深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
3121	2025-10-06	A simulation study of 1D U-Net-based inter-crystal scatter event recovery of PET detectors 2023-07-10, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ace1d1 PMID:37364572	研究论文	本研究提出一种基于1D U-Net的卷积神经网络，用于预测PET探测器中的晶体间散射事件首次相互作用位置	首次将1D U-Net结构应用于PET晶体间散射恢复问题，相比传统方法和全连接网络方法具有更好的稳定性和更少的网络参数	基于模拟数据训练，尚未在真实临床数据上验证	解决正电子发射断层扫描中晶体间散射导致的首次相互作用位置确定问题	PET探测器中的晶体间散射事件	医学影像处理	NA	GATE蒙特卡洛模拟	CNN	模拟数据	NA	NA	1D U-Net	准确率, 灵敏度, 对比噪声比, 空间分辨率	NA
3122	2025-10-06	HyperTDP-Net: A Hyper-densely Connected Compression-and-Decomposition Network Based on Trident Dilated Perception for PET and MRI Image Fusion 2023-07-05, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/acdec3 PMID:37321243	研究论文	提出一种基于三叉戟扩张感知的超密集连接压缩分解网络，用于PET和MRI医学图像融合	构建双残差超密集模块充分利用中间层信息，建立三叉戟扩张感知模块精确定位特征位置，并提出包含结构相似性损失和梯度损失的内容感知损失函数	NA	提高医学图像融合质量，生成包含更全面多模态特征的融合图像	PET和MRI医学图像	计算机视觉	NA	医学图像融合	CNN	医学图像	来自哈佛医学院发布的多模态医学图像数据集	NA	超密集连接网络,残差网络	结构相似性,梯度保持,边缘信息保持,纹理细节保持	NA
3123	2025-10-06	Fast and scalable search of whole-slide images via self-supervised deep learning 2022-12, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1 DOI:10.1038/s41551-022-00929-8 PMID:36217022	研究论文	提出一种基于自监督深度学习的全切片图像快速检索方法SISH	开发了检索速度与数据库大小无关的WSI检索算法，仅需切片级别标注即可训练	NA	开发无需监督训练的全切片图像快速检索方法	全切片图像(WSI)	数字病理学	癌症	自监督深度学习	深度学习	图像	超过22,000例患者病例，56种疾病亚型	NA	SISH	NA	NA
3124	2025-10-06	mbSparse: an autoencoder-based imputation method to address sparsity in microbiome data 2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2025.2552347 PMID:40888610	研究论文	提出一种基于自编码器的微生物组数据插补方法mbSparse，用于解决微生物组数据高稀疏性问题	采用深度学习而非传统预定义计数分布，结合特征自编码器和条件变分自编码器(CVAE)进行数据重建	NA	解决微生物组数据高稀疏性带来的分析挑战	微生物组数据	机器学习	结直肠癌	微生物组测序	自编码器,条件变分自编码器	计数矩阵数据	NA	NA	自编码器,CVAE	均方误差,精确召回曲线下面积,皮尔逊相关系数	NA
3125	2025-10-06	Diagnostic performance of dual-layer spectral CT Radiomics and deep learning for differentiating osteoblastic bone metastases from bone islands 2025-Dec, European journal of radiology open IF:1.8Q3 DOI:10.1016/j.ejro.2025.100679 PMID:40895390	研究论文	比较双层光谱CT影像组学特征和深度学习模型在鉴别成骨性骨转移与骨岛方面的诊断性能	首次将双层光谱探测器CT的影像组学特征与深度学习模型在骨病变鉴别诊断中进行系统比较	回顾性研究设计，样本量相对有限，仅纳入特定时间段内的患者	评估不同影像学方法在鉴别成骨性骨转移和骨岛方面的诊断效能	成骨性骨病变患者	医学影像分析	骨肿瘤	双层光谱探测器CT，常规CT	深度学习模型	CT影像	94名患者的216个病灶（125个骨岛，91个成骨性骨转移）	NA	NA	AUC, 敏感性, 特异性	NA
3126	2025-10-06	Deep Learning with Disc Photos or OCT Scans in Glaucoma Detection 2025 Nov-Dec, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2025.100877 PMID:40893625	研究论文	比较基于OCT RNFLT图谱和视盘照片的深度学习模型在青光眼检测中的性能差异	首次系统比较基于OCT客观定量测量与视盘照片的深度学习模型在青光眼功能损伤诊断中的性能，并分析不同人口学群体的诊断差异	回顾性单中心研究，数据来源于特定时间段(2011-2022年)，可能存在选择偏倚	评估基于OCT和视盘照片的深度学习模型在青光眼检测中的诊断准确性	青光眼患者，基于视野检查定义的功能损伤	医学影像分析	青光眼	OCT光学相干断层扫描，视野检查	深度学习模型	医学影像(OCT RNFLT图谱，视盘照片)	16,936组视盘照片和OCT图像数据集	NA	NA	AUC曲线下面积，准确率	NA
3127	2025-10-06	Multimodal data-driven approaches in retinal vein occlusion: A narrative review integrating machine learning and bioinformatics 2025 Nov-Dec, Advances in ophthalmology practice and research DOI:10.1016/j.aopr.2025.07.002 PMID:40893475	综述	整合机器学习和生物信息学的多模态数据驱动方法在视网膜静脉阻塞研究中的应用综述	首次系统整合机器学习与生物信息学方法，通过深度学习增强的视网膜成像和多组学网络研究视网膜静脉阻塞	存在数据标准化不一致和模型泛化能力有限的问题	推进视网膜静脉阻塞研究并优化患者护理	视网膜静脉阻塞(RVO)患者	机器学习,生物信息学	视网膜静脉阻塞	多模态数据整合,深度学习增强视网膜成像,多组学网络	深度学习	多模态数据,视网膜图像,多组学数据	NA	NA	NA	NA	NA
3128	2025-10-06	Progressive Knowledge Transfer Network Based on Human Visual Perception Mechanism for No-Reference Point Cloud Quality Assessment 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3532651 PMID:40031145	研究论文	提出一种基于人类视觉感知机制的无参考点云质量评估深度学习网络PKT-PCQA	通过渐进式知识转移将粗粒度质量分类知识转换为细粒度质量预测任务，模拟人类视觉系统	NA	点云感知质量评估	点云数据	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	点云	三个大型独立点云评估数据集	NA	基于空间和通道注意力模块的注意力机制	NA	NA
3129	2025-10-06	Deep Point Cloud Edge Reconstruction via Surface Patch Segmentation 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3547411 PMID:40031714	研究论文	提出一种通过表面面片分割实现点云边缘精确重建的两阶段框架	首次利用表面面片分割为边缘重建提供额外线索，通过联合优化模块重建完整精确的3D线框模型	未明确说明方法在复杂噪声环境下的鲁棒性	解决点云数据参数化边缘重建中因边缘点稀疏导致的拟合误差问题	CAD模型和日常物体（家具）的点云数据	计算机视觉	NA	点云处理	深度学习网络	点云数据	包含CAD和日常模型的多功能面片-边缘数据集	NA	PCER-Net	通过广泛实验和与先前方法的比较评估	NA
3130	2025-10-06	Single-View 3D Hair Modeling With Clumping Optimization 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3552919 PMID:40111766	研究论文	提出一种从单张图像重建具有发束效果的三维头发模型的方法	将头发发束效果整合到单视角头发重建中，引入分层头发表示和可微分优化框架	未明确说明	提升单视角头发重建的真实感，特别是发束效果的表现	头发几何模型	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA	NA	NA	定性评估,定量评估	NA
3131	2025-10-06	Fast and Robust Single-Shot Cine Cardiac MRI Using Deep Learning Super-Resolution Reconstruction 2025-Oct-01, Investigative radiology IF:7.0Q1 DOI:10.1097/RLI.0000000000001186 PMID:40184545	研究论文	本研究比较了深度学习超分辨率重建的单次激发心脏电影MRI与标准多次激发心脏电影MRI的诊断质量	首次将工业开发的深度学习超分辨率算法应用于单次激发心脏电影MRI重建，显著缩短扫描时间的同时保持非劣诊断质量	样本量相对较小（45名参与者），缺乏多中心验证	评估深度学习重建单次激发心脏电影MRI在临床诊断中的可行性和图像质量	具有心脏MRI临床适应症的参与者	医学影像分析	心血管疾病	平衡稳态自由进动序列，压缩感知，深度学习超分辨率重建	深度学习超分辨率算法	心脏MRI图像	45名参与者（平均年龄50±18岁，30名男性）	NA	NA	主观图像质量评分，边缘上升距离，表观信噪比，对比噪声比，Bland-Altman分析，Pearson相关系数	NA
3132	2025-10-06	Eliminating Rasterization: Direct Vector Floor Plan Generation With DiffPlanner 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3559682 PMID:40208765	研究论文	提出一种直接在向量空间生成边界约束平面图的深度学习框架DiffPlanner	首次在向量空间直接生成平面图，避免了传统方法中矢栅转换造成的信息损失；采用基于Transformer的条件扩散模型，集成对齐机制模拟设计师的迭代设计过程	NA	解决边界约束平面图生成问题，直接生成房间的拓扑和几何属性	建筑平面图和气泡图	计算机视觉	NA	深度学习	扩散模型, Transformer	向量数据	NA	NA	Transformer	定量比较, 定性评估, 消融实验, 感知研究	NA
3133	2025-10-06	FLINT: Learning-Based Flow Estimation and Temporal Interpolation for Scientific Ensemble Visualization 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3561091 PMID:40232923	研究论文	提出一种基于深度学习的FLINT方法，用于科学集成数据的流场估计和时间插值	首个从科学集成数据中执行流场估计的方法，能在原始流信息缺失的情况下生成对应流场	NA	开发科学集成数据的流场估计和时间插值方法	2D+时间和3D+时间的科学集成数据	科学可视化	NA	深度学习	CNN	科学集成数据，标量场	NA	NA	卷积层，反卷积层	性能，准确性	NA
3134	2025-10-06	ASight: Fine-Tuning Auto-Scheduling Optimizations for Model Deployment via Visual Analytics 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3574194 PMID:40440148	研究论文	提出ASight视觉分析系统，帮助工程师理解自动调度生成的底层代码并优化深度学习模型部署性能	开发了子图匹配算法识别中间表示中的图同构，并提出增强的可视化方法来分析自动调度的大规模搜索空间	NA	通过视觉分析系统改进深度学习模型部署时的自动调度优化	深度学习模型的自动调度优化过程	机器学习	NA	视觉分析，子图匹配算法	NA	中间表示，性能指标，计算图	两个案例研究（本地机器和数据中心）	NA	NA	推理延迟	本地机器，数据中心
3135	2025-10-06	Machine and deep learning methods for epileptic seizure recognition using EEG data: A systematic review 2025-Oct-01, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2025.149797 PMID:40562194	系统综述	对基于EEG数据的机器学习和深度学习方法在癫痫发作识别中的应用进行系统性回顾和分析	首次全面涵盖癫痫发作检测、分类和预测三大任务，并分析可解释AI、迁移学习和联邦学习等新兴趋势	仅基于PubMed数据库2013-2023年的研究，可能未涵盖所有相关文献	评估机器学习和深度学习在癫痫发作识别中的效果、可解释性和临床应用性	癫痫患者的EEG信号数据	机器学习	癫痫	脑电图	机器学习,深度学习	EEG信号	NA	NA	NA	准确率	NA
3136	2025-10-06	A Study of Data Augmentation for Learning-Driven Scientific Visualization 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3587685 PMID:40638349	研究论文	本研究系统评估了九种数据增强技术在科学可视化任务中的有效性	首次对多种数据增强技术在科学可视化领域进行系统性比较研究，揭示了数据量增加和单域多样性提升对模型性能的积极影响	研究仅针对空间超分辨率和环境光遮蔽预测两个特定任务，结论可能不适用于其他科学可视化任务	探索数据增强技术在解决科学可视化中训练数据稀缺问题的有效性	科学可视化数据集和深度学习模型	科学可视化	NA	数据增强技术	深度学习模型	科学可视化数据	多个具有不同特征的科学数据集	NA	NA	数据质量，渲染保真度，优化时间，内存消耗	NA
3137	2025-10-06	A Comprehensive Survey on 3D Single-View Object Reconstruction 2025-Oct, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2025.3591770 PMID:40699970	综述	本文系统综述了基于单视图的3D物体重建技术，特别关注了基于新视角合成方法的最新进展，并提出了一种更符合人类视觉感知的评估方法	首次全面覆盖基于新视角合成的单视图3D重建方法，提出考虑部件显著性的加权评估方法，开发自动感知重建差异的新技术	作为综述文章，主要整合现有研究而非提出全新算法，新评估方法尚未在实际应用中广泛验证	填补单视图3D物体重建领域现有综述的空白，特别关注新视角合成方法的发展，改进评估体系以更好反映人类视觉感知	单视图3D物体重建技术，特别是基于新视角合成的方法	计算机视觉	NA	深度学习，新视角合成	NA	2D图像，3D形状数据	NA	NA	NA	加权评估方法，考虑部件显著性的指标，自动感知重建差异技术	NA
3138	2025-10-06	CT-SCOPE: annotated dataset of CT SCans for the automatic semantic segmentation of the Osseous structures of the Paranasal sinusEs 2025-Oct, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2025.111962 PMID:40896122	研究论文	本文介绍了用于鼻旁窦骨结构自动语义分割的CT扫描数据集	创建了首个包含多医院、多CT设备采集的鼻旁窦CT扫描注释数据集，并提供了自动生成的伪标签	仅40名受试者，其中仅13名有手动注释，样本量相对较小	开发用于医学图像分析的深度学习语义分割模型	鼻旁窦周围骨结构	数字病理	鼻窦疾病	CT扫描	NA	医学图像	40名受试者（13名手动注释，27名未注释），共696个配对CT切片和掩码	NA	NA	NA	NA
3139	2025-10-06	UMATBrush: A dataset of inertial signals of toothbrushing activities 2025-Oct, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2025.111980 PMID:40896134	研究论文	介绍UMATBrush数据集，包含通过智能手表采集的刷牙活动惯性信号数据	首个专门针对刷牙活动监测的惯性信号数据集，包含受试者日常生活的长期监测数据	仅包含4名实验受试者的数据，样本规模有限	开发基于惯性传感器信号的人类活动识别系统，特别关注刷牙活动监测	人类刷牙活动	机器学习	口腔健康	惯性传感器信号采集	NA	惯性信号（加速度数据）	4名实验受试者，大量刷牙会话	NA	NA	NA	NA
3140	2025-10-06	Stress-strain and fracture acoustic emission dataset of high-strength concrete for metro tunnel lining under different stress states 2025-Oct, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2025.111973 PMID:40896120	研究论文	本文提出了一个包含地铁隧道衬砌高强混凝土在不同应力状态下应力应变行为和断裂声发射特性的新型数据集	首次提供了地铁隧道衬砌高强混凝土在多种应力状态下的综合数据集，包含应力应变数据、声发射数据和损伤图像	NA	解决地铁隧道衬砌工程问题并促进相关科学研究	地铁隧道衬砌高强混凝土	材料科学	NA	声发射检测、应力应变测试、高分辨率成像	NA	图像、应力应变数据、声发射数据	NA	NA	NA	NA	MTS815.04力学测试系统、AE传感器、应力应变传感器、高分辨率相机