深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
10381	2025-10-07	Neural architecture search with Deep Radon Prior for sparse-view CT image reconstruction 2025-May, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17685 PMID:39930320	研究论文	提出一种基于神经架构搜索和深度Radon先验的无监督稀疏视图CT图像重建方法	首次将神经架构搜索与深度Radon先验相结合，通过强化学习自动优化网络结构，特别关注上采样层对图像质量恢复的关键影响	方法依赖于无监督学习，可能对特定类型的数据分布敏感；网络结构搜索过程计算成本较高	解决稀疏视图CT图像重建中的伪影问题，提高重建图像质量	稀疏视图CT图像	医学影像处理	NA	CT成像，深度Radon先验	编码器-解码器网络，循环神经网络	CT图像，Radon域数据	NA	NA	编码器-解码器，RNN	PSNR, SSIM, LPIPS	NA
10382	2025-10-07	Beam's eye view to fluence maps 3D network for ultra fast VMAT radiotherapy planning 2025-May, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17673 PMID:39935217	研究论文	提出一种基于深度学习的3D网络，用于从患者剂量图直接预测VMAT放疗计划中的通量图	首次开发能够单次推理预测180个控制点通量图的3D网络，并考虑机器约束条件	仅针对单弧VMAT计划进行验证，未涉及多弧或其他复杂放疗技术	加速VMAT放疗计划制定过程	放疗计划中的通量图预测	医学影像分析	癌症	深度学习，放射治疗计划	3D CNN	3D剂量图，通量图	超过2000个VMAT计划（使用Eclipse生成）+ REQUITE数据集	NA	3D网络架构（与U-Net对比）	PSNR, SSIM, 剂量体积直方图	NA
10383	2025-10-07	Dose prediction via deep learning to enhance treatment planning of lung radiotherapy including simultaneous integrated boost techniques 2025-May, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17692 PMID:39967020	研究论文	本研究开发了基于深度学习的剂量预测模型，用于肺癌放疗计划优化，包括同步整合推量技术	首次将深度学习应用于包含多种处方剂量和同步整合推量技术的肺癌放疗剂量预测，并验证其在改善计划质量方面的潜力	样本量相对有限（93例回顾性数据+10例前瞻性验证），仅针对肺癌VMAT计划	研究深度学习在预测包含同步整合推量技术的肺癌放疗剂量分布中的可行性和潜在益处	肺癌患者接受容积旋转调强放疗的治疗计划	医学影像分析	肺癌	容积旋转调强放疗，同步整合推量技术	深度学习	CT图像，靶区和正常组织轮廓，处方剂量	93例回顾性临床计划（75训练+18测试）+10例前瞻性验证患者	NA	3D U-Net	平均剂量差异	NA
10384	2025-10-07	Automated chick gender determination using optical coherence tomography and deep learning 2025-May, Poultry science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.psj.2025.105033 PMID:40106909	研究论文	本研究提出了一种结合光学相干断层扫描和深度学习的高分辨率、非侵入性雏鸡性别鉴定方法	首次将OCT与深度学习结合用于自动化雏鸡性别鉴定，开发了针对OCT数据优化的定制卷积神经网络	模型准确率为79%，仍有提升空间，需要进一步改进成像和机器学习技术	开发自动化雏鸡性别鉴定方法以优化家禽生产	雏鸡泄殖腔结构	计算机视觉	NA	光学相干断层扫描	CNN	OCT图像	NA	NA	定制CNN, Inception, VGG-16	准确率	NA
10385	2025-10-07	A novel skeletal muscle quantitative method and deep learning-based sarcopenia diagnosis for cervical cancer patients treated with radiotherapy 2025-May, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17791 PMID:40170435	研究论文	开发基于锥形束CT和深度学习的肌肉减少症自动诊断方法用于宫颈癌放疗患者	提出使用第五腰椎替代第三腰椎进行肌肉指数评估，并设计端到端的解剖距离引导双分支特征融合网络	研究样本量有限，外部验证数据集规模较小	探索锥形束CT在评估肌肉指数和深度学习自动分割诊断肌肉减少症中的应用价值	接受放疗的宫颈癌患者	数字病理	宫颈癌	锥形束CT, 深度学习	CNN	医学影像	248例宫颈癌放疗患者	NA	解剖距离引导双分支特征融合网络	Dice相似系数, 准确率, F1分数	NA
10386	2025-10-07	Artificial intelligence in preclinical research: enhancing digital twins and organ-on-chip to reduce animal testing 2025-May, Drug discovery today IF:6.5Q1 DOI:10.1016/j.drudis.2025.104360 PMID:40252989	综述	探讨人工智能在临床前研究中通过增强数字孪生和器官芯片技术来减少动物测试的应用与影响	整合机器学习、深度学习与AI驱动的数字孪生和器官芯片平台，提升对复杂生物系统的模拟精度和预测能力	未提及具体技术实施的局限性	推动伦理且高效的药物发现，遵循3R原则（替代、减少、优化）减少动物测试	临床前药物研究中的生物系统模拟	机器学习	NA	机器学习(ML), 深度学习(DL), 数字孪生(DT), 器官芯片(OoC)	NA	生物系统模拟数据	NA	NA	NA	NA	NA
10387	2025-10-07	The application of natural language processing technology in hospital network information management systems: Potential for improving diagnostic accuracy and efficiency 2025-Apr-18, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2025.100287 PMID:40254184	研究论文	本研究探索了自然语言处理技术在医院网络信息管理系统中处理扫描文档的应用，旨在提高诊断准确性和效率	提出了一种新颖的隐藏贝叶斯集成密集双向LSTM（HB-DBi-LSTM）策略来优化词袋模型	深度学习序列模型因高计算需求需要额外的训练验证集分割，可能限制模型训练效率	研究在医院网络信息管理系统中应用自然语言处理技术提高诊断效率和准确性的可能性	电子健康记录中的扫描文档，特别是针对各种睡眠问题的诊断报告	自然语言处理	睡眠障碍	自然语言处理，光学字符识别，图像预处理	Bi-LSTM, 贝叶斯模型	扫描PDF图像，文本数据	未明确说明具体样本数量，但按70%训练集和30%测试集划分	NA	密集双向LSTM，隐藏贝叶斯集成模型	F1分数，准确率，召回率，精确率，ROC，AUROC	使用Adam优化器训练100个epoch，因高计算需求需要额外的训练验证集分割
10388	2025-10-07	Deep Learning-Based Ion Channel Kinetics Analysis for Automated Patch Clamp Recording 2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202404166 PMID:39737527	研究论文	本研究提出了首个基于人工智能的框架，用于自动膜片钳记录中多种离子通道动力学的表征分析	首次将人工智能技术应用于离子通道动力学分析，集成了异常检测和多类分类的深度学习框架	NA	开发自动化离子通道动力学分析框架以提高电生理研究效率	全细胞膜片钳记录数据	机器学习	阿尔茨海默病,帕金森病	膜片钳技术	CNN,LSTM	电生理记录数据	124个测试数据集	NA	1D卷积神经网络,双向长短期记忆网络,注意力机制	准确率	NA
10389	2025-05-19	An efficient leukemia prediction method using machine learning and deep learning with selected features 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0320669 PMID:40378164	research paper	该论文提出了一种利用机器学习和深度学习技术结合特征选择的白血病预测方法	使用特征选择和深度学习技术对白血病基因数据进行分类，其中LSTM模型达到了100%的分类准确率	研究样本量较小（仅64个样本），且仅使用了CuMiDa数据库中的GSE9476数据集	开发一种高效的白血病早期预测和分类方法	白血病基因数据（来自CuMiDa数据库的GSE9476数据集）	machine learning	leukemia	基因微阵列技术	Random Forest, Linear Regression, SVM, LSTM	gene expression data	64个样本（来自22283个基因中的5类白血病基因）	NA	NA	NA	NA
10390	2025-10-07	LungVis 1.0: an automatic AI-powered 3D imaging ecosystem unveils spatial profiling of nanoparticle delivery and acinar migration of lung macrophages 2024-11-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54267-1 PMID:39604430	研究论文	开发了一个名为LungVis 1.0的AI驱动成像生态系统，用于三维可视化纳米颗粒在肺部递送的空间分布和肺泡巨噬细胞的迁移行为	首次整合光片荧光显微镜与深度学习图像分析，实现了纳米颗粒在支气管和肺泡区域沉积的全面定量映射，并挑战了组织驻留巨噬细胞为静态实体的传统范式	研究目前仅限于小鼠肺部模型，尚未在人类或其他物种中验证	探索肺部靶向药物递送动力学和巨噬细胞介导的肺部免疫机制	小鼠肺部纳米颗粒沉积和肺泡巨噬细胞行为	数字病理学	呼吸系统疾病	光片荧光显微镜，深度学习图像分析	深度学习	三维荧光图像	NA	NA	NA	NA	NA
10391	2025-05-19	Multi-scale Multi-site Renal Microvascular Structures Segmentation for Whole Slide Imaging in Renal Pathology 2024-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering PMID:40375952	research paper	提出了一种名为Omni-Seg的新方法，用于从人类肾脏全切片图像中分割微血管结构	利用多站点、多尺度的训练数据，采用单一动态网络方法，能够处理部分标记的图像	方法依赖于多站点、多尺度的训练数据，可能对数据获取和处理提出更高要求	开发一种自动分割肾脏微血管结构的计算方法	人类肾脏全切片图像中的微血管结构（如小动脉、小静脉和毛细血管）	digital pathology	renal pathology	deep learning	dynamic network	image	来自HuBMAP和NEPTUNE两个数据集的图像，包括不同放大倍数（40×、20×、10×和5×）	NA	NA	NA	NA
10392	2025-05-18	Breast tumor diagnosis via multimodal deep learning using ultrasound B-mode and Nakagami images 2025-Nov, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.12.S2.S22009 PMID:40375887	研究论文	本文提出并评估了一种结合超声B模式和Nakagami参数图像的多模态深度学习方法，用于乳腺肿瘤分类	通过整合B模式图像的亮度信息和Nakagami图像的散射特性，提高了诊断性能，相比单输入方法有显著改进	研究样本量相对有限，仅包含264名患者的831次超声采集	提升乳腺肿瘤分类的准确性和诊断效率	乳腺肿瘤的超声图像	数字病理	乳腺癌	超声成像	EfficientNetV2B0	图像	264名患者的831次超声采集	NA	NA	NA	NA
10393	2025-10-07	Deep learning algorithm enables automated Cobb angle measurements with high accuracy 2025-Jul, Skeletal radiology IF:1.9Q3 DOI:10.1007/s00256-024-04853-7 PMID:39688663	研究论文	开发深度学习算法自动测量脊柱侧弯患者的Cobb角	首次使用深度学习算法在全身脊柱X光片上实现自动Cobb角测量，达到高精度	研究样本量相对有限（345例），成人患者的测量误差高于儿童患者	评估深度学习算法在脊柱X光片上自动测量Cobb角的准确性	脊柱侧弯患者的全身脊柱X光片	计算机视觉	脊柱侧弯	X射线成像	深度学习	医学影像	345例患者（179例儿童，166例成人）	NA	NA	平均绝对误差	NA
10394	2025-10-07	LMCBert: An Automatic Academic Paper Rating Model Based on Large Language Models and Contrastive Learning 2025-Jun, IEEE transactions on cybernetics IF:9.4Q1 DOI:10.1109/TCYB.2025.3550203 PMID:40168236	研究论文	提出一种基于大语言模型和对比学习的自动学术论文评分模型LMCBert	结合大语言模型提取论文核心语义内容，并引入动量对比学习优化Bert训练，提升学术论文自动评分的准确性	未明确说明模型在哪些特定学术领域或论文类型上的性能表现	开发自动学术论文评分系统以替代传统人工审稿流程	学术论文的接受概率预测	自然语言处理	NA	大语言模型, 对比学习	Bert, LLM	文本	NA	NA	LMCBert, Bert	准确率	NA
10395	2025-05-18	GRU4ACE: Enhancing ACE inhibitory peptide prediction by integrating gated recurrent unit with multi-source feature embeddings 2025-Jun, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.70026 PMID:40371738	研究论文	本研究提出了一种名为GRU4ACE的创新深度学习框架，通过整合门控循环单元(GRU)和多源特征嵌入，提高了血管紧张素转换酶(ACE)抑制肽的预测准确性	GRU4ACE框架首次整合了多源特征编码方法（包括序列信息、图形信息、语义信息和上下文信息）和GRU模型，显著提升了ACE抑制肽的预测性能	NA	提高ACE抑制肽的预测准确性，为新型降压药物的开发提供指导	ACE抑制肽	自然语言处理	心血管疾病	自然语言处理(NLP)嵌入、预训练蛋白质语言模型(PLM)嵌入	GRU	蛋白质序列数据	NA	NA	NA	NA	NA
10396	2025-05-18	Deep-Diffeomorphic Networks for Conditional Brain Templates 2025-Jun-01, Human brain mapping IF:3.5Q1 DOI:10.1002/hbm.70229 PMID:40372124	research paper	本文提出了一种基于深度学习的条件性脑模板生成方法，利用微分同胚框架来创建几何方法，以捕捉年龄依赖的解剖学差异	使用微分同胚（拓扑保持）框架创建纯几何方法，能够生成具有高空间保真度和一致拓扑结构的条件性脑模板	尽管方法在捕捉年龄依赖的解剖学差异方面有一定效果，但仍需进一步改进以更准确地跟踪所有脑结构的变化	开发一种能够生成条件性脑模板的深度学习方法，以改进神经影像分析中的配准精度和脑发育与退化过程的捕捉	认知正常的参与者（来自阿尔茨海默病神经影像倡议ADNI的数据集）	神经影像分析	阿尔茨海默病	深度学习	deep-diffeomorphic networks	脑部扫描图像	来自ADNI的认知正常参与者数据集	NA	NA	NA	NA
10397	2025-05-18	Automated high precision PCOS detection through a segment anything model on super resolution ultrasound ovary images 2025-May-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-01744-2 PMID:40369044	研究论文	提出了一种名为QEI-SAM的新型集成方法，用于提高超声卵巢图像质量并进行卵巢囊肿分割，以实现准确预测多囊卵巢综合征(PCOS)	结合了ESRGAN进行图像增强和SAM进行囊肿分割，以及多种CNN模型进行PCOS诊断，实现了高精度的自动化检测	未提及模型在临床环境中的实际应用验证或跨中心验证结果	开发自动化高精度PCOS检测系统以辅助临床诊断	超声卵巢图像中的囊肿	数字病理	多囊卵巢综合征	超声成像	ESRGAN, SAM, CNN (包括ResNet 50, ResNet 101, VGG 16, VGG 19, AlexNet和Inception v3)	超声图像	NA	NA	NA	NA	NA
10398	2025-05-18	A sub-meter resolution urban surface albedo dataset for 34 U.S. cities based on deep learning 2025-May-14, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05109-2 PMID:40368894	研究论文	本研究利用深度学习和多源遥感数据，首次为美国34个主要城市制作了高分辨率的城市表面反照率地图	首次为34个美国主要城市提供亚米级分辨率的城市表面反照率数据集，结合了多种遥感数据和U-Net模型进行不透水和透水表面分类及反照率预测	研究仅针对美国34个城市，可能无法直接推广到其他地区或城市	提高城市热环境理解的精确度，为城市规划和环境监测提供数据支持	美国34个主要城市的城市表面反照率	遥感与深度学习	NA	多源遥感数据（NAIP影像、屋顶反照率数据、建筑足迹、土地覆盖分类和Sentinel-2影像）	U-Net	遥感影像	美国34个主要城市	NA	NA	NA	NA
10399	2025-05-18	A fusocelular skin dataset with whole slide images for deep learning models 2025-May-14, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05108-3 PMID:40368949	研究论文	介绍了一个名为AI4SkIN的公开数据集，用于皮肤梭形细胞病变的深度学习模型研究	首次公开了用于皮肤梭形细胞病变的WSI数据集，并采用创新的众包协议进行标注	未提及具体的数据集使用限制或模型性能的局限性	开发并验证多类皮肤梭形细胞病变分类方法	皮肤梭形细胞病变的WSI图像	数字病理学	皮肤癌	深度学习	基于高斯过程的机器学习模型	WSI图像	641张H&E染色的WSI图像	NA	NA	NA	NA
10400	2025-05-18	Evaluating masked self-supervised learning frameworks for 3D dental model segmentation tasks 2025-May-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-01014-1 PMID:40368972	研究论文	评估掩码自监督学习框架在3D牙科模型分割任务中的应用	首次在3D牙科模型领域探索了四种掩码自监督学习框架（Point-BERT、Point-MAE、Point-GPT和Point-M2AE）的适用性	当标记数据充足时，预训练带来的性能提升会减弱	提高牙科模型分割任务的自动化水平，支持计算机辅助治疗规划	3D牙科模型（牙齿和牙套）	计算机视觉	牙科疾病	掩码自监督学习	Point-BERT, Point-MAE, Point-GPT, Point-M2AE	3D模型数据	超过4000个未标记的3D牙科模型（预训练），以及公开可用的Teeth3DS数据集和自建的牙套分割数据集（微调）	NA	NA	NA	NA