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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9881 | 2025-05-31 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2025-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.07.642107
PMID:40161587
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研究论文 | 该研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序分析了50个肿瘤生物样本中的200多万个细胞,开发了一种基于深度学习的策略来空间映射肿瘤细胞状态及其周围结构 | 提出了空间动态网络(SDN)的概念,揭示了肿瘤细胞状态如何组织成独特的集群('村庄'),并展示了这些村庄与肿瘤微环境之间的分子共依赖性 | 研究仅针对肝癌,未涉及其他癌症类型 | 理解肿瘤空间景观及其对肿瘤侵袭性的影响 | 肝癌肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像, 基因表达数据 | 50个肿瘤生物样本中的200多万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 9882 | 2025-05-31 |
Graph neural networks for single-cell omics data: a review of approaches and applications
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf109
PMID:40091193
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综述 | 本文系统回顾了图神经网络(GNNs)在单细胞组学数据分析中的应用及其六种变体 | 首次系统总结了GNNs在单细胞组学数据分析中的107个成功应用案例,并整理了77个公开可用的单细胞数据集 | 当前研究可能存在方法学上的不足,需要未来进一步探索 | 深化GNNs在单细胞组学数据分析中的应用 | 单细胞组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序技术 | GNN及其六种变体 | 单细胞组学数据(表观基因组学、转录组学、空间转录组学、蛋白质组学和多组学) | 总结了77个公开可用的单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 9883 | 2025-05-31 |
Utilising routinely collected clinical data through time series deep learning to improve identification of bacterial bloodstream infections: a retrospective cohort study
2025-03, The Lancet. Digital health
DOI:10.1016/j.landig.2025.01.010
PMID:40015765
|
研究论文 | 本研究利用常规收集的临床数据,通过时间序列深度学习技术,提高了细菌性血流感染的识别能力 | 使用LSTM模型分析时间序列数据,显著提高了对血流感染的预测准确性 | 研究为回顾性队列研究,可能存在数据偏差 | 开发和评估利用医疗数据预测住院患者血流感染的模型 | 住院患者 | 机器学习 | 血流感染 | 血液培养 | LSTM, logistic regression | 临床数据 | 20850名患者(训练集15212名,测试集5638名) | NA | NA | NA | NA |
| 9884 | 2025-05-31 |
A Robust and Efficient Representation-based DNA Storage Architecture by Deep Learning
2025-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400959
PMID:40114483
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research paper | 提出一种基于深度学习的表示型DNA存储架构,用于图像的高效和鲁棒存储 | 利用深度学习的出色表示和图像生成能力,结合自编码器和U-Net网络,实现了DNA存储中噪声读取下的图像表示、构建和优化 | 在插入-删除-替换(IDS)错误率低于6%的场景下才能重建中等质量的图像 | 开发一种鲁棒且高效的DNA存储架构,用于大规模图像应用 | 图像数据 | 数字病理 | NA | DNA存储 | autoencoder, U-Net | 图像 | 14个质粒中存储的图像 | NA | NA | NA | NA |
| 9885 | 2025-05-31 |
Deep Learning Derived Adipocyte Size Reveals Adipocyte Hypertrophy is under Genetic Control
2025-Feb-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.11.25322053
PMID:39990583
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研究论文 | 本研究利用深度学习技术自动分析脂肪细胞大小,探讨其与肥胖相关性状及遗传关联的关系 | 开发了基于深度学习的脂肪组织切片语义分割方法,进行了迄今为止最大规模的脂肪细胞表型与遗传关联研究 | 研究样本主要来自特定人群,可能限制结果的普适性 | 探究脂肪细胞大小与肥胖相关代谢特征的关联及其遗传基础 | 皮下和内脏脂肪组织样本 | 数字病理学 | 肥胖相关疾病 | 深度学习 | 语义分割模型 | 组织切片图像 | 5个独立队列中的2,667份样本,包含9,000张全切片图像和超过2,700万个脂肪细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 9886 | 2025-05-31 |
Artificial intelligence-driven volumetric CT outcome score in cystic fibrosis: longitudinal and multicenter validation with/without modulators treatment
2025-Feb, European radiology
IF:4.7Q1
DOI:10.1007/s00330-024-11019-5
PMID:39150489
|
研究论文 | 本研究通过3D深度学习技术开发了一种自动定量测量囊性纤维化(CF)患者气道异常的CT评分方法(NOVAA-CT),并进行了纵向和多中心的临床验证 | 首次开发了基于AI的全肺自动定量CT评分系统(NOVAA-CT),可全面监测CF严重程度并量化治疗效果 | 研究为回顾性设计,样本量相对有限(139例) | 验证AI驱动的容积CT评分在囊性纤维化诊疗中的临床应用价值 | 接受ETI或ABPA治疗的囊性纤维化患者 | 数字病理 | 囊性纤维化 | 3D深度学习 | 3D CNN | CT影像 | 139例CF患者(ETI组60例,ABPA组20例,外部验证组59例) | NA | NA | NA | NA |
| 9887 | 2025-05-31 |
HVSeeker: a deep-learning-based method for identification of host and viral DNA sequences
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf037
PMID:40372723
|
research paper | HVSeeker是一种基于深度学习的方法,用于区分细菌和噬菌体序列 | HVSeeker结合了两种独立的模型(DNA序列和蛋白质分析)以及三种预处理方法(填充、contigs组装和滑动窗口),在识别未知噬菌体基因组方面表现出色 | NA | 开发一种能够从混合宏基因组中准确识别宿主和病毒序列的方法 | 细菌和噬菌体序列 | bioinformatics | NA | deep learning | HVSeeker(包含DNA序列和蛋白质分析两个独立模型) | DNA序列和蛋白质序列 | 测试数据来自NCBI和IMGVR数据库,序列长度范围200到1,500碱基对 | NA | NA | NA | NA |
| 9888 | 2025-05-31 |
Enhancing chest X-ray datasets with privacy-preserving large language models and multi-type annotations: A data-driven approach for improved classification
2025-Jan, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2024.103383
PMID:39546982
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MAPLEZ的新方法,利用本地可执行的大型语言模型(LLM)从胸部X光报告中提取和增强发现标签,以提高分类质量 | MAPLEZ不仅提取二元标签(表示发现的存在或缺失),还提取位置、严重程度和放射科医生对发现的不确定性,显著提高了标签质量和分类性能 | 方法仅在有限分辨率的胸部X光数据集上进行了验证,可能在其他类型或更高分辨率的数据上表现不同 | 提高胸部X光图像分析的标签质量和分类性能 | 胸部X光报告和图像 | 数字病理学 | 肺病 | 大型语言模型(LLM) | LLM | 图像和文本 | 五个测试集中的八种异常情况 | NA | NA | NA | NA |
| 9889 | 2025-05-31 |
Leveraging Extended Windows in End-to-End Deep Learning for Improved Continuous Myoelectric Locomotion Prediction
2025, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
IF:4.8Q1
DOI:10.1109/TNSRE.2025.3552530
PMID:40100693
|
研究论文 | 本研究探讨了利用扩展窗口长度在端到端深度学习中改进连续肌电运动预测的方法 | 通过扩展窗口长度(250 ms至1500 ms)结合端到端CNN处理原始sEMG信号,克服了传统方法在预测能力上的限制 | 研究未涉及不同个体间的泛化能力验证 | 改进连续肌电运动预测的准确性和实时性 | 表面肌电信号(sEMG)和连续运动模式 | 机器学习 | NA | 表面肌电信号(sEMG)采集 | CNN | 信号数据 | 涉及8种运动模式和16种过渡状态 | NA | NA | NA | NA |
| 9890 | 2025-05-31 |
Continuous Joint Kinematics Prediction Using GAT-LSTM Framework Based on Muscle Synergy and Sparse sEMG
2025, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
IF:4.8Q1
DOI:10.1109/TNSRE.2025.3565305
PMID:40299730
|
研究论文 | 提出了一种基于肌肉协同和稀疏sEMG的GAT-LSTM框架,用于连续关节运动预测 | 结合肌肉协同理论和图注意力网络,有效补偿稀疏sEMG设置的局限性,显著提高预测精度 | NA | 提高基于sEMG的连续运动预测的准确性和可靠性 | sEMG信号和关节运动 | 机器学习 | NA | sEMG | GAT-LSTM | sEMG信号 | 公共数据集Ninapro DB2和自收集数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 9891 | 2025-05-31 |
Optimizing gene selection and module identification via ontology-based scoring and deep learning
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf034
PMID:40365108
|
research paper | 提出了一种结合统计方法和深度学习的集成框架,用于优化基因选择和模块识别 | 结合了基于基因本体论(GO)的新型统计算法和深度神经网络模型,提高了基因选择的准确性和生物相关性 | 未提及具体样本量或实验验证的局限性 | 优化基因选择并识别基因相互作用模块,以更好地理解复杂疾病机制 | 基因表达数据和基因相互作用 | computational biology | NA | gene ontology (GO) scoring, deep learning | deep neural network, feed-forward architecture | omics data, gene expression data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9892 | 2025-05-31 |
Automatic collateral quantification in acute ischemic stroke using U2-net
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1502382
PMID:40421138
|
research paper | 利用U2-Net深度学习框架自动量化急性缺血性卒中(AIS)中的侧支循环,并与传统视觉侧支评分(vCS)进行比较 | 首次使用U2-Net深度学习框架进行AIS侧支循环的自动量化,并提出了定量侧支评分(qCS) | 样本量相对较小(118例AIS病例),且仅基于CTA图像 | 开发一种自动量化AIS侧支循环的方法,以提高诊断准确性和治疗决策 | 急性缺血性卒中(AIS)患者的CTA图像 | digital pathology | cardiovascular disease | computed tomography angiography (CTA) | U2-Net | image | 118例AIS病例(94例用于开发,24例用于测试) | NA | NA | NA | NA |
| 9893 | 2025-05-31 |
Hybrid deep learning for IoT-based health monitoring with physiological event extraction
2025 Jan-Dec, Digital health
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/20552076251337848
PMID:40421178
|
research paper | 提出一种混合深度学习模型,结合CNN和LSTM,用于基于IoT的健康监测与生理事件提取 | 结合CNN和LSTM处理时空数据,引入生理事件提取(PEE)提升特征可解释性,使用集成技术和在线学习算法优化异常检测 | 未提及具体疾病类型的验证范围和实际临床部署的挑战 | 提升IoT医疗数据处理链的准确性和实时性 | 医疗图像和可穿戴传感器数据 | machine learning | NA | Physiological Event Extraction (PEE), Isolation Forest, One-Class SVM, Incremental Gradient Descent with Momentums | CNN, LSTM | medical images, wearable sensor data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9894 | 2025-05-31 |
Radiomics Analysis on Computed Tomography Images for Prediction of Chemoradiation-induced Heart Failure in Breast Cancer by Machine Learning Models
2025, Journal of medical signals and sensors
DOI:10.4103/jmss.jmss_51_24
PMID:40421235
|
研究论文 | 通过机器学习模型分析CT图像的放射组学特征,预测乳腺癌患者放化疗后心力衰竭的风险 | 结合放射组学、剂量学和临床特征,利用机器学习模型预测放化疗诱导的心力衰竭 | 样本量较小(54例患者),且仅针对左侧放化疗的乳腺癌患者 | 评估临床、剂量学和放射组学特征在预测乳腺癌患者放化疗后心力衰竭概率中的有效性 | 接受左侧放化疗且自然心力衰竭风险低的乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | CT扫描、深度学习、机器学习 | 决策树、K近邻、随机森林(RF) | 图像 | 54例乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 9895 | 2025-05-31 |
Advancements in Hematologic Malignancy Detection: A Comprehensive Survey of Methodologies and Emerging Trends
2025, TheScientificWorldJournal
DOI:10.1155/tswj/1671766
PMID:40421320
|
综述 | 本文系统性地回顾了基于图像分析的血液癌症检测的最新技术,旨在识别最有效的计算策略并突出新兴趋势 | 对传统机器学习、深度学习和混合学习方法进行了分类和比较,并提出了未来研究方向 | 数据稀缺、类别不平衡以及临床环境中的泛化性问题 | 评估和比较血液癌症检测中的计算方法,并提出未来研究方向 | 白血病、淋巴瘤和多发性骨髓瘤等血液恶性肿瘤 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 图像分析 | CNN(如AlexNet、VGG、ResNet)、基于Transformer的模型、支持向量机、随机森林 | 图像 | 基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 9896 | 2025-05-31 |
Artificial intelligence based advancements in nanomedicine for brain disorder management: an updated narrative review
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1599340
PMID:40432717
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review | 本文概述了人工智能在纳米医学领域的最新进展,特别是在脑部疾病管理中的应用 | 利用AI技术(如机器学习和深度学习)改进纳米医学在脑部疾病诊断、生物标志物识别、预后评估、靶向药物输送和治疗干预等方面的应用 | NA | 探讨人工智能如何加速纳米医学在脑部疾病管理中的有效和快速诊断、生物标志物识别、预后、药物输送和方法学进步 | 脑部疾病,包括脑癌、阿尔茨海默病、帕金森病和多发性硬化症 | machine learning | brain disorder | machine learning, deep learning | NA | clinical datasets | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9897 | 2025-05-31 |
Application of deep learning convolutional neural networks to identify gastric squamous cell carcinoma in mice
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1587417
PMID:40432719
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研究论文 | 本研究应用深度学习卷积神经网络(CNN)建立小鼠胃鳞状细胞癌(GSCC)的检测模型,以提高病理诊断的准确性和一致性 | 首次将五种不同的CNN模型(FCN、LR-ASPP、DeepLabv3+、U-Net和DenseNet)应用于小鼠GSCC的自动检测,并比较了它们的性能 | 研究样本量相对较小(93例GSCC和56例正常组织),且仅针对小鼠模型,未验证在人类样本中的适用性 | 开发基于深度学习的自动检测模型,提高药物非临床安全性评价中GSCC病理诊断的准确性和一致性 | 药物诱导的小鼠胃鳞状细胞癌(GSCC)和正常胃组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 深度学习 | CNN(包括FCN、LR-ASPP、DeepLabv3+、U-Net和DenseNet) | 数字病理图像 | 149例(93例GSCC和56例正常组织) | NA | NA | NA | NA |
| 9898 | 2025-05-31 |
Rice disease detection method based on multi-scale dynamic feature fusion
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1543986
PMID:40433155
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research paper | 提出了一种基于多尺度动态特征融合的水稻病害检测方法,旨在提高复杂农田环境中水稻叶片病害检测的准确性,并便于深度学习模型在移动终端上的部署以实现快速实时推理 | 引入了YOLOv11-MSDFF-RiceD网络,采用ParameterNet概念设计了FlexiC3k2Net模块和高效多尺度特征融合模块(EMFFM),优化了模型的性能并减少了计算复杂度和内存占用 | 在准确率提升方面仅有1.7%的改进,可能在某些高精度要求的场景下表现有限 | 提高水稻叶片病害检测的准确性,并优化模型以适应移动终端的部署 | 水稻叶片病害 | computer vision | plant disease | deep learning | YOLOv11-MSDFF-RiceD | image | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9899 | 2025-05-31 |
Integration of smart sensors and phytoremediation for real-time pollution monitoring and ecological restoration in agricultural waste management
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1550302
PMID:40433163
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研究论文 | 本文提出了一种结合生物地球化学模型和深度学习技术的Bio-DANN模型,用于提高农业废物管理和生态恢复中污染物监测和预测的准确性 | 结合生物地球化学模型和深度学习技术,提出Bio-DANN模型,实时处理多维环境数据,显著提高了污染物监测和生态恢复预测的准确性 | 未提及模型在极端环境条件下的表现或长期稳定性 | 开发一种高精度的污染物监测和生态恢复预测技术,以应对全球气候变化和生态退化问题 | 农业废物管理和生态恢复中的污染物监测与预测 | 环境科学与深度学习 | NA | 深度学习技术,包括DNN和注意力机制 | Bio-DANN(结合生物地球化学模型和深度学习) | 多维环境数据 | 基于Open Soil Data和NEON数据集进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 9900 | 2025-05-31 |
TS-Resformer: a model based on multimodal fusion for the classification of music signals
2025, Frontiers in neurorobotics
IF:2.6Q3
DOI:10.3389/fnbot.2025.1568811
PMID:40433555
|
研究论文 | 提出了一种基于多模态融合的音乐信号分类模型TS-Resformer,用于解决音乐流派分类中的特征提取不足和时间序列信息丢失问题 | 融合残差网络与Transformer编码层的Res-Transformer模型,以及结合不同注意力机制的TS-Resformer模型,设计了时频注意力机制以充分提取音乐的低级特征 | 未提及模型在大规模数据集上的泛化能力及计算资源消耗情况 | 提高音乐流派分类的准确率和效率 | 音乐信号 | 机器学习 | NA | 短时傅里叶变换、Mel滤波器、对数压缩 | Res-Transformer, TS-Resformer | 音频信号 | FMA-small数据集 | NA | NA | NA | NA |