深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
341	2025-09-28	Deep Learning Method Based on Multivariate Variational Mode Decomposition for Classification of Epileptic Signals 2025-Aug-27, Brain sciences IF:2.7Q3 DOI:10.3390/brainsci15090933 PMID:41008293	研究论文	提出一种结合多元变分模态分解的深度学习框架，用于癫痫信号的分类和癫痫灶定位	首次将多元变分模态分解与深度学习结合，通过保持通道间模态对齐有效解决模态混叠和失配问题	NA	提高癫痫信号分类精度，为临床诊断提供更准确的癫痫灶定位信息	多通道癫痫脑电信号	机器学习	癫痫	多元变分模态分解	深度学习框架	脑电信号	Bern-Barcelona数据库和TUSZ数据库（具体样本数未明确说明）
342	2025-09-28	Deep Learning-Powered Down Syndrome Detection Using Facial Images 2025-Aug-27, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15091361 PMID:41010303	研究论文	开发并验证了一种基于面部图像的唐氏综合征早期检测深度学习模型	提出结合RegNet X-MobileNet V3和ViT-Linformer的混合特征提取架构，采用自适应注意力特征融合机制	NA	开发非侵入性、公平的唐氏综合征筛查工具	婴儿面部图像	计算机视觉	唐氏综合征	深度学习	RegNet X-MobileNet V3, ViT-Linformer, ExtraTrees	图像	NA
343	2025-09-28	Deep Learning Algorithm to Determine the Presence of Rectal Cancer from Transrectal Ultrasound Images 2025-Aug-27, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15091358 PMID:41010300	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习算法的CNN模型，用于通过经直肠超声图像自动识别直肠癌	首次将EfficientNetV2-S架构应用于经直肠超声图像的直肠癌自动检测，为临床提供决策支持工具	研究为回顾性设计，样本量有限，模型泛化能力需进一步验证，且未实现癌症分期分类	开发并评估用于直肠癌检测的深度学习模型	经直肠超声图像（直肠癌病例和正常直肠组织）	计算机视觉	直肠癌	深度学习	CNN（EfficientNetV2-S架构）	医学图像	681张经直肠超声图像（533张直肠癌，148张正常直肠）
344	2025-09-28	The Path Towards Effective Long-Lasting Tissue-Targeted Prime/Pull/Keep Herpes Simplex Therapeutic Vaccines 2025-Aug-27, Vaccines IF:5.2Q1 DOI:10.3390/vaccines13090908 PMID:41012114	综述	本文探讨了针对单纯疱疹病毒（HSV）的有效长效组织靶向Prime/Pull/Keep治疗性疫苗的开发路径	提出结合组学、人工智能和深度学习技术设计组织靶向疫苗新策略，通过Prime/Pull/Keep三步骤在感染中枢和外周组织诱导持久T细胞免疫	目前研究仍处于临床前动物模型试验阶段，尚未进行人体临床试验	开发针对HSV-1和HSV-2的有效长效治疗性疫苗	单纯疱疹病毒类型1和2（HSV-1/HSV-2）	疫苗研发	疱疹病毒感染	组学技术、人工智能、深度学习	NA	NA	临床前动物模型试验
345	2025-09-28	Real-Time Global Longitudinal Strain During Echocardiography: A Deep Learning Platform for Improved Workflow 2025-Aug-26, Journal of the American Society of Echocardiography : official publication of the American Society of Echocardiography IF:5.4Q1 DOI:10.1016/j.echo.2025.08.015 PMID:40876495	研究论文	开发用于超声心动图实时全自动全局纵向应变分析的深度学习平台	首次实现实时GLS分析的完全自动化深度学习平台，集成标准化工具并显著提升工作流程效率	样本量较小（50例患者），需更大规模研究验证	评估深度学习辅助实时GLS测量的可行性、精确性和时间效率	50名接受超声心动图检查的患者（平均年龄56岁，64%男性）	医学影像分析	心血管疾病	超声心动图，深度学习	深度学习平台	医学影像	50例患者
346	2025-09-28	Diagnosis of Periodontitis via Neutrophil Degranulation Signatures Identified by Integrated scRNA-Seq and Deep Learning 2025-Aug-26, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes16091005 PMID:41009952	研究论文	本研究结合单细胞转录组学与深度学习技术，通过识别中性粒细胞脱颗粒特征建立牙周炎诊断模型	首次整合scRNA-seq、hdWGCNA和CNN模型系统解析中性粒细胞脱颗粒在牙周炎中的作用机制	NA	开发基于中性粒细胞脱颗粒特征的牙周炎早期诊断和精准干预模型	人牙龈组织样本及其单细胞转录组数据	数字病理	牙周炎	scRNA-seq, hdWGCNA, 伪时间轨迹分析, 细胞通讯分析	CNN, 机器学习	基因表达数据, 免疫细胞谱数据	多队列人牙龈组织scRNA-seq和批量转录组数据集
347	2025-09-28	Artificial Intelligence in Small-Molecule Drug Discovery: A Critical Review of Methods, Applications, and Real-World Outcomes 2025-Aug-26, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/ph18091271 PMID:41011141	综述	本文批判性回顾了人工智能在小分子药物发现中的方法、应用及实际成果	系统评估AI从早期规则系统到生成模型、扩散模型及自主智能体系统的演进，并首次平衡展示成功与失败案例	存在数据质量、模型可解释性、监管障碍和伦理问题等持续挑战	评估AI作为辅助工具在小分子药物发现中的实际价值与局限性	AI驱动的药物研发案例（如巴瑞替尼、halicin等）及相关技术方法	机器学习	NA	深度学习、生成模型、扩散模型、自主智能体AI系统	生成模型、扩散模型	多模态药物研发数据	涉及多个临床阶段药物案例（包括I期至IIa期）
348	2025-09-28	Comprehensive Survey of OCT-Based Disorders Diagnosis: From Feature Extraction Methods to Robust Security Frameworks 2025-Aug-25, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12090914 PMID:41007159	综述	本文系统综述了基于光学相干断层扫描的眼部疾病诊断技术，涵盖传统特征提取和深度学习方法，并首次探讨了诊断系统的对抗攻击及防御策略	首次对OCT诊断方法进行20年研究的系统比较分析，并创新性地研究针对OCT诊断系统的对抗攻击漏洞及提出实用防御方案	NA	评估OCT眼部疾病诊断技术的性能差异并提出安全防御框架	青光眼、糖尿病视网膜病变、白内障、弱视和黄斑变性等视网膜疾病	数字病理	眼科疾病	光学相干断层扫描	传统特征提取方法和深度学习模型	医学影像	基于公共OCT数据集（未指定具体数量）
349	2025-09-28	ERLD-HC: Entropy-Regularized Latent Diffusion for Harmony-Constrained Symbolic Music Generation 2025-Aug-25, Entropy (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/e27090901 PMID:41008027	研究论文	提出一种结合变分自编码器和隐空间扩散模型的符号音乐生成框架，通过熵正则化条件随机场实现和声约束	首次在隐空间扩散模型中引入熵正则化CRF模块，通过可学习的特征函数学习经典和声规则，实现算法驱动与规则约束的平衡	尚未提供直接的外部弦条件控制功能	解决符号音乐生成中违反音乐规则的问题，特别是提升和声结构的控制能力	符号音乐数据（MIDI格式）	自然语言处理	NA	变分自编码器(VAE)、隐空间扩散模型、条件随机场(CRF)、UNet架构	VAE+Diffusion+CRF混合模型	符号音乐数据（MIDI）	Lakh MIDI数据集
350	2025-09-28	Evolving Public Attitudes Towards the HPV Vaccine in China: A Fine-Grained Emotion Analysis of Sina Weibo (2016 vs. 2024) 2025-Aug-22, Entropy (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/e27090887 PMID:41008013	研究论文	通过深度学习模型分析中国微博平台2016-2024年HPV疫苗相关推文的情感演变	首次采用细粒度情感分析结合结构熵方法揭示HPV疫苗话题的情感传播网络动态	仅基于单一社交媒体平台数据，可能无法完全代表整体公众态度	探究中国公众对HPV疫苗态度的演变规律及情感传播机制	新浪微博平台2016-2024年发布的38,615条HPV疫苗相关推文	自然语言处理	宫颈癌	深度学习情感分析、结构熵分析	深度学习模型	社交媒体文本	38,615条微博推文
351	2025-09-28	Characterizing the Impact of Training Data on Generalizability: Application in Deep Learning to Estimate Lung Nodule Malignancy Risk 2025-08-20, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240636 PMID:40833260	研究论文	本研究探讨训练数据量对深度学习算法评估肺结节恶性风险性能的影响	首次系统性地量化训练数据规模与AI算法泛化能力的关系，并确定达到临床医生水平性能所需的最小数据量	回顾性研究，数据来源于特定临床试验人群，可能影响泛化性	研究训练数据量对肺结节恶性风险预测AI算法性能的影响	低剂量CT扫描检测到的肺结节	数字病理	肺癌	深度学习	深度学习AI算法	CT图像	NLST数据集16077个标注结节（1249恶性，14828良性），DLCST测试集883个结节（65恶性，818良性）
352	2025-09-28	DeepAIPs-SFLA: Deep Convolutional Model for Prediction of Anti-Inflammatory Peptides Using Binary Pattern Decomposition of Novel Multiview Descriptors with an SFLA Approach 2025-Aug-19, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.5c02422 PMID:40852276	研究论文	提出一种基于深度学习的计算模型DeepAIPs-SFLA，用于预测抗炎肽	采用新型多视图描述符的二元模式分解方法，结合进化信息和结构特征通过图像编码，使用改进的混合蛙跳算法进行特征选择	NA	开发高精度的抗炎肽预测模型以促进炎症疾病药物研发	抗炎肽（AIPs）序列	生物信息学	炎症性疾病	RECM和PSSM嵌入、LBP和CLBP算法、差分进化特征整合	深度残差卷积神经网络（RCNN）	蛋白质序列数据	训练序列及独立验证集Ind-426和Ind-1049
353	2025-09-28	Segmenting Whole-Body MRI and CT for Multiorgan Anatomic Structure Delineation 2025-08-06, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240777 PMID:40767616	研究论文	开发并验证用于MRI和CT多器官分割的深度学习模型MRSegmentator	提出跨模态深度学习模型，首次实现MRI扫描中40个解剖结构的自动分割，并展示向CT数据的良好泛化能力	较小结构（如门静脉/脾静脉、肾上腺）的分割精度相对较低，测试样本量有限	开发能够准确分割全身MRI和CT图像中多器官解剖结构的自动化工具	人体多器官解剖结构（包括肺、心脏、肝脏、肾脏等40个结构）	医学影像分析	NA	深度学习、跨模态迁移学习	深度学习模型	医学影像（MRI、CT）	训练数据：1,200例UK Biobank Dixon MRI（50人）、221例内部腹部MRI（177患者）、1,228例CT；测试数据：900例NAKO MRI（50人）、60例AMOS22 MRI、29例TotalSegmentator-MRI
354	2025-09-28	Automated Deep Learning-based Segmentation of the Dentate Nucleus Using Quantitative Susceptibility Mapping MRI 2025-08-06, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240478 PMID:40767617	研究论文	开发基于深度学习的齿状核自动分割工具，用于定量磁敏感加权成像MRI	提出两阶段深度学习管道（定位+分割），在九大数据集上验证并超越现有最佳工具	回顾性研究，样本年龄范围有限（11-64岁）	实现齿状核的自动化精准分割	健康对照者与小脑性共济失调/多发性硬化症患者	医学影像分析	神经系统疾病	定量磁敏感加权成像（QSM）	nnU-Net框架的两阶段深度学习模型	MRI图像	328名受试者（141名健康人，187名患者）
355	2025-09-28	The Expanding Landscape of Neural Architectures and Their Impact in Biomedicine 2025-08, Annual review of biomedical data science IF:7.0Q1 DOI:10.1146/annurev-biodatasci-103023-050856 PMID:40789735	综述	本文从神经网络架构的视角探讨生物医学深度学习和人工智能的应用与发展	系统总结不同神经网络架构的设计原理及其在生物医学领域的独特优势，并展望多模态语言模型和精细化机制模型的未来趋势	NA	分析神经网络架构在生物医学深度学习中的设计原则和应用前景	神经网络架构及其在生物医学领域的应用	机器学习	NA	神经网络架构搜索、图网络、Transformer	可解释神经网络、多模态语言模型	多模态生物医学数据	NA
356	2025-09-28	Recognition and classification of facial expression using artificial intelligence as a key of early detection in neurological disorders 2025-07-28, Reviews in the neurosciences IF:3.4Q2 DOI:10.1515/revneuro-2024-0125 PMID:39829206	综述	探讨人工智能在面部表情识别与分类中应用于神经退行性疾病早期检测的研究现状	系统评述AI技术通过非侵入性面部表情分析实现神经退行性疾病早期筛查的创新应用	未涉及具体实验数据验证，主要基于现有文献的理论分析	评估AI驱动面部表情分析在神经退行性疾病早期检测中的临床潜力	阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病患者的面部表情特征	计算机视觉	神经退行性疾病	深度学习和计算机视觉技术	深度学习模型	面部图像/视频数据	NA
357	2025-09-28	Applications of deep learning in the analysis of optical coherence tomography images for glaucoma-related diagnostics 2025 Jul-Sep, Taiwan journal of ophthalmology IF:1.0Q4 DOI:10.4103/tjo.TJO-D-24-00162 PMID:40995327	综述	本文综述了深度学习在光学相干断层扫描图像分析中应用于青光眼诊断的最新研究进展	系统总结了深度学习在青光眼OCT图像分析中的多任务应用潜力，包括图像质量评估、组织厚度量化及疾病进展监测	现有技术的普适性、公平性和可解释性仍需进一步验证和完善	探讨深度学习技术在青光眼光学相干断层扫描图像分析中的临床应用价值	青光眼患者的视网膜神经纤维层和视神经组织	医学影像分析	青光眼	光学相干断层扫描	深度神经网络	医学图像	NA
358	2025-09-28	A deep learning model based on chest CT to predict benign and malignant breast masses and axillary lymph node metastasis 2025-Mar-17, Biomolecules & biomedicine DOI:10.17305/bb.2025.12010 PMID:40100034	研究论文	基于胸部CT影像开发深度学习模型，用于预测乳腺肿块良恶性及腋窝淋巴结转移	首次利用常规胸部CT影像结合ResNet深度学习架构实现乳腺病变的双重诊断任务（良恶性分类+淋巴结转移预测）	回顾性研究、样本量有限（482例）、仅使用非增强CT影像	通过深度学习提升乳腺病变的初步评估效率，减少后续昂贵检查需求	482例乳腺肿块患者（良性224例，恶性258例）的术前非增强胸部CT影像	计算机视觉	乳腺癌	胸部CT成像	ResNet-34/50/101	医学影像	482例患者（训练集:验证集:测试集=8:1:1）
359	2025-09-28	A novel deep learning framework for automatic scoring of PD-L1 expression in non-small cell lung cancer 2025-Mar-03, Biomolecules & biomedicine DOI:10.17305/bb.2025.12056 PMID:40035693	研究论文	提出一种基于深度学习的自动化框架，用于非小细胞肺癌全切片图像中PD-L1表达的自动评分	采用混合人机标注方法处理大规模WSI，并首次将Vision Transformer模型应用于PD-L1表达分类任务	研究仅基于66个NSCLC组织样本，样本规模有限	提高PD-L1肿瘤比例评分评估的精确性和一致性，为免疫治疗患者筛选提供支持	非小细胞肺癌组织样本	数字病理	肺癌	免疫组织化学	EfficientNet、Inception、Vision Transformer、UNet、DeepLabV3+、StarDist	全切片图像	66个NSCLC组织样本
360	2025-09-28	Transformer-based approaches for neuroimaging: an in-depth review of their role in classification and regression tasks 2025-02-25, Reviews in the neurosciences IF:3.4Q2 DOI:10.1515/revneuro-2024-0088 PMID:39333087	综述	深入探讨Transformer模型在神经影像分类和回归任务中的应用现状与研究进展	首次系统梳理Transformer架构在神经影像领域的应用方法论与实验成果，特别强调其在回归任务中的新兴潜力	未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述的理论分析	评估Transformer模型在神经影像分析中的适用性与发展趋势	神经影像数据（如MRI、fMRI等脑部成像数据）	医学影像分析	神经系统疾病	深度学习	Transformer	神经影像数据	NA