深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
9061	2025-10-06	NLP-like deep learning aided in identification and validation of thiosulfinate tolerance clusters in diverse bacteria 2025-Jun-17, mSphere IF:3.7Q2 DOI:10.1128/msphere.00023-25 PMID:40525872	研究论文	本研究应用类似自然语言处理的深度学习技术识别和验证了多种细菌中的硫代亚磺酸盐耐受基因簇	首次将NLP-like技术应用于细菌基因簇识别，解决了传统方法因序列多样性而难以识别的问题	研究主要聚焦于植物病原菌，在其他细菌类型中的应用仍需验证	开发新方法识别细菌中难以发现的硫代亚磺酸盐耐受基因簇	多种植物病原菌及其基因簇	自然语言处理, 生物信息学	植物细菌性疾病	自然语言处理技术, 基因序列分析, 蛋白质结构预测	深度学习	基因序列数据, 蛋白质序列数据	RefSeq细菌数据库中的多个菌株，包括97-1R、pv. FDAARGOS 389和pv. tomato DC3000	DeepBGC	NA	实验验证	NA
9062	2025-10-06	Effects of patient and imaging factors on small bowel motility scores derived from deep learning-based segmentation of cine MRI 2025-Jun-17, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-025-11737-4 PMID:40526355	研究论文	本研究评估患者和影像因素对基于深度学习分割的MRI电影小肠运动评分的影响	首次系统评估MRI切片相关因素对小肠运动评分的显著影响，并开发深度学习算法进行小肠分割	样本量相对较小（54例患者），仅包含慢性便秘或疑似结肠假性梗阻患者	探究患者因素和影像因素对小肠运动评分的影响	54名慢性便秘或疑似结肠假性梗阻患者的小肠MRI影像	医学影像分析	消化系统疾病	电影MRI, 光学流算法	深度学习分割算法	MRI影像	54名患者（平均年龄53.6±16.4岁，34名女性）	NA	NA	Dice相似系数	NA
9063	2025-10-06	Innovative deep learning and signal decomposition approaches for enhanced spatial and temporal suspended sediment concentration prediction 2025-Jun-17, Environmental science and pollution research international DOI:10.1007/s11356-025-36581-3 PMID:40526349	研究论文	本研究提出新型混合深度学习方法来提高悬浮泥沙浓度的时空预测精度	结合多种深度学习模型与信号分解技术，首次将CEEMDAN和SVMD与DDNN结合用于SSC预测	研究仅限于美国科罗拉多河下游的四个连续监测站数据	开发精确可靠的悬浮泥沙浓度预测方法以改善河流管理	美国科罗拉多河下游的悬浮泥沙浓度	机器学习	NA	小波变换相干性分析，信号分解技术	LSTM, BiLSTM, GRU, DDNN	时间序列数据	2008年至2022年美国科罗拉多河下游四个连续监测站的数据集	NA	密集深度神经网络	均方误差，均方根误差，纳什-萨克利夫效率，相关系数R	NA
9064	2025-10-06	Risk factors and prognostic indicators for progressive fibrosing interstitial lung disease: a deep learning-based CT quantification approach 2025-Jun-17, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-025-11714-x PMID:40526353	研究论文	本研究采用基于深度学习的CT定量方法预测进行性纤维化性间质性肺疾病及其预后	首次将基于深度学习的CT定量分析应用于PF-ILD的预测和预后评估，证明了QCT指标对疾病进展和死亡风险的预测价值	单中心回顾性研究，样本量有限（465例患者），可能存在选择偏倚	评估基于深度学习的定量CT在预测进行性纤维化性间质性肺疾病和评估预后方面的价值	间质性肺疾病患者	医学影像分析	间质性肺疾病	CT扫描，深度学习定量分析	深度学习模型	CT影像	465名ILD患者（中位年龄65岁，238名男性）	NA	NA	C-index, OR值, HR值	NA
9065	2025-10-06	Replacing Attention with Modality-wise Convolution for Energy-Efficient PPG-based Heart Rate Estimation using Knowledge Distillation 2025-Jun-17, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3580474 PMID:40526537	研究论文	提出一种基于光电容积脉搏波的心率估计轻量级深度学习架构PULSE，通过知识蒸馏技术实现高效传感器融合	使用多头部交叉注意力层改进传感器融合，并提出基于关系的知识蒸馏机制，用模态卷积替代注意力模块	NA	开发适用于可穿戴设备的节能高效心率估计算法	光电容积脉搏波信号和加速度计数据	机器学习	心血管疾病	光电容积脉搏波	深度学习	时序信号	两个数据集：PPG-DaLiA（最大可用数据集）和WESAD	NA	多头部交叉注意力，模态卷积	平均绝对误差，内存占用，能耗	商用现成微控制器
9066	2025-10-06	ABNN: Adaptive-Gating Binary Neural Network With Dynamic Activation Quantization for Industrial Health Status Prediction 2025-Jun-17, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2025.3577620 PMID:40526547	研究论文	提出一种用于工业健康状态预测的自适应门控二值神经网络，通过动态激活量化优化边缘设备部署	提出趋势感知编码器优化输入层二值化过程、可学习精度指示器动态调整推理精度、自适应门控卷积在保持拟合能力的同时提升表示能力	未明确说明模型在极端工业环境下的鲁棒性测试结果	解决工业边缘场景资源受限和实时性要求下的设备健康状态预测问题	工业边缘场景中的复杂工业设备	机器学习	NA	二值神经网络、FPGA硬件加速	二值神经网络	工业设备状态数据	NA	NA	自适应门控二值神经网络	准确率、效率	FPGA硬件加速器
9067	2025-10-06	Beyond the Posts: Analyzing Breast Implant Illness Discourse With Natural Language Processing and Deep Learning 2025-Jun-16, Aesthetic surgery journal IF:3.0Q1 DOI:10.1093/asj/sjaf047 PMID:40173420	研究论文	使用自然语言处理和深度学习分析社交媒体上关于乳房植入物疾病的患者认知和情感反应	首次使用基于1.24亿条X平台推文训练的Robust optimizing BERT模型分析乳房植入物疾病相关讨论，并发现社交媒体讨论与植入物取出率之间的强相关性	研究仅基于社交媒体数据，无法证明因果关系，且数据来源局限于单一平台	分析社交媒体上患者对乳房植入物疾病的认知和情感反应，及其与临床决策的关系	社交媒体上关于乳房植入物疾病的讨论帖子	自然语言处理	乳房植入物疾病	自然语言处理	BERT, 深度学习模型	文本	6099条帖子（2014-2023年）	NA	Robust optimizing Bidirectional Encoder Representations from Transformers	皮尔逊相关系数	NA
9068	2025-10-06	Rate of brain aging associates with future executive function in Asian children and older adults 2025-Jun-16, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.97036 PMID:40522287	研究论文	本研究探讨脑年龄变化率与未来执行功能的关联，并在新加坡老年人和儿童群体中验证脑年龄模型的泛化能力	首次在亚洲儿童和老年人群体中验证脑年龄模型的泛化性，并发现脑年龄差距变化率与未来执行功能存在关联	样本仅来自新加坡人群，模型在儿童群体上需要微调才能适用	研究脑年龄变化率与认知功能的关联，并验证脑年龄模型在不同人群中的泛化能力	新加坡老年人（55-88岁）和儿童（4-11岁）	医学影像分析	NA	脑年龄预测	深度学习	神经解剖学影像数据	新加坡老年人和儿童群体	NA	NA	模型泛化能力，脑年龄预测准确性	NA
9069	2025-10-06	DWI-based deep learning radiomics nomogram for predicting the impaired quality of life in patients with unruptured intracranial aneurysm developing new iatrogenic cerebral infarcts following stent placement: a multicenter cohort study 2025-Jun-13, Neurosurgical review IF:2.5Q1 DOI:10.1007/s10143-025-03628-5 PMID:40512286	研究论文	开发基于DWI的深度学习影像组学列线图预测支架置入术后发生新发医源性脑梗死患者的生活质量受损	首次整合临床特征、影像组学特征和深度学习特征构建多模态预测模型，并采用超分辨率重建技术优化特征提取	研究为多中心回顾性研究，需要前瞻性验证	预测未破裂颅内动脉瘤支架置入术后发生新发医源性脑梗死患者的生活质量受损	522例未破裂颅内动脉瘤支架置入术后发生新发医源性脑梗死的患者	医学影像分析	颅内动脉瘤，脑梗死	DWI，超分辨率重建	深度学习，逻辑回归	医学影像（DWI）	522例患者（训练队列和两个外部验证队列）	NA	GoogleNet	AUC，校准曲线，决策曲线分析	NA
9070	2025-10-06	Discovery of CYP1A1 Inhibitors for Host-Directed Therapy against Sepsis 2025-Jun-12, Journal of medicinal chemistry IF:6.8Q1 DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00493 PMID:40442943	研究论文	本研究通过深度学习、虚拟筛选和生物评估发现新型CYP1A1小分子抑制剂，用于治疗多重耐药细菌引起的脓毒症	首次将CYP1A1确定为宿主导向治疗靶点，并通过深度学习发现具有卓越活性的新型小分子抑制剂	未明确说明临床前研究阶段及动物模型验证数据	开发针对多重耐药细菌脓毒症的宿主导向治疗方法	细胞色素P4501A1（CYP1A1）酶及其小分子抑制剂	药物发现	脓毒症	深度学习, 虚拟筛选, 生物评估	深度学习模型	化学结构数据, 生物活性数据	NA	NA	NA	细菌载量减少率（70%以上）, 巨噬细胞吞噬功能增强	NA
9071	2025-10-06	Amortized template matching of molecular conformations from cryoelectron microscopy images using simulation-based inference 2025-Jun-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2420158122 PMID:40465628	研究论文	提出基于模拟推理的冷冻电镜图像分析方法cryoSBI，用于从单个冷冻电镜图像推断生物分子构象	将基于物理的模拟与概率深度学习相结合，无需计算显式似然函数即可进行贝叶斯推断，显著提升计算速度	方法在合成数据和实验数据上进行了验证，但需要进一步在更广泛的实验场景中测试	开发从冷冻电镜图像中准确推断生物分子构象的计算方法	生物分子构象和构象集合	计算生物学	NA	冷冻电镜(cryo-EM)	神经网络	冷冻电镜图像	NA	NA	NA	NA	NA
9072	2025-10-06	[A preliminary exploration of an intelligent system for personalized tooth morphology reconstruction based on deep learning] 2025-Jun-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology DOI:10.3760/cma.j.cn112144-20250331-00110 PMID:40443316	研究论文	本研究构建了一种基于深度学习的牙齿可变形深度隐式网络，用于个性化牙齿形态重建	将隐式模板与深度学习技术相结合，构建了新型的T-DDIN神经网络，实现了个性化的高精度牙齿缺损形态修复	样本量相对有限（550个口内扫描模型），且仅针对特定类型的牙齿缺损进行评估	开发智能系统实现个性化牙齿形态重建	牙齿缺损患者的口内扫描模型	计算机视觉	牙齿缺损	口内扫描	深度学习神经网络	三维扫描模型	550个口内扫描模型（500个训练，50个测试）	NA	牙齿可变形深度隐式网络	三维偏差,咬合调整体积,牙尖角度偏差,修复时间	NA
9073	2025-10-06	Automated interpretation of cardiotocography using deep learning in a nationwide multicenter study 2025-Jun-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-02849-4 PMID:40467683	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的自动化胎心监护解读模型，并在全国多中心数据集上进行了验证	使用全国14家医院的大规模胎心监护数据集，由认证产科医生提供可靠标注，解决了以往研究数据规模小和临床相关性不足的问题	需要在前瞻性研究中进一步评估模型的临床适用性	开发临床适用的自动化胎心监护解读模型以改善胎儿预后	胎心监护信号	医疗人工智能	产科疾病	胎心监护技术	深度学习	生理信号数据	22,522例分娩数据，来自14家医院，共519,800人分钟的分析数据	NA	NA	AUC, PRC	NA
9074	2025-10-06	Development of Deep Learning Models to Screen Posterior Staphylomas in Highly Myopic Eyes Using UWF-OCT Images 2025-Jun-02, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.14.6.25 PMID:40504567	研究论文	开发基于深度学习模型利用超广角光学相干断层扫描图像筛查高度近视眼后巩膜葡萄肿	首次使用UWF-OCT图像开发深度学习模型用于后巩膜葡萄肿筛查，并比较了七种不同网络架构的性能	回顾性单中心研究，样本量相对有限	开发用于高度近视眼后巩膜葡萄肿筛查的深度学习模型	高度近视患者	计算机视觉	眼科疾病	超广角光学相干断层扫描	CNN	图像	训练集1428张图像来自438名患者，测试集216张图像来自69名患者	NA	VGG16,VGG19,ResNet18,ResNet50,ResNet101,DenseNet121,DenseNet161	AUC,敏感度	NA
9075	2025-06-19	High-precision inversion of vegetation parameters in the AI era: Integrating hyperspectral remote sensing and deep learning 2025-Jun-02, Innovation (Cambridge (Mass.)) DOI:10.1016/j.xinn.2025.100868 PMID:40528880	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
9076	2025-10-06	Employing transfer learning for breast cancer detection using deep learning models 2025-Jun, PLOS digital health DOI:10.1371/journal.pdig.0000907 PMID:40523018	研究论文	本研究利用迁移学习和四种预训练深度学习模型进行乳腺癌检测	结合四种预训练模型作为特征提取器，并采用多种监督学习分类器进行乳腺癌检测	仅使用BUSI数据集进行验证，未在其他数据集上测试模型泛化能力	提高乳腺癌检测的准确性和效率	乳腺癌医学图像	计算机视觉	乳腺癌	深度学习	CNN	医学图像	BUSI数据集	TensorFlow, Keras	Mobilenetv2, Inceptionv3, ResNet50, VGG16	准确率	NA
9077	2025-10-06	A Novel Artificial Intelligence Approach to Kennedy Classification for Partially Edentulous Patients Using Panoramic Radiographs 2025-May-28, The European journal of prosthodontics and restorative dentistry DOI:10.1922/EJPRD_2801Hassan09 PMID:40105321	研究论文	开发基于人工智能的系统，利用全景X光片自动对部分缺牙患者进行Kennedy分类	首次将YOLOv8深度学习模型应用于全景X光片的牙齿检测和Kennedy分类系统	仅使用公开数据集，样本来源可能有限；未提及模型在不同人群中的泛化能力	开发自动化部分缺牙分类系统，减少诊断变异并减轻牙科专业人员工作负担	部分缺牙患者的口腔全景X光片	计算机视觉	牙科疾病	全景X光成像	CNN	图像	1875张高质量全景X光片（来自5261张原始图像），通过数据增强扩展至2398张	YOLOv8	YOLOv8s	精度, 召回率, F1分数, 平均精度均值(mAP50)	NA
9078	2025-10-06	Detection of Pulmonary Nodules on Ultra-low Dose Chest Computed Tomography With Deep-learning Image Reconstruction Algorithm 2025-May-01, Journal of thoracic imaging IF:2.0Q3 DOI:10.1097/RTI.0000000000000806 PMID:39267547	研究论文	评估使用深度学习图像重建算法在超低剂量胸部CT中检测肺结节的准确性	首次在辐射剂量相当于两次胸部X线的超低剂量CT中使用深度学习图像重建算法进行肺结节检测	样本量较小（60例患者），仅评估了实性肺结节	评估超低剂量胸部CT结合深度学习重建算法检测肺结节的性能	60例转诊评估或随访实性肺结节的患者	计算机视觉	肺癌	计算机断层扫描（CT）	深度学习	医学影像	60例患者，733个结节	NA	深度学习图像重建（DLIR）	灵敏度，ICC（组内相关系数）	NA
9079	2025-10-06	Predicting Gene Comutation of EGFR and TP53 by Radiomics and Deep Learning in Patients With Lung Adenocarcinomas 2025-May-01, Journal of thoracic imaging IF:2.0Q3 DOI:10.1097/RTI.0000000000000817 PMID:39319553	研究论文	本研究基于影像组学和深度学习构建渐进式二分类模型，预测肺腺癌患者EGFR和TP53基因共突变状态	首次结合影像组学和深度学习方法构建渐进式二分类模型预测肺腺癌基因共突变，为TKI靶向治疗响应和预后评估提供新参考	回顾性单中心研究，样本量有限（267例患者），需外部验证确认模型泛化能力	构建预测模型识别适合TKI靶向治疗和预后不良的肺腺癌患者	267例接受基因检测和非增强胸部CT的肺腺癌患者	数字病理	肺癌	非增强胸部CT，基因检测	深度学习模型	医学影像，临床数据	267例肺腺癌患者	NA	NA	AUC，敏感性，特异性，准确率，精确率，F1分数	NA
9080	2025-10-06	Non-invasive biopsy diagnosis of diabetic kidney disease via deep learning applied to retinal images: a population-based study 2025-05, The Lancet. Digital health DOI:10.1016/j.landig.2025.02.008 PMID:40312169	研究论文	开发基于视网膜图像的深度学习系统DeepDKD用于无创诊断糖尿病肾病	首次利用视网膜图像通过深度学习实现糖尿病肾病的无创活检诊断和分型	外部验证数据集的AUC存在一定波动(0.733-0.844)	开发AI系统用于糖尿病肾病的筛查和分型诊断	糖尿病患者视网膜图像	数字病理	糖尿病肾病	视网膜成像	深度学习	图像	开发阶段734,084张视网膜图像，验证阶段涉及多个国家121,578名参与者	NA	DeepDKD	AUC, 敏感性	NA