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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2025-11-25 |
Efficient Generation of Protein and Protein-Protein Complex Dynamics via SE(3)-Parameterized Diffusion Models
2025-Nov-24, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01971
PMID:41188090
|
研究论文 | 提出一种基于SE(3)参数化扩散模型的蛋白质构象轨迹生成方法PTraj-Diff | 首次将几何扩散框架应用于蛋白质和蛋白质复合物轨迹生成,通过残基级SE(3)变换参数化和张量积注意力机制有效捕获蛋白质几何约束 | 未明确说明模型在特定蛋白质类型或复杂结构上的泛化能力限制 | 开发高效生成蛋白质和蛋白质-蛋白质复合物构象动态轨迹的计算方法 | 蛋白质单体和蛋白质-蛋白质复合物的构象轨迹 | 计算生物学 | NA | 扩散模型, 分子动力学模拟 | 扩散模型 | 蛋白质结构数据, 构象轨迹数据 | NA | NA | PTraj-Diff, Power Bert Encoder | NA | 降低了对数据和硬件资源的需求 |
| 2762 | 2025-11-25 |
The Use of DeepQSAR Models for the Discovery of Peptides with Enhanced Antimicrobial and Antibiofilm Potential
2025-Nov-24, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02138
PMID:41195811
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研究论文 | 利用基于循环神经网络的DeepQSAR模型预测和设计具有增强抗菌和抗生物膜活性的新型抗菌肽 | 将传统分子描述符与深度学习模型结合,开发出能高效预测抗菌肽活性的DeepQSAR方法,并成功设计出兼具抗菌和抗生物膜活性的新型肽段 | NA | 开发基于深度学习的QSAR模型以加速具有广谱抗菌和抗生物膜活性的抗菌肽发现 | 抗菌肽(AMPs)及其活性预测 | 机器学习 | 细菌感染 | 定量构效关系(QSAR),深度学习 | RNN(循环神经网络) | 分子描述符数据,肽序列数据 | 100个新设计的肽段(其中44个具有增强抗生物膜活性,31个具有更强抗菌活性) | NA | 基于RNN的QSAR模型 | 5折交叉验证准确率 | NA |
| 2763 | 2025-11-25 |
Preliminary findings on a deep learning model using electroencephalogram for multi-level neuropathic pain detection in post-stroke patients
2025-Nov-24, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2025.2584081
PMID:41199478
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研究论文 | 开发了一种基于脑电图信号的中风后神经病理性疼痛多级检测的深度学习模型 | 提出了量子启发的金字塔深度可分离残差网络,集成了深度可分离残差网络降低计算复杂度、金字塔注意力机制捕获多尺度模式、量子启发变换层建模脑电图特征间复杂非线性依赖关系三大创新 | NA | 开发准确且计算效率高的神经病理性疼痛检测框架 | 中风后神经病理性疼痛患者 | 机器学习 | 神经病理性疼痛 | 脑电图 | 深度学习 | 脑电图信号 | NA | NA | 量子启发的金字塔深度可分离残差网络 | 准确率, 召回率 | NA |
| 2764 | 2025-11-25 |
RAPID-Net: Accurate Pocket Identification for Binding-Site-Agnostic Docking
2025-Nov-24, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01744
PMID:41231530
|
研究论文 | 提出RAPID-Net深度学习算法,用于精确预测结合口袋并实现与分子对接流程的无缝集成 | 开发结合口袋不可知对接方法,能识别远端功能位点,为变构抑制剂设计提供新机会 | 姿态排序而非采样是主要精度瓶颈,在最具挑战性的时间分割测试中性能略低于AlphaFold 3 | 开发准确识别可药性口袋的算法,提升基于结构的药物设计效率 | 蛋白质结合口袋和配体对接 | 计算生物学 | 传染病(SARS-CoV-2) | 深度学习 | 深度学习网络 | 蛋白质结构数据 | PoseBusters基准测试集 | NA | RAPID-Net | RMSD, PoseBusters化学有效性标准, Top-1姿态准确率, 口袋-配体交集率 | NA |
| 2765 | 2025-11-25 |
A novel hybrid approach for multi stage kidney cancer diagnosis using RCC ProbNet
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29742-4
PMID:41276585
|
研究论文 | 提出一种名为RCC-ProbNet的新型混合深度学习模型,用于多阶段肾癌诊断和分类 | 结合特征提取和概率特征建模的混合方法,能够更精细地表征特征并增强不同肾癌阶段的区分能力 | 未明确说明样本来源和具体数据规模,未来需要扩展到实时临床决策支持系统 | 提高肾癌诊断精度,实现早期筛查和分期 | 肾细胞癌(RCC)患者 | 数字病理 | 肾癌 | 医学影像分析 | 混合深度学习模型, Logistic Regression | 医学影像数据 | NA | NA | RCC-ProbNet | 准确率 | NA |
| 2766 | 2025-11-25 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
|
综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类方法、预后价值、治疗指导意义及临床转化面临的挑战 | 系统整合了基于基因表达谱、免疫组化和深度学习图像分析的CMS分类方法,并探讨了单细胞测序解决肿瘤内异质性的新策略 | 肿瘤内异质性和技术障碍阻碍了CMS分类的临床推广应用 | 评估CMS分类在结直肠癌预后预测和个性化治疗指导中的应用价值 | 结直肠癌分子亚型及其临床特征 | 数字病理 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析, 免疫组化, 单细胞RNA测序, 深度学习 | 深度学习 | 基因表达数据, 病理图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2767 | 2025-11-25 |
Phylo-Spec: a phylogeny-fusion deep learning model advances microbiome status identification
2025-Nov-24, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.01453-25
PMID:41283667
|
研究论文 | 提出一种融合系统发育信息的深度学习模型Phylo-Spec,用于改进微生物组状态识别 | 首次将系统发育层次结构融入深度学习框架,通过自底向上迭代融合微生物特征,并动态处理未分类物种 | 仅在合成数据集和部分真实数据上验证,需要更广泛的临床验证 | 改进微生物组状态分类和健康状态识别 | 人类微生物组数据 | 生物信息学 | NA | 宏基因组测序,扩增子测序 | 深度学习 | 微生物组数据 | NA | NA | 卷积神经网络 | 准确率 | NA |
| 2768 | 2025-11-25 |
Unveiling the landscape of prokaryotic global regulators through deep protein language models
2025-Nov-24, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00950-25
PMID:41283681
|
研究论文 | 利用深度蛋白质语言模型系统性地探索原核生物全局调控因子的多样性 | 首次使用深度学习方法在大规模原核生物基因组中系统识别全局调控因子,突破了传统同源性和结构域方法的局限 | 部分识别出的蛋白质功能未知,需要进一步实验验证 | 构建原核生物全局调控因子的全面图谱,理解其多样性和进化动态 | 14,800个细菌和古菌类型菌株基因组 | 生物信息学 | NA | 蛋白质语言模型,深度学习 | 深度学习模型 | 蛋白质序列数据 | 14,800个原核生物基因组,74,872个经过验证的GR序列,270,000多个GR样蛋白质 | NA | 蛋白质语言模型 | 灵敏度,泛化能力 | NA |
| 2769 | 2025-11-25 |
Artificial intelligence in arterial healing, remodeling, and prediction: its implications in vascular surgery
2025-Nov-24, The Journal of cardiovascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.23736/S0021-9509.25.13397-1
PMID:41283977
|
综述 | 本文综述人工智能在血管外科中动脉愈合、重塑和预测分析方面的应用与前景 | 系统整合AI技术在血管外科多环节的应用,包括内皮恢复监测、血流动力学模拟和术中导航等创新方向 | 面临标注数据质量不足、算法可解释性差、数据隐私伦理问题等挑战 | 探讨人工智能技术在血管外科领域的临床应用与发展前景 | 动脉愈合过程、血管重塑机制、血管疾病预测模型 | 数字病理 | 心血管疾病 | 超声成像, MRI, 计算流体动力学 | CNN, RNN, 机器学习, 深度学习 | 医学影像, 血流动力学数据, 生物传感器数据 | NA | NA | 卷积神经网络, 循环神经网络 | NA | NA |
| 2770 | 2025-11-25 |
Artificial intelligence-based decision support systems and their role in vascular surgery and clinical practice
2025-Nov-24, The Journal of cardiovascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.23736/S0021-9509.25.13491-5
PMID:41283980
|
综述 | 探讨人工智能决策支持系统在血管外科临床实践中的应用现状与挑战 | 系统梳理AI-DSS在血管外科多场景应用(影像分析、术中导航、预测建模)并首次整合数字孪生等新兴概念 | 模型可解释性不足、泛化能力有限、与电子病历集成困难、伦理法律障碍及实施成本高昂 | 分析人工智能决策支持系统在血管外科临床实践中的潜力与实施障碍 | 血管外科疾病诊疗流程(动脉瘤、斑块、狭窄等) | 数字病理 | 心血管疾病 | 深度学习 | 深度学习模型 | 医学影像、生物力学数据、生物标志物 | NA | NA | NA | 准确率 | NA |
| 2771 | 2025-11-25 |
Deep learning for non-invasive detection of steatosis and fibrosis in MASLD: a multicenter study with a new fibroscan-labelled ultrasound dataset
2025-Nov-24, Abdominal radiology (New York)
DOI:10.1007/s00261-025-05309-9
PMID:41284028
|
研究论文 | 开发并验证基于深度学习模型利用常规B超图像无创评估肝脏脂肪变性和纤维化的方法 | 首次使用Fibroscan标记的超声数据集,结合多中心数据验证深度学习模型在MASLD疾病评估中的性能 | 样本量相对有限,外部测试集样本数量较少(DS3仅18例患者) | 开发无创检测肝脏脂肪变性和纤维化的深度学习方法 | MASLD(代谢相关脂肪性肝病)患者 | 医学影像分析 | 代谢相关脂肪性肝病 | B模式超声成像,Fibroscan测量 | CNN, Transformer | 超声图像 | 总样本247例患者(DS1:111例,DS2:95例,DS3:18例,DS4:23例),共2799张图像 | NA | EfficientNet-B4, Vision Transformers | AUROC, 95%置信区间 | NA |
| 2772 | 2025-11-25 |
Deep learning in bone marrow cytomorphology: advances in segmentation, classification, and clinical translation
2025-Nov-24, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03127-z
PMID:41284066
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2773 | 2025-11-25 |
Deep learning-based image reconstruction significantly improves image quality of MRI examinations of the orbit at 3 Tesla
2025-Nov-23, Diagnostic and interventional imaging
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.diii.2025.11.003
PMID:41276422
|
研究论文 | 本研究评估深度学习图像重建技术在3特斯拉眼眶MRI中提升图像质量的效果 | 首次系统评估深度学习图像重建技术在3T眼眶MRI中的图像质量改善效果 | 样本量相对有限(71例患者),仅评估了冠状位T2加权和对比增强脂肪抑制T1加权图像 | 评估深度学习图像重建技术对眼眶MRI图像质量的改善效果 | 眼眶MRI图像和视神经结构 | 医学影像分析 | 眼眶疾病 | 磁共振成像(MRI) | 深度学习 | 医学图像 | 71例患者(48名女性,23名男性),年龄7-90岁 | NA | NA | 信噪比(SNR), 对比噪声比(CNR), 图像质量评分 | NA |
| 2774 | 2025-11-25 |
Predicting Pharmacological Treatment Response in Migraine Using AI/ML: A Scoping Review of the Evidence and Future Directions
2025-Nov-23, Pharmacotherapy
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/phar.70085
PMID:41276479
|
综述 | 本文通过范围综述系统评估了人工智能和机器学习在预测偏头痛药物治疗反应方面的证据 | 首次系统评估AI/ML在偏头痛药物治疗预测中的应用,识别方法学缺陷并提出未来发展方向 | 纳入研究数量有限(12项),存在方法学缺陷如缺乏外部验证、患者队列重叠、缺少生物标志物和遗传数据 | 评估AI/ML在预测偏头痛药物治疗反应中的证据现状和未来方向 | 偏头痛患者药物治疗反应预测 | 机器学习 | 偏头痛 | 临床表型分析,神经影像数据 | 支持向量机,深度学习,概率模型 | 临床数据,神经影像数据 | 12项研究(自2006年起) | NA | NA | 预测准确率 | NA |
| 2775 | 2025-11-25 |
Deep learning assessment of street spatial quality in old residential communities of Wuchang, Wuhan, China
2025-Nov-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28936-0
PMID:41276562
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2776 | 2025-11-25 |
Development and validation of a machine learning-based prognostic model for gastric cancer: a multicenter retrospective study
2025-Nov-21, Langenbeck's archives of surgery
DOI:10.1007/s00423-025-03883-6
PMID:41269322
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研究论文 | 开发并验证基于机器学习的胃癌预后预测模型 | 整合多种机器学习算法构建集成模型,并在多中心真实世界数据中验证其优于传统TNM分期系统 | 回顾性研究设计,数据来源于特定数据库和医疗中心 | 开发胃癌生存预后预测模型 | 胃癌患者 | 机器学习 | 胃癌 | 临床数据分析 | Cox, RSF, CoxBoost, Deepsurv_Cox, 集成模型 | 临床数据 | SEER数据库21,559例患者,中国两个医疗中心3,805例患者 | NA | 集成模型 | C-index, IBS, mean AUC, 时间依赖ROC曲线, 校准曲线, DCA | NA |
| 2777 | 2025-11-25 |
Carbon market price prediction in the Yangtze River Basin based on improved deep learning ensemble model with CEEMDAN and Attention-RNN
2025-Nov-21, Carbon balance and management
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s13021-025-00346-9
PMID:41269474
|
研究论文 | 提出一种结合CEEMDAN分解和注意力机制RNN的集成深度学习模型,用于长江流域碳市场价格预测 | 首次将CEEMDAN分解与注意力机制RNN结合,并考虑多重影响因素进行碳价格预测 | 仅在中国长江流域三个试点地区进行验证,未在其他区域测试 | 提高碳交易市场价格预测的准确性 | 长江流域碳交易试点地区(上海市、湖北省、重庆市)的碳市场价格 | 机器学习 | NA | CEEMDAN分解,深度学习 | RNN, LSTM, GRU | 时间序列数据(碳价格和外部变量) | 长江流域3个碳交易试点地区数据 | NA | 注意力机制RNN,CEEMDAN-Attention-RNN集成模型 | 平均绝对百分比误差(MAPE) | NA |
| 2778 | 2025-11-25 |
Multi-omics strategies for biomarker discovery and application in personalized oncology
2025-Nov-21, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00340-0
PMID:41269529
|
综述 | 本文系统综述了多组学策略在生物标志物发现和个性化肿瘤学中的应用框架与方法 | 提出了涵盖水平和垂直整合策略的多组学综合分析框架,特别强调机器学习和深度学习方法在数据解读中的应用 | 存在数据异质性、可重复性以及跨患者群体临床验证等主要挑战 | 为研究人员和临床医生提供多组学数据在生物标志物发现和个性化癌症护理中实施的当前方法和未来方向 | 多组学整合策略、分析工作流程、计算工具及其在肿瘤学中的应用 | 生物信息学 | 肿瘤 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞多组学、空间多组学 | 机器学习,深度学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2779 | 2025-11-25 |
High-capacity directional information processor using all-optical multilayered neural networks
2025-Nov-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu0904
PMID:41270162
|
研究论文 | 提出一种基于超表面的方向性衍射深度神经网络,实现高容量信息处理 | 将波传播方向编码到神经网络中,引入新的自由度,实现方向依赖功能 | NA | 开发高容量光学信息处理器 | 数字和时尚产品分类、数据加密 | 光学神经网络 | NA | 超表面技术、几何相位控制、传播相位控制 | 衍射深度神经网络 | 光学信号 | NA | NA | 多层神经网络、三自旋解耦超表面 | NA | NA |
| 2780 | 2025-11-25 |
Rapid cancer diagnosis using deep learning-powered label-free subcellular-resolution photoacoustic histology
2025-Nov-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz1820
PMID:41270177
|
研究论文 | 开发了一种亚细胞分辨率紫外光声显微镜系统,结合深度学习实现无标记快速癌症诊断 | 开发了240纳米分辨率的SRUV-PAM系统,首次结合循环一致性生成对抗网络进行虚拟染色,并使用DenseNet-121实现肝脏良恶性肿瘤诊断 | NA | 解决传统组织染色方法耗时且易产生伪影的问题,开发快速无标记癌症诊断技术 | 肝脏组织中的良性和恶性肿瘤 | 数字病理学 | 肝癌 | 紫外光声显微镜,虚拟染色 | GAN, CNN | 光声显微镜图像 | NA | NA | CycleGAN, DenseNet-121 | AUC | NA |