深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
4461	2026-02-14	Meta-Learning With Unlabeled Query Updating and Consistency Learning for Few-Shot OCT Image Classification 2026-Mar, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2025.3602687 PMID:40853820	研究论文	本文提出了一种用于少样本OCT图像分类的新算法，结合元学习、无标签查询更新和一致性学习来提高模型对罕见疾病的诊断能力	首次在元学习中引入基于查询数据的无监督学习，提出跨集一致性学习以减少支持集和查询集之间元知识的差距，并集成数据混合以增强数据多样性	NA	解决传统深度学习在训练数据不足时难以实现罕见疾病自动诊断的问题	光学相干断层扫描（OCT）图像，用于筛查常见和罕见视网膜疾病	计算机视觉	视网膜疾病	光学相干断层扫描（OCT）	深度神经网络，元学习	图像	基于公共OCT数据集构建的轻量级子集，并在组织学图像数据集上进行了额外实验	NA	NA	分类准确率	NA
4462	2026-02-14	Classification of Brain Tumors in MRI Images with Brain-CNXSAMNet: Integrating Hybrid ConvNeXt and Spatial Attention Module Networks 2026-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00743-1 PMID:40739060	研究论文	本文提出了一种结合ConvNeXt和空间注意力模块的混合模型Brain-CNXSAMNet，用于MRI图像中脑肿瘤的分类	整合ConvNeXt以扩大感受野并捕获更广泛的空间上下文信息，同时引入空间注意力机制使网络能选择性关注信息丰富的区域，从而提升模型区分脑肿瘤类型和捕获复杂空间关系的能力	NA	开发一种AI驱动的诊断系统，用于准确高效地识别MRI图像中的脑肿瘤类型	脑肿瘤（包括脑膜瘤、垂体瘤和胶质瘤）的MRI图像	计算机视觉	脑肿瘤	磁共振成像（MRI）	CNN	图像	NA	NA	ConvNeXt, 空间注意力模块（SAM）	准确率	NA
4463	2026-02-14	AIP-TranLAC: A Transformer-Based Method Integrating LSTM and Attention Mechanism for Predicting Anti-inflammatory Peptides 2026-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00761-z PMID:40830309	研究论文	本文提出了一种名为AIP-TranLAC的新型深度学习框架，用于准确预测抗炎肽	整合了Transformer嵌入、双向长短期记忆网络、多头注意力和卷积神经网络，以捕获序列的局部和全局模式	未明确提及具体局限性	开发一种计算工具以加速治疗性肽的发现和炎症研究	抗炎肽	自然语言处理	炎症性疾病	深度学习	Transformer, LSTM, CNN	序列数据	NA	NA	Transformer, Bi-LSTM, CNN	NA	NA
4464	2026-02-14	AlzhiNet: Traversing from 2D-CNN to 3D-CNN, Towards Early Detection and Diagnosis of Alzheimer's Disease 2026-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00764-w PMID:40846816	研究论文	本研究提出了一种名为AlzhiNet的新型混合深度学习框架，用于阿尔茨海默病的早期检测与诊断	提出了一种结合2D-CNN和3D-CNN的混合深度学习框架，并引入了自定义损失函数和体积数据增强技术，以增强特征提取能力	未明确提及研究的局限性	提高阿尔茨海默病的早期检测和诊断准确性	阿尔茨海默病患者	数字病理学	阿尔茨海默病	磁共振成像	CNN	图像	来自Kaggle和MIRIAD数据集的MRI数据	NA	2D-CNN, 3D-CNN, ResNet-18	准确率, AUC	NA
4465	2026-02-14	Hot-Spot-Guided Generative Deep Learning for Drug-Like PPI Inhibitor Design 2026-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00756-w PMID:40897867	研究论文	本文提出了一种名为Hot2Mol的生成式深度学习框架，用于从头设计靶点特异性和类药物的蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂	Hot2Mol框架通过捕获热点残基的关键药效团特征，无需已知生物活性配体，实现了对PPI界面的精确靶向，并整合了条件Transformer、E(n)-等变图神经网络和变分自编码器以生成新颖多样的分子结构	未在摘要中明确提及	加速针对蛋白质-蛋白质相互作用的理性药物发现	蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂	机器学习	NA	生成式深度学习	Transformer, 图神经网络, 变分自编码器	分子结构数据	NA	NA	Transformer, E(n)-等变图神经网络, 变分自编码器	结合亲和力, 类药物性, 合成可及性, 新颖性, 独特性	NA
4466	2026-02-14	Evaluating Performance of a Deep Learning-based Artificial Intelligence Model for Ovarian Tumor Classification Using a Multicenter CT Dataset 2026-Mar, Radiology. Imaging cancer DOI:10.1148/rycan.250027 PMID:41686074	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的计算机辅助诊断模型，用于术前CT扫描中的卵巢肿瘤分类，并在多中心数据集上评估其性能	首次开发了基于CT扫描的深度学习模型用于卵巢肿瘤术前分类，并采用自监督学习在公共和机构数据集上进行训练，与现有超声模型和放射科医生评估进行了多中心比较	模型在外部测试集上的性能（AUC 0.61）明显低于内部测试集，表明模型泛化能力仍需提升，需要进一步改进才能投入临床应用	开发并评估基于深度学习的计算机辅助诊断模型，用于术前卵巢肿瘤的良恶性分类	卵巢肿瘤患者的CT扫描图像	数字病理学	卵巢癌	CT扫描	深度学习模型	医学影像（CT图像）	387个卵巢肿瘤图像，来自344名患者（226个良性，118个恶性）	NA	NA	AUC, 敏感性, 特异性, 阳性预测值, 阴性预测值	NA
4467	2026-02-14	Truth-based physics informed estimation of material composition in spectral CT in terms of density and effective atomic number 2026-Feb-13, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ae4284 PMID:41643313	研究论文	本研究开发并验证了一种基于物理信息生成对抗网络（GAN）的模型，用于将能谱CT图像分解为密度和有效原子数图	提出了一种结合物理信息正则化损失的GAN模型，利用经过验证的模拟数据进行训练，以提高材料分解的准确性和鲁棒性	临床验证样本量较小，限制了结果的泛化能力	开发并验证一种物理信息深度学习模型，用于能谱CT图像的材料分解	模拟腹部光子计数CT扫描数据、计算体模和临床病例	计算机视觉	NA	光子计数CT（PCCT）、能谱CT	GAN	图像	32个人体模型的模拟数据用于训练，16个计算体模和6个临床病例用于验证	NA	GAN	NRMSE, SSIM, PSNR, RMSE	NA
4468	2026-02-14	A novel automated parathyroid glands detection and segmentation method in thyroidectomy 2026-Feb-13, BMC surgery IF:1.6Q2 DOI:10.1186/s12893-026-03590-z PMID:41680745	研究论文	提出一种基于深度学习的术中甲状旁腺自动检测与分割方法PG-AI，用于甲状腺切除术中辅助识别	结合YOLOX定位子网与新型语义分割模型Trans-U-HRNet，实现实时术中图像中甲状旁腺的精确分割	数据集仅包含976张来自121例开放甲状腺切除术患者的图像，样本量有限且未说明外部验证集的具体来源与规模	开发一种术中自动识别与分割甲状旁腺的方法，以辅助外科医生在甲状腺切除术中保护甲状旁腺	甲状腺切除术患者的术中图像，重点关注甲状旁腺的检测与分割	计算机视觉	甲状腺疾病	近红外自体荧光成像	CNN, Transformer	图像	976张图像来自121例患者，其中101例用于训练与内部验证	NA	YOLOX, Trans-U-HRNet	准确率, 召回率, 识别率	NA
4469	2026-02-14	NanoLoop: A Deep Learning Framework Leveraging Nanopore Sequencing for Chromatin Loop Prediction 2026-Feb-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202517692 PMID:41684299	研究论文	本文介绍了NanoLoop，一个利用纳米孔测序数据进行全基因组染色质环预测的深度学习框架	首次提出利用纳米孔测序数据预测染色质环的算法框架，并发现了四种影响组蛋白修饰水平的环锚点甲基化模式	NA	预测全基因组染色质相互作用，研究DNA甲基化与三维基因组组织之间的潜在联系	人类淋巴母细胞系	机器学习	NA	纳米孔测序	深度学习	测序数据	四个人类淋巴母细胞系	NA	NA	NA	NA
4470	2026-02-14	Vector-Based Comparison and Average Slope Can Refine Bioequivalence Claims: A Machine and Deep Learning Approach 2026-Feb-13, Biopharmaceutics & drug disposition IF:1.7Q3 DOI:10.1002/bdd.70023 PMID:41684335	研究论文	本研究探讨了平均斜率（AS）和向量比较（VBC）两种创新概念在生物等效性研究中的应用，旨在提高吸收率测量的准确性和效率	结合AS和VBC方法，利用机器学习和人工神经网络技术，改进生物等效性研究的统计效能并减少样本量需求	NA	提高生物等效性研究的准确性和效率，简化研究流程并降低成本	生物等效性研究中的药代动力学参数和临床终点	机器学习	NA	药代动力学分析，向量分析	人工神经网络	药代动力学数据集	14个实际数据集	NA	NA	统计效能，变异性减少	NA
4471	2026-02-14	Deep learning-based cerebellar segmentation on T2-weighted fluid-attenuated inversion recovery magnetic resonance imaging for detecting cerebellar hypoplasia/atrophy in infants 2026-Feb-13, Pediatric radiology IF:2.1Q2 DOI:10.1007/s00247-026-06545-x PMID:41686223	研究论文	本研究开发并验证了一种基于深度学习的模型，用于婴儿脑部MRI中小脑体积的测量，旨在检测小脑发育不全或萎缩	针对婴儿（特别是2岁以下）小脑尺寸小、MRI组织对比度低的挑战，开发了首个专注于婴儿小脑分割的深度学习模型，并利用预测年龄与实际年龄的差异（Δage）作为分类指标来辅助诊断	模型在异常数据集上的分割精度（DSC 0.882）低于正常数据集（DSC 0.962），且异常数据集样本量较小（40例），可能影响模型的泛化能力和诊断性能评估	开发并验证一个深度学习模型，用于婴儿脑部MRI中的小脑分割和体积测量，以检测小脑发育不全或萎缩	婴儿脑部MRI扫描图像，包括正常婴儿和患有小脑发育不全或萎缩的婴儿	数字病理学	小脑发育不全/萎缩	T2加权液体衰减反转恢复磁共振成像	深度学习分割模型	MRI图像	训练集：558例新生儿MRI扫描；验证集：正常组492例，异常组40例	NA	NA	Dice相似系数, AUC	NA
4472	2026-02-14	Predicting cardiovascular events from routine mammograms using machine learning 2026-Feb-12, Heart (British Cardiac Society) DOI:10.1136/heartjnl-2025-325705 PMID:40957672	研究论文	本研究开发并测试了一种基于常规乳腺X光检查图像的深度学习算法，用于预测女性心血管事件风险	利用深度学习模型（基于DeepSurv架构）从常规乳腺X光检查图像中预测心血管风险，为女性心血管风险筛查提供了新方法	研究仅基于乳腺X光检查特征和年龄进行预测，未整合更多临床变量，且模型性能与传统工具相似，未显著超越	开发一种基于机器学习的心血管事件预测方法，以改善女性心血管风险评估	女性群体，特别是接受筛查乳腺X光检查的中年女性	机器学习	心血管疾病	乳腺X光检查	深度学习模型	图像	49196名女性，中位随访8.8年，其中3392人经历首次主要心血管事件	NA	DeepSurv	concordance index, Harrells C-statistic	NA
4473	2026-02-14	Integrating Medicinal Chemist Expertise with Deep Learning for Automated Molecular Optimization 2026-Feb-12, Journal of medicinal chemistry IF:6.8Q1 DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c03746 PMID:41617158	研究论文	本研究整合了药物化学家专业知识与深度学习，构建了自动化分子优化平台AutoOptimizer，并基于近9000个专家策略建立了首个深度学习生成的分子优化策略数据库	首次基于药物化学家专业知识构建深度学习生成的分子优化策略数据库，并开发了整合专家策略与图深度学习的自动化优化平台	未明确说明模型在更广泛靶点或复杂分子结构上的泛化能力，以及平台对计算资源的具体需求	开发自动化分子优化平台以加速先导化合物优化和药物发现进程	分子结构优化策略、FGFR4和HPK1靶点抑制剂	机器学习	NA	图深度学习	图神经网络	分子结构数据、专家策略文本	近9000个从药物化学文献中提取的分子优化策略	NA	MolOpt（基于图深度学习的框架）	IC50值（17.6 nM和46.5 nM）、优化倍数（77.6倍和51.6倍）	NA
4474	2026-02-14	Coded Event Focal Stack for Continuous Refocusing in Dynamic Scene 2026-Feb-12, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2026.3664082 PMID:41678483	研究论文	本文提出了一种名为编码事件焦栈的新方法，通过在调制焦距扫描期间记录的事件流捕获运动和深度信息，以实现动态场景中的连续重聚焦	引入编码事件焦栈，结合事件流和调制焦距扫描，能够生成任意焦距下的全时间中间帧，在动态场景中实现优越的重聚焦能力	未明确提及具体限制，但可能涉及事件流采集的硬件要求或复杂运动场景下的性能边界	解决传统相机在动态场景中因镜头限制导致的聚焦问题，开发连续重聚焦技术	动态场景中的运动和深度信息	计算机视觉	NA	事件流采集、调制焦距扫描	NA	事件流、合成和真实世界数据集	未明确指定样本数量，但涉及合成和真实世界数据集	NA	NA	未明确指定，但可能包括重聚焦准确性和时空一致性指标	NA
4475	2026-02-14	Facial Botox Injection Point Detection Using YOLOv8 Enhanced with CBAM and BiFPN: A Multi-Perspective Deep Learning Approach 2026-Feb-12, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-026-01867-6 PMID:41680574	研究论文	本研究提出了一种基于YOLOv8增强的物体检测框架，通过集成CBAM和BiFPN模块，用于在面部图像上精确检测肉毒杆菌注射点	首次将CBAM注意力模块和BiFPN特征金字塔网络集成到YOLOv8框架中，用于肉毒杆菌注射点检测，并在小皱纹定位任务上取得了显著改进	研究仅在一个新的高分辨率数据集上进行评估，未在更广泛的数据集或实际临床环境中验证	开发自动化系统以准确、一致地识别面部肉毒杆菌注射点，辅助美容皮肤科临床决策	面部图像中的肉毒杆菌注射点	计算机视觉	NA	深度学习物体检测	CNN	图像	NA	PyTorch	YOLOv8, CBAM, BiFPN	mAP@0.5	NA
4476	2026-02-14	Confidence-based prediction of antibiotic resistance at the patient level 2026-Feb-11, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.03431-25 PMID:41575464	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的模型，利用患者数据和抗生素敏感性测试结果来预测未测量的抗生素敏感性	该方法首次结合患者数据和抗生素敏感性测试结果，利用Transformer模型预测抗生素耐药性，并采用一致性预测来评估预测不确定性	模型在青霉素和喹诺酮类抗生素的耐药性预测中显示出较高的主要错误率	开发一种快速、准确的抗生素耐药性预测方法，以支持临床决策并减少抗生素过度使用	细菌感染患者及其抗生素敏感性测试结果	机器学习	细菌感染	抗生素敏感性测试	Transformer	文本数据	来自30个欧洲国家的300万份抗生素敏感性测试结果	NA	Transformer	准确率, 主要错误率, 非常主要错误率	NA
4477	2026-02-14	Noninvasive Staging of Hepatic Fibrosis in Patients with Autoimmune Liver Disease Using Deep Learning 2026-Feb-11, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2026.01.029 PMID:41680010	研究论文	本研究开发并验证了一种基于深度学习的非侵入性模型，利用常规二维B超图像对自身免疫性肝病患者的肝纤维化进行分期	首次将深度学习模型应用于基于常规二维B超图像的非侵入性肝纤维化分期，以替代有创的肝穿刺活检	研究为回顾性设计，样本量相对有限，且模型性能在外部验证集中略有下降	开发一种非侵入性方法，用于准确分期自身免疫性肝病患者的肝纤维化，以指导治疗	自身免疫性肝病患者	数字病理学	自身免疫性肝病	二维B超成像	CNN	图像	306名患者（内部训练/验证/测试集245名，外部测试集61名）	NA	ResNet34	宏平均AUC, 微平均AUC	NA
4478	2026-02-14	Clinical feasibility test of 60 kVp double-low-dose coronary CT angiography with a deep learning reconstruction algorithm 2026-Feb-10, Insights into imaging IF:4.1Q1 DOI:10.1186/s13244-026-02223-6 PMID:41665766	研究论文	本研究测试了采用深度学习重建算法的60 kVp双低剂量冠状动脉CT血管成像在临床中的可行性	首次将深度学习重建算法应用于60 kVp双低剂量冠状动脉CT血管成像，以显著降低辐射剂量和造影剂用量，同时保持与常规剂量成像在冠状动脉狭窄和CT-FFR评估方面的高一致性	样本量相对较小（89例患者），且研究为单中心前瞻性设计，可能需要更大规模的多中心验证	评估60 kVp双低剂量冠状动脉CT血管成像结合深度学习重建算法在临床应用的可行性	已知或疑似冠状动脉疾病的患者	医学影像	心血管疾病	冠状动脉CT血管成像	深度学习重建算法	医学影像	89例患者（44名女性，平均年龄59.9±13.2岁，平均BMI 23.1±3.3 kg/m²）	NA	NA	特异性, 阳性预测值, 准确率, AUC, 图像质量评分, 信噪比, 对比噪声比	NA
4479	2026-02-12	Reply: Deep learning and digital pathology power prediction of HCC development in steatotic liver disease 2026-Feb-10, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001697 PMID:41665974	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4480	2026-02-14	Deep GIST: Deep Learning Models for Predicting the Distribution of Hydration Thermodynamics around Proteins 2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c02389 PMID:41574593	研究论文	本文开发了名为Deep GIST的深度学习模型，用于快速预测蛋白质周围水合热力学量的空间分布，以替代计算密集的网格非均匀溶剂化理论方法	首次将深度学习应用于蛋白质水合热力学分布预测，将计算时间从数十小时缩短至数十秒，并能够考虑蛋白质构象波动	Δ()和Δ()的预测决定系数较低，模型性能有待进一步提升	开发高效准确的深度学习模型，用于预测蛋白质周围水合热力学量的空间分布	蛋白质周围的水合热力学分布，包括水合自由能Δ()、水合能Δ()和水合熵Δ()	机器学习	NA	分子动力学模拟，深度学习	深度学习模型	分子动力学模拟数据	NA	NA	NA	决定系数，相关系数	单个图形处理单元