深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
521	2024-12-19	LumVertCancNet: A novel 3D lumbar vertebral body cancellous bone location and segmentation method based on hybrid Swin-transformer 2024-03, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108237 PMID:38422966	研究论文	提出了一种基于混合Swin-transformer的新型3D腰椎椎体松质骨定位与分割方法	提出了一个两阶段的粗到细解决方案，结合了Swin-transformer和CNN的优势，并引入了新的LumAnatomy损失函数和多尺度注意力特征融合模块（MSA-FFM）	需要大量的标注数据，且算法复杂度较高	解决腰椎椎体松质骨的自动定位与分割问题，以辅助医学诊断和骨强度的人群分析	腰椎椎体松质骨的定位与分割	计算机视觉	NA	Swin-transformer, CNN	混合模型	图像	185个CT扫描数据
522	2024-12-19	Unsupervised domain adaptation for histopathology image segmentation with incomplete labels 2024-03, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108226 PMID:38428096	研究论文	本文提出了一种基于不完全标签的无监督域适应方法，用于组织病理学图像分割	本文提出了一种新的场景，即基于不完全标签的无监督域适应分割任务，并设计了SASN-IL网络，通过自适应染色调制模块提高模型在目标域上的分割性能	本文仅在一个胃癌数据集上进行了验证，未来需要在更多不同类型的数据集上进行测试	提高深度学习算法在组织病理学图像分割中的泛化能力	组织病理学图像的分割	数字病理学	胃癌	无监督域适应	SASN-IL	图像	一个胃癌数据集
523	2024-12-19	ECPC-IDS: A benchmark endometrial cancer PET/CT image dataset for evaluation of semantic segmentation and detection of hypermetabolic regions 2024-03, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108217 PMID:38430743	研究论文	本文发布了一个公开的子宫内膜癌PET/CT图像数据集ECPC-IDS，用于评估语义分割和检测高代谢区域	首次公开了一个包含大量多模态图像的子宫内膜癌数据集，为计算机辅助诊断提供了新的研究资源	NA	发布一个公开的子宫内膜癌PET/CT图像数据集，以促进计算机辅助诊断技术的发展	子宫内膜癌的PET/CT图像	计算机视觉	子宫内膜癌	深度学习	语义分割和目标检测模型	图像	分割部分包含7159张PET和CT图像，目标检测部分包含3579张PET和CT图像及XML标注文件
524	2024-12-19	scAuto as a comprehensive framework for single-cell chromatin accessibility data analysis 2024-03, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108230 PMID:38442554	研究论文	本文开发了一个名为scAuto的预训练深度学习框架，用于单细胞染色质可及性数据的分析，并提供了一个用户友好的在线分析工具	scAuto通过预训练和微调的方法，学习DNA序列的通用语法，并将其应用于单细胞染色质可及性分析任务，提供了一个全面的分析框架和交互式网络服务器	NA	开发一个全面的单细胞染色质可及性数据分析框架，并提供用户友好的在线分析工具	单细胞染色质可及性数据	机器学习	NA	深度学习	Transformer	文本	Buenrostro2018数据集
525	2024-12-19	CODENET: A deep learning model for COVID-19 detection 2024-03, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108229 PMID:38447500	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的新模型CODENET，用于通过胸部X光片进行COVID-19的自动诊断	该研究引入了对比学习技术，以充分利用潜在图像数据，增强模型在不同数据域中的特征提取能力和泛化能力	NA	开发一种准确且实用的自动诊断框架，用于COVID-19的检测，并提供良好的可解释性	COVID-19的自动诊断	计算机视觉	COVID-19	对比学习	CNN	图像	NA
526	2024-12-19	Predicting the diabetic foot in the population of type 2 diabetes mellitus from tongue images and clinical information using multi-modal deep learning 2024, Frontiers in physiology IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fphys.2024.1473659 PMID:39691096	研究论文	本文基于中医和西医的定量和定性融合数据，结合中医和西医的客观参数，建立了一个糖尿病足（DF）预测模型	本文创新性地将舌象特征与临床信息结合，利用多模态深度学习方法建立了糖尿病足预测模型，证明了中医舌诊在糖尿病足风险预测中的独特优势和重要作用	NA	建立一个基于临床特征和客观舌色的糖尿病足预测模型，验证中医舌诊的科学性	2型糖尿病患者的糖尿病足风险预测	机器学习	糖尿病	深度神经网络（DNN）	ResNet-50	图像和临床数据	391名患者，其中267名为糖尿病足患者
527	2024-12-19	Recognition and Localization of Maize Leaf and Stalk Trajectories in RGB Images Based on Point-Line Net 2024, Plant phenomics (Washington, D.C.) DOI:10.34133/plantphenomics.0199 PMID:39691278	研究论文	本文提出了一种基于Point-Line Net的深度学习方法，用于自动识别玉米田RGB图像中的叶片和茎秆数量及其生长轨迹	本文创新性地开发了Point-Line Net方法，基于Mask R-CNN框架，并引入了一个新的轻量级“关键点”检测分支，用于描述叶片和茎秆的位置和生长	本文主要在实验室环境下进行实验，尚未完全解决田间复杂背景和严重遮挡问题	探索深度学习技术在田间农业中获取叶片和茎秆数量及其生长轨迹的应用	玉米田中的叶片和茎秆数量及其生长轨迹	计算机视觉	NA	深度学习	Point-Line Net	图像	实验结果基于自定义的距离验证指数，达到了33.5的量级
528	2024-12-19	Artificial intelligence for chimeric antigen receptor-based therapies: a comprehensive review of current applications and future perspectives 2024, Therapeutic advances in vaccines and immunotherapy DOI:10.1177/25151355241305856 PMID:39691280	综述	本文综述了人工智能在嵌合抗原受体（CAR）疗法中的当前应用和未来展望	本文探讨了人工智能在CAR疗法中的多种应用，如使用深度学习设计CAR、自然语言处理提取临床信息、计算机视觉分析CAR细胞形态、强化学习优化CAR输注剂量等	本文指出了使用人工智能进行CAR疗法的挑战，包括数据质量不足、模型验证需求、AI输出偏差和错误风险、伦理法律问题以及对人类在癌症免疫治疗中角色的影响	探讨人工智能在CAR疗法中的应用及其未来发展方向	人工智能在CAR疗法中的设计、生产、交付等方面的应用	机器学习	NA	深度学习、自然语言处理、计算机视觉、强化学习	NA	文本、图像	NA
529	2024-12-19	Editorial: Investigating tumor immunotherapy responses in lung cancer using deep learning 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1529949 PMID:39691722	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
530	2024-12-19	EEG-based action anticipation in human-robot interaction: a comparative pilot study 2024, Frontiers in neurorobotics IF:2.6Q3 DOI:10.3389/fnbot.2024.1491721 PMID:39691819	研究论文	本研究探讨了如何利用脑电图（EEG）信号在人机交互中进行动作预测，以提高安全性和效率	本研究首次将EEG信号与深度学习技术结合，用于人机交互中的动作预测，展示了其在实时协作任务中的潜力	本研究仅进行了初步的试点实验，样本量较小，未来需要更大规模的研究来验证其有效性	探索如何利用EEG信号在人机交互中进行动作预测，以提高安全性和效率	人机交互中的动作预测	机器学习	NA	脑电图（EEG）	深度学习分类模型	脑电图信号	一个运动想象（MI）数据集，具体样本量未明确说明
531	2024-12-19	Predicting High-Grade Patterns in Stage I Solid Lung Adenocarcinoma: A Study of 371 Patients Using Refined Radiomics and Deep Learning-Guided CatBoost Classifier 2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3 DOI:10.1177/15330338241308610 PMID:39692551	研究论文	本研究开发了一种名为Refined Radiomics and Deep Learning Features-Guided CatBoost Classifier (RRDLC-Classifier)的诊断算法，用于预测临床I期实性肺腺癌中的高级别病理模式	本研究创新性地结合了精炼的放射组学和深度学习特征，开发了一种新的诊断算法RRDLC-Classifier，用于预测临床I期实性肺腺癌中的高级别病理模式	本研究为回顾性研究，样本量有限，可能存在选择偏倚	开发并评估一种新的诊断算法，用于预测临床I期实性肺腺癌中的高级别病理模式	临床I期实性肺腺癌患者的高级别病理模式	数字病理学	肺癌	放射组学、深度学习、CatBoost分类器	CatBoost分类器	影像	371名临床I期实性肺腺癌患者
532	2024-12-19	Spatiotemporal Rhythmic Seizure Sources Can be Imaged by means of Biophysically Constrained Deep Neural Networks 2023-Dec-01, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2023.11.30.23299218 PMID:38076950	研究论文	本文研究了一种基于深度学习的源成像框架（DeepSIF），用于从高密度脑电图（EEG）记录中成像药物难治性局灶性癫痫患者的癫痫发作活动	提出了一个新颖的深度学习源成像框架（DeepSIF），并展示了其在癫痫发作源成像中的优越性能	研究仅限于药物难治性局灶性癫痫患者，未来需要进一步验证其在其他类型癫痫中的应用	开发一种非侵入性方法来成像癫痫发作活动，以帮助指导临床决策和改善癫痫患者的治疗效果	药物难治性局灶性癫痫患者的癫痫发作活动	机器学习	癫痫	深度学习	深度神经网络	脑电图（EEG）	33名药物难治性局灶性癫痫患者
533	2024-12-19	EEG-Based Machine Learning Models to Evaluate Haptic Delay: Should We Label Data Based on Self-Reporting or Physical Stimulation? 2023 Oct-Dec, IEEE transactions on haptics IF:2.4Q2 DOI:10.1109/TOH.2023.3270666 PMID:37126610	研究论文	本文探讨了基于EEG数据的机器学习模型在评估触觉延迟时，使用自我报告标签与物理刺激标签的比较	首次系统研究了在评估触觉体验时，使用自我报告标签与物理刺激标签对机器学习模型性能的影响	研究结果仅适用于触觉延迟这一特定触觉体验，不能推广到其他触觉体验	探讨在评估触觉体验时，使用自我报告标签与物理刺激标签哪种方法更有效	触觉延迟的评估	机器学习	NA	EEG	机器学习模型和深度学习模型	EEG数据	NA
534	2024-12-18	Whole-body low-dose computed tomography in patients with newly diagnosed multiple myeloma predicts cytogenetic risk: a deep learning radiogenomics study 2025-Feb, Skeletal radiology IF:1.9Q3 DOI:10.1007/s00256-024-04733-0 PMID:38937291	研究论文	开发了一种基于全身低剂量CT（WBLDCT）的深度学习模型，用于预测多发性骨髓瘤（MM）患者的细胞遗传学异常	首次利用深度学习模型从全身低剂量CT扫描中预测多发性骨髓瘤患者的细胞遗传学风险	研究样本量相对较小，且仅限于新诊断的多发性骨髓瘤患者	开发和验证一种深度学习模型，用于预测多发性骨髓瘤患者的细胞遗传学异常	新诊断的多发性骨髓瘤患者	计算机视觉	多发性骨髓瘤	深度学习	深度学习模型	图像	151名多发性骨髓瘤患者
535	2024-12-18	Recent advancements and future directions in automatic swallowing analysis via videofluoroscopy: A review 2025-Feb, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2024.108505 PMID:39579458	综述	本文综述了通过视频荧光吞咽研究（VFSS）进行自动吞咽分析的最新进展和未来方向	利用计算机视觉、模式识别和深度学习技术，提供了新的范式来探索和提取VFSS记录中的信息	本文主要集中在图像处理技术在自动吞咽分析中的应用，未涵盖其他可能的技术方法	展示当前VFSS分析中的挑战，并提供未来开发更准确和临床可解释算法的见解	视频荧光吞咽研究（VFSS）记录中的解剖结构检测、食团对比分割和运动事件识别	计算机视觉	NA	计算机视觉、深度学习	深度学习模型	视频	46项研究
536	2024-12-18	Smartwatch ECG and artificial intelligence in detecting acute coronary syndrome compared to traditional 12-lead ECG 2025-Feb, International journal of cardiology. Heart & vasculature DOI:10.1016/j.ijcha.2024.101573 PMID:39687687	研究论文	本研究评估了基于智能手表的多通道、异步心电图（ECG）与人工智能（AI）系统结合用于诊断急性冠状动脉综合征（ACS）的可行性	本研究首次评估了基于智能手表的ECG与AI系统结合用于诊断ACS的可行性，并展示了其与传统12导联ECG相比的高诊断性能	本研究的样本量较小，且仅限于ACS患者和健康对照组，未来需要更大规模的研究来验证结果	评估基于智能手表的ECG与AI系统结合用于诊断ACS的可行性	急性冠状动脉综合征（ACS）患者和健康对照组	机器学习	心血管疾病	深度学习	AI-ECG工具	图像	56名ACS患者和15名健康参与者
537	2024-12-18	Advancing Ki67 hotspot detection in breast cancer: a comparative analysis of automated digital image analysis algorithms 2025-Jan, Histopathology IF:3.9Q1 DOI:10.1111/his.15294 PMID:39104219	研究论文	本文比较了基于虚拟双染色（VDS）和深度学习（DL）的数字图像分析算法在乳腺癌Ki67热点检测和评分中的临床表现	深度学习（DL）算法在临床适用性上优于虚拟双染色（VDS）算法，因为它不依赖于幻灯片的虚拟对齐，并且与手动评分相关性更强	NA	提高Ki67热点检测和评分的准确性，以改善乳腺癌的临床评估	Ki67热点检测和评分在乳腺癌中的应用	数字病理学	乳腺癌	数字图像分析（DIA）	深度学习（DL）	图像	135例连续的浸润性乳腺癌组织样本
538	2024-12-12	Application of deep learning algorithms in classification and localization of implant cutout for the postoperative hip 2025-01, Skeletal radiology IF:1.9Q3 DOI:10.1007/s00256-024-04692-6 PMID:38771507	研究论文	本研究探讨了使用卷积神经网络在骨盆前后位X光片上检测和定位植入物切出的可行性	首次使用深度学习算法进行植入物切出的分类和定位	对象检测模型在假阳性预测中产生了较多错误结果	验证深度学习算法在骨盆X光片上检测和定位植入物切出的可行性	骨盆前后位X光片上的植入物切出	计算机视觉	NA	卷积神经网络	卷积神经网络	图像	40191张骨盆X光片
539	2024-12-18	Deep Learning Applied to Diffusion-weighted Imaging for Differentiating Malignant from Benign Breast Tumors without Lesion Segmentation 2025-Jan, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240206 PMID:39565222	研究论文	本文评估并比较了不同人工智能模型在扩散加权成像（DWI）中区分良性和恶性乳腺肿瘤的性能，并与放射科医生的评估进行了比较	本文的创新点在于使用深度学习模型，特别是小型二维卷积神经网络（2D CNN），在不需要手动分割病变的情况下，区分良性和恶性乳腺肿瘤	本文的局限性在于研究是回顾性的，且样本量相对较小	研究目的是评估和比较不同人工智能模型在扩散加权成像中区分良性和恶性乳腺肿瘤的性能	研究对象是良性和恶性乳腺肿瘤的扩散加权成像数据	计算机视觉	乳腺癌	扩散加权成像（DWI）	卷积神经网络（CNN）	图像	334个乳腺病变，来自293名患者
540	2024-12-18	Long-term, automated stool monitoring using a novel smart toilet: A feasibility study 2025-Jan, Neurogastroenterology and motility IF:3.5Q2 DOI:10.1111/nmo.14954 PMID:39486001	研究论文	本文展示了一种新型智能马桶用于长期自动收集粪便图像数据的可行性，并评估了基于计算机视觉的分析方法来根据布里斯托粪便形式量表（BSFS）评估粪便形式	本文提出了一种新型智能马桶系统，能够长期自动收集粪便图像数据，并通过深度学习分割和数学定义的手工特征进行计算机视觉分析，以量化粪便的形态学属性	研究样本量较小，仅涉及六名健康志愿者，且研究时间相对较短	验证长期自动粪便形式监测的可行性和准确性	粪便形式的长期自动监测	计算机视觉	NA	深度学习分割	NA	图像	六名健康志愿者，共记录了474次排便图像