深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
7941	2025-01-28	Deep learning for kidney trauma detection: CT image algorithm performance and external validation: experimental study 2025-Jan-24, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002221 PMID:39869390	研究论文	本研究开发并验证了一种用于检测肾脏创伤的深度学习算法，使用机构创伤数据和RSNA数据集进行外部验证	首次将深度学习技术应用于肾脏创伤的CT图像检测，并通过外部验证展示了其稳健性能	模型在外部验证中的阳性预测值较低，可能需要进一步优化图像分割和计算效率	开发并验证一种用于检测肾脏创伤的深度学习算法	肾脏创伤的CT图像	医学影像	肾脏创伤	深度学习	RenoTrNet	CT图像	机构创伤数据和RSNA数据集中的随机选择病例
7942	2025-01-28	MythicVision: a deep learning powered mobile application for understanding Indian mythological deities using weight centric decision approach 2025-Jan-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85922-2 PMID:39837968	研究论文	本文介绍了一个名为'MythicVision'的深度学习驱动的移动应用程序，旨在通过识别和解释印度神话神祇的图像，帮助外国游客更好地理解印度丰富的文化遗产	该应用程序采用了模型权重计算和权重中心决策机制，相比传统的多数投票方法，在多类图像分类中提供了更准确的结果	NA	开发一个能够识别和分类实时印度神祇图像，并为用户提供有关神祇的宝贵信息的应用程序	印度神话神祇的图像	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	10,970张印度神祇图像
7943	2025-01-28	Decoding the Functional Interactome of Non-Model Organisms with PHILHARMONIC 2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.25.620267 PMID:39553947	研究论文	本文介绍了一种名为PHILHARMONIC的计算方法，用于解码非模式生物的功能互作组	PHILHARMONIC结合深度学习网络推理和鲁棒的无监督谱聚类算法，能够揭示非模式生物中的功能关系和高层次组织	方法依赖于预测的网络，可能存在噪声，且需要进一步的实验验证	研究目的是开发一种计算工具，用于预测和分析非模式生物的蛋白质-蛋白质相互作用网络	研究对象包括珊瑚、藻类共生体和果蝇等非模式生物	生物信息学	NA	深度学习、谱聚类算法、远程同源功能注释	深度学习网络	蛋白质序列数据	珊瑚、藻类共生体和果蝇的蛋白质组数据
7944	2025-01-28	ChromBPNet: bias factorized, base-resolution deep learning models of chromatin accessibility reveal cis-regulatory sequence syntax, transcription factor footprints and regulatory variants 2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.25.630221 PMID:39829783	研究论文	本文介绍了ChromBPNet，一种深度学习DNA序列模型，用于解析染色质可及性图谱，揭示调控序列的语法和遗传变异	ChromBPNet能够检测、学习并分解特定实验的酶偏差，从而在不同实验和测序深度下发现紧凑的转录因子基序词典、协同基序语法和精确足迹	NA	研究染色质可及性的调控序列语法和遗传变异	染色质可及性图谱和转录因子结合位点	机器学习	NA	染色质可及性实验	深度学习模型	DNA序列数据	NA
7945	2025-01-28	Non-Contact Optical Blood Pressure Biometry Using AI-Based Analysis of Non-Mydriatic Fundus Imaging 2025-Jan-07, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2025.01.06.25320084 PMID:39830244	研究论文	本研究旨在开发一种基于机器学习的模型，通过非散瞳眼底成像来评估血压，其准确性与臂式袖带测量相当	使用深度学习模型从眼底图像中评估血压，相比传统臂式袖带测量，可能更能反映长期高血压状况	需要在临床环境中进行更多试验，并开展更多前瞻性研究以验证结果	开发一种基于机器学习的模型，通过非散瞳眼底成像来评估血压	血压（收缩压和舒张压）	机器学习	高血压	深度学习	深度学习模型	眼底图像	基于UK Biobank数据集
7946	2025-01-28	Bayesian-optimized deep learning for identifying essential genes of mitophagy and fostering therapies to combat drug resistance in human cancers 2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.18254 PMID:39834330	研究论文	本文提出了一种基于贝叶斯优化的深度学习模型BayeDEM，用于识别调控线粒体自噬的关键基因，并开发基于线粒体自噬的治疗策略以对抗癌症耐药性	提出了BayeDEM模型，通过贝叶斯优化深度学习来识别调控线粒体自噬的关键基因，并展示了其在骨肉瘤中的优异性能	研究主要集中在骨肉瘤细胞，未涉及其他类型的癌症	识别调控线粒体自噬的关键基因，并开发基于线粒体自噬的治疗策略以对抗癌症耐药性	骨肉瘤细胞	机器学习	癌症	深度学习	BayeDEM	基因数据	NA
7947	2025-01-28	Pose Analysis in Free-Swimming Adult Zebrafish, Danio rerio: "Fishy" Origins of Movement Design 2024-Dec-16, Brain, behavior and evolution DOI:10.1159/000543081 PMID:39681106	研究论文	本文研究了成年斑马鱼自由游泳时的姿势分析，探讨了运动设计的进化	使用无标记跟踪和深度学习工具DeepLabCut进行姿势估计，结合无监督多变量时间序列分析，识别出斑马鱼自由游泳时的典型姿势	研究仅基于12只斑马鱼的数据，样本量较小	探讨运动设计的进化，特别是如何通过最小化主动控制来优化运动效率	成年斑马鱼（Danio rerio）	计算机视觉	NA	DeepLabCut（DLC）和B-SOiD机器学习软件	深度学习	视频	12只成年斑马鱼
7948	2025-01-28	An explainable language model for antibody specificity prediction using curated influenza hemagglutinin antibodies 2024-10-08, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.022 PMID:39163866	研究论文	本文介绍了一种基于序列的抗体特异性预测的轻量级记忆B细胞语言模型（mBLM），并利用超过5,000个流感血凝素（HA）抗体数据集进行训练	开发了一种新的轻量级记忆B细胞语言模型（mBLM），用于基于序列的抗体特异性预测，并通过模型可解释性分析识别了HA干区抗体的关键序列特征	数据集主要来源于研究出版物和专利，可能存在数据偏差	预测抗体特异性，并提高对流感病毒抗体反应的分子理解	流感血凝素（HA）抗体	自然语言处理	流感	语言模型	mBLM	序列数据	超过5,000个流感血凝素（HA）抗体
7949	2025-01-28	Potential Use and Limitation of Artificial Intelligence to Screen Diabetes Mellitus in Clinical Practice: A Literature Review 2024-Oct, Acta medica Indonesiana IF:0.7Q3 PMID:39865054	文献综述	本文综述了人工智能在临床实践中筛查糖尿病的潜在应用及其局限性	强调了人工智能技术（如机器学习和深度学习）在提高糖尿病筛查准确性方面的潜力，特别是在低资源环境中的应用	指出了当前临床实践中基于血液或实验室检测的糖尿病筛查方法的局限性，包括访问和成本问题	探讨人工智能技术在减少未诊断糖尿病负担中的应用	全球未诊断糖尿病的个体，特别是低收入和中等收入国家（如印度尼西亚）的人群	机器学习	糖尿病	机器学习和深度学习	NA	NA	NA
7950	2025-01-28	Status and future trends in wastewater management strategies using artificial intelligence and machine learning techniques 2024-Aug, Chemosphere IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.chemosphere.2024.142477 PMID:38844107	综述	本文综述了利用人工智能和机器学习技术进行水和废水管理的最新趋势	结合AI、深度学习和物联网技术，提出了高效的水管理框架	未具体说明数据来源和样本量，案例研究和统计评估的细节不足	探讨智能水管理机制，以满足不同用途的水质要求	水和废水管理策略	机器学习	NA	人工智能（AI）、深度学习（DL）、物联网（IoT）	NA	多种形式的数据	NA
7951	2025-01-28	MambaTab: A Plug-and-Play Model for Learning Tabular Data 2024-Aug, Proceedings. IEEE Conference on Multimedia Information Processing and Retrieval DOI:10.1109/mipr62202.2024.00065 PMID:39850741	研究论文	本文介绍了一种基于结构化状态空间模型（SSM）的创新方法MambaTab，用于处理表格数据	MambaTab利用新兴的SSM变体Mamba，为表格数据提供端到端的监督学习，相比现有方法在性能上更优且参数更少	NA	开发一种高效、可扩展且通用的表格数据处理模型	表格数据	机器学习	NA	结构化状态空间模型（SSM）	Mamba	表格数据	多样化的基准数据集
7952	2025-01-28	Beyond Size and Class Balance: Alpha as a New Dataset Quality Metric for Deep Learning 2024-Jul-31, ArXiv PMID:39830079	研究论文	本文提出了一种新的数据集质量度量指标——α，用于改进深度学习在医学影像中的性能	引入了生态学中的多样性度量框架，提出了一种新的数据集质量度量指标α，超越了传统的数据集大小和类别平衡的度量方法	研究仅限于医学影像数据集，未验证在其他类型数据集上的适用性	探索如何通过最大化数据集多样性来改进深度学习模型在图像分类任务中的性能	医学影像数据集	计算机视觉	NA	NA	深度学习模型	图像	七个医学数据集的数千个子集
7953	2025-01-28	The cytoarchitectonic landscape revealed by deep learning method facilitated precise positioning in mouse neocortex 2024-06-04, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991) DOI:10.1093/cercor/bhae229 PMID:38836835	研究论文	本文开发了一种细胞结构标志物识别流程，利用荧光显微光学断层扫描技术成像小鼠全脑，并通过快速3D卷积网络分割整个新皮层的神经元体，揭示了新皮层的细胞结构景观	开发了一种新的细胞结构标志物识别流程，结合荧光显微光学断层扫描和快速3D卷积网络，实现了新皮层神经元的三维分割和分析	研究主要集中在小鼠新皮层，未涉及其他物种或更广泛的脑区	提高对新皮层结构的理解，特别是皮层区域的精确定位	小鼠新皮层	计算机视觉	NA	荧光显微光学断层扫描	3D卷积网络	图像	小鼠全脑
7954	2025-01-28	Exploring intricate connectivity patterns for cognitive functioning and neurological disorders: incorporating frequency-domain NC method into fMRI analysis 2024-05-02, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991) DOI:10.1093/cercor/bhae195 PMID:38741270	研究论文	本研究将频域新因果方法应用于功能磁共振成像分析，以探索认知功能和神经系统疾病的复杂连接模式	将频域新因果方法引入功能磁共振成像分析，构建了多种因果关联模型，并利用深度学习模型分析脑区拓扑变化特征	研究主要基于模拟信号和特定患者群体，可能无法完全反映真实世界的复杂性	探索认知功能和神经系统疾病的复杂连接模式	1,252组不同认知障碍程度的个体	神经影像分析	阿尔茨海默病	功能磁共振成像（fMRI）	深度学习模型	功能磁共振成像数据	1,252组个体
7955	2025-01-28	Pose analysis in free-swimming adult zebrafish, Danio rerio : "fishy" origins of movement design 2024-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.12.31.573780 PMID:38260397	研究论文	本文通过无标记跟踪和深度学习技术，研究了成年斑马鱼自由游泳时的典型姿势，并分析了其运动设计的进化意义	利用DeepLabCut和B-SOiD机器学习软件进行无标记跟踪和多变量时间序列分析，揭示了斑马鱼运动中的稳定目标姿势和过渡姿势	研究仅基于12只斑马鱼的数据，样本量较小，可能限制了结果的普适性	研究斑马鱼自由游泳时的姿势，以验证运动设计中最小化主动控制的假设	成年斑马鱼（Danio rerio）	计算机视觉	NA	DeepLabCut（深度学习姿势估计工具包），B-SOiD（无监督多变量时间序列分析软件）	深度学习	视频	12只成年斑马鱼，14,000帧连续视频
7956	2025-01-28	Multi-task deep learning-based survival analysis on the prognosis of late AMD using the longitudinal data in AREDS 2021, AMIA ... Annual Symposium proceedings. AMIA Symposium PMID:35308963	研究论文	本研究利用AREDS的纵向数据和深度学习技术，预测晚期年龄相关性黄斑变性（AMD）的发展	结合历史数据和深度学习技术，提高了预测晚期AMD的准确性，并证明深度学习提取的图像特征比临床医生提取的特征更具信息性	仅使用当前访问的数据时，复杂特征的预测效果不如结合纵向数据	预测晚期AMD的发展	年龄相关性黄斑变性（AMD）患者	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	深度学习	卷积神经网络（CNN）	图像	AREDS研究中的纵向数据
7957	2025-01-27	Regional PM2.5 prediction with hybrid directed graph neural networks and Spatio-temporal fusion of meteorological factors 2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2024.125404 PMID:39613176	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的混合有向图神经网络方法，用于预测区域PM2.5浓度，并考虑了相邻城市之间的区域传输相互作用	结合图神经网络（GNN）和长短期记忆网络（LSTM）进行时空编码，显著提高了PM浓度预测的准确性，并在华北平原的48小时预测中表现出色	模型主要应用于华北平原，可能在其他地区的适用性需要进一步验证	优化空气质量预测和管理	区域PM2.5浓度	机器学习	NA	深度学习	混合有向图神经网络（GNN + LSTM）	时空数据	NA
7958	2025-01-27	Predictive analysis of COVID-19 occurrence and vaccination impacts across the 50 US states 2025-Feb, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109493 PMID:39626459	研究论文	本研究旨在通过机器学习模型评估疫苗接种在COVID-19确诊病例和死亡病例中的有效性，并使用外部验证确保对接种人群的最佳保护	开发了一个深度学习LSTM模型，用于分析疫苗接种在预测COVID-19病例和死亡中的有效性，并通过内部和外部验证评估模型性能	研究仅基于美国CDC的数据，可能无法完全适用于其他国家的疫情情况	评估COVID-19疫苗接种在减少确诊病例和死亡病例中的有效性	美国50个州的COVID-19确诊病例和死亡病例	机器学习	COVID-19	深度学习	LSTM	时间序列数据	2021年至2023年美国CDC收集的数据
7959	2025-01-27	Interpretable prediction of drug-drug interactions via text embedding in biomedical literature 2025-Feb, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109496 PMID:39626457	研究论文	本研究提出了一种基于层次注意力机制的深度学习模型，通过生物医学文献预测药物-药物相互作用（DDIs）及其类型	使用预训练的生物医学语言模型和双向长短期记忆网络结合层次注意力机制，有效捕捉药物特性并预测DDIs，同时通过注意力机制解释预测结果	未提及模型在更大规模数据集上的泛化能力或实际临床应用中的验证	预测药物-药物相互作用及其类型，以确保安全用药	药物-药物相互作用（DDIs）	自然语言处理	NA	深度学习	双向长短期记忆网络（BiLSTM）与层次注意力网络	文本	164种DDI类型
7960	2025-01-27	A review of convolutional neural network based methods for medical image classification 2025-Feb, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109507 PMID:39631108	综述	本文系统回顾了基于卷积神经网络（CNN）的医学图像分类方法，并分析了这些方法的发展、主要技术及其在提高分类准确性和效率方面的作用	对149篇最新和最重要的论文进行了深入分析，系统总结了CNN在医学图像分类中的应用及其面临的挑战，并指出了未来的研究方向	尽管CNN在医学图像分类任务中表现出色，但其在临床应用中仍面临困难	探讨CNN在医学图像分类中的应用及其未来研究方向	医学图像分类方法	计算机视觉	NA	CNN	CNN	图像	149篇论文