深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
4221	2025-11-10	The Utility of Artificial Intelligence and Deep Learning to Automate and Accelerate Follicle Counts in Human Ovarian Tissue 2025-Nov-06, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf250 PMID:41206485	研究论文	开发了一种基于人工智能的方法，通过深度学习自动计数人类卵巢组织切片中的卵泡	首次整合DeepLabV3+分割和Faster R-CNN目标检测模型，实现卵巢组织全玻片图像中卵泡的自动化计数	分割模型的Dice系数仅为0.4939，目标检测模型的COCOmetric得分仅为0.27，表明模型性能有待提升	开发自动化卵泡计数方法以提高生育力保存研究和临床决策的准确性和可重复性	人类卵巢组织中的卵泡	数字病理学	生殖系统疾病	组织切片成像	CNN	图像	47名患者的1,857张全玻片图像，包含8,300个标注卵泡	NA	DeepLabV3+, Faster R-CNN	Dice系数, 灵敏度, 阳性预测值, COCOmetric	NA
4222	2025-11-10	Mechanism-Aware Deep Learning for Polar Reaction Prediction 2025-Nov-05, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.5c16838 PMID:41123925	研究论文	提出一种机制感知的深度学习框架PMechRP用于极性反应预测，结合多种模型架构和ArrowFinder机制预测模型	使用PMechDB极性基元步骤数据集捕获电子流动和机制细节，开发直接预测箭头推动机制的ArrowFinder模型，提出结合Chemformer集成和两阶段Siamese框架的混合流程	NA	提高化学反应预测的准确性和可解释性，提供机制洞察	极性化学反应	机器学习	NA	深度学习	Transformer, 图神经网络, Siamese网络	化学反应数据	PMechDB数据集和组合生成的反应数据	NA	Chemformer, 两阶段Siamese架构	预测准确率	NA
4223	2025-11-10	Multi-Regional deep learning models for identifying dental restorations and prosthesis in panoramic radiographs 2025-Nov-05, BMC oral health IF:2.6Q1 DOI:10.1186/s12903-025-07138-0 PMID:41194095	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的自动化方法，用于在全景X光片中识别多种牙科修复体和假体	首次使用多区域人群数据集训练深度学习模型，增强了模型的泛化能力和鲁棒性	仅使用了2,235张全景X光片，样本量相对有限	开发自动化牙科修复体和假体识别系统以提高临床诊断效率	牙科修复体（牙冠、牙桥、种植体）和牙科治疗（填充物、根管治疗、根管桩）	计算机视觉	牙科疾病	全景X光成像	YOLOv11, Faster R-CNN, ViT	医学图像	2,235张来自三个不同牙科学院的患者全景X光片	NA	YOLOv11, Faster R-CNN, Vision Transformer	准确率, 精确率, F1分数, 平均精度均值, 交并比	NA
4224	2025-11-10	MRI augmented with novel artificial intelligence system is equivalent to CT in glenoid imaging 2025-Nov-04, Shoulder & elbow IF:1.5Q3 DOI:10.1177/17585732251392203 PMID:41199812	研究论文	本研究开发了一种用于肩关节MRI图像自动分割的深度学习算法，并与CT扫描进行对比验证	首次证明通过AI增强的MRI在肩关节成像中可以达到与CT相当的解剖定义精度	样本量相对较小（64例患者），且为回顾性研究	评估MRI是否能够替代CT作为肩关节前向不稳患者首选的成像方式	肩关节前向不稳患者的影像学数据	医学影像分析	肩关节疾病	MRI, CT, 深度学习分割	深度学习算法	医学影像	64例患者（39例T1脂肪抑制MRI，25例VIBE MRI关节造影）	NA	NA	Dice相似系数, Spearman相关系数	NA
4225	2025-11-10	3D Swin Transformer for patient-specific proton dose prediction of brain cancer patients 2025-Nov-02, Acta oncologica (Stockholm, Sweden) DOI:10.2340/1651-226X.2025.43969 PMID:41178022	研究论文	本研究开发了一种基于3D Swin Transformer的深度学习模型，用于脑癌患者质子治疗的体素级剂量预测	首次将3D Swin Transformer集成到UNet架构中，用于脑癌质子治疗的剂量预测，实现了解剖结构感知的精确剂量分布预测	研究为回顾性分析，样本量有限（206例），需要前瞻性验证和临床部署优化	开发精确的质子放疗剂量预测模型，提高脑癌治疗计划的质量和一致性	206例原发性脑肿瘤患者	医学影像分析	脑癌	双能计算机断层扫描（CT）	Transformer, UNet	CT影像，剂量计划，临床轮廓	206例患者（训练集186例，测试集20例）	NA	3D Swin Transformer, UNet	3D伽马分析（3%/3 mm），平均绝对误差（MAE），临床靶区覆盖率（V95%），剂量体积直方图（DVH）	NA
4226	2025-11-10	Deep learning-based 3D dose reconstruction for intensity modulated radiation therapy using electronic portal imaging devices 2025-Nov, Journal of applied clinical medical physics IF:2.0Q3 DOI:10.1002/acm2.70328 PMID:41194494	研究论文	开发并评估基于深度学习的框架，直接从电子射野影像装置图像和计划CT重建三维患者剂量分布	无需依赖蒙特卡洛模拟或传统反投影方法，直接通过深度学习从EPID图像和CT数据重建3D剂量	高剂量梯度区域存在局部低估，3%/3mm标准的伽马通过率略低于部分先前研究	开发快速、患者特异性的3D剂量重建方法用于放疗质量保证	头颈部调强放疗患者	医学影像分析	头颈部肿瘤	电子射野影像装置(EPID)成像，CT成像	深度学习	医学影像(EPID图像，CT数据)	60例头颈部IMRT患者的512个射野场，10个独立测试病例	NA	Res-UNet	平均绝对误差(MAE)，均方误差(MSE)，剂量差异，3D伽马分析，剂量体积直方图(DVH)比较	NA
4227	2025-11-10	Validating clinical feasibility of MRCAT and deep learning-based synthetic CT images for cervical cancer patient 2025-Nov, Journal of applied clinical medical physics IF:2.0Q3 DOI:10.1002/acm2.70332 PMID:41194508	研究论文	本研究验证了基于MRCAT和深度学习的合成CT图像在宫颈癌患者放疗计划中的临床可行性	首次系统比较了传统MRCAT方法与深度学习合成CT在宫颈癌放疗计划中的表现	样本量较小（仅5例患者），GTV体积差异较大	验证合成CT图像在宫颈癌放疗计划中的临床应用价值	宫颈癌患者	医学影像分析	宫颈癌	磁共振成像，深度学习，放疗计划	深度学习网络	CT图像，MR图像	5例测试患者，40对训练数据	NA	NA	Dice相似系数，百分比差异，V20Gy，V30Gy	NA
4228	2025-11-10	Artificial Intelligence-Guided Total Mesorectal Excision: Development of a Deep Learning Model to Identify the Pelvic Fascial Plane Anatomy 2025-Nov, Annals of gastroenterological surgery IF:2.9Q2 DOI:10.1002/ags3.70064 PMID:41199968	研究论文	开发用于识别盆腔筋膜平面解剖结构的深度学习模型，实现人工智能引导的全直肠系膜切除术	首次开发能够实时识别盆腔筋膜平面关键解剖标志物的深度学习模型，为AI引导的全直肠系膜切除术提供概念验证	单中心回顾性观察研究，训练和验证数据来自不同手术视频	训练深度学习模型识别全直肠系膜切除术中盆腔筋膜表面解剖标志物，验证AI引导手术的可行性	腹腔镜全直肠系膜切除术中的盆腔筋膜解剖结构	计算机视觉	结直肠癌	腹腔镜手术视频分析	深度学习	手术视频图像	157个手术视频中的2861张图像	NA	Feature Pyramid Networks, EfficientNetB7	Dice相似系数, 召回率, 标准化表面Dice	NA
4229	2025-11-10	Multi-model approach to understand and predict past and future dengue epidemic dynamics 2025-Nov, Royal Society open science IF:2.9Q1 DOI:10.1098/rsos.241870 PMID:41200242	研究论文	本文提出一种多模型方法来理解和预测登革热流行病的过去和未来动态	整合新现有技术，引入经过训练和未训练的概率集成方法，开发气候信息和无协变量的深度学习预测模型	研究数据仅限于秘鲁北部2010-2021年期间，可能影响模型的普适性	理解和预测登革热流行病的时空动态，为公共卫生决策提供支持	秘鲁北部地区的登革热流行病数据	机器学习	登革热	小波分析，贝叶斯分层模型，深度学习	概率集成模型，时间序列模型，时间卷积网络	时间序列数据，流行病学数据，气候数据	秘鲁北部2010-2021年期间的登革热流行病数据	NA	时间卷积网络，基础时间序列模型	爆发检测可解释指标，集成模型性能评估	NA
4230	2025-11-10	Artificial Intelligence in Ophthalmology: Practical Applications, Subspecialty Evidence and Real-World Deployment 2025-Nov, Cureus DOI:10.7759/cureus.96121 PMID:41200258	综述	本文详细回顾了人工智能在眼科领域的实际应用、专科证据和现实部署情况	系统梳理了AI在眼科各亚专科的应用现状，特别关注新开发AI系统的有效性和局限性	存在监管审批、标准化、数据质量和伦理考虑等挑战，阻碍AI在眼科的广泛实施	评估人工智能技术在眼科领域的应用现状和发展前景	眼科疾病包括糖尿病视网膜病变、白内障、青光眼和年龄相关性黄斑变性等	医学人工智能	眼科疾病	深度学习, 机器学习	深度学习算法, 机器学习算法	光学相干断层扫描, 视网膜图像	筛选4449条记录，纳入102项研究	NA	NA	准确率	NA
4231	2025-11-10	Artificial Intelligence for the Diagnosis and Management of Cancers: Potentials and Challenges 2025-Nov, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.70460 PMID:41200279	综述	本文系统综述人工智能技术在癌症诊断与管理中的潜力、应用及挑战	全面分析AI在肿瘤学领域的转化现状，提出临床推广的解决方案与未来方向	尚未有成熟的AI模型获得临床使用授权	促进人工智能技术在肿瘤临床实践中的转化应用	癌症患者诊疗全流程	机器学习	癌症	机器学习，深度学习	NA	多层数据	NA	NA	NA	NA	NA
4232	2025-11-10	An interactive and explainable AI approach to improve human-machine teaming in cancer subtyping from digital cytopathology 2025-Oct-31, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2025.103856 PMID:41205246	研究论文	提出一种交互式可解释AI系统，通过数字细胞病理学图像辅助病理学家进行癌症亚型分类	结合可解释规则集和交互式细胞成分检查，在保持高性能的同时增强人机协作透明度	NA	改进癌症亚型分类中的人机协作效果	数字细胞病理学图像中的细胞	数字病理学	癌症	深度学习	深度学习	图像	NA	NA	NA	准确率	NA
4233	2025-11-10	Resformer: Time-token transformer with residual compensation for quality prediction in industrial processes 2025-Oct-31, ISA transactions IF:6.3Q1 DOI:10.1016/j.isatra.2025.10.048 PMID:41206226	研究论文	提出一种结合残差补偿的Transformer架构Resformer，用于工业过程质量预测	引入残差特征补偿机制和两阶段自编码结构，通过交叉注意力融合主次特征，使用时序令牌捕获过程变量的时空依赖性	仅在TE过程和烷基化工业过程数据集上验证，未在其他工业场景测试	解决传统自编码器在多元过程数据中欠拟合或过拟合的问题，提升软传感器建模性能	工业过程数据和质量变量	机器学习	NA	深度学习	Transformer	时间序列数据	田纳西伊士曼过程和工业烷基化过程数据集	NA	Transformer, 自编码器	NA	NA
4234	2025-11-10	Leveraging quantum chemical properties in transfer learning for predicting blood-brain barrier permeability of drugs 2025-Oct-29, Drug delivery and translational research IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s13346-025-02005-5 PMID:41160380	研究论文	本研究探索利用量子化学性质进行迁移学习来预测药物分子的血脑屏障渗透性	首次将量子化学性质与迁移学习相结合用于血脑屏障渗透性预测，相比传统分子描述符具有补充预测价值	实验验证仅使用了18种化合物，样本量相对较小	开发计算模型预测药物分子的血脑屏障渗透性，以加速中枢神经系统药物的研发	药物分子，特别是中枢神经系统活性或避让药物	机器学习	中枢神经系统疾病	PAMPA-BBB体外测定，量子化学计算	SVM, DNN, D-MPNN, 迁移学习	分子结构数据，量子化学性质	B3DB数据库约8,000种化合物，EEBL库18种实验验证化合物	NA	直接消息传递神经网络，深度神经网络	准确率，ROC-AUC	NA
4235	2025-11-10	AdaptiveWordBug: Generating adversarial texts with an adaptive scoring strategy against deep learning classifiers 2025-Oct-29, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.108262 PMID:41205356	研究论文	提出一种基于自适应评分策略的黑盒对抗文本生成方法AdaptiveWordBug，用于攻击深度学习文本分类器	提出自适应评分策略(ASS)，结合三种模型依赖评分方法和一种模型独立方法，并为每个方法分配可自动调整的自适应参数	仅在中文文本分类数据集上进行实验验证，未涉及其他语言或任务类型	提高对抗文本生成方法在文本分类任务中的攻击效果	深度学习文本分类模型	自然语言处理	NA	对抗攻击	BERT, ChatGPT	文本	NA	NA	Transformer	攻击效果	NA
4236	2025-11-10	scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations 2025-Oct-27, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056 PMID:41161490	研究论文	提出一种基于视觉迁移学习和表格-图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet	首次将掩码自编码器和视觉Transformer应用于单细胞RNA测序数据，通过树状图转换利用细胞标记基因信息	NA	开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的深度学习细胞类型注释方法	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	MAE, ViT	基因表达数据	NA	PyTorch	掩码自编码器, 视觉Transformer	准确率, 批次不敏感性	NA
4237	2025-11-10	Deep-learning-based virtual screening of antibacterial compounds 2025-Oct-24, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-025-02814-6 PMID:41136774	研究论文	本研究结合高通量筛选和深度学习虚拟筛选方法，发现了新型抗菌化合物	开发了GNEprop深度学习模型用于预测抗菌活性，实现了对14亿化合物的虚拟筛选，命中率比训练用高通量实验提升90倍	研究主要针对大肠杆菌敏感菌株，对其他细菌种类的适用性需要进一步验证	发现新型抗菌化合物以应对多重耐药细菌的威胁	小分子化合物和细菌菌株	机器学习	细菌感染	高通量筛选，虚拟筛选	深度学习	化学结构数据，生物活性数据	约200万个小分子用于初始筛选，超过14亿个合成可及化合物用于虚拟筛选	NA	GNEprop	分布外泛化能力，活性悬崖预测，命中率	NA
4238	2025-11-10	Performance of Automatic Speech Analysis in Detecting Depression: Systematic Review and Meta-Analysis 2025-Oct-22, JMIR mental health IF:4.8Q1 DOI:10.2196/67802 PMID:41124683	系统综述与荟萃分析	通过系统综述和荟萃分析评估自动语音分析在抑郁症检测中的诊断性能	首次对自动语音分析检测抑郁症的诊断准确性进行全面的定量综合分析，涵盖机器学习和深度学习方法	仅纳入英文发表的研究，临床应用中作为独立工具的适用性仍有限	评估自动语音分析在抑郁症检测中的诊断性能	抑郁症患者的语音数据	自然语言处理	抑郁症	自动语音分析	机器学习,深度学习	语音数据	105项研究纳入分析	NA	NA	准确率,敏感度,特异度,精确率	NA
4239	2025-11-08	The Role of Artificial Intelligence in Stroke Imaging in Emergency Settings: A Systematic Review 2025-Oct, Cureus DOI:10.7759/cureus.93941 PMID:41200652	系统综述	系统回顾人工智能在急诊卒中影像中的应用价值	首次系统评估AI在急诊卒中影像中的诊断性能、工作流程可行性和实施情况	纳入研究数量有限（9项），需要更多外部验证和临床工作流程无缝集成	评估人工智能在急诊卒中影像中的作用	急诊卒中患者的神经影像数据	医学影像分析	卒中	非对比计算机断层扫描（NCCT）、磁共振成像（MRI）、计算机断层扫描血管成像（CTA）	CNN, 深度学习	医学影像	NA	NA	卷积神经网络, 基于变换器的方法	AUC, 准确率, Kappa值, 平衡准确率	NA
4240	2025-11-10	Towards better Hebrew clickbait detection: Insights from BERT and data augmentation 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0332342 PMID:41196869	研究论文	本研究通过深度学习方法和数据增强策略提升希伯来语点击诱饵检测性能	首次将BERT模型与多样化数据增强技术结合应用于低资源希伯来语的点击诱饵检测，实现了性能突破	针对低资源语言的研究，数据规模可能有限，方法在其他语言的泛化性需进一步验证	提升希伯来语点击诱饵检测准确率，改善数字媒体内容质量	希伯来语点击诱饵标题	自然语言处理	NA	数据增强技术	BERT	文本	NA	NA	BERT	准确率	NA