深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
361	2025-10-31	The Duke University Cervical Spine MRI Segmentation Dataset (CSpineSeg) 2025-Oct-27, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05975-w PMID:41145519	研究论文	介绍杜克大学颈椎MRI分割数据集(CSpineSeg)并提供一个深度学习分割基准模型	发布首个包含1,255例颈椎MRI检查的公开数据集，并提供481例患者的专家手动语义分割标注	NA	为深度学习分割模型提供训练和评估资源，促进颈椎脊柱研究	颈椎脊柱磁共振成像	医学影像分析	脊柱疾病	磁共振成像(MRI)	深度学习分割模型	医学影像	1,255例MRI检查（来自1,232名患者），其中481例包含专家手动分割标注	NA	NA	Dice系数	NA
362	2025-10-31	A neural architecture search optimized lightweight attention ensemble model for nutrient deficiency and severity assessment in diverse crop leaves 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-20124-4 PMID:41145525	研究论文	提出一种基于神经架构搜索优化的轻量级注意力集成模型，用于多种作物叶片营养缺乏及严重程度评估	开发了NASMobV2新型轻量级模型，结合神经架构搜索和动态注意力加权机制，实现营养缺乏分类和严重程度评估的双重功能	模型在香蕉和咖啡作物上验证，需要进一步测试在其他作物上的泛化能力	开发轻量级深度学习模型用于农业实时营养缺乏诊断	香蕉叶片和咖啡叶片的营养缺乏状况	计算机视觉	作物营养缺乏症	深度学习，迁移学习	CNN	图像	香蕉叶片营养缺乏数据集和咖啡作物数据集	TensorFlow, Keras	ResNet50, VGG16, NASNetMobile, MobileNetV1, MobileNetV2, MobileNetV3	准确率, 精确率, 召回率, F1分数	移动设备和Web应用部署
363	2025-10-31	Machine learning analysis of carbon rebound effect dynamics and drivers in Chinese prefecture-level cities 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21245-6 PMID:41145544	研究论文	基于中国地级市面板数据，结合多元线性回归与机器学习方法分析碳回弹效应的非线性驱动因素	首次将集成学习和深度学习应用于碳回弹效应研究，采用SHAP值和ALE图量化关键变量的影响路径，突破传统模型局限	研究时间范围限于2010-2021年，数据来源局限于中国地级市层面	揭示碳回弹效应的核心驱动机制，为差异化生态政策制定提供科学依据	中国地级市2010-2021年的碳回弹效应动态	机器学习	NA	面板数据分析	集成学习,深度学习	面板数据	中国地级市2010-2021年面板数据	NA	NA	SHAP值,ALE图	NA
364	2025-10-31	Public values in public R&D through natural language processing 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21312-y PMID:41145582	研究论文	本研究提出了一种利用自然语言处理和深度学习技术评估公共研发社会价值的新框架	首次将专利全文分析与大型语言模型分类器相结合，系统性地提取和分类公共研发成果的社会价值	仅关注专利限制了代表性，分类效果依赖于LLM性能，公共价值存在主观性	开发数据驱动的公共研发政策评估方法，系统评估研发成果的社会经济影响	公共资助的AI研发项目专利和AI相关新闻专栏	自然语言处理	NA	自然语言处理，深度学习	LLM	文本	1642项专利和422篇新闻专栏	NA	大型语言模型	NA	NA
365	2025-10-31	Deep learning assisted LDPC decoding for 5G IoT networks in fading environments 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21382-y PMID:41145583	研究论文	提出一种结合迭代偏移最小和算法与卷积神经网络的混合架构，用于增强5G物联网网络中LDPC码的解码效率	首次将CNN与OMS算法相结合用于LDPC解码，通过深度学习技术进行精确噪声估计和缓解，解决了衰落信道中彩色噪声带来的挑战	仅通过仿真验证性能，未提及实际硬件部署测试；研究范围限于特定衰落信道模型	提高5G物联网网络中LDPC码在衰落环境下的解码性能	5G物联网网络中的LDPC信道编码	通信工程, 深度学习	NA	LDPC信道编码, 深度学习辅助解码	CNN	通信信号, 仿真数据	NA	NA	OMS-CNN混合架构	误码率, 信噪比增益	NA
366	2025-10-31	Enhancing Urdu hate speech detection through differential transfer learning and adaptive loss functions 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21306-w PMID:41145587	研究论文	提出一种结合差分迁移学习和自适应损失函数的新方法，用于增强乌尔都语仇恨言论检测	首次将差分迁移学习与自适应损失函数相结合应用于乌尔都语仇恨言论检测，提出DAmBERT模型并创建专门的Nastaliq乌尔都语数据集	研究聚焦于乌尔都语这一低资源语言，可能在其他语言上的泛化能力有限	开发针对乌尔都语的鲁棒仇恨言论检测系统	乌尔都语YouTube评论数据	自然语言处理	NA	迁移学习，多语言嵌入，上下文处理方法	随机森林，支持向量机，决策树，循环神经网络，长短期记忆网络，迁移学习	文本	18,058条带标签的YouTube评论记录（包含仇恨、冒犯和中性标签）	NA	DAmBERT，RNN，LSTM	F1分数，加权F1分数	NA
367	2025-10-31	UAVs detect hazards with multi-directional Mamba on overhead transmission lines 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21243-8 PMID:41145615	研究论文	本研究提出基于状态空间模型的UAV-MDMamba方法，用于无人机检测架空输电线路危险	提出多方向Mamba模块增强图像空间建模能力，设计补丁级推理增强机制提升小目标检测精度	NA	提高架空输电线路危险检测的效率和准确性	架空输电线路危险区域	计算机视觉	NA	无人机航拍，深度学习	SSM, Mamba	图像	NA	NA	UAV-MDMamba, MDMamba	检测准确率	NA
368	2025-10-31	Predicted peptide scaffolds for drug screening in endometrial cancer organoids 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21282-1 PMID:41145641	研究论文	本研究利用AlphaFold预测自组装肽RFC结构，并开发支持子宫内膜癌类器官3D培养的水凝胶平台用于药物筛选	首次将AlphaFold应用于自组装肽结构预测，结合实验验证开发新型水凝胶支架用于癌症类器官培养和药物筛选	仅测试了有限数量的治疗药物，需要进一步验证平台的普适性	开发基于预测肽结构的生物材料平台用于癌症研究和精准医疗	子宫内膜癌类器官	计算生物学	子宫内膜癌	深度学习结构预测，3D细胞培养，药物筛选	深度学习	蛋白质序列，实验数据	NA	AlphaFold	AlphaFold架构	结构预测置信度，器官活力减少	NA
369	2025-10-31	Intelligent monitoring system for quality of life of colostomy patients based on deep learning and AR 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21470-z PMID:41145630	研究论文	开发基于深度学习和增强现实的结肠造口患者生活质量智能监测系统	首次将联邦学习框架引入结肠造口护理领域，结合神经架构搜索实现轻量化模型部署，通过马尔可夫模型量化健康经济效益	需要扩展跨疾病迁移学习架构，开发柔性可降解传感器以提升基层医疗可及性	解决结直肠癌术后造口患者高发并发症的临床监测难题	结肠造口患者	数字病理	结直肠癌	阻抗传感,pH响应水凝胶,3D深度相机,增强现实	深度学习	多模态数据（生理生化参数、形态特征）	多中心随机对照试验	联邦学习	跨模态时空融合网络,动态注意力机制,微分流形优化算法	并发症预警性能,护理操作标准化程度,医疗资源消耗	NA
370	2025-10-31	Optimized generative adversarial network for efficient resolution enhancement of 3D segmented rock tomography 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21624-z PMID:41145790	研究论文	提出一种基于内存优化的生成对抗网络，用于显著提升岩石3D微CT图像的分辨率和分割精度	采用八叉树结构的渐进增长生成对抗网络，突破3D超分辨率中的内存瓶颈，实现16倍分辨率提升	需要未配对的2D高分辨率LSM图像作为补充训练数据	解决3D岩石微CT图像超分辨率重建中的内存限制问题	伯里亚砂岩的3D微CT图像	计算机视觉	NA	微计算机断层扫描，激光扫描显微镜	GAN	3D图像，2D图像	NA	PyTorch, Minkowski Engine	3D Octree-Based Progressive Growing Deep Convolutional Wasserstein Generative Adversarial Network with Gradient Penalty	分辨率从7µm/voxel提升至0.44µm/voxel	采用内存优化的3D八叉树卷积层
371	2025-10-31	Decoding covert visual attention of electroencephalography signals using continuous wavelet transform and deep learning approach 2025-Oct-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-21635-w PMID:41145802	研究论文	提出结合连续小波变换和深度学习的方法，用于从脑电图信号解码隐性视觉注意力状态	首次将连续小波变换与深度神经网络结合，实现无需手动特征工程的端到端注意力状态分类	仅使用10名健康参与者的数据，样本规模较小	开发可扩展的隐性视觉注意力解码方法，用于脑机接口应用	健康参与者的脑电图信号	脑机接口	NA	连续小波变换，脑电图信号处理	CNN	脑电图时间序列数据	10名健康参与者	NA	ShallowConvNet, EEGNet	准确率	NA
372	2025-10-31	Integrating deep learning and multi-omics features in radiation pneumonitis prediction for lung cancer patients using PET/CT 2025-Oct-27, BMC medical imaging IF:2.9Q2 DOI:10.1186/s12880-025-01971-z PMID:41146084	研究论文	本研究探讨了结合PET放射组学、CT放射组学、剂量组学和深度学习特征预测肺癌患者放疗后放射性肺炎的可行性	首次将PET/CT放射组学特征、剂量组学特征和深度学习特征相结合，构建联合预测模型用于放射性肺炎预测	样本量相对有限，外部验证集仅包含27例患者	预测接受VMAT治疗的肺癌患者发生放射性肺炎的风险	肺癌患者	医学影像分析	肺癌	PET/CT成像，放射组学，剂量组学	机器学习，深度学习	医学影像（PET/CT图像）	206例训练患者（医院一），27例外部验证患者（医院二）	NA	ResNet-18	AUC，准确率，敏感性，特异性	NA
373	2025-10-31	Predicting COVID-19 patient recovery or mortality using deep neural decision tree and forest 2025-Oct-27, BMC research notes IF:1.6Q2 DOI:10.1186/s13104-025-07511-w PMID:41146277	研究论文	本研究评估深度神经决策树和深度神经决策森林在预测COVID-19患者死亡率方面的有效性	将深度神经网络的表征能力与决策森林的结构化决策相结合，仅使用临床数据即可提高模型可解释性和性能，无需依赖影像或实验室检查	NA	预测COVID-19患者的康复或死亡率，帮助急诊医生有效分配医疗资源	COVID-19患者	机器学习	COVID-19	NA	深度神经决策树, 深度神经决策森林	临床数据（包括COVID-19诊断、人口统计学、健康指标和职业风险因素）	NA	NA	深度神经决策树, 深度神经决策森林	准确率, 召回率, 精确率, F1分数	NA
374	2025-10-31	PyHFO 2.0: an open-source platform for deep learning-based clinical high-frequency oscillations analysis 2025-Oct-27, Journal of neural engineering IF:3.7Q2 DOI:10.1088/1741-2552/ae10e0 PMID:41061718	研究论文	介绍PyHFO 2.0开源平台，用于基于深度学习的高频振荡临床分析	整合了更全面的检测方法和深度学习工具，新增基于希尔伯特变换的检测器，并与Hugging Face生态系统集成	NA	开发支持临床使用的开源高频振荡分析平台	耐药性癫痫患者的脑电图高频振荡	计算神经科学	癫痫	脑电图记录	深度学习模型	脑电图信号	临床脑电图数据集	Python, Hugging Face	NA	与专家标注和RIPPLELAB工具的一致性	NA
375	2025-10-31	A semi-supervised learning-based framework for quantifying litter fluxes in river systems 2025-Oct-27, Water research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.watres.2025.124833 PMID:41161028	研究论文	提出一种基于半监督学习的框架，结合SAHI技术用于量化河流中漂浮垃圾的通量	首次将半监督学习与SAHI技术结合用于河流漂浮垃圾通量量化，解决了小尺寸垃圾检测和标注数据稀缺的问题	框架显著低估通量（3-4倍），主要由于透明垃圾和水葫芦中垃圾的漏检	开发更准确的河流漂浮垃圾通量量化方法	河流中的漂浮大型塑料垃圾（>5mm）	计算机视觉	NA	半监督学习，图像分析	ResNet50, Faster R-CNN	图像	来自荷兰、印度尼西亚和越南水道的图像数据	PyTorch	ResNet50, Faster R-CNN	F1-score	NA
376	2025-10-31	Applications of artificial intelligence in rehabilitation: technological innovation and transformation of clinical practice 2025-Oct-27, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2025.100360 PMID:41161419	综述	探讨人工智能在康复医学领域的多样化应用及其对临床实践的变革性影响	提出AI赋能的康复模型，将碎片化流程转变为具有实时评估功能的交互式自适应系统	存在数据限制、伦理问题、监管要求和临床整合障碍等挑战	研究人工智能技术在康复医学中的创新应用与临床实践转型	康复医疗服务体系与临床实践流程	自然语言处理,计算机视觉,机器学习	脑卒中康复	机器学习,深度学习,计算机视觉,自然语言处理,机器人技术	NA	多模态康复数据	NA	NA	NA	NA	NA
377	2025-10-31	scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations 2025-Oct-27, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056 PMID:41161490	研究论文	提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet	首次将树状图转换与掩码自编码器和视觉变换器结合，充分利用未标记数据和细胞标记知识	NA	开发能够充分学习细胞标记知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	MAE, ViT	基因表达数据	NA	PyTorch	掩码自编码器, 视觉变换器	准确率, 批次不敏感性	NA
378	2025-10-31	AI-Mediated Immunotherapeutics in Adenoid Cystic Carcinoma: Challenges and Current perspectives 2025-Oct-27, Critical reviews in oncology/hematology DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104984 PMID:41161628	综述	本文探讨人工智能在腺样囊性癌免疫治疗中的应用现状、挑战与未来展望	系统整合多种机器学习与深度学习模型于腺样囊性癌的精准免疫治疗，包括肿瘤分类、免疫浸润评估和个体化治疗策略制定	存在临床整合困难、模型可解释性不足和数据质量问题	推动人工智能在腺样囊性癌精准免疫治疗领域的应用发展	腺样囊性癌患者	机器学习, 数字病理学	头颈癌	影像学分析, 组织病理学分析, 基因组学分析, 液体活检	SVM, RF, KNN, LR, GBM, CNN, ANN	影像数据, 组织病理数据, 基因组数据	NA	NA	卷积神经网络, 人工神经网络	准确率, 特异性	NA
379	2025-10-31	Artificial Intelligence in Valvular Heart Disease: Innovations and Future Directions 2025-Oct-27, JACC. Cardiovascular interventions DOI:10.1016/j.jcin.2025.08.031 PMID:41161917	综述	本文探讨人工智能在瓣膜性心脏病管理中的应用、创新方向及临床实践挑战	系统阐述AI如何通过多模态数据整合提升VHD诊疗精度，并首次提出数字孪生技术在瓣膜疾病建模中的创新应用	AI模型需要多中心严格验证，存在算法偏见、数据隐私和透明度不足等应用障碍	综述AI技术在瓣膜性心脏病诊疗领域的应用现状与发展前景	瓣膜性心脏病患者的多模态医疗数据	数字病理	心血管疾病	心电图, 超声心动图, 计算机断层扫描	机器学习, 深度学习	多模态医疗数据（人口统计学、症状、生物标志物、影像等）	NA	NA	NA	NA	NA
380	2025-10-31	Artificial intelligence-driven epigenetic CRISPR therapeutics: a structured multi-domain meta-analysis of therapeutic efficacy, off-target prediction, and gRNA optimization 2025-Oct-25, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-025-01725-8 PMID:41136797	荟萃分析	通过系统综述和荟萃分析评估人工智能在CRISPR表观遗传编辑工具中对治疗疗效、脱靶预测和gRNA优化的影响	首次对AI驱动的CRISPR表观遗传编辑工具进行结构化多领域荟萃分析，涵盖治疗疗效、脱靶预测和gRNA优化三个关键领域	仅纳入58项符合条件的研究，其中仅41项提供可提取的定量数据，样本量相对有限	评估人工智能对CRISPR表观遗传编辑工具精确性、安全性和治疗疗效的影响	CRISPR表观遗传编辑工具及其AI增强应用	机器学习	NA	CRISPR表观遗传编辑，人工智能，深度学习	深度学习模型	定量研究数据，定性合成数据	540条筛选记录，58项符合纳入标准的研究（41项定量分析，17项定性合成）	NA	NA	标准化均数差(SMD)，受试者工作特征曲线下面积(AUC)	NA