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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
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8261 | 2025-06-15 |
A comprehensive dataset of mandarin leaf images for classification
2025-Jun, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2025.111685
PMID:40510633
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研究论文 | 该研究致力于使用深度学习方法对柑橘叶进行分类 | 提供了一个全面的柑橘叶图像数据集,并采用深度学习方法进行分类,支持早期健康叶片的识别 | 数据集仅包含健康叶片图像,可能限制了在病害叶片分类上的应用 | 提升柑橘叶分类技术,支持农业领域的自动化系统开发 | 柑橘叶片 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | NA | 图像 | 1917张原始图像和8000张增强图像 | NA | NA | NA | NA |
8262 | 2025-06-15 |
An annotated image dataset of urban insects for the development of computer vision and deep learning models with detection tasks
2025-Jun, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2025.111673
PMID:40510639
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research paper | 该研究创建了一个用于开发计算机视觉和深度学习模型的带注释的城市昆虫图像数据集 | 提供了一个大规模、高分辨率的城市昆虫图像数据集,包含超过25,000个注释,用于开发昆虫识别算法 | 数据集仅包含通过UV光陷阱捕获的昆虫,可能无法涵盖所有城市昆虫种类 | 开发用于自动检测城市昆虫多样性或害虫控制的深度学习模型 | 城市昆虫 | computer vision | NA | UV光陷阱、高分辨率扫描 | YOLO | image | 超过25,000个注释的昆虫图像 | NA | NA | NA | NA |
8263 | 2025-06-15 |
Commercial Products Using Generative Artificial Intelligence Include Ambient Scribes, Automated Documentation and Scheduling, Revenue Cycle Management, Patient Engagement and Education, and Prior Authorization Platforms
2025-May-24, Arthroscopy : the journal of arthroscopic & related surgery : official publication of the Arthroscopy Association of North America and the International Arthroscopy Association
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.arthro.2025.05.021
PMID:40419172
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research paper | 本文探讨了生成式人工智能在医疗保健领域的商业应用及其对临床工作流程的变革 | 重点介绍了大型语言模型(LLMs)在医疗保健中的新兴商业应用,如环境记录员、自动化文档和调度等 | 当前限制包括缺乏监管监督、现有偏见、与电子健康记录的互操作性不一致,以及由于对LLM输出缺乏信心导致的医生和利益相关者支持不足 | 研究生成式人工智能在医疗保健领域的应用及其潜在影响 | 商业生成式人工智能产品及其在医疗保健中的应用 | natural language processing | NA | large language models (LLMs), deep learning | LLM | text | NA | NA | NA | NA | NA |
8264 | 2025-06-15 |
Federated prediction for scalable and privacy-preserved knowledge-based planning in radiotherapy
2025-May-20, ArXiv
PMID:40470470
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研究论文 | 开发了一个名为FedKBP+的联邦学习平台,用于放射治疗计划中的预测任务,以提高效率和保护数据隐私 | 提出了一个全面的联邦学习平台FedKBP+,支持集中式和完全分散式的联邦学习策略,并展示了其在多种预测任务中的高效性和鲁棒性 | 未明确提及具体局限性,但可能涉及在实际临床环境中的进一步验证需求 | 解决放射治疗计划中数据稀缺和异构性导致的模型泛化能力不足问题,同时保护患者数据隐私 | 放射治疗计划中的预测任务,包括3D剂量预测、脑肿瘤分割和器官分割 | 机器学习 | 脑肿瘤 | 联邦学习(FL) | SA-Net, FedAvg, FedProx, Gossip Contrastive Mutual Learning | 医学影像数据 | 340例(OpenKBP Challenge)、227例(BraTS challenge)、384例(PanSeg dataset) | NA | NA | NA | NA |
8265 | 2025-06-15 |
VADEr: Vision Transformer-Inspired Framework for Polygenic Risk Reveals Underlying Genetic Heterogeneity in Prostate Cancer
2025-May-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.05.16.25327672
PMID:40463543
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research paper | 提出了一种基于Vision Transformer的框架VADEr,用于捕捉基因数据中的局部和全局交互,以预测前列腺癌的多基因风险 | 结合自然语言处理和计算机视觉技术,利用Vision Transformer架构捕捉基因变异间的复杂交互,并引入DARTH评分提供可解释的疾病风险驱动因素 | 研究仅针对前列腺癌,未验证在其他复杂疾病中的适用性 | 开发一种能够捕捉基因变异间复杂交互的多基因风险预测框架 | 前列腺癌(PCa)的多基因风险预测 | machine learning | prostate cancer | Vision Transformer (ViT) | Transformer | genetic data | NA | NA | NA | NA | NA |
8266 | 2025-06-15 |
ProtFun: A Protein Function Prediction Model Using Graph Attention Networks with a Protein Large Language Model
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653854
PMID:40463264
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研究论文 | 提出了一种名为ProtFun的多模态深度学习架构,用于预测蛋白质功能 | 结合蛋白质大型语言模型(LLM)嵌入和图注意力网络(GAT)来学习蛋白质嵌入,并与InterPro的蛋白质特征表示整合 | 未提及具体局限性 | 开发计算方法来自动预测蛋白质功能 | 蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质大型语言模型(LLM)、图注意力网络(GAT) | GAT | 蛋白质序列数据 | 三个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
8267 | 2025-06-15 |
Distinct actin microfilament localization during early cell plate formation through deep learning-based image restoration
2025-May-08, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03498-7
PMID:40335746
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研究论文 | 通过基于深度学习的图像恢复技术,实现了高分辨率4D成像,揭示了Lifeact-RFP标记的肌动蛋白微丝在细胞板形成初期的独特定位及其作用 | 利用深度学习进行图像恢复,实现了最小光损伤的高分辨率4D成像,揭示了两种不同标记的肌动蛋白微丝在细胞板形成初期的不同定位模式 | 研究仅使用了转基因烟草BY-2细胞,可能不适用于其他植物细胞类型 | 探究肌动蛋白微丝在细胞板形成初期的定位和功能 | 转基因烟草BY-2细胞 | 计算机视觉 | NA | 深度学习图像恢复技术 | 深度学习 | 图像 | 转基因烟草BY-2细胞 | NA | NA | NA | NA |
8268 | 2025-06-15 |
Unsupervised Deep Learning for Blood-Brain Barrier Leakage Detection in Diffuse Glioma Using Dynamic Contrast-enhanced MRI
2025-05, Radiology. Artificial intelligence
DOI:10.1148/ryai.240507
PMID:40172325
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研究论文 | 开发了一种无监督深度学习框架,用于在弥漫性胶质瘤中通过动态对比增强MRI检测血脑屏障泄漏,无需药代动力学模型和动脉输入函数估计 | 采用基于自动编码器的异常检测方法,通过重构残差识别一维体素级时间序列异常信号,并将其分为残余泄漏信号和残余血管信号 | 研究为回顾性研究,可能存在选择偏差 | 开发一种无需药代动力学模型和动脉输入函数估计的血脑屏障泄漏检测方法 | 弥漫性胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 动态对比增强MRI | 自动编码器 | MRI图像 | 274名患者(平均年龄54.4岁±14.6,其中164名男性) | NA | NA | NA | NA |
8269 | 2025-05-29 |
Pixels to Prognosis: Using Deep Learning to Rethink Cardiac Risk Prediction from CT Angiography
2025-05, Radiology. Artificial intelligence
DOI:10.1148/ryai.250260
PMID:40434277
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8270 | 2025-06-15 |
Gene expression inference based on graph neural networks using L1000 data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf273
PMID:40505083
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研究论文 | 本研究探讨了基于图神经网络(GNN)的基因表达推断方法,使用L1000数据,展示了其在预测基因表达值和基于表达的基因排序上的优越性 | 首次将图神经网络应用于基因表达推断,相比传统线性回归和非线性非GNN模型,GNN模型在减少10倍信息需求的同时达到可比性能 | 未明确提及具体的数据集规模限制或模型在特定生物环境下的适用性限制 | 探索非线性模型,特别是基于图结构的模型,在基因表达推断中的有效性 | 基因表达数据 | 生物信息学 | NA | L1000 | GNN | 基因表达数据 | 超过一百万种不同条件下的基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
8271 | 2025-06-15 |
AI-Driven Advancements in Bioinformatics: Transforming Healthcare and Science
2025-May, Journal of pharmacy & bioallied sciences
DOI:10.4103/jpbs.jpbs_389_25
PMID:40511171
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review | 本文回顾了AI在生物信息学中的关键应用及其对医疗实践和科学研究的潜在影响 | 探讨了AI在基因组和蛋白质结构预测、药物发现算法及诊断解决方案中的创新应用 | 存在数据质量、模型可解释性不明确及伦理问题等限制 | 评估AI在生物信息学中的基础方法及其在医疗和科学研究中的应用 | 基因组、蛋白质结构、药物发现算法和诊断解决方案 | 生物信息学 | NA | 机器学习、深度学习 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8272 | 2025-06-15 |
Post-Training Network Compression for 3D Medical Image Segmentation: Reducing Computational Efforts via Tucker Decomposition
2025-03, Radiology. Artificial intelligence
DOI:10.1148/ryai.240353
PMID:39812583
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研究论文 | 本研究探讨了通过Tucker分解减少基于3D CT的多器官分割模型TotalSegmentator的计算量 | 首次将Tucker分解应用于医学图像分割模型的压缩,显著减少了模型参数和计算量,同时保持分割精度 | 不同GPU架构上的实际加速效果存在差异,在性能较低的硬件上加速效果更明显 | 降低医学图像分割模型的计算需求 | TotalSegmentator模型(基于nnU-Net的117个解剖结构自动分割模型) | 数字病理 | NA | Tucker分解 | nnU-Net | 3D CT图像 | 1228个分割CT扫描(训练集)+89个CT扫描(测试集) | NA | NA | NA | NA |
8273 | 2025-06-15 |
Optimising deep learning models for ophthalmological disorder classification
2025-01-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75867-3
PMID:39856068
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研究论文 | 本文利用深度学习模型对眼科疾病进行分类,采用基于迁移学习的CNN方法 | 使用MobileNet模型结合Adam优化器,在眼科疾病分类中取得了89.64%的测试准确率 | 仅使用了ODIR数据库中的数据进行实验,可能在其他数据集上表现不同 | 优化深度学习模型以提高眼科疾病分类的准确性 | 眼科疾病(如高血压、青光眼、糖尿病视网膜病变) | 计算机视觉 | 眼科疾病 | fundus imaging | CNN, MobileNet | image | ODIR数据库中的眼底图像(患者左右眼) | NA | NA | NA | NA |
8274 | 2025-06-15 |
Detection of cervical cell based on multi-scale spatial information
2025-01-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87165-7
PMID:39856153
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研究论文 | 提出了一种基于多尺度空间信息的宫颈细胞检测方法,以提高宫颈癌筛查和诊断的效率 | 设计了多尺度空间信息增强模块(MSA)和通道注意力增强模块(CAE),有效捕捉和整合不同尺度的空间信息,并动态优化关键特征 | 未提及具体的数据集规模或多样性限制,也未讨论模型在其他数据集上的泛化能力 | 提高宫颈癌筛查和诊断的效率和准确性 | 宫颈细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 深度学习 | Sparse R-CNN | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
8275 | 2025-06-15 |
Phyla: Towards a foundation model for phylogenetic inference
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633626
PMID:39896621
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研究论文 | 本文介绍了Phyla,一种专为系统发育推理设计的混合状态空间变换器架构,旨在通过树损失函数实现序列推理和系统发育树重建的最新性能 | Phyla采用了一种新颖的混合状态空间变换器架构和树损失函数,专注于序列间的推理能力,而非传统的单个序列学习 | NA | 开发一个用于系统发育推理的基础模型,提升计算生物学中序列分析和系统发育推理的性能 | 蛋白质序列和系统发育树 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 混合状态空间变换器 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8276 | 2025-06-15 |
Artificial intelligence: the human response to approach the complexity of big data in biology
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf057
PMID:40504538
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综述 | 本文探讨了人工智能在生命科学中的应用,特别是在处理高通量组学数据时的作用 | 强调了基于组学的预测分析在系统生物学中的作用,以及创新的AI分析方法在理解复杂生物系统中的价值 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨人工智能在生命科学中的应用及其对组学数据分析的影响 | 植物科学、动物科学和微生物学中的生物过程和生态系统动态 | 机器学习 | NA | 高通量组学数据分析 | 深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8277 | 2025-06-15 |
Improving lung cancer diagnosis and survival prediction with deep learning and CT imaging
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0323174
PMID:40498724
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研究论文 | 该论文提出了一种结合深度学习和CT影像的方法,用于改善肺癌的诊断和生存预测 | 使用卷积神经网络建模肺癌风险与肺部形态之间的非线性关系,并提出了结合小批量损失和二元交叉熵的方法来预测肺癌发生和死亡风险 | 未提及具体的数据集局限性或模型泛化能力问题 | 提高肺癌的诊断准确性和生存预测效果 | 肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | CT成像 | 3D CNN | 医学影像 | 国家肺癌筛查试验数据集 | NA | NA | NA | NA |
8278 | 2025-06-15 |
An ensemble-based 3D residual network for the classification of Alzheimer's disease
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0324520
PMID:40498744
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的集成方法,用于阿尔茨海默病的分类 | 采用加权概率的集成方法整合3D残差网络的结果,并引入CBAM注意力机制增强模型性能 | 数据量有限,需通过数据增强技术来提升准确率 | 早期诊断轻度认知障碍(MCI)以延缓阿尔茨海默病(AD)的进展 | 阿尔茨海默病(AD)及其前驱阶段轻度认知障碍(MCI)患者 | 数字病理学 | 老年病 | 深度学习 | 3D ResNet-18, 3D ResNet-34, 3D ResNet-50 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
8279 | 2025-06-15 |
In-depth exploration of software defects and self-admitted technical debt through cutting-edge deep learning techniques
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0324847
PMID:40498858
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研究论文 | 提出了一种利用深度学习技术同时识别和分类自承认技术债务(SATD)及软件缺陷的创新方法 | 首次结合深度学习技术同时处理SATD和软件缺陷的识别与分类,并采用Transformer模型如GPT-3提升性能 | 未明确提及模型在小规模或特定领域软件项目中的泛化能力 | 提升软件质量评估与维护的全面性,优化技术债务与缺陷的认知及维护资源分配 | 软件注释中的自承认技术债务(SATD)及相关缺陷 | 自然语言处理 | NA | 深度学习架构(LSTM, BI-LSTM, GRU, BI-GRU)及Transformer模型(BERT, GPT-3) | LSTM, GRU, BERT, GPT-3 | 文本(软件注释) | 来自Apache、Mozilla Firefox和Eclipse等仓库的多样化项目数据,含SATD示例和缺陷实例 | NA | NA | NA | NA |
8280 | 2025-06-15 |
Interpretable deep learning for gastric cancer detection: a fusion of AI architectures and explainability analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596085
PMID:40510366
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研究论文 | 本文提出了一种结合多种深度学习架构和可解释性分析的胃癌检测方法 | 融合了VGG16、RESNET50和MobileNetV2三种深度学习架构,并采用LIME技术提高模型决策的可解释性 | 未提及具体的数据集来源和样本多样性问题 | 开发高精度且可解释的胃癌检测系统以支持临床决策 | 胃癌的医学影像检测 | 数字病理学 | 胃癌 | 深度学习融合架构、LIME可解释性分析 | VGG16、RESNET50、MobileNetV2融合模型 | 医学影像 | NA | NA | NA | NA | NA |