深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
7161	2025-04-14	A High-resolution T2WI-based Deep Learning Model for Preoperative Discrimination Between T2 and T3 Rectal Cancer: A Multicenter Study 2025-Apr-11, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2025.03.048 PMID:40221285	research paper	本研究构建了一个基于高分辨率T2加权图像的深度学习模型，用于术前区分T2和T3期直肠癌，并与经验丰富的放射科医生进行了性能比较	使用DenseNet模型在直肠癌T分期上表现出优于放射科医生的诊断性能	研究为回顾性设计，样本量相对有限，且仅针对T2和T3期直肠癌	提高直肠癌术前T分期的准确性以支持临床决策	281例经病理确诊的直肠癌患者	digital pathology	rectal cancer	high-resolution T2-weighted imaging	DenseNet	image	281例患者（255例用于训练/验证，26例用于外部测试）
7162	2025-04-14	Pre-trained molecular representations enable antimicrobial discovery 2025-Apr-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-58804-4 PMID:40210659	研究论文	提出一种基于预训练分子表示的计算策略，用于加速抗菌药物的发现	利用自监督深度学习框架MolE学习任务无关的分子表示，结合实验验证的化合物-细菌活性数据，构建通用预测模型	需要依赖已有的实验验证数据，可能对结构新颖化合物的预测能力有限	开发计算策略加速抗菌药物发现	化学化合物及其抗菌活性	机器学习	细菌感染	自监督深度学习	MolE框架	化学结构数据	实验验证了三种针对金黄色葡萄球菌的人类靶向药物
7163	2025-04-14	Heterogeneous attention multi-scale network for efficient weld seam classification 2025-Apr-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91186-7 PMID:40210665	research paper	提出了一种名为HAMS-Net的新型深度学习框架，用于高效焊缝分类	通过整合通道-空间注意力模块、异质注意力池化模块、高效Ghost特征通道ReLU层和自适应特征金字塔网络，实现了焊缝分类的最先进性能	未提及具体的数据集规模限制或实际工业应用中的潜在问题	解决工业环境中焊缝分类面临的几何多样性、类间细微差异和图像质量变化等挑战	工业焊缝图像	computer vision	NA	深度学习	HAMS-Net (整合了注意力机制和多尺度特征提取的CNN变体)	图像	使用了ImageNet和专用焊缝数据集（未提及具体样本数量）
7164	2025-04-14	A secure and efficient deep learning-based intrusion detection framework for the internet of vehicles 2025-Apr-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-94445-9 PMID:40210906	研究论文	提出了一种基于深度学习的车联网入侵检测框架，结合多种加密和优化技术以提高安全性和效率	结合AES-256加密、SMPC和HE进行隐私保护，提出新型混合优化方法CMSO，并设计DAGSNet架构增强特征检测和分类	未提及框架在极端网络条件下的性能表现	提高车联网环境中的入侵检测系统的安全性、效率和精确性	车联网网络	机器学习	NA	AES-256加密、SMPC、HE、Z-score标准化、中位数插补、小波变换	ViT、GAT、DenseNet、GoogleNet、AlexNet、SqueezeNet	网络数据	两个数据集
7165	2025-04-14	Restricted Boltzmann machine with Sobel filter dense adversarial noise secured layer framework for flower species recognition 2025-Apr-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-95564-z PMID:40210949	研究论文	提出了一种结合Sobel滤波器和受限玻尔兹曼机的SRB-VGG19模型，用于高效分类花卉物种	设计了SRB-VGG FCL和SRB-VGG Dense两个子模型，并通过FGSM攻击验证了模型的安全性	NA	开发一种能够有效分类花卉物种的深度学习技术	花卉物种	计算机视觉	NA	Sobel滤波器、受限玻尔兹曼机(RBM)、Fast Gradient Sign Method (FGSM)	SRB-VGG19、VGG19、DenseNet	图像	3400张训练图像和850张测试图像
7166	2025-04-14	Image quality improvement in head and neck angiography based on dual-energy CT and deep learning 2025-Apr-10, BMC medical imaging IF:2.9Q2 DOI:10.1186/s12880-025-01659-4 PMID:40211222	research paper	比较基于深度学习的图像重建（DLIR）和迭代重建算法在头颈部双能CT血管造影（DECTA）中的图像质量	首次在头颈部DECTA中比较DLIR与传统迭代重建算法的图像质量，并证明DLIR在降低图像噪声和提高图像质量方面的优势	样本量较小（58例患者），且仅针对头颈部DECTA，结果可能不适用于其他部位或成像方式	评估和比较不同图像重建算法在头颈部DECTA中的图像质量	头颈部双能CT血管造影图像	digital pathology	NA	dual-energy CT angiography (DECTA)	deep learning-based image reconstruction (DLIR)	image	58例头颈部DECTA患者
7167	2025-04-14	Hybrid encoding fringe and simulation-to-real scene approach for accurate depth estimation in fringe projection profilometry 2025-Apr-07, Optics express IF:3.2Q2 DOI:10.1364/OE.557221 PMID:40219402	research paper	提出了一种混合编码条纹和模拟到真实场景的方法，以提高条纹投影轮廓测量中的深度估计精度	使用混合编码条纹模式替代传统周期性条纹，并利用模拟数据进行训练，以减少对真实数据的需求，同时提出新的网络架构MSAUNet	需要进一步验证在更广泛的实际应用场景中的性能	提高条纹投影轮廓测量中的深度估计精度	条纹投影轮廓测量中的深度估计	computer vision	NA	fringe projection profilometry (FPP)	MSAUNet	image	最大的真实世界数据集
7168	2025-04-14	Denoising 3D integral images by a single-shot unsupervised deep neural network 2025-Apr-07, Optics express IF:3.2Q2 DOI:10.1364/OE.546621 PMID:40219440	研究论文	提出了一种基于单次拍摄的无监督深度学习方法，用于积分成像的去噪	利用单次拍摄的Noise2Noise方法，无需干净图像或噪声模型先验知识，适应特定成像条件	依赖于积分成像与元素成像之间的固有相似性，可能在某些成像条件下效果有限	提高积分成像的图像质量，解决噪声和图像质量下降问题	三维积分成像	计算机视觉	NA	无监督深度学习	深度神经网络	三维图像	NA
7169	2025-04-14	Snapshot video through dynamic scattering medium based on deep learning 2025-Apr-07, Optics express IF:3.2Q2 DOI:10.1364/OE.545510 PMID:40219498	research paper	提出一种基于深度学习的端到端模型，用于从动态散射介质中的单次快照重建多达八帧图像	结合编码孔径压缩时间成像系统与基于transformer的CNN，优化解复用和重建效果，并利用双输入CNN模型（同时使用散斑图案及其自相关）显著提高重建精度	NA	研究动态散射介质中单次快照的多帧图像重建技术	动态物体通过未知时变散射介质的图像重建	computer vision	NA	深度学习	transformer-based CNN	image	NA
7170	2025-04-14	External validation of a fully automated evaluation tool: a retrospective analysis of 68,471 scored embryos 2025-Apr, Fertility and sterility IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.fertnstert.2024.10.006 PMID:39414116	研究论文	本研究通过回顾性分析68,471个评分胚胎，验证了一种全自动胚胎分类系统在体外受精（IVF）治疗中的有效性	首次在全自动深度学习算法的基础上，对胚胎进行评分，并与传统形态学评估方法进行比较	研究为回顾性分析，可能受到数据选择和混杂因素的影响	验证全自动胚胎评分系统在IVF治疗中的临床应用价值	6,434名患者进行的7,352次IVF治疗中产生的70,456个胚胎	数字病理	生殖健康	深度学习	深度学习算法	胚胎图像	70,456个胚胎
7171	2025-04-14	Conventional and cutting-edge advances in plant virus detection: emerging trends and techniques 2025-Apr, 3 Biotech IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s13205-025-04253-1 PMID:40151342	综述	本文综述了植物病毒检测的传统和前沿技术，包括新兴趋势和技术	介绍了新兴技术如LAMP、HTS、纳米技术生物传感器和CRISPR诊断，以及AI、ML和IoT在实时监测中的应用	存在序列限制、多重检测约束和环境问题等挑战	优化植物病毒检测技术，确保农业可持续性和生态系统保护	植物病毒	生物技术	植物病毒病	LAMP, HTS, 纳米技术生物传感器, CRISPR诊断, AI, ML, IoT, 高光谱成像, 深度学习, 云IoT平台	深度学习	NA	NA
7172	2025-04-14	Deep learning-driven automated high-content dSTORM imaging with a scalable open-source toolkit 2025-Feb-28, Biophysical reports IF:2.4Q3 DOI:10.1016/j.bpr.2025.100201 PMID:40023500	研究论文	介绍了一个开源工具包，利用深度学习自动进行dSTORM超分辨率显微镜成像	开发了一个自动化、用户独立的工作流程，通过深度学习实现分割和对象检测，提高了超分辨率显微镜的效率和易用性	未提及具体的技术限制或样本类型的局限性	提高超分辨率显微镜的自动化程度和易用性，扩展其在生物医学中的应用	生物医学图像，如细胞培养中的微管和神经纤维中的βII-血影蛋白	数字病理	NA	dSTORM超分辨率显微镜	深度学习	图像	未提及具体样本数量
7173	2025-04-14	Comparative Analysis of nnUNet and MedNeXt for Head and Neck Tumor Segmentation in MRI-Guided Radiotherapy 2025, Head and Neck Tumor Segmentation for MR-Guided Applications : First MICCAI Challenge, HNTS-MRG 2024, held in conjunction with MICCAI 2024, Marrakesh, Morocco, October 17, 2024, proceedings DOI:10.1007/978-3-031-83274-1_10 PMID:40213035	research paper	该研究比较了nnUNet和MedNeXt在MRI引导放疗中头颈部肿瘤分割的性能	在HNTS-MRG24 MICCAI挑战赛中提出了一种自动化分割方法，结合了两种先进的深度学习模型，并在测试阶段取得了优异的成绩	研究仅基于特定的HNTS-MRG2024数据集，可能在其他数据集上的泛化能力有限	开发自动化分割方法以改进头颈部肿瘤在MRI引导放疗中的分割效率	头颈部肿瘤（HNC）的原发肿瘤体积（GTVp）和转移淋巴结肿瘤体积（GTVn）	digital pathology	head and neck cancer	MRI	nnUNet, MedNeXt	MRI图像	150例头颈部癌症患者的MRI扫描
7174	2025-04-14	Improving fishing ground estimation with weak supervision and meta-learning 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0321116 PMID:40215460	研究论文	本研究提出了一种结合弱监督和元学习的训练策略，用于改进基于海面温度模式的渔场估计	采用弱监督和元学习相结合的方法，利用部分标注或噪声数据（如轨迹数据）进行预训练，再通过元学习器在预训练过程中减轻标签噪声，从而提高模型性能	模型训练仍需要一定量的捕捞数据进行标注，且轨迹数据提供的渔场表示不够精确	改进渔场估计方法，提高渔业生产效率	渔场位置估计	机器学习	NA	深度学习	关键点检测器	海面温度模式数据、捕捞数据、轨迹数据	NA
7175	2025-04-14	A deep learning-based approach for the detection of cucumber diseases 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0320764 PMID:40215456	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的黄瓜病害检测方法，利用VGG19架构和创新的迁移学习方法进行病害分类	采用创新的迁移学习方法，相比传统方法在未见测试数据上实现了更高的平衡准确率（97.66% vs 93.87%）	未提及具体数据集的规模限制或模型在其他作物上的泛化能力	提高黄瓜病害检测的准确性，以保障作物质量和食品安全	黄瓜植株及其病害（炭疽病、细菌性枯萎病、肚腐病、霜霉病、健康黄瓜、健康叶片、腐霉果腐病、茎腐病等）	计算机视觉	植物病害	迁移学习	VGG19	图像	未明确提及具体样本数量
7176	2025-04-14	CWMS-GAN: A small-sample bearing fault diagnosis method based on continuous wavelet transform and multi-size kernel attention mechanism 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0319202 PMID:40215467	研究论文	提出了一种基于连续小波变换和多尺寸核注意力机制的小样本轴承故障诊断方法CWMS-GAN	采用连续小波卷积策略(CWCL)替代传统GAN中的卷积操作以捕获信号的频域特征，并设计了多尺寸核注意力机制(MSKAM)从不同尺度提取特征并自适应选择重要特征以提高生成信号的准确性和真实性	未提及具体样本量限制或实际工业应用中的潜在挑战	解决小样本条件下轴承故障诊断性能下降的问题	轴承振动信号	故障诊断	NA	连续小波变换(CWT), 生成对抗网络(GAN)	CWMS-GAN (基于GAN的改进模型)	振动信号(时域和频域)	在CWRU和MFPT数据集上进行实验(未明确样本数量)
7177	2025-04-14	Deep Learning-Based Image Restoration and Super-Resolution for Fluorescence Microscopy: Overview and Resources 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4414-0_3 PMID:40220224	review	本文综述了深度学习方法在荧光显微镜图像恢复和超分辨率中的应用，并提供了相关资源和工具	提供了深度学习方法在荧光显微镜图像处理中的最新进展和资源，包括开源数据库和代码库	未提及具体方法的性能比较或实际应用中的具体限制	综述深度学习方法在荧光显微镜图像处理中的应用，促进该领域的研究参与	荧光显微镜图像	computer vision	NA	deep learning	NA	image	NA
7178	2025-04-14	Calculating Protein-Ligand Residence Times through State Predictive Information Bottleneck Based Enhanced Sampling 2024-Jul-23, Journal of chemical theory and computation IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jctc.4c00503 PMID:38991145	研究论文	本文提出了一种半自动化协议，用于计算蛋白质-配体停留时间，跨越12个数量级的时间尺度	整合了基于深度学习的state predictive information bottleneck (SPIB)方法学习近似反应坐标，并指导增强采样方法metadynamics	仅应用于六种不同的蛋白质-配体复合物，样本量有限	提高药物疗效和理解生物化学中的目标识别	蛋白质-配体复合物	计算生物学	癌症	分子动力学(MD)模拟, metadynamics, SPIB	深度学习	分子模拟数据	六种不同的蛋白质-配体复合物，包括抗癌药物Imatinib (Gleevec)与野生型Abl激酶及耐药突变体的解离
7179	2025-04-14	Enhancing the Diagnostic Utility of ASL Imaging in Temporal Lobe Epilepsy through FlowGAN: An ASL to PET Image Translation Framework 2024-May-30, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.05.28.24308027 PMID:38853910	研究论文	本研究开发了一个名为FlowGAN的深度学习框架，用于从ASL和结构MRI输入合成类似FDG-PET的图像，以提高ASL在颞叶癫痫诊断中的性能	提出FlowGAN框架，通过生成对抗网络从ASL和MRI合成FDG-PET样图像，显著提升了ASL在癫痫诊断中的性能	样本量相对较小（68例患者），且仅针对颞叶癫痫患者进行研究	提高动脉自旋标记（ASL）成像在颞叶癫痫诊断中的性能	68例癫痫患者（其中36例为明确侧化的颞叶癫痫）	数字病理	颞叶癫痫	ASL成像、FDG-PET成像、MRI	GAN	医学影像	68例癫痫患者（36例明确侧化的颞叶癫痫）
7180	2025-04-13	Advancements in artificial intelligence for atopic dermatitis: diagnosis, treatment, and patient management 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2025.2484665 PMID:40200717	综述	本文综述了人工智能在特应性皮炎诊断、治疗和患者管理中的最新进展	首次全面回顾人工智能在特应性皮炎疾病过程中的应用，强调其在医学诊断、治疗监测和患者护理中的显著优势	面临数据隐私和模型透明度的挑战	推动人工智能在皮肤健康护理中的进步，提升特应性皮炎的临床诊疗水平	特应性皮炎患者	数字病理学	特应性皮炎	深度学习	深度学习算法	皮肤图像	NA