深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
7521	2025-10-06	OTMorph: Unsupervised Multi-Domain Abdominal Medical Image Registration Using Neural Optimal Transport 2025-Jan, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2024.3437295 PMID:39093684	研究论文	提出一种基于神经最优传输的无监督多域腹部医学图像配准框架OTMorph	首次将神经最优传输应用于多域医学图像配准，通过域转换图像缓解输入图像间的域差异	未明确说明模型在极端域偏移情况下的表现	解决多域腹部医学图像的非刚性配准问题	多模态和多参数腹部医学图像	医学图像分析	肝癌、淋巴瘤	医学影像扫描	深度学习	医学图像体积数据	NA	NA	OTMorph（包含传输模块和配准模块）	配准性能指标	NA
7522	2025-10-06	Improved swin transformer-based thorax disease classification with optimal feature selection using chest X-ray 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0327099 PMID:40561187	研究论文	提出一种基于改进Swin Transformer和优化特征选择的胸部X光疾病分类方法	结合增强自编码器(EnAE)、混沌鲸鱼优化算法(ChWO)和改进Swin Transformer(IMSTrans)进行胸部疾病分类	NA	开发准确的胸部疾病自动分类系统	胸部X光图像	计算机视觉	肺部疾病	胸部X光成像	自编码器,Transformer	图像	广泛的胸部X光数据集和肺部疾病数据集	NA	增强自编码器(EnAE),改进Swin Transformer(IMSTrans)	准确率,精确率,召回率,F分数,MCC,MAE	NA
7523	2025-10-06	Automated Segmentation of Knee Menisci Using U-Net Deep Learning Model: Preliminary Results 2024-Dec, Maedica DOI:10.26574/maedica.2024.19.4.690 PMID:39974461	研究论文	本研究开发了一种基于U-Net深度学习模型的膝关节半月板自动分割方法	首次将U-Net模型应用于膝关节半月板的自动检测和分割，并通过渐进式训练策略提升分割精度	面临数据稀缺问题，且需要进行序列特异性优化	开发能够自动识别和分割膝关节MRI中半月板的深度学习模型	膝关节半月板	计算机视觉	骨科疾病	磁共振成像	CNN	图像	104张膝关节MRI图像用于初始训练，额外50张用于微调	NA	U-Net	准确率, Dice系数	NA
7524	2025-10-06	Semi-Supervised Contrastive VAE for Disentanglement of Digital Pathology Images 2024-Nov, Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention DOI:10.1007/978-3-031-72083-3_43 PMID:40556771	研究论文	提出一种用于数字病理图像解耦的半监督对比变分自编码器方法	首个针对病理图像的解耦方法，提出了级联解耦、新颖架构和重建分支等创新思想	NA	提高深度学习模型的可解释性，特别关注肿瘤浸润淋巴细胞检测任务	数字病理图像	数字病理学	癌症	深度学习	变分自编码器	病理图像	NA	NA	对比变分自编码器	NA	NA
7525	2025-10-06	Considerations on Image Preprocessing Techniques Required by Deep Learning Models. The Case of the Knee MRIs 2024-Sep, Maedica DOI:10.26574/maedica.2024.19.3.526 PMID:39553362	研究论文	本研究探讨膝关节MRI图像预处理技术对深度学习模型检测半月板损伤的重要性	提出了针对膝关节MRI的创新型预处理方法，包括模态特定调整、空间重采样和强度标准化等技术	研究仅针对188例患者样本，样本量相对有限	开发适用于深度学习模型的膝关节MRI图像预处理流程	膝关节MRI图像，特别是半月板损伤区域	医学影像分析	膝关节疾病	磁共振成像	深度学习分割模型	医学影像	188例患者的PD矢状面图像	PyDicom, SimpleITK	NA	NA	NA
7526	2025-10-06	3D Auto-segmentation of pancreas cancer and surrounding anatomical structures for surgical planning 2025-Jun-27, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002835 PMID:40576127	研究论文	开发基于深度学习的胰腺癌及周围解剖结构自动分割模型，用于增强手术规划	采用分层Swin Transformer V2模型进行多中心胰腺癌3D自动分割	胰腺癌分割准确度相对较低（DSC 54.5-57.0），对小肿瘤分割效果有待提升	开发用于手术规划的胰腺癌及周围结构自动分割模型	胰腺癌患者及周围解剖结构（胰腺实质、肠系膜上动脉、门静脉等）	计算机视觉	胰腺癌	CT扫描	Transformer	3D医学图像	275名患者（176训练，59内部验证，40外部验证）	NA	Swin Transformer V2	Dice相似系数, 定性评估	NA
7527	2025-10-06	Early prediction of adverse outcomes in liver cirrhosis using a CT-based multimodal deep learning model 2025-Jun-27, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-025-05045-0 PMID:40576670	研究论文	开发基于CT的多模态深度学习模型TMF-LCNet用于早期预测肝硬化不良结局	提出融合CT影像、影像组学特征和临床文本的三模态深度学习网络，首次实现多源数据整合的肝硬化预后预测	回顾性研究设计，样本量相对有限（243例患者），仅包含两个医疗中心数据	开发深度学习模型以早期识别肝硬化高风险患者，改善临床管理策略	早期肝硬化患者	医学影像分析	肝硬化	CT影像分析，影像组学特征提取，临床文本分析	深度学习，多模态融合网络	CT图像，影像组学特征，临床文本	243例早期肝硬化患者（训练队列184例，外部测试队列59例）	NA	TMF-LCNet（三模态融合肝硬化网络）	AUC，校准曲线，决策曲线分析	NA
7528	2025-10-06	Practical applications of AI in body imaging 2025-Jun-27, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-025-05088-3 PMID:40576669	综述	本文综述了截至2024年底美国FDA批准的商业AI算法在腹部盆腔器官及相关疾病评估中的实际应用	系统梳理了FDA批准的商用AI算法在体部成像中的实际应用价值与发展方向	仅涵盖美国市场已获批的商用算法，未包括研究阶段或非商用算法	评估AI在放射学体部成像中的实际应用价值和发展前景	FDA批准的商用AI算法及其在腹部盆腔器官疾病评估中的应用	医学影像分析	腹部盆腔疾病	深度学习	NA	医学影像	NA	NA	NA	NA	NA
7529	2025-10-06	Deep learning for classification of aggressive versus non-aggressive central giant cell granuloma using whole-slide histopathology images 2025-Jun-27, Virchows Archiv : an international journal of pathology IF:3.4Q1 DOI:10.1007/s00428-025-04160-z PMID:40576733	研究论文	本研究使用深度学习算法分析中央性巨细胞肉芽肿的侵袭性与非侵袭性病例的显微图像，以评估其在预测CGCG生物学行为方面的潜力	这是首个基于全切片显微图像使用深度学习模型区分侵袭性与非侵袭性中央性巨细胞肉芽肿的先驱性研究	模型性能不佳，可能由于缺乏特定分割和技术染色问题，需要进一步研究改进预处理方法	评估深度学习算法在预测中央性巨细胞肉芽肿生物学行为方面的潜力	侵袭性与非侵袭性中央性巨细胞肉芽肿病例	数字病理学	中央性巨细胞肉芽肿	H&E染色，全切片扫描	CNN	图像	87例患者（48例侵袭性组，39例非侵袭性组），4272个切片用于训练，100个图像用于测试	NA	ResNet-50	AUC, 敏感度, 特异度	NA
7530	2025-10-06	Deep learning predicts onset acceleration of 38 age-associated diseases from blood and body composition biomarkers in the UK Biobank 2025-Jun-27, GeroScience IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s11357-025-01702-w PMID:40576910	研究论文	本研究开发了一种神经网络Cox模型，用于预测38种年龄相关疾病的发病加速风险	首次利用疾病诊断的相对发病加速关联来表征疾病模式，并识别高风险群体的加速疾病发展	研究基于UK Biobank数据，可能受到数据来源的限制	预测年龄相关疾病的发病加速风险，理解疾病共现模式	UK Biobank中的60,396名个体	机器学习	老年疾病	生存分析	神经网络Cox模型	人口统计学、人体测量、影像学和血液生物标志物数据	60,396名个体，218,530个结局事件	NA	OnsetNet	Harrell's concordance index (C-index), Kaplan-Meier曲线, log-rank检验, Schoenfeld残差	NA
7531	2025-10-06	Catheter detection and segmentation in X-ray images via multi-task learning 2025-Jun-27, International journal of computer assisted radiology and surgery IF:2.3Q2 DOI:10.1007/s11548-025-03461-7 PMID:40576920	研究论文	提出一种基于多任务学习的卷积神经网络模型，用于X射线图像中导管检测与分割	提出多级动态资源优先级方法，动态调整训练过程中的样本和任务权重，优先处理更具挑战性的任务	NA	开发实时准确的手术器械检测与分割方法，增强微创心脏手术中的图像引导	X射线荧光图像中的导管和电极	计算机视觉	心血管疾病	X射线成像	CNN	图像	NA	NA	ResNet	平均J指数, 平均精度, IoU	NA
7532	2025-10-06	Cluster-based human-in-the-loop strategy for improving machine learning-based circulating tumor cell detection in liquid biopsy 2025-Jun-13, Patterns (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.patter.2025.101285 PMID:40575126	研究论文	提出一种基于聚类的人机协同策略，用于改进液体活检中循环肿瘤细胞的机器学习检测方法	结合自监督深度学习与传统ML分类器，通过潜在空间高不确定性聚类的靶向采样策略，实现人机协同迭代优化	仅在转移性乳腺癌患者数据上验证，未涉及其他癌症类型	改进液体活检中循环肿瘤细胞的检测效率和准确性	转移性癌症患者血液样本中的循环肿瘤细胞和非循环肿瘤细胞	数字病理学	乳腺癌	液体活检	深度学习, 传统机器学习分类器	图像	转移性乳腺癌患者血液样本	NA	自监督深度学习	分类性能	NA
7533	2025-10-06	Discovering the nuclear localization signal universe through a deep learning model with interpretable attention units 2025-Jun-13, Patterns (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.patter.2025.101262 PMID:40575124	研究论文	开发了一种可解释的核定位信号预测方法NLSExplorer，通过深度学习模型探索核定位信号宇宙	利用蛋白质语言模型提取的核特异性位点信息辅助NLS检测，在基准数据集上F1分数比现有方法提高超过10%	NA	开发可解释的核定位信号预测工具并探索核定位信号宇宙	核定位信号和核转运片段	生物信息学	NA	深度学习，蛋白质语言模型	深度学习模型，注意力机制	蛋白质序列数据	Swiss-Prot数据库中的核定位蛋白质，涵盖416个物种	NA	具有可解释注意力单元的深度学习模型	F1分数	NA
7534	2025-10-06	Development and validation of a combined clinical and MRI-based biomarker model to differentiate mild cognitive impairment from mild Alzheimer's disease 2025-Jun, PCN reports : psychiatry and clinical neurosciences DOI:10.1002/pcn5.70134 PMID:40575445	研究论文	开发并验证结合临床和MRI生物标志物的模型，用于区分轻度认知障碍和轻度阿尔茨海默病	首次结合临床特征和易于测量的神经影像标记构建诊断模型，无需复杂深度学习即可实现高精度区分	样本量有限（161名参与者）且仅进行内部验证，缺乏外部验证	开发能够区分轻度阿尔茨海默病和轻度认知障碍的诊断模型	阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍患者和健康对照者	医学影像分析	阿尔茨海默病	MRI神经影像分析	逻辑回归	临床数据和MRI影像数据	161名参与者（30名对照，71名轻度AD，60名MCI）	NA	逻辑回归	AUC, 校准曲线, 决策曲线分析	NA
7535	2025-10-06	UK-YOLOv10: Deep Learning-Based Detection of Surgical Instruments 2025-Jun, The international journal of medical robotics + computer assisted surgery : MRCAS DOI:10.1002/rcs.70083 PMID:40576152	研究论文	提出UK-YOLOv10深度学习框架用于手术器械检测	集成统一融合注意力模块(UFAM)增强多尺度特征表示，并使用C2fKAN模块通过KAN卷积提高分类精度和训练速度	NA	提高手术器械检测的准确性和实时性能	手术器械	计算机视觉	NA	深度学习	YOLO	图像	M2CAI16-Tool-Locations数据集和COCO2017数据集	NA	UK-YOLOv10, YOLOv10	检测准确率, mAP@0.5, mAP@0.5:0.95	NA
7536	2025-10-06	Improving computer vision for plant pathology through advanced training techniques 2025 May-Jun, Applications in plant sciences IF:2.7Q2 DOI:10.1002/aps3.70010 PMID:40575549	研究论文	本研究通过先进训练技术提升卷积神经网络在可可树病害检测中的性能	提出动态焦点损失函数，采用半监督学习和非可可类别增强模型鲁棒性，创建高质量可可树病害基准数据集	未明确说明模型在其他作物病害上的泛化能力，数据集规模相对有限	改进计算机视觉技术在植物病理学中的应用，提升农作物病害检测性能	可可树病害检测	计算机视觉	植物病害	图像分类	CNN	图像	7220张病害和健康可可树图像	NA	ResNet18, PhytNet	准确性，鲁棒性，计算效率	NA
7537	2025-10-06	Annotation of spatially resolved single-cell data with STELLAR 2022-11, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-022-01651-8 PMID:36280720	研究论文	本文提出了一种名为STELLAR的几何深度学习方法，用于空间分辨单细胞数据的细胞类型注释和发现	STELLAR是首个专门为空间分辨单细胞数据设计的几何深度学习方法，能够考虑空间组织信息，自动发现新型细胞类型和细胞状态	NA	开发能够准确注释空间分辨单细胞数据中细胞类型的新计算方法	空间分辨单细胞数据	计算生物学	NA	CODEX多重荧光显微镜技术，多重RNA成像	几何深度学习	空间分辨单细胞数据，显微镜图像，RNA成像数据	260万个空间分辨单细胞	NA	NA	NA	NA
7538	2025-10-06	Insights on Scan-Specific Deep-Learning Strategies for Brain MRI Parallel Imaging Reconstruction 2025-Aug, NMR in biomedicine IF:2.7Q1 DOI:10.1002/nbm.70079 PMID:40545734	研究论文	本研究提出针对脑部MRI并行成像重建的扫描特异性深度学习策略优化方法	提出基于ACS的客观网格搜索优化策略和量化结构残留伪影的新指标COBRAI	仅评估了2D脑部MRI数据，未涉及3D或其他解剖部位	优化并行成像重建的扫描特异性深度学习策略	脑部MRI图像	医学影像处理	NA	并行成像，深度学习重建	CNN	MRI图像	FastMRI公共数据集和内部多对比度2D数据	NA	单层残差CNN, 三层残差CNN	COBRAI, 图像质量指标	NA
7539	2025-10-06	Oral mucosal lesions triage via YOLOv7 models 2025-Jul, Journal of the Formosan Medical Association = Taiwan yi zhi DOI:10.1016/j.jfma.2024.07.010 PMID:39003230	研究论文	本研究利用YOLOv7深度学习模型对口腔黏膜病变进行自动分类和分诊	首次系统比较多种YOLOv7模型配置在口腔病变分类中的表现，并在YOLOv7-D6模型中集成坐标注意力机制显著提升分类准确率	NA	提升口腔黏膜病变的早期检测和分类能力	口腔黏膜病变图像	计算机视觉	口腔癌	白光宏观成像	YOLO	图像	初始6903张图像，扩展至超过50000张图像（采集于2006-2013年）	NA	YOLOv7-E6, YOLOv7-D6, YOLOv7-D6-CA	精确率, 召回率, F1分数	NA
7540	2025-10-06	Fostering Clinical Judgment and Promoting Transition Into First Clinical Rotation Through Active Learning 2025 Jul-Aug 01, Nursing education perspectives IF:0.9Q3 DOI:10.1097/01.NEP.0000000000001293 PMID:38920415	研究论文	本文介绍了一种通过互动课堂活动帮助护理专业学生发展临床判断能力并促进向首次临床轮转过渡的教学方法	采用新颖的互动课堂活动设计，帮助学生将课堂知识应用于临床场景，促进学习迁移和临床判断能力发展	NA	提升护理学生的批判性思维能力和临床判断能力，促进从课堂到临床环境的顺利过渡	护理学士项目第一学期课程结束的学生	医学教育	NA	互动课堂活动，患者情景模拟	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA