深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
3741	2025-11-15	GAM-enhanced deepLabv3+ for accurate burn scar extraction in karst regions from remote sensing images 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0336384 PMID:41218024	研究论文	提出一种结合全局注意力机制的DeepLabv3+模型，用于喀斯特地区遥感图像中火烧迹地的精确提取	通过优化ASPP模块的扩张率(1,3,5)避免网格伪影，并在解码器后引入全局注意力模块(GAM)动态重校准通道-空间依赖关系	在参数量和推理速度方面仍有优化空间	解决喀斯特地区地形破碎和植被模式复杂等挑战，实现火烧迹地的精确语义分割	喀斯特地区森林火烧迹地	计算机视觉	NA	遥感技术	语义分割	遥感图像	贵州省贵阳市花溪区2024年典型火灾事件构建的单区域数据集	NA	DeepLabv3+, ResNet50	mIoU, mAcc	NA
3742	2025-11-15	Hybrid deep learning framework for real-time fault detection in squirrel-cage induction motors 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0336323 PMID:41218031	研究论文	提出一种基于混合深度学习的实时故障检测框架，用于鼠笼式感应电机的故障诊断	开发了结合CNN和GRU/LSTM的混合深度学习架构，能同时捕捉时空特征，在实时故障检测中实现高精度和计算效率	需要大量计算资源和标注数据集，未与最先进方法直接对比，缺乏真实工业噪声数据的验证	开发智能可靠的预测性维护系统，实现鼠笼式感应电机的实时故障检测	鼠笼式感应电机(SCIMs)	机器学习	NA	传感器数据分析	CNN, GRU, LSTM, BiLSTM, ANN	传感器时序数据	100万样本(健康与故障状态各半)	MATLAB Simulink	CNN-GRU, CNN-LSTM, LSTM, BiLSTM, Stacked LSTM, GRU, CNN, ANN	准确率, 精确率, 召回率, F1分数, 推理时间, 延迟, 吞吐量	需要大量计算资源(具体型号未指定)
3743	2025-11-15	Enhancing museum visitor forecasting using deep learning and sentiment analysis: A transformer-based approach for sustainable management 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0335623 PMID:41218039	研究论文	本研究开发了一种结合结构化数据和情感分析的博物馆访客预测模型，采用Transformer架构提升预测精度	首次将博物馆相关新闻和用户评论的情感分析融入访客预测，通过比较七种算法证明Transformer模型的优越性	未明确说明数据来源的具体时间跨度和地理范围，模型在极端事件下的适应性有待验证	建立融合多源数据的博物馆访客预测框架以支持可持续管理决策	博物馆年度访客量及相关结构化数据、新闻文章和用户评论的情感数据	自然语言处理,机器学习	NA	情感分析,深度学习	Transformer,RNN,GAN,CNN,LSTM	结构化数据,文本数据	NA	NA	Transformer	RMSE,MSLE,MAPE	NA
3744	2025-11-15	SH-DETR: Enhancing steel surface defect detection and classification with an improved transformer architecture 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0334048 PMID:41218093	研究论文	提出一种改进的Transformer架构SH-DETR，用于增强钢铁表面缺陷检测与分类性能	结合多通道随机编码与多尺度特征融合模块，引入多通道混洗编码模块和参数无关的UPC-SimAM注意力模块	NA	解决传统模型在钢铁表面缺陷检测中识别精度低和分类能力不足的问题	钢铁表面缺陷	计算机视觉	NA	深度学习	Transformer, CNN	图像	NEU-DET和GC10-DE数据集	NA	ResNet18, Transformer, UPC-SimAM	分类准确率, mAP@0.5, mAP@0.5:0.95	NA
3745	2025-11-15	Computational models for pan-cancer classification based on multi-omics data 2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2025.1667325 PMID:41220429	综述	本文综述了基于多组学数据的泛癌分类计算模型，总结了现有方法并探讨了未来研究方向	系统梳理了泛癌分类的计算模型方法，并对不同方法的优劣进行了比较分析	现有框架难以整合肿瘤内部的动态时间变化和空间异质性，限制了实时临床应用	研究泛癌分类方法以解决肿瘤异质性带来的诊断和治疗挑战	多组学数据（基因组学、转录组学、蛋白质组学）和泛癌图谱	机器学习	泛癌（多种癌症）	多组学数据整合分析	机器学习,深度学习	多组学数据	NA	NA	NA	NA	NA
3746	2025-11-15	A rapid approach for discriminating Ganoderma species using attenuated total reflectance-Fourier transform infrared (ATR-FTIR) spectroscopy integrated with chemometric analysis and convolutional neural network (CNN) 2025, Frontiers in chemistry IF:3.8Q2 DOI:10.3389/fchem.2025.1655760 PMID:41220432	研究论文	本研究开发了一种结合化学计量学分析和卷积神经网络的ATR-FTIR光谱快速鉴别灵芝物种的方法	首次将ATR-FTIR光谱与化学计量学分析和深度学习CNN相结合，建立了一个新颖的灵芝物种鉴别框架	仅针对三种灵芝物种进行研究，未来需要扩展到更多药用植物验证	解决灵芝物种掺假和错误分类问题，开发快速准确的物种鉴别方法	三种灵芝物种（具体物种名称在原文中未明确列出）	化学计量学, 深度学习	NA	衰减全反射-傅里叶变换红外光谱(ATR-FTIR)	CNN, OPLS-DA	光谱数据	NA	NA	卷积神经网络	准确率, 灵敏度, 特异性, RMSEE, RMSEP, RMSECV, 精确率, 召回率, F1分数	NA
3747	2025-11-15	DeepTDM: Deep Learning-Based Prediction of Sequential Therapeutic Drug Monitoring Levels of Vancomycin 2025, IEEE journal of translational engineering in health and medicine IF:3.7Q2 DOI:10.1109/JTEHM.2025.3623605 PMID:41220794	研究论文	开发基于深度学习的DeepTDM系统，用于预测重症患者万古霉素序列治疗药物监测水平	提出GRU集成联合多层感知器网络(GointMLP)模型，结合回归和分类预测提供双重验证机制	NA	优化重症患者万古霉素剂量管理，提高治疗药物监测的准确性	重症监护病房患者	医疗人工智能	重症感染	治疗药物监测	GRU, MLP	临床监测数据	NA	NA	GointMLP	准确性	NA
3748	2025-11-15	Diagnosis and Severity Rating of Parkinson's Disease Based on Multimodal Gait Signal Analysis With GLRT and ST-CNN-Transformer Networks 2025, IEEE journal of translational engineering in health and medicine IF:3.7Q2 DOI:10.1109/JTEHM.2025.3611498 PMID:41220792	研究论文	基于多模态步态信号分析和GLRT与ST-CNN-Transformer网络的帕金森病诊断与严重程度评级	提出结合广义似然比检验(GLRT)和时空卷积神经网络-Transformer(ST-CNN-Transformer)的多模态步态分析框架，用于帕金森病严重程度的自动化分类	样本量较小（10名健康对照和30名帕金森病患者），需要更大规模验证	开发自动化的帕金森病严重程度分类方法	帕金森病患者和健康对照者的步态数据	医疗人工智能	帕金森病	多模态步态信号分析，惯性测量单元数据采集	ST-CNN-Transformer	多模态步态信号（足部加速度、角速度、垂直地面反作用力）	10名健康对照者和30名帕金森病患者	NA	ST-CNN-Transformer	准确率	NA
3749	2025-11-15	Two-step pipeline for oral diseases detection and classification: a deep learning approach 2025, Frontiers in oral health IF:3.0Q1 DOI:10.3389/froh.2025.1659323 PMID:41221302	研究论文	开发并评估结合目标检测和分类模型的两步人工智能流程，用于口腔疾病的早期识别和区分	提出结合YOLOv11目标检测和MobileNetV2分类的两步深度学习流程，专门针对口腔潜在恶性病变和口腔鳞状细胞癌的检测与分类	YOLO检测阶段遗漏的图像（17.4%）被排除在分类阶段之外，可能影响报告的性能指标	开发人工智能辅助口腔疾病早期诊断系统	口腔潜在恶性病变和口腔鳞状细胞癌的临床图像	计算机视觉	口腔癌	深度学习	CNN	图像	基线数据集773张图像（FOP-UNICAMP），外部验证数据集132张图像（UFPB）	NA	YOLOv11, MobileNetV2	mAP50, 准确率, 精确率, 召回率, F1分数, AUC-ROC	NA
3750	2025-11-15	AI-Based Detection of Coronary Artery Occlusion Using Acoustic Biomarkers Before and After Stent Placement 2025, IEEE open journal of engineering in medicine and biology IF:2.7Q3 DOI:10.1109/OJEMB.2025.3615394 PMID:41221436	研究论文	利用人工智能通过声学生物标志物检测冠状动脉阻塞，并比较支架植入前后的变化	首次将DeepSets架构应用于学习患者特异性声学生物标志物，能够识别支架植入前后心脏声音的差异	样本量较小（仅12名患者），属于初步研究	开发基于人工智能的非侵入性冠状动脉疾病监测方法	人类患者的心脏声音信号	机器学习	心血管疾病	匹配追踪信号分解，深度学习	DeepSets	音频信号	12名人类患者	NA	DeepSets	准确率	NA
3751	2025-11-15	Discriminating Between Marijuana and Alcohol Gait Impairments Using Tile CNN With TICA Pooling 2025, IEEE open journal of engineering in medicine and biology IF:2.7Q3 DOI:10.1109/OJEMB.2025.3607556 PMID:41221437	研究论文	本研究开发了一种基于智能手机传感器数据和深度学习的方法，通过步态分析区分酒精和大麻损伤	首次使用受损步态数据集，提出结合TICA池化的平铺CNN架构，将时间序列传感器数据转换为GAF图像进行分类	阳性标记的酒精和大麻实例数据不足，需要借助更丰富的清醒步态样本进行预训练	研究机器学习分析智能手机传感器数据是否能从步态中区分酒精和大麻消费	受试者的步态数据	机器学习	NA	智能手机加速度计和陀螺仪传感器数据采集	CNN	时间序列传感器数据，图像	NA	NA	平铺CNN with TICA池化	准确率，F1分数，ROC AUC分数	NA
3752	2025-11-15	Development of an Improved Stacked U-Net Model for Cuffless Blood Pressure Estimation Based on PPG Signals 2025, IEEE open journal of engineering in medicine and biology IF:2.7Q3 DOI:10.1109/OJEMB.2025.3624566 PMID:41221440	研究论文	开发了一种改进的堆叠U-Net深度学习模型，仅使用光电容积脉搏波信号进行无袖带血压估计	引入速度容积脉搏波输入，采用加性空间和通道注意力机制，改进特征提取并缓解U-Net架构中的解码器不匹配问题	NA	提高无创血压测量的准确性	光电容积脉搏波信号	机器学习	心血管疾病	光电容积脉搏波	U-Net	信号数据	NA	NA	堆叠U-Net	平均绝对误差	NA
3753	2025-11-15	Enhancing Super-Resolution Network Efficacy in CT Imaging: Cost-Effective Simulation of Training Data 2025, IEEE open journal of engineering in medicine and biology IF:2.7Q3 DOI:10.1109/OJEMB.2025.3610160 PMID:41221441	研究论文	提出一种从薄层CT图像生成厚层CT图像的简单而真实的方法，用于创建超分辨率算法的训练数据对	首次识别并解决了基于深度学习的CT超分辨率模型生成适当配对训练数据的挑战，提出的方法既简单又真实，无需原始数据或复杂重建算法	NA	增强CT成像中超分辨率网络的效能和适用性	CT图像，特别是肺纤维化相关的厚层CT图像	医学影像处理	肺纤维化	CT成像	生成模型	CT图像	NA	NA	NA	PSNR	NA
3754	2025-11-15	Application of a convolutional neural network model to construct an automatic, AI-based identification system for rat kidney tissue microscopic images 2025, Folia neuropathologica IF:1.5Q3 DOI:10.5114/fn.2025.153859 PMID:41229247	研究论文	开发基于卷积神经网络的AI识别系统用于大鼠肾脏组织显微图像的自动分析	设计了基于残差学习思想的ResPool采样结构，成功实现了肾小球实例分割和损伤分析	由于输入图像分辨率较高需要多次采样，跨度乘数水平显著影响网络性能	构建基于深度学习的肾脏病理图像自动识别系统	大鼠慢性肾病模型的肾脏组织显微图像	数字病理	慢性肾脏病	组织染色显微成像	CNN	图像	5个病理组×3种染色×50张图像=750张训练图像	NA	ResNet	准确率	NA
3755	2025-11-15	Correction: An explainable hybrid deep learning framework for precise skin lesion segmentation and multi-class classification 2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2025.1724427 PMID:41234911	correction	对一篇关于皮肤病变分割与多分类的混合深度学习框架论文进行更正	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
3756	2025-11-15	Learning meaningful representation of single-neuron morphology via large-scale pre-training 2024-09-01, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btae395 PMID:39230697	研究论文	提出MorphRep模型，通过大规模预训练学习单神经元形态的有意义表示	首次使用超过25万神经元形态数据进行大规模预训练，采用图结构数据编码和图形变换器，通过多增强视图一致性学习实现最先进性能	NA	开发能够准确表征神经元形态的计算模型	单神经元形态结构	机器学习	脑部疾病	显微镜成像	图变换器	图结构数据	超过250,000个神经元形态数据	NA	图变换器	NA	NA
3757	2025-11-15	Protein structure prediction with in-cell photo-crosslinking mass spectrometry and deep learning 2023-12, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-023-01704-z PMID:36941363	研究论文	本研究开发了AlphaLink方法，通过将实验距离约束信息整合到AlphaFold2网络架构中，提升具有构象变化或同源序列稀少蛋白质的结构预测精度	提出首个将细胞内光交联质谱实验数据整合到深度学习蛋白质结构预测框架的方法，通过稀疏实验接触点作为锚点改进预测性能	未明确说明方法对各类蛋白质构象变化的普适性及计算效率的具体评估	改进蛋白质结构预测精度，特别是针对构象变化蛋白质和同源序列稀少的困难目标	蛋白质三维结构，特别是具有构象变化的蛋白质	计算生物学	NA	光交联质谱，非经典氨基酸光亮氨酸标记	深度学习	蛋白质序列数据，质谱实验数据，距离约束信息	NA	AlphaFold2	AlphaFold2改进架构	结构预测精度	NA
3758	2025-11-15	Interpretable neural architecture search and transfer learning for understanding CRISPR-Cas9 off-target enzymatic reactions 2023-12, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-023-00569-1 PMID:38177723	研究论文	提出Elektrum深度学习框架，通过可解释神经网络架构搜索和迁移学习预测CRISPR-Cas9脱靶编辑概率	结合数据驱动和生物物理可解释模型，通过体外动力学假设生成和体内迁移学习的两阶段框架	NA	开发预测性和可解释的酶促通路模型	CRISPR-Cas9脱靶编辑反应	机器学习	NA	体外动力学检测，深度学习	CNN，可解释神经网络	体外动力学数据，体内反应数据	NA	NA	KINNs（动力学可解释神经网络），卷积神经网络	预测性能，正则化效果，可解释性	NA
3759	2025-11-15	Deep contrastive learning of molecular conformation for efficient property prediction 2023-12, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-023-00560-w PMID:38177719	研究论文	提出一种基于深度对比学习的分子构象领域自适应方法LACL，用于高效预测分子性质	通过局部原子环境对比学习形成领域无关的潜在空间，规避了几何弛豫瓶颈同时保持量子化学精度	NA	解决不同构象生成方法间的领域偏移问题，实现准确的分子性质预测	有机小分子、生物和药理学长链分子	机器学习	NA	对比学习	深度学习	分子构象数据	NA	NA	LACL（局部原子环境对比学习）	量子化学精度	NA
3760	2025-11-15	Predictive analyses of regulatory sequences with EUGENe 2023-11, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-023-00544-w PMID:38177592	研究论文	介绍了一个名为EUGENe的FAIR工具包，用于使用深度学习分析基因组序列	开发了首个完全符合FAIR原则的深度学习工具包，专门用于调控基因组学分析	NA	为基因组序列的深度学习分析提供标准化工具包	基因组调控序列	生物信息学	NA	深度学习	神经网络	基因组序列数据	NA	PyTorch, TensorFlow	多种架构	NA	NA