深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6281	2025-03-25	Deep-VEGF: deep stacked ensemble model for prediction of vascular endothelial growth factor by concatenating gated recurrent unit with two-dimensional convolutional neural network 2024-Mar-07, Journal of biomolecular structure & dynamics IF:2.7Q2 DOI:10.1080/07391102.2024.2323144 PMID:38450715	research paper	该研究提出了一种名为Deep-VEGF的深度学习集成模型，用于预测血管内皮生长因子（VEGF）	提出了一种新的特征描述符KSTS-BPSSM，并采用GRU、GAN和CNN的深度学习技术进行模型训练，通过堆叠学习方法集成GRU和CNN	实验识别VEGF昂贵且耗时，该方法可能依赖于特定数据集的质量和规模	开发一种计算模型以准确预测VEGF，加速相关研究和药物发现	血管内皮生长因子（VEGF）及其在多种疾病中的作用	machine learning	cancer, diabetic retinopathy, macular degeneration, arthritis	deep learning	GRU, GAN, CNN	primary sequences	NA
6282	2025-03-25	CMNet: deep learning model for colon polyp segmentation based on dual-branch structure 2024-Mar, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.11.2.024004 PMID:38525292	research paper	提出了一种基于双分支结构的深度学习模型CMNet，用于结肠息肉分割	采用双分支结构结合CNN与transformer，引入深度可分离卷积和条纹池化模块，提出聚合注意力模块(AAM)进行高维语义信息融合	NA	开发深度学习模型辅助结肠息肉的医学诊断和手术	结肠息肉	digital pathology	colon cancer	deep learning	CNN, transformer	medical images	Kvasir-SEG数据集上的五折交叉验证
6283	2025-03-22	Author Correction: A study on hybrid-architecture deep learning model for predicting pressure distribution in 2D airfoils 2025-Mar-20, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93621-1 PMID:40113839	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
6284	2025-03-24	This Microtubule Does Not Exist: Super-Resolution Microscopy Image Generation by a Diffusion Model 2025-Mar, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202400672 PMID:39400948	研究论文	本文探讨了扩散模型在超分辨率显微镜图像生成中的应用，展示了生成图像与实验图像的相似性，并证明了生成模型在数据增强中的实用性	首次将扩散模型应用于超分辨率显微镜图像生成，并展示了其在数据增强中的潜力	生成模型的训练依赖于少量实验图像，可能限制了生成图像的多样性和泛化能力	探索扩散模型在超分辨率显微镜图像生成中的应用，并评估其在数据增强中的效果	超分辨率显微镜图像	计算机视觉	NA	扩散模型	扩散模型	图像	少量实验图像
6285	2025-03-24	Artificial Intelligence-Assisted Detection of Breast Cancer Lymph Node Metastases in the Post-Neoadjuvant Treatment Setting 2025-Feb-26, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology DOI:10.1016/j.labinv.2025.104121 PMID:40020876	研究论文	本研究开发了一种可解释的深度学习管道，用于在乳腺癌患者接受新辅助系统治疗（NAT）后，自动检测淋巴结转移	首次评估了深度学习算法在接受NAT治疗的乳腺癌患者淋巴结转移检测中的泛化能力，并创建了一个包含1027张切片的大型数据集	研究仅限于乳腺癌患者，且数据集仅包含接受NAT治疗的患者，可能限制了算法的广泛适用性	开发并评估一种深度学习管道，用于自动检测乳腺癌患者接受NAT治疗后的淋巴结转移	乳腺癌患者的淋巴结切片	数字病理学	乳腺癌	深度学习	深度学习管道	图像	1027张切片
6286	2025-03-23	Automated Cone Photoreceptor Detection in Adaptive Optics Flood Illumination Ophthalmoscopy 2025 May-Jun, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2024.100675 PMID:40114708	研究论文	本文开发并验证了一种基于深度学习的模型，用于在自适应光学泛光照明眼底成像（AO-FIO）中检测视锥细胞	该研究首次使用基于U-Net架构的深度学习模型进行视锥细胞的自动检测，并在多个医疗中心进行了验证，表现优于制造商的自动检测软件	研究仅涉及健康志愿者，未涵盖患有眼部疾病的患者，且样本量相对较小	开发一种自动检测视锥细胞的深度学习模型，以提高检测效率和准确性	健康志愿者的视锥细胞	计算机视觉	NA	自适应光学泛光照明眼底成像（AO-FIO）	U-Net	图像	36名健康志愿者，每只眼睛采集21张AO-FIO图像
6287	2025-03-23	AlphaMissense Predictions and ClinVar Annotations: A Deep Learning Approach to Uveal Melanoma 2025 May-Jun, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2024.100673 PMID:40114711	研究论文	本文探讨了使用深度学习工具AlphaMissense评估葡萄膜黑色素瘤（UM）中基因突变的功能影响	使用AlphaMissense工具对UM中的错义突变进行功能影响评估，并与ClinVar数据库中的临床意义进行交叉验证	仅分析了COSMIC数据库中的错义突变，且只有40.4%的突变在ClinVar中有对应数据	评估UM中基因突变的致病性，以改进基因组诊断和个性化治疗策略	葡萄膜黑色素瘤（UM）患者的基因数据	生物信息学	葡萄膜黑色素瘤	深度学习	AlphaMissense, AlphaFold	基因突变数据	1310个UM中的错义突变，其中151个独特错义突变被分析
6288	2025-03-23	Robust and interpretable deep learning system for prognostic stratification of extranodal natural killer/T-cell lymphoma 2025-Apr, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1 DOI:10.1007/s00259-024-07024-x PMID:39714634	研究论文	本文开发并验证了DeepENKTCL，一个用于预测外鼻型自然杀伤/T细胞淋巴瘤（ENKTCL）预后风险分层的可解释深度学习系统	DeepENKTCL结合了肿瘤分割模型、PET/CT融合模型和预后预测模型，通过SHAP分析增强了模型的可解释性，提供了优于现有模型的预后性能和临床效益	研究样本来自四个中心，可能存在样本选择偏差，且未提及外部验证结果	开发并验证一个可解释的深度学习系统，用于ENKTCL的预后风险分层	外鼻型自然杀伤/T细胞淋巴瘤（ENKTCL）患者	数字病理学	淋巴瘤	深度学习、PET/CT融合、放射组学、拓扑特征分析	深度学习模型	医学影像（PET/CT）	562名患者，分为训练、验证和测试队列
6289	2025-03-23	Progress, Pitfalls, and Impact of AI-Driven Clinical Trials 2025-Apr, Clinical pharmacology and therapeutics DOI:10.1002/cpt.3542 PMID:39722473	评论	本文探讨了自2010年代初深度学习革命以来，人工智能在药物发现和开发中的应用进展、挑战及潜在影响	本文强调了人工智能在药物发现和开发中的潜力，并指出了当前面临的挑战	尽管投入了大量资金和努力，但很少有AI发现或设计的药物进入人体临床试验，且尚未有药物获得临床批准	探讨人工智能在药物发现和开发中的应用进展及挑战	人工智能驱动的药物发现和开发	机器学习	NA	NA	NA	NA	NA
6290	2025-03-23	Deep convolutional neural networks for early detection of interproximal caries using bitewing radiographs: A systematic review 2025-Mar-21, Evidence-based dentistry DOI:10.1038/s41432-025-01134-7 PMID:40114013	系统综述	本文系统综述了使用深度卷积神经网络（DCNN）通过咬翼片X光片检测邻面龋齿的研究	本文首次系统性地评估了不同深度卷积神经网络在咬翼片X光片上检测邻面龋齿的效果，并特别强调了YOLOv8模型在此任务中的优越性	纳入的研究中仅有40%在参考标准领域具有低偏倚风险，表明研究质量参差不齐	评估深度卷积神经网络在咬翼片X光片上检测邻面龋齿的准确性和有效性	咬翼片X光片	计算机视觉	龋齿	深度卷积神经网络（DCNN）	CNN, YOLOv8	图像	112至3,989名参与者
6291	2025-03-23	Challenges in Implementing Endoscopic Artificial Intelligence: The Impact of Real-World Imaging Conditions on Barrett's Neoplasia Detection 2025-Mar-21, United European gastroenterology journal IF:5.8Q1 DOI:10.1002/ueg2.12760 PMID:40116287	研究论文	本研究旨在量化在社区医院中，基于专家图像训练的巴雷特氏瘤计算机辅助检测系统在暴露于日常临床实践中更异质成像条件下的性能下降，并评估减轻这种性能损失的策略	研究首次量化了在社区医院中，基于专家图像训练的计算机辅助检测系统在异质成像条件下的性能下降，并提出了三种提高算法对数据异质性鲁棒性的方法	研究仅针对巴雷特氏瘤的检测，未涉及其他疾病或更广泛的临床应用	评估和提高计算机辅助检测系统在异质成像条件下的性能	巴雷特氏瘤患者的内镜图像	计算机视觉	巴雷特氏瘤	深度学习	计算机辅助检测系统	图像	373名巴雷特氏瘤患者的1011张高质量图像，以及117名患者的独立测试集
6292	2025-03-23	Ovarian masses suggested for MRI examination: assessment of deep learning models based on non-contrast-enhanced MRI sequences for predicting malignancy 2025-Mar-21, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-025-04891-2 PMID:40116887	研究论文	本研究评估并比较了四种基于非增强MRI的深度学习模型在区分良性和恶性卵巢肿瘤中的诊断效能和开发成本	首次在非增强MRI序列上评估和比较了四种深度学习模型（ConvNeXt, FBNet, GhostNet, ResNet50）在卵巢肿瘤良恶性鉴别中的应用	研究为回顾性设计，可能受到选择偏倚的影响，且未考虑不同MRI扫描仪和参数的影响	评估和比较深度学习模型在非增强MRI上区分良性和恶性卵巢肿瘤的诊断效能	526名因疑似卵巢肿块而推荐进行MRI检查的患者	数字病理	卵巢癌	非增强MRI	ConvNeXt, FBNet, GhostNet, ResNet50	图像	526名患者（327例良性病变，199例恶性病变）
6293	2025-03-23	Deep learning-assisted detection of intracranial hemorrhage: validation and impact on reader performance 2025-Mar-21, Neuroradiology IF:2.4Q2 DOI:10.1007/s00234-025-03560-x PMID:40116947	研究论文	本研究验证了一种用于颅内出血检测的深度学习算法，并评估了其对读者诊断性能的影响	开发并验证了JLK-ICH深度学习算法，显著提高了非专家读者对颅内出血的诊断准确性	研究主要基于回顾性数据，且外部验证数据集仅来自美国多民族群体，可能存在一定的局限性	验证深度学习算法在颅内出血检测中的准确性及其对临床诊断的辅助作用	颅内出血患者的CT扫描图像	计算机视觉	颅内出血	深度学习	JLK-ICH	CT图像	1,370例CT扫描，其中800例用于读者性能研究
6294	2025-03-23	Annotation-efficient, patch-based, explainable deep learning using curriculum method for breast cancer detection in screening mammography 2025-Mar-19, Insights into imaging IF:4.1Q1 DOI:10.1186/s13244-025-01922-w PMID:40106066	研究论文	开发了一种基于课程学习和分块方法的深度学习模型，用于乳腺X光检查中的乳腺癌检测，利用弱注释和强注释，并通过Grad-CAM提供可解释的人工智能	结合课程学习和分块方法，利用有限数量的强注释数据进行训练，提高了模型性能和可解释性	需要进一步验证模型在更大规模数据集上的泛化能力	开发一种高效的深度学习模型，用于乳腺X光检查中的乳腺癌检测	乳腺X光检查图像	计算机视觉	乳腺癌	深度学习	基于分块的深度学习模型	图像	1976张乳腺X光检查图像（来自三个中心），外部测试数据集包含4276张乳腺X光检查图像
6295	2025-03-23	Design of thin, wideband electromagnetic absorbers with polarization and angle insensitivity using deep learning 2025-Mar-19, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-94116-9 PMID:40108286	研究论文	本文介绍了一种利用深度学习设计薄型、宽带电磁波吸收器的新方法，该吸收器具有极化和角度不敏感性	利用生成对抗网络（GAN）和多层感知器（MLP）网络设计薄型、宽带电磁波吸收器，覆盖8-12 GHz频率范围，具有高吸收率和极化和角度不敏感性	NA	设计一种薄型、宽带电磁波吸收器，适用于大规模生产	电磁波吸收器	机器学习	NA	生成对抗网络（GAN），多层感知器（MLP）	GAN, MLP	数值全波电磁模拟数据	NA
6296	2025-03-23	Prediction and analysis of tumor infiltrating lymphocytes across 28 cancers by TILScout using deep learning 2025-Mar-19, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-00866-0 PMID:40108446	研究论文	本文介绍了TILScout，一种利用深度学习从全切片图像中计算肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）分数的泛癌方法	TILScout在验证集和独立测试集上分别达到了0.9787和0.9628的准确率，以及0.9988和0.9934的AUC，超越了之前的研究	NA	预测和分析28种癌症中的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）	28种癌症的全切片图像	数字病理学	癌症	深度学习	NA	图像	NA
6297	2025-03-23	Seasonal forecasting of the hourly electricity demand applying machine and deep learning algorithms impact analysis of different factors 2025-Mar-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91878-0 PMID:40102500	研究论文	本文提出了基于机器学习和深度学习算法的短期季节性预测模型，用于预测新英格兰控制区（ISO-NE-CA）的每小时电力需求	结合了多种机器学习和深度学习技术（如自适应神经模糊推理系统、长短期记忆网络、门控循环单元和人工神经网络），并分析了温度对电力需求的影响	模型在不同季节和场景下的准确性存在差异，特别是在秋季和春季的预测精度较低	提高短期电力需求预测的精度，分析温度对电力需求的影响	新英格兰控制区（ISO-NE-CA）的每小时电力需求	机器学习	NA	自适应神经模糊推理系统（ANFIS）、长短期记忆网络（LSTM）、门控循环单元（GRU）、人工神经网络（ANN）	ANFIS、LSTM、GRU、ANN	时间序列数据	NA
6298	2025-03-23	Deep transfer learning for seismic characterization of strike-slip faults in karstified carbonates from the northern Tarim basin 2025-Mar-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-94134-7 PMID:40102580	研究论文	本文提出了一种利用深度迁移学习和Unet模型检测塔里木盆地北部走滑断层的方法	提出了一种构建断层标签的方法，并引入了深度迁移学习工作流程来检测塔里木盆地北部的走滑断层	构建实际断层标签和获取大量断层标签仍存在挑战	优化井轨迹和开发计划，提高走滑断层的地震特征识别	塔里木盆地北部的走滑断层	地球物理	NA	深度迁移学习	Unet	地震数据	塔里木盆地北部的走滑断层数据
6299	2025-03-23	LUNETR: Language-Infused UNETR for precise pancreatic tumor segmentation in 3D medical image 2025-Mar-15, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.107414 PMID:40117980	研究论文	本文提出了一种名为LUNETR的多模态编码器模型，结合文本和图像信息进行精确的医学图像分割，特别是针对胰腺肿瘤的3D医学图像分割	LUNETR模型通过结合自动编码语言模型和跨注意力机制，有效利用文本和图像数据之间的语义关联，提高了胰腺微肿瘤的精确定位能力，并设计了多尺度聚合注意力模块（MSAA）以增强模型从胰腺组织中提取微病变特征的能力	多模态医学数据集的稀缺性可能限制了模型的泛化能力	提高胰腺肿瘤及其附近血管的精确分割能力，以辅助胰腺癌的临床诊断	胰腺肿瘤及其附近血管	数字病理	胰腺癌	CT扫描	UNETR	3D医学图像和病理报告文本	135名胰腺癌患者的CT图像和相应病理报告
6300	2025-03-23	AI-driven biomarker discovery: enhancing precision in cancer diagnosis and prognosis 2025-Mar-13, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02064-7 PMID:40082367	评论	本文探讨了人工智能在癌症诊断和预后中生物标志物发现的应用，旨在提高精准医学的效果	利用深度学习和机器学习技术从大规模数据集中发现生物标志物，推动早期诊断和精准治疗	数据质量、算法透明度以及隐私相关的伦理问题	通过人工智能技术改进癌症早期诊断和精准治疗，提高患者生存率	癌症患者	机器学习	癌症	深度学习、机器学习	NA	大规模数据集	NA