深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
5881	2026-04-05	Learning Deep Tree-Based Retriever for Efficient Recommendation: Theory and Method 2026-May, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2025.3648453 PMID:41452694	研究论文	本文提出了一种基于深度树的高效推荐检索器（DTR），通过软最大多类分类和损失函数修正方法，提升推荐效率并满足最大堆假设	提出DTR模型，将训练任务构建为同层树节点上的软最大多类分类，实现显式横向竞争和更优的top-k选择，同时引入损失函数修正和基于树的采样方法以提升泛化能力	未明确说明模型在大规模候选集下的计算成本或实际部署中的具体限制	提高深度推荐模型的推荐效率，同时保持推荐准确性	基于树结构的深度推荐模型	机器学习	NA	NA	深度树模型	推荐数据	四个真实世界数据集	NA	Deep Tree-based Retriever (DTR)	推荐准确性, 推荐效率	NA
5882	2026-04-05	Revisiting Out-of-Distribution Detection in Real-Time Object Detection: From Benchmark Pitfalls to a New Mitigation Paradigm 2026-May, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2025.3650695 PMID:41489965	研究论文	本文针对实时目标检测中的分布外检测问题，揭示了现有评估基准的缺陷并提出了一种新的训练时缓解范式	揭示了广泛使用的OoD评估基准存在根本性缺陷（高达13%的标注错误），并提出了一种不依赖外部OoD检测器的新型训练时缓解范式，通过语义相似的合成OoD数据集微调检测器	未明确说明合成OoD数据集的构建细节和规模，且方法在极端分布偏移场景下的有效性有待验证	有效减少目标检测器中由分布外输入引发的幻觉错误	实时目标检测模型	计算机视觉	NA	深度学习	CNN, Transformer	图像	BDD-100K数据集	PyTorch	YOLO, Faster R-CNN, RT-DETR	幻觉错误减少率	NA
5883	2026-04-05	Learn to Enhance Sparse Spike Streams 2026-May, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2026.3653768 PMID:41528913	研究论文	本文提出了首个深度学习框架SS2DS，用于将稀疏的脉冲流增强为密集的脉冲流，以解决脉冲相机在低光照高速场景下的性能下降问题	提出了首个深度学习框架SS2DS，能够调整稀疏脉冲流的时间分布，并首次构建了合成和真实的稀疏脉冲流数据集进行评估	未明确说明模型在极端低光照条件下的鲁棒性，以及计算复杂度和实时性方面的具体表现	解决脉冲相机在低光照高速视觉任务中脉冲信号稀疏导致的性能下降问题	脉冲相机产生的稀疏脉冲流	计算机视觉	NA	脉冲相机成像	神经网络	脉冲流数据	合成和真实稀疏脉冲流数据集（具体数量未明确）	NA	SS2DS	MA, BRISQUE, NIQE, PSNR, SSIM, LPIPS	NA
5884	2026-04-05	Consistency-Aware Spot-Guided Transformer for Accurate and Versatile Point Cloud Registration 2026-May, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2026.3653989 PMID:41533614	研究论文	本文提出了一种用于点云配准的一致性感知点引导Transformer模型，旨在通过改进粗匹配过程提升配准的准确性和效率	设计了两种稀疏注意力机制：一致性感知自注意力通过选择具有全局一致对应关系的点子集来传播全局一致性；点引导交叉注意力将注意力限制在动态定义的“点”区域，以消除相似但不相关区域的干扰	未明确说明模型在极端噪声或严重遮挡场景下的性能，也未讨论计算资源消耗的具体量化数据	提升点云配准的准确性、效率和鲁棒性，并增强模型在未见领域的泛化能力	室外LiDAR数据集和室内RGB-D相机数据集中的点云	计算机视觉	NA	NA	Transformer	点云	NA	NA	一致性感知点引导Transformer (CAST)	准确性, 效率, 鲁棒性	NA
5885	2026-04-05	Single-Photon Imaging in Complex Scenarios via Physics-Informed Deep Neural Networks 2026-May, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2026.3654264 PMID:41538339	研究论文	提出一种物理信息深度神经网络框架，用于复杂场景下的单光子成像，通过嵌入成像物理实现无监督学习	将成像物理嵌入深度神经网络，引入多尺度时空先验和体积渲染，并设计双分支结构以应对多深度和雾遮挡	未明确说明计算资源需求或模型在极端低信噪比下的性能边界	解决复杂场景下单光子成像的低信噪比和泛化问题	单光子成像系统捕获的3D结构数据	计算机视觉	NA	单光子成像	深度神经网络	图像	NA	NA	U-Net	均方根误差	NA
5886	2026-04-05	Rapid assessment of pesticide toxicity in aquatic ecosystems using deep learning-based automatic duckweed counting method 2026-May, Aquatic toxicology (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1016/j.aquatox.2026.107791 PMID:41887020	研究论文	本研究利用基于深度学习的自动浮萍计数方法快速评估农药对水生生态系统的毒性	应用基于StarDist技术的优化自动浮萍计数工具，实现高通量、自动化的农药毒性评估	仅测试了28种常用农药，且毒性评估基于实验室条件，可能无法完全反映自然环境中的复杂效应	评估农药对水生植物的毒性，为农药环境风险评估提供快速有效的方法	浮萍（Wolffia globosa）	计算机视觉	NA	StarDist技术	深度学习	图像	28种常用农药（包括除草剂、杀菌剂和杀虫剂）对浮萍生长的测试	NA	StarDist	IC值（抑制浓度）	NA
5887	2026-04-05	Neuroimaging-Based Deep Learning Applications for Lesion Detection and Predicting the Outcome Following Epilepsy Surgery 2026-May, Neuroimaging clinics of North America IF:1.3Q3 DOI:10.1016/j.nic.2025.10.002 PMID:41932780	综述	本文综述了基于神经影像的深度学习在癫痫手术病灶检测和术后结果预测中的应用	总结了深度学习在癫痫手术病灶检测中的进展，并探讨了其在术后结果预测方面的探索性应用	基于神经影像的手术结果预测模型仍处于探索阶段，缺乏透明、可解释和前瞻性验证	评估深度学习在癫痫手术病灶检测和术后结果预测中的应用潜力	药物难治性局灶性癫痫患者	医学影像分析	癫痫	神经影像（如MRI）	深度学习模型	神经影像数据	多中心大型研究	NA	NA	NA	NA
5888	2026-04-05	Synthetic data-augmented machine learning for 30-day readmission prediction in patients with chronic conditions: a retrospective real-world study 2026-Apr-03, BMJ open IF:2.4Q1 DOI:10.1136/bmjopen-2025-108273 PMID:41932702	研究论文	本研究开发并评估了一个结合合成数据增强的可解释机器学习框架，用于预测慢性阻塞性肺疾病、心力衰竭和2型糖尿病患者的30天非计划性再入院，并识别关键临床和社会预测因子	采用合成数据生成技术（包括高级重采样和基于深度学习的方法）来解决结果不平衡问题并改进模型训练，同时结合了结构化变量和非结构化临床笔记信息	研究基于单一三级学术医疗中心（MIMIC-IV数据库）的数据，可能限制了结果的普遍性，且为回顾性研究	开发一个可解释的机器学习框架，预测慢性病患者的30天非计划性再入院，并识别关键预测因子	患有慢性阻塞性肺疾病、心力衰竭或2型糖尿病的成年住院患者	机器学习	慢性阻塞性肺疾病, 心力衰竭, 2型糖尿病	合成数据生成（高级重采样和深度学习技术）	集成机器学习模型	电子健康记录数据（包括结构化变量和非结构化临床笔记）	慢性阻塞性肺疾病患者14,050人，心力衰竭患者7,097人，2型糖尿病患者12,735人	未明确指定（提及了多种机器学习方法）	未明确指定具体架构	未明确指定具体指标（但提及了使用五折交叉验证评估预测性能）	NA
5889	2026-04-05	Label-free pathological subtyping of non-small cell lung cancer using deep classification and virtual immunohistochemical staining 2026-Apr-03, NPJ digital medicine IF:12.4Q1 DOI:10.1038/s41746-026-02557-x PMID:41933080	研究论文	本研究提出了一种无标记方法，利用自发荧光成像和深度学习技术对非小细胞肺癌进行病理亚型分类和虚拟免疫组化染色	采用无标记的自发荧光成像结合深度学习，实现非小细胞肺癌亚型的快速准确区分，并生成临床级虚拟免疫组化染色，避免了传统染色过程的耗时与成本	未明确说明样本来源的多样性或外部验证集的情况，可能影响模型的泛化能力	开发一种无标记、快速且准确的非小细胞肺癌病理亚型分类方法，以加速诊断流程	非小细胞肺癌组织样本，包括非癌组织、腺癌、鳞状细胞癌及其他亚型	数字病理学	肺癌	自发荧光成像（强度成像和寿命成像）	深度学习	图像	未明确说明具体样本数量	未明确说明	未明确说明具体架构	曲线下面积	未明确说明
5890	2026-04-05	Improving Diabetic Foot Care With Infrared Thermography and Artificial Intelligence: A Review 2026-Apr-03, Journal of diabetes science and technology IF:4.1Q2 DOI:10.1177/19322968261432639 PMID:41933482	综述	本文综述了红外热成像与人工智能在糖尿病足护理中的应用，分析了37篇相关研究	整合红外热成像与人工智能技术，用于糖尿病足并发症的识别和风险预测，强调了自动诊断系统的潜力	研究多局限于使用预准备数据集进行足部热图分类，分割方法研究有限，且因缺乏大规模多样化数据集而限制了深度学习的应用	评估红外热成像与人工智能在糖尿病足护理中的潜力，以改善决策、减少错误并支持预后评估	糖尿病足并发症的识别和风险预测	计算机视觉	糖尿病足	红外热成像	NA	图像	NA	NA	NA	NA	NA
5891	2026-04-05	INB3P: A Multi-Modal and Interpretable Co-Attention Framework Integrating Property-Aware Explanations and Memory-Bank Contrastive Fusion for Blood-Brain Barrier Penetrating Peptide Discovery 2026-Apr-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202523984 PMID:41933929	研究论文	提出一个名为INB3P的多模态可解释共注意力框架，用于发现血脑屏障穿透肽，该框架整合了属性感知解释和记忆库对比融合技术	提出了物理化学引导突变（PCGM）这一新颖的数据增强策略，通过强制生化约束来扩展训练多样性而不违反生物流形；同时开发了双向共注意力机制融合序列和结构信息，并通过对比学习和Stable-MCC损失进行优化	未明确说明模型在极端数据稀缺情况下的泛化能力极限，也未详细讨论计算资源需求	解决功能肽（特别是血脑屏障穿透肽）发现中因数据极度稀缺和深度学习“黑箱”性质带来的限制	血脑屏障穿透肽（BBBPPs）	生物信息学，机器学习	神经系统疾病相关药物递送	物理化学引导突变（PCGM），对比学习	多模态深度学习框架，共注意力机制	序列数据，结构数据	NA	NA	双向共注意力机制	NA	NA
5892	2026-04-05	Dynamic modulation of social gaze by sex and familiarity in marmoset dyads 2026-Apr-02, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.105034 PMID:41925718	研究论文	本研究开发了一种新框架，用于精确追踪自由活动的普通狨猴的面部特征和三维头部注视方向，并量化了性别和熟悉度对其社交注视行为的影响	开发了一种结合深度学习计算机视觉工具和三角测量算法的新框架，能够在自由活动状态下准确追踪多只狨猴的面部特征和三维头部注视方向，克服了传统方法需限制头部运动的局限	NA	研究非人灵长类动物在自然状态下的社交注视行为，并探究性别和熟悉度对其的影响	自由活动的普通狨猴	计算机视觉	NA	深度学习, 三角测量算法	CNN	视频	NA	NA	NA	NA	NA
5893	2026-04-05	Artificial Intelligence-Assisted reflectance confocal microscopy for Real-Time intraoperative margin assessment in oral squamous cell carcinoma 2026-Apr-02, Oral oncology IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.oraloncology.2026.107939 PMID:41932031	研究论文	本研究评估了人工智能驱动的反射共聚焦显微镜模型在口腔鳞状细胞癌中的诊断性能，旨在开发用于术中即时检测的平台	首次将人工智能模型与反射共聚焦显微镜结合，用于口腔鳞状细胞癌的实时术中切缘评估，并实现了高精度的诊断性能	研究依赖于特定数据集和Google Cloud平台，可能限制了模型的泛化能力和实际部署的灵活性	开发一种准确、快速、非侵入性的方法，用于口腔鳞状细胞癌的诊断和术中切缘评估	口腔鳞状细胞癌患者	数字病理学	口腔鳞状细胞癌	反射共聚焦显微镜	深度学习模型	图像	4,090张注释的反射共聚焦显微镜图像（1,998张良性，2,092张恶性）	Google Cloud Vertex AI Automated Machine Learning (AutoML) Vision	NA	AUC-PR, AUC-ROC, 灵敏度, 特异性, 准确率, 阳性预测值, 阴性预测值	Google Cloud Vertex AI平台
5894	2026-04-05	AI-based methods for simulating, sampling, and predicting protein ensembles 2026-Apr-02, Current opinion in structural biology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.sbi.2026.103251 PMID:41932144	综述	本文综述了基于AI的蛋白质集合模拟、采样和预测方法的最新研究进展	强调了通过模型训练、模拟和推理的闭环来克服训练数据可用性挑战，并推动下一代模型发展	当前方法的技术成熟度尚需现实评估，且训练数据可用性存在挑战	推动基于AI的蛋白质集合预测技术发展	蛋白质集合	机器学习	NA	NA	生成模型	NA	NA	NA	NA	NA	NA
5895	2026-04-05	GFETM: Genome foundation-based embedded topic model for scATAC-seq modeling 2026-Apr-02, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2026.101563 PMID:41932342	研究论文	提出一种结合基因组基础模型和嵌入主题模型的深度学习框架GFETM，用于分析单细胞ATAC-seq数据	首次将基因组基础模型的序列嵌入与嵌入主题模型结合，利用开放染色质区域的序列特征提升建模准确性和泛化能力	未明确说明模型在更大规模或更多样本类型中的泛化性能	提升单细胞ATAC-seq数据的分析准确性和可解释性	单细胞ATAC-seq数据	基因组学，深度学习	肾脏糖尿病	scATAC-seq	嵌入主题模型，基础模型	DNA序列数据，单细胞染色质可及性数据	NA	NA	GFETM（基因组基础嵌入主题模型），ETM	准确性，泛化能力	NA
5896	2026-04-05	Reconstruction of blood flow velocity with deep learning information fusion from spectral ct projections and vessel geometry 2026-Apr, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3 DOI:10.1080/10255842.2024.2423883 PMID:39512150	研究论文	本文研究了一种基于深度学习信息融合的新方法，从增强X射线投影和血管几何中重建变形血管内的血流速度	提出了一种结合Radon投影和血管网格的线性或非线性降维技术，通过信息融合重建血流速度场，优于简单的PCA-net方法	NA	开发一种深度学习重建方法，用于从X射线投影和血管几何中准确估计血流速度	变形血管内的血流速度场	计算机视觉	心血管疾病	对比增强X射线投影	深度学习神经网络	图像投影数据、血管网格数据	NA	NA	多种神经网络架构	准确性	NA
5897	2026-04-05	Structure-Preserving Two-Stage Diffusion Model for CBCT Metal Artifact Reduction 2026-Apr, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2025.3628764 PMID:41187053	研究论文	本文提出了一种用于CBCT金属伪影减少的两阶段扩散模型，强调结构保留和领域泛化	采用两阶段扩散框架，结合结构感知扩散模型和分割引导采样策略，以提取无伪影边缘图作为结构先验，并利用IOS与CBCT融合数据监督训练，提升对真实世界数据的泛化能力	未明确说明模型在极端金属植入物情况下的性能或计算效率限制	减少CBCT中的金属伪影，同时保留牙齿解剖结构	CBCT图像，特别是受金属植入物影响的牙齿区域	计算机视觉	牙科疾病	CBCT, 口腔内扫描(IOS)	扩散模型	图像	NA	NA	扩散模型	NA	NA
5898	2026-04-05	Efficient Large-Deformation Medical Image Registration via Recurrent Dynamic Correlation 2026-Apr, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2025.3630584 PMID:41201925	研究论文	提出了一种基于循环动态相关性的高效大变形医学图像配准框架	通过循环动态重定位匹配区域来高效捕获大变形所需的长距离对应关系，并采用轻量级循环更新模块和特征解耦来抑制语义冗余	NA	解决大变形医学图像配准中的效率与精度挑战	医学图像（脑部MRI和腹部CT）	医学影像分析	NA	深度学习图像配准	卷积网络，循环网络	图像	NA	NA	基于循环相关的框架	精度，计算量（FLOPs），运行速度	NA
5899	2026-04-05	FunOTTA: On-the-Fly Adaptation on Cross-Domain Fundus Image via Stable Test-Time Training 2026-Apr, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2025.3631049 PMID:41212692	研究论文	提出一种名为FunOTTA的新型眼底图像测试时适应框架，用于解决跨域眼底图像诊断中的领域偏移问题	通过动态内存库去歧义化减少有害先验知识偏差，并引入基于可靠类别条件估计和一致性正则化的增量适应训练目标	仅在两种疾病的跨域眼底图像基准上进行了实验验证，未涵盖更广泛的眼科疾病类型	提升深度学习模型在跨域眼底图像诊断中的泛化能力	眼底图像	计算机视觉	眼科疾病	深度学习	CNN	图像	NA	PyTorch	ResNet, VGG, Transformer	准确率, AUC	NA
5900	2026-04-05	Self-Paced Learning for Images of Antinuclear Antibodies 2026-Apr, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2025.3637237 PMID:41296939	研究论文	提出一种用于抗核抗体图像检测的自适应学习框架，以处理多实例多标签学习任务	引入基于人类标注逻辑的实例采样器、概率伪标签分发器和自步学习权重系数，实现无需手动预处理的端到端优化	未提及框架在更广泛临床环境或不同成像设备下的泛化能力验证	自动化抗核抗体检测以辅助自身免疫性疾病诊断	抗核抗体荧光图像	计算机视觉	自身免疫性疾病（如狼疮、干燥综合征、硬皮病）	荧光显微镜成像	深度学习框架	图像	一个ANA数据集和三个公共医学MIML基准数据集	未明确指定	未明确指定	F1-Macro, mAP, Hamming loss, one-error	NA