深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
8781	2026-01-02	AI-assisted sentinel lymph node examination and metastatic detection in breast cancer: the potential of ChatGPT for digital pathology research 2025-Dec, Pathologica IF:4.4Q1 DOI:10.32074/1591-951X-N1068 PMID:41454765	研究论文	本研究评估了ChatGPT-4在乳腺癌前哨淋巴结冰冻切片中检测转移的潜力	首次将ChatGPT-4应用于乳腺癌前哨淋巴结冰冻切片的转移检测，探索其在数字病理研究中的实际应用	样本量较小（仅90个前哨淋巴结），且为回顾性研究，可能影响结果的普遍性	评估AI模型在乳腺癌前哨淋巴结转移检测中的诊断性能，以提升病理工作流程的准确性和效率	乳腺癌患者的前哨淋巴结冰冻切片	数字病理	乳腺癌	冰冻切片，数字病理	深度学习模型	图像	90个前哨淋巴结	NA	ChatGPT-4	准确率，灵敏度，特异性	NA
8782	2026-01-02	Accurate Generation of Conformational Ensembles for Intrinsically Disordered Proteins with IDPFold 2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202511636 PMID:41082321	研究论文	本文介绍了一种名为IDPFold的新方法，该方法利用微调的扩散模型直接从序列生成内在无序蛋白的构象集合	IDPFold消除了对多序列比对或实验数据的依赖，能够更详细地表征IDP集合的结构特征	NA	研究内在无序蛋白的构象特性	内在无序蛋白	机器学习	癌症, 糖尿病, 阿尔茨海默病	扩散模型	扩散模型	蛋白质序列	27个IDP系统	NA	IDPFold	回转半径误差, Cα二级化学位移的均方根偏差	NA
8783	2026-01-02	RiboMicrobe: An Integrated Translatome Atlas for Microorganism 2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202509877 PMID:41082396	研究论文	本文介绍了RiboMicrobe，一个专为原核微生物Ribo-seq数据设计的综合数据库，并集成了基于Transformer的深度学习模型用于sORF预测	开发了首个专门针对原核微生物翻译组的综合数据库，并引入了两种基于Transformer架构的新型sORF预测模型	数据库目前仅涵盖36种原核生物和2种病毒，数据覆盖范围有限	构建一个集成数据库和工具平台，以支持微生物翻译组学研究和sORF注释	原核微生物和病毒的翻译组数据	生物信息学	NA	Ribo-seq, RNA-seq, 蛋白质组学	Transformer	测序数据	891个Ribo-seq数据集、369个匹配的RNA-seq数据集和62个蛋白质组数据集	NA	Transformer	NA	NA
8784	2026-01-02	Cytological Classification Diagnosis for Thyroid Nodules via Multimodal Model Deep Learning 2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202511369 PMID:41098080	研究论文	本文开发了AI-TFNA平台，通过多模态深度学习模型提高甲状腺结节细胞学分类诊断的准确性和临床效率	提出了结合BRAF突变数据和图像外观迁移（IAM）技术的多模态模型，显著提升了模型在不同机构间的泛化能力	研究主要基于中国七个医疗中心的数据，可能在其他地区或人群中的适用性有待进一步验证	开发一个稳健的人工智能平台，以提高甲状腺结节诊断的准确性和临床效率	甲状腺结节样本，特别是甲状腺细针穿刺（TFNA）样本	数字病理学	甲状腺结节	甲状腺细针穿刺（TFNA）、BRAF突变检测	深度学习模型	图像、突变数据	总样本20,803个，其中4,421个TFNA样本用于训练，2,153个样本用于外部验证	NA	多模态模型	准确率、灵敏度、特异性	NA
8785	2026-01-02	Molecular Motif Learning as a pretraining objective for molecular property prediction 2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-66685-w PMID:41309631	研究论文	本文提出了一种名为分子基序学习的无监督预训练方法，用于学习分子表示，以提升分子性质预测的准确性	MotiL方法直接从原生分子图中学习，同时保留整体分子结构和基序水平信息，能够捕捉小分子和蛋白质的相似结构与功能	NA	提高分子性质预测的准确性，以支持药物发现	小分子和蛋白质	机器学习	NA	分子图学习	NA	分子图	至少16个分子基准数据集	NA	NA	准确性	NA
8786	2026-01-02	Cognitive embodied learning for anomaly active target tracking 2025-Nov-27, Communications engineering DOI:10.1038/s44172-025-00556-6 PMID:41310085	研究论文	本文提出了一种受人类大脑双决策系统启发的认知具身学习方法，用于解决复杂物理场景中的异常主动目标跟踪问题	提出了一种新颖的认知具身学习方法，该方法能动态切换正常跟踪与异常处理模式，并引入了分类目标函数来解决严重异常导致的函数不可测性和数据混淆问题	未在摘要中明确说明	解决复杂物理场景中主动目标跟踪的鲁棒性和准确性问题	无人机异常主动目标跟踪	机器视觉	NA	具身智能、强化学习、深度学习	NA	模拟场景数据、真实世界场景数据	NA	NA	NA	成功率、任务完成效率	NA
8787	2026-01-02	A clinically validated AI framework for kidney cancer detection and characterization 2025-Nov-27, Communications medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1038/s43856-025-01264-0 PMID:41310187	研究论文	本文介绍了一种名为BMVision的深度学习工具，用于检测和表征肾癌，并通过临床验证评估其性能	BMVision是首个经过临床验证的商业化AI工具，用于肾癌检测和表征，能显著提高放射科医生的工作效率和诊断一致性	研究为回顾性设计，可能未完全反映实际临床环境中的表现	开发并验证一个AI工具，以辅助放射科医生提高肾癌诊断的准确性和效率	肾细胞癌的对比增强计算机断层扫描图像	计算机视觉	肾癌	对比增强计算机断层扫描	深度学习	图像	200份扫描图像	NA	NA	诊断敏感性、病变测量、报告效率、放射科医生间一致性	NA
8788	2026-01-02	A deep learning-based multiscale integration of spatial omics with tumor morphology 2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-66691-y PMID:41310346	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的多尺度集成方法MISO，用于从H&E染色组织切片预测空间转录组学数据	开发了MISO方法，首次实现从常规H&E切片预测高分辨率空间基因表达，达到近单细胞水平	方法依赖于现有数据集，未来需在更多癌症类型和更大样本中验证	整合空间转录组学与肿瘤形态学，实现从H&E切片预测基因表达	肿瘤组织样本，包括72个10X Genomics Visium样本和348个MOSAIC联盟样本	数字病理学	肿瘤	空间转录组学，H&E染色	深度学习模型	图像，基因表达数据	420个样本（72个验证样本+348个测试样本）	NA	NA	NA	NA
8789	2026-01-02	Expediting hit-to-lead progression in drug discovery through reaction prediction and multi-dimensional optimization 2025-Nov-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-66324-4 PMID:41290653	研究论文	本研究展示了一种集成药物化学工作流程，通过反应预测和多维优化加速药物发现中的命中到先导优化阶段	结合微型化高通量实验与深度学习及分子性质优化，显著缩短命中到先导的周期时间	NA	加速药物发现中的命中到先导优化阶段	单酰基甘油脂肪酶（MAGL）抑制剂候选分子	机器学习	NA	高通量实验（HTE），Minisci型C-H烷基化反应	图神经网络	化学反应数据	13,490个新颖的Minisci型C-H烷基化反应	NA	深度图神经网络	NA	NA
8790	2026-01-02	Deep learning model outperforms traditional models in clinical data-based prognostic prediction for adult-type diffuse glioma 2025-Nov-26, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-04123-5 PMID:41296239	研究论文	本研究系统比较了传统统计方法与机器学习方法在成人型弥漫性胶质瘤生存预测中的表现，发现深度学习模型DeepSurv在性能与稳定性上优于传统模型	首次在成人型弥漫性胶质瘤预后预测中系统比较了传统统计模型与深度学习模型，并公开了模型包	基于回顾性真实世界数据，存在异质性和部分数据缺失	比较不同方法在成人型弥漫性胶质瘤生存预测中的性能、可解释性和临床适用性	成人型弥漫性胶质瘤患者	机器学习	胶质瘤	NA	Cox Proportional Hazards, Random Survival Forest, Neural Multi Task Logistic Regression, DeepSurv	临床数据	两个公共数据集和一个私人回顾性队列	NA	DeepSurv	生存预测性能、稳定性	NA
8791	2026-01-02	Deep learning-extracted high-resolution dataset of rural courtyards and rooftops in northern China 2025-Nov-25, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-06260-6 PMID:41290723	研究论文	本研究利用深度学习技术从亚米级遥感影像中提取了中国北方农村地区庭院和屋顶的高分辨率空间数据集	首次通过深度学习自动化方法生成了农村宅基地庭院边界和屋顶足迹的精细尺度数据集，填补了微观尺度农村数据的空白	未明确说明模型在更广泛地理区域或不同季节条件下的泛化能力	分析农村聚落结构以支持可持续农村发展、资源管理和环境规划	中国北方代表性地区的农村家庭庭院和建筑屋顶	计算机视觉	NA	亚米级遥感影像	CNN	图像	NA	NA	NA	准确性	NA
8792	2026-01-02	Interpretable multimodal MRI radiomics for predicting neoadjuvant chemotherapy response in nasopharyngeal carcinoma 2025-Nov-25, BMC medical imaging IF:2.9Q2 DOI:10.1186/s12880-025-02071-8 PMID:41291491	研究论文	本研究探讨了多模态MRI影像组学模型在预测鼻咽癌新辅助化疗反应中的价值，并比较了机器学习和深度学习模型的性能差异	结合DCE-MRI特征的多模态MRI影像组学深度学习模型，通过SHAP分析增强模型可解释性，在预测鼻咽癌新辅助化疗反应中表现出优越性能	回顾性研究设计，样本量有限（370例患者），且仅部分患者（126例）进行了DCE-MRI检查	预测鼻咽癌患者对新辅助化疗的反应	鼻咽癌患者	数字病理学	鼻咽癌	多模态MRI（包括T1WI、PDWI、CE-T1WI和DCE-MRI）	机器学习模型（逻辑回归、支持向量机、随机森林、极端梯度提升）和深度学习模型（多层感知机）	MRI图像	370例鼻咽癌患者，其中126例进行了DCE-MRI检查	Scikit-learn, TensorFlow或PyTorch（具体未明确说明）	多层感知机	AUC, 敏感性, 特异性	NA
8793	2026-01-02	OMetaNet: an efficient hybrid deep learning model based on multimodal data fusion and contrastive learning for predicting 2'-O-methylation sites in human RNA 2025-Nov-24, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-025-06324-9 PMID:41286599	研究论文	本文提出了一种基于多模态数据融合和对比学习的混合深度学习模型OMetaNet，用于预测人类RNA中的2'-O-甲基化位点	构建了低冗余数据集，创新性地提出了KN-PairMatrix编码方案，并开发了集成残差和降采样优化CNN模块、Mamba网络及专有跨模态交互融合模块的深度学习框架，采用对比学习驱动的自适应混合损失函数和渐进特征解缠策略	未在摘要中明确提及	准确识别RNA 2'-O-甲基化位点，以深入理解RNA调控机制	人类RNA中的2'-O-甲基化位点	机器学习	NA	KN-PairMatrix编码方案	CNN, Mamba网络	多模态数据	NA	NA	残差和降采样优化CNN模块, Mamba网络, 跨模态交互融合模块	NA	NA
8794	2025-11-26	Mood states recognition based on Mandarin speech and deep learning in patients with bipolar disorder 2025-Nov-24, BMC psychiatry IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12888-025-07630-5 PMID:41286671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
8795	2026-01-02	Detection of intracranial hemorrhage using ultralow-dose brain computed tomography with deep learning reconstruction versus conventional-dose computed tomography 2025-Nov-24, BMC medical imaging IF:2.9Q2 DOI:10.1186/s12880-025-02082-5 PMID:41286703	研究论文	本研究评估了使用深度学习重建的超低剂量脑CT在检测颅内出血方面的诊断性能、图像质量和辐射剂量，并与迭代重建的超低剂量CT及常规剂量CT进行比较	首次将深度学习重建技术应用于超低剂量脑CT，在显著降低辐射剂量的同时，保持了与常规剂量CT相当的图像质量和诊断性能	研究为回顾性设计，样本量相对较小（93例患者），且仅针对颅内出血检测，未涵盖其他脑部病变	评估超低剂量CT结合深度学习重建在颅内出血检测中的有效性，以降低患者辐射暴露	93例患者（中位年龄67岁，61例男性）的脑CT图像	计算机视觉	颅内出血	CT扫描	深度学习重建	医学图像	93例患者	NA	NA	灵敏度, 特异性	NA
8796	2026-01-02	Deep vision in agriculture: assessing the function of YOLO in the classification of plant leaf diseases (PLDs) 2025-Nov-24, BioData mining IF:4.0Q1 DOI:10.1186/s13040-025-00497-y PMID:41286934	综述	本文对基于YOLO模型的植物叶片病害分类方法进行了全面综述，包括从YOLOv1到YOLOv10的版本演进、领域特定变体，并提供了数据集目录、性能基准分析以及未来研究方向	提供了结构化的数据集目录，包含大小、分辨率、病害类别及局限性信息；进行了YOLO各版本在性能指标上的比较基准分析；讨论了开放挑战和未来研究方向，如轻量化模型	NA	评估YOLO模型在植物叶片病害分类中的应用，促进可持续农业发展	植物叶片病害	计算机视觉	植物病害	深度学习	YOLO	图像	NA	NA	YOLOv1, YOLOv2, YOLOv3, YOLOv4, YOLOv5, YOLOv6, YOLOv7, YOLOv8, YOLOv9, YOLOv10, CTB-YOLO, BED-YOLO, RAG-augmented YOLOv8	准确率, 精确率, 召回率, F1分数, 平均精度均值, 每秒帧数	NA
8797	2026-01-02	Artificial intelligence-driven prediction of lymph node metastasis in T1 esophageal squamous cell carcinoma using whole slide images 2025-Nov-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-01186-z PMID:41274958	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的人工智能模型，利用全切片图像预测T1期食管鳞状细胞癌的淋巴结转移，以减少过度治疗	首次使用全切片图像和深度学习模型来预测T1期食管鳞状细胞癌的淋巴结转移，并在内外部验证中展示了高准确性和高阴性预测值	研究样本主要来自未接受内镜黏膜下剥离术的患者，且外部验证队列仅包含临床高风险病例，可能限制了模型的泛化能力	预测T1期食管鳞状细胞癌的淋巴结转移，以指导内镜黏膜下剥离术后的治疗决策	T1期食管鳞状细胞癌患者	数字病理学	食管癌	全切片图像分析	深度学习模型	图像	160例手术切除病例（72例LNM+，88例LNM-），来自374名患者，外加一个外部内镜黏膜下剥离术队列	NA	NA	AUC, 准确率, 灵敏度, 特异性, F1分数, 阴性预测值	NA
8798	2026-01-02	A dataset of building surface defects collected by UAVs for machine learning-based detection 2025-Nov-22, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-06318-5 PMID:41274920	研究论文	本研究构建了一个基于无人机采集的建筑表面缺陷数据集，用于支持基于机器学习的缺陷检测研究	构建了首个大规模、高质量、多场景的无人机建筑表面缺陷数据集，涵盖多种结构类型和缺陷类别，并提供了标准化标注和数据集划分	未提及模型性能的具体评估结果，也未讨论数据集在特定光照或环境条件下的潜在偏差	解决建筑表面缺陷检测中高质量标注数据集缺乏的问题，推动深度学习在实际工程中的应用	建筑表面缺陷图像	计算机视觉	NA	无人机图像采集	NA	图像	14,471张高分辨率图像，涵盖6种结构类型和5种缺陷类别	NA	NA	NA	NA
8799	2026-01-02	Development and validation of an artificial intelligence-based model for cardiovascular disease prediction using longitudinal data 2025-Nov-22, BMC medical informatics and decision making IF:3.3Q2 DOI:10.1186/s12911-025-03280-5 PMID:41275275	研究论文	本研究开发并验证了一种基于人工智能的模型，利用纵向数据预测心血管疾病	使用基于LSTM和GRU的深度学习模型分析纵向数据中的风险因素动态变化，以预测10年心血管疾病发病率，并在有限特征集下达到与使用更多变量研究相当的性能	模型仅限于21个常用临床变量，可能未涵盖所有相关风险因素	评估深度学习和混合效应逻辑模型在预测10年心血管疾病发病率方面的有效性	伊朗30岁及以上无心血管疾病史的成年人	机器学习	心血管疾病	临床历史检查	LSTM, GRU	纵向数据	4872名成年人（最终分析样本包括1942名男性和2930名女性）	NA	Long Short-Term Memory, Gated Recurrent Unit	AUC	NA
8800	2026-01-02	A global bibliometric and visualization study of the adaptive radiotherapy research landscape 2025-Nov-20, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-04066-x PMID:41264148	研究论文	本文通过文献计量学分析，揭示了自适应放疗（ART）的研究格局、趋势及合作网络	首次对自适应放疗领域进行全面的文献计量与可视化分析，识别了从器官运动/剂量递增到深度学习及MR引导放疗的研究趋势演变	分析基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献；且为回顾性分析，无法预测未来具体技术发展	揭示自适应放疗的流行研究模式、新兴趋势及合作网络，以指导未来临床研究方向	自适应放疗相关的科学出版物	医学信息学/放射肿瘤学	癌症	文献计量分析、网络可视化	NA	文本（科学出版物元数据）	3,941篇出版物（1999-2024年）	CiteSpace, Excel	NA	NA	NA