深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
361	2025-09-09	Benchmarking of open-source algorithms for heart rate estimation from motion-corrupted photoplethysmography 2025-Sep, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110808 PMID:40714408	研究论文	系统评估开源算法在运动干扰下通过光电容积脉搏波描记法估计心率的性能	首次对126种已发表算法进行系统性检索与评估，并对11种开源方法使用统一真实数据集进行基准测试，发现深度学习算法在动态条件下显著优于传统方法	仅包含提供开源实现的算法（11/126），数据集多样性有限可能影响泛化能力	比较不同光电容积脉搏波描记法与加速度计数据融合的心率估计算法性能	心率估计开源算法	生物医学信号处理	心血管疾病	光电容积脉搏波描记法（PPG）与加速度计数据融合	深度学习算法 vs 基于模型的算法	生理信号数据（PPG和加速度计数据）	11种开源算法，使用统一真实数据集进行测试
362	2025-09-09	Affinity prediction of inhibitor-kinase based on mixture of experts enhanced by multimodal feature semantic analysis 2025-Sep, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146324 PMID:40738444	研究论文	提出一种基于专家混合系统增强多模态特征语义分析的抑制剂-激酶亲和力预测模型Mokin	首次使用专家混合系统作为药物分子特征提取桥梁，创新设计全局记忆门控路由模块，并整合蛋白质和蛋白质相互作用网络特征	NA	提高抑制剂-激酶结合亲和力的预测精度，解决冷启动问题	人类激酶中的EGFR家族及其抑制剂	机器学习	癌症	多模态特征语义分析，蛋白质-蛋白质相互作用网络分析	Mixture of Experts (MoE), 双线性注意力机制	生物分子数据，网络数据	NA
363	2025-09-09	High-efficiency spatially guided learning network for lymphoblastic leukemia detection in bone marrow microscopy images 2025-Sep, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110860 PMID:40753948	研究论文	提出一种基于空间引导学习网络的高效方法，用于骨髓显微镜图像中的淋巴细胞白血病检测	构建了包含1794张高质量图像的新数据集，并提出空间引导学习框架、尺度感知融合模块、小目标增强机制和高效IoU损失函数等创新改进	NA	开发自动化白血病检测方法，提高诊断准确性和效率	淋巴细胞白血病细胞	数字病理学	白血病	深度学习	SGLNet（空间引导学习网络）	显微镜图像	1794张高质量骨髓显微镜图像
364	2025-09-09	Deep learning model enables the discovery of a novel BET inhibitor YD-851 2025-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2025.118431 PMID:40779884	研究论文	本研究利用深度学习模型发现了一种新型BET抑制剂YD-851，该化合物在实体瘤治疗中表现出高效低毒特性	采用环化骨架跃迁策略结合高精度深度学习模型设计新型BET抑制剂，成功获得具有优异抗肿瘤活性的先导化合物	研究目前处于临床前阶段，尚未进行人体临床试验验证	开发高效低毒的新型BET抑制剂用于实体瘤治疗	BET抑制剂化合物及其实体瘤模型	药物发现	实体瘤	深度学习、环化骨架跃迁、多步合成路线	深度学习模型	化学结构数据	多个异种移植实体瘤模型
365	2025-09-09	Application of AI-based techniques for anomaly management in wastewater treatment plants: A review 2025-Sep, Journal of environmental management IF:8.0Q1 DOI:10.1016/j.jenvman.2025.126886 PMID:40780155	综述	本文系统回顾了人工智能技术在污水处理厂异常管理中的应用进展	全面比较监督学习、无监督学习和迁移学习方法，并强调实际工程应用中的性能指标如可扩展性、检测及时性和技术适应性	存在模型可解释性、计算强度、数据质量控制、跨设施泛化能力和成本效益等方面的研究空白	评估人工智能技术在污水处理厂异常管理中的研究进展和应用潜力	污水处理厂（WWTPs）的异常管理过程	机器学习	NA	深度学习、集成学习、智能优化算法	监督学习、无监督学习、迁移学习	传感器数据、多模态数据	NA
366	2025-09-09	Ultrasound-based machine learning models for predicting response to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer: A meta-analysis 2025-Sep, Clinical imaging IF:1.8Q3 DOI:10.1016/j.clinimag.2025.110574 PMID:40769066	meta-analysis	通过荟萃分析评估基于超声的机器学习模型预测乳腺癌新辅助化疗反应的效能	首次系统评估超声影像组学结合机器学习在预测乳腺癌新辅助化疗反应中的综合性能，并区分完全缓解和部分缓解的预测模型	部分缓解模型仅进行了内部验证分析，缺乏外部验证结果；需要进一步开发临床可推广的模型	评估基于超声的机器学习模型预测乳腺癌患者新辅助化疗反应的准确性	乳腺癌患者	digital pathology	breast cancer	radiomics, deep learning	machine learning models	ultrasound images	22项研究（具体样本量未在摘要中明确说明）
367	2025-09-09	Deep Learning-Based Saturation Compensation for High Dynamic Range Multispectral Fluorescence Lifetime Imaging 2025-Sep, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2025.3548297 PMID:40042955	研究论文	提出一种基于深度学习的饱和补偿网络SatCompFLImNet，用于校正多光谱荧光寿命成像中的饱和伪影	首次将生成对抗网络应用于多光谱FLIm的饱和伪影校正，实现高动态范围成像	NA	解决多光谱荧光寿命成像中因检测系统动态范围有限导致的饱和伪影问题	多光谱荧光寿命成像数据	计算机视觉	NA	荧光寿命成像(FLIm)	GAN	图像	模拟和真实数据（未指定具体数量）
368	2025-09-09	Prognosis and prognostic factors for chronic fibrosing idiopathic interstitial pneumonias 2025-Sep, Respiratory investigation IF:2.4Q2 DOI:10.1016/j.resinv.2025.06.005 PMID:40561889	综述	本文综述了特发性间质性肺炎（IIPs）尤其是特发性肺纤维化（IPF）的预后及预测因素的最新进展	整合了抗纤维化治疗成为标准方案后的最新研究成果，涵盖遗传多态性、影像学分析和深度学习等新技术在预后预测中的应用	NA	总结IPF及其他慢性纤维化IIPs的预后及其预测因素	特发性间质性肺炎患者（重点关注IPF患者）	NA	肺纤维化疾病	遗传多态性分析、放射影像分析、深度学习	NA	临床数据、影像数据、遗传数据	NA
369	2025-09-09	Optimization of deep learning models for inference in low resource environments 2025-Sep, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110615 PMID:40716232	研究论文	本研究评估了深度学习模型在医疗应用中的优化技术效果，重点关注低资源环境下的推理性能	系统评估多种优化技术在医疗AI模型上的效果，涵盖不同硬件配置和医疗领域	研究仅针对特定医疗任务和模型类型，未涵盖所有可能的医疗AI应用场景	优化深度学习模型在低资源环境中的推理效率，促进AI在医疗领域的临床转化	放射学、组织病理学和医学RGB成像领域的AI工作负载	machine learning	结直肠癌	深度学习优化技术	深度学习模型	MRI图像、H&E染色组织切片图像、RGB图像	NA
370	2025-09-09	CLT-MambaSeg: An integrated model of Convolution, Linear Transformer and Multiscale Mamba for medical image segmentation 2025-Sep, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110736 PMID:40716230	研究论文	提出一种结合卷积、线性变换器和多尺度Mamba的集成模型CLT-MambaSeg，用于医学图像分割，并通过MeGA-GAN生成合成图像解决数据有限问题	首次整合卷积、线性变换器和多尺度Mamba架构，并引入SREx模块捕获空间关系及MeGA-GAN生成合成数据增强性能	未明确说明模型在计算资源需求或实时应用方面的具体限制	提升医学图像分割的局部特征捕获、全局上下文建模及计算效率	医学图像分割任务	计算机视觉	皮肤癌（基于ISIC数据集），结肠癌（基于CVC-ClinicDB），乳腺癌（基于BUSI）	深度学习，生成对抗网络(GAN)	CNN, Transformer, Mamba, GAN	图像	五个基准数据集（CVC-ClinicDB, BUSI, PH2, ISIC-2016, ISIC-2017），具体样本量未明确
371	2025-09-09	Automatic quantitative analysis of atherosclerotic aortic plaques in patients with embolic cerebral infarction using deep learning 2025-Sep, The Korean journal of internal medicine DOI:10.3904/kjim.2024.360 PMID:40859808	研究论文	基于U-net深度学习模型自动量化分析动脉粥样硬化主动脉斑块，并评估其在栓塞性脑梗死患者中的临床应用价值	首次开发基于U-net的自动斑块分割模型，用于自动计算主动脉斑块面积（APA）和斑块比例（APR），并验证其在复杂斑块识别中的性能	模型估计的APA和APR在预测主要不良心脑血管事件方面未显示出额外价值，需要结合斑块活动性和形态学等更全面的定量分析	开发自动斑块分割模型并评估其在栓塞性卒中源不明（ESUS）患者中的临床实用性	711名因各种原因就诊于心血管中心的患者，以及ESUS患者的临床数据集	数字病理	心血管疾病	经食道超声心动图（TEE）	U-net	图像	711名患者（模型开发），多中心ESUS患者临床数据集（验证）
372	2025-09-09	Enhancing reconstruction-based out-of-distribution detection in brain MRI with model and metric ensembles 2025-Sep-01, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109045 PMID:40915097	研究论文	本研究通过集成模型和度量方法优化基于重建的自编码器，以提升脑MRI中的分布外检测性能	探索了简单OOD检测模型的潜力，优化了深度学习策略专门用于OOD检测，并系统评估了重建度量的选择	检测性能在不同伪影类型间存在差异，局部伪影较难检测，标准深度学习方法未完全解决OOD检测的特殊挑战	优化基于重建的自编码器，专门用于医学图像中的分布外检测，提高自动化医疗图像分析系统的可靠性	脑MRI图像中的合成局部和全局伪影	计算机视觉	NA	自编码器重建，LPIPS，SSIM对比度组件	Autoencoder	图像	包含多种伪影类型的脑MRI数据集
373	2025-09-09	Current Trends and Future Directions of Statistical Methods in Medical Research: A Scientometric Analysis 2025-Sep, Journal of evaluation in clinical practice IF:2.1Q2 DOI:10.1111/jep.70257 PMID:40916916	综述	通过科学计量分析探讨医学研究中统计方法的当前趋势与未来方向	结合CiteSpace工具进行双图谱叠加和文献共被引分析，量化跨学科知识流动及研究新颖性	基于Web of Science的4919篇文献，可能存在数据库选择性偏差	分析医学统计学领域的研究热点、学科交叉及方法论演变	医学统计学相关学术出版物	机器学习	NA	科学计量分析、关键词分析、引文网络分析	NA	文本（学术出版物元数据）	4919篇相关出版物
374	2025-09-09	Optimized multi-stage network with multi-dimensional spatiotemporal interactions for septal and apical hypertrophic cardiomyopathy classification using 12-lead ECGs 2025-Sep, Biomedical engineering letters IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s13534-025-00492-6 PMID:40917150	研究论文	提出一种优化的多阶段网络Ms-MdST，用于基于12导联心电图对室间隔和心尖肥厚型心肌病进行分类	结合一维和二维卷积分支捕获心电图时空特征，引入全局-局部交互注意力机制和多损失联合优化策略	NA	提高肥厚型心肌病分型的诊断准确性	室间隔肥厚和心尖肥厚型心肌病患者的心电图数据	医学图像分析	心血管疾病	深度学习	CNN结合注意力机制	心电图信号	NA
375	2025-09-09	SamRobNODDI:q-space sampling-augmented continuous representation learning for robust and generalized NODDI 2025-Aug-29, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adf9b8 PMID:40780245	研究论文	提出一种基于q空间采样增强的连续表示学习框架，用于提升NODDI参数估计的鲁棒性和泛化性	引入q空间采样增强的连续表示学习方法，并设计采样一致性损失函数，使模型对不同采样方案保持输出一致性	NA	开发能够在不同扩散梯度方向下稳健进行NODDI参数估计的方法	扩散磁共振成像(dMRI)数据	医学影像分析	神经系统疾病	扩散磁共振成像(dMRI)，Neurite orientation dispersion and density imaging (NODDI)	深度学习框架	医学影像数据	在19种不同q空间采样方案下与7种先进方法进行比较验证
376	2025-09-09	A deep learning-based approach for measuring patellar cartilage deformations from knee MR images 2025-Aug-27, Journal of biomechanics IF:2.4Q3 DOI:10.1016/j.jbiomech.2025.112930 PMID:40915052	研究论文	开发基于深度学习的方法从膝关节磁共振图像中自动测量髌骨软骨变形	首次使用2D和3D U-Net网络实现髌骨及软骨的自动分割，并成功检测运动诱导的软骨变形	研究样本量有限（109例膝关节MR扫描），且未与其他关节评估方法进行广泛比较	开发自动分割工具以研究髌骨软骨力学特性及其在早期骨关节炎中的变化	人类膝关节髌骨及软骨组织	计算机视觉	骨关节炎	磁共振成像（MR）	2D U-Net, 3D U-Net	医学图像	109例膝关节MR扫描
377	2025-09-09	Single-cell multiomics reveals the oscillatory dynamics of mRNA metabolism and chromatin accessibility during the cell cycle 2025-Aug-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116089 PMID:40751912	研究论文	通过单细胞多组学技术揭示细胞周期中mRNA代谢和染色质可及性的振荡动态	首次结合单细胞多组学测序、生物物理建模和深度学习量化mRNA转录、剪接、核输出和降解速率，揭示转录后调控在mRNA积累中的重要作用	NA	研究细胞周期中全基因组mRNA代谢动态和染色质可及性变化	增殖细胞中的基因表达调控	生物信息学	NA	单细胞多组学测序	深度学习	基因组学数据	NA
378	2025-09-09	Heat stress responses mediated by N6-methyladenine DNA methylation in maize 2025-Aug-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116058 PMID:40728929	研究论文	本研究揭示了玉米中N6-甲基腺嘌呤（6mA）DNA甲基化在热胁迫响应中的调控作用及其分子机制	首次在作物中发现6mA动态与热胁迫耐受性相关，鉴定ZmALKBH1作为6mA去甲基化酶，并利用深度学习模型预测6mA分布	NA	探究6mA在玉米热胁迫响应中的功能机制	玉米自交系B73、Mo17、W22和B104	表观遗传学	NA	全基因组6mA分析、深度学习模型	深度学习	甲基化组数据	四个玉米自交系（B73、Mo17、W22、B104）
379	2025-09-09	FoodABSANet: Developing an adaptive graph convolutional neural network for aspect-based sentiment analysis of food reviews with a weighted polarity score 2025-Aug-26, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2025.108635 PMID:40914996	研究论文	开发一种自适应图卷积神经网络用于食品评论的方面级情感分析，并引入加权极性评分	提出FoodABSANet模型，采用自适应图卷积神经网络处理方面间相互影响，并引入加权极性评分机制提升分析精度	NA	提升方面级情感分析在食品评论领域的准确性和细粒度情感挖掘能力	食品评论文本数据	自然语言处理	NA	深度学习	图卷积神经网络（GCN）	文本	NA
380	2025-09-09	Accurate VLE Predictions via COSMO-RS-Guided Deep Learning Models: Solubility and Selectivity in Physical Solvent Systems for Carbon Capture 2025-Aug-25, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01148 PMID:40757514	研究论文	开发基于COSMO-RS和深度学习的机器学习流程，用于精确预测物理溶剂系统中的溶解度和选择性，以支持碳捕获应用	结合量子化学热力学模型COSMO-RS与定向消息传递神经网络(D-MPNN)，通过迁移学习校正预测偏差，显著提升预测精度	依赖COSMO-RS模拟数据作为预训练基础，实验数据量仍可能限制模型泛化能力	提高物理溶剂在碳捕获过程中溶解度和选择性的预测准确性，减少对实验测量的依赖	物理溶剂系统，特别是针对CO₂及常见气体杂质(如H₂S、CH₄、N₂、H₂)的汽液平衡(VLE)	机器学习	NA	COSMO-RS量子化学热力学模型，定向消息传递神经网络(D-MPNN)，迁移学习	D-MPNN (Directed Message Passing Neural Network)	分子表示数据，附加特征数据，实验VLE数据	预训练使用30,000个COSMO-RS模拟数据点，并使用实验VLE数据集进行微调