深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
2981	2025-10-06	Artificial intelligence for early diagnosis and risk prediction of periodontal-systemic interactions: Clinical utility and future directions 2025-Dec-20, World journal of methodology DOI:10.5662/wjm.v15.i4.105516 PMID:40900876	系统综述	评估人工智能在牙周病与全身性疾病相互作用早期诊断和风险预测中的临床应用价值	首次系统评估AI整合多组学数据和先进影像技术在牙周-全身性疾病相互作用中的诊断和预测能力	仅纳入2010-2024年期间样本量≥500的研究，可能存在发表偏倚	评估人工智能在牙周-全身性疾病相互作用诊断和风险预测中的作用	牙周病患者及其与全身性疾病的相互作用	医疗人工智能	牙周病及相关全身性疾病	多组学数据整合，锥形束CT，磁共振成像	机器学习，深度学习，自然语言处理	临床数据，影像数据，文本数据	500-1500名参与者	NA	NA	准确率，特异性，敏感性	NA
2982	2025-10-06	Adversarial learning for beamforming domain transfer in ultrasound medical imaging 2025-Dec, Ultrasonics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.ultras.2025.107749 PMID:40674811	研究论文	本研究利用生成对抗网络将平面波DAS超声图像转换为类似F-DMAS质量的图像	首次将GAN应用于超声波束形成域转换，提出使用纹理分析验证生成图像质量	需要依赖专家定性评估，且原始RF数据不可得时的方法限制	提升B模式超声图像质量，实现波束形成域转换	超声医学图像	医学影像处理	NA	超声成像，生成对抗网络	GAN	超声图像	NA	NA	Pix2Pix, Pyramidal Pix2Pix, CycleGAN	RMSE, PSNR, 对比度改善指数, 纹理特征参数	NA
2983	2025-10-06	Integration of pre-trained GRU and molecular docking for virtual screening of quinoa seed derived ACE inhibitory peptides: An innovative prediction strategy 2025-Nov-15, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.145591 PMID:40712418	研究论文	本研究开发了一种结合预训练GRU模型和分子对接的创新策略，用于从藜麦种子蛋白中筛选ACE抑制肽	提出预训练门控循环单元模型结合分子对接的创新预测策略，通过迁移学习解决数据稀缺问题，使用平衡MSE损失缓解标签不平衡	数据稀缺和标签不平衡问题仍需进一步解决	开发高效的生物活性肽虚拟筛选方法	发芽藜麦种子蛋白衍生的ACE抑制肽	自然语言处理, 生物信息学	心血管疾病	分子对接, 虚拟筛选	GRU	序列数据	NA	NA	预训练GRU	R平方值	NA
2984	2025-10-06	Deep learning algorithm-assisted non-destructive detection of TBARS values of salmon flesh using multi-modal molecular spectra fusion 2025-Nov-15, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.145649 PMID:40712430	研究论文	提出一种基于深度学习框架的非破坏性检测方法，通过融合多模态分子光谱评估鲑鱼肉脂质氧化程度	首次将多模态分子光谱（近红外和拉曼）与卷积神经网络结合，实现动态存储条件下TBARS值的端到端预测	NA	开发非破坏性检测方法评估鲑鱼肉在多种存储条件下的脂质氧化程度	鲑鱼肉样品	计算机视觉	NA	多模态分子光谱（近红外光谱和拉曼光谱）	CNN	光谱数据	NA	NA	CNN	Rₚ, RPD	NA
2985	2025-10-06	Decoding olfactory response from neurophysiological signal with a multi modal deep learning framework 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107775 PMID:40609506	研究论文	提出一种多模态深度学习框架TACAF，通过融合脑电图和呼吸信号来解码嗅觉反应	开发了Token对齐和交叉注意力融合网络(TACAF)，首次将呼吸信号与脑电图同步融合用于嗅觉解码	样本量较小(20名受试者)，未考虑个体差异对结果的影响	通过多模态深度学习更好地理解嗅觉感知的神经特征	人类嗅觉系统的时域动态特征	机器学习	NA	脑电图(EEG)，呼吸信号监测	深度学习，注意力机制	神经生理信号，时间序列数据	20名受试者	NA	TACAF，多头自注意力机制，TTSA模块	识别性能	NA
2986	2025-10-06	MSC-transformer-based 3D-attention with knowledge distillation for multi-action classification of separate lower limbs 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107806 PMID:40614457	研究论文	提出基于多尺度可分离卷积Transformer的滤波器-空间-时间注意力模型(MSC-T3AM)，用于下肢多动作分类	首次在EEG分析中结合维度特异性注意力机制与多尺度可分离卷积，并采用在线知识蒸馏技术提升模型性能	未明确说明数据集规模和多样性限制，模型复杂度可能较高	解决下肢运动想象、真实运动和运动观察的多动作分类问题	下肢分离动作的脑电图信号	脑机接口, 机器学习	运动功能障碍	脑电图(EEG)	Transformer, CNN	脑电图时序信号	NA	PyTorch (基于代码仓库推断)	MSC-T3AM, 多尺度可分离卷积, 自注意力机制	分类准确率	NA
2987	2025-10-06	Flexible visually secure image encryption with meta-learning compression and chaotic systems 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107799 PMID:40618469	研究论文	提出一种融合元学习、混沌系统和深度学习的视觉安全图像加密方案	设计了具有动态辅助输入的元学习压缩重建网络，构建了新型IS-DP混沌系统，结合LSB-2校正嵌入方法实现灵活可调的加密方案	NA	解决现有图像加密方案安全性不足和解密图像质量低的问题	数字图像的加密与压缩	计算机视觉	NA	元学习, 混沌系统, 深度学习, LSB嵌入	深度学习网络	图像	NA	NA	元学习压缩重建网络	运行时间, 解密图像质量	NA
2988	2025-10-06	Redesigning deep neural networks: Bridging game theory and statistical physics 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107807 PMID:40633289	研究论文	提出一种结合博弈论和统计物理学的深度图表示方法，用于统一特征提取和模式分类	将神经网络神经元重新设计为博弈论模型中的玩家和统计物理学中的粒子，通过Shapley值和Banzhaf权力指数实现模型正则化和可解释性增强	仅在人脸年龄估计和性别分类任务上验证，未在其他领域测试	通过融合博弈论和统计物理学原理重新设计深度神经网络架构	深度神经网络中的神经元和网络层	机器学习	NA	深度图表示	深度神经网络	图像数据	NA	NA	多层感知机,卷积神经网络	效率,准确率	NA
2989	2025-10-06	Combining aggregated attention and transformer architecture for accurate and efficient performance of Spiking Neural Networks 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107789 PMID:40633294	研究论文	提出一种结合脉冲神经网络低功耗特性与Transformer高性能优势的新型模型架构SAFormer	设计了脉冲聚合自注意力机制(SASA)，仅使用脉冲矩阵计算注意力权重，显著简化计算过程并降低能耗	未明确说明模型在更复杂任务或更大规模数据集上的扩展性	探索脉冲神经网络与Transformer模型的融合，实现低功耗高性能计算	脉冲神经网络(SNNs)和Transformer模型	计算机视觉, 机器学习	NA	脉冲神经网络, 自注意力机制	Transformer, SNN	图像数据, 事件相机数据	在CIFAR-10、CIFAR-100、Tiny-ImageNet、DVS128-Gesture和CIFAR10-DVS数据集上评估	NA	SAFormer, Spike Aggregated Self-Attention (SASA), Depthwise Convolution Module (DWC)	准确率, 能耗	NA
2990	2025-10-06	CosELU: An improved activation deep neural network for EEG signal recognition in stroke patients 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107800 PMID:40633296	研究论文	本文提出了一种改进的激活函数CosELU用于中风患者脑电信号识别	开发了自适应激活函数CosELU，通过可调参数a和自适应参数λ监控梯度，缓解梯度爆炸和梯度消失问题	仅在中风患者数据集上验证，未在其他疾病或更大规模数据集上测试	提高中风患者运动想象脑电信号的识别准确率	中风患者的运动想象脑电信号	脑机接口	中风	脑电信号采集	CNN	脑电信号	中风患者数据集	NA	注意力机制卷积神经网络	识别率	NA
2991	2025-10-06	CGNet: A Complex-valued Graph Network for jointly learning amplitude-phase information in EEG-based brain-computer interfaces 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107795 PMID:40644990	研究论文	提出一种用于脑电信号幅相信息联合学习的复数值图网络	首次构建复数值图网络同时编码幅相信息，设计双尺度卷积、空间注意力模块和动态图卷积来捕获局部时空信息和全局时间依赖	NA	开发能够联合学习脑电信号幅相信息的深度学习模型	基于脑电信号的脑机接口系统	机器学习	NA	脑电信号分析	图神经网络,CNN	脑电信号	NA	NA	CGNet,FBCGNet	分类准确率	NA
2992	2025-10-06	Similarity-based prototype reconstruction and feature reorganization for non-exemplar class incremental learning 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107837 PMID:40664157	研究论文	提出一种基于相似性的原型重建和特征重组方法来解决非示例类增量学习中的灾难性遗忘问题	设计了特征重组机制持续更新原型以适应增量学习中模型更新导致的特征空间变化，并提出基于相似性的原型重建方法选择新数据特征重建旧数据特征	NA	缓解深度学习在增量学习中的灾难性遗忘问题	非示例类增量学习场景下的深度学习模型	计算机视觉	NA	NA	深度学习	图像	在CIFAR-100、TinyImageNet和ImageNet-Sub三个基准数据集上验证	NA	NA	NA	NA
2993	2025-10-06	SimTA++: Simple attention neural network for clinical asynchronous time series 2025-Nov, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107735 PMID:40570801	研究论文	提出一种用于临床异步时间序列建模的简单注意力神经网络SimTA++	引入简单时间依赖注意力机制和非线性时间注意力机制，能够捕捉异步时间步之间的关系和非单调时间关系	NA	解决临床实践中异步时间序列数据的建模挑战	临床异步时间序列数据	机器学习	NA	深度学习	注意力神经网络	异步时间序列数据	三个基准数据集（包括合成概念验证数据集、PhysioNet 2019和内部免疫治疗响应预测数据集）	PyTorch	SimTA, SimTA++	NA	NA
2994	2025-10-06	A Survey of Deep Learning in Sports Applications: Perception, Comprehension, and Decision 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3554801 PMID:40138241	综述	本文系统综述了深度学习在体育应用中的研究进展，涵盖感知、理解和决策三个层次	首次从算法、数据集与虚拟环境、挑战三个维度系统梳理深度学习在体育领域的应用现状	作为综述文章，未提出新的算法模型或实验验证	为深度学习在体育应用中的研究提供全面的参考指南	深度学习在体育领域的算法、数据集和挑战	计算机视觉,自然语言处理,机器学习	NA	NA	NA	图像,视频,文本	NA	NA	NA	NA	NA
2995	2025-10-06	PhenoLearn: a user-friendly toolkit for image annotation and deep learning-based phenotyping for biological datasets 2025-Sep-06, Journal of evolutionary biology IF:2.1Q3 DOI:10.1093/jeb/voaf058 PMID:40366779	研究论文	介绍PhenoLearn工具包，帮助生物学家通过深度学习对2D标本图像进行注释和表型分析	开发了用户友好的图形界面工具包，使非计算机专业的生物学家能够轻松使用深度学习技术	NA	为生物学家提供易于使用的深度学习工具，用于生物数据集中的图像注释和表型分析	2D标本图像，特别是鸟类羽毛区域分割	计算机视觉	NA	深度学习，图像分割	深度学习模型	图像	NA	NA	NA	预测准确度，运行时间	GPU和CPU（比较有无GPU时的运行时间）
2996	2025-10-06	Research based on EEG for addiction level assessment methods and parietal/occipital lobes brain function analysis 2025-Sep-06, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3 DOI:10.1080/10255842.2025.2551014 PMID:40913522	研究论文	提出一种基于脑电图的甲基苯丙胺使用障碍评估方法，结合深度学习、可视化和时频域分析	使用增强型紧凑卷积神经网络ECCN-Net进行EEG分类，结合CAM可视化识别关键脑区通道	NA	开发准确的成瘾程度评估方法并分析顶叶/枕叶脑功能	甲基苯丙胺使用障碍患者的脑电图数据	机器学习	药物成瘾	脑电图	CNN	脑电图信号	NA	NA	ECCN-Net	准确率	NA
2997	2025-10-06	Artificial intelligence-assisted assessment of metabolic response to tebentafusp in metastatic uveal melanoma: a long axial field-of-view [18F]FDG PET/CT study 2025-Sep-06, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1 DOI:10.1007/s00259-025-07504-8 PMID:40913640	研究论文	本研究评估人工智能辅助的[18F]FDG长轴视野PET/CT在转移性葡萄膜黑色素瘤患者接受tebentafusp治疗中的代谢反应评估可行性和预后价值	首次将人工智能辅助量化与长轴视野PET/CT结合用于tebentafusp治疗的转移性葡萄膜黑色素瘤代谢反应评估	样本量较小（15例患者），部分生存分析结果仅显示趋势而未达统计学显著性	探索AI辅助的PET/CT代谢参数在转移性葡萄膜黑色素瘤治疗监测和预后评估中的应用价值	接受tebentafusp治疗的转移性葡萄膜黑色素瘤患者	数字病理	葡萄膜黑色素瘤	[18F]FDG PET/CT成像，循环肿瘤DNA检测	深度学习	医学影像（PET/CT），分子生物学数据	15例转移性葡萄膜黑色素瘤患者	RECOMIA平台	NA	总生存期，p值	NA
2998	2025-10-06	Multi-task learning for classification and prediction of adolescent idiopathic scoliosis based on fringe-projection three-dimensional imaging 2025-Sep-06, European spine journal : official publication of the European Spine Society, the European Spinal Deformity Society, and the European Section of the Cervical Spine Research Society IF:2.6Q1 DOI:10.1007/s00586-025-09340-8 PMID:40913670	研究论文	基于条纹投影三维成像开发多任务学习模型用于青少年特发性脊柱侧凸的分类和预测	首次将多任务深度学习应用于脊柱侧凸评估，通过联合学习Cobb角预测和曲线分类任务提取共享形态特征	未明确说明样本来源和数据集划分细节，缺乏外部验证结果	开发无创无辐射的脊柱侧凸诊断框架以替代传统X射线评估	青少年特发性脊柱侧凸患者	计算机视觉	脊柱侧凸	条纹投影三维成像	深度学习	三维表面数据	NA	NA	多任务深度学习模型	平均绝对误差,均方根误差,相关系数,决定系数,灵敏度,阳性预测值	NA
2999	2025-10-06	Interictal Epileptiform Discharge Detection using Dual-domain Features and GAN 2025-Sep-05, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3605257 PMID:40911454	研究论文	提出一种融合卷积层和Transformer的IED检测器，结合GAN进行数据增强，用于自动检测癫痫样放电	首次将卷积层与Transformer结合用于IED检测，并提出基于Transformer的GAN进行数据增强	IED数据稀缺问题仍未完全解决，模型在更广泛数据集上的泛化能力有待验证	开发自动检测癫痫样放电的深度学习模型	癫痫患者的脑电图数据	机器学习	癫痫	脑电图	CNN, Transformer, LSTM, GAN	脑电图时间序列数据	两个数据集（具体数量未明确说明）	NA	Transformer, CNN, LSTM, GAN	准确率, 灵敏度, 精确率	NA
3000	2025-10-06	Fundus Image Enhancement With Pyramid Conditional Flow 2025-Sep-05, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3600277 PMID:40911458	研究论文	提出一种基于金字塔条件流的眼底图像增强方法，通过学习高质量眼底图像的复杂分布而非像素级映射来改善图像质量	首次将归一化流方法应用于眼底图像增强，通过视网膜结构作为条件约束和金字塔结构识别视网膜特征频率成分	未明确说明方法在特定病理条件下的泛化能力	开发能够保留临床重要信息的眼底图像增强方法	低质量眼底图像	计算机视觉	眼科疾病	深度学习	归一化流	眼底图像	NA	NA	金字塔条件流(PCFlow)	NA	NA