深度学习在生物医药领域的应用

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当前共找到 45506 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 算法框架 模型架构 性能指标 计算资源
281 2026-06-08
Multi-scale structural similarity embedding search across entire proteomes
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出一种基于蛋白质语言模型和深度神经网络的跨蛋白质组多尺度结构相似性嵌入搜索方法 通过将三维结构转化为定长向量,结合向量数据库实现大规模蛋白质结构相似性的高效检索,且能泛化至全长多肽链和多聚体组装体 NA 开发可扩展的高效结构相似性搜索策略,应对日益增长的生物大分子三维结构数据 实验测定结构和AI/DL预测的结构模型(包括全长多肽链和多聚体组装体) 机器学习 NA 蛋白质语言模型、深度神经网络 深度神经网络 蛋白质三维结构数据 NA PyTorch NA TM-score NA
282 2026-06-08
Rapid and interpretable protein contact map prediction using a pattern-matching strategy
2026-Feb-20, Physical biology IF:2.0Q3
研究论文 提出一种基于模板的模式匹配方法,通过识别同源实验结构中的保守结构基序来预测蛋白质接触图,无需深度学习或大量同源序列 首次将模式匹配策略应用于蛋白质接触图预测,仅需少量结构模板(50-500个)即可在标准硬件上快速完成预测,兼顾效率与可解释性 依赖已有实验结构作为模板,对全新折叠类型或无同源结构的蛋白质预测能力有限 开发一种计算高效且可解释的蛋白质接触图预测方法,以替代深度学习和共进化方法 蛋白质接触图预测方法 机器学习 未明确提及 结构模式匹配 模式匹配模型 蛋白质序列与结构数据 25个蛋白质结构域(验证集)和7599条低注释序列(测试集) NA 模式匹配框架 相关系数、准确率、接触覆盖率、平均F1分数 标准硬件(无需GPU或高性能计算集群)
283 2026-06-08
Temporal fusion transformer-based forecasting of COVID-19 infection trends using environmental indicators
2026-Feb-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 基于时间融合转换器利用环境指标预测COVID-19感染趋势 结合废水质量、空气质量和天气条件等多维环境变量进行预测,并采用间接估计方法(基于病例数比例变化)提升预测准确性 测试数据集中病例数被低估,直接预测不可靠;研究局限于单一地区(区级)和单一疾病(COVID-19) 开发并评估基于时间融合转换器的多元时间序列预测模型,以环境指标预测COVID-19病例动态 2020年2月至2022年5月期间的区级COVID-19确诊病例数据及环境变量(废水质量、空气质量、天气条件) 机器学习 传染病 时间序列预测 时间融合转换器 时间序列数据 区级数据,时间跨度约2年4个月 NA 时间融合转换器 R值 NA
284 2026-06-08
Truth-based physics informed estimation of material composition in spectral CT in terms of density and effective atomic number
2026-Feb-13, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1
研究论文 开发并验证一种基于物理信息的深度学习模型,用于从光谱CT图像中分解出密度和有效原子序数图 将物理信息正则化损失融入生成对抗网络训练,以提升材料分解的精度,并使用验证过的模拟数据训练模型,弥补了深度学习缺乏物理原理和真实数据的局限性 临床数据样本量较小,限制了结果的泛化能力 实现光谱CT图像中密度和有效原子序数图的材料分解,并评估其临床实用性 光谱CT图像中的密度和有效原子序数图 计算机视觉 肝脏病变 光谱CT 生成对抗网络 图像 32个人类模型的模拟腹部PCCT扫描用于训练,16个计算体模和6个临床病例用于验证,30张图像切片用于读者研究 NA 生成对抗网络 NRMSE, SSIM, PSNR, RMSE, 显著度评分 NA
285 2026-06-08
A lightweight depthwise separable convolution and channel attention based GRU network for multichannel EEG seizure detection
2026-Feb-11, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3
研究论文 提出一种轻量级端到端注意力深度学习网络,用于从原始多通道脑电图信号中自动检测癫痫发作 采用残差深度可分离卷积块与通道注意力机制结合门控循环单元,实现高效空间特征提取和时间依赖建模,同时保持低计算复杂度 NA 开发快速、准确且非侵入性的癫痫发作检测框架,改善癫痫诊断和管理 多通道脑电图信号中的癫痫发作检测 机器学习 癫痫 NA 卷积神经网络与门控循环单元混合模型 脑电图信号 CHB-MIT数据集,采用留一病人交叉验证方法 NA 残差深度可分离卷积块、通道注意力机制、门控循环单元 准确率、精确率、灵敏度、特异性、F1分数 NA
286 2026-06-08
Expert-level probabilistic breathing event detector informs phenotyping of sleep apnea
2026-Feb-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一个专家级别的概率性呼吸事件检测器,用于睡眠呼吸暂停的表型分析 提出了端到端深度学习架构训练的自动呼吸事件检测器,能够输出概率性结果(“apnotyping”),从而揭示睡眠呼吸暂停的病因,并比传统指数更紧密地与关键睡眠呼吸暂停特征相关 未提及明确限制 开发自动分类阻塞性呼吸暂停、中枢性呼吸暂停、低通气和孤立呼吸事件的方法,以提升诊断准确性和支持个性化治疗 来自六个队列的5456次多导睡眠图用于训练,1099次用于测试 机器学习 睡眠呼吸暂停 NA 深度学习 多导睡眠图信号 训练集5456次多导睡眠图,测试集1099次多导睡眠图 NA 端到端深度学习架构 F1分数,相关系数 NA
287 2026-06-08
A fine-grained fundus image dataset for cataract severity assessment and diagnosis
2026-Feb-07, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 构建了白内障严重程度与诊断图像数据集(CSDI),并提出基于多模态大语言模型的精细诊断框架 首次将多模态大语言模型技术应用于白内障的精确量化诊断,实现从眼底图像进行细粒度严重程度评分并生成专业诊断文本 未明确提及具体局限性,但现有方法仅提供二元评估,而临床需要多级严重程度评估 解决缺乏高质量、公开可用的细粒度白内障分类数据集的问题,并实现精细诊断 187例眼底图像病例及其详细的临床诊断报告 计算机视觉, 自然语言处理 白内障 多模态大语言模型 多模态大语言模型 图像, 文本 187例眼底图像病例 NA 多模态大语言模型 严重程度评估和诊断报告生成的基准测试指标 NA
288 2026-06-08
Design and rationale of the artifiCiAl intelligence Model for Evaluating the surgical techniques of caRdiAc surgeons (CAMERA): a cohort study
2026-Feb-06, BMJ open IF:2.4Q1
研究论文 开发并验证基于人工智能的框架,利用真实手术视频自动评估冠状动脉搭桥手术的技术技能 首次将AI驱动的技能评估应用于高风险心脏手术(CABG),采用混合AI管道结合视觉印象和工具轨迹准确性进行评分 单中心前瞻性观察研究,样本来源单一,可能限制泛化性 建立并验证基于真实手术视频的CABG手术技能自动评估AI框架 接受择期CABG的成年患者及其完整术中视频数据 计算机视觉 心血管疾病 手术视频分析 混合AI模型 手术视频 单中心,具体样本数量待定 NA NA 组内相关系数、一致性分析、工具轨迹分析、相关性分析 NA
289 2026-06-08
EgyPLI: A Real-life Annotated Image Dataset for Egyptian Plant Leaf Identification
2026-Feb-06, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 介绍埃及植物叶片图像数据集EgyPLI,用于支持自动植物识别研究 首个在埃及本地收集的综合性植物叶片图像数据集,包含真实农业环境下的自然噪声和变化,弥补了当地代表性数据集的缺失 未明确说明限制 提供地理多样性的数据集,支持开发通用化自动植物识别模型 八种广泛种植的植物叶片:苹果、浆果、无花果、番石榴、橙子、李子、柿子、番茄,包括健康叶片和病害叶片 计算机视觉 植物病害 NA CNN 图像 3588张叶片图像 PyTorch ResNet50, VGG16, 自定义CNN 准确率 NA
290 2026-06-08
Establishing dermatopathology encyclopedia DermpathNet with Artificial Intelligence-Based Workflow
2026-Feb-06, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 利用人工智能工作流建立开放性皮肤病理学图像数据集DermpathNet 采用深度学习的图像模态分类与图表标题分析相结合的混合方法,自动从PubMed Central中提取和分类皮肤病理学图像,并构建大规模开放获取数据集 检索工作流程半自动化,仍需人工验证;OpenAI图像分析算法在数据集上表现不足 为教育、交叉参考和机器学习目的建立一个全面的开放获取皮肤病理学图像数据集 从PubMed Central存储库中提取的皮肤病理学图像 数字病理学 皮肤疾病 NA 深度学习模型 图像,文本(图表标题) 651张手动标注图像用于验证;最终数据集包含7,772张图像,涵盖166种诊断 NA NA F值 NA
291 2026-06-08
Explainable and physics-informed machine learning for seasonal water quality prediction in the monsoon-driven Padma River Basin, Bangladesh
2026-Feb-05, Environmental geochemistry and health IF:3.2Q2
research paper 开发首个结合机器学习、深度学习和物理信息神经网络的集成可解释人工智能框架,预测孟加拉国帕德玛河流域的季节性水质动态 首次将可解释人工智能与物理信息神经网络相结合,实现季节性水质预测、解释和空间特征化,并在采样有限条件下通过PINN数据增强提高模型泛化能力 样本量仅44个地表水样,可能限制模型在不同流域的泛化能力;季节性因素主导而空间变异性较弱,需更多数据验证 开发可解释且具有物理信息的机器学习框架,预测季风驱动流域的季节性水质动态,提升预测可靠性和决策相关性 孟加拉国帕德玛河流域的冬季和季风季节地表水样 machine learning NA NGS Deep Neural Networks, Ridge Regression, Voting Ensemble, Physics-Informed Neural Networks 数值型水质指标数据(pH、DO、NO等) 44个地表水样(冬季和季风季节) NA Deep Neural Networks, Ridge Regression, Voting Ensemble, Physics-Informed Neural Networks 相关系数R, 均方根误差RMSE NA
292 2026-06-08
A deep learning approach to emotionally intelligent AI for improved learning outcomes
2026-Feb-05, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出一种多模态情感感知深度学习框架,整合情感智能到教育AI中,提升学习效果 首次通过图融合机制联合分析面部表情、语音和文本多模态数据,实现情感感知自适应反馈 伦理考量如数据隐私、知情同意和责任部署仍需进一步深入研究 开发具有情感智能的教育AI系统,提升学习者参与度、情绪调节和任务持续性 学习者情感状态、多模态数据(面部表情、语音、文本) 自然语言处理 不适用 不适用 深度学习 图像、语音、文本 使用AffectNet和IEMOCAP基准数据集 NA 图融合机制 情感识别性能、学习者参与度、情绪调节、任务持续性 NA
293 2026-06-08
Leveraging in-silico deep learning and computational analyses to predict the pathogenicity of ROBO4 variants of uncertain significance in aortic aneurysm and dissection patients
2026-Feb-04, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3
研究论文 利用计算分析和AlphaFold2等工具预测ROBO4基因意义不明确变异在主动脉瘤和夹层患者中的致病性 将AlphaFold2等计算工具与临床数据结合,建立评估意义不明确变异致病性的新型工作流程,并揭示基因型-表型相关性 样本量小(仅5例患者),缺乏功能实验验证 预测ROBO4基因错义意义不明确变异在胸主动脉瘤和夹层中的致病潜力 5例携带杂合ROBO4意义不明确变异并患有胸主动脉瘤或夹层的患者 计算生物学 主动脉瘤和夹层 AlphaFold2, AlphaMissense, REVEL, PolyPhen-2, SIFT, FATHMM, MutationTaster2, GranthamMatrix, PhastCons AlphaFold2, AlphaMissense 临床数据, 基因序列数据 5例患者 NA AlphaFold2 NA NA
294 2026-06-08
Deep Learning-based Assessment of Eyelid and Periorbital Parameters: Assisting Diagnosis and Treatment Planning in Blepharoptosis
2026-Feb-04, Journal of medical systems IF:3.5Q2
研究论文 开发并评估一种基于深度学习的系统,用于自动测量眼睑和眶周参数并分类提上睑肌功能,辅助诊断和治疗计划制定 首次将深度学习模型应用于眼睑和眶周参数的自动测量及提上睑肌功能分级,且系统性能与眼科医生评估水平相当 未在摘要中明确说明局限性,可能包括回顾性设计、单中心数据、样本量有限等 开发基于深度学习的眼睑和眶周参数自动测量及提上睑肌功能分级系统,支持个性化诊断和手术规划 眼睑下垂患者的眼睑和眶周参数,包括眼眶边缘距离1和眉毛高度 机器学习 眼睑下垂 NA 深度学习模型、多项逻辑回归模型 图像 1177名接受提睑术的患者 NA 深度学习分割模型(具体架构未在摘要中明确) Dice系数、组内相关系数、准确率、AUC NA
295 2026-06-08
An improved seam carving method for enhancing the visual field of tunnel vision patients
2026-Feb-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出一种改进的接缝裁剪方法,用于增强隧道视野患者的视野范围 通过多尺度图像融合(结合深度、显著性、前景分割和边缘检测特征)计算能量图,并采用前向-中间方法进行接缝移除 NA 改善隧道视野患者的视觉体验,将输入图像宽度缩小以适应患者视角,同时保留重要物体和细节 隧道视野患者的视觉场景图像 计算机视觉 眼科疾病 图像重定向 NA 图像 NA NA NA SSIM, SIFT特征匹配, 深度学习感知质量指标, 综合评分 NA
296 2026-06-08
Self-supervised pretraining with NuSPIRe unlocks nuclear morphology-driven insights in spatial omics
2026-Feb-03, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种自监督深度学习模型NuSPIRe,通过分析DAPI染色的细胞核形态图像,挖掘空间组学数据中的核形态信息 首次将自监督预训练应用于细胞核形态分析,并在空间组学中整合核形态与基因表达数据,实现AI驱动的实验优化 未提及 利用细胞核形态信息提升空间组学数据分析的效率和准确性 DAPI染色的细胞核图像及空间组学数据 计算机视觉, 数字病理学 未提及 DAPI染色, 空间组学 自监督深度学习模型 图像 1552万个细胞核图像 PyTorch NuSPIRe 未提及 未提及
297 2026-06-08
Integrating deep learning and radiomics for precise identification of luminal A/B breast cancer subtypes on dynamic contrast-enhanced MRI
2026-Feb-03, Cancer imaging : the official publication of the International Cancer Imaging Society IF:3.5Q1
research paper 开发并验证一种结合影像组学和深度学习特征从动态对比增强磁共振成像(DCE-MRI)中精准区分Luminal A/B乳腺癌亚型的混合分类模型 首次将影像组学特征与3D ResNet-50深度学习特征通过堆叠集成方法融合,实现乳腺癌亚型的非侵入性分类,并应用SHAP和Grad-CAM增强模型可解释性 样本量相对有限(312例患者),且研究局限于Luminal A/B亚型,尚未进行前瞻性验证及与基因组学数据的整合 开发一种非侵入性影像学方法替代有创活检,实现乳腺癌Luminal A/B亚型的精准分类 来自中国、俄罗斯和保加利亚的312例确诊Luminal亚型乳腺癌患者(含独立外部验证队列148例) computer vision, digital pathology breast cancer DCE-MRI CNN, 3D ResNet-50, 堆叠集成模型 image 312例患者(训练及测试),148例独立外部验证 PyRadiomics, PyTorch 3D ResNet-50, 堆叠集成模型 AUC, sensitivity, specificity NA
298 2026-06-08
The expectations of in silico fragment-based drug design and future challenges
2026-Feb, Expert opinion on drug discovery IF:6.0Q1
评论 本文概述了基于片段的药物设计(FBDD)中计算机方法的最新进展,特别是人工智能和机器学习在加速药物发现中的作用 强调了AI通过强化学习、生成化学和口袋感知设计等方法,自动优化化合物性质、提升化学多样性并拓展靶向难治蛋白的能力 尽管AI减少了开发时间并提高了准确性,但实验验证仍不可或缺,且大片段库训练模型的实际效果有待进一步验证 综述基于片段的计算机药物设计(FBDD)的最新发展,并讨论未来挑战 FBDD中的计算机方法,特别是AI-ML技术及其在药物发现中的应用 机器学习 NA 计算药物设计,计算机辅助药物设计 强化学习模型,变分自编码器,生成模型 分子结构数据 NA NA VAE,强化学习模型 NA NA
299 2026-06-08
Unified model with random penalty entropy loss for robust nasogastric tube placement analysis in X-ray
2026-Feb, Computerized medical imaging and graphics : the official journal of the Computerized Medical Imaging Society IF:5.4Q1
研究论文 提出一个统一的深度学习模型,结合随机惩罚熵损失,用于X射线图像中鼻胃管放置的稳健分析 首次将随机惩罚熵损失引入鼻胃管放置评估,动态调整熵惩罚以提高模型鲁棒性和校准性能 外部数据集性能仍有提升空间,且模型在极端不清晰病例中的表现未充分评估 提升鼻胃管放置自动评估的泛化能力和可靠性,减少诊断错误并改善患者安全 鼻胃管放置位置评估中的医学X射线图像 计算机视觉 鼻胃管放置相关病症 X射线成像 统一深度神经网络(基于nnUNet) 图像(X射线) 内部数据集5674张胸片(来自三家韩国医院),外部数据集来自MIMIC-CXR NA nnUNet F1分数,AUROC,MCE,ECE 未指定
300 2026-06-08
Learning geometric and visual features for medical image segmentation with vision GNN
2026-Feb, Computerized medical imaging and graphics : the official journal of the Computerized Medical Imaging Society IF:5.4Q1
研究论文 提出名为MedSegViG的模型,该模型基于视觉图神经网络(ViG)的层次编码器和混合特征解码器,用于医学图像分割 首次将视觉图神经网络(ViG)应用于医学图像分割,通过将图像表示为图结构来捕捉对象之间的关系,而非传统的网格结构 未提及具体限制 提高医学图像分割的准确性、鲁棒性和泛化能力,通过考虑图像中对象之间的关系 息肉、皮肤病变和视网膜血管三种病变类型的医学图像 计算机视觉 息肉, 皮肤病变, 视网膜血管疾病 NA 视觉图神经网络(ViG) 医学图像 六个数据集,涵盖三种病变类型 NA 基于ViG的层次编码器,混合特征解码器 分割准确性, 鲁棒性, 泛化能力 NA
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