价在意识体验相似性判断中的作用	首次将微观效价概念与深度神经网络处理阶段相结合，揭示效价判断与相似性判断的关系不完全由刺激感知特征中介	研究仅使用日常物体图像，样本量相对有限（149名参与者），未涵盖更复杂的情感刺激	探究效价是否作为意识体验的内在维度，以及其与相似性判断的关联机制	日常物体图像的效价判断与相似性判断	机器学习	NA	行为实验（三选一任务、空间排列任务、生日任务）、深度神经网络激活提取	DNN	图像	149名参与者对120张日常物体图像进行判断	NA	NA	表征相似性分析、多维尺度分析	NA
2602	2026-03-03	Impact of AIR™ Recon DL on magnetic resonance imaging-based quantitative brain structure measurements 2026, Psychoradiology DOI:10.1093/psyrad/kkaf036 PMID:41767425	研究论文	本研究评估了AIR™ Recon DL算法相较于传统重建方法对MRI图像质量和定量脑结构测量的影响	首次系统评估了深度学习重建算法AIR™ Recon DL对脑形态定量测量的系统性偏差影响	研究样本仅包含健康成年人，未涉及患者群体；样本量相对较小（74人）	评估深度学习MRI重建算法对图像质量和脑形态定量测量的影响	健康成年人的脑部MRI图像	医学影像分析	NA	磁共振成像（MRI），3D T1加权成像	深度学习重建算法	医学影像（MRI）	74名健康成年人	NA	AIR™ Recon DL	图像质量评分，体积测量，皮质厚度，沟深，分形维度，脑回化指数	NA
2603	2026-03-03	CT imaging characteristics analysis of bone erosion in rheumatoid arthritis and bioinformatics study of inflammation-related gene rG4s 2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2026.1769517 PMID:41767505	研究论文	本研究收集了类风湿关节炎患者的关节CT影像和外周血转录组数据，构建了用于自动精准评估骨侵蚀的深度学习模型，并通过生物信息学方法筛选了受rG4s调控的RA相关炎症基因，探索了骨侵蚀影像表型与分子调控特征之间的潜在关联	首次将类风湿关节炎的CT影像特征（骨侵蚀）与受rG4s结构调控的炎症相关差异表达基因进行关联分析，并构建了优化的U-Net CNN模型实现骨侵蚀的自动分割和严重程度量化	样本量相对有限（RA组148例，健康对照组49例），且数据来源于单一医院，可能影响结果的普适性	实现类风湿关节炎骨侵蚀的自动精准评估，并探索其与炎症相关基因的转录后调控机制的关联	类风湿关节炎患者（148例）和健康对照者（49例）的临床数据、关节CT影像及外周血RNA测序数据	数字病理学	类风湿关节炎	RNA测序（RNA-seq），CT成像	CNN	图像，转录组数据	RA组148例，健康对照组49例	PyTorch	U-Net	准确率，Dice相似系数，灵敏度，特异性	NA
2604	2026-03-03	Foundation Models Meet Medical Image Interpretation 2026, Research (Washington, D.C.) DOI:10.34133/research.1024 PMID:41767596	综述	本文系统回顾了基础模型在医学图像解读领域的研究进展，涵盖关键任务、数据集、评估指标，并提出了一个创新的医学基础模型平台	首次系统分析了医学基础模型在12个关键维度上的挑战与趋势，并创新性地提出了IPIU医学基础模型平台	作为综述文章，主要基于现有文献进行分析，未进行新的实验验证	为医学基础模型的可持续发展提供理论支持和实践参考	医学基础模型，包括预训练模型、视觉基础模型、视觉-语言基础模型及扩展多模态基础模型	计算机视觉	NA	大规模预训练、高效微调	基础模型	2D/3D医学影像、视觉-语言数据、电子健康记录、生理信号、生物信息学数据	NA	NA	NA	分类、分割、生成、预后预测等任务的评估指标	NA
2605	2026-03-03	Mapping knowledge landscapes and emerging trends in artificial intelligence in glioblastoma: A bibliometric analysis 2026 Jan-Dec, Digital health IF:2.9Q2 DOI:10.1177/20552076261428356 PMID:41767867	文献计量分析	本研究通过文献计量分析，系统梳理了过去二十年人工智能在胶质母细胞瘤研究中的应用趋势、关键贡献者和新兴热点	首次全面描绘了人工智能在胶质母细胞瘤领域的知识图谱演变，并识别出从方法开发到临床转化的关键转变，以及影像基因组学作为新兴前沿	分析仅基于Web of Science核心数据库的英文文献，可能遗漏其他数据库或非英语发表的重要研究	探索人工智能驱动的胶质母细胞瘤研究趋势和关键参与者	2004年至2024年间发表的1487篇英文文献	机器学习	胶质母细胞瘤	文献计量分析	NA	文献元数据	1487篇文献	CiteSpace, VOSviewer, Microsoft Excel	NA	NA	NA
2606	2026-03-03	Global research landscape and emerging trends in the application of artificial intelligence in depression: A bibliometric analysis 2026 Jan-Dec, Digital health IF:2.9Q2 DOI:10.1177/20552076261427866 PMID:41767874	文献计量分析	本研究通过文献计量分析，揭示了人工智能在抑郁症领域应用的研究格局、关键主题和发展轨迹	提供了人工智能在抑郁症领域的最新全面文献计量分析结果，明确了当前研究热点和方向	仅分析了Web of Science核心合集中的英文文章，可能未涵盖所有相关研究	揭示人工智能与抑郁症交叉领域的关键主题和发展轨迹	2011年至2024年间发表的关于人工智能在抑郁症中应用的学术出版物	机器学习	抑郁症	文献计量分析	NA	文本（学术出版物）	1361篇出版物	Bibliometrix, CiteSpace, VOSviewer	NA	NA	NA
2607	2026-03-03	Fine-grained few-shot class-incremental identification of medicinal plants via frequency-aware contrastive learning 2026, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2026.1730047 PMID:41768052	研究论文	本文提出了一种基于频率感知对比学习的细粒度少样本类增量学习框架，用于药用植物的精确识别	提出了一种新颖的频率感知引导域增强对比学习（FGDE）框架，该框架通过集成高、低频分量来细化特征表示，并采用多频率融合来保留细节增强信息，同时引入多目标损失函数以增强基类内的语义紧凑性和增量类间的分离性	未明确提及	开发一种鲁棒的算法工具，用于在仅有少量标注样本的情况下，准确且增量地识别多样化的药用植物物种	药用植物物种	计算机视觉	NA	深度学习	对比学习	图像	未明确提及具体数量，但涉及自收集数据集和两个公共基准数据集	未明确提及	未明确提及	未明确提及具体指标，但通过实验表明优于现有方法	未明确提及
2608	2026-03-03	Deep learning-based pulmonary nodule risk assessment outperforms established malignancy risk scores in lung cancer screening 2026-Jan, Radiology advances DOI:10.1093/radadv/umag003 PMID:41768120	研究论文	本研究评估了一种基于深度学习的肺结节恶性风险估计算法（DeepPNP）在肺癌筛查数据集中的性能，并探讨了数据增强在模型训练中的效果	DeepPNP算法在肺结节恶性风险评估中超越了现有的专家共识指南（如Lung-RADS）和PanCan模型，并通过结合外部活检确认的恶性结节数据集实现了性能提升	研究为回顾性分析，可能受到数据选择偏差的影响；模型性能在特定测试集上评估，需进一步外部验证	评估深度学习算法在肺结节恶性风险估计中的性能，并研究数据增强对模型训练的影响	肺结节，特别是肺癌筛查中发现的结节	计算机视觉	肺癌	CT成像	CNN	3D图像	合并数据集包含28,057个结节（其中2,362个为恶性），测试集包含来自1,243次CT扫描的2,597个结节	未明确指定，但基于3D卷积网络	EfficientNet-B0	ROC AUC, 敏感性, 特异性, 精确度, F1分数, 准确度	NA
2609	2026-03-03	Using swin UNETR deep model for automated detection of alveolar bone fenestration/dehiscence in CBCT 2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2026.1752350 PMID:41768130	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的模型，用于自动检测锥形束计算机断层扫描（CBCT）图像中的牙槽骨开窗/开裂，为诊断牙槽骨缺损提供定量工具	首次将Swin UNETR模型应用于CBCT图像中牙槽骨开窗/开裂的自动检测，实现了关键点定位、长度测量和疾病诊断的集成	研究仅基于10,752张手动标注的矢状CBCT图像，未涉及其他成像平面或更大规模的多中心数据	开发自动检测牙槽骨开窗/开裂的深度学习模型，以提升诊断效率和准确性	牙槽骨开窗和开裂的CBCT图像	计算机视觉	牙槽骨缺损	锥形束计算机断层扫描（CBCT）	Transformer, U-Net	图像	10,752张手动标注的矢状CBCT牙科图像	PyTorch	Swin UNETR	关键点识别率, 长度测量相关性, 疾病诊断准确率	NA
2610	2026-03-03	Signal-aware deep learning-based respiratory motion prediction for lung tumor management 2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2026.1735140 PMID:41768245	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的混合模型，用于预测肺癌放疗中的呼吸运动，以改善肿瘤运动管理	结合扩张卷积层、双向长短期记忆层和生成自编码器模块，联合建模呼吸运动的空间和时间特征，并重建生理一致的呼吸信号	研究侧重于算法可行性，未来需进行临床校准和剂量学验证	提高肺癌放疗中呼吸运动预测的准确性，以优化肿瘤靶向和减少健康组织辐射	肺癌患者的呼吸运动信号	机器学习	肺癌	深度学习	CNN, LSTM, 自编码器	呼吸运动信号数据	NA	NA	扩张卷积层, 双向LSTM, 生成自编码器	运动范围分类准确率, 均方根误差	NA
2611	2026-03-03	Assessing the robustness and clinical evaluation of a deep-learning segmentation model for head and neck cancer 2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2026.1731007 PMID:41768244	研究论文	本研究评估了一种基于深度学习的头颈癌PET/CT分割模型在临床相关图像扰动下的鲁棒性和临床可用性	首次系统评估了深度学习分割模型在多种合成图像扰动（如噪声、模糊、伪影、运动等）下的鲁棒性，并分析了影像组学特征与鲁棒性指标之间的相关性	研究使用了合成扰动而非真实世界采集的扰动数据，且淋巴结肿瘤分割在严重扰动下临床可用性显著下降	评估深度学习分割模型在头颈癌放疗中勾画大体肿瘤体积的鲁棒性和临床适用性	头颈癌患者的PET/CT图像及其大体肿瘤体积（原发灶GTVp和淋巴结GTVn）	数字病理	头颈癌	PET/CT成像	深度学习	医学图像（PET/CT）	474例训练病例，50例测试病例，每例生成36种扰动变体	PyTorch	3D Dynamic U-Net	Dice分数，Hausdorff距离，准确率，Likert量表评分	NA
2612	2026-03-03	The diagnostic value of radiomics-based machine learning for lymph node metastasis in prostate cancer: a systematic review and meta-analysis 2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2026.1710716 PMID:41768254	系统综述与荟萃分析	本文通过系统综述和荟萃分析，评估了基于影像组学的机器学习模型在前列腺癌淋巴结转移诊断中的准确性	首次对基于影像组学的机器学习模型在前列腺癌淋巴结转移诊断中的性能进行了全面的系统综述和荟萃分析，并比较了不同成像模态（PET/CT与MRI）和建模方法（传统机器学习与深度学习）的诊断效能	纳入研究的样本量有限，外部验证不足，成像方案存在异质性，且深度学习模型的研究数量较少	系统评估基于影像组学的机器学习模型诊断前列腺癌淋巴结转移的准确性，为临床决策提供循证支持	前列腺癌患者的淋巴结转移	医学影像分析	前列腺癌	影像组学，正电子发射断层扫描/计算机断层扫描，磁共振成像	机器学习，深度学习	医学影像	共纳入22项研究，涉及PET/CT影像组学研究13项，MRI影像组学研究9项	NA	NA	灵敏度，特异度，汇总受试者工作特征曲线下面积	NA
2613	2026-03-03	Adult-type diffuse glioma prediction using MnasNet optimized by the advanced single candidate optimizer 2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2026.1637208 PMID:41768258	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的非侵入性方法，利用术前T2加权MRI预测成人型弥漫性胶质瘤	提出了一种结合了改进的MnasNet架构、新型元启发式算法ASCO、对立学习以及切比雪夫混沌映射的优化预测模型	研究样本来自两个数据库（共533例），可能存在数据异质性；未明确说明模型在外部验证集上的泛化能力	开发一种准确、非侵入性的成人型弥漫性胶质瘤预测方法，以克服现有诊断方法的局限性	成人型弥漫性胶质瘤患者	数字病理学	胶质瘤	术前T2加权MRI	CNN	图像	533例患者（来自名古屋大学医院的237例和公开数据库的296例）	NA	MnasNet	灵敏度, 特异度, 精确度, 准确率, F1分数, 马修斯相关系数	NA
2614	2026-03-03	Deep learning for regulatory genomics: a survey of models, challenges, and applications 2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2 DOI:10.1093/bioadv/vbaf271 PMID:41768279	综述	本文综述了深度学习在调控基因组学中的最新进展，包括模型、挑战和应用	强调了从传统神经网络到Transformer和图神经网络等先进模型的演进，并考虑了三维基因组结构	承认了过拟合、生物变异性和数据集多样性有限等持续挑战	旨在回顾深度学习在调控基因组学中的应用，以帮助解读非编码基因组区域的复杂调控机制	调控基因组学中的非编码基因组区域，涉及转录因子结合、染色质可及性、RNA过程和RNA-蛋白质相互作用	自然语言处理, 机器学习	NA	深度学习	Transformer, 图神经网络	基因组数据	NA	NA	Transformer, 图神经网络	NA	NA
2615	2026-03-03	Combining deep learning with statistical shape modelling enables automated lower limb measurements with observer-level reliability using weight-bearing computed tomography 2026-Jan, Journal of experimental orthopaedics IF:2.0Q2 DOI:10.1002/jeo2.70669 PMID:41768538	研究论文	本研究提出了一种结合深度学习与统计形状建模的混合方法，用于自动评估负重条件下的下肢对线与形态	首次将深度学习与统计形状建模结合，实现了在负重CT扫描上对下肢骨骼的自动分割、三维标志点识别及28项对线与形态学测量的全自动计算	研究样本量较小（仅30例全下肢负重CT扫描），且证据等级为III级，需要更大规模的外部验证	开发一种自动化、观察者独立的方法，以可靠地评估负重条件下的下肢三维对线与形态	下肢骨骼（股骨、髌骨、胫骨、距骨、跟骨、第二跖骨）及其在负重CT扫描中的三维形态	计算机视觉	骨科疾病/下肢畸形	负重计算机断层扫描（WBCT）	深度学习模型（用于分割）	三维医学图像（CT扫描）	30例全下肢负重CT扫描	NA	NA	Dice相似系数（DSC），平均绝对误差（MAE）	NA
2616	2026-03-03	Automated segmentation and classification of lumbar transverse ultrasound views using a two-stage deep learning method 2026, Frontiers in radiology DOI:10.3389/fradi.2026.1721194 PMID:41768825	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的两阶段框架，用于自动检测和分类腰椎超声图像中的横突旁横切面和椎间孔旁横切面视图	提出了一种结合语义分割和基于坐标分类的两阶段深度学习框架，通过将关键解剖标志分组为单一类别来降低标注复杂性并提高鲁棒性，从而实现了对腰椎超声视图的高精度自动识别	数据集仅来自单一医疗中心，未来需要扩展数据集并在多样化的临床环境中验证方法的泛化能力	开发并评估一种基于深度学习的自动化框架，用于识别和分类腰椎超声视图，以支持超声引导的腰椎区域麻醉和慢性疼痛管理	来自425名接受疼痛治疗患者的腰椎超声图像	计算机视觉	慢性疼痛	超声成像	CNN, SVM	图像	425名患者	NA	U-Net	IoU, 准确率	NA
2617	2026-03-03	Scaling Early Detection for Developmental Dysplasia of the Hip With Artificial Intelligence-Assisted Imaging 2026-Jan, Cureus DOI:10.7759/cureus.102507 PMID:41769581	综述	本文综述了人工智能辅助超声和放射成像在儿童发育性髋关节发育不良早期诊断中的应用现状与进展	总结了AI模型（特别是深度学习和卷积神经网络）在自动化图像分析、解剖标志点检测及关键诊断参数（如α角、β角、髋臼指数）测量方面的应用，并探讨了便携式超声系统和云端诊断平台在资源匮乏地区推广筛查的潜力	面临数据集异质性、深度学习模型在不同人群和设备间的泛化能力有限、模型可解释性不足以及临床工作流整合困难等挑战	评估人工智能技术在儿童发育性髋关节发育不良早期诊断与筛查中的应用效果与发展前景	发育性髋关节发育不良的超声与放射影像数据	计算机视觉	儿童骨科疾病	超声成像, 放射成像	CNN, 深度学习模型	图像	NA	NA	分割网络, 3D卷积模型	诊断准确性, 一致性, 观察者间变异性	NA
2618	2026-03-03	Retinal proteomics in neurodegeneration: Insights into ocular and brain disorders 2025-Oct-30, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00291 PMID:41169217	综述	本文总结了视网膜蛋白质组学在神经退行性疾病和眼部疾病中的最新进展，重点关注其在发现治疗靶点和非侵入性诊断生物标志物方面的潜力	整合了人工智能驱动的计算流程，特别是GPU加速的深度学习架构，显著提高了视网膜蛋白质组学的精确性和效率，并利用先进的大数据基础设施支持早期生物标志物检测	NA	探索视网膜蛋白质组学在神经退行性疾病和眼部疾病中的应用，以发现新的治疗靶点和诊断生物标志物	视网膜蛋白质组，涉及疾病包括青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、视网膜色素变性，以及阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化症和帕金森病	数字病理学	神经退行性疾病	基于质谱的蛋白质组学技术	深度学习	蛋白质组学数据	NA	NA	NA	疾病特异性和敏感性	GPU加速的深度学习架构，先进的大数据基础设施
2619	2026-03-03	Memorization bias impacts modeling of alternative conformational states of solute carrier membrane proteins with methods from deep learning 2025-Oct, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1013590 PMID:41105726	研究论文	本文评估了深度学习建模中记忆化偏差对溶质载体膜蛋白替代构象状态的影响，并提出了一种结合ESM和模板建模的方法来一致建模这些状态	提出了一种结合进化尺度建模和模板建模的新流程，以克服AlphaFold2/3在建模溶质载体蛋白多构象状态时的记忆化偏差，并利用序列进化协方差数据进行验证	方法主要适用于具有内部伪对称性的溶质载体蛋白，可能不适用于所有膜蛋白类型，且依赖于模板的可用性	评估记忆化偏差对溶质载体膜蛋白多构象状态建模的影响，并开发一种能一致建模替代构象状态的方法	溶质载体膜蛋白，特别是具有伪对称结构的蛋白质，如SLC35F2	计算生物学	NA	进化尺度建模，模板建模，序列进化协方差分析	AlphaFold2, AlphaFold3, ESM	蛋白质序列，结构模板	多个整合膜蛋白转运体，包括SLC35F2	NA	NA	NA	NA
2620	2026-03-03	scMODAL: a general deep learning framework for comprehensive single-cell multi-omics data alignment with feature links 2025-May-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-60333-z PMID:40442129	研究论文	本文介绍了一个名为scMODAL的深度学习框架，专门用于单细胞多组学数据的对齐，通过特征链接实现全面整合	scMODAL利用神经网络和生成对抗网络，结合有限的已知正相关特征，对齐细胞嵌入并保持特征拓扑结构，有效去除不必要变异并保留生物信息	NA	开发一个计算框架以整合单细胞多组学数据，促进联合分析	单细胞多组学数据，包括转录组、表观基因组和蛋白质组数据	机器学习	NA	单细胞技术，包括转录组、表观基因组和蛋白质组分析	神经网络, 生成对抗网络	单细胞多组学数据	NA	NA	NA	NA	NA