深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-09-20	SynapseNet: Deep learning for automatic synapse reconstruction 2025-Oct-01, Molecular biology of the cell IF:3.1Q3 DOI:10.1091/mbc.E24-11-0519 PMID:40875337	研究论文	介绍SynapseNet，一种用于电子显微图像中突触自动分割和分析的工具	开发了基于深度学习的自动分割工具，支持多种电子显微镜方法，并包含领域自适应功能	NA	实现突触结构的自动分割与分析，促进大规模数据集的系统研究	突触囊泡、活性区、线粒体、突触前密度、突触带及突触区室等突触结构	计算机视觉	NA	电子显微镜成像	深度学习	图像	基于大规模标注数据集（具体数量未说明）
22	2025-09-20	Polyp segmentation in colonoscopy images using DeepLabV3+ 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110986 PMID:40876416	研究论文	本研究提出了一种基于DeepLabV3+改进的DeepLabV3++模型，用于提高结肠镜图像中息肉分割的精度和鲁棒性	在编码器中采用EfficientNetV2S减少可训练参数，并集成了多尺度金字塔池化(MSPP)和并行注意力聚合模块(PAAB)，重新设计了解码器结构	仅在三个公开数据集上进行验证，未提及临床实际应用环境的测试结果	提升结肠镜图像中息肉分割的准确性和鲁棒性，辅助结直肠癌的早期识别与诊断	结肠镜图像中的息肉区域	计算机视觉	结直肠癌	深度学习图像分割	DeepLabV3++, EfficientNetV2S	图像	三个公开数据集(CVC-ColonDB, CVC-ClinicDB, Kvasir-SEG)
23	2025-09-20	LUNAR: Periodicity-aware time-series analysis framework for LUNg Auscultation Respiratory detection 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110947 PMID:40876419	研究论文	提出一种周期性感知的深度学习框架LUNAR，用于自动检测肺听诊信号中的呼吸周期	集成新型呼吸周期性感知模块(RPAM)与CNN，显式建模呼吸周期的重复特性，无需依赖专家手动标注	NA	开发自动化呼吸周期检测方法以辅助呼吸系统疾病诊断	肺听诊信号	数字病理	呼吸系统疾病（哮喘、COPD、肺炎）	深度学习	CNN	时间序列信号	训练集279例，验证集ICBHI 126例和SNUCH_Lung 203例
24	2025-09-20	Advancements in biomedical rendering: A survey on AI-based denoising techniques 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110979 PMID:40882480	综述	本文调查了基于AI的去噪技术在生物医学渲染中的应用，并通过专业医护人员问卷分析其主观评价与定量指标的不一致性	通过专业医护人员的主观评价调查，揭示AI去噪技术在CT图像渲染中定量指标与主观感知之间的差异	样本量相对较小（74人），且依赖作者专业网络进行抽样，可能存在选择偏差	探究深度学习去噪技术在CT体积可视化中的主观评价与定量结果不一致的原因	放射科医师、住院医师、骨科外科医生和兽医等医疗专业人员	计算机视觉	NA	蒙特卡洛路径追踪，AI去噪	深度学习	CT图像，视频	74名医疗专业人员（经验<1年11人，1-3年27人，3-5年12人，>5年24人）
25	2025-09-20	Designing Buchwald-Hartwig Reaction Graph for Yield Prediction 2025-Sep-19, The Journal of organic chemistry IF:3.3Q1 DOI:10.1021/acs.joc.5c01400 PMID:40929732	研究论文	设计了一种用于Buchwald-Hartwig反应产率预测的新型反应图表示方法	提出Buchwald-Hartwig反应图，通过将每个反应物表示为图中的独立节点来模拟多组分相互作用，同时捕获单分子和分子间关系特征	NA	开发基于图神经网络的化学反应产率预测模型	Buchwald-Hartwig反应体系	机器学习	NA	图神经网络(GNN)	BH-RGNN (B-H Reaction Graph Neural Network)	化学反应数据	高通量B-H反应数据集
26	2025-09-20	PWLS-SOM: alternative PWLS reconstruction for limited-view CT by strategic optimization of a deep learning model 2025-Sep-19, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adffe0 PMID:40865562	研究论文	提出一种结合深度学习先验与数据一致性的新型有限视角CT重建方法PWLS-SOM	引入显著性评分机制量化模型参数贡献，并采用三阶段策略优化实现DL先验与PWLS自适应的融合	NA	改善有限视角CT中的条纹伪影抑制与鲁棒重建	CT投影数据	医学影像重建	NA	惩罚加权最小二乘(PWLS)重建、深度学习	深度学习网络	CT投影数据	大规模配对数据集（具体数量未说明）及死亡大鼠真实实验
27	2025-09-20	Full-Spectrum phototherapy in hair loss management: a systematic review of wavelength-dependent mechanisms, clinical efficacy, and future directions 2025-Sep-19, Lasers in medical science IF:2.1Q2 DOI:10.1007/s10103-025-04616-3 PMID:40968340	综述	本文系统综述了全光谱光疗在脱发管理中的波长依赖性机制、临床疗效及未来发展方向	提出新型'波长-穿透深度-靶向机制'模型，阐明全光谱光疗对毛囊再生的多层次调控作用	存在治疗窗口窄、患者反应差异大和组织穿透有限等未解决挑战	探讨光疗作为精准无创治疗方式在脱发管理中的应用潜力	脱发患者（包括斑秃和雄激素性脱发）的毛囊再生机制	医学光疗	脱发疾病	全光谱光疗（紫外到中红外波长）	NA	临床研究数据	NA
28	2025-09-20	MorphoITH: a framework for deconvolving intra-tumor heterogeneity using tissue morphology 2025-Sep-19, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01504-x PMID:40968388	研究论文	提出MorphoITH框架，利用组织形态学从病理切片推断肿瘤内异质性	开发了一种任务无关的自监督深度学习相似性度量方法，从多维度量化表型多样性	NA	研究肿瘤内异质性和肿瘤进化，支持精准肿瘤学	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）	数字病理学	肾癌	深度学习，多区域测序	自监督深度学习	组织病理学切片图像	NA
29	2025-09-20	Research progress and future prospects in intelligent lung sound diagnosis: models, lightweight design, and hardware platform implementation 2025-Sep-19, Biomedizinische Technik. Biomedical engineering DOI:10.1515/bmt-2025-0197 PMID:40968576	综述	本文系统回顾了基于深度学习的肺音智能识别技术，重点关注模型构建、轻量化设计及硬件平台部署的最新进展	深入探讨了肺音识别模型在嵌入式系统和FPGA等硬件平台的部署路径，特别是软硬件协同设计在边缘计算中的应用前景	NA	推动肺音智能识别技术在医疗辅助诊断领域的发展，实现低延迟本地推理	肺音信号	数字病理	呼吸系统疾病	深度学习	深度学习模型	音频信号	NA
30	2025-09-20	Cross-Modal Interaction-Aware Progressive Fusion Network for Drug-Target Interaction Prediction 2025-Sep-19, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01429 PMID:40970765	研究论文	提出一种用于药物-靶点相互作用预测的跨模态交互感知渐进融合网络（CIPFN）	引入双向交互感知模块精确对齐药物与蛋白质间的细粒度交互，并开发包含门控和卷积融合块的渐进融合网络	NA	改进药物-靶点相互作用（DTI）预测的准确性和效率	药物和蛋白质之间的相互作用	机器学习	NA	深度学习	CIPFN（包含门控和卷积融合块的融合网络）	跨模态数据（药物和蛋白质的交互信息）	五个基准数据集
31	2025-09-20	PPAP: A Protein-protein Affinity Predictor Incorporating Interfacial Contact-Aware Attention 2025-Sep-19, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01390 PMID:40970903	研究论文	提出一种结合界面接触感知注意力的蛋白质-蛋白质亲和力预测模型PPAP	整合结构特征与序列表示，通过界面接触感知注意力机制充分利用相互作用界面的结构信息	NA	准确预测蛋白质-蛋白质相互作用结合亲和力，以理解相互作用机制并指导蛋白质工程	蛋白质-蛋白质复合物	生物信息学	NA	深度学习	注意力机制神经网络	蛋白质序列和结构数据	未明确说明具体样本数量，但包含内部和外部测试集
32	2025-09-20	Deep learning-based acceleration and denoising of 0.55T MRI for enhanced conspicuity of vestibular Schwannoma post contrast administration 2025-Sep-19, Neuroradiology IF:2.4Q2 DOI:10.1007/s00234-025-03758-z PMID:40970959	研究论文	本研究评估基于深度学习的去噪算法在0.55T MRI中提升前庭神经鞘瘤对比度并缩短扫描时间的效果	首次在0.55T MRI中应用DL去噪技术，实现在保持图像质量的同时将扫描时间缩短超过一半	回顾性研究，样本量较小（30例患者），且仅针对前庭神经鞘瘤一种疾病	评估深度学习去噪技术对低场强MRI图像质量和扫描时间的改善效果	前庭神经鞘瘤患者	医学影像分析	前庭神经鞘瘤	MRI成像，深度学习去噪算法	深度学习（具体架构未说明）	医学影像	30例前庭神经鞘瘤患者（9名女性）
33	2025-09-20	Intelligent sports rehabilitation: integrating deep learning and real-time monitoring to achieve personalized rehabilitation 2025-Sep-19, Disability and rehabilitation. Assistive technology DOI:10.1080/17483107.2025.2559187 PMID:40970943	研究论文	本研究探讨将太极拳融入强制性药物康复计划对运动员的心理益处	结合太极拳这一传统文化运动与现代康复理念，验证其在心理康复中的有效性	样本量有限（172人），且仅针对特定运动员群体，结果普适性有待进一步验证	评估太极拳对运动员药物康复期间心理健康的改善效果	参与强制性药物康复计划的运动员	运动康复	药物成瘾	随机对照试验	NA	心理评估数据	172名参与者，平均分为太极拳干预组和对照组
34	2025-09-20	Deep Learning Models for Predicting Human Cytochrome P450 Inhibition and Induction 2025-Sep-18, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01192 PMID:40966069	研究论文	本研究开发了基于深度学习的模型，用于预测人类细胞色素P450酶的抑制和诱导作用	整合深度神经网络与PCA和SMOTE技术，开发了新型分类模型并能识别结构警报，还首次提出了专门预测hPXR激活的深度学习方法	NA	提高药物开发和安全评估中CYP酶抑制和诱导作用的预测效率	人类细胞色素P450酶（CYP3A4、CYP2D6、CYP1A2、CYP2C9、CYP2C19）及相关化合物	机器学习	NA	深度神经网络、主成分分析(PCA)、合成少数类过采样技术(SMOTE)	深度学习模型	化合物结构数据	NA
35	2025-09-20	Revisiting Protein-Protein Docking: A Systematic Evaluation Framework 2025-Sep-18, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01399 PMID:40966105	研究论文	提出一个用于系统评估蛋白质-蛋白质对接方法的综合基准框架	建立了统一的基准测试框架，包含经典数据集、新构建的抗体-抗原复合物数据集以及用于评估分布外泛化能力的数据集	深度学习模型在分布外泛化测试中表现显著下降	评估蛋白质-蛋白质对接方法的性能并比较传统与深度学习方法的优劣	11种蛋白质-蛋白质对接方法	计算生物学	NA	蛋白质-蛋白质对接	传统方法(HDOCK, PatchDock等)和深度学习方法(EquiDock, AlphaFold系列等)	蛋白质结构数据	使用DockingBenchmark 5.5数据集、AACBench抗体-抗原数据集和PPCBench数据集
36	2025-09-20	FourierMask: Explain EEG-based End-to-end Deep Learning Models in the Frequency Domain 2025-Sep-18, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3610742 PMID:40966133	研究论文	提出FourierMask框架，用于从频域角度解释基于EEG的端到端深度学习模型	首个专门为EEG模型频域解释设计的掩码扰动框架，包含傅里叶域变换、可学习掩码机制和集群感知正则化三项创新	NA	增强基于EEG的端到端深度学习模型的可解释性	脑电图（EEG）信号	机器学习	NA	傅里叶变换，深度学习	EEGNet, TSCeption, DeepConvNet	时间序列EEG信号	EEG基准数据集（具体数量未说明）
37	2025-09-20	Multi-source Discriminant Dynamic Domain Adaptation for Cross-subject Motor Imagery EEG Recognition 2025-Sep-18, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3610446 PMID:40966137	研究论文	提出一种多源判别动态域自适应模型（MSD-DDA），用于提升跨被试运动想象脑电信号的分类精度	动态最小化全局域与局部子域差异，引入批量核范数最大化保证目标域判别性，设计加权联合预测机制自适应调整多源域贡献	NA	通过域自适应技术解决跨被试脑电信号分类的泛化问题	运动想象（MI）脑电信号（EEG）	脑机接口	NA	域自适应（Domain Adaptation）	MSD-DDA（多源判别动态域自适应模型）	脑电信号（EEG）	基于BCI Competition IV数据集1和2a及openBMI数据集进行实验
38	2025-09-20	Multi-Channel Fusion Deep Wavelet Spectrum Network for Epileptic Signal Classification 2025-Sep-18, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3610433 PMID:40966141	研究论文	提出一种基于多通道小波频谱网络的癫痫信号分类方法MavenNet，用于改进癫痫自动检测和发作分类	结合连续小波变换和多通道卷积操作，保持EEG信号空间结构，并通过类激活映射增强模型可解释性	NA	改进癫痫的自动检测和癫痫发作分类	癫痫患者的脑电图（EEG）信号	机器学习	癫痫	连续小波变换（CWT），类激活映射（CAM）	多通道小波卷积网络（MavenNet）	EEG信号	三个广泛使用的数据集和一个私有数据集
39	2025-09-20	Continuous Reaching and Grasping with a BCI Controlled Robotic Arm in Healthy and Stroke-Affected Individuals 2025-Sep-18, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society IF:4.8Q1 DOI:10.1109/TNSRE.2025.3611821 PMID:40966144	研究论文	提出一种基于运动想象的脑机接口范式，通过添加‘点击’信号增强对机械臂的连续抓取控制能力	引入类似计算机鼠标的点击机制，在二维运动控制基础上增加额外自由度，实现连续抓取而非离散动作选择	脑电信号信噪比和空间分辨率较低，可能限制系统性能	开发能够同时控制运动和点击的脑机接口系统，用于复杂连续抓取任务	健康受试者和中风幸存者	脑机接口	中风	EEG信号处理，深度学习	DL	EEG信号	健康受试者和中风患者（具体数量未明确说明）
40	2025-09-20	Reply: Technical considerations in the development of a multimodal deep learning model for predicting hepatocellular carcinoma outcomes 2025-Sep-18, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001540 PMID:40966423	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA