深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
561	2025-09-23	Classification of Electroencephalography Motor Execution Signals Using a Hybrid Neural Network Based on Instantaneous Frequency and Amplitude Obtained via Empirical Wavelet Transform 2025-May-23, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s25113284 PMID:40968836	研究论文	本研究比较了传统分类器与混合神经网络在基于EEG手势分类中的性能表现	提出结合经验小波变换瞬时频率和幅度的混合神经网络架构，在EEG手势识别中实现更高分类准确率	仅针对七个特定手势进行二分类任务，样本规模有限（33名参与者）	提高脑机接口系统中EEG手势识别的分类准确率	33名参与者执行的七种不同手势的EEG信号	脑机接口	NA	经验小波变换、带功率特征提取	混合神经网络、LDA、SVM	EEG信号	33名参与者的七种手势EEG记录
562	2025-09-23	TU-DAT: A Computer Vision Dataset on Road Traffic Anomalies 2025-May-22, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s25113259 PMID:40968794	研究论文	本文介绍了一个用于分析交通事故的计算机视觉数据集TU-DAT	首个结合真实监控视频和高保真模拟视频的混合交通异常数据集，包含时空标注和结构化元数据	NA	解决交通异常检测模型训练和评估缺乏公开数据集的问题	道路交通事故和异常驾驶行为	计算机视觉	NA	计算机视觉分析	混合深度学习和逻辑推理框架	视频	约280个真实世界和模拟视频
563	2025-09-23	Research on Measurement of Coal-Water Slurry Solid-Liquid Two-Phase Flow Based on a Coriolis Flow Meter and a Neural Network 2025-May-22, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s25113267 PMID:40968798	研究论文	基于科里奥利流量计和神经网络的水煤浆固液两相流测量误差校正研究	提出深度学习校正框架，通过BP神经网络和算法优化将两相流测量误差从5.11%降低至1.01%	研究聚焦水煤浆特定工况，未验证其他类型多相流体的适用性	提升科里奥利质量流量计在液固两相流场景下的测量精度	水煤浆固液两相流体	工业过程控制	NA	深度学习、神经网络优化	BP神经网络	流量计传感器数据	通过重复性实验构建的液固两相流测量数据集
564	2025-09-23	Underwater SLAM Meets Deep Learning: Challenges, Multi-Sensor Integration, and Future Directions 2025-May-22, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s25113258 PMID:40968800	综述	本文全面分析深度学习增强水下SLAM技术的最新进展，并提出基于水下无线传感器网络集成的新型分类框架	提出基于水下无线传感器网络（UWSNs）集成的新型分类框架，探讨通信感知SLAM方法如何提升水下导航精度和操作效率	作为综述论文，主要分析现有技术而非提出新算法，未进行实证性能验证	探讨深度学习技术如何克服水下SLAM面临的挑战，并展望未来研究方向	自主水下航行器（AUVs）和水下无线传感器网络（UWSNs）	机器人与自主系统	NA	深度学习、传感器融合、声学通信	Transformer架构、轻量级神经网络	多模态传感器数据、图像数据	NA
565	2025-09-23	Quantitative Assessment of Facial Paralysis Using Dynamic 3D Photogrammetry and Deep Learning: A Hybrid Approach Integrating Expert Consensus 2025-May-22, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s25113264 PMID:40968808	研究论文	提出结合动态3D摄影测量和深度学习的混合方法，用于面部瘫痪的客观量化评估	首次将面部运动点云数据与专家共识相结合，通过PointNet网络实现面部瘫痪严重程度的自动化定量评估	样本量较小（仅包含五种面部表情），需要进一步扩大数据集验证泛化能力	开发客观量化的面部瘫痪评估方法以解决临床主观评估的可重复性问题	面部瘫痪患者的面部运动数据	计算机视觉	面部神经疾病	动态3D摄影测量、深度学习	PointNet	3D点云数据	基于五种面部表情（静止状态和最大表情状态）的点云数据集
566	2025-09-23	LivecellX: A Scalable Deep Learning Framework for Single-Cell Object-Oriented Analysis in Live-Cell Imaging 2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.23.639532 PMID:40060645	研究论文	提出LivecellX深度学习框架，用于活细胞成像中的单细胞定向分析，解决细胞分割和追踪的准确性挑战	定义了分割校正新任务，提出纠正分割网络和轨迹级校正算法，利用归一化距离变换和合成增强技术	NA	开发可扩展的活细胞动态分析框架，提高单细胞分割和追踪精度	活细胞成像数据中的单细胞	计算机视觉	NA	深度学习、活细胞成像	CS-Net（纠正分割网络）	活细胞成像视频数据	包含来自两种不同类型显微镜的新型成像数据集
567	2025-09-23	FakeRotLib: expedient non-canonical amino acid parameterization in Rosetta 2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.27.640629 PMID:40093079	研究论文	提出FakeRotLib方法用于在Rosetta中快速参数化非经典氨基酸	开发了基于小分子构象统计拟合的旋转异构体分布建模方法，显著提升参数化效率并扩展可建模的NCAA类型	NA	改进Rosetta软件中非经典氨基酸的参数化方法	非经典氨基酸的旋转异构体分布建模	计算生物学	NA	统计拟合、小分子构象分析	NA	分子构象数据	NA
568	2025-09-23	Development of machine learning-based mpox surveillance models in a learning health system 2025-May-02, Sexually transmitted infections IF:3.6Q2 DOI:10.1136/sextrans-2024-056382 PMID:40318862	研究论文	开发基于机器学习和深度学习的猴痘监测模型，利用临床笔记进行病例检测	首次在学习型医疗系统框架下比较传统机器学习（LASSO回归）与深度学习模型（ClinicalBERT、ClinicalLongformer）在猴痘监测中的性能	单中心回顾性研究，样本量有限（228例病例），需外部验证	开发高效的猴痘病例自动监测模型以支持公共卫生 surveillance	经PCR确诊的猴痘患者及匹配对照组	自然语言处理	猴痘	机器学习、深度学习、自然语言处理	LASSO、ClinicalBERT、ClinicalLongformer	临床文本笔记	228例确诊病例和698例匹配对照
569	2025-09-23	Evaluation by dental professionals of an artificial intelligence-based application to measure alveolar bone loss 2025-Mar-01, BMC oral health IF:2.6Q1 DOI:10.1186/s12903-025-05677-0 PMID:40025477	研究论文	评估牙科专业人士对基于人工智能的牙槽骨丧失测量应用的接受度和使用效果	首次开发结合语义分割和物体检测网络的深度学习模型用于牙槽骨测量，并系统调查牙科专业人士对AI应用的接受度	样本量有限（56名专业人士），仅使用550张咬翼片X光片数据集	评估AI应用在牙槽骨高度测量中的准确性和牙科专业人士的接受度	牙科专业人士和咬翼片X光影像	数字病理	牙周病	深度学习	语义分割神经网络和物体检测网络	X光影像	56名牙科专业人士评估35个可计算测量值，使用550张咬翼片X光片训练集
570	2025-09-23	Cellpose as a reliable method for single-cell segmentation of autofluorescence microscopy images 2025-Feb-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82639-6 PMID:39952935	研究论文	本研究验证了深度学习网络Cellpose在自发荧光显微镜图像中进行单细胞分割的可靠性	开发了专门针对低信噪比自发荧光图像的自动荧光训练模型（ATM），首次系统验证了Cellpose在NAD(P)H自发荧光成像中的性能	研究主要针对PANC-1细胞系和9例患者来源的类器官，样本多样性有限	验证Cellpose深度学习网络在自发荧光显微镜图像单细胞分割中的准确性和可靠性	PANC-1细胞系和9例患者来源的癌症类器官	数字病理	癌症	多光子强度成像、荧光寿命成像显微镜（FLIM）	Cellpose深度学习网络	自发荧光显微镜图像	PANC-1细胞系和9例患者来源的癌症类器官
571	2025-09-23	Large-scale multi-center CT and MRI segmentation of pancreas with deep learning 2025-Jan, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103382 PMID:39541706	研究论文	本研究开发了一种名为PanSegNet的深度学习模型，用于大规模多中心的CT和MRI胰腺自动分割	结合nnUNet和Transformer网络优势，引入新型线性注意力模块实现体积计算，首次在大型多中心MRI数据集上进行胰腺分割研究	回顾性研究设计，缺乏前瞻性验证	开发精准的胰腺自动分割方法以辅助胰腺疾病诊断和随访	胰腺器官	医学影像分析	胰腺疾病	深度学习	nnUNet + Transformer	CT和MRI影像	2,117例扫描（767例MRI来自499名参与者，1,350例CT来自公开数据集）
572	2025-09-23	Histopathological image analysis and enhanced diagnostic accuracy explainability for oral cancer detection 2025, Polish journal of pathology : official journal of the Polish Society of Pathologists IF:0.7Q4 DOI:10.5114/pjp.2025.153973 PMID:40977550	研究论文	提出一种用于口腔癌组织病理学图像分类的深度学习模型，通过特征选择和可解释性增强诊断准确性	结合Vahadane染色标准化、加权Fisher评分特征选择和可解释人工智能技术，改进U-Net分类器使用特征输入而非完整图像	NA	开发高精度可解释的口腔癌检测系统以减少诊断错误	口腔癌组织病理学图像	数字病理学	口腔癌	深度学习，染色标准化，分水岭分割，数据增强	U-Net，DenseNet201，VGG10	组织病理学图像	NA
573	2025-09-23	Accuracy of Machine Learning in Detecting Pediatric Epileptic Seizures: Systematic Review and Meta-Analysis 2024-12-11, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/55986 PMID:39661965	系统综述与Meta分析	通过系统评价和Meta分析评估机器学习在儿童癫痫发作检测中的准确性	首次对机器学习在儿科癫痫发作检测领域的应用效果进行系统性量化评估，并比较了传统机器学习与深度学习的性能差异	纳入研究数量有限（28项），可能存在发表偏倚，各研究间方法学异质性较高	评估机器学习方法在儿童癫痫发作检测中的诊断准确性	儿童癫痫患者	机器学习	癫痫	机器学习（ML）、深度学习（DL）	多种ML/DL模型	脑电图（EEG）数据	基于28项原始研究（15项ML研究，13项DL研究）的汇总分析
574	2025-09-23	Leveraging Large Language Models for Improved Understanding of Communications With Patients With Cancer in a Call Center Setting: Proof-of-Concept Study 2024-12-11, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/63892 PMID:39661975	研究论文	本研究评估GPT-4在癌症患者电话咨询意图分类中的性能，并与传统深度学习模型进行比较	首次将GPT-4的上下文学习能力应用于癌症患者电话咨询分类，无需大量标注数据即可处理复杂查询	提示设计和类别定义需要进一步优化，尚未在实际医疗场景中完全验证	评估大语言模型在癌症患者电话咨询意图分类中的有效性	癌症患者的电话咨询记录	自然语言处理	癌症	大型语言模型、零样本学习、少样本学习	GPT-4、LSTM、BERT	文本	430,355条电话咨询句子（2016-2020年）
575	2025-09-23	Sex-and Stress-Dependent Plasticity of a Corticotropin Releasing Hormone / GABA Projection from the Basolateral Amygdala to Nucleus Accumbens that Mediates Reward Behaviors 2024-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.11.30.626183 PMID:39651305	研究论文	本研究揭示了基底外侧杏仁核向伏隔核的CRH/GABA投射在调控奖赏行为中的性别差异机制	首次发现CRH+/GABA能BLA-NAc投射的神经支配模式存在性别和早期逆境依赖差异	研究局限于小鼠模型，人类相关性需进一步验证	探究早期逆境对奖赏回路功能的性别特异性影响机制	成年雄性和雌性CRH-Cre转基因小鼠	神经科学	情感障碍	化学遗传学、免疫染色、电生理、组织透明化、光片荧光显微镜、深度学习	DREADD技术	神经影像数据、行为数据、电生理数据	控制组和早期逆境组的成年雄雌CRH-Cre小鼠
576	2025-09-23	Research trends of computational toxicology: a bibliometric analysis 2024-Oct, Toxicology research IF:2.2Q3 DOI:10.1093/toxres/tfae147 PMID:39309752	文献计量分析	通过文献计量学方法分析1977年至2024年计算毒理学领域的研究趋势	首次对计算毒理学领域近50年的研究发展进行系统性文献计量分析，揭示该领域向机器学习、分子对接和深度学习等先进计算方法演进的重要趋势	仅基于Web of Science数据库进行分析，可能未涵盖所有相关文献	评估计算毒理学领域的研究影响和发展趋势	计算毒理学领域的科学文献	计算毒理学	NA	文献计量分析、机器学习、分子对接、深度学习	pkCSM等预测模型	科学文献数据	1977年至2024年2月12日期间Web of Science数据库收录的计算毒理学相关文献
577	2025-09-23	Development and evaluation of a deep learning framework for the diagnosis of malnutrition using a 3D facial points cloud: A cross-sectional study 2024-07, JPEN. Journal of parenteral and enteral nutrition DOI:10.1002/jpen.2643 PMID:38796717	研究论文	开发并评估基于3D面部点云的深度学习框架用于营养不良诊断	首次使用PointNet++深度学习模型处理3D面部点云数据实现营养不良自动分类	样本量有限（482名患者），且为单中心横断面研究	开发精准诊断营养不良的深度学习工具	营养不良患者的面部特征	计算机视觉	营养不良	3D摄像技术	PointNet++	3D点云	482名患者（150名中度营养不良，54名重度营养不良）
578	2025-09-23	Deep Learning-Based H-Score Quantification of Immunohistochemistry-Stained Images 2024-Feb, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.modpat.2023.100398 PMID:38043788	研究论文	开发基于深度学习的自动化算法用于免疫组化图像H-score定量分析	首次提出仅基于苏木精染色训练深度学习模型进行区域识别，实现IHC图像的自动化H-score计算	未提及算法在不同类型IHC染色或罕见病例中的泛化能力验证	提高免疫组化图像分析的效率和准确性	免疫组化染色图像	数字病理	NA	免疫组化染色	深度学习模型	图像	NA
579	2025-09-23	Displacement of the Lamina Cribrosa With Acute Intraocular Pressure Increase in Brain-Dead Organ Donors 2023-12-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.64.15.19 PMID:38099735	研究论文	本研究通过光学相干断层扫描技术探究急性眼压升高对脑死亡器官捐献者视神经头深层组织变形的影响	首次在脑死亡器官捐献者中结合深度学习自动分割和三维量化算法，系统分析不同参考平面对筛板位移测量的影响	样本仅来自脑死亡器官捐献者，结果可能不适用于健康人群	研究急性眼压升高对视神经头深层组织结构的生物力学响应	20名脑死亡器官捐献者的26只眼睛	医学影像分析	眼科疾病	光谱域光学相干断层扫描（OCT）、深度学习分割算法	线性混合效应模型	医学影像数据	26只眼睛（来自20名捐献者，年龄范围22-62岁）
580	2025-09-23	Transfer learning enables predictions in network biology 2023-06, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06139-9 PMID:37258680	研究论文	开发了基于注意力机制的深度学习模型Geneformer，通过迁移学习提升网络生物学中数据稀缺场景下的预测能力	首次将迁移学习理念引入网络生物学领域，通过3000万单细胞转录组预训练模型，实现注意力权重自动编码网络层次结构	NA	解决罕见疾病和临床难以获取组织等数据稀缺场景下的基因网络预测问题	基因网络、染色质动力学、心肌病治疗靶点	机器学习	心肌病	单细胞转录组测序	基于注意力的深度学习模型（Geneformer）	转录组数据	约3000万个单细胞转录组