深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-04-24	Editorial for "Prostate Cancer Risk Stratification and Scan Tailoring Using Deep Learning With Abbreviated Prostate MRI" 2025-Apr-23, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29806 PMID:40264361	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
42	2025-04-24	Efficient spheroid morphology assessment with a ChatGPT data analyst: implications for cell therapy 2025-Apr-23, BioTechniques IF:2.2Q4 DOI:10.1080/07366205.2025.2493489 PMID:40264428	研究论文	本研究开发了一种利用ChatGPT数据分析师进行深度学习的方法，用于自动测量球体大小以评估球体质量	首次将ChatGPT数据分析师应用于球体形态评估，提供了一种自动化和高效的质量控制方法	未提及该方法在不同类型球体或更大规模样本中的适用性验证	开发一种自动化的球体大小测量方法，以提高球体质量评估的效率和准确性	脂肪来源干细胞（ADSCs）衍生的球体	数字病理学	骨关节炎	深度学习	ChatGPT Data Analyst	图像	未明确提及具体样本数量
43	2025-04-24	Using deep learning generated CBCT contours for online dose assessment of prostate SABR treatments 2025-Apr-23, Journal of applied clinical medical physics IF:2.0Q3 DOI:10.1002/acm2.70098 PMID:40265325	research paper	该研究利用深度学习生成的CBCT轮廓评估前列腺SABR治疗中的每日剂量，以指导个性化决策树的开发	首次使用深度学习生成的CBCT轮廓进行每日剂量评估，并与计划剂量指标比较，揭示视觉评估的局限性	研究为回顾性分析，样本量有限（40名患者），且未考虑其他可能影响OAR位置的因素	评估当前决策树在前列腺SABR治疗中的有效性，并探索自动化工具的必要性	前列腺SABR治疗患者的CBCT扫描数据	digital pathology	prostate cancer	deep learning, CBCT	NA	image	200次预处理CBCT扫描（来自40名患者）
44	2025-04-24	Deep learning-based detection of generalized convulsive seizures using a wrist-worn accelerometer 2025-Apr-23, Epilepsia IF:6.6Q1 DOI:10.1111/epi.18406 PMID:40265999	research paper	开发并验证了一种基于手腕加速度计的深度学习可调算法，用于自动检测全身性或双侧惊厥性癫痫发作，可与市售智能手表集成	提出了一种基于单传感器加速度计数据的深度学习技术，实现了高灵敏度的癫痫发作检测，并支持可调灵敏度	模型在测试集中漏检了两次癫痫发作，其中一次是由于患者佩戴传感器的手臂被床栏卡住	开发一种自动检测全身性或双侧惊厥性癫痫发作的算法	癫痫患者	machine learning	epilepsy	3D-accelerometer sensor	CNN	accelerometer data	384名患者（训练集37名患者54次发作，测试集347名患者49次发作）
45	2025-04-24	Multitask Deep Learning for Automated Detection of Endoleak at Digital Subtraction Angiography during Endovascular Aneurysm Repair 2025-Apr-23, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240392 PMID:40266029	研究论文	开发并评估一种新型多任务深度学习框架，用于在腹主动脉瘤血管内修复手术中自动检测和定位主动脉数字减影血管造影中的内漏	提出了一种结合分类和回归任务的多任务深度学习框架，用于内漏的自动检测和定位，性能优于人类专家	研究为回顾性设计，样本量相对有限（220例患者）	开发自动检测血管内修复手术中内漏的深度学习系统	接受腹主动脉瘤血管内修复手术患者的主动脉数字减影血管造影图像	数字病理学	腹主动脉瘤	数字减影血管造影（DSA）	CNN	图像	220例患者（181名男性，中位年龄74岁）
46	2025-04-24	Deep learning-based post hoc denoising for 3D volume-rendered cardiac CT in mitral valve prolapse 2025-Apr-23, The international journal of cardiovascular imaging DOI:10.1007/s10554-025-03403-z PMID:40266552	research paper	本研究探讨了基于深度学习的后处理去噪技术如何提升心脏CT在二尖瓣脱垂3D体积渲染成像中的质量	首次将残差密集网络应用于心脏CT图像的后处理去噪，显著提升了3D体积渲染图像的质量和诊断效率	研究样本量较小（50例患者），且为回顾性研究	评估去噪后的3D体积渲染图像在二尖瓣脱垂可视化中的质量及其诊断性能和效率	接受二尖瓣修复手术的连续患者的心脏CT图像	digital pathology	cardiovascular disease	cardiac CT	residual dense network	3D volume-rendered images	50例患者（中位年龄64岁，30名男性）
47	2025-04-24	Super-resolution deep learning reconstruction to evaluate lumbar spinal stenosis status on magnetic resonance myelography 2025-Apr-23, Japanese journal of radiology IF:2.9Q2 DOI:10.1007/s11604-025-01787-5 PMID:40266548	research paper	研究超分辨率深度学习重建（SR-DLR）在磁共振脊髓造影中评估腰椎管狭窄状态的效果	首次将SR-DLR技术应用于腰椎MR脊髓造影，显著提升了图像质量和观察者间一致性	样本量较小（40例患者），且为回顾性研究	评估SR-DLR技术在腰椎MR脊髓造影中的应用效果	40例腰椎管狭窄患者的MR脊髓造影图像	digital pathology	腰椎管狭窄	MR myelography, SR-DLR, DLR, ZIP	deep learning	image	40例患者（16男24女，平均年龄59.4±31.8岁）
48	2025-04-24	deep-Sep: a deep learning-based method for fast and accurate prediction of selenoprotein genes in bacteria 2025-Apr-22, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.01258-24 PMID:40062874	research paper	开发了一种基于深度学习的算法deep-Sep，用于快速准确地预测细菌基因组中的硒蛋白基因	使用Transformer神经网络架构构建检测Sec编码UGA密码子的最优模型，并结合同源搜索策略去除额外假阳性	未明确提及具体局限性	开发高效预测细菌硒蛋白基因的算法	细菌基因组中的硒蛋白基因	生物信息学	NA	深度学习	Transformer	基因组序列	20个细菌基因组作为独立测试数据集
49	2025-04-24	Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning 2025-Apr-22, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.00183-25 PMID:40105319	研究论文	本研究结合扩散模型和Transformer模型，用于增强合成启动子的设计与强度预测	首次将扩散模型应用于合成启动子设计，并结合Transformer模型进行强度预测，提高了预测性能	研究仅限于模型细菌和蓝藻中的启动子，未在其他生物体中验证	优化外源基因表达和代谢途径效率，设计高性能合成启动子	合成启动子及其强度预测	合成生物学	NA	扩散模型，Transformer模型	扩散模型，Transformer，CNN，变分自编码器	启动子序列数据	NA
50	2025-04-24	Destruction for growth: a novel laser direct writing perovskite strategy with intelligent anti-counterfeiting applications 2025-Apr-22, Nanoscale horizons IF:8.0Q1 DOI:10.1039/d4nh00612g PMID:40125819	研究论文	本文提出了一种新型的激光直写钙钛矿策略，利用激光破坏诱导钙钛矿生长，并展示了其在精密图案化和防伪应用中的潜力	不同于以往依赖热效应和光子吸收诱导成核的激光直写技术，本研究利用脉冲激光快速破坏应力丰富的钙钛矿前驱体磷酸盐玻璃表面，通过应力释放和反向移动剪切带效应促进钙钛矿晶体的成核和生长	NA	探索激光破坏诱导钙钛矿生长的新机制及其在光电子学和防伪应用中的潜力	钙钛矿材料及其在激光直写技术中的应用	光电子学	NA	激光直写技术（LDW）	NA	NA	NA
51	2025-04-24	A Raman spectroscopy algorithm based on convolutional neural networks and multilayer perceptrons: qualitative and quantitative analyses of chemical warfare agent simulants 2025-Apr-22, The Analyst DOI:10.1039/d5an00075k PMID:40192710	研究论文	提出了一种基于卷积神经网络和多层感知器的拉曼光谱算法，用于化学战剂模拟物的定性和定量分析	结合卷积神经网络和多层感知器，提出了一种新的深度学习算法RS-MLP，能够自适应捕捉混合物权重并进行分层特征匹配	未提及算法在更广泛或不同环境下的适用性测试	开发一种快速、可靠的化学战剂检测方法，以支持军事防御和反恐行动	化学战剂模拟物	机器学习	NA	拉曼光谱	CNN, MLP	光谱数据	四种组合的光谱数据用于验证
52	2025-04-24	A machine learning toolkit assisted approach for IMRT fluence map optimization: feasibility and advantages 2025-Apr-22, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/adcaca PMID:40203852	研究论文	本研究提出了一种利用机器学习工具包辅助IMRT（调强放射治疗）通量图优化的新方法，展示了其在计划质量和效率上的优势	首次将机器学习工具包直接应用于治疗计划优化，实现了比传统优化方法更快的收敛速度和更强的鲁棒性	研究仅在前列腺和头颈部病例上进行了测试，未涉及其他癌症类型	探索机器学习在放射治疗计划优化中的新应用方式	IMRT治疗计划中的通量图优化	机器学习	前列腺癌,头颈癌	PyTorch的L-BFGS优化器	单层网络	剂量沉积矩阵	前列腺和头颈部病例（具体数量未明确说明）
53	2025-04-24	An end-to-end neural network for 4D cardiac CT reconstruction using single-beat scans 2025-Apr-22, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adcafb PMID:40203865	研究论文	提出了一种基于深度学习的端到端重建框架，用于利用单次心跳快速CT扫描进行动态心脏成像	该方法仅依赖单次心跳扫描数据，无需对心率施加显式限制，展示了强大的泛化能力和更广泛的临床应用潜力	模型训练使用了来自30名真实患者的模拟投影数据，可能在实际应用中存在一定的局限性	解决心脏CT成像中的运动伪影问题，提高心脏疾病的准确检测和诊断	心脏CT图像	数字病理	心血管疾病	深度学习	端到端神经网络	CT图像	30名真实患者的模拟投影数据
54	2025-04-24	A novel deep learning approach to classify 3D foot types of diabetic patients 2025-Apr-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-98471-5 PMID:40258927	research paper	提出一种基于DiffusionNet的新型深度学习方法，结合自注意力机制和外部特征，利用简单的3D足部图像对糖尿病患者的足型进行分类	首次将DiffusionNet与自注意力机制结合用于糖尿病足型分类，准确率达到82.9%，超越现有机器和深度学习方法	未提及模型在不同种族或年龄群体中的泛化能力	开发一种成本效益高的方法来分析糖尿病患者的足部形状，为鞋类行业和医疗应用提供个性化定制支持	糖尿病患者的3D足部图像	computer vision	diabetes	deep learning	DiffusionNet with self-attention mechanism	3D image	未提及具体样本数量
55	2025-04-24	Securing the CAN bus using deep learning for intrusion detection in vehicles 2025-Apr-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-98433-x PMID:40258975	研究论文	本文评估了深度学习方法在检测CAN总线网络入侵中的应用	利用RNN变体（包括LSTM、GRU和VGG-16）分析CAN消息的时间和空间特征，以提高入侵检测的准确性和效率	未提及模型在实时检测中的性能表现及计算资源消耗	提高智能交通系统（ITS）中CAN总线网络的安全性和韧性	CAN总线网络中的电子控制单元（ECUs）及其通信	机器学习	NA	深度学习	RNN, LSTM, GRU, VGG-16	序列数据	Car Hacking, Survival Analysis, 和 OTIDS 数据集
56	2025-04-24	Deep Learning-Based Classification of CRISPR Loci Using Repeat Sequences 2025-Apr-22, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00174 PMID:40261207	research paper	提出了一种基于深度学习的CRISPR位点分类方法CRISPRclassify-CNN-Att，仅利用重复序列进行分类	首次提出仅基于重复序列的CRISPR位点分类方法，结合CNN和自注意力机制，采用堆叠策略和迁移学习解决样本不平衡问题	对于样本量较少的亚型分类准确率仍有提升空间	开发不依赖cas基因的CRISPR-Cas系统分类方法	CRISPR位点的重复序列	machine learning	NA	deep learning	CNN with self-attention mechanism	sequence data	多个亚型的CRISPR位点样本（具体数量未提及）
57	2025-04-24	A CT-free deep-learning-based attenuation and scatter correction for copper-64 PET in different time-point scans 2025-Apr-22, Radiological physics and technology IF:1.7Q3 DOI:10.1007/s12194-025-00905-2 PMID:40261572	研究论文	本研究开发并评估了一种基于深度学习的全身64Cu PET成像中的衰减和散射校正模型	使用预训练的SwinUNETR模型通过迁移学习在小规模Cu-PET数据集上进行微调，实现了跨时间点的一致性校正	训练数据集规模有限（仅15例Cu-PET图像）	开发无需CT的深度学习PET衰减散射校正方法	铜-64标记的全身PET成像	医学影像分析	NA	深度学习/PET成像	swinUNETR	医学影像（PET-CT）	训练集15例Cu-PET+51例Ga-PSMA PET，测试集6例Cu-PET（含1h/12h/48h时间点各2例）
58	2025-04-24	CPDMS: a database system for crop physiological disorder management 2025-Apr-22, Database : the journal of biological databases and curation DOI:10.1093/database/baaf031 PMID:40261733	research paper	开发了一个用于实时收集和分析作物生理障碍图像的系统，专注于番茄作物	构建了一个包含多种番茄生理障碍的大规模图像数据库，并训练了深度学习模型进行识别	模型的平均精度(mAP)和召回率仍有提升空间	开发一个可扩展的实时作物生理障碍管理系统	番茄作物的生理障碍	digital pathology	植物病害	深度学习	CNN	image	58,479张图像(其中24,000张用于训练，13,037张用于测试)，涵盖7种番茄品种的5种生理障碍
59	2025-04-24	FRSynergy: A Feature Refinement Network for Synergistic Drug Combination Prediction 2025-Apr-22, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3563433 PMID:40261768	research paper	提出了一种名为FRSynergy的特征细化深度学习框架，用于预测协同药物组合	通过捕捉不同药物-药物-细胞系三元组特征之间的关系和学习特征上下文信息，指导不同场景下药物和细胞系特征的细化	未明确提及具体局限性	预测协同药物组合，以增强治疗效果并减少不良反应	药物组合和癌细胞系	machine learning	cancer	深度学习	heterogeneous graph attention network	药物和细胞系特征数据	未明确提及具体样本量
60	2025-04-24	Deep Learning to Localize Photoacoustic Sources in Three Dimensions: Theory and Implementation 2025-Apr-22, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control DOI:10.1109/TUFFC.2025.3562313 PMID:40261767	研究论文	开发了一种基于深度学习的3D光声点源定位系统，用于手术工具尖端的定位和跟踪	提出了一种新颖的基于目标检测的3D光声点源定位系统，并推导了点源位置、声速和波形形状之间的理论关系	NA	实现手术和介入过程中工具尖端的三维定位和跟踪	手术工具尖端	计算机视觉	NA	光声成像	深度学习	图像	4000个模拟数据帧、993个幻影数据帧和1983个离体数据帧