深度学习在生物医药领域中的应用
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当前共找到 30532 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-09-05 |
Artificial intelligence in metalloprotein binding site prediction: A systematic review bridging bioinformatics and biotechnology
2025-Aug-28, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146666
PMID:40885350
|
系统综述 | 本文系统回顾了人工智能在金属蛋白结合位点预测中的应用，比较了传统方法与机器学习及深度学习技术的性能差异 | 提出了基于数据集特征和研究目标的结构化决策框架，指导模型选择并应对数据不平衡和结构异质性等挑战 | 模型泛化能力受数据不平衡、金属离子代表性不足及结构异质性限制 | 推动金属蛋白结合位点预测研究，支持生物技术和制药工业的创新 | 金属蛋白及其金属结合位点 | 生物信息学 | NA | 机器学习（ML）、深度学习（DL） | Random Forest、CNN（卷积神经网络） | 序列数据、结构数据 | NA |
| 982 | 2025-09-05 |
DECODE: An open-source cloud-based platform for the noninvasive management of peripheral artery disease
2025-Aug-28, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109037
PMID:40902337
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研究论文 | 开发了一个名为DECODE的开源云平台，用于外周动脉疾病的非侵入性管理 | 整合了人工智能、交互式3D可视化和计算建模，提供自动化的云集成解决方案 | NA | 改善外周动脉疾病的诊断和患者特异性治疗规划 | 外周动脉疾病患者 | 数字病理 | 心血管疾病 | 深度学习分割、有限元模拟、光学相干断层扫描 | CNN、U-Net、nnU-Net | CT图像、OCT图像 | 22个CT数据集和300个血管内光学相干断层扫描图像 |
| 983 | 2025-09-04 |
Deep Learning-Derived Plaque Burden for Intracoronary Optical Coherence Tomography: An Intravascular Ultrasound-Based Validation Study
2025-Aug-27, JACC. Cardiovascular interventions
DOI:10.1016/j.jcin.2025.07.021
PMID:40900048
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 984 | 2025-09-05 |
Development of a multi-feature predictive model for risk stratification in stage IB-IIA non-small cell lung cancer: a multicenter analysis
2025-Aug-24, European journal of radiology
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.ejrad.2025.112379
PMID:40902436
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研究论文 | 开发了一种整合临床病理数据与CT影像的多特征预测模型，用于IB-IIA期非小细胞肺癌的风险分层 | 首次结合临床病理因素、放射组学特征和深度学习特征构建多特征融合模型（CRD模型），并采用SHAP方法增强模型可解释性 | 回顾性研究设计，外部验证队列样本量较小（n=70） | 开发IB-IIA期非小细胞肺癌的术后风险分层预测模型 | IB-IIA期非小细胞肺癌患者 | 数字病理 | 肺癌 | CT影像分析、放射组学特征提取、深度学习 | ResNet50、逻辑回归、多特征融合模型（CRD模型） | 临床病理数据、CT医学影像 | 训练集370例、内部验证120例、外部验证70例患者 |
| 985 | 2025-09-05 |
Molecular characterization of an adhesion GPCR signal transduction
2025-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.14.670383
PMID:40894777
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研究论文 | 本研究通过多学科方法揭示了黏附GPCR ADGRG1的机械信号转导分子机制 | 首次整合单分子力谱、分子动力学模拟和细胞实验，阐明剪切应力诱导GAIN结构域变构激活的两种并行路径 | 研究主要聚焦ADGRG1受体，其他aGPCR家族的普适性仍需验证 | 阐明黏附G蛋白偶联受体的机械信号转导分子机制 | ADGRG1受体及其GAIN结构域 | 分子生物物理学 | NA | 单分子力谱、分子动力学模拟、深度学习辅助设计 | 分子动力学模型、深度学习指导的蛋白质设计 | 生物物理测量数据、分子模拟数据、细胞信号检测数据 | NA（未明确样本数量，但涉及工程化GAIN变体验证） |
| 986 | 2025-09-05 |
Multi-organ AI Endophenotypes Chart the Heterogeneity of Pan-disease in the Brain, Eye, and Heart
2025-Aug-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.09.25333350
PMID:40832432
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研究论文 | 本研究利用多器官AI内表型（MAEs）探索脑、眼和心脏疾病的异质性和共享病因 | 提出'泛疾病'概念，首次通过弱监督深度学习模型从多器官多组学数据中识别出11个AI驱动的生物标志物 | NA | 研究脑、眼和心脏疾病的异质性和共同病因机制，推动精准医疗发展 | 129,340名参与者的多器官成像、遗传、蛋白质组和RNA-seq数据 | 数字病理 | 阿尔茨海默病、心血管疾病 | 成像技术、遗传分析、蛋白质组学、RNA-seq | Surreal-GAN（弱监督深度学习模型） | 多模态数据（图像、遗传、蛋白质组、转录组） | 129,340名参与者 |
| 987 | 2025-09-05 |
Precise, predictable genome integrations by deep-learning-assisted design of microhomology-based templates
2025-Aug-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02771-0
PMID:40796977
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的微同源模板设计方法，用于实现精确可预测的CRISPR基因组整合和编辑 | 利用深度学习模型预测基因组-外源序列界面的修复过程，并设计碱基对串联重复修复臂匹配双链断裂处的微同源区 | NA | 提高CRISPR介导的DNA整合和编辑的精确性与可预测性 | HEK293T细胞、非洲爪蟾、成年小鼠脑组织 | 机器学习 | NA | CRISPR、深度学习、微同源模板设计 | 深度学习模型 | 基因组序列数据 | 32个基因位点（HEK293T细胞）及多种体内外模型 |
| 988 | 2025-09-05 |
Progress and new challenges in image-based profiling
2025-Aug-07, ArXiv
PMID:40799808
|
综述 | 回顾基于图像的细胞表型分析的计算方法进展，讨论当前流程、局限性与未来发展方向 | 深度学习重塑特征提取与多模态数据整合，单细胞分析和批次效应校正等方法的引入提升分析精度 | 领域仍面临重大挑战，需要创新性解决方案 | 为研究人员提供该快速发展领域的进展路线图和新挑战导航 | 细胞表型分析 | 计算机视觉 | NA | 显微镜成像，深度学习 | NA | 图像 | NA |
| 989 | 2025-09-05 |
Deep learning-based cell type profiles reveal signatures of Alzheimer's disease resilience and resistance
2025-Aug-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf285
PMID:40794555
|
研究论文 | 使用基于Transformer的深度学习模型从批量RNA-seq数据恢复细胞类型特异性转录程序，以研究阿尔茨海默病的认知韧性和脑抵抗性 | 开发了优于先前方法的Transformer模型，能够从批量RNA-seq数据中有效恢复细胞类型特异性转录程序，实现大规模、成本效益高的细胞类型特异性研究 | 单核技术存在核转录覆盖度低、成本高和技术复杂性的限制 | 揭示阿尔茨海默病韧性和抵抗性的细胞类型特异性特征 | 大脑细胞类型，特别是星形胶质细胞、兴奋性神经元和少突胶质细胞祖细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单核技术 | Transformer | 转录组数据 | NA |
| 990 | 2025-09-05 |
Automatic trending and analysis of SPECT quality assurance with artificial intelligence optical character recognition
2025-Aug, Medical physics
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/mp.18083
PMID:40903927
|
研究论文 | 开发了一种结合AI深度学习OCR的核医学质量保证服务器，用于自动化SPECT和伽马相机的QA数据检索与分析 | 首次将AI深度学习OCR技术应用于核医学QA数据自动提取与趋势分析，显著提升处理效率和准确性 | OCR性能可能受字体类型和大小限制，目前主要针对特定扫描仪型号优化 | 提高核医学设备质量保证数据的处理效率和自动化水平 | SPECT和伽马相机的质量保证数据 | 医疗人工智能 | NA | 光学字符识别(OCR)，深度学习 | 深度学习OCR | 图像，数值数据 | 60张洪水图像和6张COR图像用于基准测试，3459张洪水扫描图像用于准确性评估 |
| 991 | 2025-09-05 |
Massively parallel characterization of non-coding de novo mutations in autism spectrum disorder
2025-Jul-28, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.07.008
PMID:40738258
|
研究论文 | 本研究通过整合多种技术系统评估了自闭症谱系障碍中非编码新生突变的功能影响 | 开发了优化的方法来阐明非编码新生突变的功能作用，识别了42个潜在的ASD风险突变和29个未报道的候选基因 | 研究主要关注特定类型的非编码突变，可能未涵盖所有类型的调控变异 | 系统评估非编码新生突变在自闭症谱系障碍中的功能影响和致病机制 | 自闭症谱系障碍患者的非编码新生突变 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 深度学习变异预测模型、大规模平行报告分析、细胞特异性顺式调控元件注释 | 深度学习模型 | 基因组数据 | 来自Simons Simplex Collection和Autism Speaks MSSNG资源的227,878个非编码新生突变 |
| 992 | 2025-09-05 |
Deep learning based classification of tibio-femoral knee osteoarthritis from lateral view knee joint X-ray images
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04869-6
PMID:40594325
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研究论文 | 提出一种基于深度学习的自动方法，用于从膝关节X光图像中定位和分类胫股关节骨关节炎 | 首个针对AP和侧位视图的胫股关节骨关节炎自动分类深度学习方法 | 侧位视图性能(92.42%)明显低于AP视图(98.57%) | 开发膝关节骨关节炎的自动检测和分类系统 | 胫股膝关节 | 计算机视觉 | 骨关节炎 | X射线成像 | DenseNet 201 with transfer learning | X光图像 | 4334个膝关节X光图像 |
| 993 | 2025-09-05 |
Multiscale wavelet attention convolutional network for facial expression recognition
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07416-5
PMID:40596501
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研究论文 | 提出一种结合多尺度卷积和小波通道注意力机制的改进卷积神经网络，用于提升面部表情识别准确率 | 首次将多尺度卷积层与小波通道注意力机制结合，并集成到ResNet18基线模型中，在多个数据集上验证了性能提升 | NA | 提高面部表情识别应用的准确率 | 学生真实课堂面部表情数据集(FESR)和卡洛林斯卡定向情绪面孔数据集(KDEF) | 计算机视觉 | NA | 深度学习，小波变换 | CNN, MCNN, wCA-CNN, wCA-MCNN, ResNet18 | 图像 | 两个数据集：FESR（真实课堂采集）和KDEF |
| 994 | 2025-09-05 |
AI analysis of medical images at scale as a health disparities probe: a feasibility demonstration using chest radiographs
2025-Apr-08, ArXiv
PMID:40297238
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研究论文 | 本研究开发了一种利用胸部X光片提取定量指标并计算健康差异指数的可行性流程 | 首次将医学影像自动提取的定量指标作为健康差异指数的输入，为健康差异研究提供了新型数据源 | 研究样本量有限（1,571名患者），仅验证了可行性而未进行大规模应用 | 探索医学影像作为健康差异研究新型数据源的可行性 | 1,571名独特患者的胸部X光片 | 医学影像分析 | 肺部疾病 | 深度学习模型分析 | 深度学习模型（未指定具体类型） | 医学影像（X光片） | 1,571名患者 |
| 995 | 2025-09-05 |
Spatiotemporal Profiling Defines Persistence and Resistance Dynamics during Targeted Treatment of Melanoma
2025-Mar-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0690
PMID:39700408
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和深度学习分析，揭示了BRAF突变黑色素瘤在靶向治疗中持久性和耐药性的时空动态机制 | 首次结合空间转录组学和深度学习组织病理学分析，在患者来源异种移植模型中解析治疗过程中克隆谱系演化的时空动态 | 研究基于异种移植模型，可能与人类体内真实微环境存在差异 | 阐明黑色素瘤靶向治疗中持久细胞状态的形成机制和耐药性演化规律 | BRAF突变黑色素瘤细胞和患者来源异种移植模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学，深度学习分析 | 深度学习 | 空间转录组数据，组织病理学图像 | 患者来源异种移植模型样本 |
| 996 | 2025-09-05 |
Donor-Specific Digital Twin for Living Donor Liver Transplant Recovery
2025-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639518
PMID:40568069
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研究论文 | 本研究通过整合临床基因表达数据和数学模型，为活体肝移植供体开发了个性化渐进机制数字孪生（PePMDT）以预测肝再生恢复轨迹 | 首次将血液来源的基因表达数据通过深度学习映射到肝再生数学模型变量，构建供体特异性数字孪生平台 | 样本量较小（12名供体），且仅针对健康供体群体 | 开发个性化数字孪生模型以预测活体肝移植供体的肝再生恢复过程 | 活体肝移植健康供体的肝再生过程 | 数字病理 | 肝移植相关 | RNA-seq, WGCNA, 深度学习 | 数学模型结合深度学习 | 基因表达数据 | 12名健康LDLT供体，在一年内14个时间点采集的全转录组数据 |
| 997 | 2025-09-05 |
HeteroMRI: Robust white matter abnormality classification across multi-scanner MRI data
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf092
PMID:40844084
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研究论文 | 提出一种名为HeteroMRI的深度学习方法，用于跨多扫描仪MRI数据的白质异常分类 | 通过白质组织强度聚类减少MRI异质性影响，无需额外机器学习方法处理数据异质性 | 在数据量减少64%和75%时，准确率分别下降4%和12%，在极有限数据场景下性能仍有下降 | 开发对MRI扫描仪和采集协议高度独立的分类方法，提升多源MRI数据的白质异常诊断能力 | 人类大脑白质异常的MRI数据 | 医学影像分析 | 脑白质病变 | MRI，深度学习 | 二元分类器 | MRI图像 | 11个公共数据集的200个MRI用于训练，包含40种MRI协议 |
| 998 | 2025-09-05 |
A review of the emerging technologies and systems to mitigate food fraud in supply chains
2025, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2024.2405840
PMID:39356551
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综述 | 本文综述了新兴技术和系统在缓解食品供应链中食品欺诈方面的应用与挑战 | 探讨了手持LIBS、智能手机光谱等快速食品认证新前沿，以及结合深度学习策略的多功能传感设备 | 实验室先进技术向高速实时工业应用的转化存在显著差距 | 调查缓解食品欺诈的新兴技术和策略，并探索其应用的主要障碍 | 食品供应链中的欺诈行为 | NA | NA | 激光诱导击穿光谱(LIBS)、智能手机光谱、光谱技术、分离技术、深度学习 | 深度学习 | 光谱数据、食品指纹数据 | NA |
| 999 | 2025-09-05 |
Artificial Intelligence and Chromothripsis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4750-9_16
PMID:40884650
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评论 | 探讨人工智能在检测和表征染色体碎裂（chromothripsis）中的潜力及其临床应用 | 利用深度学习和机器学习算法分析复杂基因组数据，整合多组学数据，以前所未有的准确性识别染色体碎裂模式并预测其功能影响 | NA | 研究人工智能在遗传学和基因组学领域，特别是染色体碎裂检测与解读中的应用 | 染色体碎裂（chromothripsis）及其相关的复杂基因组重排 | 机器学习 | NA | 深度学习，机器学习，多组学数据整合 | 深度学习，机器学习 | 基因组数据，多组学数据 | NA |
| 1000 | 2025-09-05 |
Development and validation of a deep learning-based assessment tool for teacher leadership: A case study from Xinjiang, China
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0331560
PMID:40892831
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研究论文 | 开发并验证了一个基于深度学习的教师领导力评估工具，针对新疆多民族多语言背景 | 引入了可解释的深度学习模型ITL-LSTM，采用Diagonal BiLSTM结构进行动态分类，准确率达90.10% | 研究样本仅限新疆371名中小学教师，可能影响结果的普适性 | 开发文化敏感的教师领导力评估工具以支持教育质量提升 | 新疆中小学教师 | 自然语言处理 | NA | 深度学习 | LSTM | 问卷文本数据 | 371名新疆中小学教师 |