深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
861	2025-11-08	Investigating Membership Inference Attacks Against CNN Models for BCI Systems 2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3593443 PMID:40720264	研究论文	研究针对脑机接口系统中CNN模型的成员推断攻击及其隐私风险	首次对脑机接口CNN模型进行成员推断攻击的实证分析，重点解决异构数据集和时空设计选择两大挑战	攻击对其他类型数据（如图像和表格数据）的深度学习模型无效，研究结果可能受特定实验设置限制	探究脑机接口系统中CNN分类器的隐私漏洞	基于脑电图数据的CNN分类器	机器学习	NA	脑电图	CNN	脑电图信号	涉及多个参与者的脑电图数据集	NA	CNN	成员推断攻击成功率	NA
862	2025-11-08	Verification is All You Need: Prompting Large Language Models for Zero-Shot Clinical Coding 2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3593028 PMID:40720269	研究论文	提出基于代码验证的新型ICD编码范式，利用大型语言模型作为代码验证器而非生成器	首次将大型语言模型应用于临床编码验证任务，通过简化任务从直接生成代码转变为验证候选代码	在直接生成临床代码方面性能仍不理想，需要依赖候选代码集	提高临床编码在不同数据分布下的泛化性能	电子健康记录中的临床编码任务	自然语言处理	NA	大型语言模型	GPT-4o	医疗文本	CodiEsp数据集	NA	GPT-4o	准确率	NA
863	2025-11-08	Feasibility of optical stereotactic navigation for rectosigmoid cancer with deep learning-supported 3D modelling 2025-Nov, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology DOI:10.1016/j.ejso.2025.110397 PMID:40907165	研究论文	本研究评估了深度学习支持的3D建模在直肠乙状结肠癌光学立体定向导航手术中的可行性	首次将深度学习生成的MRI分割与术前CT图像融合用于直肠乙状结肠癌的实时光学立体定向导航	单中心研究且样本量较小（仅10例患者）	评估光学立体定向导航在直肠乙状结肠癌手术中的实施可行性和准确性	局部晚期cT4bN0-2直肠癌或局部复发性直肠乙状结肠癌患者	数字病理	直肠癌	光学立体定向导航，CT-MRI图像融合	深度学习模型	医学影像（CT，MRI）	10例患者	NA	NA	目标配准误差，R0切除率，无瘤切缘率	NA
864	2025-11-08	Epigenomic landscape of single vascular cells reflects developmental origin and disease risk loci 2025-Nov, Molecular systems biology IF:8.5Q1 DOI:10.1038/s44320-025-00140-2 PMID:40931195	研究论文	通过单细胞染色质可及性和基因表达谱分析揭示血管部位特异性疾病风险的调控机制	首次在三个血管部位同时进行单细胞表观基因组和转录组分析，发现关键调控增强子具有血管部位特异性，并整合GWAS数据通过深度学习模型预测变异效应	研究仅限于小鼠血管组织，尚未在人类样本中验证	探索血管部位特异性疾病风险的表观基因组和转录组基础	小鼠三个不同血管部位的血管组织	计算生物学	心血管疾病	scATACseq, scRNAseq, 全基因组关联分析	深度学习模型	单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联数据	三个血管部位的血管组织样本	ChromBPNet	NA	NA	NA
865	2025-11-08	Cell-APP: A generalizable method for cell annotation and cell-segmentation model training 2025-Nov-01, Molecular biology of the cell IF:3.1Q3 DOI:10.1091/mbc.E25-02-0076 PMID:40991412	研究论文	提出一种自动化细胞注释和分割模型训练的方法Cell-APP，用于高通量显微镜数据分析	开发了结合透射光和核荧光图像自动生成高质量细胞分割训练数据的流程，支持构建细胞系特异性和多细胞系通用分割模型	NA	自动化细胞注释和分割模型训练，解决手工标注数据规模有限的问题	显微镜图像中的细胞	计算机视觉	NA	透射光成像、核荧光成像	Vision Transformer	显微镜图像	NA	NA	Vision Transformer	NA	NA
866	2025-11-08	The impact of neck tilt on the accuracy of deep learning generated contours for CT images of the head and neck 2025-Nov, Journal of applied clinical medical physics IF:2.0Q3 DOI:10.1002/acm2.70316 PMID:41183859	研究论文	本研究探讨颈部倾斜对头颈部CT图像深度学习自动分割轮廓准确性的影响	首次系统评估患者颈部倾斜对FDA批准的七种深度学习自动分割工具在头颈部放疗规划中性能的影响	样本量相对较小（35例），仅回顾性分析，未包含所有可能的解剖变异	评估异常颈部倾斜对头颈部CT扫描中深度学习自动分割轮廓准确性的影响	头颈部CT扫描图像中的危及器官（脑干、腮腺、颌下腺、臂丛神经、视神经）	医学影像分析	头颈部肿瘤	计算机断层扫描（CT）	深度学习自动分割模型	CT医学影像	35例头颈部CT扫描	NA	NA	DSC, sDSC, MDA, 平均剂量差异	NA
867	2025-11-08	Integrative Graph-Based Framework for Predicting circRNA Drug Resistance Using Disease Contextualization and Deep Learning 2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2024.3457271 PMID:39255076	研究论文	提出一种整合疾病背景的图神经网络模型circRDRP，用于预测环状RNA介导的癌症耐药性	首次将疾病特异性背景整合到circRNA-药物相互作用分析中，采用GAT和GCN混合的图神经网络架构	未明确说明模型在其他癌症类型或药物中的泛化能力	开发计算模型预测circRNA介导的癌症耐药性	环状RNA、抗癌药物（如顺铂和甲氨蝶呤）、疾病背景	生物信息学	癌症	图神经网络、深度学习	GAT, GCN, CNN	生物网络数据	NA	NA	Graph Attention Networks, Graph Convolutional Networks, 卷积神经网络	准确率, 精确率, 召回率	NA
868	2025-11-08	Denoising Motion-Corrupted Seismocardiogram Signals Using Score-Based Generative Diffusion Models 2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3576385 PMID:40478705	研究论文	提出基于分数生成扩散模型的运动伪影消除方法，用于提升地震心动图信号质量	首次将分数生成扩散模型应用于地震心动图信号去噪，利用干净SCG心跳的周期性学习概率空间作为先验	仅在健康参与者数据集上进行验证，未在患者群体中测试	开发有效的运动伪影消除算法，实现日常环境中高质量SCG信号采集	地震心动图信号	信号处理	心血管疾病	分数生成扩散模型	扩散模型	地震心动图信号	健康参与者运动数据集	NA	分数生成扩散模型	平均绝对误差	NA
869	2025-11-08	Decoding the spectrum of meat quality: advances in hyperspectral imaging for multi-attribute analysis 2025-Nov-01, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.146912 PMID:41197306	综述	本文综述了高光谱成像技术在新鲜肉类多属性质量分析中的最新进展与应用	系统探讨了人工智能、深度学习和数据融合等前沿数据分析方法在提升预测可靠性和实现实际应用中的作用	NA	评估高光谱成像技术在新鲜肉类质量多参数分析中的应用	新鲜牛肉、猪肉和禽肉	计算机视觉	NA	高光谱成像	深度学习	高光谱图像	NA	NA	NA	预测可靠性	NA
870	2025-11-08	ATR-FTIR spectroscopy coupled with deep learning for the identification and quantitative detection of Panax notoginseng adulteration 2025-Nov-01, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy DOI:10.1016/j.saa.2025.127118 PMID:41197414	研究论文	本研究开发了一种结合衰减全反射傅里叶变换红外光谱与深度学习的三七掺假快速检测方法	首次将ATR-FTIR光谱与深度学习方法结合用于三七主根粉掺假的定性和定量检测	未提及样本规模的具体限制和实际应用场景的验证	开发快速、低成本的三七药材掺假检测方法	三七主根粉及其掺假物（三七须根粉、莪术粉、米粉）	光谱分析	NA	ATR-FTIR光谱技术	CNN, Transformer	光谱数据	NA	NA	CNN, Transformer	准确率, R值	NA
871	2025-11-08	Assessing deep learning artificial intelligence support for detecting elbow fractures in the pediatric emergency department 2025-Nov-01, European journal of radiology IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.ejrad.2025.112498 PMID:41197552	研究论文	评估深度学习算法在儿科急诊中辅助检测肘关节骨折的性能	首次系统评估深度学习AI在儿科急诊肘关节骨折检测中的辅助价值，并比较有无AI辅助下临床医生的诊断表现	回顾性单中心研究，样本量相对有限，AI辅助仅为理论性评估	评估急诊医生在深度学习算法辅助下检测儿童肘关节骨折的诊断性能	0-15岁因创伤接受肘关节X线检查的儿科急诊患者	计算机视觉	骨科创伤	X线摄影	深度学习算法	医学影像	755名儿童患者，其中352名(47%)有肘关节骨折、关节积液和/或脱位	NA	NA	灵敏度, 特异度	NA
872	2025-11-08	Integration of radiomics, habitat imaging, and deep learning for MRI-based prediction of parametrial invasion in cervical cancer: A dual-center study 2025-Oct-30, Magnetic resonance imaging IF:2.1Q2 DOI:10.1016/j.mri.2025.110542 PMID:41173217	研究论文	本研究通过整合放射组学、生境成像和2.5D深度学习模型，开发了一种用于预测宫颈癌宫旁侵犯的多模态集成模型	首次将放射组学、生境成像和2.5D深度学习相结合构建多模态集成模型，并在双中心数据上验证其对宫颈癌宫旁侵犯的预测性能	回顾性研究设计，样本量相对有限（共290例患者）	评估基于MRI的放射组学、生境成像和深度学习模型在预测宫颈癌宫旁侵犯中的诊断性能	290例FIGO分期IB1-IIB期宫颈癌患者	医学影像分析	宫颈癌	MRI成像, k-means聚类, 特征选择	机器学习, 深度学习	MRI图像	290例患者（中心A：227例，中心B：63例）	NA	2.5D深度学习模型	AUC, 准确率	NA
873	2025-11-08	Artificial intelligence in hip and knee surgery: a bibliometric analysis of the 50 most cited articles 2025-Oct-30, Orthopaedics & traumatology, surgery & research : OTSR DOI:10.1016/j.otsr.2025.104543 PMID:41176060	文献计量分析	对人工智能在髋膝关节手术领域被引用次数最多的50篇文献进行文献计量分析	首次系统分析人工智能在髋膝关节手术领域的高影响力文献，揭示研究趋势和方法学模式	仅分析50篇高被引文献，可能无法代表整个研究领域；文献主要集中于膝关节和诊断应用，髋关节和治疗导向研究较少	识别人工智能在髋膝关节手术领域的研究现状、发展趋势和关键贡献者	Web of Science核心合集中人工智能在髋膝关节手术领域的50篇高被引研究论文	医学人工智能	骨科疾病	文献计量分析，描述性统计	深度学习	文献元数据，引文数据	50篇高被引文章，累计7140次引用	NA	NA	引用次数，期刊影响因子，Pearson相关系数	NA
874	2025-11-08	FA-UNet: A FasterNet and Attention-Gated Hybrid Network for Precise Ischemic Stroke Segmentation 2025-Oct-30, Journal of integrative neuroscience IF:2.5Q3 DOI:10.31083/JIN40100 PMID:41200985	研究论文	提出一种结合FasterNet和注意力门控的混合网络FA-UNet，用于精确分割缺血性脑卒中病灶	在瓶颈层引入计算高效的FasterNet模块捕获全局病灶上下文，并在跳跃连接中使用多尺度注意力门自适应优化特征并抑制噪声	未明确说明模型在计算效率方面的具体提升数据	开发兼顾高分割精度和临床实用计算效率的深度学习框架	缺血性脑卒中患者的扩散加权成像（DWI）数据	医学图像分割	缺血性脑卒中	扩散加权成像（DWI）	CNN	医学影像	公共数据集ISLES 2022（250名患者）和独立测试集（80名患者的600个DWI扫描）	NA	U-Net, FasterNet, Attention-Gated UNet	Dice系数, IoU, 敏感度, 精确度	NA
875	2025-11-08	LCMF-Net: A lightweight collaborative multimodal fusion network for brain tumor segmentation 2025-Oct-28, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2025.108257 PMID:41197263	研究论文	提出一种轻量级协作多模态融合网络用于脑肿瘤分割	通过跨模态跨切片注意力机制和基于状态空间模型的融合模块实现多模态MRI序列的协同优化	在2D计算约束下进行3D上下文建模，可能损失部分空间信息	开发高效准确的脑肿瘤自动分割方法	多模态MRI序列中的脑肿瘤区域	医学图像分析	脑肿瘤	多模态MRI（T1, T2, T1ce, FLAIR）	深度学习网络	医学图像	NA	NA	多分支编码器架构, 改进的残差初始块（RIB）	分割准确率	NA
876	2025-11-08	Self-supervised learning for breast cancer detection: A review 2025-Oct-24, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111245 PMID:41138363	综述	本文综述了自监督学习在乳腺癌检测中的应用现状与前景	系统分析自监督学习在乳腺癌检测全流程中的应用潜力，指出PET成像中自监督学习研究的明显缺失	未涉及PET成像等探索不足的模态，缺乏对临床部署实际障碍的深入讨论	探讨自监督学习如何降低乳腺癌检测对标注数据的依赖并提升性能	乳腺癌检测流程中的筛查、诊断、分级和分期	计算机视觉	乳腺癌	医学影像分析	自监督学习	医学影像	NA	NA	NA	NA	NA
877	2025-11-08	HeavyBuilder: Analysis of High-Throughput of Antibody Heavy Chain Repertoires in the Structural Space 2025-Oct-24, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2025.169509 PMID:41201484	研究论文	开发基于深度学习的抗体重链快速结构预测工具HeavyBuilder，用于高通量结构分析	首个专门针对抗体重链的高通量结构预测工具，速度远超AlphaFold2和IgFold，同时保持相当准确性	仅针对抗体重链进行预测，未包含轻链结构信息	开发高效抗体重链结构预测方法，实现大规模免疫组库结构分析	抗体重链序列及其三维结构	计算生物学	免疫相关疾病	深度学习, 结构预测	深度学习	蛋白质序列, 三维结构	73个免疫组库中的1100多万条序列	Python	ImmuneBuilder	预测速度, 准确性	单GPU
878	2025-11-08	GoFlow: efficient transition state geometry prediction with flow matching and E(3)-equivariant neural networks 2025-Oct-21, Digital discovery IF:6.2Q1 DOI:10.1039/d5dd00283d PMID:41189760	研究论文	提出一种基于流匹配和E(3)-等变神经网络的过渡态几何结构高效预测方法GoFlow	将过渡态生成建模为最优传输流问题，使用E(3)-等变流匹配和几何张量网络，相比扩散模型实现百倍以上推理加速	仅针对单步化学反应进行验证，未明确说明对多步反应的适用性	开发高效的过渡态几何结构预测方法以替代计算密集的量子化学方法	化学反应的过渡态几何结构	机器学习	NA	流匹配，几何张量网络	E(3)-等变神经网络	2D反应图	NA	NA	几何张量网络	几何精度，推理速度	NA
879	2025-11-08	Free-running isotropic three-dimensional cine magnetic resonance imaging with deep learning image reconstruction 2025-Oct, Pediatric radiology IF:2.1Q2 DOI:10.1007/s00247-025-06266-7 PMID:40442341	研究论文	评估结合深度学习重建和Heart-NAV技术的自由运行三维电影磁共振成像在先天性心脏病患者中的效果	提出自由运行三维电影成像结合深度学习重建技术，可同时获取电影和血管造影图像，显著缩短采集时间	样本量较小（16名患者），仅针对先天性心脏病患者进行研究	评估深度学习重建的三维电影磁共振成像在心脏功能评估中的效率和准确性	先天性心脏病患者	医学影像	心血管疾病	磁共振成像，深度学习图像重建，Heart-NAV技术	深度学习	三维磁共振图像	16名先天性心脏病患者（7名男性，中位年龄6岁）	NA	NA	对比度噪声比，心室容积，射血分数，横截面积，Bland-Altman分析	NA
880	2025-11-08	Clinical Implementation of Inspiratory-Expiratory Chest CT: Defining Quality Criteria for Diagnostic Quality and Detection of Concurrent FEV1 Decline following Lung Transplantation 2025-Oct, Radiology. Cardiothoracic imaging DOI:10.1148/ryct.240468 PMID:40932379	研究论文	本研究通过定义呼气相CT的质量标准，评估定量空气潴留对慢性肺移植物功能障碍的诊断和预测价值	首次将气管形态作为呼气相CT诊断质量的评价标准，并建立了空气潴留与肺功能下降的定量关系	研究为单中心回顾性研究，样本量有限，空气潴留检测的敏感性较低	建立呼气相CT的质量评价标准并验证其在慢性肺移植物功能障碍监测中的应用价值	肺移植术后患者	数字病理	肺移植相关并发症	CT扫描，肺功能检测	深度学习算法	CT图像，肺功能数据	192例肺移植患者的603次吸呼气相胸部CT扫描	NA	NA	特异性，敏感性，Pearson相关系数，ROC曲线分析	NA