深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5841	2024-08-07	Correlating Deep Learning-Based Automated Reference Kidney Histomorphometry with Patient Demographics and Creatinine 2023-12-01, Kidney360 IF:3.2Q1 DOI:10.34067/KID.0000000000000299 PMID:37966063	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
5842	2025-04-03	Deep learning approximation of attenuation maps for myocardial perfusion SPECT with an IQ ⋅ ⋅ SPECT collimator 2023-08-28, EJNMMI physics IF:3.0Q2 DOI:10.1186/s40658-023-00568-1 PMID:37639082	研究论文	本研究探讨了使用深度学习从非衰减校正的SPECT重建中近似衰减图的可行性	首次展示了在配备IQ SPECT准直器的SPECT扫描仪上使用深度学习近似衰减图的方法	研究仅基于150项回顾性研究，样本量相对较小	开发一种无需CT图像即可进行SPECT心肌灌注成像衰减校正的方法	心肌灌注SPECT成像	数字病理学	心血管疾病	SPECT成像	U-Net与条件生成对抗网络框架	医学影像	150项回顾性研究
5843	2025-04-03	Integrative dissection of gene regulatory elements at base resolution 2023-Jun-14, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2023.100318 PMID:37388913	研究论文	结合表观遗传扰动、碱基编辑和深度学习技术，解析CD69基因调控元件的功能序列	首次在天然染色质环境中系统解析调控元件的功能序列，并发现GATA3与BHLHE40的相互作用在T细胞快速转录反应中的普遍作用	研究仅聚焦于Jurkat T细胞中的CD69基因座，未验证其他细胞类型或基因	解析基因调控元件的功能序列基础	CD69基因座的调控元件	基因组学	NA	表观遗传扰动、碱基编辑、深度学习	深度学习	基因组序列数据	Jurkat T细胞系
5844	2025-04-03	Quantitative imaging of apoptosis following oncolytic virotherapy by magnetic resonance fingerprinting aided by deep learning 2022-05, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1 DOI:10.1038/s41551-021-00809-7 PMID:34764440	研究论文	通过深度学习辅助的磁共振指纹图谱定量成像技术，检测溶瘤病毒治疗后的细胞凋亡	利用深度学习辅助的CEST-MRF技术，无需外源性对比剂即可快速检测肿瘤内pH值和蛋白质、脂质浓度	研究仅在多形性胶质母细胞瘤小鼠模型和一名健康志愿者中进行，样本量有限	开发一种非侵入性成像方法，用于检测溶瘤病毒治疗后的宿主反应	多形性胶质母细胞瘤小鼠模型和一名健康志愿者	数字病理学	多形性胶质母细胞瘤	化学交换饱和转移磁共振指纹图谱（CEST-MRF）	深度神经网络	磁共振成像数据	多形性胶质母细胞瘤小鼠模型和一名健康志愿者
5845	2025-04-02	A damage identification method for aviation structure integrating Lamb wave and deep learning with multi-dimensional feature fusion 2025-Jul, Ultrasonics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.ultras.2025.107623 PMID:40058116	研究论文	提出了一种结合Lamb波和多维特征融合深度学习的航空结构损伤识别方法	该方法首次将Lamb波信号的一维和二维处理与多维特征融合深度学习模型相结合，提升了损伤信息的时空表征能力，并尝试了跨几何传感器阵列的迁移研究	未明确说明方法在更复杂损伤场景下的适用性以及实际工程应用中的计算成本	解决航空结构健康监测中复杂传感信号的多维损伤信息提取和有效利用问题	航空器切割截面的结构损伤	结构健康监测	NA	Lamb波信号处理、Gramian角场(GAF)转换	包含1D分支网络(Inception-v1+BiLSTM)和2D分支网络(连续卷积+BiLSTM)的融合深度学习模型	一维时间序列信号、二维图像数据	未明确说明具体样本数量，但提到使用真实飞机切割截面的传感信号
5846	2025-04-02	Feature compensation and network reconstruction imaging with high-order helical modes in cylindrical waveguides 2025-Jul, Ultrasonics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.ultras.2025.107631 PMID:40101471	研究论文	提出了一种基于特征补偿和网络重建的逐步反演方法，结合高阶螺旋导波技术，用于管道缺陷的高分辨率成像	结合深度学习的高阶螺旋导波技术，扩展成像视野并实现管道缺陷的高分辨率成像	在有限视角条件下准确反演弱特征缺陷仍具挑战性	提高管道缺陷检测的准确性和分辨率	管道缺陷	无损检测	NA	高阶螺旋导波技术、深度学习	深度学习模型	超声波信号	50个随机选择的缺陷样本
5847	2025-04-02	Development and validation of a deep learning algorithm for the classification of the level of surgical difficulty in impacted mandibular third molar surgery 2025-May, International journal of oral and maxillofacial surgery IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.ijom.2024.11.008 PMID:39632213	研究论文	开发并验证了一种用于分类下颌第三磨牙手术难度水平的深度学习算法	使用YOLOv5模型首次实现了对下颌第三磨牙手术难度水平的自动分类	样本量相对较小，仅包含1730张全景X光片	开发一种能自动分类下颌第三磨牙手术难度的算法	下颌第三磨牙	计算机视觉	口腔疾病	深度学习	CNN, YOLOv5	图像	1730张全景X光片（1300训练，430测试）
5848	2025-04-02	Automated Cerebrovascular Segmentation and Visualization of Intracranial Time-of-Flight Magnetic Resonance Angiography Based on Deep Learning 2025-Apr, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01215-6 PMID:39133457	research paper	该研究提出了一种基于深度学习的自动化脑血管分割和可视化方法，用于颅内飞行时间磁共振血管成像（TOF-MRA）	提出了一种优于现有两种深度学习方法的新型CNN模型，其可视化效果被评估为与放射科医生手动重建的外观相似	研究未提及模型在更广泛或多样化数据集上的表现，可能限制了其普适性	评估深度学习血管分割技术在TOF-MRA中自动获取颅内动脉的图像质量	颅内动脉的TOF-MRA扫描图像	digital pathology	cardiovascular disease	TOF-MRA	CNN	image	394例TOF-MRA扫描（包括脑血管健康、动脉瘤或狭窄病例）
5849	2025-04-02	Quantitative Imaging of Colloidal Structures 2025-Apr-01, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acs.langmuir.4c05270 PMID:40098481	research paper	该论文提出了一种用于胶体材料显微镜图像定量分析的图像处理和分析方法	开发了确保复杂图像准确二值化的方法，并定义了基于二进制对象基本形态特征的度量标准	适用于手动标记不实用但深度学习方法不可行的情况，可能不适用于其他场景	解决胶体材料显微镜图像定量分析中的挑战	胶体聚集体和悬浮液的结构特征	图像处理	NA	图像处理和分析方法	NA	视频显微图像	自组装胶体团簇的多样化数据集
5850	2025-04-02	Uncertainty quantification for CT dosimetry based on 10 281 subjects using automatic image segmentation and fast Monte Carlo calculations 2025-Apr-01, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17796 PMID:40167139	research paper	本研究提出了一种结合自动图像分割与GPU加速蒙特卡罗模拟的新方法，用于分析10,281名接受CT检查的患者的器官剂量不确定性	结合深度学习自动分割与GPU加速蒙特卡罗模拟，处理大规模患者特异性器官剂量数据	研究仅基于中国一家医院的数据，可能无法完全代表其他地区或人群的情况	量化并理解CT剂量不确定性，改进依赖简化体模的剂量测定方法	10,281名接受CT检查的患者（6,419名男性和3,862名女性）	digital pathology	NA	自动图像分割，GPU加速蒙特卡罗模拟	DeepContour（深度学习模型）	CT图像	10,281名患者
5851	2025-04-02	Deep learning-based identification of vertebral fracture and osteoporosis in lateral spine radiographs and DXA VFA to predict incident fracture 2025-Apr-01, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research IF:5.1Q1 DOI:10.1093/jbmr/zjaf050 PMID:40167218	research paper	该研究利用深度学习技术从脊柱侧位X光片和DXA VFA图像中识别椎体骨折和骨质疏松症，以预测老年人骨折风险	开发了深度学习模型用于检测椎体骨折和骨质疏松症，并在DXA VFA数据集上进行了微调，提高了骨折风险预测的准确性	研究数据集来自单一三级医疗机构，可能影响模型的泛化能力	提高老年人骨折风险的预测准确性	脊柱侧位X光片和DXA VFA图像	digital pathology	geriatric disease	deep learning	DL	image	VERTE-X队列: 9276名个体的26299张脊柱侧位X光片；KURE队列: 部分DXA VFA数据集
5852	2025-04-02	Leveraging sound speed dynamics and generative deep learning for ray-based ocean acoustic tomography 2025-Apr-01, JASA express letters IF:1.2Q3 DOI:10.1121/10.0036312 PMID:40167492	研究论文	本文介绍了一种基于生成深度学习框架的射线海洋声学层析成像方法，用于估计声速剖面	利用变分自编码器和线性动力学模型对声速剖面变化进行低维参数化，作为进一步的正则化手段	方法仅在模拟数据上进行了测试，未涉及实际海洋环境数据	解决海洋声学层析成像中的逆问题，即基于多声学换能器之间的到达时间测量估计声速剖面	海洋声速剖面	机器学习	NA	变分自编码器，线性动力学模型	VAE	模拟声学数据	使用区域海洋模型模拟的声速剖面变化数据
5853	2025-04-02	Attention mechanism-based multi-parametric MRI ensemble model for predicting tumor budding grade in rectal cancer patients 2025-Apr-01, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-025-04886-z PMID:40167646	research paper	开发并验证了一种基于深度学习的多参数MRI特征集成模型，用于预测直肠癌患者的肿瘤萌芽分级	基于注意力机制的Transformer模块用于捕捉不同成像序列间的空间交互，构建多参数集成模型，相比单序列模型能更有效地预测肿瘤萌芽分级	模型间AUC值的差异在统计上不显著，样本量相对有限且为回顾性研究	预测直肠癌患者的肿瘤萌芽分级，为治疗选择和预后评估提供指导	458例经病理证实的直肠癌患者	digital pathology	rectal cancer	multiparametric MRI (T2WI, DWI)	CrossFormer, Transformer-based attention mechanism	MRI图像	458例患者（训练队列248例，内部验证107例，外部验证103例）
5854	2025-04-02	Deep learning-based segmentation of gallbladder cancer on abdominal computed tomography scans: a multicenter study 2025-Apr-01, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-025-04887-y PMID:40167645	research paper	该研究训练并验证了用于从增强CT图像中自动分割胆囊癌（GBC）病变的深度学习模型	使用多中心数据集训练和验证了2D和3D图像分割模型，并比较了它们的性能，其中MedSAM表现最佳	分割性能与GBC形态无关，且与病变大小的相关性较弱	开发并验证用于胆囊癌自动分割的深度学习模型	胆囊癌（GBC）患者	digital pathology	gallbladder cancer	contrast-enhanced CT	SAM Adapter, MedSAM, 3D TransUNet, SAM-Med3D, 3D-nnU-Net	image	训练和验证队列317例，内部测试队列29例，外部测试队列85例
5855	2025-04-02	Optimizing bladder magnetic resonance imaging: accelerating scan time and improving image quality through deep learning 2025-Apr-01, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-025-04895-y PMID:40167648	research paper	本研究探讨了深度学习在膀胱T2加权成像中的应用，以加速扫描时间并提高图像质量	首次在膀胱MRI中应用深度学习重建技术，显著减少扫描时间并提升图像质量	样本量较小（28例患者），且仅针对膀胱癌进行评估	评估深度学习在膀胱MRI中的临床应用价值	膀胱癌患者	digital pathology	bladder cancer	T2-weighted imaging, deep learning reconstruction	DL	MRI图像	28例连续膀胱癌患者
5856	2025-04-02	Coherence shaping for optical vortices: a coherence shift keying scheme enabled by deep learning for optical communication 2025-Apr-01, Optics letters IF:3.1Q2 DOI:10.1364/OL.549356 PMID:40167728	research paper	本研究提出了一种用于光学涡旋的相干整形方法，并通过深度学习实现了一种相干移位键控方案，用于光通信	提出了一种新的相干整形方法，能够生成完全相干和非相干状态之间的非衍射干涉状态，并首次将深度学习应用于相干移位键控方案	实验验证仅限于特定条件下的性能测试，未涉及大规模实际应用场景的验证	开发一种基于低阶结构光模式的高容量加密移位键控通信系统	光学涡旋的相干性和干涉状态	optical communication	NA	coherence shaping, deep learning	deep learning model	optical interference patterns	NA
5857	2025-04-02	Integrative deep learning and radiomics analysis for ovarian tumor classification and diagnosis: a multicenter large-sample comparative study 2025-Apr-01, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-025-02006-x PMID:40167932	research paper	本研究评估了结合经阴道超声（US）的放射组学和深度学习模型在大规模研究中准确区分良性和恶性卵巢肿瘤的有效性	结合CNN和放射组学模型，提供了一种更准确和可靠的卵巢肿瘤诊断方法	研究为回顾性研究，可能存在选择偏倚	评估结合放射组学和深度学习模型在卵巢肿瘤诊断中的有效性	良性和恶性卵巢肿瘤	digital pathology	ovarian cancer	transvaginal ultrasound (US)	CNN	image	3193张图像来自2078名患者
5858	2025-04-02	Diagnostic performance of deep learning-assisted [18F]FDG PET imaging for Alzheimer's disease: a systematic review and meta-analysis 2025-Mar-31, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1 DOI:10.1007/s00259-025-07228-9 PMID:40159544	meta-analysis	通过系统综述和荟萃分析评估深度学习辅助[18F]FDG PET成像在阿尔茨海默病诊断中的性能	首次对深度学习辅助[18F]FDG PET成像在阿尔茨海默病诊断中的性能进行系统综述和荟萃分析	研究间存在显著的异质性，部分归因于深度学习方法和成像模态的差异	评估深度学习辅助[18F]FDG PET成像在阿尔茨海默病诊断中的性能	阿尔茨海默病(AD)、轻度认知障碍(MCI)和正常对照(NC)	digital pathology	geriatric disease	[18F]FDG PET成像	深度学习(DL)	医学影像	36项符合纳入标准的研究
5859	2025-04-02	Toxicologic Pathology Forum*: Opinion on New Technologies and Trends Disrupting Drug Discovery and Development: How Can the Next Generation of Toxicologic Pathologists Be Prepared for Evolving Roles? 2025-Mar-31, Toxicologic pathology IF:1.4Q4 DOI:10.1177/01926233251321805 PMID:40159889	评论	本文探讨了制药行业技术创新的加速如何重塑药物研发，并提出了毒理病理学家如何适应和利用这些变化的建议	讨论了当前技术变革的速度和规模对毒理病理学家角色的影响，并提出了未来行业所需人才类型的思考	未提出具体的培训或教育方案来应对这些变化	探讨毒理病理学家如何适应制药行业的技术和社会变革，并利用这些变化为药物研发做出更大贡献	毒理病理学家和制药行业	数字病理	NA	人工智能、深度学习、数字病理	NA	NA	NA
5860	2025-04-02	Machine learning radiomics for H3K27M mutation prediction in gliomas: A systematic review and meta-analysis 2025-Mar-31, Neuroradiology IF:2.4Q2 DOI:10.1007/s00234-025-03597-y PMID:40163098	meta-analysis	该研究通过系统综述和荟萃分析评估了基于机器学习的影像组学模型在预测胶质瘤H3K27M突变中的性能	首次通过荟萃分析全面评估机器学习模型在预测H3K27M突变中的诊断性能，并比较了深度学习与传统机器学习模型的差异	纳入研究数量有限(15项)，且未对不同MRI序列或特征提取方法进行亚组分析	评估机器学习模型预测胶质瘤H3K27M突变的诊断性能	胶质瘤患者	digital pathology	glioma	MRI radiomics	machine learning/deep learning	medical imaging	15项研究(具体样本量未明确说明)