深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
7861	2025-11-22	Applications of Deep Learning Techniques in Healthcare Systems: A Review 2024-Nov, Journal of clinical practice and research DOI:10.14744/cpr.2024.25381 PMID:41257169	综述	本文综述了深度学习技术在医疗保健系统中的应用研究	系统梳理了卷积神经网络、堆叠自编码器和循环神经网络等主流深度学习方法在医疗领域的应用现状	未涉及具体实验验证和性能对比分析	探讨深度学习技术在医疗保健领域的应用前景	医疗图像分析、药物研发和远程患者监测	机器学习	NA	深度学习	CNN, SAE, RNN	图像, 时间序列数据	NA	NA	卷积神经网络, 堆叠自编码器, 循环神经网络	NA	NA
7862	2025-11-22	Quantization of extraoral free flap monitoring for venous congestion with deep learning integrated iOS applications on smartphones 2023-11-01, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000000626 PMID:37462988	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
7863	2025-11-21	Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits? 2026 Jan-Feb, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720 PMID:41038299	综述	本文系统回顾了基因表达与蛋白质丰度关联性的研究方法、影响因素及在生物技术中的应用前景	整合了单细胞分析最新进展，系统比较不同实验环境下分子特征关联性研究方法	主要依赖相关性分析方法，受限于蛋白质定量技术发展滞后	探讨基因表达与蛋白质丰度的关联程度及其在生物技术中的应用潜力	转录组学与蛋白质组学数据关联性研究	生物信息学	NA	转录组学, 蛋白质组学, 单细胞分析	NA	基因表达数据, 蛋白质丰度数据	NA	NA	NA	相关性指标	NA
7864	2025-11-21	Enhanced CT image classification for kidney stones using pruned ConvNeXt and two-tier optimization 2025-Dec, Acta clinica Belgica IF:1.1Q2 DOI:10.1080/17843286.2025.2586626 PMID:41217965	研究论文	提出一种用于肾脏结石CT图像分类的两层优化深度学习模型	结合动态通道剪枝的改进ConvNeXt架构和河豚优化算法的特征选择方法	NA	提高肾脏结石在CT图像中的检测准确率和效率	肾脏CT图像	计算机视觉	肾脏结石	CT成像	CNN, LightGBM	医学图像	NA	NA	ConvNeXt	准确率	NA
7865	2025-11-21	A comparative deep learning methodology for plant insect image classification: Assessment of CNN architectures and augmentation techniques 2025-Dec, MethodsX IF:1.6Q2 DOI:10.1016/j.mex.2025.103680 PMID:41246037	研究论文	提出一种用于植物昆虫图像分类的深度学习方法，评估不同CNN架构和数据增强技术	在小型野外采集数据集上系统比较了四种CNN架构、六种单因素数据增强技术和三种优化器的组合效果	研究基于有限的小型数据集，未在大规模数据集上验证方法的普适性	开发适用于数据稀缺场景的鲁棒昆虫识别方法，为农业决策提供支持	植物昆虫图像	计算机视觉	NA	图像分类	CNN	图像	BAU-Insectv2数据集中的植物昆虫图像	NA	ResNet101V2, EfficientNet-B1, InceptionV3, InceptionResNetV1	准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
7866	2025-11-21	Design of Carbon Nanotube Inhibitors for Main Proteinase of SARS-CoV-2: A Combined Deep Learning and Molecular Dynamics Simulation Study 2025-Nov-20, The journal of physical chemistry. B DOI:10.1021/acs.jpcb.5c05780 PMID:41212638	研究论文	本研究结合深度学习和分子动力学模拟评估碳纳米管与SARS-CoV-2主蛋白酶的结合性能	首次系统评估深度学习在纳米结构-蛋白质对接中的性能，并揭示DL生成构象为局部能量最小值的亚稳态结构	深度学习模型未能完全处理结合口袋附近柔性环的结构变化	开发SARS-CoV-2主蛋白酶的碳纳米管抑制剂	碳纳米管与SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)	机器学习	COVID-19	分子动力学模拟, 分子对接	深度学习模型	分子结构数据	NA	NA	DeepRMSD + Vina	结构一致性, 能量势垒分析	NA
7867	2025-11-21	Low-count whole-body PET denoising with deep learning in a multicenter, multi-tracer and externally validated study 2025-Nov-20, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1 DOI:10.1007/s00259-025-07672-7 PMID:41261209	研究论文	通过深度学习算法在多中心、多示踪剂研究中实现低计数全身PET图像去噪并保持诊断准确性	首个在欧洲临床环境中针对多种示踪剂和未见过的扫描仪技术进行盲法评估的PET去噪算法研究	仅在欧洲三家医院进行验证，未包含更多地区和扫描仪型号	验证深度学习去噪算法在低计数PET扫描中的临床实用性和泛化能力	65个来自GE和西门子系统的PET扫描，使用[¹⁸F]FDG、[¹⁸F]PSMA、[⁶⁸Ga]PSMA和[⁶⁸Ga]DOTATATE四种示踪剂	医学影像分析	肿瘤疾病	PET成像，深度学习去噪	深度学习	PET医学影像	65个扫描，243个病灶	NA	NUCLARITY	RMSE, PSNR, SSIM, SUVmean, SUVmax, MTV, 敏感性, 特异性, 一致性相关系数	NA
7868	2025-11-21	Deep learning model for automated detection of Helicobacter pylori and intestinal metaplasia on gastric biopsy digital whole slide images 2025-Nov-19, American journal of clinical pathology IF:2.3Q2 DOI:10.1093/ajcp/aqaf110 PMID:40996022	研究论文	开发用于胃活检数字全切片图像中幽门螺杆菌和肠上皮化生自动检测的深度学习模型	采用两阶段模型（Vision Transformer与图注意力网络结合），并考虑背景组织病理学特征，更贴近真实临床诊断场景	样本量相对有限（180个全切片图像），仅基于单一医疗中心的H&E染色图像	开发自动化工具用于胃活检标本中幽门螺杆菌微生物和肠上皮化生的检测	胃活检组织标本的数字化全切片图像	数字病理学	胃部疾病	H&E染色，全切片图像数字化	Vision Transformer, Graph Attention Network	图像	180个胃活检H&E全切片图像（776,636个图像块）	NA	Vision Transformer, Graph Attention Network	精确度, F1分数, 微平均F1分数, 宏平均F1分数	NA
7869	2025-11-21	Frequency-Aware B-Line and Pleural Line Analysis in Lung Ultrasound Videos 2025-Nov-19, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3634433 PMID:41259172	研究论文	提出一种集成小波增强和时序注意力建模的肺超声视频分析框架，用于准确识别B线和胸膜线	引入离散小波变换的双组分频率特征增强方法和自适应注意力模块，有效抑制噪声并建模长程时序依赖	肺超声视频数据标注有限，模型在多诊断特征开发方面存在数据限制	开发自动分析肺超声视频中B线和胸膜线的深度学习框架	肺超声视频中的B线和胸膜线	计算机视觉	肺间质疾病	肺超声	深度学习	视频	2,149个超声视频（193,410帧），外加Covid-BLUES公共数据集	PyTorch	时序注意力模型	AUC, ACC	NA
7870	2025-11-21	Cardiac Arrhythmia Classification From Lead I ECG Recorded in a Free-Living Environment 2025-Nov-19, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3634307 PMID:41259171	研究论文	提出基于深度学习的框架CARE-I，使用单导联心电图在自由生活环境中进行心律失常分类	开发了新的数据相似性评估指标以增强迁移学习和外部数据集验证，并测试了在真实噪声环境下的鲁棒性	仅使用单导联心电图数据，可能无法捕捉某些需要多导联的心律失常特征	开发能够在自由生活环境中准确检测心律失常的AI模型	心律失常患者的心电图数据	机器学习	心血管疾病	心电图记录	深度学习	心电图信号	超过60,000份心电图来自PhysioNet Challenge 2021数据集	NA	NA	AUC, 敏感度, 特异度	NA
7871	2025-11-21	Explainable End-to-End Seizure Prediction via Stationary Wavelet Transform-Driven Dynamic Multiscale Fuzzy Clustering 2025-Nov-19, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3633739 PMID:41259173	研究论文	提出一种基于平稳小波变换的动态多尺度模糊聚类框架，用于可解释的癫痫发作预测	结合平稳小波变换与几何注意力机制，开发黎曼流形模糊聚类算法，并采用对比学习和混合监督/自监督策略增强模型鲁棒性	未明确说明模型在跨数据集泛化能力及计算复杂度方面的具体限制	解决癫痫发作预测中存在的个体差异性和时空耦合复杂性难题，提升特征判别性和模型可解释性	癫痫患者的脑电图信号	生物医学信号处理	癫痫	平稳小波变换，脑电图分析	CNN，模糊聚类	脑电图信号	NA	PyTorch，TensorFlow	三层卷积网络，多尺度卷积核	FPR，预测性能指标	NA
7872	2025-11-21	Interpretable End to End Epileptic Seizure Detection via Linear and Nonlinear Filtering Networks 2025-Nov-19, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3633726 PMID:41259168	研究论文	提出一种结合线性和非线性滤波网络的可解释癫痫发作检测对比学习框架	首次通过双分支解耦网络分离EEG信号的线性和非线性成分，并采用混合监督与自监督对比学习策略	未提及模型在不同癫痫亚型间的泛化能力及计算效率分析	开发可解释的端到端癫痫发作检测方法	头皮和颅内脑电图数据中的六种癫痫发作类型与非发作状态	医疗人工智能	癫痫	脑电图分析	CNN, 对比学习	脑电图信号	NA	PyTorch	三层卷积架构，双分支解耦网络，多尺度卷积模块	准确率	NA
7873	2025-11-21	Deep domain adaptation eliminates costly data required for task-agnostic wearable robotic control 2025-Nov-19, Science robotics IF:26.1Q1 DOI:10.1126/scirobotics.ads8652 PMID:41259448	研究论文	提出一种深度域适应框架，利用生物力学模型模拟传感器数据解决可穿戴机器人控制中的数据稀缺问题	通过构建中间域将易获取数据转换为数据受限域，无需昂贵设备特定标注数据	模型误差仍比使用完整设备特定数据集的最佳情况高11-44%	开发可实时部署的深度学习模型，用于任务无关的可穿戴机器人控制	髋膝关节力矩估计和可穿戴外骨骼控制	机器学习	NA	深度域适应	深度神经网络	生物力学传感器数据，模拟传感器数据	8名外骨骼使用者	NA	深度域适应网络	力矩估计误差(Nm/kg)，代谢成本降低百分比	NA
7874	2025-11-21	Real-World Prospective Validation and Economic Evaluation of Deep Learning-Based Diabetic Retinopathy Detection From Fundus Photographs: A Systematic Review and Meta-analysis 2025-Nov-19, Diabetes care IF:14.8Q1 DOI:10.2337/dc25-1493 PMID:41259706	系统综述与荟萃分析	通过系统综述和荟萃分析评估深度学习糖尿病视网膜病变检测系统在真实世界前瞻性验证中的表现和经济性	首次对深度学习糖尿病视网膜病变检测系统在真实世界前瞻性验证中的表现和经济性证据进行系统综合评估	缺乏评估多种糖尿病视网膜病变严重程度或糖尿病黄斑水肿的研究限制了亚组分析能力，低收入国家的研究数据不足	评估基于眼底照片的深度学习糖尿病视网膜病变检测系统在不同国家实施的可行性	糖尿病视网膜病变检测系统	数字病理	糖尿病视网膜病变	眼底摄影	深度学习	图像	47项研究纳入荟萃分析	NA	NA	AUROC	NA
7875	2025-11-21	A rapidly evolving female-controlled lock-and-key mechanism determines Aedes mosquito mating success 2025-Nov-17, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2025.09.066 PMID:41161314	研究论文	本研究揭示了雌性伊蚊通过生殖器尖端伸长行为主动控制交配的锁钥机制	首次发现雌性伊蚊通过生殖器尖端伸长行为主动控制交配启动，并揭示这种快速进化的锁钥机制决定交配成功率	NA	探究伊蚊交配机制及雌性防止重复交配的生物学基础	入侵性埃及伊蚊和白纹伊蚊	生物医学	蚊媒传染病	双色荧光精子系统、行为追踪、深度学习、定量分析	深度学习	行为视频、图像数据	NA	NA	NA	交配成功率统计（86%-96%单次交配率）	NA
7876	2025-11-21	An intelligent brain tumor detection model using lightweight hybrid twin attentive pyramid convolutional network 2025-Nov-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-23813-2 PMID:41249242	研究论文	提出一种用于脑肿瘤检测的轻量级混合双注意力金字塔卷积网络模型	结合双层级注意力模块和混合金字塔卷积块，采用恒星振荡优化器进行超参数调优，并集成Grad-CAM实现检测区域可视化	NA	开发高效的脑肿瘤早期检测方法	脑部MRI图像	计算机视觉	脑肿瘤	MRI	CNN	图像	BT Detection 2020数据集	Python	ResNet, LHTA-PCNet, TwinL-A, HPC	准确率	NA
7877	2025-11-21	CT-based radiomics and deep learning models for predicting thyroid cartilage invasion and patient prognosis in laryngeal carcinoma 2025-Nov-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-23809-y PMID:41249227	研究论文	本研究比较了基于CT的影像组学和深度学习模型在预测喉鳞状细胞癌甲状腺软骨侵犯及患者预后方面的性能	首次系统比较二维深度学习模型与影像组学模型在预测甲状腺软骨侵犯方面的性能，并构建了结合深度学习特征和临床风险因素的列线图	在外部验证队列中未发现模型性能存在显著差异，样本量相对有限	预测喉鳞状细胞癌患者的甲状腺软骨侵犯情况并评估预后价值	经病理证实的喉鳞状细胞癌患者	医学影像分析	喉癌	CT成像	深度学习, 影像组学	CT图像	418例来自两个中心的患者（训练队列247例，内部验证110例，外部验证61例）	NA	2D深度学习模型	AUC, 疾病无进展生存期	NA
7878	2025-11-21	Explainable convolutional neural network architectures for high-performance taxonomic classification of gasteroid macrofungi 2025-Nov-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-23974-0 PMID:41249260	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的高性能胃菌类大型真菌分类框架	首次将可解释AI技术应用于胃菌类真菌分类，实现了高精度且可解释的深度学习模型	仅针对六种胃菌类真菌物种，样本多样性有限	开发高精度且可解释的真菌分类方法	六种胃菌类大型真菌：Battarrea phalloides, Crucibulum laeve, Cyathus olla, C. striatus, Tulostoma brumale, T. fimbriatum	计算机视觉	NA	图像分析	CNN	图像	1200张高分辨率图像	NA	DenseNet121, ResNeXt, RepVGG, ShuffleNetV2	准确率, F1分数, AUC, 推理时间, 能效	NA
7879	2025-11-21	Enhancing image based classification for crop disease detection using a multiclass SVM approach with kernel comparison 2025-Nov-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-23568-w PMID:41249263	研究论文	本文提出了一种基于机器学习的作物叶片病害检测框架，通过多类SVM核函数比较提升图像分类性能	结合双边滤波和GraphCut分割与基于纹理的特征提取，并在多作物数据集上系统比较多类SVM核函数	未与深度学习方法进行直接对比，仅提供了未来比较的基础	开发有效的作物病害检测系统以最小化农业损失	作物叶片病害（包括黄锈病、红锈病和炭疽病）	计算机视觉	植物病害	图像处理，机器学习	SVM	图像	9,111张经过增强平衡的精选图像	NA	多类SVM（线性核、多项式核、RBF核等）	准确率，精确率，召回率，F1分数	NA
7880	2025-11-21	Mitigating distributed denial of service-based cyberattack in federated computing framework using deep reinforcement learning with frilled lizard algorithm 2025-Nov-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-23899-8 PMID:41249288	研究论文	提出一种基于深度强化学习和皱褶蜥蜴优化算法的联邦学习框架DDoS攻击缓解技术	结合联邦学习、深度强化学习和皱褶蜥蜴优化算法，提出新型DDoS攻击检测与分类方法	联邦学习在网络安全领域的应用仍处于早期阶段，多个关键方面有待探索	缓解联邦计算框架中的分布式拒绝服务网络攻击	网络攻击流量数据	机器学习	NA	深度强化学习，优化算法	D3QN	网络流量数据	CICIDIS 2017和ToN-IoT数据集	NA	Dueling Double Deep Q-Network	准确率	NA