深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
821	2026-06-06	Evaluating the impact of deep learning-based image denoising on low-dose CT for lung cancer screening 2026-Feb, Journal of applied clinical medical physics IF:2.0Q3 DOI:10.1002/acm2.70480 PMID:41579047	研究论文	评估深度学习图像去噪对低剂量CT肺癌筛查的影响	系统比较了七种深度学习去噪方法在低剂量CT肺癌筛查中的效果，并评估了去噪对实性和亚实性结节特征及Lung-RADS分类准确性的影响	去噪对亚实性结节的影响有限，且去噪可能引入偏差，需要进一步验证对诊断性能的影响	评估深度学习图像去噪对低剂量CT肺癌筛查中结节检测和分类的影响	低剂量CT扫描图像中的肺结节（实性和亚实性结节）	计算机视觉	肺癌	低剂量CT	深度学习去噪模型	图像	来自LDCT和投影数据集的胸部CT扫描，具体样本数量未提及	NA	七种深度学习去噪方法，具体架构未提及	均方根误差（RMSE）、峰值信噪比（PSNR）、结构相似性指数（SSIM）、结节大小、CT密度、Lung-RADS分类	NA
822	2026-06-06	Multi-dimensional attention-enhanced reconstruction for sparse-view CBCT 2026-Feb, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.70299 PMID:41589426	研究论文	本研究提出一种多维度注意力增强重建算法（MAE-Recon），用于稀疏视图锥形束计算机断层扫描（CBCT），以减少条纹伪影并恢复图像细节	引入两种即插即用的注意力增强模块以建模投影间的长程依赖性和特征内的信息冗余，并在投影域和图像域联合进行深度学习重建	待定（摘要未明确提及局限性）	消除稀疏视图CBCT中的条纹伪影并提升图像质量	稀疏视图CBCT重建中的投影数据和重建图像	计算机视觉	不适用	锥形束计算机断层扫描（CBCT）	深度学习网络（多重注意力增强网络）	图像（CBCT投影数据与重建图像）	一个真实胸部数据集和一个模拟腹部数据集	PyTorch（基于论文描述推断，未明确说明）	线性插值模块、投影域网络、FDK算子、图像域网络（含两种注意增强模块）	RMSE, SSIM, PSNR	待定（摘要未提及计算资源）
823	2026-06-06	Classification of epileptic seizure using hybrid deep learning framework with time and time-frequency Hjorth features 2026-Feb, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering IF:1.7Q3 DOI:10.1080/10255842.2026.2618585 PMID:41589762	研究论文	提出一种融合时域和时频域Hjorth参数及注意力增强时间建模的混合深度学习框架，用于癫痫发作阶段分类	首次将多域Hjorth参数与注意力增强的时间建模相结合，用于癫痫发作阶段分类，并在Bonn EEG数据集上实现了高分类精度	未提及模型在真实临床环境中的泛化能力及跨数据集验证结果	提出一种结合多域Hjorth特征和注意力增强时间模型的深度学习框架，以提高癫痫发作阶段的分类性能	Bonn EEG数据集中的脑电图信号	机器学习	癫痫	NA	1D CNN, BiLSTM, 注意力机制	脑电图信号	使用Bonn EEG数据集，具体样本量未提及	NA	1D CNN, BiLSTM, Attention	精确度, 召回率, F1分数, 准确率	NA
824	2026-06-06	Functional and Clinical: An Explainable Deep Learning Model for Multimodal Alzheimer's Disease Classification 2026-Feb, Brain and behavior IF:2.6Q3 DOI:10.1002/brb3.71240 PMID:41612899	研究论文	提出了一种结合功能磁共振成像和临床测试的多模态可解释深度学习模型，用于阿尔茨海默病分类	通过多模态融合和可解释人工智能方法，克服了fMRI小数据集、可解释性和可靠性问题，并利用扰动排序解释特征重要性	样本量较小，需要外部验证	提高阿尔茨海默病分类的准确性和可解释性，促进模型的临床应用	阿尔茨海默病患者和健康对照者	数字病理学	阿尔茨海默病	功能磁共振成像	3D卷积神经网络	图像、临床测试数据	52名参与者来自ADNI数据集	NA	3D卷积神经网络	准确率	NA
825	2026-06-06	Deep learning-assisted spectral technology monitoring the preservation effect of sodium octenyl succinate starch co-loaded with cinnamaldehyde and carvacrol microcapsules for pork 2026-Feb, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150502 PMID:41581811	研究论文	利用深度学习辅助光谱技术监测辛烯基琥珀酸淀粉钠共载肉桂醛和香芹酚微胶囊对猪肉的保鲜效果	首次将辛烯基琥珀酸淀粉钠共载肉桂醛和香芹酚微胶囊与深度学习相结合，开发基于可见-近红外光谱的快速猪肉品质检测模型	模型基于实验室采集的光谱数据，实际应用中的泛化性和鲁棒性需进一步验证	开发一种快速、非破坏性的猪肉新鲜度检测方法，并评估微胶囊的保鲜效果	猪肉样品，使用辛烯基琥珀酸淀粉钠共载肉桂醛和香芹酚微胶囊处理	机器学习和数字病理学	NA	喷雾干燥、可见-近红外光谱	深度学习模型	光谱数据	未明确说明	NA	NA	相关系数R	NA
826	2026-06-06	Beyond the Leaderboard: Evaluating the Robustness of Deep Learning Models for Detecting Freezing of Gait 2026-Feb, The European journal of neuroscience DOI:10.1111/ejn.70424 PMID:41657009	研究论文	评估深度学习模型在检测帕金森病患者冻结步态时的鲁棒性，并测试其在真实世界数据集上的可迁移性	通过全球机器学习竞赛筛选获胜模型，并在新的家庭采集数据集中评估模型的可迁移性，而仅关注排行榜性能	模型在计数冻结发作和检测亚型方面表现不足，需要额外传感器或其他建模方法	评估深度学习模型在检测冻结步态中的鲁棒性和可迁移性	帕金森病患者的冻结步态检测	机器学习	帕金森病	加速度计传感器	深度学习模型	加速度数据	12名患者	NA	NA	F1分数、准确率、召回率、特异度、精确度、组内相关系数	NA
827	2026-06-06	Cell Analyser in Batch for Neurite (CABaNe), an Automated, High-Throughput ImageJ Macro for Cell and Neurite Analysis 2026-Feb, eNeuro IF:2.7Q3 DOI:10.1523/ENEURO.0193-25.2025 PMID:41617476	研究论文	介绍CABaNe，一种用于细胞和神经突分析的高通量自动化ImageJ宏	提出一种开源、高通量、基于规则的ImageJ宏，用于自动分析细胞及其神经突长度，具有图形界面和元数据生成功能	未在更复杂的神经元类型或体内数据上验证其泛化能力	开发一种高通量、自动化的细胞和神经突分析工具	N2A小鼠神经母细胞瘤细胞系	数字病理学	神经退行性疾病	NA	基于规则的方法	图像	小样本和大数据集	ImageJ	NA	精度	NA
828	2026-06-06	Model uncertainty estimates for deep learning mammographic density prediction using ordinal and classification approaches 2026-Jan-30, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/ae39e2 PMID:41554181	研究论文	通过分类和序数深度学习方法预测乳腺密度，并生成模型不确定性估计	提出在保持预测性能的同时，利用分类和序数深度学习模型内置不确定性估计的方法	NA	在不降低预测性能的前提下，生成带有不确定性估计的深度学习模型	乳腺密度	机器学习, 数字病理学	乳腺癌	NA	深度学习模型（分类和序数模型）	图像	超过150,000张乳房X线照片	NA	NA	均方根误差	NA
829	2026-06-06	Decoding Allosteric Inhibition in MALT1: The Hidden Role of Conformational Plasticity in Metastable States via Biased MD and Deep Learning 2026-Jan-29, The journal of physical chemistry. B DOI:10.1021/acs.jpcb.5c07665 PMID:41557786	研究论文	通过偏置分子动力学和深度学习揭示MALT1蛋白变构抑制中构象可塑性的隐藏作用	首次结合偏置分子动力学模拟、神经网络和对接计算，系统研究MALT1蛋白在变构抑制中的复杂构象行为，揭示Loop 1和Loop 3运动对催化位点腔体积缩小和半胱氨酸不可及性的关键作用	研究结果适用于小鼠MALT1蛋白，尽管与人类MALT1有93%同源性，但泛化至人类MALT1需谨慎	探索MALT1蛋白的复杂动力学行为及其变构抑制机制，为新型MALT1变构抑制剂的计算机设计提供客观标准	MALT1蛋白（黏膜相关淋巴组织淋巴瘤易位蛋白1）	机器学习	血液癌症	偏置分子动力学模拟、神经网络、对接计算	神经网络	分子动力学轨迹数据	未明确提及样本数量	NA	NA	NA	NA
830	2026-06-06	Protein language models trained on biophysical dynamics inform mutation effects 2026-Jan-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2530466123 PMID:41576089	研究论文	提出了两种基于生物物理动力学训练的蛋白质语言模型SeqDance和ESMDance，用于预测蛋白质动态特性和突变效应	首次将分子动力学模拟和简正模态分析的动态生物物理特性整合到蛋白质语言模型中，能捕获蛋白质结构动态性从而提升突变效应预测的泛化能力	未提及具体局限性	通过融合蛋白质动态特性改进语言模型对突变效应的预测能力	超过64000种蛋白质的动力学特性及其突变效应	机器学习	NA	分子动力学模拟、简正模态分析	蛋白质语言模型	蛋白质序列、动态生物物理特性数据	超过64000种蛋白质	PyTorch	Transformer, ESM2	零样本预测性能	NA
831	2026-06-06	Deep atrous context convolution generative adversarial network with corner key point extracted feature for nuts classification 2026-Jan-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-36238-2 PMID:41588160	研究论文	提出一种深度空洞上下文卷积生成对抗网络（DAC-GAN）用于坚果分类，在8类坚果数据集上达到99.83%准确率	将角点关键点特征提取与空洞卷积相结合，并在空洞卷积前后附加上下文模块以融入图像级信息，同时利用DCGAN生成合成图像解决标注数据不足问题	NA	实现坚果分类的自动化，提升分类精度和泛化能力	8类坚果（巴西坚果、腰果、花生、山核桃、开心果、栗子、夏威夷果、核桃）	计算机视觉	NA	NA	生成对抗网络、空洞卷积神经网络	图像	Common Nut KAGGLE数据集，共4000张坚果图像，涵盖8个类别	NA	DAC-GAN（基于DCGAN的生成器和判别器，结合空洞卷积及前后上下文模块）	准确率	NA
832	2026-06-06	Exploring anatomical similarity in zero-shot learning for bone abnormality detection 2026-Jan-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-37516-9 PMID:41593191	研究论文	本文探索了在骨骼异常检测中利用解剖相似性进行零样本学习的方法	明确提出在MURA数据集上进行零样本转移训练，利用解剖相似性进行跨部位检测，无需目标数据访问	研究仅基于MURA数据集，未使用语义侧信息或目标自适应，可能限制实际应用中的性能	评估解剖相似性在零样本学习中提升骨骼异常检测跨部位迁移性能的可行性	MURA数据集中的不同解剖部位图像	计算机视觉	骨骼异常	NA	NA	图像	NA	NA	NA	准确率，95% Wilson置信区间	NA
833	2026-06-06	Trimester-aware yoga video recommendation using hybrid deep learning for pregnant woman 2026-Jan-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-37149-y PMID:41588129	研究论文	提出一种孕期意识混合深度学习框架，用于为孕妇推荐孕 trimester-aware 瑜伽视频	引入了孕期加权Wasserstein相似度机制和安全性感知有向图卷积关系神经网络，实现多模态文本-视频分析与生理安全推理的结合	未明确提及局限性	开发孕期意识瑜伽推荐系统，提升孕妇运动安全性和个性化体验	孕妇及其不同孕期的瑜伽视频推荐	机器学习, 计算机视觉, 自然语言处理	孕妇健康	NA	混合深度学习模型	文本和视频	未明确提及	NA	孕期加权Wasserstein相似度机制, 安全性感知有向图卷积关系神经网络	准确率, 孕期特异性安全合规性	NA
834	2026-06-06	Aegis: a transformer-based deep learning framework for the accurate identification of anticancer peptides 2026-Jan-26, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-026-02520-y PMID:41588397	研究论文	提出基于Transformer的深度学习框架Aegis用于精准识别抗癌肽	首次将Transformer架构应用于抗癌肽识别，结合SHAP特征重要性分析和增量特征选择，达到最先进性能	NA	开发高效计算工具以准确预测抗癌肽	抗癌肽序列	机器学习	癌症	NA	Transformer	文本（氨基酸序列）	NA	NA	Transformer	NA	NA
835	2026-06-06	FibroTrack: a standalone deep learning platform for automated fibrosis quantification in muscle and cardiac histology 2026-Jan-26, Skeletal muscle IF:5.3Q2 DOI:10.1186/s13395-026-00415-8 PMID:41588534	研究论文	介绍FibroTrack，一个用于肌肉和心脏组织学中自动化纤维化量化的独立深度学习平台	独特的整合了LAB色彩空间归一化与YOLOv11分割模型，并结合图形用户界面，实现高精度、高重现性的纤维化自动化量化	未提及具体局限性	提供一种准确、可重复且高效的全自动纤维化量化工具，用于临床前研究和病理学实践	肌肉和心脏组织学图像中的纤维化区域	数字病理学	肌肉疾病、心脏疾病	组织学染色（天狼星红、马松三色、免疫组化）	YOLOv11	图像	2,034张组织学图像	PyTorch	YOLOv11	掩码精确率、斯皮尔曼相关性	NA
836	2026-06-06	[Precision surgical treatment for middle and low rectal cancer in the era of artificial intelligence] 2026-Jan-25, Zhonghua wei chang wai ke za zhi = Chinese journal of gastrointestinal surgery DOI:10.3760/cma.j.cn441530-20251015-00381 PMID:41566182	综述	探讨人工智能时代中低位直肠癌的精准外科治疗策略	提出通过深度学习算法分析CT和MRI影像数据为手术规划提供量化依据，并结合增强现实技术实现术中实时肿瘤定位和解剖导航	NA	实现中低位直肠癌的个性化精准外科治疗	中低位直肠癌患者	机器学习, 计算机视觉	直肠癌	CT, MRI	CNN, 深度学习	影像	NA	NA	深度学习模型	NA	NA
837	2026-06-06	Sickle cell disease detection in low-resource conditions using transfer-learning and contrastive-learning coupled with XAI 2026-Jan-24, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-35831-9 PMID:41580439	研究论文	利用迁移学习和对比学习结合可解释人工智能在低资源条件下检测镰状细胞病	提出结合迁移学习与基于三元组损失的对比学习及可解释人工智能方法，解决低资源条件下深度学习模型训练数据不足的问题	信息不足	提高低资源条件下镰状细胞病自动检测的效率和可解释性	镰状细胞病图像数据集	计算机视觉	镰状细胞病	NA	CNN	图像	NA	NA	ResNet-50, DenseNet-121, EfficientNet-B0	NA	NA
838	2026-06-06	EDEN: multiscale expected density of nucleotide encoding for enhanced DNA sequence classification with hybrid deep learning 2026-Jan-24, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-026-06367-6 PMID:41580658	研究论文	提出基于核密度估计的多尺度编码框架EDEN，用于增强DNA序列分类	首次将核密度估计应用于DNA序列编码，统一捕获局部和长程依赖，并在16个基准数据集中以极少参数取得最优平均性能	N/A	提升DNA序列分类的准确性和效率	DNA序列，涵盖启动子检测、核心启动子检测和转录因子结合预测	机器学习	N/A	N/A	混合深度学习模型	DNA序列数据	16个基准数据集	N/A	混合深度学习架构	平均性能	N/A
839	2026-06-06	DANEELpath open source digital analysis tools for histopathological research in neuroblastoma models 2026-Jan-24, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-026-37134-5 PMID:41580539	研究论文	介绍DANEELpath，一个用于神经母细胞瘤模型组织病理学研究的开源数字分析工具包	开发了集深度学习、数学形态学管道和空间特征提取于一体的开源图像分析工具包，适用于3D水凝胶培养的神经母细胞瘤模型	NA	开发用于分析3D培养神经母细胞瘤细胞动态的开源图像分析工具，以研究肿瘤微环境中细胞外基质的作用	三维水凝胶培养的神经母细胞瘤细胞模型	数字病理学	神经母细胞瘤	生物图像分析	深度学习模型	全切片图像	NA	NA	数学形态学管道	NA	NA
840	2026-06-06	The role of low-complexity repeats in RNA-RNA interactions and a deep learning framework for duplex prediction 2026-Jan-23, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-026-68356-w PMID:41571635	研究论文	分析低复杂度重复序列在RNA-RNA相互作用中的作用，并开发了一个基于深度学习的双链预测框架	首次识别低复杂度重复序列（包括简单串联重复）作为RNA-RNA相互作用的关键驱动因素，并利用核酸语言模型嵌入开发了性能优于传统热力学工具的深度学习模型RIME	未明确指出局限性	阐明低复杂度重复序列在RNA-RNA相互作用中的分子决定作用，并开发更准确的相互作用预测工具	多个大规模RNA-RNA相互作用数据集，以及lncRNA Lhx1os的相互作用组	自然语言处理	不适用	RNA-seq	深度学习	序列数据	多个大规模RNA-RNA相互作用数据集	PyTorch	核酸语言模型	准确性，AUC	不适用